1SK1A

Arsenate reductase r60k mutant +0.4m arsenate from e. coli
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
138
structure length
137
Chain Sequence
NITIYHNPAGTSRNTLEMIRNSGTEPTIILYLENPPSRDELVKLIADMGISVRALLKKNVEPYEQLGLAEDKFTDDQLIDFMLQHPILINRPIVVTPLGTRLCRPSEVVLDILQDAQKGAFTKEDGEKVVDEAGKRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Arginine 60 in the ArsC arsenate reductase of E. coli plasmid R773 determines the chemical nature of the bound As(III) product.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Arsenate reductase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli
total genus 38
structure length 137
sequence length 138
ec nomenclature ec 1.20.4.1: Arsenate reductase (glutaredoxin).
pdb deposition date 2004-03-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03960 ArsC ArsC family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1sk1A00
2OBIA 4N0VA 3DYRA 3V1WA 5B8AA 3W8JA 4LMWA 2H0HA 4MF5A 2DLXA 4LL1B 4DSQA 2AHEA 3F9UA 3FEUA 3IK7A 3EC3A 1TI3A 2GVPA 4GWRA 1SL1B 2H1BA 5FHIA 1FW1A 3FHKA 2B7KA 1TRSA 3H8QA 2MMZA 2B6MA 3UEMA 4EL1A 1B8XA 4QL7A 3UIWA 2IIYA 3QR6A 1PL2A 2LSTA 1GSFA 2FA4A 4N30A 4XCSA 3DIEA 7GSSA 6GSUA 1G7EA 3H79A 4WXTA 4KCAA 4IP6A 1SJ6A 3DD3A 20GSA 1JZDA 3QMXA 1V98A 5HR0A 5CRGA 5FT3A 1Z6MA 3TOUA 2E2MA 2LRTA 2NTOA 4WF5A 4KDXA 1R26A 2NBSA 5EPFA 3IDVA 3UOMA 2CVBA 2G0FA 1AC1A 1S3AA 1TU7A 1TXXA 3HHVA 2VCVA 3DVXA 3GFKA 5D9TA 3UBLA 2LEGA 5J9CA 2GT5A 1E6BA 2V6KA 2WZ9A 2VO4A 2VL2A 1NW2A 1O6JA 2LV3A 2X8CA 2LS5A 2YCDA 1GTAA 3IR4A 1SK2A 2H66A 3F3RA 1V9WA 3WD6A 4JEDA 4ZIJA 4K7NA 2FCHA 2VCTA 2MZCA 3GURA 2CVKA 3ZVJA 5G31A 1O7UA 2E7PA 1PD21 3L4NA 4NV5A 3APQA 1WP0A 3G9BA 2H76A 2L59A 3VPTA 4DSSB 5ECSA 1G6WA 