The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
84
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structure length |
84
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Chain Sequence |
MFTGLNTPSGVAVDSAGTVYVTDHGNNRVVKLAAGSNTQTVLPFTGLNTPHGVAVDSAGTVYVTDHGNNRVVKLAAGSNTQTVL
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
De novo protein
|
| publication title |
Biomineralization of a Cadmium Chloride Nanocrystal by a Designed Symmetrical Protein
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
nvPizza2-S16H58
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| total genus |
13
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| structure length |
84
|
| sequence length |
84
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| chains with identical sequence |
B, C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-07-10 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Beta Barrel | Thrombin, subunit H | Thrombin, subunit H |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5CHB A; 4ZCN A; 3WWF A; 3WWB A; 3WW7 A; 5F53 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2O8U A; 1TNJ A; 5J4Q A; 4XFQ A; 1BUI A; 1C2M A; 1C9P A; 1C5U A; 2VB0 A; 1P04 A; 5EJZ A; 1VGC C; 2GZ8 A; 1HXF H; 2CMY A; 1NY2 2; 3KNX A; 4I32 A; 1MAX A; 2OP9 A; 1IAU A; 1C2G A; 2Q6F A; 2CHA B; 4R0I A; 3QTO H; 5HGG A; 3SND A; 1ANC A; 4DW2 U; 1LVB A; 2C8W B; 1F92 A; 1GJ4 H; 2FX6 A; 3M3V A; 4J2Y B; 2HWL B; 1K1L A; 2Y5H A; 2FPZ A; 1K21 H; 3M7Q A; 1BRC E; 5EIY A; 5FCK A; 2IN2 A; 5PTP A; 3PV2 A; 1CT2 E; 5K0H A; 2J97 A; 1DSU A; 1FN6 A; 1RRK A; 2IPQ X; 3P8F A; 1ZTJ A; 1J9C H; 1GI4 A; 3ZVF A; 1ZHM A; 3ZZ5 A; 1HB0 B; 4ZKN U; 2FX4 A; 1ZTK A; 3LGU A; 1TYN A; 1EKB B; 3RUO A; 3SV7 A; 3OY5 U; 3PMH B; 4FET A; 4CBN A; 1YPH C; 2OIN A; 1W0Y H; 3NUM A; 2GCT C; 1GHZ A; 3BG8 A; 2P93 A; 1DOJ A; 1SOZ A; 2CK3 D; 2FOB A; 3SJ9 A; 