The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
104
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structure length |
104
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Chain Sequence |
GSQRQFARVKLPARIRYIGANREGVDARLLDLSAGGFAFTASGAPIQPGDLYKGKLLFQVDSISFSLEVEFQVRSVDPASRRVGCEFQNLKPREVAALRYLITS
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Unknown function
|
| source organism |
Pseudomonas aeruginosa
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| publication title |
Pilz domain with c-di-gmp of a protein from Pseudomonas aeruginosa
rcsb |
| molecule keywords |
Alginate biosynthesis protein Alg44
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| total genus |
18
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| structure length |
104
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| sequence length |
104
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| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature |
ec
2.4.1.33: Mannuronan synthase. |
| pdb deposition date | 2015-01-21 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Beta Barrel | Thrombin, subunit H | predicted glycosyltransferase like domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1YLN A; 2GJG A; 3CNR A; 4P02 A; 4RT1 A; 5EJZ A; 4FOU C; 5EJ1 A; 3DSG A; 1YWU A; 5KGO A; 4HG6 A; 5EIY A; 5EJL A; 4RT0 A; 4F48 B; 3KYF A; 5KEC A; 4P00 A; 3KYG A; 4XRN A; 2RDE A; 4I86 A; 2L74 A; 5KED A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3EQ0 H; 1YY3 A; 5FCR A; 2VU8 E; 4UD9 H; 4Y8Y A; 5AF9 H; 1N8O B; 1V2O T; 1GHW H; 4XBB A; 1TWX B; 3VB4 A; 3BTK E; 1A5G H; 4KTS A; 2VWM A; 2BDA A; 1WDI A; 2OD3 B; 4BAH B; 1K1N A; 2CF9 H; 4AZ2 B; 1ELG A; 4D8N A; 4NA7 A; 1O5F H; 1Y5B T; 2WPI S; 1C1T A; 4KEL A; 4YZU A; 5HM2 A; 2ZA5 A; 4AFQ A; 1IQG A; 3PLK A; 2OP9 A; 4BAO B; 3ATM A; 5F6M A; 5LH8 A; 2TRM A; 1SGY E; 1LTO A; 1O5B B; 1UHB A; 4UEH H; 