1RQMA

Solution structure of the k18g/r82e alicyclobacillus acidocaldarius thioredoxin mutant
Total Genus 35
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
ATMTLTDANFQQAIQGDGPVLVDFWAAWCGPCRMMAPVLEEFAEAHADKVTVAKLNVDENPETTSQFGIMSIPTLILFKGGEPVKQLIGYQPKEQLEAQLADVLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution Structure and Backbone Dynamics of the K18G/R82E Alicyclobacillus acidocaldarius Thioredoxin Mutant: A Molecular Analysis of Its Reduced Thermal Stability.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin
molecule tags Oxidoreductase
source organism Alicyclobacillus acidocaldarius
total genus 35
structure length 105
sequence length 105
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-12-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1rqmA00
5JCGA 3TOUA 4ISDA 4AJ6A 1GTAA 1SL0B 5D96A 3APOA 1ZMAA 2YCDA 1Q98A 1DE1A 6GSSA 5CRDA 2TRXA 1A0RP 4OFNA 3QFAC 2K6VA 1SU9A 1TK5B 3FR6A 1MD4A 1YF0A 3D5JA 5CREA 3EWLA 1KTEA 4OD7A 1YKAA 2H72A 3BOAA 1VF4A 5LCZA 5IMAA 3VURA 1SJ6A 2OA7A 1XWKA 5G1KA 5CAXA 2E0QA 2DIZA 3KH9A 1OC9A 3DYRA 4PURA 19GSA 1A8LA 1A0FA 3LYKA 2EIRA 2L5OA 1MD3A 4K0GA 4TXVA 1NHYA 2AV4A 1ZL9A 5DAKA 5EPFA 3FK8A 4TR1A 2RIIA 3KIJA 1GULA 3BD2A 5CP1A 3EYTA 4H86A 4X1UA 3TKPA 2XPDA 3KCMA 5A5KA 5HR1A 5IMDA 2IFQA 2TIRA 4GLTA 4WF4A 2JACA 1TI1A 3TJFA 3D4TA 4WR4A 2HI7A 1TTZA 3HVSA 1M9BA 5INYA 2KP2A 2R5GA 3FZ4A 3IXRA 1X5EA 4HQSA 3D0ZA 2HE3A 3EINA 3O3TA 2DLXA 3KM6A 3DEXA 4HZ4A 3JCML 5DDLA 2MYGA 3WGXA 4ZBAA 2CAQA 3LQ7A 1TRUA 1WWJA 4DSQA 2X8CA 2LRNA 4EXJA 2HZFA 2R2JA 2F8AA 5ID2A 1TRSA 1X9MB 1G7EA 1GSQA 1YEPA 1HD2A 3QD9A 2YNXA 1NW2A 3C8EA 3DIEA 4MF7A 6GSYA 1XW5A 3E0UA 2C0GA 1SD9A 3FW2A 3HJOA 1BYEA 