The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
8
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sequence length |
87
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structure length |
87
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Chain Sequence |
MRIKGVVLSYRRSKENQHNNVMIIKPLDVNSREEASKLIGRLVLWKSPSGKILKGKIVRVHGTKGAVRARFEKGLPGQALGDYVEIV
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution Structure of the 50S Ribosomal Protein L35AE from Pyrococcus furiosus: Northeast Structural Genomics Consortium Target PfR48
rcsb |
| molecule keywords |
50S ribosomal protein L35Ae
|
| molecule tags |
Ribosome
|
| source organism |
Pyrococcus furiosus
|
| total genus |
8
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| structure length |
87
|
| sequence length |
87
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-03-19 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01247 | Ribosomal_L35Ae | Ribosomal protein L35Ae |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Beta Barrel | Thrombin, subunit H | translation elongation factor selb, chain A, domain 4 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SQR A; 4ACA A; 4ACB A; 4AC9 A; 2LP6 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1C2H A; 3E91 A; 3MTY A; 3BV9 B; 4Y8Z A; 2TGP Z; 3RC4 A; 1XKB C; 4GHT A; 2BY9 X; 4ZHM U; 2A31 A; 4H42 U; 1TYN A; 1BMA A; 1QA7 A; 2ZU1 A; 2WPH S; 4U01 A; 1YCP K; 1UVT H; 2XCF A; 2ZPS A; 6CHA B; 3A7Y A; 5EW1 H; 3LOX A; 1C1R A; 2XWA A; 1Z7K A; 3V3M A; 4NZL A; 4B2C A; 2UUY A; 1NY2 2; 2P8O C; 3VXE H; 4YT7 H; 1MTV A; 2ZO3 H; 1G30 B; 1GJ9 B; 1O3P B; 1Z8I B; 2BOH B; 4WMD A; 1PPF E; 1NS3 A; 3SO3 A; 1KXE A; 1O32 A; 1DUE A; 3SJO A; 1C2E A; 4ZCN A; 2FLB H; 2Z9L A; 1WSS H; 4IBL H; 2HOB A; 1EB1 H; 1G3E A; 3GCH C; 1D6W A; 2ZEC A; 3P8N A; 2GD4 B; 1C2F A; 1QA0 A; 2W3K A; 1L1G A; 4NA9 H; 3SUG A; 3TH4 H; 1TX8 A; 3GY7 A; 2F83 A; 4ABD A; 3VB5 A; 2QAA A; 1BMM H; 2EQN A; 4DW2 U; 2ZDV H; 5EU8 A; 3P95 A; 1K1L A; 5JPM H; 3QGJ A; 1ESA A; 8KME 2; 1TBQ H; 5J4Q A; 1E37 B; 3PB1 E; 1RTK A; 1UTK A; 2D8W A; 4B71 A; 3H5C B; 3W95 A; 1K9O E; 1G2M A; 2NU4 E; 5HMA A; 3SNA A; 1O2N A; 3VXF H; 1QJ7 B; 2EI6 A; 2TBS A; 2LPR A; 3O8D A; 1TGB A; 3MYW A; 2G55 A; 5GCH G; 4ZXX H; 1SOT A; 1LKB A; 2PGQ B; 3KYG A; 1V2O T; 3LDX H; 1P3C A; 2GZ8 A; 2ZA5 A; 4KTU A; 1IQE A; 1G2L A; 5T6G A; 1MCV