1RW1A

Yffb (pa3664) protein
Total Genus 35
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
114
structure length
114
Chain Sequence
TYVLYGIKACDTMKKARTWLDEHKVAYDFHDYKAVGIDREHLRRWCAEHGWQTVLNRAGTTFRKLDEAQKADLDEAKAIELMLAQPSMIKRPVLELGGRTLVGFKPDAYAAALA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the YffB protein from Pseudomonas aeruginosa suggests a glutathione-dependent thiol reductase function.
pubmed doi rcsb
molecule keywords conserved hypothetical protein yffB
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 35
structure length 114
sequence length 114
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-12-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03960 ArsC ArsC family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1rw1A00
3FEUA 4K6XA 1GUKA 1TRWA 1PRXA 3FZAA 3GNJA 4N30A 1OC3A 5HFGA 4F03A 6GSTA 2V6KA 4ZBDA 4F0BA 4HZ4A 3LXZA 4MA9A 2G0FA 1G6YA 4G9HA 2G2QA 2NBSA 1ZOFA 1VRSD 5IPGA 6GSYA 4KDXA 2ES7A 4GQFA 2M46A 4NMUA 5ECMB 3GX0A 2H0HA 3EMPA 3RAZA 2PPTA 1PSQA 4KDYA 3C71A 3TJKA 1GLPA 1EEJA 1XVQA 1YQ1A 3TKQA 5J4UA 3VWVA 4AF2A 4JE1A 3D5JA 3A2VA 3E3EA 3NIVA 3A2XA 3ERWA 2DLXA 2IFQB 2K9FA 4P3YB 4F82A 3KIJA 1HD2A 3TRXA 2MMAA 3CTGA 2P0GA 2VCXA 4GLTA 5INYA 2H1AA 3DVXA 4DSSA 2YOIA 3A3TA 4JU5A 3APOA 4I2TA 2NTOA 1K3YA 2XC2A 1BEDA 5F0GA 4FYCA 2H71A 4MZBA 4O7HA 3WT1A 1EEMA 2HFDA 3L9SA 4PUFC 5B8AA 2PBJA 4K7OA 2CZ2A 2GGTA 2HYXA 3J7Yb 1O73A 2Z9SA 4KNDA 3IRAA 1YDKA 2JSZA 3IK7A 4NHWA 3Q6OA 2C0EA 2MZCA 3L78A 1BYEA 1G7EA 1QXHA 4MJBA 5CYYA 1X9MB 3GRXA 3P2AA 3TUEA 5D96A 1JZOA 4ZILA 3IXRA 5J9BA 4QL7A 1J9BA 2H75A 4MDCA 3FZ4A 4F2IA 4MH2A 2PWJA 2K18A 4ULXA 1PQNA 5EY6A 2DIYA 4KW6A 3FZ5A 4HJ2A 1J0FA 3KMOA 4XIHA 4XCSA 3GH6A 2KP2A 3EVIA 5GZZB 4HJMA 3WGXA 4WF4A 1KNGA 4RQRA 3GFKA 5D9WA 3FK8A 2LRNA 3D22A 3ZVJD 4K7NA 4XRAA 4XS6A 4PXOA 4MLYA 1A2MA 2EIOA 2ZUPA 3FW2A 4D73B 4PNFA 2VLUA 1XW6A 1PA3A 3UOMA 5IOWA 3ZL5A 2TRCP 1XWCA 2FCHA 2BMXA 3QAGA 8GSSA 2YWIA 4YQVA 4FH8A 3KTBA 2CV4A 3L9UA 3S9FA 3QAVA 2B5YA 1V2AA 2HI7A 3P7XA 1MD3A 2VL2A 4OCFA 1PKZA 