The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
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sequence length |
74
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structure length |
74
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Chain Sequence |
VDMSNVVKTYDLQDGSKVHVFKDGKMGMENKFGKSMNMPEGKVMETRDGTKIIMKGNEIFRLDEALRKGHSEGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Metal binding protein
|
| source organism |
Cupriavidus metallidurans
|
| publication title |
Molecular basis of the cooperative binding of Cu(I) and Cu(II) to the CopK protein from Cupriavidus metallidurans CH34.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Copper resistance protein K
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| total genus |
5
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| structure length |
74
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| sequence length |
74
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-06-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF11525 | CopK | Copper resistance protein K |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Beta Barrel | Thrombin, subunit H | Thrombin, subunit H |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2K0Q A; 3N7E A; 2LEL A; 2KM0 A; 3DSO A; 3DSP A; 3N7D A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1EOL A; 5HGG A; 2WV4 A; 3BTE E; 5A09 A; 2GDD A; 2KZ4 A; 2XC0 A; 1C5Y B; 1ZPZ A; 2XBV A; 1W12 U; 1QA0 A; 3DA9 B; 1FY5 A; 2O8M A; 2ZF0 H; 5CHA C; 3P17 H; 1N1L A; 1GI4 A; 1TB6 H; 1ELT A; 1CO7 E; 1L4D A; 1RIW C; 4WVP E; 3PYH A; 3BF6 H; 3EA8 A; 2GP9 B; 1H9H E; 1BTX A; 3OYP A; 1E1Q D; 2FTM A; 2ZU1 A; 2OC0 A; 2P3U B; 3LIW A; 3A7W A; 1Z7K A; 1Z8I B; 2BD7 A; 2J38 A; 3U8T H; 2G4T A; 1J8A A; 1KXC A; 2HGT H; 1Y5A T; 1ZHR A; 3TK9 A; 5GPI B; 2V3H H; 2QGR A; 5L2Y H; 2BTC E; 3R0F A; 6EST A; 4OS4 A; 4INK A; 5EPN A; 5E2O A; 1ZHP A; 2QYI A; 