1SYR | Genus

Total Genus 33

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	33
sequence length	103
structure length	103
Chain Sequence	MVKIVTSQAEFDSIISQNELVIVDFFAEWCGPCKRIAPFYEECSKTYTKMVFIKVDVDEVSEVTEKENITSMPTFKVYKNGSSVDTLLGANDSALKQLIEKYA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Initial Structural Analysis of Plasmodium falciparum thioredoxin rcsb
molecule tags	Structural genomics, unknown function
source organism	Plasmodium falciparum
molecule keywords	thioredoxin
total genus	33
structure length	103
sequence length	103
chains with identical sequence	B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L
ec nomenclature
pdb deposition date	2004-04-01

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00085	Thioredoxin	Thioredoxin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	1syrA00

2V6OA 2I9HA 1PQNA 1B9YC 4GSNA 1DE1A 1PA3A 3ERGA 1CQHA 4TR1A 4XS4A 1Z7PA 2PVOC 4AF2A 2H71A 4ISDA 4X0XA 4XTSA 1YJ6A 2ES7A 1AQXA 3GA4A 2H76A 1XWAA 2R2JA 2HSHA 2K6VA 3ME7A 3QPMA 6GSUA 5FHIA 1SU9A 3ZVJA 2GSSA 3GURA 4RUVA 3QOUA 2N5BA 4MZBA 2R3XA 5G31A 4WBJA 4WXTA 4EC0A 2DJ2A 4GLTA 4NPBA 5J41A 2PMTA 4F0CA 2I81A 3KGKA 3WGDA 3BOAA 1FVJA 4I5QA 1EZKA 4N30A 1TK0B 3KMOA 2H75A 2H74A 4EDZA 4F0BA 1NSWA 4KH7A 2BJXA 5FT3A 2NVLA 1SK0A 2B6MA 3CRUA 1B8XA 2YJHA 3CMIA 3DKSA 3M9KA 1OE8A 3VWVA 1I9DA 3TUEA 1SJZA 3P90A 1NM3A 1LU4A 2H1GA 3EE2A 3GRXA 3MSZA 4HQZA 3TOTA 3TCOA 1ST9A 5DAKA 1WP0A 2H72A 1HD2A 4MH2A 3EMXA 3DVWA 2BMXA 4PQHA 1ZZYA 3VFIA 3TJFA 1M0UA 4OCFA 1ERVA 3VLNA 4IJIA 4IW9A 4LL4B 1TRSA 2VL3A 3HYPA 1GTIA 4ZBAA 2VLTA 3QCPA 4K7IA 3KP9A 4KB3A 1OAZA 3V1WA 2TRXA 4IP1A 3ZZXA 1A0FA 5ECQB 4HZ4A 2K9FA 2EIQA 7GSSA 1ERTA 4WR5A 1ON4A 14GSA 4O5RA 5AIXA 1TU8A 2IWTA 3IBHA 3BCKA 2GT5A 2PGTA 1EWXA 1SKWB 2ON5A 3Q18A 1X9MB 1FO5A 1A23A 3GYKA 2DIZA 2A4VA 3GIXA 2VCWA 2AJQB 5D73A 3U5RE 5ECSA 5H5RA 2YP6A 5CYYA 4HZ2A 4BL7A 4RQRA 5ENUA 4NV2A 1K0BA 2B5XA 3M8NA 3UMAA 1EV9A 4MA9A 2QGVA 3HDCA 3RAZA 3FYGA 2VCQA 5GSTA 5G1LA 2C0GA 