4KB3A 3RBTA 3TKRA 5G1LA 1G0TA 2G0FA 1ZYEA 4MPGA 2C1YA 1U87A 2L57A 4MABA 5CNWA 2OBIA 3GL5A 3IOSA 1SJIA 2H6XA 2GZZA 3Q18A 3EE2A 1HQOA 4ZB9A 3UIWA 2GT5A 1TKDB 4QL9A 3IRAA 1MDJA 2X64A 3H93A 4BPYA 4KA0A 2HNLA 3DD3A 3ZTLA 3GH9A 3HZ4A 1JZRA 2DJ3A 1FOVA 4GXZA 3C73A 3F9UA 5ELGA 4IKHA 4XS4A 2B3SA 18GSA 3GX0A 1U3AA 1WJKA 5HQPA 1GTIA 1PN9A 5HR3A 4XHMA 3RPNA 3ERFA 5D8IA 7GSSA 2NDOA 4N10A 3DWVA 3FZ5A 4CW9A 3NZNA 2M46A 1F9MA 1M2DA 2C3TA 1EWXA 5EVOA 4O92A 1PQNA 2H1AA 4OCEA 1JLVA 1XFLA 4TVEA 3AY8A 1TDIA 4FYCA 4LMWA 4ECCA 1UVZA 1QFNA 2P5QA 2REMA 3QR6A 4FH8A 1T1VA 1BQ7A 3HJMA 5G31A 1K0NA 3RDWA 2DSAA 2L4QA 2P5RA 3L78A 5B6MA 4OWYA 3HD5A 3F4RA 1K3LA 1GNEA 2H0HA 2A2RA 4ZL7A 3I43A 3WYWA 4MJBA 1QGVA 4N30A 4FIWA 1AUCA 9GSSA 3KGKA 4E8HA 4Q5FA 3LYPA 5F8BA 1F37A 1XWBA 2OJLA 2RM6A 2HRFA 3O76A 1X9WB 2K9FA 4IW9A 4HDEA 4P3YB 1T4YA 4BL7A 2YV9A 4RQXA 1TRVA 1GWCA 2O7KA 4PQIA 1XW6A 2BMXA 1AQVA 1XWGA 1K0DA 4KNDA 4K9ZA 2FD3A 1VF2A 5A4UA 1SL2B 1E2YA 2VCZA 1M2AA 6GSTA 5D9XA 4NAXA 4BA7A 1YY7A 3DVXA 1XWAA 3VI7A 2N5BA 2E7PA 3G7YA 1SD8A 2GSRA 4FYBA 5GAPD 1GUKA 3IV4A 5CYYA 4ID0A 1A23A 2LUSA 2C0FA 2FWEA 5F06A 3M3MA 5ELAA 2AHEA 2GLRA 2YPMA 2PGTA 4KCEA 3ZVJD 2C3QA 3GFKA 5DCHA 3EU3A 4MCUA 4PQHA 5IMCA 2I3YA 3PR8A 3TGZA 1NM3A 5FHIA 3P8WA 4KW6A 2IMDA 5JWQB 3VWVA 1XOAA 3LXTA 4X0XA 4YQVA 2H73A 1JLWA 2VM2A 4N0ZA 3IAS2 3ERWA 5JCWA 1SK2A 3ZVJA 4GF0A 1C72A 4OO4A 3KP9A 4PNGA 4KCAA 3FRCA 4MH3A 4PNFA 4F9ZA 4IP1A 3US3A 3TUEA 3C71A 3F6FA 5CO3A 4X43A 5GSSA 4MLYA 3V1WA 3WGDA 1B48A 1V57A 1FW1A 2WDUA 4LLRA 4KE3A 1J9BA 3L9UA 2VL2C 1WIKA 4IQAA 4TXOA 2FGXA 1T4ZA 4K8MA 1O81A 4BVXA 1GH2A 1K0MA 1M0UA 3BBYA 4WEYA 2X8HA 4AGSA 3NIVA 5D93A 3RPPA 3FKFA 1K0CA 2LKUA 4I97A 1M9AA 4WKWA 2I4AA 4PQ1A 