3GIC B; 1SQA A; 2J98 A; 2P94 A; 5EXN A; 2PR3 A; 1FON A; 2NU0 E; 4AFS A; 3RXB A; 3QGN B; 1RXP A; 3F9F A; 2BZA A; 3QTO H; 1GJ8 B; 4MG3 A; 3A80 A; 3ZZ8 A; 1BUI A; 2QXJ A; 2QF5 A; 4JCN A; 1O2G H; 2F9B H; 1NRQ H; 4A6L A; 5FBI A; 1GVZ A; 2I6Q A; 4HGC A; 3ATM A; 1QRW A; 1LHE H; 1UCY E; 2B9L A; 1CHO F; 2XBW A; 3RXP A; 2F9N A; 2BY7 X; 4RT0 A; 4Q7Z A; 3ATW A; 3ATL A; 1K1N A; 1OWK A; 3DUX H; 3SU1 A; 5BRR E; 1YLC A; 5DK1 A; 3SN8 A; 5FPT A; 2BXT H; 1VR1 H; 3RXI A; 4E06 H; 1ZR0 A; 1O3C A; 1BMF D; 1BRB E; 3W1E A; 1W0Y H; 2BM2 A; 1CA0 B; 7GCH F; 1WTG H; 1JOU B; 5IYT A; 1UTN A; 4B2C A; 3N7O A; 1C1M A; 2AMP A; 4Z0K A; 1E79 D; 3MOC A; 4XBB A; 1TLD A; 4Y11 E; 1NFW A; 1AFE H; 1AVX A; 3PV2 A; 1NZQ H; 1E38 B; 1QRX A; 3JZ2 B; 4KP0 A; 5FX5 A; 2TPI Z; 1EAS A; 1JBU H; 1O36 A; 5A0B A; 1ID5 H; 1THR H; 4ABH A; 4FU9 A; 1YF4 A; 1EZQ A; 4AYV B; 4CRD A; 4OS6 A; 1H8D H; 2W3I A; 1C1W H; 2XC4 A; 3RU4 T; 1VIT G; 1OHH D; 3BTG E; 1NC6 A; 2WYJ A; 1ELD E; 1O33 A; 5C17 A; 5HYO A; 3OSY A; 2R9P A; 1Z8G A; 1A0L A; 1NRS H; 1P57 B; 1ZJK A; 1O2V A; 1WOF A; 2A31 A; 5EG4 A; 3ZZC A; 1ARB A; 3RXJ A; 2F43 B; 1GCD A; 4X1Q U; 5GCH G; 5HM9 A; 3U1J B; 1TNJ A; 4GSO A; 3N99 A; 4BAM B; 2G00 A; 4ZUH A; 1T8O A; 1TGB A; 2ANY A; 1SQO A; 5EU8 A; 1O3J A; 3PMJ A; 2GCH G; 4IMQ A; 3P8F A; 2ZU5 A; 2BDH A; 1HJ8 A; 1FAX A; 1HRT H; 3ZZA A; 1Y59 T; 5A2M H; 1BHX B; 2A1D B; 1IQH A; 2BLQ A; 2VH6 A; 1C2L A; 2ZO3 H; 1O30 A; 5GDS H; 3NPS A; 3UWJ H; 2GDE H; 1UW7 A; 4DW2 U; 2EI6 A; 2K8I A; 4K60 A; 1K1O A; 1EPT B; 3KGP A; 4DJZ B; 3EA7 A; 2A4Q A; 3ZZ7 A; 1BJU A; 1YWU A; 2OK5 A; 1WAY B; 3A8D A; 2KM0 A; 3LON A; 2ZG0 H; 3LGV A; 2ANW A; 3A88 A; 1GL1 A; 3MO9 A; 4BTI B; 1GBJ A; 1O2W A; 3RXV A; 2CGA A; 3DSG A; 3L33 A; 3LJO A; 1TNI A; 1SI5 H; 4O3U A; 1C1U H; 2C4F H; 1O5G H; 4Q63 A; 3MH5 A; 1MUE B; 1DXW A; 4XDE A; 1CE5 A; 2YNB A; 1Y3Y A; 1EAW A; 5TCC A; 1BCU H; 1O2H A; 3B23 B; 1LVO A; 4KTU A; 1V2Q T; 2VIW A; 4I33 A; 2JKH A; 3GYM A; 