The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
104
|
structure length |
104
|
Chain Sequence |
GSQRQFARVKLPARIRYIGANREGVDARLLDLSAGGFAFTASGAPIQPGDLYKGKLLFQVDSISFSLEVEFQVRSVDPASRRVGCEFQNLKPREVAALRYLITS
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Alginate biosynthesis protein Alg44
|
| publication title |
Pilz domain with c-di-gmp of a protein from Pseudomonas aeruginosa
rcsb |
| source organism |
Pseudomonas aeruginosa
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| molecule tags |
Unknown function
|
| total genus |
18
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| structure length |
104
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| sequence length |
104
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| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature |
ec
2.4.1.33: Mannuronan synthase. |
| pdb deposition date | 2015-01-21 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Beta Barrel | Thrombin, subunit H | predicted glycosyltransferase like domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4FOU C; 5KEC A; 4P02 A; 5EJZ A; 2GJG A; 3KYF A; 4P00 A; 3DSG A; 4I86 A; 1YLN A; 4XRN A; 5EIY A; 4F48 B; 1YWU A; 3CNR A; 5EJ1 A; 2L74 A; 4RT1 A; 3KYG A; 4HG6 A; 5KGO A; 5EJL A; 4RT0 A; 5KED A; 2RDE A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1LKB A; 2ZIQ H; 4B71 A; 1LTO A; 2TGT A; 1CT0 E; 2VGC B; 1G36 A; 4A6L A; 1J14 A; 2H1U A; 1GI0 A; 1HAO H; 3RXO A; 4YLQ H; 2J9N A; 1PPZ A; 4UFF H; 1C1T A; 1UHB B; 1XUH A; 1HAI H; 1TPA E; 4KTS A; 1RJX B; 1DLK B; 1MD7 A; 3SGQ E; 3M5L A; 1MKW K; 4DY7 B; 3S9A A; 4LOY H; 4Y6D A; 3MI4 A; 5FPY A; 4IW4 E; 2K1Q A; 1KXB A; 1CHO G; 1JRS A; 3SQH E; 1Y3X A; 3BEF B; 1GBK A; 1D3T B; 1UJ1 A; 3A7V A; 1Y5A T; 3M35 A; 2BDY A; 4YT7 H; 5A8Y A; 2OP9 A; 2OXS A; 3QO6 A; 5C0T A; 1G3E A; 5EG4 A; 1C1O A; 3LGU A; 3U1I B; 3UPE A; 1SQA A; 2NU3 E; 3ZVC