1S3AA

Nmr solution structure of subunit b8 from human nadh-ubiquinone oxidoreductase complex i (ci-b8)
Total Genus 22
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
22
sequence length
85
structure length
85
Chain Sequence
GLREIRIHLCQRSPGSQGVRDFIEKRYVELKKANPDLPILIRECSDVQPKLWARYAFGQETNVPLNNFSADQVTRALENVLSGKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
publication title The oxidized subunit B8 from human complex I adopts a thioredoxin fold.
pubmed doi rcsb
molecule keywords NADH-ubiquinone oxidoreductase B8 subunit
total genus 22
structure length 85
sequence length 85
ec nomenclature ec 1.6.5.3: Transferred entry: 7.1.1.2.
pdb deposition date 2004-01-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05047 L51_S25_CI-B8 Mitochondrial ribosomal protein L51 / S25 / CI-B8 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1s3aA00
2YV9A 2H01A 3VWXA 1S3AA 3DGQA 1XW6A 4OCFA 4BWSA 1TK8B 1K3YA 3M3MA 5DALA 1ACVA 2JZTA 1JHBA 1G6YA 1O81A 1ZYEA 2AV4A 3ZMKA 1B48A 3BJ5A 2GGTA 1XOBA 4G9HA 1YQ1A 1TRSA 4I5QA 4ZL9A 3UBKA 4KGIA 2JSZA 5J41A 1EWXA 2VCVA 1JZOA 4NWYA 2GZZA 4BL7A 3KEBA 4K7NA 1PA3A 3HVXA 3KCMA 2LQOA 3DYRA 2XHFA 3L9UA 3U5RE 2E2GA 4KA0A 4HI7A 2L6CA 1MDJA 2CVKA 1B4QA 3KH7A 5A4UA 2K6VA 2V32A 4EXJA 4JBBA 4MH2A 2C3NA 3ZTLA 5C04A 2IFQA 1OKTA 2RUFA 3GL3A 1W4VA 7GSSA 3APOA 4ZBDA 1FOVA 1B8XA 1TRUA 4CDOA 3LFLA 2DSAA 3ME7A 4ECBA 2OE3A 5J3RA 5AISA 4YAPA 2N5FA 4XS4B 2KOKA 2L5LA 2HYXA 5AGYA 1O85A 1EP7A 3LEFA 4XRDA 1E2YA 3L78A 4TXOB 2IWTA 3QAVA 1URMA 3W8JA 5DDLA 2H0GA 4TVEA 3SBCA 1M7TA 3GMFA 1NM3A 3TJGA 3IHQA 4ZB9A 2VM2A 4FYUA 2JADA 2R3XA 4KAEA 1N8JA 2XBQA 4BA7A 2H1GA 1FB6A 5J9BA 3F6FA 5FT3A 3C7MA 5FHIA 3UL3A 3VURA 3M1GA 4TW5A 1ON4A 