4GWRA 2P5RA 4MPGA 4GQCA 4POBA 2HZFA 4Q5RA 3GH6A 4KA0A 2ZUPA 3OR5A 2IL3A 2LSTA 5DALB 1Z7RA 1A8YA 2LTKA 2RM6A 3D22A 5ECNB 2DC5A 2GSTA 5IOXA 2GS3A 2H66A 4PNFA 4XCSA 2IMDA 1UC7A 1XW6A 4ZB9A 5F06A 3TOUA 3L9VA 3TRQA 3IK9A 4ID0A 3E3EA 1B48A 4K9ZA 1TK5B 5J9BA 3LWAA 4IP6A 1HYUA 1QGVA 1JZDA 2KHPA 1TI1A 2H8LA 3GMFA 1WE0A 2CVDA 1Q98A 4PUAA 3EU4A 3KH7A 3FHKA 5ELGA 1TRWA 4H86A 1JFUA 2XPEA 5B6NA 3M3MA 3GKXA 1W89A 3VK9A 2IMKA 2YN1A 2YWNA 1MEKA 4WF4A 2CZ3A 2VCXA 1K3OA 4O7HA 2B5YA 3H4KA 1WJKA 4EVMA 4ACSA 4DSRA 3F3QA 2PUKC 2VM1A 2NBSA 4NHWA 4MZWA 3TKSA 4V2MA 1MDIA 4X43A 3L78A 2M46A 4ZILA 5FWGA 3ERWA 2WJUA 1K0MA 4ZL9A 4MJCA 2QC7A 4K0GA 3APQA 2HFDA 2PVQA 4KDYA 3PH9A 5F0GA 1X5CA 4LMVA 3E0UA 1TOFA 3KP8A 1FB6A 13GSA 2P0GA 5AISA 3C8EA 5ECPB 1VRSD 1JHBA 2F8AA 4IN0A 3DGQA 3TKRA 4MCUA 2IN3A 4PUFC 3D5JA 2D2ZA 1XW5A 4O32A 2O8VB 2M80A 1R7HA 2B3SA 4FO5A 6GSVA 5ID2B 2O7KA 5IMCA 1R4WA 3GH9A 3LG6A 3M1GA 1N2AA 2B7KA 2MBTA 2LV3A 1ZMAA 5ID2A 2FGXA 3NIVA 3GX0A 1WMJA 5B7CA 3IAS2 3CBUA 2JZRA 2PERA 3ZITA 2FWHA 1VGLA 4PXOA 1GUHA 2Z9SA 2CV4A 2OE3A 1OC9B 1A2MA 2C0DA 4TXOB 2G0FA 4V2NA 4K6XA 3NOFA 1T4YA 1OC9A 3DEXA 1GUKA 4F03A 1K0NA 2REMA 4JU5A 4TXOA 3ZL5A 2I1UA 3SBCA 5F8BA 2HNLA 1T8EB 3VWXA 3HJPA 4JRRA 5G5EA 3CSHA 3F9UA 1QK8A 2V32A 4PNGA 3DYRA 4MDCA 1HNAA 3KTLA 2VL2A 4QQ7A 5HFGA 5HR2A 4OWYA 1U88A 1C72A 5DCGA 4V1Ag 3GKKA 4RQXA 5LCZA 4POKA 1SENA 2VD0A 3K8NA 1ZYQB 5DDLA 2M72A 2GQLA 4ECJA 3RHCA 3CSIA 4L8EA 3G7IA 3EC3A 1FB0A 3HKRA 4KNDA 1GNWA 3QD9A 3FY7A 4ML1A 3GKNA 4BWQA 4HU9A 1YEPA 3HZ4A 19GSA 4I2TA 3UVTA 2OACA 5ABRA 2L57A 3F4SA 5EVOA 1XBSA 3IOSA 1N8JA 1H4OA 3WT2A 2IMEA 5DQYA 3TKQA 1DSBA 5CRWA 4BVYA 3F6FA 1GRXA 3A2VA 4DEJA 2F9SA 2YCDA 4KCEA 5EL8A 3TKPA 2LRCA 2KP1A 2JL4A 3HA9A 2GT6A 2LQOA 4OD7A 1VF3A 2YANA 4XS1A 3ZRDA 2LUSA 1XVWA 4MH3A 2VLVA 4HU7A 2QSIA 4ZBBA 4QL7A 1WOUA 1QMVA 2WRTA 4TR3A 3HHVA 3IAM2 3EVIA 3KCMA 3F4TA 3WGEA 5COHA 1FOVA 3GL5A 2FWGA 2H6YA 2H0IA 4Z7XA 1PSQA 1FG4A 4N11A 4OCEA 3UBLA 5CAXA 5IOWA 2PBJA 1OE7A 2YWOA 2HSYA 4K0NA 2NPBA 