1QUWA 1NSWA 4GRFA 2M72A 4QQ7A 1TXXA 4AJ8A 1SYRA 4NWYA 4AJ7A 1KBNA 5A4VA 2ZNMA 5ECOB 2P31A 3FZAA 1RW1A 4WXTA 3LGCA 1ABAA 1H4OA 3U6VA 5EL8A 3TCOA 4G19A 1YF1A 5JWOB 2BTOT 4TR4A 4POLA 4HOJA 3CBUA 1GUHA 1FVJA 1XW9A 2C8UA 3E3EA 2L4CA 2WCIA 2FWHA 4OMVA 1YZXA 4HJMA 3WT2A 3GN3A 4ML1A 3QDNA 2A4VA 3UVHA 4ZIJA 1X0RA 1GUMA 2AYTA 2JU5A 2CA8A 1WP0A 2G2QA 1LJRA 2PN8A 3EMXA 3ZLPA 3C7MA 1BG5A 3H4KA 2H6ZA 3G7IA 3CSIA 3UJ1A 2FLSA 4CHSA 2GZYA 2GQMA 3VFIA 2B5YA 1YKCA 4HU9A 2LJAA 3VWXA 3R2QA 4ECIA 1V2AA 2IN3A 1N2AA 3MWHA 4I2TA 3M0FA 3ZIVA 1B9XC 3GURA 4KDXA 5KN2A 2VLTA 3GMFA 3TJGA 1THOA 5ECSA 3ISOA 4V2LA 2R3XA 4MZCA 2HLSA 2FA8A 4JBBA 2VIMA 5FWGA 2HT9A 5IO0A 1VF3A 4ACSA 4JR6A 3DVWA 1XOBA 3C1SA 2I81A 1K3YA 1PGTA 2LSTA 3O6TA 1SL1B 4GSNA 1H75A 3H1NA 5D9TA 4V1Ag 1A2LA 2HZEA 1EGRA 5H5QA 3W8SA 3GSTA 3A3TA 2GGTA 2GTUA 4HU7A 1EOHA 3WGEA 1X9SB 3WD6A 2FWGA 4KDUA 4RI7A 2CX4A 2WFCA 2FWFA 1A2JA 6GSXA 1F2EA 2H0IA 4EDYA 3HVVA 1PX6A 4PGTA 2MBSA 4F82A 4I2UA 2KUCA 1OC9B 2LNSA 3SWLA 1G6YA 2VL9A 2YZHA 1T7PB 1XBSA 5DAKB 1QQ2A 3TKSC 2FHEA 2VM1A 2GT6A 3FEUA 4TR1B 1KNGA 1R4WA 3WT1A 3VI5A 3IBHA 1ZCPA 1FB0A 2E2GA 2DIYA 2NVLA 3KEBA 1MDKA 1Z9HA 3QAVA 2C0EA 2IFQB 4MP4A 1A2MA 2LV3A 4ZILA 5B8AA 4EF0A 4ECJA 1DBYA 1B8XA 2YWNA 3MDKA 1WE0A 2LJRA 1YEXA 3F6DA 2WZ9A 5DBQA 1PRXA 2CVBA 2ES7A 3FZ9A 1TK0B 3ZREA 3ZFBA 3G7JA 3KTBA 1TU8A 1FB6A 14GSA 3A2WA 2B7JA 1EV4A 3ZMKA 3QCPA 2H1BA 3GTUA 3HXSA 4V2MA 3VWWA 3D6IA 4POBA 2OADA 5ID2B 3EMPA 3QMXA 1XPVA 3IE3A 1WRYA 1GTUA 4NV5A 5AIVA 4NXIA 2FNOA 4EO3A 3HJPA 2NTOA 3IAM2 2YV7A 3G9BA 1SKWB 3HHVA 4I6XA 4NMUA 2XBQA 3EU4A 1I5GA 1QK8A 1GLQA 2CZ3A 13GSA 3TRPA 5H5SA 4KUNA 3IK9A 2CAIA 2YN1A 2IL3A 1EEMA 1V40A 3TKQA 1GSYA 3TJKA 1GSUA 2OE3A 3ZL5A 2LS5A 