2ON5A 3WGDA 4RI6A 3ZIJA 2HZFA 3EMXA 5ELAA 3E0UA 1E2YA 4JR4A 1ZYQB 1WOUA 2V32A 3ERGA 1LJRA 2RM5A 3IK9A 2IL3A 3DEXA 3CSIA 2WJUA 4O5RA 1SENA 2YJHA 3GN3A 3IAM2 4WF4A 1FOVA 1NM3A 4EDZA 1T8EB 1U87A 3ERWA 3IBHA 1YEXA 1T1VA 2B1LA 1EEMA 1XBSA 4XRDA 4D73A 4ULXA 2HYXA 5IMZA 2A2SA 1R7HA 2PVQA 2HZEA 5D8IA 3KXOA 4O32A 1CQGA 3H4KA 1PX6A 5AN1A 4KCEA 2H0GA 1OKDA 3LWAA 1QMVA 1OC9B 2M72A 3TJBA 1FAAA 4L5LA 5GAPD 5COHA 1F9MA 2P5QA 2WGRA 2O7KA 2DJ2A 1N8JA 5ECIB 3VWUA 4KGIA 1SU9A 3FK8A 2GS3A 5IMDA 5E59A 4X0XA 3TUEA 1M0UA 2C0FA 4HI7A 2DJJA 4HZ2A 4ID0A 1OYJA 2QSIA 1ZCPA 2XC2A 2GTUA 3HCZA 5ECPB 10GSA 4ZL8A 2XBQA 3RHBA 4LMVA 3BBYA 4PQ1A 1F3BA 3GTUB 2AB6A 3QOUA 2H0IA 1K3YA 4O92A 5D73A 1V40A 3MDKA 4MABA 1JZRA 2DMMA 2LUSA 2VLVA 3KD0A 4PURA 1HNBA 1KEBA 1SL0B 4JBBA 4EUYA 1C72A 2JSZA 1PKWA 1JZOA 3TRPA 1Q98A 2ON7A 1A0FA 4GSNA 1AQXA 3D4TA 4TN8A 1YZXA 5IMFA 3CSHA 1B9XC 1BG5A 4EKZA 3F4SA 1F37A 6GSWA 4KDUA 4YAPA 1WRYA 3PGTA 1QGVA 4V2NA 3EVIA 2AAWA 1GRXA 5J3RA 2JL4A 5D93A 3FR6A 1EP8A 3KJYA 2YWMA 2L6DA 4ZBAA 1T4ZA 2F9SA 1F2EA 4YQUA 2R3XA 5IMVA 2VLUA 1PGTA 1NHYA 1TTZA 4NV2A 2R6KA 1GP1A 1HNAA 4L5OA 2P31A 1FVKA 4GF0A 2NVLA 2OA7A 17GSA 3N5OA 2K6VA 2GQMA 3MAKA 1VF4A 2CQ9A 5DBQA 1GSDA 3BCIA 3EU3A 2DJ3A 4N11A 4RI7A 3MWHA 3KM6A 4I2TA 4HQZA 4POMA 4PUFC 2E2GA 4E8EA 3UVTA 5ECHB 2FA8A 3IA1A 4DSSA 3GKNA 3HY2A 1TU8A 2YP6A 4RQXA 1Z7PA 1PA3A 5AIVA 1K0NA 2WRTA 3VLNA 1SD8A 5J5NA 3GH9A 4MPGA 3E9JB 2QC7A 2BTOT 3UMAA 1LBKA 4HU9A 5IPHA 2DMLA 2HRNA 4IKHA 4IS0A 1XWCA 1SK1A 1URMA 4HUAA 1A2MA 1GSQA 1DUGA 1K0OA 4V1Ap 3S9FA 4CHSA 4KX4A 1SYXA 5DQSA 1K0MA 2H01A 4TXVA 5ENUA 3SBCA 4TR4A 1MD3A 1PL1A 5ECRB 3I9V2 1KTEA 1R5AA 1HD2A 3H93A 1TRUA 2GQKA 2V1MA 3A2VA 2V41A 4GSTA 1R4WA 1SL2B 1SJZA 1USBA 2YZHA 