1C5Q A; 2QXH A; 1IQK A; 4OGY A; 4Y0Z E; 3PLB A; 4MQA A; 1IHS H; 1PQ8 A; 2CXV A; 1TBR H; 3AAV A; 3TGI E; 2A7C A; 2SGQ E; 1UTP A; 1C5Z B; 1XUG A; 2XNI A; 2J9N A; 1DT2 A; 3LGY A; 1CT4 E; 5I46 H; 3SJ9 A; 2GV7 A; 1G9I E; 1D6R A; 1GBL A; 4FVD A; 4J2Y B; 4LOY H; 2PTN A; 2WIN I; 1ABJ H; 1KXF A; 2ODQ A; 2VGC B; 1WQS A; 4B1T A; 1XX9 A; 4CRC A; 1TGN A; 4BXW A; 3OU0 A; 3DCL A; 3MU0 A; 1O2Q A; 3LGU A; 5C0U A; 1AY6 H; 1SLW B; 2F4L A; 3UB0 A; 1GI8 B; 3F0O A; 1TNK A; 2AER H; 1AMH A; 4ZKS U; 2AGE X; 4F48 B; 4IC6 A; 2JIZ D; 2FI3 E; 1PPZ A; 3UR9 A; 2ANK H; 3RXT A; 1AE5 A; 2CN0 H; 1F92 A; 1AFQ C; 1AGJ A; 2G52 A; 2ZFR H; 4UFE H; 4KEL A; 4R0I A; 2XOK D; 1TX8 A; 1AWF H; 1T8N A; 1C2K A; 3HK3 B; 3SZE A; 4JYT A; 4CBN A; 1BBR H; 4CR9 A; 4ABG A; 1GBK A; 7LPR A; 4TT3 D; 2UWP A; 4PRO A; 2P3T B; 1GL0 E; 2NWN A; 3VGC B; 1O34 A; 4ABE A; 1CBW C; 2XXL A; 1EOJ A; 1ZML A; 2VVC A; 2OQU A; 3PTN A; 3B8J A; 3SZN A; 2KFW A; 1CT0 E; 2YMS D; 1XXF A; 4SGA E; 1ELF A; 2G4U A; 2CHA C; 4NG9 H; 4NIX A; 1LHG H; 2XBY A; 1F2S E; 2RCE A; 1Y5B T; 5F53 A; 2A5I A; 3O8D A; 3TJU A; 3RXM A; 1AB9 B; 3T2N A; 1AE8 H; 4MPW A; 4GHT A; 2QF4 A; 7GCH G; 3IWM A; 1GGD B; 4Y76 A; 1QL9 A; 1EP6 A; 1H9L B; 1E1R D; 4JZE H; 2Z94 A; 3D65 E; 3VB7 A; 2VWO A; 5AHG H; 4CRA A; 2BHG A; 2BVX H; 1IAU A; 1MBM A; 4BAN B; 3OE7 D; 1QJ6 B; 1GMC F; 2FEQ H; 4NA8 A; 1ETT H; 4VGC C; 4NWK A; 1EUF A; 1A3B H; 1OWH A; 2FOH A; 4JZD H; 1YPH C; 2QA9 E; 4CRE A; 1LMW B; 3GDU A; 1GHX H; 5HKK D; 2QXG A; 3SUE A; 2H6M A; 3F68 H; 1IQI A; 1QFK H; 2F3C E; 1WQV H; 2UUK B; 1UTO A; 2GKV E; 5DO4 H; 3M36 A; 5LGO A; 5J4Q A; 1A61 H; 3SU2 A; 4D8N A; 2A7H A; 3F0P A; 1GI7 B; 1GDQ A; 1W11 U; 1V2S T; 2QF0 A; 2Q6F A; 1W0Z U; 2JH6 D; 3GY4 A; 1L1N A; 3V13 A; 3E90 B; 1J15 A; 3U1I B; 1BZX E; 1B5G H; 3LC3 A; 2G5V A; 3NXP A; 4BTT B; 1C5T A; 1TGT A; 4OS2 A; 2ZFP H; 4JZI A; 3ODF A; 1TNG A; 1TA2 A; 2BQ6 B; 2O8W A; 1KDQ A; 5JYI A; 1O2L A; 1O3E A; 4NCY A; 1O3G A; 3ZZ5 A; 