A; 1TYN A; 4DII H; 1WAY B; 1C1P A; 4CRA A; 2XOK D; 2ZQ1 A; 1H9I E; 1HV7 A; 2GZ9 A; 4DIH H; 1PQ8 A; 1ELB A; 3O8R A; 4AFQ A; 3SOR A; 3PO1 C; 5LPR A; 1HCG A; 1P9U A; 3RC4 A; 1K1M A; 2AFQ B; 3RXH A; 1XKB C; 4R8T B; 3UNS A; 5HM2 A; 3KQB A; 1TGT A; 3MU5 A; 4JZD H; 1WOF A; 3N7E A; 1F5L A; 4IS5 A; 4FUC A; 2ANM H; 3KYG A; 1ETR H; 2PR3 A; 2WPM S; 4O97 A; 5FPT A; 2RCE A; 1L1J A; 2B9L A; 3BTH E; 1AKS B; 3STI A; 1QBN A; 3A7X A; 2F9V A; 3ZZA A; 2G00 A; 4MPX A; 4P02 A; 4CBN A; 1JRT A; 4BAK B; 2PSY A; 2G55 A; 1D3Q B; 1NM6 A; 1SSX A; 1P12 E; 4ZKR U; 4CRD A; 1GCD A; 4XBC A; 4KEL A; 1GDQ A; 1HAX B; 1TAB E; 1Z7K A; 2LEL A; 1J17 T; 3O8C A; 3Q3Y A; 6GCH F; 3ODD A; 3NWU A; 2P3U B; 1NN6 A; 2ZDN A; 3GDU A; 1GI3 A; 5K7R A; 2A5A A; 2H9T H; 3HKJ B; 2OD3 B; 1QB9 A; 4WWY A; 3SUG A; 1HFD A; 4I8K A; 4AGK A; 3A84 A; 3ZZ4 A; 2BDI A; 3NRL A; 1O32 A; 1DAN H; 3QTV H; 1LQD B; 2R2W U; 4ABF A; 1DUA A; 2UWP A; 1EZQ A; 1DXP A; 3LU9 B; 1IQF A; 2YMS B; 2AGG X; 4MQA A; 2M2A A; 3VB3 A; 1HJA C; 3C1K A; 1HAZ B; 4DT4 A; 3SV9 A; 3SV7 A; 1IAU A; 1QY6 A; 1NBM E; 2XYA A; 3KL6 A; 1P3E A; 1T4U H; 3TPI Z; 2KAI B; 3ATW A; 1OSS A; 1P3C A; 4FUI A; 1RTK A; 4RKJ B; 3BIV H; 1THP B; 1UO6 A; 2ZPQ A; 4BAQ B; 1VR1 H; 5JYI A; 3MYW A; 1YGC H; 2AMD A; 4JMY A; 4ACA A; 1EAI A; 2GX4 A; 3KNX A; 4I31 A; 1BHX B; 2OC7 A; 1O3H A; 1O2M A; 1FXY A; 2J2U A; 4RT1 A; 2QV1 A; 3E1X B; 3ZYE A; 1UVU H; 5EOK A; 5C17 A; 1GJB B; 1O2N A; 3TGK E; 1NES E; 2D1J A; 2R0K A; 1PPH E; 1BMA A; 4MTB A; 4YZU A; 4IC6 A; 1SI5 H; 2VWO A; 1QHR B; 2O9Q A; 1O2Y A; 1GI5 A; 3Q3X A; 3W95 A; 2KCY A; 1K21 H; 1V2J T; 2ZGX H; 4AGJ A; 1E38 B; 2KR7 A; 3U1J B; 4XRN A; 2KCA A; 1O0D H; 1O2H A; 3BTT E; 1YPL H; 2Y7X A; 1NRO H; 3AW1 A; 3KCG H; 2R9P A; 2TGA A; 1G2M A; 1E36 B; 1ELG A; 2HPQ H; 3E8L A; 1LVO A; 5E0H A; 2LPR A; 3RXP A; 3SHC H; 3L3T A; 1PYT C; 2OIN A; 1Y3W A; 1Y8T A; 4WXI A; 4ZHM U; 3P6Z B; 2R0L A; 1QL8 A; 3UNR A; 1A2C H; 