1PX7A 1OC9A 4J56E 4BVXA 4OCFA 4NHZA 2H1DA 3A5WA 4EF0A 2VM2A 2YV9A 4WBJA 1AIUA 3FZ9A 4OO4A 3CYNA 1V2AA 1YF0A 2AYTA 1YF1A 1XXUA 2HSYA 3LJRA 5DVBA 1EV9A 1K3OA 3QPMA 1ERVA 3F6DA 1J0FA 4N0ZA 1ERTA 3GMFA 1T4YA 2WFCA 4GSSA 4OFNA 4TRXA 3VFIA 2CA8A 1PQNA 2GZZA 1GL8A 1XVWA 1FB0A 1N2AA 3TGZA 2R2JA 3VWXA 3C7MA 1QFNA 2VLTA 4TXOB 5A4VA 2MMAA 4EC0A 4PQHA 4XHMA 2V6OA 1OC8A 6GSVA 4ZB8A 4KE3A 3F0IA 2YJ7A 2B5YA 1JZWA 2ALBA 5IOXA 3P90A 2H1GA 3IV4A 2YNXA 14GSA 1X5DA 5AGYA 1GTBA 2O8VB 3F4TA 1U88A 4AJ6A 3FZ5A 3GSSA 3G7JA 2WULA 3KTBA 4NMUA 3GYKA 4X1UA 4POKA 3UVHA 1XWGA 1WWJA 2LJKA 3KMNA 2YWNA 4PNGA 4FIWA 4XS6A 5DDLA 4IHUA 5G1KA 3LXTA 3I43A 2B3SA 1JLWA 4QQ7A 2VL9A 1GUKA 19GSA 1M7TA 4GRFA 1S3CA 1OKTA 2EC4A 4LLRA 1BQ7A 1TKDB 4HU7A 3WYWA 4TOPA 3HA9A 2LTKA 3KGKA 2DJKA 3W6GA 5EL8A 3EWLA 2ZUPA 3VI7A 2GSSA 3I69A 5KN3A 4MJAA 4TR3A 2GGTA 3LG6A 3NOFA 1YJ6A 2VD1A 5HR2A 2PVOC 3TB2A 3M9KA 1GWCA 2AUVA 4POBA 2A4VA 4ZB9A 1GSUA 4DEJA 2L5OA 3LFLA 3FKFA 3LORA 4YAVA 1XWKA 1X5EA 3HVSA 1TK5B 2EIRA 4I6XA 4MMMA 5F06A 5DQYA 1IYIA 4IVFA 3RBTA 3D5JA 3AY8A 3GKXA 4TW5A 3DGQA 5B8BA 5IMCA 2KP1A 2DIZA 3CRUA 3F3QA 3Q74A 4IQAA 4RQRA 5ELGA 5J9BA 1XOBA 3GL5A 5LD0A 2TRCP 1JHBA 3QDNA 4KA0A 4IBPA 5GZZB 5CYYA 2TRXA 4FYCA 1A24A 1ZYEA 4K1FA 3VWWA 2VOCA 5A5KA 1M99A 2JACA 3ED3A 2MYGA 3HXSA 1JFUA 2MMOA 2GT6A 4DSRA 2H71A 2JZSA 2FWHA 1TOFA 4TR1A 2GLRA 4HDEA 4TVEA 2C1YA 4AF2A 2H75A 2HE3A 4BPYA 4NXIA 3QFAC 5JWQB 1ERUA 2C0GA 1QXHA 4PGTA 2YOIA 2FD3A 4FYUA 2H19A 3GV1A 2A2RA 1SK0A 2H8LA 5AISA 5ECMB 1YQ1A 2E0QA 2CV4A 1M2DA 4CW9A 4NPBA 2P0GA 3CRTA 4FYBA 2EIOA 1RK4A 1ML6A 3W8SA 2H30A 3UJ1A 2VCZA 4HJMA 5F07A 3GHAA 5ECQB 1ZGNA 12GSA 4OMVA 1W4VA 4TXOA 1DSBA 4Q5RA 3M8NA 1J9BA 2GZYA 1MD4A 3APSA 4MK3A 4YQVA 5IQYA 3CMIA 