4EL1A 5AN1A 1CQHA 2LUSA 5IMAA 4GQCA 2CVBA 1XXUA 2DC5A 2OKAA 4PQIA 2O85A 3PINA 2OBIA 5JWQB 3A2WA 1XFLA 4ILFA 4ZIJA 4IBPA 4OWYA 3HDCA 3W8SA 1RW1A 11GSA 3WGXA 4K7IA 2IL3A 4L8EA 2IMKA 1WRYA 3GN3A 5KN3A 1Z5YE 4MP4A 3ZRDA 4O7HA 3TJJA 2VOCA 4TKYA 3UBLA 2GQMA 4EDZA 4K7OA 3H4KA 2C0DA 2PERA 2IMFA 3UVHA 5G1KA 3P7XA 1T8EB 3OR5A 3J7Yb 4MPGA 3TJBA 4EF0A 3FZ4A 5ECLB 1OE7A 3GH6A 4OO5A 1JFUA 4K6XA 4FO5A 2LJRA 3VI5A 5JWRB 2I9HA 9GSSA 1DE2A 1X5EA 4L5OA 1EV4A 2DIYA 2FA8A 2DJJA 4PNFA 2E2MA 1SL0B 2BJXA 2GQLA 4RQRA 4BVXA 2MMNA 2N5BA 1ABAA 2B7JA 4AJ8A 2KLXA 1TK0B 2K8VA 3D22A 2B7KA 3LJRA 4WBRD 1GSSA 2H1BA 4MJCA 4PNGA 4OO4A 1MTCA 1TTZA 2WRTA 4I97A 5E4WA 1SJIA 2OE0A 3UOMA 4XIHA 1MDIA 1VF2A 3ERWA 3TGZA 1I5GA 1PQNA 2GDRA 5IOXA 1TDIA 6GSVA 3US3A 1BYEA 2YP6A 4V2LA 1XOAA 2VIMA 4N0ZA 4FIWA 3D4MA 2H0IA 3WT1A 1THOA 3ZIVA 3FY7A 1BQ7A 3E9JB 4HU7A 3FZ9A 3KTBA 3M0FA 2VCXA 4IS0A 1X5DA 4EO3A 1AC1A 4DVCA 14GSA 2H19A 3I43A 1TW9A 2YWNA 1GRXA 4ZXGA 1F6MC 4HU9A 5EY6A 3HZ8A 1A8YA 3GUSA 3GA4A 3SWLA 4LMVA 4MJBA 2H6XA 1G7OA 5DVBA 5HR3A 4BVYA 4PXOA 1TK5B 3TOUA 4KCAA 1N2AA 3HCZA 5CRGA 4HEA2 1GTIA 4GCIA 2I3YA 1EV9A 2IJYA 2RUEA 5DAKB 2H72A 2VCZA 3CSHA 3GNJA 3LWAA 3GURA 5A5KA 3TKSE 4F0BA 3RBTA 13GSA 3F4SA 3P90A 2QC7A 3GSSA 4LMWA 3TJFA 1QFNA 2XC2A 3PH9A 3R2QA 4TXVA 2H30A 3QOUA 4V2MA 4JU5A 3DIEA 3UMAA 1C72A 1UA5A 2NTOA 5CRHA 2PWJA 3UAPA 1BAYA 2LS5A 4BPYA 5DCHA 4WF4A 2CT6A 3GKMA 5D9WA 1OC9B 2X8HA 5B7CA 4IJIA 3G7IA 1Z3EA 1GSQA 3H8QA 5DQSA 3H1NA 5G31A 1M2DA 1T1VA 1AQWA 1O73A 3EE2A 3TOTA 18GSA 2KP1A 5J5NA 1EZKA 3QMXA 4ZBAA 1PX7A 1OAZA 1XWKA 3S9FA 4EUYA 2FWFA 3P8WA 4HUAA 2OADA 2PVOC 4TR1A 1EGRA 3C1SA 3C8EA 2EIRA 16GSA 4OFMA 3LYPA 2KUCA 5DJMA 1I9DA 2JU5A 3N5OA 4MJEA 1J08A 2X99A 1V57A 1GLQA 