4K9ZA 2HRFA 1O7UA 1H75A 2EIQA 3M0FA 3TCOA 3FZ9A 2LV3A 2X8GA 3FKFA 2GSSA 3GN3A 1ZCPA 4V2MA 5GSTA 2IJYA 3ZTLA 1THOA 3P90A 5ID2B 2WCIA 2LKUA 2YP6A 2FWGA 5CRHA 2OBIA 2F9SA 3CTFA 1MDKA 3RHCA 1U3AA 5IQYA 2IMKA 1OKTA 2A2RA 1FB0A 4MMMA 4JR4A 2O8VB 2H6XA 1GUMA 2HNLA 1V9WA 4Q5FA 2K8SA 4POMA 3UBLA 2I9HA 1TKDB 5G2ZA 1V57A 2GZZA 5CP1A 2ZCTA 3D4MA 2QC7A 2OKAA 1NM3A 3VFIA 5B6MA 3UEMA 3MAKA 3TJGA 3W8JA 1Z5YE 3JCML 3HVVA 1AQVA 1EZKA 1AQXA 1OAZA 3IV4A 2DBCA 1GSDA 1BAYA 1FVJA 4WF5A 5J5NA 2VCVA 3F4TA 3HJOA 5DDLA 5EPFA 1ZL9A 1LBKA 3GKNA 4EUYA 1TI1A 1F6MC 3O76A 2PMTA 5A4WA 2L6DA 4L5OA 1AQWA 1ERUA 4FYBA 4BA7A 2VL3A 3TKSE 1ZYQB 2OE0A 5F06A 2GSQA 4JRRA 1DSBA 1A0RP 4L5LA 3ERGA 1A23A 1ERVA 1PKWA 4RI6A 2MBSA 2HE3A 2OBKA 2GS3A 4I97A 3HVSA 3WT2A 4E8HA 2P5QA 1GTIA 1QGVA 4KSOA 3IBHA 2DMMA 3GKMA 1SK1A 2R4VA 2CZ3A 5KN1A 2AHEA 1WRYA 2RM5A 5JCGA 2GTUA 5F05A 3PH9A 2GSTA 2B5XA 2M80A 3GSTA 2LNTA 3D4TA 1UN2A 3BCIA 3ZREA 2N5BA 2L57A 4WXTA 2GT5A 4L0UA 4IQAA 3HA9A 4ILFA 2HSYA 2B7KA 2GQLA 4ISDA 4EF0A 4GSTA 2B5EA 5JCWA 1NHOA 5HFKA 2A4VA 2K6VA 4IQ1A 5IMDA 2B7JA 1EWXA 1SYXA 1U6TA 6GSXA 3GUSA 1G0TA 5ECLB 2XPEA 1GUHA 5IIZA 3HVXA 4KE3A 3VI7A 2OA7A 3EMXA 1E2YA 4YAVA 5A5KA 4KCEA 5E4WA 5JCUA 1X5EA 2JADA 1S3CA 3ZMLA 3GV1A 3DD3A 4QQ7A 1F3BA 4PQ1A 3CMIA 4DSQA 4GF0A 4ZBBA 1TXXA 2MMNA 2A2SA 4JBBA 3KGKA 1MEKA 3TOTA 3RBTA 3QR6A 4HS1A 4PUAA 2VD0A 1M2AA 1YJ6A 4EKZA 4KDUA 1GTAA 3P8WA 3BCKA 3HZ8A 1XBSA 4KSMA 4WBJA 6GSVA 4GRFA 4X0XA 5H5SA 2L6CA 3ME7A 2C3NA 3GHAA 2H66A 1WWJA 3MSZA 5COHA 1DE2A 1JHBA 2H8LA 4MJAA 1FB6A 2H1DA 2CT6A 1ILOA 2YJ7A 5B6NA 2C0FA 4V1Ag 5AN1A 3QDNA 2AYTA 2DJ2A 4G19A 2FGXA 4X1UA 5DQSA 3GIXA 2R2JA 1XZOA 5IMZA 5EL8A 4BWQA 2YV9A 1M7TA 5D9VA 3KZQA 1PL2A 1SJ6A 1F9MA 3GTUA 3ISOA 5G1KA 2DJ1A 1WMJA 1S3DA 5IMFA 4WETA 2I1UA 4IELA 1FW1A 3C1RA 1DBYA 2L4CA 2GVPA 1QUWA 3DVWA 1SL1B 1XIYA 2R3XA 2E0QA 1M2BA 2V32A 3F3RA 1HNAA 2WJUA 4PQHA 1FO5A 2LJRA 2MYGA 5A4VA 4I2UA 3TRQA 3FR6A 2PVQA 3TGZA 3HZ4A 1E6BA 1B4PA 4ML6A 4KCAA 1EV9A 4CDOA 2ON7A 16GSA 2WZ9A 1WP0A 4OFMA 4KAEA 1VF1A 1GWCA 1W89A 4MF5A 1H4OA 