4BTI B; 1O2V A; 3F2F A; 1VJA U; 1AO5 A; 2L6O A; 3V13 A; 2D2D A; 1VIT F; 1ZTJ A; 1A46 H; 3LGI A; 1EKB B; 2P95 A; 4OGY A; 2FOH A; 4B2B A; 1ZRB A; 4H4F A; 7GCH F; 2W3K A; 3S9C A; 2RFK C; 1TNI A; 1S0Q A; 2ZTZ A; 2Q6D A; 1GGD C; 5JBB S; 2ZTX A; 5A0A E; 1DPO A; 4I8G A; 4DJZ B; 1C1R A; 2AS9 A; 5F53 A; 3RP2 A; 2FYR A; 1TX8 A; 3P8G A; 3N7O A; 5JDU B; 1ZMJ A; 1V2P T; 3SJK A; 1EOL A; 1BRC E; 1V2R T; 4Q80 A; 1BIT A; 1OYQ A; 1GJ8 B; 3SN8 A; 5F6M A; 5EW1 H; 3H7O A; 1P2Q A; 3BTK E; 3OX7 U; 4YTA A; 4GSO A; 3VXF H; 1SKY E; 3D65 E; 3PTB A; 3GOV B; 2G5N A; 2P8O C; 1ZZZ A; 1MTS A; 1C5S A; 4JK5 A; 2WV9 A; 3WWB A; 1BML A; 2WPD D; 2F9P A; 2AMQ A; 3QTO H; 1O5A B; 1EAW A; 4XE4 A; 2Z9J A; 1V3X A; 3MMG A; 2A4Q A; 2C8X B; 3FP7 E; 3CP7 A; 1BDA A; 1ETS H; 2VJ1 A; 1JIR A; 3VEQ B; 2WPK S; 3FO8 D; 1QL9 A; 3BG4 C; 3RML H; 3GIS B; 4BAN B; 2ZQ2 A; 3TJV A; 2A4O A; 1OYT H; 3KEE A; 3S7H B; 4X8S H; 1KSN A; 2XWA A; 4RT0 A; 3MU4 A; 4X2V A; 1N8O B; 1XXD A; 2HVX A; 2F9B H; 2VVC A; 4WH6 A; 4I32 A; 1G32 B; 3MU1 A; 3M5O A; 3PWB A; 1UTQ A; 2CMY A; 3F9G A; 2A7C A; 2WYG A; 1PPG E; 1BQY A; 1VIT H; 2H2Z A; 2BZ6 H; 1UTN A; 3FP6 E; 1QB1 A; 3P8F A; 2A7J A; 3SJI A; 3HGN A; 1GBA A; 3OFN D; 2BD4 A; 3H09 A; 3Q77 A; 1RS0 A; 2D26 C; 2XCF A; 1GVL A; 1UK4 A; 5C67 A; 1O5G H; 1QJ7 B; 1NTP A; 3ZV8 A; 1YPK H; 2GMT C; 1Y3Y A; 1P05 A; 2PTC E; 2FO9 A; 4OS2 A; 1GG6 B; 3S0N A; 2QAA A; 2BLV A; 2ZCL P; 1G3D A; 1GBH A; 1DWD H; 5GCH G; 1SGR E; 1AZ8 A; 1TQ0 B; 2EI6 A; 4I7Y H; 1O2X A; 1GI4 A; 3SNB A; 5EXL A; 1WBG B; 2ZKS A; 2UWL A; 3LGT A; 2Y5F A; 3A7T A; 2FOG A; 1CBW B; 1O2K A; 1IQK A; 1TAL A; 2AIQ A; 2VWL A; 4IN1 A; 4OS7 A; 1EOJ A; 2J98 A; 3K9X B; 1VCP A; 1Z6J H; 1ANB A; 3QGJ A; 1EB2 A; 3BSQ A; 4XDE A; 1C2I A; 5EPY A; 3SU6 A; 2BD3 A; 4UD9 H; 1O33 A; 4NFF A; 3IIT A; 3H5C B; 4Y8X A; 2ZEC A; 1O3N A; 2CF8 H; 1NU9 A; 2QY0 B; 3TK5 A; 1XUK A; 3UUZ A; 1AFQ C; 1YM0 A; 2O8T A; 1ABI H; 1GI7 B; 2BDB