A; 1ANB A; 3RXA A; 4ABB A; 1LVM A; 3A80 A; 1SFI A; 5DO4 H; 2YMS C; 3SU6 A; 3Q3K A; 1H8D H; 1YPE H; 1TX6 A; 4INK A; 2VGC C; 2R0L A; 1BBR E; 4I8K A; 1BTZ A; 5SGA E; 2BY8 X; 3M3T A; 1MBM A; 3LH1 A; 4TWW A; 3RXL A; 3AAU A; 4B6E A; 1DVA H; 4K3J A; 1DXW A; 4HGC A; 1W13 U; 3O8B A; 2WPI S; 2G8T A; 1NFY A; 1GBM A; 1P02 A; 2AGI X; 2R3U A; 5CHA C; 1TNG A; 1CHO F; 1D9I A; 1V2P T; 3KID U; 2A5K A; 5EQQ A; 3OX7 U; 5FHT A; 1H9H E; 2OUA A; 2EC9 H; 1O3D A; 1ZRB A; 4UE7 H; 4Z6A H; 5C20 A; 1Y3U A; 2XRC A; 2C8Z B; 2BY5 X; 1Q31 A; 1L2E A; 3FZZ A; 2BYA X; 4X1N U; 1J14 A; 1SMF E; 2I6Q A; 4BXW A; 3K9X B; 4Y79 A; 1GI8 B; 4E7R G; 1TFX A; 1UHB B; 1WXR A; 1E38 B; 3M7Q A; 4MQA A; 3RMM H; 1ZLR A; 5FPS A; 3H09 A; 3MNC A; 5C1U A; 3GIS B; 3M7U A; 1UTP A; 2F4L A; 1XUI A; 4NIX A; 2K8I A; 1A7S A; 5GXP A; 1UCY E; 4CRF A; 2BLO A; 2KR7 A; 2G00 A; 1RIW C; 2FS8 A; 1DUA A; 3F2H A; 5JBC S; 1AVG H; 1BRC E; 3R3G B; 3BTH E; 3RXD A; 3S0N A; 1B5G H; 1XX9 A; 1YLC A; 2M2A A; 1EZQ A; 5C17 A; 3K6Y A; 2KCP A; 2Z9K A; 3ZZ7 A; 1ZHP A; 1KTT B; 3E0N B; 1GHA F; 1CGI E; 4Y71 A; 3RXS A; 1QFK H; 1QB1 A; 7KME H; 1ZPB A; 1MAY A; 1S6F A; 2BQW B; 2RA3 A; 3FP6 E; 3LGU A; 1QL9 A; 1A0J A; 1JBU H; 2QF3 A; 2H9T H; 5B6L A; 3ZVD A; 1CA8 B; 2VWL A; 3IG6 B; 1BJV A; 1AUJ A; 4K60 A; 1ZJD A; 2H9H A; 4H4F A; 1G37 A; 3F9F A; 6GCH F; 1HXF H; 5DKM A; 2F9P A; 4IC5 A; 5KGO A; 4XSK U; 2A5I A; 1XMN B; 1V2S T; 1OWH A; 2CHA C; 1NES E; 2EA3 A; 2PUQ H; 2HVY B; 3ZZ6 A; 4ZKR U; 2Z9G A; 1GVL A; 3HGN A; 1HJA C; 2QXJ A; 2P93 A; 1AWF H; 3BEF B; 3RDZ A; 1IOE A; 1V2J T; 1SHY A; 2ZP0 H; 3ZVG A; 1GL1 A; 1A5H A; 2B9L A; 1YPH E; 2CN0 H; 4XDE A; 3T5F H; 2STB E; 3SYJ A; 1KXB A; 3KQC A; 3SNE A; 1Z6E A; 4FUF A; 4ZAE A; 4KP0 A; 2P59 A; 3ATK A; 1W0K D; 1PPB H; 2KX4 A; 4ISL A; 1S0R A; 3KCG H; 4K8B A; 1Q2W A; 2WV4 A; 3T28 A; 1O2I A; 2V35 A; 3AAS A; 1O3G A; 2ALP A; 5IYT A; 4B1T A; 1NBM E; 5E0H A; 1NRR H; 3GYL B; 3KGP A; 1YPG H; 2AH4 X; 4OS4 A; 2BDY A; 1C4V 2; 2PKA A; 3EE7 A; 2J92 A; 2Z3E A; 1FZZ A; 3S69 A; 2BLW A; 1AN1 E; 3QX5 H; 1TOM H; 4AYY B; 4UFD H; 4YOJ A; 2A4Q A; 2H5D A; 3TJO A; 1TX7 A; 1O2Z A; 1UTQ A; 2RCE A; 1MQ6 A; 1O0D H; 2J94 A; 4DVA U; 5A09 A; 1CBW B; 1EAT A; 2JJ2 D; 2O8T A; 1PQ8 A; 1ZOM A; 1UCY H; 2BB4 A; 5C0T A; 3T62 A; 4R0I A; 1IQG A; 3RC6 A; 1G36 A; 1MU6 B; 3GIC B; 4Z0K A; 1BRU P; 1O2K A; 1BUI A; 1D3Q B; 1THR H; 3TIT A; 3DCL A; 4BXS A; 1K1O A; 2H9E H; 4TPI