1FI8 A; 4TPI Z; 1O3O A; 1Z8J B; 1ZTK A; 2ZFS A; 2PHB A; 3RXF A; 2VBC A; 5TCA A; 1NM6 A; 3DT0 H; 1V2N T; 2W7U A; 4U2W A; 1S82 A; 4LK4 A; 2SNW A; 1HAV B; 1KTS B; 1A0J A; 2BOH B; 1V6D A; 3SV7 A; 3UWI A; 4JYU H; 2IPQ X; 4X8V H; 3T62 A; 5ESB A; 2BYA X; 5DGJ A; 1MKX H; 2ZEB A; 3NZI A; 2ZU2 A; 4Y8Z A; 2BY8 X; 1FZZ A; 3MH7 A; 4ACA A; 2W26 A; 1MH0 A; 1BBR E; 3LDX H; 1RTL A; 1UMA H; 1NFX A; 2A2Q H; 1SGN E; 1SVP A; 3FAN A; 3QX5 H; 1GJD B; 1GWA A; 2XWB I; 2BLW A; 3SBK A; 2W5E A; 4F55 A; 2ASU B; 4MNV A; 5C20 A; 1W7X H; 1GI5 A; 3A87 A; 2HNT E; 3U69 H; 5AFY H; 1HUT H; 1GHZ A; 1MTN B; 4DOQ A; 1YPK H; 1QJ7 B; 1GJC B; 1W2K H; 1JRS A; 2VID A; 3F2H A; 6GCH F; 1O3I A; 1O2J A; 3P70 B; 1TPO A; 3ZVD A; 1V3X A; 1MZA A; 1OPH B; 5DP8 A; 4DVA U; 1BRU P; 3GS9 A; 1Y8T A; 1CGJ E; 1J17 T; 1PPH E; 4E05 H; 2WPD D; 4H4F A; 5FHT A; 3UNS A; 1GHY H; 1TPP A; 1O39 A; 4WMD A; 3ZVA A; 3P92 A; 2VJ1 A; 2GT7 A; 4AB9 A; 4K2Y A; 1GJA B; 2P95 A; 4XOJ A; 2AYW A; 2B5T B; 1L1J A; 1XUI A; 4Y0Y E; 1MQ5 A; 1BB0 B; 3LH1 A; 2ZU4 A; 2ZGX H; 3KID U; 1MTU A; 3TIT A; 3TNT A; 5DP7 A; 4MNY A; 1C2H A; 3ZV9 A; 4K8Y A; 1TAW A; 2XCN A; 2ALV A; 1LHC H; 1T4U H; 1BTW A; 2OLG A; 2GGV B; 3A7T A; 4IGD A; 3W94 A; 1GJB B; 4BOH A; 4I8H A; 1V2O T; 3UTU H; 4B2B A; 4CH2 B; 2GTB A; 2QC2 A; 1V2V T; 1WUN H; 2LEL A; 1UK4 A; 3FVF B; 2FOD A; 1BOQ A; 3ZZ9 A; 4FUI A; 3VB6 A; 4I8L A; 5DJ7 A; 1O2R A; 1K1L A; 1F7Z A; 1YPG H; 2ZFF H; 4B73 A; 3A8A A; 3GIS B; 1QJ1 B; 1TOC B; 1ZPC A; 1KLT A; 3NCL A; 4X1P U; 1O2O A; 4Z6A H; 1C2J A; 1RFN A; 2Z3D A; 2EY4 C; 4KKD A; 4YT7 H; 5JBB S; 1H1B A; 1GBT A; 4X6M A; 1GJ9 B; 1NU9 A; 1TWX B; 2Z7F E; 1HJA C; 1P06 A; 3AAU A; 1SGE E; 1HV7 A; 3QUM P; 2ALP A; 2WUB A; 1TFX A; 2NU4 E; 3SUF A; 3URC A; 3F1S B; 2Y7X A; 5GCH F; 3T27 A; 1AWH B; 1PQ5 A; 2AIP A; 4AOQ A; 4ACB A; 3LKW A; 3SU0 A; 3PO1 B; 3V12 A; 4ZKN U; 1GBD A; 1D3Q B; 2FOC A; 3GCT G; 2FES H; 1OP2 A; 2YMS B; 5HMA A; 4EST E; 2GCH F; 1MTW A; 1Z1I A; 2GCT