1BMN H; 3N99 A; 5C5O A; 5GCH G; 1C2E A; 1A0H B; 1W0K D; 2AS9 A; 2WV9 A; 2EY4 C; 1MTU A; 3RC6 A; 1AB9 B; 2GD4 B; 4NCY A; 2Z3D A; 1AD8 H; 5AFZ H; 1ELG A; 2Y5G A; 3AVZ A; 3U98 H; 1DST A; 5EW2 H; 4I33 A; 4JZF H; 4LOY H; 3SU4 A; 2XC4 A; 1O5F H; 3MO3 A; 1PJP A; 2AIP A; 2J38 A; 3AW0 A; 3RXF A; 1GBH A; 1TFX A; 3BTT E; 1SOT A; 3RXC A; 1YPM H; 1PPE E; 5ESB A; 1DWD H; 3RXE A; 3VB5 A; 2XC5 A; 1YWU A; 1CGI E; 2ODY B; 2ZU1 A; 4U01 A; 4BAH B; 1YM0 A; 1FAX A; 1GL1 A; 1SR5 C; 1SKY E; 2OUA A; 1O5B B; 1OWJ A; 1TRY A; 3FAO A; 1QRW A; 2ZCK P; 1DXW A; 1V2Q T; 2NWN A; 4K1T A; 4RSP A; 1BTH H; 2EST E; 4ZXY H; 1D3T B; 5DP5 A; 3VB6 A; 1S82 A; 1H8D H; 4WXI A; 4A7I B; 5IK2 D; 1C1W H; 4TWW A; 2HNT E; 1IOE A; 2V7Q D; 1NU7 B; 2Y80 A; 3OAA D; 3ZYD A; 3LT3 A; 1Y8T A; 4NA7 A; 1ELB A; 2JKH A; 1SGP E; 1SLU B; 3SV8 A; 1GI8 B; 2WIN I; 3MU0 A; 4MLF B; 3SV9 A; 1BMF D; 3TK6 A; 2ANY A; 4E7R G; 4WH8 A; 1O3N A; 2FS9 A; 1S0Q A; 2XND D; 3FP7 E; 1V2S T; 2VVU A; 1CBW C; 1Z1J A; 4X2W A; 3R3G B; 1XUG A; 3KF2 A; 2CN0 H; 2K0Q A; 3A87 A; 2FI4 E; 1TNL A; 4UFD H; 1TNH A; 1OYQ A; 1SLW B; 3M5M A; 3TJU A; 1K1P A; 3IG6 B; 1ABI H; 1L1J A; 1NRQ H; 2DUC A; 3GYM A; 3RDZ A; 4BTU B; 4U2W A; 1XVO A; 2ZNK H; 5AF9 H; 2PKA B; 3ATL A; 5EQS A; 2Z9I A; 3F9E A; 3SGB E; 1C1P A; 2A7J A; 1QL9 A; 3A85 A; 2QXJ A; 3Q77 A; 2AMP A; 1ZMJ A; 1OWI A; 1N1L A; 1P2Q A; 4TSF D; 2Z9J A; 3FOA A; 1ESB A; 1BRA A; 1JXP A; 1QZ8 A; 4DIH H; 1V2J T; 1WCZ A; 3HKJ B; 2BX4 A; 4K69 A; 1CHO F; 4MPW A; 1YKT A; 5F6M A; 1XUK A; 2WV4 A; 1BTY A; 1Z8I B; 2H9H A; 1IQK A; 3BV9 B; 5JPM H; 4B1T A; 1P9U A; 1WTH D; 3GYL B; 4Q7X A; 4NIX A; 4XBB A; 2QA9 E; 2G81 E; 1HNE E; 4D76 A; 1K28 D; 2Z9G A; 1CO7 E; 4TWY A; 2Y7X A; 1Z6E A; 3E91 A; 1LTO A; 1E1R D; 2QCY A; 1ELC A; 4LZ1 H; 3TH2 H; 1YBW A; 3BTW E; 4K1E A; 2ZG0 H; 1AFQ C; 1C4Y 2; 1ZRB A; 2HPP H; 2KFW A; 2OQ5 A; 4GSO A; 1MZA A; 4WF8 A; 2ZU4 A; 4M9F A; 3GCH B; 1G30 B; 5L6N