1S3AA

Nmr solution structure of subunit b8 from human nadh-ubiquinone oxidoreductase complex i (ci-b8)
Total Genus 22
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
22
sequence length
85
structure length
85
Chain Sequence
GLREIRIHLCQRSPGSQGVRDFIEKRYVELKKANPDLPILIRECSDVQPKLWARYAFGQETNVPLNNFSADQVTRALENVLSGKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The oxidized subunit B8 from human complex I adopts a thioredoxin fold.
pubmed doi rcsb
molecule keywords NADH-ubiquinone oxidoreductase B8 subunit
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
total genus 22
structure length 85
sequence length 85
ec nomenclature ec 1.6.5.3: Transferred entry: 7.1.1.2.
pdb deposition date 2004-01-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05047 L51_S25_CI-B8 Mitochondrial ribosomal protein L51 / S25 / CI-B8 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1s3aA00
2FWEA 3WT1A 5G30A 2F8FA 2J23A 1OE7A 3FY7A 3H93A 4KSMA 3IAS2 2CAQA 4TW5A 2FWGA 4OO4A 4D73B 2TRCP 2B5EA 1F3BA 5ID2B 4F2IA 4TR1A 5D8IA 1EZKA 2VCQA 2MMZA 1T8EB 2PMTA 3ERFA 3TOUA 2GDRA 3RDWA 1M7TA 3G7YA 1MDIA 20GSA 4MJBA 1W89A 1R7HA 2YJHA 2FA8A 2H0GA 2OACA 2GSTA 5CYYA 3VPQA 3F4TA 3S9FA 2R3XA 1YF0A 4HS1A 2ON5A 1Z6NA 2LUSA 4FYBA 2GSSA 1Z9HA 2YJ7A 4V1Ag 4RQXA 2CT6A 2H1GA 1JZRA 4K0NA 2PWJA 4MH2A 3QAWA 3TJBA 2C3NA 2GQKA 3EE2A 5JWOB 5F0GA 5AGYA 4XS4A 1A2MA 1EV4A 1GSEA 2O89A 3GA4A 2C0GA 1GSYA 1VF1A 1OVNA 1N2AA 2DIZA 2ES7A 4MZWA 4KDXA 1PQNA 1ZMAA 2H72A 3KMOA 4L0UA 4I97A 4TR1B 1FOVA 2JSZA 5AIVA 5DVBA 3ZREA 2F51A 1XVWA 3EMXA 1THXA 3FR3A 5ECRB 1XWKA 1A0FA 1VF3A 1VRSD 1DUGA 2YWNA 13GSA 3Q74A 2TIRA 2AYTA 3E9JB 3LXZA 4JR4A 1MD3A 3KIJA 2IIYA 3UMAA 1YQ1A 3M1GA 1H75A 3KTBA 3TKRA 