B; 5ABW A; 2BD9 A; 1THP B; 3BIV H; 1UCY H; 1MKW K; 1J16 A; 4NZQ A; 4RSP A; 1PPF E; 5JB9 S; 2XWA A; 3RXQ A; 4NSV A; 3CS7 A; 1NRN H; 3LJJ A; 2BQW B; 2LPR A; 3BEU A; 1TAB E; 1GBM A; 3N7E A; 4NIV A; 3HGP A; 3GDV A; 3BSQ A; 1GHW H; 3M7U A; 1DY9 A; 2QE7 D; 1FX0 B; 5GND A; 1JMO H; 2BD4 A; 3VG8 A; 5C1U A; 1MCT A; 3GY8 A; 1EXF A; 1QNJ A; 4O3T A; 2XYA A; 2RFK C; 5DP3 A; 3RM2 H; 1FAK H; 1QY6 A; 3Q3K A; 1ZSL A; 2A5A A; 1HAG E; 1EZX C; 1CGI E; 2AMQ A; 2H1U A; 1OWD A; 3MNS A; 3GCH C; 2OQ5 A; 1VCW A; 1L4Z A; 1YGC H; 1UTJ A; 6CHA C; 3PTB A; 1GJ5 H; 1PPB H; 3ZZ4 A; 3SI3 H; 4K1T A; 1RTK A; 1KYN A; 4DT4 A; 1QUR H; 1KTT B; 1N8O C; 1A4W H; 4U01 A; 1GJ4 H; 1ZRB A; 1SLV B; 3EE7 A; 3SNB A; 3SJK A; 1QA7 A; 3UPE A; 2HVY B; 1NBM E; 3RXU A; 2ZP0 H; 5JPM H; 2GMT C; 3P95 A; 3M3S A; 4YT6 H; 2Q6D A; 3FFG A; 3PB1 E; 1C1T A; 1K21 H; 2FIR H; 1Q3X A; 3TIU A; 5CMX H; 3HKI B; 5F8T A; 1TBQ H; 1HB0 B; 3Q00 A; 1WV7 H; 1DDJ A; 4ZHM U; 3RXK A; 3K9X B; 1P03 A; 3SU3 A; 4FUJ A; 1P12 E; 4CBO A; 1DE7 H; 3PWC A; 1CVW H; 1OP8 A; 1BJV A; 4D7F A; 1C1R A; 3P8O A; 1OKX A; 3M61 U; 1BML A; 4XSK U; 1MCV A; 2D26 C; 1Y3W A; 3PWB A; 1MTS A; 4JZ1 A; 4XFQ A; 4INL A; 1TGC A; 1C2I A; 2GZ9 A; 1DVA H; 1QQ4 A; 2PTC E; 3MNX A; 3CNR A; 2IN2 A; 5H4I B; 4B76 A; 4Y79 A; 1FY3 A; 1YPE H; 2FMJ A; 5T6G A; 3C27 B; 1EAX A; 2BD8 A; 4A1V A; 3UOP A; 3F3B A; 3KHV A; 1W3C A; 3S69 A; 3ATI A; 1P3C A; 1GPZ A; 1GCT C; 1C4U 2; 1DY8 A; 3ENS B; 2ZGC A; 4RI0 A; 4ISI H; 5A0C A; 2V7Q D; 3EAJ A; 3UQO A; 3O8R A; 3URE A; 2C3S A; 2IPH A; 3V7T A; 3BTF E; 1TPS A; 1QL7 A; 1GI1 A; 8GCH G; 5EOK A; 2OC1 A; 1GHV H; 1TPA E; 2ZDM A; 1T8L A; 1M9U A; 5CDF E; 3O8C A; 1P2O A; 1ZTJ A; 1FDP A; 3ITI A; 1HAX B; 3PMH B; 3GY7 A; 2J98 B; 5GJ4 B; 4YLQ H; 3S9C A; 5CHA B; 5C0T A; 6GCH G; 2FLR H; 1C5U A; 1BTY A; 1NFY A; 3MMG A; 1C9T A; 1V2P T; 2KCA A; 4AB8 A; 1LVM A; 1RIW B; 1ZOM A; 2I6S A; 3K6Z A; 5T3H A; 3ZYE A; 3S9A A; 1NRP H; 1DWB H; 3M5N A; 2BY5 X; 3U9A