The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
74
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structure length |
74
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Chain Sequence |
b'VDMSNVVKTYDLQDGSKVHVFKDGKMGMENKFGKSMNMPEGKVMETRDGTKIIMKGNEIFRLDEALRKGHSEGG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Copper resistance protein K
|
| publication title |
CopK from Cupriavidus metallidurans CH34 Binds Cu(I) in a Tetrathioether Site: Characterization by X-ray Absorption and NMR Spectroscopy
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Ralstonia metallidurans
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| molecule tags |
Metal binding protein
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| total genus |
11
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| structure length |
74
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| sequence length |
74
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-07-15 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF11525 | CopK | Copper resistance protein K |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Beta Barrel | Thrombin, subunit H | Thrombin, subunit H |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2K0Q A; 2LEL A; 3N7D A; 3DSP A; 3DSO A; 3N7E A; 2KM0 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4D7F A; 3GY8 A; 3ITI A; 4YLU A; 5FCK A; 3HPT B; 2SGA A; 5EG4 A; 1Y59 T; 5T3H A; 1P9U A; 1JWT A; 3GCT F; 1TPS A; 2WPD D; 2XBY A; 9LPR A; 2FTL E; 5T1V A; 2FYQ A; 3SQE E; 3LJJ A; 1H9H E; 5LPF A; 3QN7 A; 3G01 A; 1P2N A; 1QRZ A; 1UCY K; 2OBO A; 2FOE A; 1O3L A; 3UNR A; 1O2O A; 1UTM A; 3KF2 A; 4NG9 H; 4MNY A; 2GJG A; 3BG4 B; 1ZSK A; 3M3T A; 2LPR A; 2LP6 A; 1GJC B; 3MMG A; 1UTP A; 1GBT A; 2ZDN A; 1TPO A; 3VFE A; 1AVG H; 1V2W T; 4AC9 A; 1GBB A; 1ZOM A; 2VNT A; 5C3N A; 4Y76 A; 1TOM H; 3NZI A; 2XW9 A; 1W7X H; 1WDI A; 1FY4 A; 4XBB A; 