H; 1TOM H; 2FOF A; 3N7O A; 3ZV9 A; 3LGY A; 1K1J A; 3AK5 A; 1DWC H; 1B7X B; 1PPZ A; 3C1K A; 3STI A; 5C94 A; 4OS1 A; 4YT7 H; 1CT4 E; 3O8R A; 2OC8 A; 2ZFP H; 3RXL A; 5CE1 A; 1QRZ A; 4Z0K A; 2HVY B; 1A4W H; 2JET C; 2P8O C; 1SGR E; 3NXP A; 4I7Y H; 5ABW A; 4TY6 A; 5JBT A; 2WUB A; 3V0X A; 1G3D A; 3RM0 H; 1GCD A; 1G3E A; 1BJV A; 1WU1 A; 5EXL A; 1XUJ A; 3BEI B; 4GLY A; 1Y3Y A; 2Z9L A; 4CR9 A; 1C2H A; 3QWC H; 1BBR K; 1O2W A; 3SU6 A; 3D65 E; 1A0L A; 1CA0 B; 2J94 A; 2ZA5 A; 2V6N A; 1BOQ A; 2STB E; 1RJX B; 1V2V T; 1GJ6 A; 1RD3 B; 3QZQ A; 2TGT A; 5C5N A; 1O2K A; 1O2Y A; 6CHA B; 1F0U A; 2NU4 E; 1GJ9 B; 2OXS A; 2P95 A; 3E0N B; 3GS9 A; 1SQA A; 3FO8 D; 1AI8 H; 2BQ6 B; 4BAQ B; 3EYD A; 1ZGV A; 3A83 A; 1BML A; 1FZZ A; 3PRD A; 3UR6 A; 4XRN A; 2FM2 A; 4IS5 A; 1CHO G; 3IWM A; 1O5D H; 1MMJ N; 5HKK D; 3H7O A; 1QNJ A; 1O32 A; 1TGC A; 5J4S A; 3FZZ A; 1EOL A; 1LPG B; 3BTK E; 1GJA B; 3GY6 A; 5A0C A; 1HCG A; 3OTP A; 1V2W T; 5DP9 A; 1SBW A; 3MH5 A; 2RDE A; 1O30 A; 2XBW A; 1O5C B; 3MH6 A; 3P8G A; 3MNC A; 3M3S A; 1L4D A; 4XD7 D; 2OQU A; 3DCL A; 1C5Y B; 3K6Z A; 3PB1 E; 2Q6G A; 1ZGI A; 3I29 A; 1MQ5 A; 1JIM A; 1N6X A; 2ZQ1 A; 1YPH E; 1P2K A; 1IHS H; 4JMY A; 3G01 A; 5FPS A; 3DD2 H; 1HV7 A; 1GBM A; 1S0R A; 1KXF A; 1BCU H; 1D3P B; 4HI3 A; 3AAU A; 4I8K A; 2IJO B; 2A4G A; 5IYT A; 1NT1 A; 5CDF E; 3A8A A; 3T26 A; 4YXW D; 4ZH8 A; 4AB9 A; 4Y7A A; 2FYR A; 3QDZ B; 4ZHM U; 2A7C A; 4AFS A; 1SGE E; 3CEN A; 2ZFS A; 3A7Y A; 1VZQ H; 1GI0 A; 2Z9K A; 5JYI A; 3F0O A; 1ETS H; 3QZR A; 1S85 A; 1QR3 E; 1ARC A; 4K2Y A; 1ELD E; 5F03 A; 3PWC A; 2A1D B; 1SQT A; 2F91 A; 3EGK H; 3DSG A; 3SU1 A; 4TY7 A; 1LHD H; 3EE7 A; 3M5O A; 3RU4 T; 3KGP A; 1BMM H; 1P03 A; 4MNY A; 3TIU A; 1YF4 A; 4HZH A; 2VJ1 A; 2F4L A; 4IC6 A; 1E36 B; 2G8T A; 1MD7 A; 1ZJK A; 2PKS C; 4MTB A; 1SC8 U; 1V2P T; 2HRV A; 5ETX A; 2P3T B; 4X2V A; 3SYJ A; 1VR1 H; 1D6W A; 4ISO A; 4B76 A; 2V3H H; 1TX7 A; 1SGN E; 2G5V