3O76A 4YQUA 2OJLA 4LMWA 5AIVA 3CTGA 3UAPA 1PRXA 4OFMA 2X99A 2H0HA 3VI5A 3M0FA 3DIEA 2R4VA 2XBQA 1PGTA 5D96A 3VWWA 5HR0A 4BVXA 4N10A 5GZZB 2O85A 1G6WA 2GVPA 2LJKA 2MZCA 4K2DA 1PKWA 1JLWA 2N5AA 3QAWA 3HJMA 1Z5YE 5IPGA 3A5WA 4G9HA 4MZCA 5F05A 3FZAA 1GSFA 5DAKB 2H70A 2FWFA 1GUMA 3ED3A 1YF0A 1SL2B 1V40A 4TXVA 1GNEA 1AQVA 3EINA 3LGCA 4TOPA 1EV4A 1G7EA 2C4JA 3VPQA 2E2MA 2E7PA 3WYWA 4FIWA 3QDNA 1ZCPA 4MK3A 1TU7A 3C71A 1VF4A 2GSRA 2H1DA 4K7OA 2TIRA 2GQKA 5KN3A 3KTBA 1EOHA 4KCAA 4MJEA 3Q6OA 5GAND 3FW2A 1SL0B 1GTUA 1Z9HA 3HCZA 2DSAA 5EY6A 3IRAA 5ECIB 4MF6A 2KOKA 3GN3A 3KM6A 1U3IA 1XWKA 3HVSA 4GRFA 4I2UA 4KDUA 1XXUA 1Y25A 2LJAA 1EOGA 3IHQA 3LXTA 3GSSA 2JU5A 2HXKA 3HXSA 1XOBA 2CAQA 1TK8B 2WCIA 2H0GA 1M2BA 3GUSA 4LL1B 4YH2A 3ZVJD 1HQOA 2FNOA 1YF1A 3J7Yb 2KP2A 1T00A 1F6MC 1SD9A 1QFNA 2AB6A 1WRYA 5A4WA 2GGTA 2WDUA 2VCZA 3CRTA 4K1FA 2MMZA 2WGRA 4HEA2 5IMZA 3KXOA 2YPMA 2VL9A 3E9JB 1BEDA 1XWGA 2E2GA 4TW5A 3LXZA 1PX7A 2LRNA 3A2WA 2IFQB 3GFKA 2K8VA 2QKEA 5CNWA 5IO0A 3IXRA 1GSEA 1PD21 2L4CA 3N9JA 5CREA 4MPFA 3ME8A 1GSSA 6GSXA 4EDYA 4IHUA 1GTAA 1TDIA 2V1MA 2H1BA 2IFQA 4JE1A 5ECRB 3EU3A 1ERUA 1PX6A 2GDRA 3G7YA 1BJXA 1AUCA 2V2GA 3ZTLA 2VD1A 5D93A 3NZNA 1YKAA 4IQAA 1MD4A 3H1NA 3DRNA 3QR6A 4MF7A 4G19A 3P7XA 4OMVA 1V9WA 4NWYA 1Z6NA 4KSMA 1SKSB 3H79A 4I8BA 2O89A 3D4TA 1OYJA 3M9JA 1X5EA 2HLSA 1URMA 1O85A 5IQYA 5JWOB 1J08A 5AGYA 3O3TA 2OBIA 3QMXA 2IIYA 3S9FA 2KUCA 2JSZA 1K0CA 2MMAA 1J9BA 2XPDA 4HQSA 4CDOA 1GP1A 3DMLA 1ZL9A 3IC4A 1ZOFA 1Z6MA 2OE0A 4G10A 1YZXA 8GSSA 5KN1A 2JACA 3I6AA 1O73A 2L4QA 1FHEA 1TTZA 1WIKA 1GSUA 4N0ZA 4L5LA 5INYA 1SK1A 2X8HA 1XIYA 1X5DA 4MJBA 2RLIA 2I3YA 3APSA 2LKUA 5B8BA 2BTOT 5F07A 2IMIA 2F51A 1RK4A 2GZYA 3CTFA 2V41A 3J7Yk 3US3A 2MYGA 2EIOA 4FYCA 4KW6A 2X8GA 1AIUA 1R5AA 3FK8A 2CX3A 3ZREA 1O81A 1JLVA 3KEBA 2R6KA 3MAKA 2G2QA 4GCIA 3C73A 3ISOA 1F3BA 4TR0A 5G5FA 3I43A 2LQQA 2H1AA 2GQMA 5D9WA 1F9MA 1F3AA 3PGTA 1AXDA 1BQ7A 3ZMLA 4JR4A 1G7OA 2DLXA 3HY2A 2CQ9A 4RI7A 1KEBA 5GAPD 1HNBA 10GSA 2IJYA 2HI7A 6GSYA 