4MCUA 1SD8A 2YWNA 3LWAA 3CBUA 3BOAA 4V2LA 4FIWA 2I3YA 1SD9A 1SKSB 3DEXA 1U88A 3DRNA 5ECOB 2MMOA 1IYHA 3M9KA 4HU7A 3WD6A 1FG4A 2CA8A 6GSWA 1TDIA 4XHMA 4I5QA 1K0AA 3TKSA 5HFIA 1KTEA 4TR0A 1SK0A 1TI3A 1Y25A 1T4YA 4LMWA 2YJHA 2H19A 4TXOA 2LQQA 4PURA 1PL1A 2NDOA 5ECSA 1X0RA 5ECKB 4ML1A 4IGJA 3GMFA 2C3QA 2ZNMA 1TJDA 5CRWA 4IP1A 4TR1A 3HD5A 5DALA 4BPYA 4G10A 2C80A 3US3A 2H73A 1M99A 2HZEB 3A5WA 5LCZA 4I6XA 4MPGA 2X99A 6GSUA 3GH9A 3F4RA 4V2NA 5CO3A 1R7HA 2J23A 2L5OA 4HQSA 1TK8B 1GSUA 3EC3A 3NZNA 2FD3A 2GT6A 2FNOA 1C72A 1WE0A 1OC9A 5LNKe 5ECNB 4TRXA 1K0DA 1YEXA 1T4ZA 5CNWA 3MDKA 3VPTA 2VM2A 1GSFA 3GA4A 3C1SA 3M1GA 2P31A 2KHPA 2JZRA 3KH9A 4MP4A 4TKYA 1SENA 5IM9A 3ZZXA 4YQMA 3UBKA 5GAPD 1TW9A 1TP9A 2H6YA 1GTBA 3UL3A 3F6DA 2PU9C 4ECIA 3IPZA 2H72A 2XBIA 3LXTA 5J3RA 2CX3A 1ERWA 1YKCA 3KM6A 2V41A 2E2GA 5B8BA 1WPIA 1GNEA 5C00A 2FHEA 5D9XA 3IE3A 4ECJA 3DYRA 3GYKA 5FWGA 1FVKA 4O92A 3DIEA 1F2EA 4XS4A 1EP8A 14GSA 2LJAA 2L4QA 4AJ8A 2LJKA 3I6AA 2V6OA 3BBYA 2WFCA 3VWWA 2NVLA 3H1NA 2AB6A 1DUGA 1Q4JA 2WRTA 2JL4A 5FHIA 1B9XC 1THXA 3ZFLA 5G1LA 1GTUA 1PX6A 4POKA 2FWHA 4LLRA 2RLIA 4NWYA 22GSA 1B9YC 4GSNA 4HOJA 2H1BA 3PGTA 1VF2A 3H93A 5DVBA 1GSSA 3ZMKA 3K8NA 18GSA 4LL4B 3RPNA 2YV7A 2QGVA 1HYUA 3DGQA 3GTUB 5JWRB 4K7IA 3CRTA 1M9AA 3D0ZA 1J08A 4ZXGA 2HT9A 4MK3A 1RW1A 2DIZA 4HEA2 2RUFA 1N8JA 3C8EA 5G31A 2DJ3A 3DMLA 1F37A 1HNBA 3V1WA 3PINA 1R5AA 3QFAC 4BVYA 4ZB6A 5A4UA 4LA1A 3UJ1A 5AISA 1GSQA 3APSA 1A2LA 3MWHA 4POLA 4NAXA 5H5RA 2OE3A 2H0IA 1X9SB 1ON4A 5D9TA 4Z7XA 4IS0A 2CVDA 5F07A 4F0CA 2O7KA 2FA8A 1TK5B 3DXBA 1DE1A 2B1KA 2FWFA 3KMNA 5ECPB 1A2JA 1K0CA 2PVOC 3Q19A 4MABA 2JSYA 3HJPA 5C04A 4PNGA 2R5GA 2M72A 3L4NA 3HY2A 1UVZA 1O8XA 1M0UA 5E59A 4MZWA 5ECRB 1A8YA 5HR2A 1W4VA 4OFNA 1GNWA 5ABRA 3RHBA 3ME8A 2WULA 3ZYWA 3EINA 1SJIA 5EVOA 2YWOA 2VD1A 3CSIA 1ACVA 2AUVA 5J9CA 2IMFA 3TKPA 3RDWA 5AIXA 3HDCA 4OFTA 1I5GA 1K3LA 3J7Yk 4DSSB 2IPAA 4HUAA 5D8IA 2J9HA 4NV2A 5IPHA 1XWGA 9GSSA 1BG5A 2HZFA 3IOSA 4YH2A 1NSWA 4EC0A 2H1GA 5ECHB 2AAWA 3W6GA 2CX4A 3HKRA 1XWKA 2TRXA 2N5FA 3DWVA 1R5PA 