1QBN A; 1XUJ A; 1FPH H; 3M3S A; 4ZHA A; 3SU2 A; 1MKX K; 1DST A; 2O9Q A; 2PFE A; 2VH6 A; 1BUI A; 5IYT A; 2AGG X; 5FPT A; 1MTS A; 1OWK A; 5DGJ A; 2EY4 C; 3P17 H; 3BTM E; 3A8B A; 3MNC A; 5SGA E; 4I86 A; 1NBM E; 5ESB A; 1GVZ A; 1NFU A; 1VCP A; 1UTL M; 1GGD B; 1P3C A; 2W7S A; 3RXC A; 1ZPC A; 5J4S A; 1IOE A; 4FET A; 5JBC S; 2C8Y B; 1QUR H; 3N7O A; 1ZRB A; 2G81 E; 5F03 A; 3S7H B; 4JMY A; 1V2W T; 3BG4 C; 2F9B H; 3KN2 A; 1HDT H; 2BX3 A; 2KCY A; 3BN9 A; 3PMA B; 1EPT A; 4X1R U; 1DWB H; 2YMS D; 1QB1 A; 2BY5 X; 3CS0 A; 4JZE H; 1ID5 H; 1W0K D; 4TT3 D; 2R0L A; 2A4O A; 5LPE A; 1K1M A; 3NRL A; 5H4I B; 5DP7 A; 1GI6 A; 2B5T B; 2BDG A; 1O36 A; 1GMD G; 3ZZD A; 3BIV H; 2D2D A; 2H5C A; 2FO9 A; 2Z6B D; 5KGO A; 2XTT B; 4DVA U; 1O34 A; 4Q4L A; 1GBJ A; 1T4V H; 3IG6 B; 2ZNK H; 3TGJ E; 1YYY 1; 1E38 B; 3T5F H; 1W14 U; 2ZGJ A; 3OU0 A; 1V2J T; 3GCO A; 1QR3 E; 1QGF A; 4M7G A; 3DHK H; 4A5T S; 1O3B A; 2R0K A; 1GJ4 H; 3A81 A; 3NPS A; 2UWP A; 4X8V H; 5DPA A; 1YCP M; 4ZUH A; 1EZQ A; 3BEF B; 1FAX A; 1D9I A; 3TK6 A; 1GDN A; 4CRB A; 3K6Y A; 4X6M A; 4CRA A; 3BEU A; 1P8V C; 1SGE E; 4BTI B; 1V2V T; 4DW2 U; 2VGC B; 3GCT G; 3VB3 A; 4I33 A; 4H6S B; 1Z71 A; 2O8T A; 1W0Y H; 3Q3X A; 2GZ9 A; 1C2I A; 3AAV A; 3VPK A; 1G2L A; 2ZCH P; 1SBW A; 4P02 A; 3RXQ A; 1LPZ B; 2WV9 A; 5DO4 H; 3A7X A; 1UVU H; 1Z6J H; 5EOK A; 5B6L A; 1E79 D; 2CF8 H; 1JRT A; 1C2E A; 1IQJ A; 2NU0 E; 4F48 B; 1ZTK A; 2BDH A; 2XBW A; 1EJM A; 1W3C A; 1KMH B; 2R3U A; 3O8C A; 2TPI Z; 1GMD F; 3MMG A; 5JBT A; 1V2S T; 5JPM H; 4ISN A; 1F0S A; 3UB0 A; 1TX8 A; 2ZCL P; 4TYD A; 1O5D H; 1AB9 C; 1HXE H; 1ORF A; 4MNY A; 2OK5 A; 3FZZ A; 1AQ7 A; 2JJ2 D; 4QT8 C; 1ZHR A; 1C5M D; 1P11 E; 4CRC A; 2TGP Z; 2WPD D; 3HK3 B; 3TU7 H; 4MDS A; 1TIO A; 2ZIQ H; 3AAU A; 1CVW H; 1QBO A; 1XUF A; 3SU0 A; 2CJI A; 3GY4 A; 3EGK H; 3PRD A; 3F0O A; 1ZOM A; 4BAK B; 1GVK B; 4XFQ A; 1A2C H; 1O5A B; 2GV6 A; 3HGP A; 1GPZ A; 1EAI A; 4I8K A; 1FPC H; 1RD3 B; 3RXT A; 1P05 A; 