A; 2ANW A; 1GJB B; 1UTQ A; 3PYH A; 5GXP A; 1XUF A; 3ODF A; 3SI4 H; 1BIT A; 4JK6 A; 3SZE A; 2FYQ A; 4FUH A; 3SU0 A; 1O2R A; 1C5P A; 3D23 A; 4O3T A; 2AER H; 1AKS B; 5HM9 A; 2UUF B; 4DY7 B; 1TQ7 B; 2JH0 D; 5LPE A; 2W7S A; 2GZ9 A; 1GGD C; 2HLC A; 1MAY A; 1EZS C; 2PSX A; 3F6U H; 5I25 A; 1A3B H; 2EI7 A; 2PUX B; 3I77 A; 1COW D; 2F9O A; 2H9E H; 4RT0 A; 1GI2 A; 2GV6 A; 2XOK D; 2QF5 A; 1ETR H; 3M7T A; 2J98 A; 2XTT B; 1OP8 A; 4BAK B; 3GCT F; 3SNA A; 5K7R A; 2VGC C; 1F0R A; 3T25 A; 1AY6 H; 2D1J A; 2V35 A; 1S6H A; 4AZ2 B; 1KY9 A; 2A4Q A; 2O8M A; 2Z6B D; 3BG4 C; 4CHA B; 4TPY A; 1O36 A; 2TGA A; 1CA0 C; 3QO6 A; 1N8O C; 4YOI A; 5C1U A; 4YM9 A; 1TPA E; 1S84 A; 3S9B A; 2PHB A; 1Z8G A; 2B7D H; 1Y59 T; 4FUI A; 5GPI B; 1KTS B; 2Y81 A; 2JJ2 D; 1VGC B; 2R3Y A; 3L3T A; 1DIT H; 1O3K A; 2SFA A; 2KCO A; 2WPD D; 2F43 B; 1ELE E; 3K2U A; 4Y10 E; 4AFZ A; 1TNK A; 1O2L A; 4KP0 A; 1KLJ H; 1P2N A; 1SGF A; 1VIT F; 4X1R U; 4Y8Y A; 6CHA C; 1MTS A; 1YPK H; 1C5Z B; 5T3H A; 1P01 A; 2BD4 A; 2HAL A; 2OTV A; 2XBY A; 3K9X B; 3LKW A; 4YOG A; 4CRF A; 3RMM H; 3O8B A; 1SGD E; 2FS8 A; 2BMG B; 2GDD A; 3FZD A; 4NIV A; 3SU2 A; 3NWU A; 1ZTL A; 3SN8 A; 1OKX A; 1C2I A; 2FOH A; 1O3E A; 2ZTY A; 1AFE H; 1AND A; 1JRT A; 2HNT C; 2Y6T A; 3M61 U; 1O2S A; 2QF0 A; 3SOR A; 4X1N U; 1HAZ B; 1L0Z A; 4MNV A; 1DFP A; 1UHB B; 4FU7 A; 2AEI H; 1V6D A; 4B73 A; 1AZZ A; 2M2A A; 4CBO A; 4NWK A; 1MCT A; 2KAI B; 1OP2 A; 1AVX A; 1YPG H; 2OLG A; 1KLI H; 1O3A A; 3GDU A; 1UTP A; 3A8C A; 2KZ4 A; 4WXV A; 2ILN A; 2GCT B; 3WY8 A; 3KEE A; 2XNI A; 3FP6 E; 2ZI2 H; 1LDT T; 1ETT H; 2ZF0 H; 1NFW A; 4X6N A; 3ZV8 A; 1LHF H; 3RMO H; 3A89 A; 3FKS D; 8KME 2; 1B5G H; 1SI5 H; 2ZTZ A; 4QT8 C; 4DG4 A; 2WPL S; 4JZ1 A; 4KTC A; 5HXF A; 5GDS H; 1XMN B; 1C1Q A; 3SU5 A; 2C8Y B; 3BIU H; 2ZP0 H; 3MMG A; 4GCH F; 4YT6 H; 1UVO A; 3LON A; 4NA9 H; 1QB9 A; 2A32 A; 1E0F D; 1ELF A; 4WWY A; 2OC1 A; 4MQA A; 4B2B A; 1VCQ A; 