5DCHA 5IO0A 3VWWA 1KTEA 1GRXA 1WIKA 2X99A 4GTUA 3WGEA 2DJ3A 3J7Yk 4XS4B 3ZLPA 2VL2A 3ZIVA 1QFNA 3A2VA 4FO5A 1Z7RA 5A4VA 4DSQA 2XHFA 4KH7A 5IMAA 3IK9A 3UVTA 1ERVA 4N0VA 4GF0A 1WRYA 2WS2A 4OD7A 3CXGA 2YV9A 1VF4A 1JZOA 4KW6A 2LJRA 1TRVA 1Y6EA 3BCKA 1SYXA 2IMEA 3MAKA 1ERTA 4PQHA 3RHBA 6GSSA 5CAXA 5HR3A 10GSA 1G6YA 2X8HA 1TDIA 3LWAA 2XBIA 2AJQB 2NPBA 5LD0A 3GH9A 4L5OA 3BD2A 1V9WA 4PQ1A 2I4AA 1NM3A 2PN8A 1AQXA 1TP9A 1BJXA 4WF4A 3W8SA 2RM5A 4PXOA 2HRNA 1T1VA 5B6NA 3HXSA 4MJAA 2N5AA 2PVOC 1OAZA 3GNJA 4WR4A 1O85A 3KD0A 3WGDA 4V2LA 2YNXA 5CRGA 5ECQB 3L9SA 2GSRA 5CRHA 2HE3A 3GTUB 3O6TA 4MPFA 1FVKA 3WT2A 2L4QA 2GT5A 2KP2A 3CSHA 3VK9A 3ERWA 5D9TA 3GSTA 5IMFA 2IMFA 1A23A 1IYHA 2K9FA 2H6XA 3DRNA 3LQ7A 1URMA 3KH9A 5C00A 3FEUA 1JLWA 1A24A 5ELAA 1CQGA 2FGXA 1QUWA 2AAWA 2WJUA 3E3EA 4ISDA 1R5AA 3N9JA 1GUKA 1RK4A 2ON7A 3A2WA 3CBUA 2JADA 3LSZA 1O73A 1FAAA 4ZL9A 3WD6A 2C3QA 4FYUA 4L8EA 2O8VB 2WDUA 1I9DA 1FHEA 5FT3A 2WCIA 1GULA 3HVXA 5IIZA 5C04A 3F4SA 4K7OA 3AY8A 1PA3A 1FVJA 1R26A 22GSA 2FWHA 2BJXA 4ZILA 5HR0A 1XW9A 3APOA 3KEBA 2RM6A 4BWQA 1AQWA 3TRPA 2VD0A 3TB2A 3GUSA 3LG6A 1UA5A 5HFKA 1JLVA 4RI7A 2VM1A 2H6YA 4OFTA 1TI1A 3C1RA 1XWBA 4QL9A 3A2XA 3KZQA 4AJ8A 3IV4A 1X9SB 4JZQA 4IKHA 2F8AA 3GV1A 4KA0A 2R6KA 18GSA 5ECIB 4TKYA 4V2NA 4K2DA 4NXIA 2QKEA 3TJKA 1HYUA 2LJAA 1PX7A 2A2RA 3GKNA 4TVEA 4MJCA 1H4OA 4NMUA 1SD9A 5F06A 3IAM2 3L78A 3LGCA 3VLNA 2H75A 4EF0A 3ISOA 4GXZA 1VGLA 2KOKA 1XFLA 3KTLA 1E2YA 1EEMA 2GT6A 4F0CA 2YV7A 1J9BA 3DGQA 3VPTA 2C80A 4QL7A 1EOHA 2B1KA 3CTFA 2NDOA 4BL7A 1GH2A 4O92A 3ZYWA 3ME7A 1AW9A 1AXDA 3TGZA 3PR8A 1ON4A 2H76A 2O87A 3O3TA 2OE3A 2DJ0A 2H1AA 2WULA 2LRTA 2B5XA 5KN3A 2CX4A 4ECCA 2D2ZA 4K8MA 2BTOT 5G5EA 4MMMA 2O7KA 2EIOA 4FH8A 3RPNA 5LCZA 