1SENA

Endoplasmic reticulum protein rp19 o95881
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
134
structure length
134
Chain Sequence
LGKGFGDHIHWRTLEDGKKEAAASGLPLMVIIHKSWCGACKALKPKFAESTEISELSHNFVMVNLEDEEEPKDEDFSPDGGYIPRILFLDPSGKVHPEIINENGNPSYKYFYVSAEQVVQGMKEAQERLTGDAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Endoplasmic reticulum protein Rp19
rcsb
molecule keywords Thioredoxin-like protein p19
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Homo sapiens
total genus 43
structure length 134
sequence length 134
ec nomenclature ec 1.8.4.2: Protein-disulfide reductase (glutathione).
pdb deposition date 2004-02-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13899 Thioredoxin_7 Thioredoxin-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1senA00
4X1UA 1TRVA 3D5JA 2CVKA 3D0ZA 3E3EA 2DC5A 4ZBAA 3ED3A 2VO4A 4WEYA 2H8LA 5A4UA 2IL3A 1W89A 3QMXA 4RI7A 2DJJA 4QL9A 2GSRA 1O81A 3TJKA 5HR0A 2MMAA 3BJ5A 4POBA 1ZOFA 5ABRA 13GSA 1FHEA 3LSZA 4TVEA 1OKTA 1EOGA 2GSTA 4IELA 4EL1A 4I8BA 2PBJA 3TKSE 2M46A 3LQ7A 3DRNA 4TR1B 2MMOA 4LMWA 2HZFA 4XS4A 4HZ4A 4KE3A 4TW5A 3EURA 2K8VA 6GSUA 5IPGA 3GL5A 2AUVA 4HEA2 2OE1A 3BCIA 3TRXA 4MZCA 1DUGA 2NPBA 2YPMA 5D93A 5EVOA 3IBHA 4H86A 3FEUA 3I43A 3TKSA 2VD1A 1THXA 4FH8A 6GSTA 6GSYA 2R6KA 2EIOA 4V2LA 1ML6A 1GL8A 3H1NA 3UEMA 3FZAA 2OA7A 1XVQA 4MPFA 3G9BA 1WRYA 2MMZA 3UL3A 1VF3A 5ECSA 2F51A 1U87A 5DCHA 1XZOA 2VOCA 1F3BA 4WR4A 1F37A 1WJKA 3UBLA 5GSTA 2OACA 1VF2A 4GSTA 1JZOA 1M99A 4ECCA 1Z7PA 2HNLA 5IO2A 4TOPA 3GYKA 1M9AA 2OADA 2C0GA 5INYA 1HNAA 2KP1A 3KH7A 3RHCA 1U88A 2GQKA 2Z9SA 1G6YA 3UOMA 2GGTA 4IP6A 2IMEA 3IAM2 3D4MA 3TJJA 4I2TA 2WZ9A 2LJKA 2C3QA 4JRRA 1UVZA 2RIIA 4KCAA 