The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
103
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structure length |
103
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Chain Sequence |
GSSGSSGELPSVEELTIILPEDIELKPLGMVSSIIEQLVIIESMTNLPPVNEETVIFKSDRQAAGKIFEIFGPVAHPFYVLRFNSSDHIESKGIKIKETMYFA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transcription
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| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
Solution structure of the NAF1 domain of Hypothetical protein BC008207 [Homo sapiens]
rcsb |
| molecule keywords |
Hypothetical protein LOC92345
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| total genus |
11
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| structure length |
103
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| sequence length |
103
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-03-30 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Beta Barrel | Thrombin, subunit H | Probable tRNA pseudouridine synthase domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2EQN A; 2EY4 C; 2HVY B; 3UAI C; 3U28 C; 2RFK C; 2V3M A; 3MQK C; #chains in the Genus database with same CATH topology 1EJN A; 2F91 A; 3K6Z A; 2F3C E; 4AYV B; 4NIW A; 1YLN A; 2G00 A; 2XWA A; 1OWE A; 3EA7 A; 2KCO A; 1NY2 2; 2LP6 A; 1CHG A; 1J8A A; 1O2L A; 3GOV B; 2OXS A; 3VXF H; 3A8A A; 4ACB A; 5EGM A; 1HIA B; 1ESB A; 1NFY A; 1H9H E; 2BLQ A; 2ZDV H; 2FOF A; 1O5G H; 3MHW U; 2ZFQ H; 3QZR A; 3HGN A; 2QF0 A; 1V2P T; 1Z71 A; 1L2E A; 3LC3 A; 3A7X A; 1SBW A; 1GJ8 B; 3M61 U; 3ZV8 A; 1QB6 A; 3ZYD A; 1VJ9 U; 2KM0 A; 2TGA A; 3N7D A; 3DSP A; 1O3D A; 1W13 U; 1DT2 A; 3IWM A; 5BPE A; 4O3U A; 2A7H A; 1HJA C; 3MO6 A; 1WU1 A; 4ZMA H; 3M3T A; 1L1J A; 2FO9 A; 1QCP A; 1N1L A; 3LH3 A; 3BTT E; 8EST E; 1UVP A; 1Q2W A; 2CK3 D; 2G81 E; 1CSO E; 2AGI X; 1E35 B; 4IMQ A; 4I7Y H; 4GHQ A; 3TPI Z; 2GZ7 A; 4ZHM U; 1BTP A; 2F83 A; 2XOK D; 6GCH G; 2FEQ H; 2VNT A; 1MTN C; 3FOA A; 3M7Q A; 5C20 A; 2VIN A; 1ID5 H; 4GVU A; 1CE5 A; 5TCA A; 3BG8 A; 4KGA A; 1Z1I