2MBTA 3P7XA 3U5RE 5AIXA 6GSWA 2HYXA 1B9YC 3GKKA 1XIYA 3HY2A 17GSA 2H19A 8GSSA 1GP1A 2J9HA 2VLVA 3QDNA 2OA7A 1AQVA 2V2GA 2LEGA 1K0CA 3QFBC 4ULXA 5F05A 3SWLA 5A5KA 1WWJA 2I9HA 2VIMA 5CNWA 1T00A 2DMMA 2Z9SA 2JZRA 5JWQB 4G19A 3FW2A 4I5QA 5LNKe 2CA8A 4K0GA 1O8WA 5A4UA 2RIIA 4MDCA 4NWYA 2GVPA 4DVCA 4HJMA 1JZDA 2H1DA 4EKZA 2MMNA 1XOBA 3KXOA 3F9UA 2XBQA 1ZYEA 1OKDA 1TOFA 3W8JA 2REMA 3GFKA 2HZFA 3F4RA 4IBPA 1BEDA 2N5BA 1Q98A 3M9JA 3O76A 4FYCA 2PPTA 4MF5A 4YQUA 1HD2A 3UBLA 1TU8A 3VWVA 2LSTA 1V98A 1B48A 5HFGA 3PH9A 1GLQA 1OC8A 2OBKA 2FCHA 2L5LA 4EUYA 4KDUA 1DBYA 2VL3A 3D22A 3MWHA 1ILOA 5B7CA 4Q5QA 3VI7A 4H86A 3LORA 5JCUA 3KJYA 4XCSA 4XRDA 3EMPA 3FR9A 2GS3A 1S3CA 3TRQA 1M0UA 3C1SA 1U3AA 4IQAA 1K0DA 3GX8A 3TKSE 4O7HA 2PGTA 1XW6A 1B9XC 4HZ2A 3ME8A 2VCXA 5EVOA 5F8BA 1FW1A 1C72A 4PURA 3FHKA 5KEJA 1T3BA 2XPDA 3L9VA 3UJ1A 1SD8A 3DVXA 1TJDA 3ZMLA 5H5SA 2H6ZA 3VWUA 5JCWA 4YAPA 5H5QA 2GGTA 3UBKA 3CTGA 2CVBA 1ZOFA 1PX6A 5EL8A 3ZFBA 4X43A 3QR6A 1IYIA 5DAKA 6GSVA 3IK7A 3L4NA 1WMJA 5J9BA 1MD4A 3LYKA 3PINA 1LJRA 3EU3A 4IQ1A 1XPVA 3QPMA 1BQ7A 4MABA 5ECLB 3NIVA 4OWYA 3IHQA 4XTSA 3LXTA 2HLSA 4EDYA 2H0IA 4HI7A 1YDKA 3GN3A 4BVXA 4TR0A 1USBA 3ZMKA 4F9ZA 2I1UA 2C0EA 3IC4A 2JZTA 4J57E 3L9UA 3UOMA 3CSIA 3I43A 3GKXA 5CP1A 2LNTA 3UARA 4K7NA 1R4WA 4KGIA 2WRTA 4GWRA 1SU9A 1U6TA 1OE8A 5G1LA 11GSA 2O85A 1ZCPA 4RI6A 5ECKB 3HVVA 3EINA 1JFUA 2N5FA 1KBNA 1FB6A 3NOFA 4N0ZA 2WFCA 1FO5A 2CZ3A 2WB9A 4GQCA 1WJKA 3FK8A 4IS0A 5DAKB 4Z7XA 1E6BA 1S3AA 4EDZA 1XOAA 4NV2A 5B8AA 1ML6A 3GTUA 3DKSA 4AF2A 4NV5A 4PNGA 3FZ5A 1K3OA 4MA9A 2X8CA 5H5RA 1O6JA 3D6IA 1OC9A 3EC3A 7GSSA 4K9ZA 1G7OA 3GYKA 3EURA 1M2BA 2HZEA 2KLXA 1UVZA 4PGTA 1BAYA 1TRWA 2A2SA 3LJRA 4YH2A 1TXXA 4WETA 4I6XA 2E2MA 4I8BA 