1FW1A 3TKPA 4EVMA 2WGRA 3MAKA 3DXBA 3HJMA 1GTBA 3G9BA 1JZWA 4KNDA 2V1MA 3MNGA 5DBQA 4JR6A 1PD21 3GKXA 2OJLA 4I2UA 3A2XA 3GX8A 3QD9A 3QFBC 3GIXA 2OA7A 4ML6A 4IN0A 4L0WA 3TB2A 1H4OA 3ERGA 4KDXA 2IPAA 3GSTA 2P0GA 1AXDA 3ME8A 1G6WA 4GLTA 1ZYQB 1ST9A 5IMFA 3CRTA 5ID2A 4GXZA 3GYKA 3DVXA 5EVOA 4I8BA 1NSWA 3EC3A 1BJXA 2B6MA 1ZL9A 3HD5A 2CZ2A 3KMNA 3RHCA 2C3QA 5IMCA 4MA9A 1USBA 2YPMA 3QDNA 1CQGA 1WOUA 3IOSA 4YH2A 2VCWA 2H70A 2O89A 2C3TA 4IHUA 4JZQA 3GTUB 1RK4A 5IMVA 1GSYA 3RAZA 4CW9A 1TRWA 3KXOA 5F8BA 2I81A 4DSSA 4ID0A 1XZOA 4YQMA 4FYBA 3M8NA 2C1YA 5CO3A 3GKKA 3EU4A 3QR6A 2ALBA 1B9YC 1JZRA 1EOGA 1A2MA 1Q98A 4NPBA 2YZUA 5IO2A 3LG6A 2X8CA 1YEPA 4E8EA 5CAXA 3HHVA 1XWAA 1YEXA 4G2EA 3CSJA 5D9VA 5ECNB 3UIWA 1UVZA 3ZVJA 3A5WA 2L57A 4ZB8A 3FK8A 3HJOA 4HOJA 1WPIA 4TN8A 2R5GA 1YDKA 4X43A 3TRQA 3F3RA 2DLXA 1J0FA 4K1FA 1AW9A 1TRVA 1DE1A 2E0QA 4X1UA 2LV3A 3IDVA 4MF5A 2HRFA 5G30A 1SU9A 1DSBA 3ZZXA 1Z6MA 5ECPB 1R4WA 2FWHA 5ECSA 2YJ7A 3TUEA 4HDEA 2HZEA 4WR5A 3QPMA 4IQ1A 2H6YA 1MEKA 2H6ZA 3GFKA 5IMDA 4K0GA 4NV5A 4WR4A 2B5XA 1THXA 2FWGA 5LNKe 5EL8A 1FB0A 4RI7A 1HNAA 3GHAA 1ZZYA 3I6AA 1AUCA 1KBNA 4PX1A 3O6TA 2H71A 2B3SA 5G1LA 3Q6OA 2H8LA 1SK2A 3KH9A 1G7EA 4WBJA 4DSRA 5CRWA 3MDKA 3LYKA 2V2GA 2AAWA 3ZIJA 2LJKA 4TR4A 4K8MA 2XBIA 4XS6A 2JACA 2VCTA 2YV7A 6GSTA 1B9XC 1FAAA 4TR3A 1GULA 3F9UA 4KSMA 1PRXA 1OC8A 2C0GA 4NHZA 1O8XA 5IIZA 5KEJA 1TP9A 5G5EA 2CV4A 1K3OA 1AAZA 3ZVJD 4XS1A 1R5AA 1SK0A 3UARA 5KN2A 4POMA 1WE0A 2PMTA 3EINA 3LXTA 2JSYA 2L6DA 4POBA 2BTOT 5C00A 1NHYA 2LRCA 3D5JA 3C1RA 3FRCA 2OBKA 3BD2A 2R37A 2RIIA 2JL4A 1TJDA 2RM5A 1LBKA 2H73A 3D0ZA 3NOFA 2I4AA 2M80A 2MMZA 2FA4A 1DBYA 1XWGA 4IGJA 1BEDA 3CRUA 1T3BA 4E8HA 1YF0A 4ZL7A 3KD0A 4D73B 3TKQA 2PPTA 