Z; 1V2N T; 1AQ7 A; 1AO5 A; 2VID A; 2WPD D; 1IQN A; 4A7I B; 1SKY E; 1MUE B; 4F48 B; 2VU8 E; 2GKV E; 3FKS D; 1LHG H; 1DSU A; 5CDF E; 3BG4 B; 1PFX C; 3EAJ A; 1UK2 A; 1F92 A; 1LO6 A; 3F9G A; 1THP B; 1XUF A; 4DII H; 9EST A; 1XUG A; 5C67 A; 2A4G A; 4MVN A; 3A87 A; 1MZD A; 3RM0 H; 3NCL A; 4WJG 2; 2XND D; 3RXB A; 1S82 A; 1K21 H; 2ZGB H; 4XRN A; 1NFU A; 2WV9 A; 4X1Q U; 1TBZ H; 3MMG A; 4X6M A; 1AVX A; 3WW7 A; 1XM1 A; 2P3F H; 3SN8 A; 4NCY A; 1J17 T; 1ZML A; 2PLX A; 1RRK A; 5EJL A; 5GDS H; 1WU1 A; 3V0X A; 3KEE A; 4OGY A; 4VGC B; 1BJU A; 1C5R A; 1AKS B; 1JIR A; 2GDE H; 1SLX B; 3VG8 A; 3ZZ9 A; 1E1R D; 1IQM A; 1Z8G A; 1GHB G; 1IQH A; 1O33 A; 3ZZA A; 1AB9 B; 1O2H A; 1SLW B; 1ELG A; 1WTH D; 1VCQ A; 4E05 H; 4LK4 A; 4WH6 A; 3ATL A; 2CF9 H; 2IPQ X; 1FAK H; 4NA7 A; 3P17 H; 2J9N A; 2OLG A; 3E3T A; 1XKA C; 1GJ6 A; 1MMJ N; 3TPI Z; 3MNB A; 3PV4 A; 3S7K B; 1BBR K; 1BIO A; 2ANM H; 1F5R A; 4A92 A; 4Q7Z A; 2IJO B; 1O3O A; 2GMT C; 3UUZ A; 5DP4 A; 2PSX A; 2QN5 T; 3A88 A; 3SU4 A; 1DWD H; 1HYL A; 4X6N A; 5FPY A; 3ZZ3 A; 4DG4 A; 2BD9 A; 4FET A; 1GL0 E; 1DDJ A; 3FFG A; 1EPT A; 1BMF D; 4JYU H; 2YNA A; 1P9U A; 1FPC H; 2THF B; 1DPO A; 4RKJ B; 1K2I 1; 4E7N A; 3QZQ A; 4M9F A; 1T7C A; 3ZZB A; 2K1Q A; 1BRA A; 1TPP A; 3H7T A; 1C2G A; 1OP0 A; 2BXT H; 2Y7Z A; 1QJ1 B; 4RT1 A; 2LP6 A; 3AVZ A; 2XXL A; 2HVX A; 4DCD A; 1JMO H; 1O3J A; 3TIU A; 1QL7 A; 1GGD B; 2KFW A; 3A81 A; 2RDE A; 3BTE E; 1OX1 A; 4ACA A; 1A61 H; 1T4U H; 1PYT D; 2R0K A; 1Y5U T; 3QK1 A; 1SGF A; 2QV1 A; 1C5Q A; 1Y3Y A; 1HJ9 A; 3RXT A; 4GCH G; 1UK4 A; 5E0G A; 4ISN A; 1IQK A; 2XCN A; 1G3C A; 2A5A A; 2SGQ E; 3ZZ4 A; 2V3M A; 3UWI A; 1MTN C; 4B6F A; 2ULL A; 1GG6 B; 3A89 A; 1HAG E; 2PV9 B; 3UOP A; 3TK5 A; 4BAM B; 1A46 H; 1FN6 A; 1P03 A; 3ZV8 A; 3O8C A; 1O3N A; 3E1X B; 3M5O A; 4UFG H; 1AFQ C; 1QBV H; 3SU0 A; 3UFA A; 1PQ7 A; 2PKA B; 1JIM A; 1H9L B; 4I33 A; 1L0Z A; 3I29 A; 1HGT H; 3TJU A; 4CH8 B; 1F0R A; 1TNL A; 2BY6 X; 4IS5 A; 5AFY H; 2LNC A; 1XUJ A; 2AEI H; 2BVS H; 3BTF E; 4CHA B; 3WWF A; 1JWT A; 3URD A; 1WTG H; 3NXP A; 2Y7X A; 2VVU A; 4NSY A; 1MKW H; 3RXO A; 3VEQ B; 5EIY A; 5DPA A; 4AB9 A; 2HPQ H; 4AGK A; 1O36 A; 2W7U A; 3PLP A; 1BZX E; 1CO7 E; 5EJZ A; 1O35 A; 5AHG H; 2HLC A; 4HZH A; 1H8H D; 2ZHE H; 2AIP A; 1BB0 B; 4AC9 A; 1F5L A; 1SGN E; 1O2V A; 1QHR B; 2O8U A; 2QIQ A; 3Q76 A; 1OOK B; 1UTL M; 3OE7 D; 4WH8 A; 2WPJ S; 5K7R A; 2HPP H; 3GDV A; 3CNR A; 1O2P