4MPW A; 3L6P A; 1GMC G; 1GBA A; 4OGX A; 1BCU H; 4XBC A; 2BD7 A; 4FUJ A; 1C5X B; 3K9X B; 5FX5 A; 5HIY A; 2XOK D; 1TYN A; 3UR9 A; 3TNT A; 4NG9 H; 1AIX H; 4SGA E; 3S69 A; 2Y5G A; 3DA9 B; 3ZZ8 A; 1DPO A; 4DT4 A; 1AZ8 A; 1ANE A; 1P0S H; 1TA2 A; 1UCY K; 5DSF A; 3QDZ B; 2BD5 A; 1CGI E; 1A46 H; 3KGP A; 3U1J B; 1O3N A; 2RA3 A; 1H1B A; 1HPG A; 3F2H A; 3W1E A; 1QZ8 A; 3CNR A; 2G8T A; 3BTF E; 4ZAE A; 1UTK A; 4CRE A; 3PMB B; 2GGV B; 1GG6 B; 2A4R A; 3LJJ A; 3MU1 A; 1O0D H; 4ISO A; 1YCP H; 2GVF A; 1SC8 U; 3KNX A; 4H4F A; 2WUC A; 5ABW A; 2XWB I; 1C1N A; 3QGJ A; 2P16 A; 3MI4 A; 3TPI Z; 1H8D H; 2BTC E; 1OP8 A; 3P70 B; 4RKJ B; 5CE1 A; 4B2B A; 4NZL A; 4DOQ A; 1S81 A; 3DFJ A; 2PUX B; 2ODQ A; 3SHA H; 5GJ4 B; 4JYT A; 3SU6 A; 3U69 H; 1BIO A; 1P12 E; 3F9F A; 1AND A; 1SVP A; 4IMQ A; 2QF5 A; 5C1X A; 3R0F A; 1ELE E; 1WTH D; 2FX4 A; 2GX4 A; 2PTC E; 2QAA A; 3A7T A; 1HBT H; 3OFN D; 1J15 A; 5TCA A; 1LKA A; 2JH6 D; 1VZQ H; 1GHA G; 1JRS A; 2ZU4 A; 3KL6 A; 5C1Y A; 5JDU B; 4AX9 H; 5FBI A; 4AOQ A; 5C20 A; 4DJZ B; 1W8B H; 1T4U H; 3ATI A; 3OTJ E; 1V6D A; 2HVX A; 2WZQ A; 2HNT E; 3E3T A; 3RM0 H; 2PP6 A; 1EZU C; 1P9S A; 3GY2 A; 4GCH G; 3MHW U; 4BNR A; 3ZZB A; 1QJ1 B; 4X8T H; 2HRV A; 1S6F A; 3RXH A; 4ISI H; 1W7X H; 5TCC A; 1EP6 A; 1MKX H; 1O2Z A; 2BM2 A; 4CRF A; 2Y81 A; 2JIZ D; 1VGC B; 3SI4 H; 1ZTL A; 3D49 H; 3RXG A; 5B6O A; 1EOL A; 1DLK B; 5E2O A; 1EPT C; 5EPN A; 3T28 A; 2IOT A; 2A32 A; 3PV4 A; 3Q76 A; 2BXU H; 1O2S A; 2PTN A; 5JB9 S; 2V3M A; 1GI5 A; 5BPE A; 2KX4 A; 1EB1 H; 5HGG A; 3R3G B; 1S5S A; 4IC6 A; 1Z8R A; 2QF3 A; 1QRZ A; 3N7E A; 1IQI A; 1TB6 H; 1KXB A; 2ZP0 H; 4ABB A; 2WYG A; 2Z9L A; 3RXD A; 1ARC A; 4Y7B A; 1ELA A; 1LHF H; 1XXD A; 4GSO A; 4K2Y A; 1Q31 A; 4WMF A; 1DSU A; 2GD4 B; 4X8S H; 1AKS B; 2C4F H; 2QXJ A; 3PRO A; 1CQQ A; 1GHA F; 3NUM A; 1SFI A; 3M5M A; 5EJZ A; 2AGE X; 1DIC A; 1VIT H; 4JCN A; 4ACB A; 3UAI C; 2I6Q A; 2ZHQ H; 5EOD A; 1S0R A; 2KAI B; 1TX7 A; 1DAN H; 5C1U A; 