1R5PA 2NPBA 3C71A 5CRHA 1XW5A 4K7OA 3KZQA 3LSZA 5ECOB 3TRXA 3K8NA 1XWAA 3VWVA 2YWOA 2C3NA 2C8UA 4ECJA 3ZL5A 1EGRA 3TDGA 2FWEA 4KDYA 4XS1A 1Z5YE 1V57A 5GSTA 1BYEA 5IO0A 4I2UA 2B5XA 5JCGA 3O3TA 2DJ0A 4NWYA 2EIQA 2R5GA 1MDIA 3UL3A 2PERA 4O7HA 1FHEA 2IFQA 3R2QA 4IGJA 5HR3A 3EU4A 2PUKC 1S3DA 5CRWA 2PBJA 5F0GA 3D4MA 5F05A 4PXOA 1ZMAA 2PMTA 5H5SA 2VCWA 4OCEA 2L5LA 1A2LA 3RPNA 3P7XA 1Z3EA 5DJLA 2H72A 3KH7A 4ECCA 5J4UA 2RIIA 1VF2A 2XPDA 3D6IA 3APOA 4TKYA 4AGSA 4IW9A 2K18A 2N5AA 3LEFA 5DCHA 5EY6A 1BEDA 1GUMA 3VPQA 2HFDA 6GSXA 5LNKe 3KIJA 4ZBDA 4IJ3A 1TK8B 3ZFLA 5KN0A 3FRCA 3GNJA 3Q6OA 3HVVA 3TJGA 3QD9A 4OWYA 4GXZA 1O8XA 2VIMA 1OAZA 5F8BA 4P3YB 4EDYA 2K8VA 18GSA 1CQHA 2L4QA 4AJ8A 1GNEA 3M3MA 3TKSC 4IJIA 3WT2A 3VURA 1Q4JA 3EINA 5KEJA 3G7IA 5B6NA 4KUNA 1G7OA 3C73A 4PX1A 2QGVA 1SD9A 3WT1A 1U3IA 3UAPA 1EZKA 2I3YA 4WR4A 3PINA 3TKPA 2GSTA 2ZCTA 2CX4A 3N9JA 3QAVA 1DE2A 1Z9HA 3FZ4A 2QKEA 3LXZA 4K9ZA 4PUAA 4FH8A 3FR3A 4OFMA 4ZL9A 1K3LA 2KHPA 3PR8A 3HVXA 4G2EA 5L71A 4F0BA 1GSYA 3GSTA 2K9FA 2OE0A 2GDRA 3QAGA 1AQVA 1OC3A 3HD5A 4MA9A 4Q5FA 3HDCA 1EOGA 1WMJA 2B5EA 4G10A 5CO3A 2WCIA 2X99A 2GZPA 1K0BA 4HEA2 1B9YC 4K7IA 2FHEA 1T7PB 2C3TA 4QL9A 4IN0A 4MZWA 4MF7A 4I97A 2IMDA 1RW1A 2CVDA 5A4WA 1TK0B 3ZYWA 2X64A 3BCKA 2FUG2 3KP9A 1OVNA 4HJ2A 2RUFA 5B7CA 3HZ4A 4E8HA 4KW6A 1THOA 4L8EA 1HYUA 2OKAA 3E3EA 3CBUA 1YKAA 1WIKA 3VI5A 1SJIA 3US3A 5JWRB 5ID2B 1EEJA 1J08A 4TR1B 3BJ5A 3A2XA 4K2DA 4POLA 1TP9A 4F82A 2H6XA 5CREA 2XBIA 4Q5NA 4H86A 2RUEA 1ST9A 4EXJA 5DAKA 1M9BA 5GAND 5CRDA 5A4UA 2HXKA 4ZILA 5CAXA 3GA4A 1YDKA 3QFBC 3IOSA 2BJXA 4Z7XA 16GSA 1QQ2A 4PNFA 1B4QA 5C04A 2OE3A 2C3QA 3GX8A 3Q19A 5D9VA 1PMTA 1A8LA 2LJRA 3NZNA 5G30A 1GTUA 3IRAA 2L6CA 4EE0A 1XOAA 2IWTA 3P8WA 