A; 1PQ7 A; 1HXE H; 3KQE A; 1ELA A; 1GI8 B; 1NS3 A; 4JYU H; 4X6M A; 2ZFP H; 2ZNK H; 2G81 E; 3DD2 H; 3ATM A; 1FV9 A; 4ZKN U; 1AVW A; 3SNC A; 5DP9 A; 4AZ2 B; 1KTT B; 3RXU A; 1O3I A; 2XBW A; 3ATI A; 2Q6F A; 2F9U A; 1KYN A; 1MH0 A; 2BY8 X; 1O3E A; 1BIO A; 2ZGH A; 5LPF A; 3SOS A; 2I6S A; 3VGC C; 1BB0 B; 5CHA C; 2VIP A; 2C8Y B; 4SGA E; 1W0J D; 3T27 A; 1MAX A; 3UFA A; 2QGR A; 2CK3 D; 5DSF A; 1AUJ A; 1DSU A; 1SGQ E; 3SBK A; 4YES B; 3RXC A; 3DSO A; 1SFQ B; 3OSY A; 4Y79 A; 1A7S A; 2GP9 B; 4FUG A; 1GMH F; 1GI6 A; 1LVY A; 4MNY A; 1KDQ A; 3UTU H; 8KME 2; 1NRQ H; 3DSG A; 4NFE A; 5FAH A; 2OTV A; 3AAU A; 1FAX A; 4AB9 A; 1C1V H; 1MKX H; 1DUE A; 3M5N A; 1C2L A; 1NY2 2; 3JZ1 B; 4BXS A; 6GCH G; 2VH6 A; 4X1P U; 1QRW A; 5EU8 A; 1AIX H; 4OS1 A; 2BQ7 B; 2NU1 E; 5FPS A; 1TB6 H; 2Z3E A; 3GCO A; 1K0H A; 3UB0 A; 2OCV B; 3R3G B; 2XTT B; 2QF4 A; 1K2I 1; 1TGN A; 1P06 A; 4M7G A; 3STJ A; 2HRV A; 2FOB A; 4ZHL U; 1TRM A; 1EFR D; 2C8Z B; 3E6P H; 4K1T A; 4M9F A; 3RU4 D; 5EQR A; 1ZR0 A; 3I29 A; 4GAW A; 3MNX A; 4ZXY H; 1N6Y A; 3SYJ A; 4FUD A; 5E2P A; 3M7U A; 1SQT A; 3L33 A; 1S82 A; 5C1Y A; 1CA0 C; 3SQE E; 5FHT A; 1O2W A; 1E34 B; 2HWL B; 3RXB A; 3ZZC A; 4FU8 A; 2ANK H; 3EA7 A; 4CH2 B; 1KY9 A; 2EST E; 2J97 A; 2BD2 A; 3AVZ A; 1IHT H; 4P00 A; 1T7C A; 1SQO A; 4MPW A; 5C0U A; 1WYK A; 1NO9 H; 1YPE H; 1QA7 A; 5F03 A; 1HJA B; 1MBQ A; 2BLO A; 1LDT T; 4UFE H; 2ZDA H; 2BB4 A; 2V6N A; 3KGP A; 3RXQ A; 5PTP A; 3A8A A; 2A4R A; 2HLC A; 2XNI A; 3M61 U; 1OWK A; 3OU0 A; 1FIW A; 1SLV B; 2A5K A; 1TRN A; 4ZKO U; 2O8L A; 1YPM H; 2ILN A; 2ZHF H; 4AYV B; 1WXR A; 4FUJ A; 1ZJK A; 4FU9 A; 3RXR A; 2BQW B; 1P11 E; 1AND A; 1FAK H; 1H8D H; 1D4P B; 1VJ9 U; 3P92 A; 4LZ4 B; 2BD5 A; 4XD7 D; 2FI5 E; 1O2U A; 2WV5 A; 4ZH8 A; 1ZSK A; 1YLC A; 1YPH E; 2WUB A; 1DOJ A; 2ZPS A; 2GV7 A; 2WPJ S; 4RSP A; 1W8B H; 4GPG A; 1SPJ A; 1TMB H; 2CHA B; 1A5I A; 2K0Q A; 4NWL A; 5L2Z H; 5A2M H; 1TOC B; 1INC A; 1TA2 