4ISL A; 2H9H A; 1C5S A; 1UHB B; 2OUA A; 1U6Q A; 2ZO3 H; 4Y0Y E; 5HYO A; 2VIN A; 4ABE A; 5JB8 S; 2P16 A; 4U30 A; 3TK6 A; 1CQQ A; 1QA7 A; 2BY9 X; 1JMO H; 1VIT H; 3BTH E; 1OKX A; 2BD4 A; 1BRC E; 1K21 H; 3P70 B; 3OX7 U; 2PLX A; 2QCY A; 1P8V C; 2A1D B; 4I86 A; 1UHB A; 3RXS A; 1QRX A; 1GG6 C; 1DWB H; 4AFQ A; 4CRE A; 1L1G A; 4NWL A; 3QTV H; 1Y8T A; 4UFF H; 1TWX B; 2VH0 A; 2AER H; 1SLX B; 5K7R A; 4AB8 A; 3LIW A; 5EW2 H; 3E8L A; 2SNW A; 1UVS H; 3CS0 A; 2VWN A; 2UUJ B; 5E0H A; 2JIZ D; 2V7Q D; 1EPT C; 4HI3 A; 4NIW A; 4RSP A; 5EQS A; 1A3B H; 3FZZ A; 5HGG A; 2F91 A; 2HVX A; 4X6N A; 4Y8X A; 1TE0 A; 3VXE H; 3QTO H; 5K0H A; 2WUC A; 1YWU A; 1GGD C; 2BQ6 B; 1EZS C; 4FU9 A; 2BXU H; 3HK3 B; 2BX3 A; 5F03 A; 5F8X A; 1TPP A; 2BVS H; 3VGC B; 1ELV A; 1PYT D; 3Q3K A; 2ZGJ A; 3F2H A; 3GCN A; 5IYT A; 4OS5 A; 4YOJ A; 2BOH B; 9EST A; 2KFW A; 1PJP A; 3GDU A; 4KEL A; 1PFX C; 1O2J A; 1ZSL A; 2CV3 A; 4UDW H; 2W26 A; 2GCT C; 1O31 A; 2ZHF H; 3TPI Z; 3UR9 A; 3PRD A; 4ZKO U; 1GI7 B; 2BQ7 B; 3RDZ A; 1Y5A T; 1RTK A; 3U1J B; 1DE7 H; 5C5N A; 3FOA A; 4X1R U; 1AE8 H; 1TQ7 B; 1LVY A; 2V3M A; 3TNS A; 1EJM A; 2AS9 A; 1LMW B; 3OTP A; 1GI3 A; 5AF9 H; 1TGB A; 5DP7 A; 1TIO A; 3ZZ9 A; 2G4U A; 2GT8 A; 4K8B A; 5L2Y H; 1XVM A; 1HRT H; 2C90 B; 3RC5 A; 3L33 A; 5CDF E; 1IHS H; 2ZP0 H; 1GBC A; 1AUJ A; 2AMD A; 1WYK A; 1QBV H; 1QHR B; 5A8Z A; 2FOH A; 3U28 C; 1ZGV A; 1Z6E A; 3ELA H; 1Z8G A; 4O3U A; 1C1S A; 2GVF A; 1O5E H; 4X6P A; 5L6N H; 1O2V A; 1EP6 A; 5IK2 D; 4I31 A; 1SOZ A; 2ALV A; 5CHA C; 3E3T A; 3PWB A; 4ZHA A; 1ESB A; 3I77 A; 3LPR A; 1L1N A; 4YO9 A; 1UVP A; 3WW7 A; 3PLB A; 4JYU H; 1F0S A; 3DFL A; 5DN6 D; 2VJ1 A; 3ZZ5 A; 3NXP A; 4O97 A; 1YPJ H; 1P57 B; 2ZCK P; 5HKK D; 1BB0 B; 3K9X B; 1LVO A; 2RA0 A; 3K2U A; 1Q3X A; 1VCP A; 1AKS B; 1H8I H; 1BRU P; 3BG4 C; 4X8T H; 2JH5 D; 4FUJ A; 4FVD A; 4NWK A; 2C3S A; 1V6D A; 2KCP A; 2A31 A; 2ZGX H; 4XBC A; 3OE7 D; 1GCT B; 1GJ9 B; 1UK3 A; 3EYD A; 3OFN D; 1V2Q T; 