3F3QA 3DVWA 1SYRA 6GSYA 4I6XA 3IC4A 3KTLA 1PX6A 4J57E 2QSIA 5ECMB 4IKHA 5G5FA 1F37A 4IVFA 4KW6A 4QL9A 1WWJA 4GF0A 2WS2A 2NBSA 1F3BA 4WKWA 2P5QA 1A0RP 5DALB 2CAIA 4O5RA 3IE3A 3E3EA 4ECIA 4PUFC 2F8FA 3UVTA 5GAPD 4ZILA 1SJ6A 3TCOA 4O92A 1H75A 2NPBA 4IQAA 1Y25A 2LNTA 2IIYA 2PVQA 1SKWB 1U88A 5HFKA 5ECOB 3ZYWA 4HZ2A 2GSRA 1M99A 3WGEA 2X8GA 1XW9A 2B5EA 3IAM2 2PU9C 3H79A 3C71A 2IMEA 4OMVA 1M9BA 1PN9A 6GSWA 1HNBA 2A4VA 2IN3A 3VWUA 1FVJA 1EP8A 2IFQB 4MCUA 1KNGA 2XPDA 3VWWA 5ELAA 3CTFA 1GL8A 2ON5A 2RM6A 2LEGA 4EDYA 3ERFA 2HXKA 1ZOFA 1HQOA 4L0UA 1XIYA 4OFTA 5JCGA 4L5LA 1BG5A 1QUWA 12GSA 1TOFA 1T7PB 4NXIA 4MZBA 1GH2A 2HSYA 4IELA 2GSTA 4V2NA 5HR0A 2H74A 1WP0A 1K0DA 1X9SB 2YWMA 3F0IA 1JZDA 2HSHA 1XCCA 1Y6EA 2GSQA 3HZ4A 3TJKA 3NZNA 3VWVA 1T4ZA 2WFCA 1K0MA 1MDKA 2PGTA 4LL1B 2YOIA 2KP2A 4GTUA 4HJMA 1GNWA 5CRDA 2HRNA 4DEJA 1GSFA 2C0FA 3G7YA 1IYIA 2FY6A 4F0CA 4HJ2A 2RLIA 3P2AA 1OVNA 2LTKA 3ZITA 2LQQA 2G2QA 5GSSA 2VUPA 4GRFA 2A2RA 5D8IA 4EE0A 1TU8A 2FWEA 1K0CA 1QXHA 1V58A 4Z7XA 4Q5NA 3L0HA 3E0UA 2J9HA 1KEBA 5L71A 1U3AA 4LA1A 2IMDA 5F0GA 4XS4A 4JR4A 5CP1A 5FWGA 1A24A 4OD7A 4F03A 3F8UA 5DCGA 3HA9A 4KDYA 1FO5A 1GUKA 3ZREA 2ON7A 5DQYA 2LNSA 2MBTA 22GSA 3HXSA 4RQXA 1VGLA 2L59A 1R5PA 3GRXA 3DEXA 1TXXA 4TXOA 2PUKC 1ILOA 5J4UA 4KDUA 2H76A 4NMUA 1A23A 1YY7A 2N5AA 2FNOA 1Z7PA 2KHPA 4MDCA 2DJ0A 4MF7A 3EWLA 3IAS2 1ZCPA 4WF5A 5CREA 2CZ3A 5D96A 5INYA 2HZFA 2AYTA 1J9BA 2VLTA 3DMLA 3TDGA 4HQSA 2GVPA 3FYGA 5IPHA 2EC4A 1SYXA 2FD3A 4KX4A 3VK9A 4GSNA 2VL3A 4ZBBA 3FR6A 2DIZA 4V1Ap 1UN2A 4GQFA 4LL4B 4MJAA 3IRAA 3CTGA 2TRXA 1JLWA 5D73A 1F3AA 3KP9A 6GSUA 1XVWA 1ERWA 2HNLA 2YANA 2VLVA 3GKNA 3KP8A 2F3MA 5HFGA 1LJRA 2VD1A 1O7UA 4F9ZA 3PR8A 5H5SA 2HE3A 1SJZA 3DD3A 3NIVA 2GQKA 