4O92A 5HFIA 5B8BA 1ZCPA 5B6MA 3HXSA 4FYBA 5ECQB 3L9SA 1GSFA 4MF6A 5ECOB 3IV4A 4HI7A 1PRXA 2VL2C 2HZEB 2DIYA 1GSYA 1TRSA 3M1GA 4K7NA 1JZRA 3L9VA 5EPFA 4ZB6A 3ZFBA 3G7JA 5IM9A 4Q5FA 1HQOA 5H5RA 1NSWA 3ZZXA 1BYEA 2TRCP 5H5QA 4OFNA 4I97A 4TXOA 4PUAA 4G2EA 4XHMA 4CDOA 1HNCA 2HLSA 5EL8A 3A2VA 5CO3A 1X0RA 2RM6A 4JZQA 2GTUA 2P5RA 5HQPA 4J57E 1BQ7A 4GWRA 5FHIA 1Q98A 3NIVA 2A4VA 3DGQA 5GSSA 1PGTA 2DBCA 1XWGA 3EMPA 5AIVA 5G5FA 2DJ0A 4KDXA 4XS1A 2IIYA 4NHZA 1TI1A 4MMMA 5GAND 1SENA 1YEXA 2AV4A 3QPMA 3QOUA 1Z7RA 3VI7A 2FA4A 3TRQA 2I9HA 3TJBA 5IMZA 3K8NA 2ES7A 1QGVA 1DE1A 4IGJA 4IJIA 3RDWA 3IA1A 5DCGA 3C1RA 3O3TA 3IOSA 3EVIA 1K3OA 2VCXA 3S9FA 1Q4JA 4EXJA 1WOUA 1YF0A 5IO0A 2FA8A 1A2LA 4TR3A 3ZLPA 4K1FA 2C3NA 3UVTA 5IOWA 5GAPD 2XPDA 3Q18A 3GL3A 3LORA 2WULA 3I6AA 2BMXA 3M3MA 3FR6A 3H4KA 5IQYA 2YN1A 3HZ8A 4IVFA 1QXHA 3BOAA 3F8UA 1X5CA 2GZZA 2P5QA 2LNTA 4NPBA 4WF4A 1VF4A 2YP6A 2PUKC 3DWVA 3HA9A 4GSNA 4ECBA 3WD6A 4POLA 3KCMA 1R5AA 3RPPA 7GSSA 1AQVA 2JZTA 1S3DA 5EY6A 1GUMA 3EWLA 3FKFA 1MD4A 4IP1A 2X8CA 1XW5A 1AUCA 4POKA 3LWAA 4IQ1A 3VWVA 3IAS2 1XWAA 5ELGA 3MDKA 1F2EA 3PGTA 3QCPA 3ZRDA 3GSTA 3P90A 4IKHA 5DAKA 2O89A 3FR3A 2PPTA 1RQMA 1H75A 5HR1A 4GCIA 3FHKA 4Q5QA 2OE0A 3WT2A 1JLWA 2MZCA 2B3SA 4CW9A 1TW9A 5JWRB 1MDKA 2JZSA 1MTCA 5J9BA 2LKUA 2VUPA 1YJ6A 1TRWA 3A2WA 2CVDA 3GTUB 2L5OA 4ZXGA 5E59A 4BVYA 2LRCA 4I2UA 3DMLA 5ECPB 1X5EA 6GSXA 1M2AA 4O5RA 1KBNA 2FY6A 1GSDA 3ZFLA 4JEDA 4NHWA 3HJOA 1Y25A 1ON4A 1FO5A 4RUVA 3APQA 3QAVA 3GRXA 3CRUA 3GA4A 3VLNA 4ZILA 4GQFA 5G1KA 4PQIA 3F9UA 4LL4B 1NHOA 1THOA 4G19A 1JHBA 1ERWA 2C0FA 3QAGA 2PGTA 4HU7A 4POMA 4QL7A 3O6TA 2LS5A 3CBUA 3HY2A 1GTIA 4RI6A 1OKDA 1T4YA 4ID0A 4GXZA 4I6XA 2R37A 1X9WB 2AB6A 2WJUA 1GSUA 