1F0U A; 3F6U H; 3KQ5 A; 1UTJ A; 3RXO A; 1S6L A; 1ZTL A; 2AYW A; 4BAQ B; 1QIX B; 2P59 A; 5EOD A; 2OC8 A; 4FUB A; 1BRB E; 1LKA A; 1MU8 B; 2GT7 A; 2Q6D A; 2QAA A; 1MKX H; 4H4F A; 5DP8 A; 2A4G A; 1NBM E; 2VIV A; 5HIZ A; 2H5D A; 3FKS D; 4OS7 A; 4THN H; 2XOK D; 3PV4 A; 2VIQ A; 1DY9 A; 3GDV A; 3LKW A; 1AHT H; 1EZX C; 1ACB E; 1ZRB A; 1SGD E; 1GBH A; 2F9P A; 3NRL A; 2F4L A; 2P3U B; 3VXF H; 3UIR A; 1Y3W A; 1GMC F; 1TNH A; 3VB3 A; 1ETR H; 3SJ9 A; 1C5N H; 2YNB A; 3KQB A; 4B2A A; 2F9O A; 1CBW C; 4BXW A; 2ALP A; 1GMD G; 1TNK A; 4E05 H; 2SGP E; 3D49 H; 2HNT C; 1KDQ B; 1TON A; 2BZ6 H; 4FUH A; 3U1I B; 1ELT A; 1C1M A; 1MAB B; 4FXG H; 4CH8 B; 5A8Y A; 2FWW A; 3GOV B; 1AZZ A; 3VEQ B; 5E0G A; 4OS1 A; 1MKX K; 2KR7 A; 4KGA A; 3PMB B; 1ZTK A; 1FAK H; 2VWO A; 1HIA B; 3A89 A; 4BAH B; 4DT4 A; 2Q1J A; 2C8X B; 2HRV A; 1TQ0 B; 3UFA A; 1HAH H; 3NKK A; 1TNG A; 3BEU A; 1KDQ A; 3T26 A; 1BTW A; 3P92 A; 1KSN A; 2ODY B; 2Z7F E; 2P93 A; 3TJV A; 2Z94 A; 4BAN B; 3BTG E; 1W0Y H; 1W11 U; 1QL7 A; 5CE1 A; 1D3D B; 4NSY A; 1CGI E; 2GX4 A; 4X1P U; 4X1N U; 4A7I B; 1FN8 A; 2BLW A; 1NFW A; 1GBE A; 1TOC B; 2G5V A; 2H5C A; 1MTN B; 4KP0 A; 4JK6 A; 3SI4 H; 1F2S E; 1P2K A; 5L2Z H; 1SL3 A; 1FLE E; 3N7O A; 1KMH B; 1MZA A; 4X8U H; 1K1L A; 1HAZ B; 1P3C A; 3FZD A; 4JYT A; 3FP7 E; 4AZ2 B; 3SUG A; 4Q2K A; 1T4U H; 1W0Z U; 5AFY H; 1DLE A; 4D7G A; 3ZZC A; 2UWL A; 1C2L A; 1TAL A; 1CGH A; 1O2Y A; 2ZU1 A; 1HGT H; 4K2Y A; 1J17 T; 4DGJ A; 3KQE A; 4DG4 A; 3KCG H; 3M3V A; 3LGW A; 4K60 A; 2XC0 A; 3TNT A; 5EQR A; 4XBD A; 1VCQ A; 1V2S T; 1OWE A; 3SU1 A; 2PR3 A; 2SGF E; 5FPS A; 4O3T A; 5JBC S; 1WUN H; 3SN8 A; 4D9R A; 2PKS B; 1F5L A; 1QGF A; 1C5P A; 1V2V T; 4MPV A; 2J2U A; 1PPZ A; 2R0K A; 2ZCH P; 1NN6 A; 2TGP Z; 1FUJ A; 1O3I A; 2ZC9 H; 4AX9 H; 3DCL A; 3E1X B; 5KGO A; 1EAT A; 1C2H A; 2QF5 A; 3S7K B; 2GMT B; 3TGI E; 1FZZ A; 5AVD A; 5C1Y A; 3MU5 A; 1H8H D; 8EST E; 2OP9 A; 5JBA S; 3SJI A; 1C1R A; 3P17 H; 1XMN B; 1BMN H; 