A; 1PYT C; 5LGO A; 3PMH B; 1S6H A; 3NCL A; 4FUH A; 5CHA C; 3PRO A; 3RML H; 3T25 A; 3KQC A; 2GGV B; 1T32 A; 3CS7 A; 4ABG A; 1NU7 B; 1DWE H; 5EJZ A; 3TK6 A; 3V13 A; 2Q6F A; 1E36 B; 4VGC C; 3UQV A; 3URE A; 4BXW A; 1FY5 A; 5HXF A; 1YYY 1; 1V2S T; 4H6S B; 1G3C A; 1O2I A; 1ZPB A; 2BDC A; 1B0E A; 4ZXX H; 1MKW H; 1WOF A; 5CHA B; 1HFD A; 4OS6 A; 3M5L A; 4EST E; 3GY3 A; 1ELA A; 5DK1 A; 3RU4 E; 1CGJ E; 4KEL A; 2FS9 A; 2SNW A; 3TLO A; 3PV2 A; 1VIT G; 2Z7F E; 1MZA A; 4O9V A; 3R3G B; 2NU0 E; 3DFL A; 1HB0 B; 5KGO A; 1P3C A; 2RFK C; 3A85 A; 2QXG A; 3W1E A; 3M5M A; 3QUM P; 3D65 E; 1C4U 2; 1RIW B; 3NZI A; 4Y8Y A; 1WCZ A; 4E7N A; 1SQT A; 2Y81 A; 1GBI A; 1Y8T A; 5E0J A; 2ZFP H; 4HG6 A; 2RCE A; 3M35 A; 4Q4L A; 4D76 A; 1PPZ A; 4IGD A; 1Q31 A; 2D8W A; 1SGP E; 2ZF0 H; 3GDS A; 3F2H A; 5AF9 H; 2Y5H A; 2VID A; 3AAU A; 2PWX A; 3NK8 A; 1ZGI A; 3RUO A; 3MU5 A; 5DO4 H; 3VEQ B; 1S0Q A; 1EKB B; 2YNA A; 5C67 A; 3MQK C; 2R3Y A; 1LHC H; 2W3K A; 2VVC A; 1IQK A; 1OS8 A; 4X0W U; 1CGH A; 1O3A A; 2P8O B; 1UTK A; 4AZ2 B; 1XKB C; 5E2P A; 4XD7 D; 1ACB E; 5B6L A; 1Z8G A; 3EDX B; 5JDU B; 4X1P U; 1FXY A; 1CHO F; 1BRC E; 1O33 A; 1GBH A; 1Y5U T; 5C1X A; 1S5S A; 4UFE H; 4MTB A; 5GXP A; 4AOR A; 4R8T B; 1J14 A; 2BD9 A; 2BOH B; 4YM9 A; 4ZCN A; 2RA0 A; 3ZZ3 A; 1Y3Y A; 1C1N A; 5GWZ A; 4O97 A; 1B7X B; 1C5Z B; 1KXE A; 2ZTZ A; 2AIQ A; 3ZZA A; 4BTU B; 1MUE B; 1C1U H; 1S84 A; 2ZU3 A; 1TX6 A; 4IW4 E; 1ZSJ A; 3KQB A; 1V2L T; 5F6M A; 1JIR A; 2QXJ A; 1IHS H; 1FPC H; 3MH7 A; 3Q76 A; 1VCW A; 2AYW A; 1A5G H; 1FV9 A; 2V3O H; 3SNC A; 1BTU A; 3P8O A; 1LVM A; 2GT8 A; 1IQE A; 1O5D H; 2HPQ H; 4K69 A; 1X7A C; 5H4I B; 1QHR B; 1KMH B; 3KID U; 2DUC A; 2ZP0 H; 5F8Z A; 4DGJ A; 4GLY A; 1ZTK A; 4WVP E; 3LU9 B; 1O2J A; 4B6F A; 1OYT H; 1O2U A; 4ISH H; 2GZ9 A; 3M37 A; 3T5F H; 1YBW A; 1UK4 A; 1PPF E; 1AVX A; 4MLF B; 3RXJ A; 2EY4 C; 3ATW A; 3RXR A; 3FP7 E; 4B2C A; 1LPG B; 1XM1 A; 1P2K A; 1XVM A; 1S85 A; 2WV4 A; 1K1O A; 4F55 A; 2EC9 H; 1UTQ A; 1SGT A; 4JK6 A; 4JZI A; 2PLX A; 3R0F A; 1MU8 B; 3MFJ A; 2C90 B; 1BMM H; 1NBM E; 2VU8 E; 3V12 A; 3SUE A; 1C1V H; 2GZ8 A; 2KCA A; 2ZGJ A; 1LKA