2N5FA 3LFLA 3KM6A 4MDCA 1Z3EA 2MBSA 2CVBA 4IS0A 1T3BA 1ERVA 2GZPA 2YWIA 3VURA 3NOFA 1W4VA 2FD3A 2YZHA 2CT6A 2LNSA 3DD3A 3QFBC 18GSA 4KGIA 1LJRA 5IMAA 2I3YA 2L6CA 3ZIVA 2L57A 1OVNA 4NV5A 3GX0A 2C80A 4NV2A 2IMKA 3LJRA 5IMCA 1EOHA 4EDZA 4XS4B 4FYUA 1M9BA 3N9JA 2WDUA 5CRHA 3F3QA 4L8EA 2H30A 4ISDA 5LCZA 3HYPA 2VL9A 3F4RA 2PVOC 4ZB8A 11GSA 5JWQB 4MJAA 1DSBA 2LJRA 2HRNA 4WETA 3WGEA 4IN0A 2FWGA 1SKRB 2QC7A 4PGTA 2JADA 2V6KA 1K3YA 5C04A 4AJ8A 4KSOA 1XFLA 4KCEA 2H75A 1TI3A 1NHYA 2YZUA 1EEJA 2E2GA 1TK0B 4ZB9A 1ERUA 3EYTA 9GSSA 2H6YA 5J41A 4OFTA 2EIRA 3N5OA 2PMTA 2LTKA 3GN3A 1X9SB 1PSQA 4L0WA 4EF0A 5DJMA 4ECIA 4YH2A 2GSQA 2OE3A 1ST9A 4V1Ag 2CX3A 3TJGA 3CXGA 2X8HA 1ABAA 1XWKA 2C8UA 1TK8B 4N30A 1GTAA 4HUAA 2AHEA 3ZIJA 2ON5A 4NWYA 1T4ZA 4N0VA 2B7KA 1J0FA 2JZRA 5CNWA 1V40A 2ZCTA 4TR4A 3MSZA 5LNKe 1MDJA 3TRPA 4PNGA 4G9HA 4KH7A 2DIZA 4KDYA 2KOKA 2VCQA 2AJQB 2V1MA 3VPQA 3R2QA 3ZVJA 1KEBA 2GT5A 2NBSA 1PL2A 1Z9HA 4D73A 1VGLA 3ZMKA 4E8HA 1YZXA 1EWXA 5A4VA 1MDIA 2PWJA 2OKAA 2VCTA 1O73A 2XBIA 3H93A 3IK7A 4EC0A 1T8EB 1ZYQB 2I81A 4YAVA 3HCZA 4TXOB 1T7PB 1Z5YE 5IMFA 4OD7A 3IK9A 1DE2A 1NM3A 5DALA 3PH9A 4PQHA 4K2DA 2HSHA 3U5RE 2CZ2A 2LV3A 3IHQA 1AC1A 1LBKA 3GMFA 1XOBA 2L4QA 3LG6A 1PX6A 1SYXA 3FR9A 3F0IA 1O85A 3IXRA 3EE2A 1SKWB 2EIQA 2OBIA 1FVJA 3CSIA 4L0UA 2GDRA 2DJ1A 2GVPA 1E6BA 1A23A 2F3MA 3TGZA 2O7KA 3KTLA 1JFUA 1EEMA 4TRXA 5JWOB 1USBA 1GTBA 1YDKA 2IFQA 2E2MA 1S3AA 2G2QA 4EDYA 1F9MA 3SBCA 1FVKA 2FUG2 2LQQA 1NW2A 2IJYA 3M0FA 5KN3A 3UBKA 5F8BA 2GSSA 3GIXA 2RM5A 3HJPA 2TIRA 1TDIA 1UA5A 3I69A 3M9JA 1SK1A 4YQMA 4HJ2A 1T1VA 4G10A 3CTFA 3ERGA 3QAWA 4YQVA 1GUHA 1IYHA 3F3RA 5HR2A 1JZWA 1Y6EA 1YEPA 2H6ZA 1G0TA 2E0QA 1KNGA 4DSRA 4E8EA 3FK8A 3LXZA 4KB3A 