1D3P B; 4F49 A; 4CRC A; 2FI3 E; 3EGK H; 4ZHL U; 1ZHM A; 1GMD F; 1YBW A; 1IQM A; 1C1Q A; 3SZN A; 1GCT C; 4GLY A; 1Y3U A; 2PGQ B; 1AMH A; 1BOQ A; 5FX6 A; 2BOK A; 2BY6 X; 2AIP A; 2G52 A; 2GZ9 A; 1GL0 E; 2IPH A; 1E1Q D; 2ODP A; 3TH2 H; 1KIG H; 1XM1 A; 1J14 A; 1P2O A; 5T6D A; 1IQH A; 4Y8Y A; 1AFQ C; 4FUE A; 2G00 A; 4X2W A; 4NZL A; 4Z1M D; 3M61 U; 3WWF A; 3C27 B; 2P8O B; 4YT6 H; 1S0R A; 2YMS B; 4K3J A; 2HPQ H; 1LQD B; 4B75 A; 2PUQ H; 4ABB A; 4FOU C; 1ANB A; 5T6G A; 4TWY A; 1E35 B; 3T28 A; 1YLD A; 1JXP A; 2AGG X; 1HFD A; 2EST E; 3D62 A; 2ZNK H; 2BLO A; 4DY7 B; 5TCC A; 2QGR A; 3MFJ A; 1DM4 B; 1GVK B; 3RM0 H; 2BMG B; 3PO1 B; 1AUT C; 5CMX H; 2FX4 A; 1EAU A; 1PPC E; 2FI4 E; 3GDS A; 3SJO A; 4GHQ A; 1O37 A; 1ID5 H; 3M7U A; 3SBK A; 2WV4 A; 4ZUH A; 3OEE D; 2BY7 X; 4P00 A; 1DS2 E; 1TX8 A; 2A0Q B; 2G51 A; 1BCU H; 1C5X B; 2Y6T A; 4D76 A; 2W3I A; 4E7R G; 1GDU A; 2Y7Z A; 3PB1 E; 1ZGI A; 3Q3X A; 3MNS A; 3T27 A; 3RC6 A; 5A09 A; 2XWB I; 1GBK A; 1TBQ H; 3BSQ A; 3KID U; 2RCE A; 3LGI A; 1Z8I B; 4X6O A; 2PGB B; 5DP3 A; 1S6H A; 1O5B B; 2FTM A; 1HUT H; 1EB2 A; 1Q2W A; 3ATW A; 3VB4 A; 1C2G A; 1JBU H; 1N8O B; 2XND D; 3KN2 A; 3URE A; 4KTU A; 2GDE H; 4HZH A; 4KKD A; 2FOG A; 1C4V 2; 1FJS A; 1O2X A; 3QK1 A; 5FX5 A; 2P3F H; 4VGC C; 1ZZZ A; 1SLV B; 4JCN A; 1V2U T; 2FEQ H; 3GCH C; 2SGE E; 1UVU H; 3E91 A; 3TJO A; 1D3Q B; 1C9P A; 1TAB E; 1EP5 A; 1NRP H; 1KLT A; 4I7Y H; 1DVA H; 3LU9 B; 1GBI A; 2PSX A; 4GVU A; 4ZCN A; 3ZZ8 A; 2PV9 B; 2WPM S; 1SSX A; 4XOJ A; 2EQN A; 3O8B A; 1Z71 A; 4AG1 A; 1HDT H; 1XX9 A; 3W95 A; 4DUR A; 4LZ4 B; 2QXG A; 3MNX A; 1DWE H; 1QFK H; 3KYF A; 3K6Y A; 4DJZ B; 1E1R D; 2FS8 A; 1RFN A; 4B71 A; 3MO9 A; 4UFE H; 1NRN H; 4ISH H; 2VIW A; 4FUG A; 3RXI A; 1G3C A; 3DSP A; 2PWX A; 1CHO F; 2CXV A; 1AN1 E; 4I8L A; 1ZMJ A; 5C1U A; 2XYA A; 2VIP A; 1O2I A; 1GWA A; 3F9F A; 1AD8 H; 4ABH A; 3BIU H; 3LGY A; 3ZYE A; 3PLP A; 1A61 H; 2BTC E; 2ULL A; 3HAT H; 3QGJ A; 5ESB A; 1EKB B; 3F9G