A; 3FAN A; 4I8J A; 4ZMA H; 1CGJ E; 1DWC H; 1AWH B; 3F9H A; 1S81 A; 1QUR H; 1DWB H; 1VIT G; 5LPE A; 5J4Q A; 1C5M D; 1ELE E; 7GCH G; 4D76 A; 5DJ7 A; 2W6I D; 1CU1 A; 3T26 A; 3GDV A; 1DT2 A; 3ZZ7 A; 4CBO A; 3QZR A; 1AB9 B; 1TX7 A; 1Z8R A; 5B6L A; 2UUY A; 1C1S A; 2FLR H; 1F5K U; 1V2U T; 1A5H A; 2PUX B; 4A1X A; 1C1W H; 5KEC A; 1EXF A; 3IG6 B; 2C3S A; 1V2T T; 1EB1 H; 3U9A H; 4YM9 A; 1SOT A; 3EST A; 1DE7 H; 1EZS C; 4B75 A; 1P0S H; 1XUF A; 2PW8 H; 2DE8 A; 1GWA A; 4NGA H; 2W7S A; 3A81 A; 5EQQ A; 3PRD A; 2ZU2 A; 2STA E; 2YNB A; 3A7Y A; 4PRO A; 1C5N H; 1AFE H; 1IQL A; 1YLD A; 2XWB I; 5DG6 A; 3GYL B; 1O3O A; 4K8Y A; 4NA8 A; 2FM2 A; 2ZU5 A; 5DKM A; 1OWH A; 1SOZ A; 3MTY A; 1YCP H; 5AF9 H; 2FLB H; 2B5T B; 4I8L A; 1ESA A; 1GL0 E; 3T28 A; 1O2G H; 3RXD A; 1LMW B; 1SLX B; 1ZOM A; 1KDQ B; 5LH8 A; 1AZZ A; 3SJO A; 4TYD A; 1T8L A; 2ZCK P; 5F8X A; 2ZFS A; 3NK8 A; 1Z1J A; 2A1D B; 2VB0 A; 1HAV A; 1S85 A; 2WPL S; 3GY4 A; 3OY5 U; 3GCH C; 2OBO A; 1CA8 B; 2A32 A; 4E7R G; 4DCD A; 2XBV A; 1P2J A; 4HTC H; 1LVB A; 3HKI B; 3SUD A; 3V12 A; 5JBC S; 1FPC H; 3NZI A; 2GZ7 A; 3HGP A; 2J34 A; 2KCP A; 3BG4 B; 3LDX H; 4OGX A; 1QBV H; 1LHE H; 5C5O A; 4VGC C; 5GCH F; 3T5F H; 8EST E; 1V2K T; 1YC0 A; 2ZP0 H; 5C94 A; 1KLI H; 2PKA A; 1P9S A; 4FXG H; 4TSF D; 2PV9 B; 2PLX A; 3NUM A; 4B6E A; 2NU4 E; 2VWN A; 3P95 A; 3UAI C; 1CVW H; 1T8N A; 2GT8 A; 1E1R D; 4MNV A; 1EPT B; 1TLD A; 2XRC A; 5BRR E; 1IQE A; 2K8I A; 3EGK H; 3M7Q A; 2QXG A; 1G3B A; 2J95 A; 2BY7 X; 3BTF E; 3RM0 H; 4BTT B; 1ARC A; 5JPM H; 1V2Q T; 2BXT H; 3Q3K A; 4D9R A; 1GMD F; 5JBA S; 1TGC A; 2GDE H; 3BTQ E; 3EAJ A; 4IC5 A; 4B74 A; 2FMJ A; 2RG3 A; 3F68 H; 1XUG A; 2GCT B; 3RXS A; 1ANC A; 1BMM H; 1DS2 E; 1GHZ A; 1GHV H; 2IPH A; 2G4T A; 3LC3 A; 3VXE H; 3B8J A; 4WMF A; 2WUC A; 2EI7 A; 2WV4 A; 3EA9 A; 5L2Y H; 4AC9 A; 1Z8J B; 1OWE A; 4X1R U; 2Z3C A; 3PRB A; 5HM9 A; 1VGC C; 3VFE A; 2ZHD A; 5C3N A; 2JH5 D; 1NRN H; 