3IK9A 4TR1B 3HYPA 1TU8A 3TJFA 1FHEA 5CAXA 3LJRA 5CRDA 1T8EB 2PERA 2LNSA 4I8BA 4KA0A 2LRTA 1NHYA 1URMA 2L5LA 1PGTA 4MH3A 1ML6A 3A2WA 1WOUA 2HXKA 2C0GA 3F3QA 4BWSA 2P5RA 2JZTA 10GSA 2LEGA 1FOVA 1JLWA 1MD4A 1TK0B 4YQUA 2VCQA 1OC9B 4KB3A 1G6WA 1V58A 1O8WA 3FY7A 1X5DA 4HZ2A 2IIYA 2F8FA 3UARA 4GQCA 2JU5A 3ZVJA 2X64A 3BJ5A 3GURA 2JZSA 3CXGA 6GSSA 3IDVA 1SK2A 1Z6MA 2XPDA 2GLRA 1VF3A 3VURA 2LTKA 2VIMA 1T00A 1AW9A 4N11A 5CREA 5DAKA 5IOXA 1ERTA 2GQKA 1NW2A 4XS4B 3CSHA 3TJBA 4IHUA 4MJEA 3HXSA 3KH7A 4N0VA 4MF7A 3AY8A 3L0HA 5ELGA 1YEPA 1K0MA 7GSSA 2FY6A 1RK4A 5ECQB 4WEYA 2IN3A 2VAFA 2F8AA 2YCDA 3R2QA 4CW9A 2MBTA 1QQ2A 1RQMA 4MF6A 3HJMA 1TRVA 3KP9A 1T1VA 5HR3A 2V1MA 1V98A 3LYKA 2BJXA 1JZWA 4YAPA 1B8XA 2I81A 4LL1B 4L8EA 3C73A 5IO2A 2C8UA 3QPMA 1ST9A 3ZIVA 1WJKA 2VCTA 3O6TA 5L71A 2GZPA 2CVBA 3ZIJA 3FHKA 2DJKA 3TJJA 1SKRB 1QK8A 4NPBA 4WKWA 1JZDA 3ZLPA 3VK9A 1GH2A 1TU7A 2PUKC 3IC4A 3QAWA 2OACA 4GTUA 3ZFBA 2GQMA 3G7JA 3KD0A 2AV4A 3IA1A 4F9ZA 3QOUA 1B48A 3F9UA 5IMAA 4WBRD 1G7OA 5H5QA 1K3OA 2R37A 2F51A 3TDGA 1EP7A 1XVWA 4RUVA 4ZIJA 2CQ9A 4EL1A 2VL2C 4JZQA 2LS5A 1XW9A 5AGYA 1USBA 2CAIA 2WB9A 2QSIA 5KN2A 1K0OA 2VLVA 1KBNA 3TB2A 4ZL8A 4ECBA 4ZBAA 4BL7A 3FYGA 3F6FA 1CQGA 1T3BA 2O87A 3LFLA 3Q18A 1SL0B 1AC1A 3TKRA 3M3MA 5DCHA 3GL3A 5ENUA 4DEJA 3HHVA 2B3SA 1SU9A 5CRGA 4K0GA 4E8EA 2LQOA 1A24A 1OKDA 4EDYA 4KH7A 3GKKA 1IYIA 4TR3A 2GDRA 3G7YA 1HQOA 3OR5A 1X5CA 2DJJA 1S3AA 2KLXA 19GSA 2LRCA 4V1Ap 3N5OA 2BTOT 4GWRA 2DMLA 2IMIA 2N5AA 5DJLA 1ABAA 2VLTA 1M9BA 2K8VA 3ZRDA 3UAPA 2VCZA 4J2FA 1I9DA 2JACA 2QKEA 4BVXA 3H79A 4IBPA 1MTCA 5KN0A 1HNCA 3HCZA 1TRUA 3QMXA 1Z7PA 3H4KA 3VPQA 3M8NA 2GZYA 2WDUA 1XCCA 1AXDA 4OMVA 5G5EA 1YKAA 3M9JA 1VF4A 2VM1A 2YNXA 1YF0A 2HSHA 4KX4A 2H01A 1BQ7A 4IJ3A 3KP8A 2OE1A 2PN8A 5J41A 1WIKA 4OO5A 1K0NA 5DAKB 3CSJA 5G5FA 4MZCA 1O85A 2E7PA 1AAZA 3QCPA 2E2MA 3EYTA 1UC7A 4HQZA 3EU3A 4N0ZA 2H6ZA 1QMVA 2AJQB 3DKSA 4TXVA 4X43A 11GSA 4GCIA 3LYPA 4N10A 4NV5A 3EWLA 3UVTA 2ON5A 3I43A 3KEBA 4OD7A 3UMAA 4J57E 1KEBA 1PX7A 13GSA 4K1FA 4L0WA 4CHSA 2NPBA 5IMCA 2R6KA 