A; 1IQI A; 3GCO A; 4CRB A; 1L2E A; 1EFR D; 1BRA A; 2G81 E; 1O3M A; 2I6S A; 1ETS H; 2L74 A; 4ISI H; 2BZA A; 2OQU A; 2GZ7 A; 4K1E A; 2Y80 A; 1YF4 A; 3NPS A; 3IG6 B; 4UON A; 1BMM H; 3SO3 A; 3DUX H; 3FO8 D; 1LVB A; 1V2R T; 2ZHQ H; 8GCH G; 3BTT E; 3SW2 B; 1HXF H; 1DPO A; 2XCF A; 5EU8 A; 1YY3 A; 3L6P A; 1O2U A; 1QCP A; 1N6X A; 3KGP A; 2PSY A; 3VB7 A; 1XUH A; 4H6T A; 3S7H B; 1TNL A; 2ODQ A; 3M3S A; 3F9H A; 2WPI S; 1OPH B; 2JET C; 3A8B A; 2Q6F A; 1T32 A; 1Z6J H; 5C0U A; 3ZVD A; 3WY8 A; 3ZZ3 A; 1IQG A; 3EE0 B; 2YMS C; 1DLK B; 1RIW B; 5GWZ A; 3H5C B; 4IMQ A; 1A4W H; 3QZR A; 2VBC A; 3U8T H; 3DD2 H; 3FFG A; 1GBL A; 3OSY A; 2A7J A; 2EY4 C; 2JJ2 D; 1YKT A; 2RDE A; 3SV7 A; 1BBR H; 1ZHP A; 1BHX F; 3PO1 C; 3ATK A; 4MPU A; 3SOR A; 3RXC A; 3TGJ E; 5JBT A; 3JZ1 B; 2ZDV H; 4B74 A; 4SGB E; 1XKB C; 1XUG A; 1LDT T; 2HLD D; 3W94 A; 4U32 A; 1O5D H; 4RN6 A; 4GUX A; 1QY6 A; 1ELD E; 2FMJ A; 3D65 E; 3UB0 A; 2B0F A; 2FXR A; 3KHV A; 2HWL B; 1ZMN A; 5DP9 A; 2Z9I A; 2KM0 A; 3LC3 A; 3LOX A; 4NFE A; 2DE8 A; 5H4I B; 2WPK S; 2RA3 A; 3V13 A; 3SQH E; 1FY3 A; 4BTI B; 3LGV A; 5FBE A; 1W3C A; 3OTJ E; 1ZJD A; 4NGA H; 1BMF D; 2A4O A; 1S81 A; 3A82 A; 4UFD H; 1BBR K; 5AFZ H; 2CHA B; 4AGJ A; 5T6F A; 5BRR E; 1QJ1 B; 1AVX A; 2A5A A; 1QJ7 B; 2BLQ A; 1RJX B; 1TGC A; 2A4Q A; 2F43 B; 1QBO A; 1UMA H; 1SGI B; 2TGD A; 5BPE A; 4EST E; 5EQQ A; 2H6M A; 1KTS B; 3ZIA D; 2YNA A; 4BOH A; 1VJ9 U; 3RLW H; 3RXE A; 4ZXY H; 2BDY A; 2R3U A; 2V3O H; 1D3T B; 1SC8 U; 4Q7Z A; 5DPA A; 5TJX A; 3PLK A; 1O32 A; 1GVL A; 3MH6 A; 1PQ7 A; 2J98 B; 6CHA C; 1H9I E; 3TVJ B; 1CT4 E; 2AGE X; 2H2Z A; 1SFI A; 3MHW U; 5FBI A; 1SHH B; 1F5R A; 4AG2 A; 3U98 H; 1V2O T; 1O35 A; 4WH6 A; 2F83 A; 3SNA A; 1SGP E; 3T29 A; 4NIV A; 3RU4 D; 8GCH F; 2UWO A; 1SGR E; 1O5A B; 3AAV A; 4Y7B A; 2J98 A; 2K8I A; 1BJU A; 3E0N B; 4DCD A; 1CU1 A; 6EST A; 2HOB A; 2BLV A; 1G3D A; 4ISN A; 5B6L A; 4OGX A; 1O2Q A; 2TGT A; 3MU0 A; 3F0O A; 1ZHR A; 2OIN A; 3ZZB