3SUE A; 3CNR A; 2L74 A; 2BD8 A; 1XX9 A; 1K28 D; 3DFJ A; 1ZTK A; 1TE0 A; 1PFX C; 1MKW H; 3ATL A; 3K65 B; 5GJ4 B; 2J38 A; 1MTN C; 1F0S A; 4JZF H; 4NSY A; 1V2M T; 3E90 B; 4ABJ A; 3ZZD A; 3FVF B; 1O38 A; 1Y3V A; 2VIW A; 3UY9 A; 2EC9 H; 4WF8 A; 3A85 A; 4WY3 A; 1PYT D; 3ZIA D; 2JDI D; 2BLW A; 3PMA B; 1X7A C; 3A8B A; 3U8O H; 1QZ8 A; 2W7U A; 3P8N A; 4Y7A A; 2Y80 A; 1W2K H; 1T32 A; 5GND A; 1OPH B; 1BRB E; 3SHA H; 1LHG H; 2BY9 X; 4Y8Y A; 5DP4 A; 1W7X H; 4TWY A; 1GMH G; 3O8B A; 6LPR A; 3F0O A; 2G51 A; 2Z9L A; 5DP5 A; 4MVN A; 1XMN B; 1QBO A; 1SGY E; 3BTG E; 1YPG H; 4ZRO A; 2BDH A; 1O5F H; 3U28 C; 1O3D A; 1HDT H; 2ZTY A; 5E2O A; 3RXT A; 5HYO A; 1ZGV A; 1GJA B; 2FTM A; 4IMZ A; 3F2G A; 4AFU A; 3P17 H; 4U01 A; 3V7T A; 4BAM B; 3LGY A; 5CHA B; 1TRY A; 3SI3 H; 1O5D H; 2J4I A; 1JMO H; 1C1N A; 1UVS H; 3F1S B; 1C5U A; 1P2N A; 2RA0 A; 3EQ0 H; 2YOL A; 3AAS A; 2Z6B D; 1Z8I B; 3LH1 A; 2BM2 A; 3RC5 A; 1SGE E; 3MNS A; 3ITI A; 4WVP E; 3W94 A; 5DPA A; 1C5Z B; 4GVU A; 1C5X B; 1KMH B; 2ULL A; 1MTV A; 2BLQ A; 3F3B A; 1HXF H; 7EST E; 1SHH B; 1RTF B; 1ZML A; 4DUR A; 3PLB A; 4WMD A; 1V2N T; 1PJP A; 1EP5 A; 3KQ5 A; 3A87 A; 1HGT H; 1SLW B; 3A8C A; 4BOH A; 2ZEB A; 3I77 A; 2GGV B; 1A3B H; 3RDZ A; 4UEH H; 1DVA H; 1AE8 H; 1QR3 E; 4KGA A; 1EP6 A; 1O3F A; 1V2V T; 1C5P A; 3RLW H; 1E1Q D; 5EQS A; 4U32 A; 1WSS H; 4X8U H; 2JH0 D; 1D6W A; 3P70 B; 2R3Y A; 2ALV A; 2Z3D A; 3RMN H; 3FZZ A; 4FUE A; 5LGO A; 3EE0 B; 1C9T A; 3TU7 H; 1HAV B; 3Q76 A; 4ZHA A; 1D3D B; 1QRX A; 1FN6 A; 1O2T A; 3EA8 A; 1SB1 H; 4X8V H; 1LVM A; 1V2L T; 5I46 H; 2LNC A; 2PKS B; 3D23 A; 1G9I E; 3MO3 A; 2DUC A; 2W26 A; 3QUM P; 1YP9 A; 3O8D A; 2KFW A; 3SGB E; 1RFN A; 1RGQ A; 4Q7Z A; 3UOU A; 1CE5 A; 2BHG A; 2IN2 A; 1ZYO A; 3SU2 A; 1UTO A; 1UTK A; 4MPV A; 4F48 B; 1MZA A; 4K3J A; 3HAT H; 4B2C A; 1SGN E; 4ZCN A; 1BJV A; 1GMC F; 4NA9 H; 1BMN H; 2CGA A; 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