3APQA 4IN0A 4H86A 5B7CA 1SKWB 5JWQB 1O6JA 1ZYEA 2IL3A 3GKXA 3LQ7A 2L59A 3WGEA 2FLSA 1YF1A 2VUPA 3KTLA 3D21A 3N9JA 3TRPA 1YZXA 4NHZA 3SWLA 1ZZYA 2C3TA 2KP1A 2REMA 3CRUA 2LUSA 4K8MA 2X8CA 5DQYA 1OC8A 1GLQA 1U3IA 2PGTA 4LMVA 1X9WB 5LD0A 1PD21 4TR4A 2IMEA 3F63A 2DJ0A 1GSEA 5G30A 4Q5QA 1V40A 2VO4A 2GSRA 3GSSA 3W8SA 1EOHA 1XOBA 3KCMA 1TRSA 3LG6A 5F8BA 4DVCA 1Y6EA 2WGRA 3TOUA 4ZL9A 3O3TA 2IMDA 2RIIA 4FYUA 1VGLA 3IR4A 2FWEA 2EC4A 4WR5A 5HR0A 1GL8A 1MDIA 2CAQA 5GSSA 3Q74A 3F8UA 3E9JB 1UA5A 5AIVA 4HI7A 4O32A 1GULA 2VL9A 5DCGA 1OE8A 1BX9A 4ID0A 4OWYA 20GSA 3IAS2 1U87A 2FA4A 4JR6A 1K0BA 4QL9A 1YY7A 5JWOB 1PMTA 4EE0A 1XFLA 2XBQA 1GSYA 1XPVA 1EGOA 2C0DA 3VWXA 4TXOB 2CVKA 4PGTA 4XS1A 2V2GA 4IJIA 3ERFA 1TTZA 1N2AA 4IKHA 3CYNA 4EDZA 3GL5A 4Q5RA 5DALB 2I4AA 1XXUA 2IFQA 1SYRA 4ZL7A 2YANA 3FR9A 2H0GA 1XW5A 1R26A 4WR4A 3IHQA 1JLVA 1LJRA 1OE7A 4EO3A 5DBQA 3G7IA 3F0IA 1M2DA 1B4QA 2C4JA 5KN3A 4AGSA 2OJLA 3D6IA 1XOAA 5KEJA 4O5RA 1XWAA 4K0NA 5D73A 2B1LA 3ZITA 4XTSA 1F3AA 3NOFA 2O85A 3UIWA 2LSTA 4AJ7A 4ACSA 4PQIA 2XHFA 4EXJA 3EE2A 4AJ6A 3MNGA 3VLNA 2HZEA 2H76A 4POBA 4K2DA 3UVHA 2RM6A 1JZRA 4TOPA 3L9VA 2ALBA 2EIRA 2KUCA 4XRDA 2C1YA 1AUCA 3WYWA 5ELAA 3SBCA 3LSZA 1EGRA 2HRNA 4KGIA 2X8HA 5D93A 1PN9A 3KXOA 2VCWA 2TIRA 2YWMA 1O81A 2YZUA 3TKSC 4PX1A 1GRXA 3BD2A 2YZHA 4MPFA 1Z9HA 3LORA 3LGCA 3QD9A 1QFNA 2MMZA 3U5RE 4DSRA 4GXZA 5FT3A 3WGDA 2H30A 5GAND 2RUEA 2YPMA 3E0UA 4IW9A 5IO0A 1EOGA 2B6MA 3PR8A 3FR3A 3G9BA 2DSAA 4ZB8A 2H70A 1EV4A 4D73A 4OCEA 3IAM2 3EU4A 2IWTA 5IMVA 2KOKA 3RPPA 1Q98A 1BJXA 4J56E 4IP6A 2F3MA 1GP1A 5HR1A 2H74A 4KUNA 3VWUA 2HLSA 3GX8A 1LU4A 3ED3A 4Q5NA 1A0FA 4RQXA 4FO5A 3F4SA 3VI5A 17GSA 4JEDA 2D2ZA 3EURA 4EVMA 1A8LA 2FUG2 4OO4A 4NXIA 4IVFA 1AIUA 1TOFA 5ID2A 4TVEA 3H8QA 1Z3EA 1FAAA 1SL2B 3LEFA 3QFBC 1Z7RA 2O89A 4TN8A 3U6VA 5ECIB 4HU9A 3I69A 4MJCA 1ZGNA 4ZB9A 12GSA 2DC5A 1SJZA 4RI7A 2WS2A 5HQPA 2OADA 3C7MA 2VOCA 3FRCA 1JFUA 1Z6NA 4GSSA 1CQHA 1MDJA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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