1TU7A 1U6TA 1Z6NA 6GSVA 4EVMA 4V1Ap 2REMA 1Z6MA 1K0DA 2V41A 5G30A 1GUKA 4QQ7A 3H8QA 3KP9A 4AGSA 5A5KA 3MNGA 1F3AA 2YWNA 4WKWA 5CRGA 1EZKA 3UIWA 3H79A 5DAKB 3TKRA 4BPYA 3FZ4A 2HT9A 3D6IA 4N11A 2D2ZA 1OAZA 3UVHA 2H71A 1J08A 2CAQA 1BJXA 3W6GA 4ZBBA 5J5NA 1AQXA 4TXVA 4WR5A 2IWTA 1RK4A 2M80A 3D22A 3ERWA 5HR3A 4ML1A 4V2NA 1H4OA 4OMVA 1EP7A 2WRTA 2JSYA 1SD8A 2VLVA 2VL2A 3ERFA 4IHUA 3C1SA 1WPIA 4N10A 5IIZA 4DSQA 3GV1A 3DVXA 3UMAA 3ZL5A 3KTBA 2I4AA 2KP2A 1EP8A 5D96A 4JR4A 2H1DA 1TP9A 1EGOA 3CMIA 3P7XA 3P8WA 1TK5B 1TRUA 3WGDA 3VWXA 4NXIA 14GSA 2ALBA 5A4WA 1X5DA 2R5GA 2IMDA 4BA7A 4OO5A 1B9YC 2N5BA 3FRCA 3EC3A 3UJ1A 3OR5A 4ZIJA 3HZ4A 5DBQA 3KIJA 1OC9A 5G1LA 4OCEA 3F4TA 5F07A 2CAIA 2H73A 1A0FA 3J7Yk 1O8XA 3KGKA 3QFAC 2B1LA 2V32A 3EINA 3VWWA 2VLUA 3HHVA 2JL4A 1TJDA 3Q6OA 1ZYEA 4KUNA 3GKMA 2JU5A 1PKWA 3GKXA 1GULA 2KUCA 1U3AA 1WMJA 5CRDA 3LXTA 2FCHA 3FZ9A 4I5QA 5J4UA 1OC3A 1BG5A 3ISOA 4K6XA 1YKAA 5ID2A 3DVWA 2XC2A 3SWLA 1JZDA 1M2DA 2L5LA 3DKSA 3D4TA 1I5GA 4WBRD 4OO4A 1V2AA 2YCDA 2H1BA 3IC4A 1BAYA 4EE0A 5ECHB 5JCUA 2FNOA 2VCWA 3MAKA 1GSSA 4FYCA 1K0MA 3J7Yb 5D8IA 1DBYA 5DVBA 1CQGA 4TKYA 1TU8A 2B7JA 2CA8A 2F8AA 1QMVA 3TUEA 3TKPA 3KP8A 2F9SA 1OE7A 3L0HA 2IMFA 4BWSA 1YF1A 1M2BA 2YWMA 2H0HA 4LA1A 1ERTA 5C00A 3VPTA 2J9HA 4FIWA 3UAPA 2YNXA 2FWEA 2L59A 2F8FA 4PX1A 4KNDA 2NTOA 4K0NA 2DSAA 3DEXA 3GHAA 4ML6A 4D73B 3P2AA 2WS2A 4L5OA 1EGRA 5FWGA 3RPNA 5J3RA 3FY7A 1SJZA 1V9WA 4MCUA 4KX4A 3QR6A 4V2MA 4F2IA 2R2JA 2GZYA 1J9BA 1GWCA 2H1AA 4PURA 2B5EA 1GRXA 5DALB 4XRAA 2YV7A 3JCML 1A0RP 4KA0A 3BD2A 3EU4A 1N2AA 5B7CA 4F03A 2CX4A 3PINA 4K7IA 3BBYA 3ZITA 3CRTA 4LMVA 2P31A 1XOAA 5H5SA 3KMNA 6GSSA 4ECJA 3GNJA 4KW6A 1M0UA 3F4SA 5AISA 2K6VA 3C73A 2MBTA 