A; 1EP6 A; 1K28 D; 3M35 A; 5B6O A; 1RXP A; 1WV7 H; 2ASU B; 1GHX H; 2B7D H; 2FI3 E; 2PWX A; 1KXF A; 3PMB B; 3MQK C; 4NWL A; 1A2C H; 1FV9 A; 2ZDA H; 1YPH C; 2H2Z A; 1ESB A; 1CGH A; 3I77 A; 1GBI A; 2R2W U; 3Q00 A; 1YPM H; 4AOQ A; 1SVP A; 2O8M A; 2ODY B; 1C1T A; 1EUF A; 5HGG A; 1E1Q D; 3BTT E; 2SNW A; 2GCT C; 1N8O C; 1O5F H; 1GJ8 B; 3HK6 B; 5FPT A; 1NO9 H; 3SU5 A; 5LPE A; 3P8F A; 3AW0 A; 3ATI A; 1PPH E; 1MTW A; 1VGC B; 1INC A; 5EPN A; 4GUX A; 5C94 A; 1XXF A; 4IN1 A; 1GBB A; 1ANC A; 2KCA A; 2QYI A; 3DT0 H; 2TIO A; 3A7V A; 3P8G A; 1W11 U; 4TY6 A; 4BAH B; 4DT4 A; 3M5M A; 3MHW U; 1SGI B; 4I8G A; 4X8V H; 2FX4 A; 1GI4 A; 1O2G H; 2G5V A; 2QF4 A; 1HAY B; 2F3C E; 5F8Z A; 2HNT F; 3D62 A; 5CE1 A; 1SLV B; 4U30 A; 5EXM A; 2FO9 A; 3CP7 A; 2C93 B; 1JXP A; 5EGM A; 1UTN A; 1C2I A; 4TPY A; 2FM2 A; 3BIV H; 4X2V A; 1VIT H; 4A1V A; 1E34 B; 1O3I A; 2PUX B; 2WPK S; 1J16 A; 2JET B; 4X1S U; 1CA0 B; 1DST A; 1B7X B; 1C2D A; 1ELT A; 5TJX A; 1GBL A; 1EPT B; 3EE0 B; 2ZEB A; 4KEL A; 4FXG H; 1C2J A; 1O2R A; 1TAB E; 2GV7 A; 3GCT F; 4OS5 A; 1TRM A; 2V6N A; 3S9A A; 1THS H; 1VIT G; 3RXG A; 5JB9 S; 3NK8 A; 4P00 A; 1VZQ H; 3LH3 A; 1ARB A; 5C0U A; 2G81 E; 2VIN A; 3NPS A; 1HAO H; 1P2I A; 1O5A B; 2Y5H A; 1FXY A; 5A8X A; 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4I32 A; 4H6S B; 4AGJ A; 2J34 A; 2F43 B; 2XTT B; 3URE A; 4JK5 A; 1P09 A; 2IOT A; 5FCK A; 4LZ4 B; 1QZ8 A; 4NA8 A; 2GV6 A; 3ELA H; 2GCH G; 1MQ5 A; 2ZGC A; 4FOU C; 1NRQ H; 4TY7 A; 5EXN A; 3TNT A; 3ZVB A; 1HXE H; 1EAU A; 2ZGJ A; 1O5C B; 1BTY A; 2WUC A; 1PPZ A; 3TNS A; 4IN2 A; 5A2M H; 4DY7 B; 1T32 A; 3LPR A; 1XVO A; 4R8T B; 2VWN A; 3N7D A; 1CGJ E; 1B0E A; 1AE5 A; 2YMS B; 1RS0 A; 1GI6 A; 3U9A H; 1C2K A; 3RXM A; 2VGC B; 1C1O A; 1LTO A; 1VR1 H; 2ZDN A; 2IJD 1; 3VFE A; 4ZH8 A; 1C5O H; 2EY4 C; 4ZUH A; 1SC8 U; 1GI5 A; 1HIA B; 3AW1 A; 2JIZ D; 4JK6 A; 1O3F A; 1LVO A; 1IQF A; 3LJJ A; 2XW9 A; 1HBT H; 1TQ7 B; 2CJI A; 4EST E; 1FY1 A; 3M5L A; 3TJV A; 1P11 E; 2FTM A; 3EA8 A; 1PPG E; 3SBK A; 4XOJ A; 2ZQ1 A; 1C5Z B; 2A4R A; 2NU0 E; 2XWB I; 5EST E; 1MKX K; 1HLT H; 4CRA A; 1EOJ A; 1PYT C; 1M9U A; 4YLQ H; 2G52 A; 1RGQ A; 4AFQ A; 5I25 A; 3PWB A; 1AVW A; 6LPR A; 4K69 A; 1CQQ A; 3UR9 A; 2QA9 E; 3AAV A; 2BD5 A; 1FQ3 A; 2G4U A; 2NU3 E; 3SU2 A; 1ZMJ A; 1SSX A; 1ZZZ A; 4TWY A; 3RMN H; 2BX3 A; 2Z7F E; 6EST A; 1TGT A; 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