1YGC H; 2HWL B; 7GCH G; 3FKS D; 2R3Y A; 2XBY A; 3QTV H; 4GCH F; 2G5V A; 1W12 U; 2OBQ A; 1BRC E; 1LPG B; 1GBC A; 2EC9 H; 1GHY H; 2ZDL A; 3MH6 A; 3LT3 A; 1MTN C; 3CP7 A; 5L30 H; 1K1I A; 3F9H A; 1EAX A; 4AC9 A; 1X7A C; 2VIP A; 1LHC H; 3SV2 H; 1IHS H; 2QIQ A; 4XE4 A; 1C2L A; 5T6D A; 3MH4 A; 4FXG H; 3S9A A; 1BRB E; 1K28 D; 2XBV A; 3ZZ5 A; 1O2G H; 8KME 2; 5HMA A; 3LC5 A; 3U1I B; 1FIW A; 2Q1J A; 1ZSJ A; 1ZJD A; 1MQ6 A; 1D3T B; 4M9F A; 3Q77 A; 3BV9 B; 3UOP A; 1Y3X A; 4U01 A; 3UNR A; 1O35 A; 2FI3 E; 1FY8 E; 1BHX B; 4IN2 A; 1A3B H; 1EUF A; 5BRR E; 2XND D; 2YMS C; 1BRU P; 3KQ5 A; 1ZRK A; 2RG3 A; 1ABJ H; 1YLD A; 3FO8 D; 1Y8T A; 1MAX A; 2ZTZ A; 1QRW A; 4O97 A; 1PQ5 A; 2CMY A; 2ZGB H; 1NRN H; 4FUC A; 3U8O H; 1QA7 A; 1GI9 B; 2PUQ H; 2SGF E; 4KTC A; 5EQQ A; 3RML H; 1GJ8 B; 1DUE A; 1UVS H; 1NZQ H; 1DDJ A; 4ZCN A; 1BT7 A; 1QY6 A; 1SGF A; 2F3C E; 1L4D A; 1LKB A; 4FUB A; 2DE8 A; 4RSP A; 1U6Q A; 4INH A; 7GCH F; 3SUD A; 1ANC A; 2FZZ A; 4K8Y A; 1O5E H; 1MKW K; 2GV7 A; 3SV8 A; 2C8Z B; 1DS2 E; 1GVL A; 3ZZ3 A; 3SUE A; 2TGD A; 4GPG A; 1VCW A; 1THS H; 3OEE D; 1PQA A; 3F6U H; 1FDP A; 1SHH B; 2PSY A; 2W7U A; 5E0H A; 1XUI A; 1SI5 H; 2Y5F A; 5EW2 H; 2HAL A; 5JBA S; 2FOH A; 1P2J A; 1QRX A; 1C2G A; 4Q80 A; 1TBR H; 3DSG A; 2K1Q A; 2ZKS A; 4LZ1 H; 2B9L A; 9EST A; 2HGT H; 4GUX A; 1XX9 A; 2ANM H; 2J95 A; 1SGR E; 2SGA A; 2BLW A; 3RXV A; 4B1T A; 4YM9 A; 1KYN A; 3A8D A; 2NU2 E; 5DP3 A; 1UCY H; 3MO9 A; 3TJV A; 2FS8 A; 4ZHM U; 4WXV A; 1BBR H; 5EXN A; 1TGN A; 2KCO A; 3BTQ E; 3PMJ A; 4OS1 A; 1MD7 A; 1TE0 A; 1DWE H; 1GCT B; 1GHZ A; 3E90 B; 1C1R A; 4WXI A; 1EAU A; 2M5T A; 1HGT H; 1AFQ C; 4Y11 E; 1LHG H; 3F0P A; 3KEE A; 1ZGV A; 3PM3 A; 1F0R A; 5FPY A; 1O38 A; 3RXM A; 2A4G A; 3PTB A; 1BTW A; 2Q6G A; 4H42 U; 5GPI B; 4A1X A; 1KXE A; 1UJ1 A; 5DP6 A; 1KLJ H; 2ILN A; 4DIH H; 1G3E A; 2J4I A; 1IQH A; 1P02 A; 3DUX H; 3KQE A; 3B23 B; 1HB0 B; 3SU1 A; 4Y8X A; 1TGC A; 2BQW B; 4IBL H; 1BMA A; 1K1L A; 