2FWFA 3I9V2 2H73A 2ALBA 2E0QA 3TKSC 3QAGA 2YCDA 3MNGA 3DVWA 4KCAA 2CV4A 4Q5FA 3I6AA 2EC4A 3A5WA 3UEMA 2VCVA 3SBCA 3P90A 3CSJA 4POMA 2MBSA 2GSQA 1K0AA 1PMTA 2JL4A 1XWGA 4EXJA 3ZTLA 3F8UA 4LLRA 1DSBA 5J3RA 2IL3A 5DDLA 2ZCTA 2RLIA 3IA1A 1YKCA 5B8BA 1QK8A 4POLA 12GSA 2VD1A 3Q18A 1GSQA 5JCGA 1M9BA 3EYTA 1XVQA 4WF5A 2AHEA 1SJIA 3VFIA 5IMCA 1X5DA 2B7JA 5DALA 3TUEA 3LYPA 3H4KA 4TXOA 2R2JA 3M9KA 5DCGA 2RUFA 3HVSA 4ZIJA 1FG4A 3IPZA 4V2MA 2KUCA 4ZL7A 3A3TA 3WYWA 3TJJA 5INYA 1PN9A 5IMDA 1M2DA 3J7Yb 4TN8A 3C7MA 1OC9B 5D9WA 3QOUA 2H1BA 4YQMA 1ACVA 5IO2A 2HZEB 4TRXA 1ERWA 4G2EA 2LRNA 1HQOA 2KHPA 3EU4A 3GL5A 4KAEA 2IMIA 4JEDA 2FLSA 4IHUA 3ZVJD 3HDCA 1MDJA 4WBJA 1CQHA 5A4WA 1GTUA 4HOJA 4HZ4A 1XWCA 1EWXA 2B3SA 5JWRB 2G2QA 1QMVA 1GL8A 1GUHA 2P0GA 5E59A 1VF2A 1Z5YE 2FHEA 1TTZA 1GSSA 2R5GA 2JSYA 5D96A 9GSSA 2YZUA 6GSUA 4XHMA 4MZCA 1EP8A 1AIUA 2YP6A 2YWOA 2B7KA 2A4VA 1T4ZA 4HJ2A 1Y25A 5DALB 4ZB6A 1Z6MA 1G7EA 2AB6A 3KCMA 2WZ9A 1U88A 4CDOA 4TXOB 6GSTA 2LV3A 3PGTA 1X9WB 1ST9A 2M46A 16GSA 1W4VA 4E8HA 2NVLA 3GRXA 4OO5A 3CRUA 1T4YA 5GSTA 3IRAA 1KEBA 4WXTA 4EO3A 3R2QA 2GZPA 1TK8B 1PKWA 3CMIA 2IFQB 2VUPA 1GNEA 1X0RA 4XRAA 1F2EA 4HQZA 2LKUA 3GMFA 2M80A 5DJMA 3HYPA 4ZBDA 6GSYA 1AC1A 2HXKA 3K8NA 4KE3A 4TOPA 2JU5A 4EVMA 2TRXA 5D9VA 4ECIA 5D73A 1F37A 1ZYQB 2PBJA 2C8UA 1U87A 2VCZA 2VL9A 2H0HA 4V1Ap 1TRSA 3V1WA 3Q6OA 1K3YA 4IN0A 4LL1B 5IOWA 1S3DA 2DIYA 4GQFA 4BVYA 5CO3A 3C8EA 2YOIA 2MMOA 3ZIJA 1WP0A 1GUMA 5L71A 1UC7A 4KSOA 1NW2A 1AAZA 4N30A 3QMXA 5G31A 4J2FA 4BA7A 2HI7A 2L59A 2IPAA 4MH3A 2X8GA 2H01A 1XCCA 3ZVJA 5GZZB 3TJGA 3D4MA 3KGKA 3TCOA 4WEYA 4PUFC 4NPBA 2HSYA 5IMZA 4KCEA 4MZBA 2OJLA 4N11A 2YZHA 2QGVA 2CAIA 4HEA2 1DE2A 3OR5A 1F3AA 3D4TA 3FR6A 2VL2C 1R5PA 4JR6A 4MP4A 