1SKRB 1BX9A 2FLSA 5HR2A 4V1Ag 3GV1A 1EGOA 2K9FA 1QK8A 5GSTA 5GZZB 2MZCA 2CA8A 3GL5A 1U6TA 3VI7A 2WB9A 1EEMA 1K0AA 1K3LA 5G2ZA 5HQPA 2CQ9A 1HNCA 4F82A 2FUG2 5KN0A 2H1DA 3N9JA 4QL7A 1AQXA 5IM9A 2GZYA 3DRNA 2V6OA 2V6KA 5F05A 5HR1A 1EEJA 4OCEA 4YQVA 3WYWA 3F4RA 1S3DA 4K0NA 1PMTA 3KMOA 2M72A 4OFNA 3L9SA 3LGCA 1XVQA 3BCIA 3D6IA 2MYGA 3CYNA 3A2VA 3Q19A 2A2SA 2CX3A 3KGKA 3I9V2 5D9XA 1GNEA 4GWRA 4YAVA 20GSA 2EIQA 1SL2B 4AJ6A 3RPNA 4PQ1A 1RQMA 4POLA 2DJ3A 2WJUA 3MWHA 4PUAA 3KJYA 1B4PA 4XCSA 3BBYA 4KB3A 2GT6A 1S3CA 5ECIB 5CYYA 3IV4A 1VF3A 2C80A 1GUMA 3M9JA 1FHEA 5H5QA 2BMXA 3GH9A 3ZFLA 3FHKA 3ZL5A 2L4CA 2H75A 2FCHA 1AQVA 4K2DA 1FG4A 1Q4JA 1OC3A 4X0XA 5ELGA 2ZUPA 1A0FA 2X64A 2LKUA 5EPFA 3L4NA 2PBJA 2IMIA 4FYCA 5D9TA 5F06A 4IP1A 2OE1A 3KZQA 3CXGA 1HYUA 1XW5A 2VAFA 3VFIA 2MMOA 2LSTA 2YN1A 2LRNA 2F51A 3AY8A 1ZGNA 4TR1B 3TKRA 5ECKB 4JEDA 3RPPA 3Q18A 1SL1B 5F07A 3QAGA 1V9WA 4N0VA 1T00A 5DAKA 4ACSA 3HVVA 3D4TA 3IK7A 2J23A 4NV2A 3APQA 4ECJA 5JWOB 3C73A 1V2AA 3DWVA 3MSZA 5JCUA 1IYHA 4N30A 1U3IA 3HJPA 2MMAA 3J7Yk 2R4VA 3CSIA 4IW9A 3G7JA 3KM6A 1V40A 2VL2A 3FEUA 4FH8A 4JRRA 1M2BA 4PURA 3CMIA 2Z9SA 3EURA 2O87A 1K0NA 4JE1A 2DBCA 5B6NA 3HKRA 5LCZA 2CAQA 2FGXA 1O6JA 4TOPA 1OC9A 1TI1A 17GSA 3GX0A 1WIKA 2C4JA 1KTEA 3LSZA 5GAND 2GSSA 1GTAA 2YNXA 4NHWA 2FHEA 1F9MA 1GUHA 2YCDA 2R6KA 3TKSC 4H86A 5ID2B 2D2ZA 3EYTA 3L9VA 3DKSA 4GSSA 3UJ1A 1MD4A 2YWOA 2P5RA 5COHA 2I1UA 2V41A 2C0EA 4MH3A 1F2EA 4ECCA 5ECRB 1QGVA 5DJLA 4MABA 2VL9A 4Q5QA 3TRXA 2YZHA 2QKEA 3IA1A 3FR9A 1GP1A 5J9CA 1T4YA 5IPGA 1O8WA 4WXTA 4KH7A 1LU4A 1SENA 1U87A 3EVIA 1GSUA 1TI3A 4IJ3A 1VF1A 3LXZA 1K0OA 5IOWA 3ED3A 4IP6A 2DJ1A 3F63A 1GSEA 4DSSB 4KUNA 4J56E 4WEYA 2P31A 2MBSA 2VD0A 1EOHA 5IQYA 3WD6A 4Q5RA 