1PPH E; 5FHT A; 1C5Q A; 4O03 A; 1WBG B; 2LNC A; 3SJ8 A; 3ZZ6 A; 1KXF A; 1V2T T; 2JH0 D; 2VWL A; 1YP9 A; 5IDK A; 2PW8 H; 1FLE E; 5FCK A; 9LPR A; 3L33 A; 2SGD E; 1Y3V A; 1A0H B; 1XUG A; 1S82 A; 2GMT C; 2XYA A; 1DY9 A; 3I77 A; 2AIQ A; 1OWJ A; 1V2P T; 2UUJ B; 1YC0 A; 3M35 A; 1ZZZ A; 3T62 A; 1EZS C; 1O3M A; 2Z9I A; 2W3K A; 1TNJ A; 3RM2 H; 1NRO H; 2BY6 X; 5FAH A; 2Y80 A; 3BTE E; 1MQ5 A; 1P9U A; 2OQU A; 3CS7 A; 4Q63 A; 2ZFS A; 2K0Q A; 1T31 A; 2WPJ S; 2P3U B; 2JET B; 1ACB E; 1NBM D; 7KME H; 3VB5 A; 4ZRO A; 1BOQ A; 3WY8 A; 2BY8 X; 2FXR A; 4F4O C; 1FV9 A; 4YLU A; 1C5T A; 2V35 A; 5AFZ H; 1LQE A; 2A45 B; 1YCP K; 1O3D A; 1GJ6 A; 1Q2W A; 4ZXY H; 2OTV A; 1W7G H; 1ZML A; 2O8L A; 1H9H E; 1O3E A; 1C1S A; 1GJA B; 5L2Z H; 1FI8 A; 4YTA A; 4VGC B; 3TGK E; 2OC0 A; 1Y3Y A; 3BEI B; 3AVZ A; 3FN8 A; 3G01 A; 4FVB A; 4WF8 A; 1ZTJ A; 4XSK U; 5DP5 A; 5FBE A; 2HLC A; 4GLY A; 3TLO A; 1BML A; 5C5N A; 3ZZA A; 4JZF H; 4NFE A; 3OY6 U; 4TWY A; 1OWI A; 1XVO A; 1QB9 A; 1BB0 B; 1C5P A; 3GCN A; 2QY0 B; 2BMG B; 2QA9 E; 4IMZ A; 1O3P B; 2JH5 D; 5A0B A; 3FP8 E; 1GI4 A; 2CN0 H; 2A4Q A; 2ZEB A; 1RTF B; 1EXF A; 2BLO A; 3MNB A; 3KYG A; 1SQA A; 2BDI A; 1P2N A; 4B75 A; 2HLD D; 1ELB A; 2VNT A; 3SNE A; 1ZJK A; 3TH4 H; 2ODP A; 2VVC A; 3U28 C; 4NA9 H; 3HAT H; 3DD2 H; 2KZ4 A; 4I8G A; 2KR7 A; 4X2W A; 1OPH B; 2HPQ H; 2W5E A; 2FM2 A; 4X6N A; 1GBI A; 3PRB A; 2ZO3 H; 2STA E; 4B2C A; 1Z8G A; 3SW2 B; 1V2R T; 3A7Z A; 3RXE A; 2G52 A; 2QE7 D; 4ZKO U; 1JIR A; 1EB2 A; 2GCH G; 1TAW A; 1RIW C; 1RS0 A; 1YM0 A; 1E37 B; 2BD4 A; 2Y82 A; 3GCH C; 2C93 B; 1WQS A; 3UWI A; 1GBE A; 1YPL H; 3A88 A; 1GI7 B; 1MUE B; 2BOK A; 5EST E; 2ZFF H; 3K2U A; 1TMT H; 1SOT A; 3TH3 H; 2UWL A; 3SBK A; 1J8A A; 3DT0 H; 2O8U A; 3NZI A; 1MTW A; 1G30 B; 1NFY A; 1TA6 A; 1QHR B; 3MNS A; 2ANK H; 2ZFR H; 3ZV9 A; 1GI0 A; 5JYI A; 3FAO A; 3GYM A; 1MU8 B; 4BAM B; 1XMN B; 2TBS A; 1WYK A; 1OYQ A; 2Q6F A; 1O3C A; 1GJB B; 1YPH E; 4XOJ A; 1GHX H; 2BX4 