2L4CA 5E4WA 4O5RA 1O7UA 5DQSA 3QAVA 4KDYA 4WBRD 4DEJA 2MMAA 3IE3A 4K1FA 2VO4A 2L6DA 5G2ZA 3RBTA 3DWVA 1ABAA 1M99A 2LQQA 4NAXA 4IJ3A 2R37A 4QQ7A 4Q5RA 4LL4B 5J4UA 3D5JA 1BYEA 3UL3A 3M8NA 1OC3A 4L0WA 4IJIA 5J5NA 5KN0A 4F0BA 4X1UA 2L6CA 1PSQA 3HJMA 1YEXA 5DQYA 3G7IA 1WPIA 1BX9A 3APQA 3LEFA 4F03A 3GSSA 1V40A 4Q5NA 3UAPA 1A0RP 4IP1A 3WGXA 4GSNA 5J41A 4OCFA 3IR4A 4HU9A 1QQ2A 1YJ6A 2HFDA 1EEJA 3KM6A 4N10A 2EIQA 2DJ1A 5ECHB 2CQ9A 2OE1A 1XW5A 3G9BA 2PVQA 5COHA 4TR4A 4HQSA 1MEKA 4IVFA 3GURA 5F07A 4HDEA 1ZZYA 1LBKA 2QC7A 1B4QA 5ECOB 2CVKA 5G1KA 2L57A 2LTKA 2KP1A 1TW9A 2L5OA 4WKWA 3UIWA 4CW9A 3M0FA 3DMLA 2ZUPA 4IW9A 4TXVA 3F3RA 1XBSA 1F9MA 4HUAA 3P2AA 1PRXA 4ILFA 3ERGA 4MF7A 4XIHA 3DEXA 1GWCA 4GSSA 3TRXA 4K6XA 1SL2B 2DBCA 5IM9A 3ZZXA 3IXRA 4J56E 1X9MB 3FZ4A 1HNBA 2CX3A 5GAND 5ECMB 4EE0A 1X5EA 2YWMA 4AGSA 4ID0A 3RAZA 2VAFA 4JRRA 4RUVA 4EL1A 1EV9A 5ABRA 2C0FA 2DJJA 1TKDB 3E0UA 3F6FA 5HFIA 1EOGA 1SENA 5IPHA 5GSSA 4NHZA 1JHBA 2H70A 4GSTA 2VCTA 1EGRA 1AUCA 1XXUA 1K3LA 2E2GA 2RUEA 3TJFA 2YPMA 1SKRB 3HZ4A 3TOTA 4G9HA 3GKMA 2FY6A 3D21A 2LQOA 1ERUA 4GCIA 1YZXA 3HJPA 2OADA 3DXBA 2V6KA 2FA4A 1K0MA 5HR2A 3QFAC 1J08A 2GZYA 2JACA 1O8XA 3IOSA 4GRFA 2P5QA 4RQRA 3FRCA 1I5GA 4ZBAA 3US3A 4BWSA 4L5LA 3CRTA 3UVHA 2LRCA 5DBQA 1YEPA 3ED3A 2DLXA 3GHAA 2IMKA 4KB3A 3APSA 1RQMA 1V58A 4P3YB 4MCUA 3EVIA 1B8XA 1V2AA 2YWIA 3LFLA 1F6MC 2IJYA 5ELGA 5GAPD 3HCZA 5KN2A 1SKWB 2E7PA 2MZCA 4IELA 1TU7A 5ENUA 3M3MA 4OCEA 1EGOA 4AJ7A 2IMDA 3IDVA 3G7JA 2OKAA 1Z3EA 1GTAA 1YF1A 2XC2A 4ZB9A 5HQPA 2C3TA 3C71A 1M2AA 3FKFA 2LJKA 4AJ6A 4ECJA 3KP8A 2H74A 1EP7A 4ML1A 4GLTA 1OYJA 4G10A 1MDKA 3CYNA 4X0XA 2NBSA 4XS6A 4LMWA 1PGTA 2IFQA 5IPGA 1GTBA 3H79A 1K0BA 3FZ9A 4LMVA 6GSXA 5IMVA 1YY7A 3BJ5A 4KUNA 