A; 3DCL A; 2GCH F; 3A84 A; 1MAB B; 4YOJ A; 2O8M A; 1DWC H; 2W3I A; 1Y3V A; 2ZPQ A; 2W26 A; 2HLD D; 3SU4 A; 4NIY A; 3WWF A; 1A0L A; 1EZS C; 1ZSK A; 2PW8 H; 2J97 A; 1TBZ H; 1O37 A; 2FTM A; 1GL1 A; 4O03 A; 3ATL A; 1QRX A; 1C5X B; 1TNI A; 2M5T A; 2ZHW H; 3P95 A; 1GBC A; 2YNB A; 3C27 B; 3DSG A; 4X6N A; 2ZQ1 A; 5GDS H; 1JRT A; 2F9P A; 1XUI A; 1K1N A; 1COW D; 3L33 A; 1YC0 A; 4TWY A; 1UK3 A; 1QRW A; 2A2Q H; 4AB9 A; 1KDQ A; 1LQE A; 2Z94 A; 1P2N A; 4DW2 U; 3GCO A; 2F9O A; 3NWU A; 1P2J A; 2LPR A; 4ABA A; 1FQ3 A; 4HGC A; 1KLI H; 3GY7 A; 1LHF H; 4FU7 A; 4WME A; 3UPE A; 2LEL A; 2TGP Z; 3Q3X A; 4DUR A; 1TPS A; 3A82 A; 3GDU A; 1C5O H; 3FVF B; 1VIT H; 1HDT H; 1QGF A; 5DKM A; 2ZQ2 A; 4FET A; 5EXL A; 1P3E A; 2GDD A; 2L6O A; 1W0K D; 1GVZ A; 1O5C B; 5EQR A; 4X6O A; 1GI3 A; 2VWO A; 5FPS A; 1O3L A; 1LTO A; 2OTV A; 1C5P A; 3RMO H; 5C0T A; 4NA8 A; 1D3T B; 1QA7 A; 1P57 B; 2HNT E; 3LGV A; 5FXL A; 4OS4 A; 4NSY A; 3KGP A; 1GHB G; 1EAT A; 3F9H A; 4CRA A; 1CHO G; 3S7K B; 1GPZ A; 4RN6 A; 2W7U A; 1V2O T; 3GY5 A; 3QLP H; 1G2M A; 3T28 A; 1UVU H; 3E90 B; 3M5N A; 2V7Q D; 4F48 B; 2KAI B; 2A5A A; 5FAH A; 2WZQ A; 3FZD A; 2FDA A; 3RXF A; 1KYN A; 1EAU A; 4KTC A; 3U8R H; 4Y7B A; 1SGF G; 5DPA A; 1UVO A; 3ZZ4 A; 3AW1 A; 4YTA A; 1P04 A; 1YCP H; 3FZZ A; 4ABD A; 5GPI B; 1P9S A; 1AND A; 3T27 A; 8LPR A; 1N6X A; 4NSV A; 3PRB A; 2JH6 D; 1TPA E; 3O8C A; 1MTW A; 5JYI A; 2BD8 A; 1EJM A; 1GBK A; 3ZZD A; 4UD9 H; 1PPH E; 3ZYE A; 1ZTJ A; 3BEI B; 1UCY H; 1Y5A T; 2FYR A; 3D49 H; 5EJ1 A; 1G32 B; 4YZU A; 1V2M T; 1E1R D; 1GBJ A; 1E1Q D; 4NZL A; 4X8S H; 2BM2 A; 1CT2 E; 1HAP H; 1A4W H; 1UHB A; 1ZJD A; 3KQ5 A; 1ZPC A; 4INH A; 3HKI B; 2FI4 E; 2OC0 A; 2WPJ S; 1ABI H; 1A2C H; 2SGA A; 4NCY A; 3PYH A; 2L74 A; 1KXA A; 2B9L A; 1AZ8 A; 5EU8 A; 1Z1J A; 3EE0 B; 1ARC A; 2CF9 H; 2FI3 E; 3BIU H; 1SFI A; 2ZZU H; 2ZGH A; 3RC4 A; 4A1X A; 2A0Q B; 2PUQ H; 3M7T A; 1GWA A; 1HUT H; 2D1J A; 2H5D A; 5T1V A; 4DOQ A; 4DVA U; 1DY9 A; 3LJJ A; 3B23 B; 4GHT A; 1PPE E; 5A0B A; 2GCH G; 1BJV A; 1SC8 U; 1THR H; 3DSO A; 4H42 U; 2TPI Z; 2ZPS A; 3SU1 A; 1CT4 E; 2CGA A; 3PTN A; 4OS1 A; 1LO6 A; 3UWI