A; 2HPP H; 2ZDV H; 5ETX A; 3RC5 A; 1P06 A; 1AN1 E; 2ZFT A; 1IQN A; 3EST A; 5C2Z A; 1BJV A; 4FOU C; 1KLI H; 1NTP A; 4ZHL U; 1O39 A; 2VIO A; 1MKW H; 4OS2 A; 1SLU B; 1OYT H; 1OXG A; 2FS9 A; 4YT7 H; 1QIX B; 4B6F A; 1IQE A; 1J17 T; 3PWB A; 2P94 A; 1XVM A; 3M37 A; 2H2Z A; 3RXF A; 4CBN A; 2J9N A; 3ZYE A; 3RXL A; 2ZGH A; 3F9E A; 2UUF B; 1C5N H; 7LPR A; 1GI8 B; 1PJP A; 2P8O C; 3M3T A; 3SNC A; 1GWA A; 3FVF B; 1HIA B; 2GT8 A; 4ABG A; 3LGY A; 4UE7 H; 3A86 A; 1FY1 A; 2ZDN A; 2GCH F; 4NCY A; 2DE9 A; 2SFA A; 1QJ6 B; 2Z3C A; 2BD2 A; 1G3B A; 1O31 A; 4NWK A; 6CHA C; 3FAN A; 2F91 A; 3E91 A; 2FOB A; 3GY5 A; 3E8L A; 2R2W U; 2FYQ A; 1T8M A; 4Q7Z A; 3RP2 A; 3KQC A; 1HCG A; 1GBF A; 1OWE A; 1EAW A; 2A5I A; 4D76 A; 4AB8 A; 1TFX A; 1ZYO A; 2VID A; 2ZTY A; 3T29 A; 5E2P A; 5FL7 D; 4FUG A; 5C67 A; 1C2F A; 2A1D B; 5C3N A; 2JDI D; 3LH3 A; 3AW0 A; 1A3E H; 2NU3 E; 1O3K A; 1DIT H; 4MPU A; 1AFE H; 1CA8 B; 1FXY A; 1PFX C; 3FFG A; 1ELF A; 3RXB A; 4WJG 2; 1CA0 B; 3AW1 A; 7EST E; 3MO3 A; 3SU4 A; 5LGO A; 4GHT A; 2GCT C; 2J5U A; 4YES B; 2W26 A; 1V2L T; 1VKY A; 3LGI A; 1OWD A; 1WU1 A; 1BA8 B; 3ATK A; 3VGC C; 1WXR A; 2FLR H; 1L2E A; 2Q6D A; 2PKA B; 3PO1 B; 1MAB B; 5EGM A; 3RU4 T; 1D4P B; 2RCE A; 3ZZ9 A; 1UK4 A; 5DKM A; 1J16 A; 3H7O A; 1O30 A; 3PYH A; 5F53 A; 2WPK S; 3SZE A; 2J38 A; 1C4U 2; 2PKS C; 3RLY H; 1ABI H; 2XWA A; 3QTO H; 2AER H; 1BMM H; 1HNE E; 1MH0 A; 3BTH E; 4LOY H; 8LPR A; 4YO9 A; 1NPM A; 1O2O A; 4NZQ A; 4BTU B; 3TVJ B; 2EI7 A; 2BLV A; 1SGT A; 3V7T A; 1W0J D; 1ETT H; 1AVG H; 2J98 A; 1GJD B; 2G5N A; 4Z6A H; 2PR3 A; 1HAV B; 1TGB A; 1CU1 A; 3SNA A; 1C1W H; 3GY8 A; 1TRY A; 2ZZU H; 2A2Q H; 2Y6T A; 3QN7 A; 1SHY A; 1O33 A; 4U32 A; 4TPY A; 2OC1 A; 4FUH A; 3CEN A; 3DFL A; 3TJN A; 1JOU B; 1HXF H; 1AU8 A; 1LDT T; 1ZR0 A; 3LGW A; 4AGK A; 3RU4 E; 1AWF H; 1C1M A; 2G4T A; 1O3O A; 1BBR K; 3M7T A; 5TJX A; 4NIX A; 1Q3X A; 4I8J A; 4B74 A; 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