1QCP A; 1YY3 A; 3GIS B; 2BDB A; 5A8Z A; 3GCT G; 2Z3C A; 1TPO A; 5A0A E; 1V2O T; 4JCN A; 5DO4 H; 2H9T H; 1HIA B; 4BTT B; 1O5G H; 1YLN A; 2YOL A; 2ZGB H; 2ZDK A; 4X2Y A; 1WBG B; 1H9I E; 1DUE A; 3UPE A; 1TPS A; 1C4U 2; 1HAY B; 1P06 A; 4BAM B; 2BY9 X; 2EC9 H; 2WSS D; 2ZPS A; 1TMT H; 2LPR A; 4GHQ A; 1EZX C; 2C3S A; 2RA0 A; 2P59 A; 1QA0 A; 1HAP H; 3U1J B; 1UTN A; 2FXR A; 3GY5 A; 3BEU A; 4DOQ A; 3KL6 A; 3SQH E; 1FI8 A; 1ANB A; 1EZQ A; 4HFP B; 3LJO A; 2PTN A; 4HG6 A; 1W12 U; 1Q3X A; 3E0P B; 4JYT A; 1GBC A; 4WME A; 3RXK A; 1P02 A; 1C5X B; 2A45 B; 3I78 A; 5T6G A; 3RXA A; 4I86 A; 2FI3 E; 1EAW A; 1FPH H; 4NZQ A; 1IQH A; 1CGJ E; 3OFN D; 2BD8 A; 1GBJ A; 3NPS A; 3ELA H; 1GHV H; 3A88 A; 2V3M A; 4FVD A; 3SI3 H; 1ANE A; 1FNI A; 2R2M B; 1E37 B; 3NZI A; 1CBW B; 2ALP A; 3MU5 A; 1Q2W A; 2WUC A; 2GGV B; 2WZQ A; 3SO3 A; 2VIW A; 1IQN A; 1C1S A; 1ZJD A; 2WYG A; 2WPM S; 2BOH B; 4K8B A; 4R8T B; 3V7T A; 2TGP Z; 2XRC A; 2RG3 A; 4Q80 A; 2GTB A; 2QAA A; 3KID U; 1LPK B; 1O2U A; 2CGA A; 3UB0 A; 1C5N H; 2A2X H; 1YLC A; 1WUN H; 4ABI A; 4ZXX H; 1MTN B; 2BY6 X; 2BYA X; 3KN2 A; 3U1I B; 1AU8 A; 3D49 H; 1GHW H; 1O2P A; 3KYF A; 3ZVB A; 3BSQ A; 4WMF A; 5AFY H; 1QQU A; 3P95 A; 5KEC A; 4GCH G; 4AGJ A; 2VH0 A; 1Z1I A; 3GCN A; 3UIR A; 4F48 B; 2K1Q A; 5LGO A; 3T28 A; 4MPV A; 1KIG H; 2SGP E; 4FUB A; 4B6E A; 3URC A; 1EAS A; 3BTF E; 1EAT A; 1QJ1 B; 5E0J A; 1MTW A; 1NRN H; 1TQ0 B; 3OSY A; 2BD7 A; 3A84 A; 2BVS H; 1W8B H; 3ZZB A; 2PTC E; 1TMU H; 2A31 A; 3QX5 H; 1YLD A; 1GHY H; 1H8I H; 1T32 A; 1QB6 A; 1RS0 A; 1EAI A; 1NPM A; 2A2Q H; 1Y5A T; 1AFQ B; 2B5T B; 3CS0 A; 1O35 A; 2RFK C; 4Y6D A; 1GI1 A; 1HDT H; 1UVT H; 2STA E; 1L1N A; 4NGA H; 1W0J D; 3VG8 A; 5GIB A; 2P94 A; 1TPP A; 3P6Z B; 1DXP A; 4ZKS U; 1GHX H; 1DWE H; 1BDA A; 2AYW A; 1P9S A; 1ZYO A; 2TGD A; 1CSO E; 1HRT H; 5C17 A; 4NG9 H; 4OS7 A; 1LMW B; 4FUF A; 2JET B; 2DE8 A; 2P8O B; 2VWM A; 4B75 A; 1TLD A; 1D6R A; 