4J2FA 4RUVA 5IO0A 3CBUA 2AJQB 2DMLA 4HS1A 2WCIA 1YZXA 1YKCA 3O76A 3VPQA 1WJKA 4N11A 5B8AA 2XPEA 4KE3A 3O3TA 3H93A 2TIRA 2GTUA 2NDOA 4RI6A 2E7PA 3VLNA 2B1KA 2JZSA 1ML6A 1WMJA 2CVDA 1QQ2A 3WGDA 5JCWA 3F6DA 2ZCTA 5E59A 4HZ4A 3TRPA 10GSA 3ISOA 1TU7A 1A2LA 4G10A 5ABRA 1ERVA 1E6BA 3Q74A 3U6VA 1SD9A 3QFAC 4AF2A 3LORA 4MZCA 4AJ7A 4AGSA 4MPFA 1XWCA 3RHBA 2H0HA 4XTSA 4N10A 2JZRA 3GTUA 1NHOA 2WULA 2VL2C 1YJ6A 4XHMA 1X5CA 2HZEB 4BWQA 1A8LA 4MLYA 4YQUA 2H1AA 2L5OA 3JCML 2H66A 4ZB6A 2AHEA 4P3YB 4PGTA 3BCKA 3W6GA 1PL1A 1PKWA 2VM1A 5A4WA 8GSSA 3ZLPA 1X9MB 5D93A 2K8SA 2DJ2A 1JLVA 3IPZA 5CNWA 1PSQA 4XRAA 4HQZA 4PQHA 1XWBA 3IK9A 4POKA 5LD0A 1UC7A 1SKSB 2LRTA 1R26A 3F4TA 5AIVA 4G19A 1AIUA 1OKDA 4ZL8A 1K0BA 2OACA 2K18A 1XBSA 1NW2A 1OYJA 2B5YA 3EMXA 4MMMA 1XPVA 3K8NA 2O7KA 1VF4A 4TRXA 4NAXA 3FKFA 3M9KA 2GZPA 3IBHA 2GLRA 2C8UA 3EMPA 4ISDA 3V1WA 2R2JA 3A3TA 1Z6NA 6GSSA 2HFDA 1G0TA 4K9ZA 4TR0A 2WDUA 4EC0A 2YWIA 3QAWA 2TRCP 4MK3A 2HLSA 3FZAA 3ZFBA 1TKDB 1R7HA 2LJAA 2AUVA 1YKAA 2F9SA 1YF1A 1PGTA 1PKZA 5AIXA 2ZNMA 5B8BA 5B6MA 1X0RA 4WETA 3ZMLA 5A4VA 1OE8A 1ERUA 1M2AA 3WT2A 5H5RA 1GSDA 1GLPA 4ML1A 1SD8A 1GWCA 3HVSA 1M0UA 4KCEA 4Q5FA 2NVLA 2YJHA 1MD3A 2L4QA 2B1LA 3QCPA 1ZMAA 2GT5A 3IR4A 1FVKA 3UEMA 4F2IA 2WZ9A 4O32A 1Z9HA 3HY2A 3RDWA 6GSXA 3PGTA 4GSTA 19GSA 2REMA 1VRSD 1Z7RA 2O8VB 2DJKA 1X9WB 1DUGA 2VLUA 2CX4A 5HFIA 1HD2A 2GS3A 3BOAA 3KIJA 1SK1A 2PN8A 2QGVA 2F8AA 1QMVA 5ECQB 1A2JA 2AB6A 4KSOA 4I2TA 5KN1A 5IMZA 1GTUA 5ENUA 3FR3A 5ECHB 2HI7A 2VO4A 3EU3A 4CHSA 3VPTA 1PL2A 1W89A 4QQ7A 2DMMA 4MF6A 2M46A 4EKZA 4D73A 1V98A 3APSA 3I69A 2EIOA 1M9AA 3LQ7A 3TKSA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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