A; 2BY8 X; 2PHB A; 3I29 A; 3SV8 A; 1P11 E; 2IN2 A; 2PP6 A; 1O3M A; 3DFJ A; 4B76 A; 2YMS D; 2HRV A; 4YLQ H; 1L1N A; 4Z6A H; 2UWO A; 2QA9 E; 3A89 A; 3BSQ A; 1F7Z A; 2QN5 T; 4B73 A; 2OIN A; 4SGB E; 3MH4 A; 1S0R A; 5AHG H; 5IDK A; 2HVX A; 4J1Y A; 4CH2 B; 1QL8 A; 2WPD D; 3I78 A; 1NO9 H; 2ODY B; 4GUX A; 2PR3 A; 3N7O A; 3OY6 U; 1FN6 A; 2XW9 A; 3AAS A; 3CNR A; 5L6N H; 3ZVA A; 3A81 A; 1W10 U; 1YLC A; 2O8U A; 2PTC E; 3ZVG A; 5A8Z A; 1EPT C; 5KEC A; 3TU7 H; 5JBC S; 1C9P A; 2Y5G A; 3M3V A; 1S6L A; 3URD A; 5EIY A; 3E0N B; 2WIN I; 1NFW A; 1EAI A; 2O8L A; 2FWW A; 3A88 A; 3SNA A; 1ZPZ A; 4ABF A; 1AB9 B; 1EAS A; 1GBD A; 1QA0 A; 1SLV B; 1UCY E; 1SG8 B; 1EPT B; 1NU9 A; 1TQ7 B; 1TYN A; 2BXU H; 4Q63 A; 1TMB H; 2JH0 D; 1TBQ H; 2RDE A; 2PKA B; 2ZNK H; 3H7T A; 4X2V A; 1KY9 A; 3T2N A; 2SFA A; 2HLC A; 5HGG A; 3RXH A; 1FUJ A; 1NRS H; 3SHA H; 1FY3 A; 1WQS A; 2J98 B; 3Q3Y A; 1SSX A; 2LNC A; 1AFQ C; 3OEH D; 4WJG 2; 3TH2 H; 4I32 A; 6CHA C; 1SQA A; 8GCH F; 3ITI A; 3C1K A; 1JOU B; 3QZQ A; 1QJ6 B; 1O38 A; 2G5N A; 4CRC A; 1NRQ H; 1QQ4 A; 2STB E; 3HK3 B; 4NIV A; 1AVG H; 7LPR A; 2QXH A; 4NWL A; 3EYD A; 3SV7 A; 3NKK A; 5FX6 A; 2BVX H; 2VWN A; 3SBK A; 3WWB A; 3K6Y A; 4AFS A; 1GBF A; 3MO9 A; 4OGY A; 2B8O H; 1AFQ B; 1GJ6 A; 3GCN A; 2V6N A; 1PJP A; 1SGC A; 2QF4 A; 1VJA U; 3LGT A; 1BTH H; 2PSX A; 1TOC B; 1OHH D; 1TQ0 B; 1JIM A; 1YP9 A; 1MZD A; 1HAV A; 3RU4 D; 1TPO A; 3UR9 A; 4ISI H; 5EXM A; 4FVB A; 1INC A; 1Z6J H; 4B71 A; 2AH4 X; 2BMG B; 5I25 A; 4DJZ B; 2Z3E A; 1KIG H; 1BIT A; 1RRK A; 1YM0 A; 1DX5 M; 1XXD A; 1C1R A; 1IOE A; 5FCR A; 1O2Q A; 2ASU B; 1QUR H; 3GCT F; 4I31 A; 1O3E A; 2VIO A; 1U6Q A; 4X2W A; 1QQU A; 2FLB H; 2BZA A; 9EST A; 1BBR K; 1BBR E; 1G37 A; 2BDY A; 2WUC A; 2A1D B; 3LGU A; 4E05 H; 3K9X B; 2R2W U; 1Z8J B; 1NC6 A; 3PLP A; 3BTF E; 5EOD A; 3SJK A; 1A0H B; 1FY8 E; 1AI8 H; 4Y6D A; 2WPK S; 5EPY A; 2XWB I; 4MPW A; 1IHT H; 1M9U A; 7EST E; 3H7O A; 2ZPR A; 2O8W A; 3BN9 A; 3U1J B; 1FNI A; 3HPT B; 1RFN A; 2BD7 A; 1THP B; 5JBB S; 5C17 A; 1O2N A; 2C4F H; 2FOE A; 3KHV A; 4ACA A; 1C2E A; 3PMA B; 4BAO B; 3Q3K A; 2OBO A; 4BAH B; 4Y76 A; 1SGE