5KN1A 3ZL5A 4PX1A 2EIRA 2VOCA 3BCIA 3FZAA 3KH7A 1UN2A 4IP6A 1JZWA 1V57A 4BPYA 2NTOA 3ZRDA 5ECNB 1U3IA 2IN3A 1MTCA 1B4PA 1HNAA 1DE1A 2DJ2A 3P8WA 3VURA 1ZGNA 3FYGA 1GTIA 4OFNA 3RHCA 1XWAA 2MYGA 3GH6A 2K6VA 1PKZA 3TKPA 2DJKA 3TDGA 4JBBA 1M9AA 4MF6A 4ML6A 3I69A 3U6VA 2PERA 4ZXGA 1PL1A 3HKRA 2B1LA 5DJLA 2V1MA 2P31A 4O32A 4ZB8A 2PU9C 2QSIA 4PNFA 5D93A 4DSSA 1NHYA 4YAVA 1J0FA 2DC5A 5ECSA 3VWXA 4EC0A 2CVDA 5B6MA 3GL3A 3QD9A 1X5CA 4ACSA 5EY6A 4HU7A 3D0ZA 2H8LA 2G0FA 3Q19A 4WR5A 1A2JA 4KX4A 3DIEA 4MJEA 4F82A 3NZNA 2K18A 4IGJA 1SK1A 5AISA 4CHSA 1BG5A 5FWGA 2M72A 2V6OA 3KP9A 4YQVA 3F6DA 3KMNA 2LNSA 2F3MA 2GQMA 2FUG2 2H30A 1HNCA 1FB0A 5J9CA 2OE0A 1WE0A 2LS5A 2IWTA 3C73A 4ZBBA 2VLUA 1TK0B 4POBA 1KNGA 2WGRA 3MDKA 2C0DA 1GLPA 5IOXA 4I2TA 2DMLA 2I81A 2FNOA 2F9SA 2GLRA 1QXHA 4LA1A 1SJ6A 3QCPA 4POKA 4DSSB 4OMVA 2OBIA 2DSAA 3GX0A 2HNLA 5HR1A 3RPPA 2B6MA 3VI5A 1TK5B 1G6WA 3W6GA 2VLTA 1SK0A 1SK2A 5D9XA 4JE1A 1GNWA 5AN1A 4MK3A 2V32A 3DYRA 1ZL9A 3L0HA 3MSZA 3F0IA 4PQIA 1YKAA 1G0TA 2PUKC 1WOUA 2I3YA 3F63A 2HRFA 5CRWA 2C4JA 1TRUA 1GSUA 3H1NA 5ECPB 2YANA 2GTUA 1NHOA 2R4VA 3BBYA 3ZFLA 1A8LA 2H71A 1A8YA 1SKSB 4MPGA 1QGVA 1SL1B 1SJZA 2AUVA 2ZNMA 1NSWA 1SL0B 3TKSA 5IQYA 1RW1A 4NHWA 2B5YA 4E8EA 4ECBA 3N5OA 4K7IA 1K0NA 4D73A 3IBHA 1T7PB 2JZSA 1GSFA 3JCML 5ID2A 2GQLA 2HT9A 4DSRA 1A2LA 2H66A 4XS1A 3ZITA 2AV4A 3HJOA 2HSHA 19GSA 1O81A 1TI3A 14GSA 1N8JA 1THOA 2X64A 2VM2A 2K8VA 3H8QA 1PD21 1Z7PA 5CRDA 1SYRA 1OKTA 2YN1A 3TKQA 4I2UA 2BMXA 3HA9A 1GSDA 1PL2A 5EPFA 2V41A 3EWLA 4ZL8A 5G5FA 2CZ2A 3HHVA 3GIXA 2GZZA 1XZOA 1Q4JA 3HZ8A 5CREA 2P5RA 2VCWA 4MLYA 1K0OA 4JU5A 2K8SA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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