1GL8A 4ZBBA 1UC7A 5HR2A 3MNGA 2GVPA 2YJHA 3DXBA 2LRCA 2VCVA 2JADA 4YH2A 2B1LA 1K3OA 2C80A 2FCHA 5B8BA 5J41A 3N5OA 1A24A 4BWSA 2LQOA 2LEGA 3FR9A 3U5RE 5DJMA 3CSHA 4EDZA 3E9JB 2K18A 1B4PA 3IHQA 3M1GA 2GS3A 1V98A 4N0VA 4XS4B 2PMTA 1OAZA 2LNTA 1GP1A 2PERA 3CRUA 3GKXA 1PMTA 2YOIA 2IJYA 1EP8A 4IVFA 3TRXA 1Z6MA 2E2MA 1O7UA 1JHBA 1E6BA 1X5CA 2PPTA 3RAZA 2H75A 3D21A 2P0GA 1OKDA 4LMVA 5ECKB 2B1KA 1EEJA 2VLVA 3M9JA 3UMAA 1AXDA 6GSWA 5IOXA 4N11A 5KN3A 4MZBA 2HFDA 2GDRA 1MDIA 3L9SA 3F8UA 4IQ1A 1ILOA 5JWRB 3RHBA 3GX8A 3I9V2 3GKKA 1R5AA 5AN1A 5AGYA 3DKSA 2XPEA 1FHEA 2NPBA 4L0WA 3TB2A 4G9HA 5C00A 2MMNA 4F0CA 4HEA2 1M2BA 2PVOC 3QAWA 4NHZA 8GSSA 1O85A 3ZFLA 4BWQA 5B6NA 2VCXA 1Q4JA 1TW9A 1U3IA 1FG4A 4KX4A 2YWMA 3APQA 3MAKA 1DUGA 4PXOA 2VOCA 3ED3A 4OFMA 5GAND 1F6MC 1RK4A 1CQHA 4NHWA 4JR4A 5E4WA 2VL2A 2I9HA 4EUYA 4GCIA 1JZDA 4TOPA 4MJCA 3PINA 3SBCA 4DSSA 4TRXA 4AF2A 4J56E 5IPGA 1TJDA 1TK8B 3HY2A 2VL3A 1N8JA 4HZ2A 2J23A 4XRDA 2OE1A 4OO5A 22GSA 1R26A 2DJKA 1GSSA 2BJXA 1XWCA 2OACA 2DJJA 3J7Yb 3ERGA 1OE7A 4F03A 4IGJA 4DEJA 4IHUA 3UEMA 2DC5A 5IMVA 3UL3A 4GWRA 2ON7A 1GNWA 3BJ5A 3UVTA 4ZBDA 1ML6A 2MMZA 3RHCA 1MEKA 4FYUA 4L0UA 3ZZXA 2B6MA 4POKA 3HDCA 4K1FA 2YP6A 3TRQA 1W89A 3PGTA 5IPHA 2IMFA 1B4QA 1USBA 1EV9A 3DGQA 4IBPA 4D73A 2VUPA 4GQFA 4OFTA 3GSSA 2AJQB 2VD1A 2JSYA 5GZZB 2C3NA 2CV4A 1KEBA 12GSA 5IM9A 5C04A 2PWJA 3HZ8A 2QC7A 6GSUA 4MZWA 4JZQA 1Z6NA 2FUG2 3Q19A 3GH6A 3IR4A 5ECQB 2CZ2A 3OR5A 3C1RA 1VRSD 3ME7A 2F8FA 2YWIA 2XHFA 1HYUA 5CRWA 5DALA 4TXOB 2PUKC 1FAAA 5ECIB 1WPIA 3HYPA 1V9WA 4ZL9A 5IOWA 1SKRB 5E59A 1TI3A 2VD0A 2CQ9A 4K0NA 1G6WA 1I9DA 1FO5A 3KTLA 2QGVA 3L9VA 1WMJA 1Y25A 4V1Ap 2H6YA 2XBIA 4WF5A 1EP7A 1K0AA 1PKZA 3P2AA 4XCSA 4EC0A 3FYGA 