E; 2QF3 A; 4NIX A; 1PQ7 A; 3S69 A; 1ESA A; 2ODP A; 2Z3C A; 5DG6 A; 3SU6 A; 1BA8 B; 3DD2 H; 4GCH G; 3DHK H; 1JWT A; 1BHX B; 1AQ7 A; 1GJB B; 3FP8 E; 3LGI A; 5F8X A; 2BLO A; 2FOB A; 2OC1 A; 1BIO A; 2UUY A; 3TGI E; 3BEF B; 2J95 A; 5DP8 A; 1IQL A; 2AHM E; 1XX9 A; 1SGF A; 4ZRO A; 1ZTL A; 1AHT H; 4BAK B; 3TGJ E; 1QB1 A; 5C5O A; 1OP8 A; 3OEE D; 4H4F A; 3Q77 A; 2YMS B; 1GVK B; 2F9V A; 5T6G A; 1GHZ A; 1G3B A; 4K8B A; 2WPI S; 4IC5 A; 3RXG A; 4FXG H; 3RXA A; 1BJU A; 3A8C A; 4MPX A; 1UTM A; 7GCH F; 1YY3 A; 3UTU H; 4ISL A; 1RGQ A; 3B8J A; 1EB2 A; 1F0R A; 3P8G A; 1HAO H; 2XC5 A; 1WBG B; 2ODQ A; 1UK2 A; 4NA7 A; 1O34 A; 4TY6 A; 1SOZ A; 2FPZ A; 3UOU A; 4WY3 A; 1GHX H; 4JMY A; 5EQS A; 3ZVF A; 2Z9G A; 2ZU2 A; 4THN H; 2ZU1 A; 1DY8 A; 3N99 A; 3F2G A; 3EGK H; 3NPS A; 1W3C A; 4UFF H; 1TPP A; 2ZFT A; 2XND D; 1UTJ A; 1ARB A; 1NRO H; 1ZHR A; 4BTI B; 3SI4 H; 1HLT H; 2BXT H; 4ABI A; 5LPF A; 2ZDN A; 5DP9 A; 3L3T A; 1NBM D; 3URC A; 2NU2 E; 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1GJC B; 4YES B; 3GY2 A; 1GHA F; 3OU0 A; 1W12 U; 1P2Q A; 5EW1 H; 2GV6 A; 2FOD A; 4TPI Z; 5EST E; 2ZU5 A; 1OOK B; 1YWU A; 3PO1 C; 4AGK A; 4UE7 H; 4B74 A; 2ZHF H; 1V2U T; 1N6Y A; 1THS H; 1C2M A; 1C1S A; 1GMC F; 1W0Y H; 3CS0 A; 1SGI B; 1A5I A; 1BOQ A; 1K2I 1; 3FN8 A; 4UFG H; 1O3J A; 4X8U H; 2ANW A; 1ZMN A; 2ZHQ H; 1DPO A; 3PO1 B; 1G30 B; 2AMQ A; 2Y7Z A; 1XMN B; 2SGF E; 2BVS H; 2OQ5 A; 1O5E H; 1HJ8 A; 2ZDL A; 3QDZ B; 3QGJ A; 4AX9 H; 2J92 A; 4JK5 A; 1YPJ H; 4OS5 A; 3G01 A; 3RP2 A; 2PTN A; 1F5R A; 4P00 A; 3I77 A; 4DT4 A; 3HAT H; 4JYU H; 1UMA H; 7GCH G; 1SKY E; 3MWI U; 5EPN A; 4TPY A; 3GDV A; 1GBB A; 1TX8 A; 3K2U A; 3V3M A; 3SUF A; 3VG8 A; 4ISO A; 3F9G A; 4INL A; 4B1T A; 1HJ9 A; 1EZX C; 4JYV H; 4NG9 H; 2QGR A; 3BTK E; 2NU4 E; 1DLK B; 3UUZ A; 1C5W B; 1ABJ H; 1A5H A; 2FI5 E; 1B5G H; 2AMP A; 4JZ1 A; 3RXB A; 1J16 A; 3AAV A; 4WMF A; 1PPG E; 2BD4 A; 3GYM A; 2VIV A; 1HAH H; 2ZDM A; 4YOI A; 4ABJ A; 1L1G A; 5CHB A; 1UVT H; 1EUF A; 4AG2 A; 1TGN A; 2EA3 A; 1ETS H; 4FUJ A; 4WXV A; 2FOC A; 1GCT C; 2XNI A; 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