4JR6A 5LD0A 1YKCA 1I9DA 1R26A 2G0FA 2YJHA 2N5AA 2H19A 1XWCA 4OFMA 4Q5RA 3TCOA 2IMIA 1SD9A 1YY7A 5KN0A 1WWJA 3WT1A 1EV4A 1PMTA 2QSIA 1GNWA 3KH9A 3TB2A 5L71A 2IFQB 4BL7A 2VM2A 4MH2A 2C0DA 5F06A 4AF2A 1GH2A 1XVWA 4BWQA 5G31A 4EUYA 1GP1A 4KDUA 3US3A 4AJ7A 5ECMB 1K0NA 3EMXA 2VD0A 19GSA 3TKSC 3TOTA 1RW1A 5DQSA 5AGYA 3CTGA 1XCCA 2GLRA 2I1UA 3LYKA 3FW2A 1AAZA 1SK2A 1AXDA 5HFGA 1G6WA 4HZ2A 6GSWA 5ECRB 5CAXA 4LLRA 4GQCA 3GX8A 1F6MC 2YV9A 2ZNMA 4F82A 1O7UA 3LGCA 4PXOA 2H70A 4DSSA 2LRTA 1MD3A 1HYUA 4HJMA 2DMLA 2WCIA 8GSSA 5JCWA 1UC7A 2BTOT 2R4VA 5D9XA 3VWUA 2LQOA 3KXOA 2C1YA 4X43A 3RHBA 4ZL9A 3Q74A 4OCFA 4ZL7A 2XBQA 3W8JA 2LJAA 2H01A 3HJMA 1O6JA 3HVSA 4MZBA 3IPZA 4MABA 2OBKA 1SL1B 4F0CA 1TXXA 5B6NA 2L4CA 1ZMAA 3AY8A 4GLTA 5F0GA 2YWOA 2JSZA 4PQ1A 3TOUA 1QUWA 4MP4A 2EC4A 3E9JB 4MH3A 5D9VA 3O76A 1BX9A 4NMUA 1XBSA 4IJ3A 3FYGA 3RAZA 2KHPA 1SK0A 1PN9A 5D9WA 1V57A 2DJKA 4Z7XA 3GH6A 1TKDB 3M9KA 1JLVA 2H0IA 5ELAA 5CRWA 4HU9A 1ACVA 4PNFA 2HI7A 1TOFA 2PU9C 4IQAA 1HD2A 4GTUA 1B8XA 1FG4A 1R5PA 3DIEA 2FHEA 1N8JA 4GF0A 4OWYA 2OJLA 3E0UA 16GSA 2DJ3A 2K18A 4K0GA 3F6FA 22GSA 3HVXA 10GSA 2MMNA 2PN8A 5GZZB 3HDCA 1SJ6A 3L9UA 2VM1A 1SL2B 1K3LA 2GQLA 1OC9B 1X9MB 4HDEA 2O85A 3EU3A 2VL3A 4JE1A 3TKQA 1FB0A 3LYPA 2ZUPA 1UN2A 5CP1A 3IE3A 1OYJA 2H66A 2GQMA 2BJXA 5AN1A 3GKNA 2IN3A 2K9FA 3ZMLA 1K0AA 2LUSA 1GNEA 3QD9A 2L6DA 2RUFA 3VK9A 3VFIA 4TR1A 1V58A 4KAEA 2O8VB 2X99A 1PL1A 4P3YB 2A2SA 3MWHA 4N0ZA 2QKEA 1K0OA 3KEBA 1IYIA 3G7YA 3W8SA 5ID2B 4MJCA 1R7HA 4JBBA 3KZQA 1XW9A 3DXBA 2FGXA 3M8NA 2PVQA 4F0BA 2HSYA 1QFNA 1XW6A 1BEDA 3WGXA 4DEJA 5IMVA 3LEFA 4RQXA 5ECNB 4MLYA 4MJBA 3Q19A 5COHA 2NVLA 2V6OA 4XCSA 5IMDA 4O32A 2FLSA 3IR4A 2B5YA 1B48A 1GTUA 2NDOA 2RUEA 5IOXA 