1OC3A 5ECRB 3F0IA 2GQLA 3LEFA 1GLPA 2AB6A 3GNJA 4XS6A 5KN1A 3TKSE 2IWTA 3F4SA 4HJ2A 2O89A 2OBKA 3TJJA 1O6JA 4ZL8A 1LU4A 3KD0A 5IIZA 3K8NA 2VO4A 4EE0A 2B5EA 2YANA 4I8BA 5D9VA 2RUFA 5HFKA 3KMNA 1Z7RA 5G5EA 2X99A 2FY6A 1YQ1A 1EOGA 3I6AA 1ST9A 2OE0A 3GV1A 1SYXA 2MZCA 2EC4A 1ERUA 4PX1A 5KN0A 3TKSA 4XRAA 4WBJA 1DE2A 3QPMA 5FT3A 3VK9A 5J4UA 2ZUPA 17GSA 1M99A 3LSZA 2VLUA 3GKMA 2V41A 3LWAA 2O87A 1YJ6A 3F3QA 3GHAA 2DJ0A 3QOUA 2R4VA 2X8GA 4RI6A 1Z7PA 1FVKA 5ECLB 4O5RA 4EVMA 4MJAA 3GUSA 3ZRDA 4MPFA 1PA3A 5IMFA 4WR5A 4G10A 4YQUA 3GRXA 2JSZA 2CVDA 1J08A 4K2DA 4LL1B 1URMA 4XS1A 2WRTA 4IELA 4LL4B 3LORA 1THXA 1VGLA 3CXGA 3H8QA 4MF6A 1U6TA 1A8YA 1O73A 2JL4A 4BVYA 4QL7A 2HZEB 4HUAA 4WBRD 3IPZA 2AUVA 3EURA 3H79A 1QMVA 3IK7A 5EY6A 2DBCA 2JZRA 2V2GA 2Z9SA 4JRRA 2VCTA 3PH9A 2HXKA 1YDKA 2VCQA 3HKRA 5DCGA 2O85A 3A5WA 2JZSA 1V58A 2PBJA 11GSA 1Z3EA 1AW9A 2FA4A 5LNKe 3ZYWA 5HR0A 4YQMA 2H0GA 2EIQA 2WB9A 4LA1A 2PU9C 3A2VA 5F05A 4ECBA 1XVWA 1W4VA 2NBSA 5GSTA 5B7CA 5CRGA 2MMOA 5AISA 4EL1A 5A4WA 5H5RA 5IQYA 4V2NA 3Q6OA 3FR3A 4MK3A 2YZUA 1OYJA 5ECPB 4IN0A 2EIOA 4XTSA 5J9BA 3L4NA 2RUEA 5G30A 1PD21 1TRWA 2OKAA 2DMLA 5HFGA 4RQRA 4MA9A 4IJ3A 2A2SA 3W8JA 1PKWA 4MMMA 2L5LA 3GYKA 4JE1A 4PUFC 2I1UA 2IMKA 5G2ZA 3UBLA 3IA1A 2L59A 3ZITA 1HNBA 3A2XA 1R5PA 2YWOA 1ZYQB 4F2IA 1M7TA 1X5DA 3GKNA 2H70A 3I69A 1BJXA 3J7Yk 4ZB6A 1VF1A 1K0BA 3DRNA 1RQMA 4IS0A 3GA4A 3CSJA 1XZOA 3GTUB 2ALBA 3S9FA 2WULA 1PX7A 2R6KA 2D2ZA 4J57E 3UBKA 2LTKA 2H66A 2V1MA 5KEJA 2V6KA 1PSQA 4GSSA 2IMEA 1DSBA 1F3BA 2GSSA 3P7XA 5F07A 2H1DA 2L6CA 1Z5YE 4GSTA 1S3AA 4HS1A 4TR0A 2M80A 3L0HA 2O8VB 2TRCP 1BX9A 1SKSB 2MBTA 1S3CA 3MSZA 4YAPA 1B9YC 4ZXGA 2H01A 1OE8A 3HCZA 1GSEA 4TW5A 1BAYA 1SJZA 1XXUA 2F51A 