A; 2ANK H; 2GV7 A; 5CHB A; 1MD8 A; 2NU1 E; 4IW4 E; 2UUY A; 1DWD H; 3M7Q A; 2TBS A; 3HKI B; 3K65 B; 2FZZ A; 5J4S A; 2WZQ A; 1P2J A; 1SQO A; 3LGT A; 1TMT H; 1P2M A; 2GGV B; 4DW2 U; 1SKY E; 3DA9 B; 4CHA C; 3LDX H; 1W14 U; 3TK5 A; 1QNJ A; 1OP8 A; 1MQ5 A; 1NFX A; 1ZJK A; 5GIB A; 1P03 A; 4B1T A; 2SNV A; 3CNR A; 3ZZD A; 3KEE A; 1MUE B; 1S85 A; 1KYN A; 1DX5 M; 2XBX A; 1UVT H; 3URC A; 1A3E H; 1BIT A; 4LZ1 H; 4BAO B; 4J1Y A; 3LT3 A; 1ELA A; 1C2M A; 1HAI H; 1GMC G; 4TY7 A; 1RS0 A; 4M7G A; 3SV6 A; 1O3E A; 2B8O H; 4DOQ A; 1YCP M; 2IJD 1; 2WYJ A; 4TPY A; 1YM0 A; 1B7X B; 2O9Q A; 2PUX B; 2QV1 A; 3Q77 A; 1MCV A; 3M35 A; 5EXL A; 2VGC B; 3F1S B; 1S6F A; 4TSF D; 1SGQ E; 4K69 A; 1SQT A; 1O3P B; 3EST A; 1IQL A; 1RTL A; 3GY6 A; 1XVO A; 1IQF A; 5DJ7 A; 1AE5 A; 1V2N T; 1MMJ N; 2BB4 A; 4IN1 A; 1QA0 A; 2QXJ A; 1L1J A; 1SPJ A; 3S69 A; 5E0J A; 1Z7K A; 2AHM E; 3A8C A; 3SNC A; 1K2I 1; 4OS2 A; 1C1O A; 1P09 A; 4B6E A; 3MU8 A; 5HM2 A; 1OP0 A; 1H9L B; 2G5N A; 1DUA A; 4XE4 A; 4DT7 B; 3P8G A; 3M5N A; 4AYY B; 5EJZ A; 1G3E A; 3SU2 A; 1C1T A; 1GHV H; 1BTX A; 4YTA A; 1W8B H; 3V0X A; 2Z9G A; 2HGT H; 1Z1J A; 2Q6G A; 3HK6 B; 1NY2 2; 1IAU A; 2VIO A; 4RI0 A; 5HMA A; 3MO3 A; 1NC6 A; 4FUD A; 3Q3Y A; 1O2Z A; 1W2K H; 1HBT H; 2V0B A; 1SR5 C; 2BDB A; 3M37 A; 4A5T S; 2L6O A; 2F9N A; 2IPQ X; 4Y7A A; 1O5G H; 5EJ1 A; 1LO6 A; 2QC2 A; 4BTT B; 4AN7 A; 1MTU A; 5L30 H; 3GYL B; 1MTV A; 4GCH F; 3OEH D; 2QF0 A; 1HJ8 A; 5FHT A; 1J15 A; 5LGO A; 1N6Y A; 3SNE A; 1PQA A; 1D6W A; 2QF3 A; 3RXP A; 1GHZ A; 1GMH F; 1LKB A; 2CHA C; 2GD4 B; 4NA7 A; 1S84 A; 2V3H H; 4ABA A; 1ZYO A; 4UFG H; 5E2O A; 4WMF A; 2A5K A; 2AEI H; 4MPX A; 1C5Z B; 1QJ6 B; 4QT8 C; 1CT2 E; 2OD3 B; 5KED A; 1EUF A; 3UOU A; 3BN9 A; 1YPK H; 5EXM A; 1D9I A; 1C1P A; 3ZZA A; 3PRO A; 1LVM A; 1VCW A; 4FET A; 4CBO A; 2PHB A; 2ZPR A; 1NRS H; 2FX6 A; 1MCT A; 2ANM H; 3PMJ A; 3DFJ A; 1GBA A; 3FVF B; 4MDS A; 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