3U6VA 2XPEA 4RQRA 3VI5A 1V98A 1MEKA 4KSMA 2DMMA 4K9ZA 4MK3A 1URMA 3RBTA 2CZ3A 2V2GA 4CHSA 4HQSA 5DQYA 3ME7A 3BCKA 3A3TA 4JU5A 5J9CA 4DVCA 4GSSA 3D21A 2J23A 1B4QA 3KD0A 3KJYA 1WP0A 2FWHA 4ZL8A 2C3TA 4EKZA 1M7TA 4FO5A 1OC8A 5KN1A 2HRFA 1XWBA 2X64A 2C0EA 3ME8A 4WF5A 3IRAA 4EO3A 4PUFC 3CSJA 1TTZA 4GRFA 4O7HA 2GS3A 2VLTA 4X0XA 5E4WA 3HKRA 1G7OA 1AIUA 2HZEA 3ZYWA 2M72A 4MA9A 2X8GA 1SJIA 3GUSA 17GSA 1QK8A 2HE3A 3PR8A 2P0GA 3GKKA 3A2XA 2KLXA 3FZ5A 4K8MA 2FWFA 2YJ7A 5AIXA 5CYYA 3KMOA 1S3CA 4ULXA 3CYNA 4HOJA 4ILFA 1SU9A 3APSA 1WE0A 5G5EA 4MF7A 4K7OA 3DYRA 3I9V2 2VCVA 1A2MA 3A5WA 2B1KA 1B9XC 4MF5A 4IBPA 1K0CA 3WYWA 1PX7A 5D9TA 3TJFA 3V1WA 2AAWA 2VIMA 1FOVA 3NZNA 1XPVA 5D73A 2VAFA 3ZVJD 5FT3A 5ECIB 2R3XA 3G7IA 3IDVA 2LSTA 2WFCA 2A2RA 3APOA 1GSQA 1PKZA 2H72A 2IPAA 2VCZA 5DDLA 3GURA 4WXTA 4ACSA 3ZTLA 4YQUA 5HFKA 2PERA 1YQ1A 2WGRA 1SL0B 1GSEA 1HNBA 1A8LA 1PA3A 1U3IA 5KEJA 1ZGNA 4NAXA 1T00A 5ECLB 2LEGA 2HFDA 2JACA 2RLIA 5F05A 1AW9A 1A24A 1R4WA 1ILOA 3TDGA 4MJEA 4IW9A 2ON7A 5ENUA 5CREA 2B6MA 1AQWA 1QQ2A 2O87A 1FAAA 1LU4A 3L4NA 2XHFA 4DSSB 3GFKA 2DJ2A 1VRSD 1WIKA 2H74A 3GSSA 1G7EA 1E2YA 2LRNA 4HQZA 4LL1B 1GLQA 5DJLA 2C4JA 3ZREA 1VF1A 2H6XA 1B4PA 20GSA 2CV4A 2YOIA 1FW1A 1EV9A 1K0BA 1PD21 1OE8A 2MYGA 5KN2A 4XS6A 1O8WA 1XIYA 2B5XA 1GLPA 4XTSA 4TR0A 4XIHA 4F9ZA 2K8SA 1CQHA 2WB9A 4YAPA 3HD5A 4WBJA 12GSA 2CQ9A 1PQNA 5ECKB 5G2ZA 4J2FA 2TRXA 1A8YA 2H76A 1XXUA 1C72A 5IPHA 2HXKA 3HVVA 2QGVA 4HS1A 3C8EA 1SKSB 1FB6A 4XRDA 2DLXA 3QDNA 3F63A 5B8AA 3GTUA 4ZBDA 4AJ6A 3GH9A 2AYTA 1SYRA 1A2JA 4J56E 1ZL9A 4MPGA 2H1GA 2HYXA 1KTEA 2H0GA 3L78A 1ZZYA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
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