H; 1S6H A; 4UFD H; 2BQ7 B; 2F9O A; 2FO9 A; 4X2X A; 2FYQ A; 1HFD A; 1BMN H; 1FIZ A; 4SGB E; 2WHX A; 4D7G A; 1AO5 A; 1P01 A; 1C1Q A; 5DP5 A; 1MKW H; 2FOG A; 1P9U A; 4Q4L A; 3WW7 A; 1UTK A; 2JET C; 4ABA A; 2SGE E; 3BTM E; 2B8O H; 1LHF H; 1P8V C; 1UVO A; 1MTV A; 3H5C B; 3MU8 A; 2W6I D; 1G3D A; 3RMO H; 1PPG E; 1NRR H; 1C5N H; 3A7V A; 1XVO A; 1XUH A; 3WY8 A; 1BBR K; 2FP7 B; 3KQE A; 1ABI H; 3SUG A; 4DUR A; 3A8B A; 1KXD A; 2FZZ A; 3A84 A; 1O3M A; 4ZRO A; 1EZS C; 1NRO H; 2A45 B; 4WY3 A; 5EOD A; 1UK3 A; 2VIO A; 1QZ8 A; 4O9V A; 5TJX A; 4U32 A; 2PW8 H; 3U28 C; 2Z9G A; 3QZQ A; 2BDI A; 1GBH A; 5FCR A; 1MBQ A; 1O38 A; 1XUF A; 2QAA A; 4YXW D; 4FUH A; 1HDT H; 4HFP B; 4YLU A; 5IDK A; 4X2Y A; 2F9U A; 1YC0 A; 5KGO A; 3KN2 A; 4WMF A; 1E37 B; 1TIO A; 5J4S A; 1V2U T; 2BX3 A; 2DE9 A; 1A1R A; 2XND D; 1C5W B; 4E7N A; 1G3B A; 1D3T B; 2ODY B; 1IQJ A; 1YPJ H; 1D3P B; 3GY2 A; 2TIO A; 5DN6 D; 1SG8 B; 1TX6 A; 2A2X H; 3O8B A; 1O3F A; 1A0H B; 4NZL A; 2KR7 A; 1E35 B; 3F9E A; 2HPQ H; 4LXB H; 1ELB A; 2R2M B; 5T1V A; 3M37 A; 4AOR A; 3EDX B; 2PUX B; 2V35 A; 5DPA A; 1SQR A; 3BG4 C; 2SNV A; 1ZMJ A; 1C5X B; 3MHW U; 3PLK A; 5EQS A; 1WDI A; 4Y7A A; 1AVG H; 1OSS A; 2UUJ B; 1P2I A; 1V2J T; 3SND A; 1YP9 A; 3IIT A; 1G32 B; 1GDU A; 3M7T A; 1HCG A; 3VEQ B; 1P04 A; 2J94 A; 3CS0 A; 3LT3 A; 3RXG A; 1O2N A; 1EX3 A; 1LCY A; 1SLU B; 1DAN H; 1C5P A; 2CF8 H; 4M7G A; 4BAH B; 3RLY H; 1RGQ A; 1GG6 C; 4B2A A; 2HRV A; 4FU8 A; 3QZR A; 1DX5 M; 3PRD A; 4Q7Y A; 3U98 H; 1P2Q A; 2QCY A; 2PLX A; 5HIZ A; 5B6L A; 2Y5H A; 1UTM A; 3BEI B; 3QN7 A; 3HKJ B; 3RXL A; 3RXR A; 1C1O A; 5FXL A; 2R0K A; 1CT2 E; 2ZFT A; 1XVM A; 4ZAE A; 1HAZ B; 1QHR B; 4ISH H; 2RDL A; 4QT8 C; 3STI A; 3BIU H; 2DUC A; 4FUD A; 3BN9 A; 4OS1 A; 3QLP H; 2EEK A; 1QIX B; 1C5L H; 4RT1 A; 1A5G H; 2HVX A; 3FAO A; 3TNS A; 4XBD A; 1HXE H; 2GVF A; 4J1Y A; 5EXM A; 4LZ1 H; 4X8U H; 1GMD G; 2PSY A; 2WSS D; 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