5KN1A 2BMXA 2HRFA 1KBNA 1SYRA 2J9HA 1XWBA 1O81A 4F9ZA 1AAZA 2H73A 4WBRD 2D2ZA 2X8HA 5JCUA 3HYPA 4ZXGA 1VRSD 2N5BA 4J57E 2DBCA 1M2AA 3OR5A 5ECNB 4MZBA 1FO5A 2JZRA 3IAS2 1OE7A 1GTIA 2OE1A 4BWSA 3HZ8A 3ISOA 2OADA 3TOTA 3IHQA 2R4VA 1GH2A 2I81A 4JZQA 5JCWA 4KNDA 2MBTA 4JRRA 4BVYA 5IIZA 3FR9A 3LYKA 2IFQB 3CTGA 4MH2A 4KH7A 8GSSA 4NAXA 4G9HA 1ON4A 1O8WA 2PU9C 3TKSE 2O89A 4ML1A 2J23A 2H1AA 2JSYA 1PRXA 1AW9A 4MCUA 4HQSA 3GKMA 3FY7A 1XPVA 4OFTA 3D22A 5CP1A 5D96A 2VL2C 3GRXA 3M1GA 4V2MA 2VCQA 4I8BA 1A0RP 1EV4A 4XS4B 1WE0A 4GCIA 1LU4A 3DMLA 4YQMA 1U6TA 1XW9A 4L0WA 2KOKA 4GTUA 4ECIA 2GQLA 2LQOA 1FVJA 3D0ZA 1QUWA 2KLXA 3TJJA 4ISDA 2DC5A 5DJMA 1AUCA 3EYTA 4PQIA 3VK9A 2HNLA 4JE1A 4ZB6A 1XZOA 5EVOA 1M2BA 4ZBBA 5DALA 3EE2A 2CT6A 2F51A 5H5RA 4G19A 1B48A 5HR1A 3HJOA 3L9VA 1K0CA 6GSYA 3CSJA 2G2QA 3ZVJD 5B6MA 2DIYA 3ZLPA 3WGXA 1MDJA 1VGLA 11GSA 4L0UA 1O73A 2LQQA 1ILOA 4IELA 2CZ2A 1BAYA 1NSWA 2V2GA 3IXRA 2LNTA 3RHCA 2LKUA 3M9JA 4V1Ag 2H6ZA 2OACA 4MP4A 2LJAA 4X43A 2DSAA 1GSEA 4WEYA 1MEKA 1XIYA 2H74A 3ZMKA 5ID2A 2XPEA 1HNCA 3LQ7A 4ILFA 1ZZYA 3C8EA 3KH9A 1PKZA 3ME8A 4F03A 4K8MA 4CDOA 2FWGA 2WS2A 3RDWA 1XW6A 3ME7A 3FW2A 2FY6A 3ZFBA 2IMIA 13GSA 2IN3A 1EWXA 1BJXA 2H6YA 2AV4A 1TRWA 2F8FA 1T00A 2VD0A 4GQFA 2PWJA 1K0AA 4KB3A 2HT9A 3J7Yk 2JU5A 1TJDA 2GSRA 1TDIA 3P2AA 1O85A 5CNWA 2C0DA 3C1SA 4I5QA 4EVMA 4IP1A 2JZTA 1UC7A 3F6FA 3CXGA 1EGOA 1GSSA 4IQ1A 1XVQA 1Y25A 2O85A 5ECKB 1EOHA 2FGXA 3ZZXA 4ACSA 1GULA 3WGEA 2H70A 5HFGA 5IO2A 1WPIA 2PPTA 1XCCA 4MH3A 2HSHA 1BX9A 3NIVA 4WR5A 1U3AA 2HLSA 2YN1A 1H4OA 2DJ1A 3MSZA 1TW9A 1WJKA 2M80A 5J41A 5G2ZA 1ABAA 1VF3A 3UBKA 3MNGA 3BOAA 2N5FA 5DAKB 3ZTLA 3EMPA 4OD7A 1V58A 4TR0A 2FWFA 2L4CA 5C00A 2KUCA 1XFLA 3A3TA 4NHWA 1A2JA 1KNGA 2B7JA 