4HI7A 1TP9A 1J0FA 5J9CA 3TOTA 2C0DA 4JEDA 2H30A 2DJ2A 4DSRA 2LRTA 4F0BA 2H74A 2QKEA 4EKZA 4KAEA 2CX3A 3VPQA 1S3DA 2KLXA 1ERWA 4ILFA 4L8EA 2F3MA 5HFIA 1GSFA 3BCIA 4E8EA 1GTBA 3UARA 2K8SA 3TDGA 2H71A 4OCFA 2B7KA 4CDOA 2YJ7A 1ERVA 3EVIA 4K7IA 4ML6A 1T00A 3GL3A 2KHPA 3QFBC 6GSVA 1EZKA 4MDCA 1TU7A 3ZMLA 4Z7XA 1ZZYA 2H1GA 4RUVA 10GSA 4KSOA 4L5LA 4TN8A 5F0GA 3KXOA 3HVXA 4Q5RA 1G7OA 1JZWA 3M9KA 2V32A 5ECNB 3ME8A 5CRHA 2F9SA 3D4MA 4K6XA 2PVQA 2RM5A 2JZTA 1AAZA 1WOUA 5J3RA 3P90A 3M8NA 2XC2A 4KH7A 1CQGA 1ON4A 4KDYA 2L6DA 1IYIA 3VWUA 2HSHA 3KMOA 1HNCA 5ENUA 3KP8A 4K7NA 4MJEA 2IPAA 4ZB8A 3LJRA 2QSIA 4TKYA 1IYHA 3QAGA 4DVCA 2GZPA 1Y6EA 1GSDA 3CMIA 3D22A 2ON5A 1XIYA 3LFLA 4PUAA 2CT6A 5DQSA 1ERTA 2K8VA 5COHA 3W6GA 1SENA 1U88A 1MTCA 1O8XA 20GSA 1GRXA 2VAFA 1ZOFA 3TJBA 4DSSB 1UN2A 5ECHB 3FHKA 2IMIA 1SK0A 3IDVA 1AIUA 1XVQA 3F3RA 2KOKA 1QXHA 3F4TA 4YAVA 1EGOA 2V6OA 4HQZA 4O7HA 1UA5A 1R7HA 5DJLA 4I5QA 2WJUA 4JU5A 4NV2A 1NHOA 3KJYA 4POMA 3BCKA 3APSA 5L71A 3GIXA 4TR3A 2DJ1A 1HNAA 5LD0A 3UOMA 5ECMB 3CRTA 1T3BA 4K7OA 3KZQA 5J5NA 3EC3A 5JCUA 3F63A 4IP6A 1F3AA 2N5FA 4D73B 2VCWA 5AIXA 2WGRA 5IO2A 1T8EB 3VLNA 1XCCA 1LBKA 2GSTA 2HSYA 3FY7A 1ZGNA 3LG6A 4GTUA 1AQWA 4FO5A 4NPBA 3HA9A 2KP1A 1PL1A 2DMMA 2H8LA 4J2FA 3VPTA 1TOFA 2AAWA 3N9JA 2J9HA 2H19A 2ZCTA 4Q5QA 5DVBA 5ABRA 2GSQA 3NOFA 2HYXA 5D9WA 4KSMA 3ZIJA 1O8WA 1OC8A 2IIYA 2HRNA 5D73A 1BEDA 4MH2A 3IC4A 5DQYA 5DALB 3LXZA 2GQKA 3Q74A 1ACVA 16GSA 4L5OA 1K0OA 3CTGA 4WETA 1AC1A 4G2EA 1SK1A 4KGIA 2C4JA 3KH7A 4XIHA 4GQCA 4Q5NA 2CVKA 2B5XA 3CYNA 4O32A 2WS2A 4IJIA 5IMZA 1OKTA 1JFUA 2RLIA 4ULXA 1PL2A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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