1HAI H; 1TAL A; 3NRL A; 1GI3 A; 1LQE A; 3A8B A; 4AYV B; 1GBI A; 2BB4 A; 3TVJ B; 1TON A; 3BTH E; 4OS6 A; 5DSF A; 1TBR H; 1ZRK A; 2Q1J A; 2L6O A; 2FO9 A; 1AIX H; 1NRR H; 3M7U A; 1FY1 A; 5JDU B; 1NN6 A; 2ZFQ H; 4TPI Z; 3VB7 A; 3HK6 B; 2Z7F E; 4YES B; 3SZN A; 4X1Q U; 1P3C A; 2AHM E; 1UTL M; 2QY0 B; 1PQA A; 2IPH A; 5DP3 A; 3RLW H; 1YCP M; 3HGP A; 1IQI A; 5A09 A; 2WHX A; 4FUJ A; 3LH1 A; 1LHC H; 2QE7 D; 1EUF A; 1XKA C; 1G2M A; 2VBC A; 4DT4 A; 3BTD E; 1PQ7 A; 1CHG A; 1GMC F; 3P17 H; 3KHV A; 1Q31 A; 2BLO A; 1C4V 2; 1W2K H; 4X8V H; 1HFD A; 2SGQ E; 3ZZ7 A; 1O5E H; 1PQ5 A; 1GJD B; 3TU7 H; 2K8I A; 1UK2 A; 1Z7K A; 4Y11 E; 1UVS H; 1ZPZ A; 2F3C E; 2WPK S; 1NU9 A; 4U30 A; 1GMD F; 3Q3Y A; 4D7F A; 2WYJ A; 1O3I A; 1UVP A; 2BXT H; 2SGA A; 1HAX B; 1BTU A; 3ODD A; 1O2V A; 2ZKS A; 1MKX K; 1YP9 A; 1GBK A; 1YPJ H; 3HKI B; 2FTL E; 1V2T T; 2XWB I; 1UTM A; 1YYY 1; 3E6P H; 4OS5 A; 2ZQ2 A; 1G32 B; 1W14 U; 4MNX A; 4CH8 B; 2GDE H; 4E7N A; 1HUT H; 2G00 A; 3RXP A; 2ZU3 A; 1KXB A; 4IMQ A; 2KCP A; 2HNT F; 2H1U A; 5I46 H; 2BDC A; 3UNS A; 3RM2 H; 2W26 A; 3CNR A; 2QYI A; 4VGC B; 1H8H D; 1ORF A; 2VID A; 2G52 A; 1BTW A; 2WPI S; 1AWF H; 2Y5F A; 1MTN C; 1NTP A; 2OBQ A; 4JZI A; 1O34 A; 1XUH A; 2FWW A; 5DG6 A; 5L2Z H; 1QFK H; 4Q7Y A; 2UWL A; 3M36 A; 4INH A; 4NIW A; 1KDQ A; 2YMS C; 4K3J A; 1OWD A; 2VIN A; 2OBO A; 1AQ7 A; 1O2J A; 2F9N A; 1V2U T; 4WJG 2; 2A5I A; 3TJO A; 3URE A; 1FXY A; 2A7H A; 2H2Z A; 3BTQ E; 4FUG A; 1GG6 C; 1TA2 A; 1FLE E; 2PKS B; 1ZML A; 1AN1 E; 3GOV B; 2HPQ H; 1AZ8 A; 3MU4 A; 5FAH A; 5E2P A; 1QBV H; 1GBT A; 1L2E A; 2AMD A; 4ISH H; 3P8N A; 1QL7 A; 3EE0 B; 4JK5 A; 1DLK B; 2W6I D; 1F0T A; 3PRB A; 2PUQ H; 3ZVG A; 7EST E; 2LEL A; 1GI5 A; 1GMH F; 3EA9 A; 1TGB A; 1WXR A; 3MU8 A; 1DE7 H; 3ZZC A; 3GY3 A; 1GMC G; 2FES H; 1HJA C; 4Y0Z E; 4AN7 A; 3WWF A; 3LGV A; 1RXP A; 3UTU H; 2OCV B; 1DS2 E; 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