3GIXA 2YZUA 1HQOA 4GLTA 1Z7RA 2LRCA 1X5CA 2YPMA 4BL7A 3DVWA 4K6XA 4HS1A 2X8GA 2WDUA 4MLYA 3IPZA 1Z6NA 1X9WB 5DCGA 5E4WA 3TRQA 6GSTA 2F3MA 2OBKA 2C0EA 1NHOA 2B1KA 3QAWA 5HQPA 2JADA 1M9AA 1DBYA 4XS4A 1GNWA 1SKWB 1X9SB 2IMFA 4MJEA 1IYHA 2XHFA 3I6AA 1F3AA 5G5EA 1MTCA 1UVZA 3ERFA 4KSOA 4OO5A 2Z9SA 4ECBA 3KP8A 3UARA 3M0FA 3HKRA 3F4RA 2F8AA 1X0RA 3SWLA 2RM6A 2CAIA 22GSA 4Q5QA 3KMOA 3L9SA 3O6TA 3J7Yb 5G1LA 2YV7A 4ZL7A 1ERWA 3TKRA 3FYGA 1A8YA 4MZCA 1TRVA 1F6MC 4FO5A 3CTFA 2L57A 3TJKA 2CX3A 1GLPA 2YWIA 5ECLB 4ML6A 1SKSB 1TI1A 2LRNA 2YANA 3TCOA 1I5GA 2GSQA 5HFIA 1THXA 2NDOA 1AXDA 3L0HA 1QK8A 3KTLA 1PN9A 3TKQA 3D21A 3RAZA 4MPFA 2C4JA 3Q18A 5DALB 3F63A 6GSSA 2R37A 3TKSA 3PH9A 3ZITA 1ZL9A 4AJ7A 5INYA 1W89A 3GUSA 5KN2A 1AQWA 3KEBA 5JWOB 2HI7A 1ZOFA 4EO3A 3DXBA 2VM1A 2O87A 3QCPA 3O76A 2AJQB 1I9DA 1FB6A 5AIXA 2M46A 3L9UA 4V2LA 3FZAA 3F8UA 4HZ4A 2RLIA 2MBSA 2I9HA 3HJMA 4KSMA 3DRNA 2IPAA 2REMA 3ZRDA 3GKKA 1GUHA 4F2IA 3L78A 3LGCA 3ZREA 2ES7A 5HFKA 3ZIVA 5IPGA 1YKCA 2I1UA 2VUPA 5D9XA 3GH6A 2I4AA 5H5QA 2VL3A 3DWVA 1YEPA 3BD2A 3U5RE 5GSSA 1DE1A 5LCZA 4BA7A 1H75A 3KCMA 4WETA 2LNSA 3IE3A 5D9WA 4DVCA 3G7YA 1YY7A 2TIRA 2FLSA 4LL4B 1VF1A 5FWGA 4MDCA 4F0CA 5IOWA 4K0NA 2CAQA 2IMEA 2C80A 1UN2A 1OE8A 2FNOA 1JLVA 5ABRA 4LA1A 4XRAA 1FG4A 2PN8A 2IJYA 4XIHA 1MDKA 9GSSA 1B4PA 2VCXA 5IMAA 2IMKA 2PGTA 4MJBA 5IM9A 4J2FA 3LYPA 1SKRB 3A2WA 3C1RA 3GTUA 3GX0A 4XTSA 1T3BA 1UA5A 2MMNA 4GQCA 1G6YA 2WB9A 3U6VA 1GLQA 4D73B 2VAFA 2KP2A 4KAEA 2OJLA 2ZNMA 4YH2A 1K0DA 4JU5A 2HZEB 1G0TA 2CZ3A 3TJFA 4RUVA 3RPPA 4MF6A 3H1NA 1A23A 4MJCA 2K8SA 4K0GA 3HJPA 4BWQA 1X9MB 1Y6EA 5G5FA 3EURA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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