3F6DA 3BCIA 2DJ1A 3IK7A 2C0EA 1QXHA 3RPPA 4PGTA 4OO5A 1PL1A 3GSTA 4EXJA 3GX8A 1AW9A 3BD2A 2WZ9A 3VURA 1OKTA 3QAVA 3LEFA 1SJ6A 4N0VA 1PMTA 1E6BA 4NMUA 5HR1A 3TGZA 3F4RA 3RBTA 2YZUA 5ECOB 1R5PA 3IE3A 4TKYA 2VUPA 4HUAA 3PINA 3UL3A 4L5OA 4GSTA 3KMNA 1EP7A 3TKSE 2CA8A 2AUVA 5KN2A 2B1KA 1T4ZA 1FVKA 4DSSB 5HFIA 3TRPA 1M7TA 4EE0A 2IMFA 1V57A 3ZIJA 3C7MA 5IIZA 1ACVA 4EO3A 3A2XA 1MDKA 1M2AA 4CHSA 1W4VA 2E0QA 2CVBA 4ILFA 2P5QA 4PX1A 4DSSA 2AYTA 4MP4A 5H5SA 1QUWA 2YWMA 2IPAA 2NDOA 3HZ8A 5CO3A 1BX9A 3L0HA 2JZTA 4POLA 1YDKA 2XBIA 2YOIA 4K7NA 5D9TA 2C0FA 5J5NA 3DWVA 1A2LA 2AAWA 5JWQB 3ZFLA 3W8SA 2VO4A 1SKRB 1XW9A 4IKHA 1E2YA 5CP1A 2VCTA 2DMMA 1R26A 1V2AA 4HJMA 1DBYA 1GSDA 3F63A 2YNXA 3IPZA 3CXGA 2MMOA 3UOMA 3FKFA 5J3RA 1MD3A 1Q4JA 5IPHA 2HZEB 4JEDA 3D6IA 4L0WA 1K0AA 4RI6A 1J0FA 4O92A 4ECIA 4BWSA 2FHEA 1B4QA 4IELA 4ZL7A 2HZEA 1GL8A 3A3TA 1NHYA 1YY7A 3FZ5A 4D73B 4HI7A 1SL1B 1TJDA 4MJAA 5ECHB 3VWUA 5G2ZA 3UVHA 3UARA 3GHAA 3IR4A 3WGXA 4OFNA 5L71A 2GSQA 4YAVA 4BA7A 3HVXA 3WT1A 1RW1A 5LNKe 4D73A 4E8EA 1V98A 3FR3A 4ULXA 2LRTA 2DIYA 5C04A 4XS6A 3ERFA 3VPTA 3QFAC 1SK2A 2YJ7A 3GNJA 1B4PA 3ZLPA 5DVBA 2FLSA 1ZYEA 4ECCA 1IYIA 1K0DA 2HRFA 2XC2A 1S3CA 1TI3A 3EYTA 3LYPA 5H5QA 3HD5A 1EEMA 1OC3A 3KIJA 5E59A 1TRUA 2DBCA 2DJ0A 2C8UA 3LORA 4Q5FA 17GSA 2JSYA 4WEYA 1ABAA 3KJYA 2DJKA 4K8MA 3FZ9A 1UN2A 1O8XA 2GTUA 4Q5NA 1S3AA 2H19A 2CX4A 4J57E 5KEJA 1TW9A 4DVCA 2X64A 4I6XA 1H75A 1U3AA 2CZ2A 5JCWA 1WWJA 2B5EA 2HRNA 5CRGA 2XHFA 5KN0A 1VF2A 5ECMB 3FR6A 3N5OA 3TB2A 3F3RA 3QAGA 3D21A 2ZCTA 4PQ1A 3GV1A 2L59A 5E4WA 3SWLA 5IMDA 2L6DA 2FY6A 4FYBA 1XPVA 2F8FA 2VIMA 2LJRA 4QL9A 4POMA 2GZPA 2H6ZA 4YQMA 4ECBA 2KLXA 6GSTA 5GSSA 1GSYA 4OFTA 2C3NA 4HJ2A 4KAEA 1IYHA 4ZB6A 4X1UA 2ZNMA 4EKZA 4XHMA 3L4NA 2X8CA 5JCUA 2B7JA 3BBYA 3JCML 1HNCA 4TRXA 2FWEA 4MLYA 3LQ7A 3QFBC 3TKSC 2YV9A 3DD3A 3W6GA 1XWBA 4G2EA 1KTEA 4BPYA 9GSSA 2RUFA 3LYKA 5D9XA 1AC1A 2PWJA 2VOCA 4LLRA 4OO4A 1EEJA 1K3LA 4YAPA 3ZFBA 5J4UA 1O7UA 3FRCA 5EPFA 2L5OA 2H01A 4ZBDA 2MBSA 3LSZA 3BJ5A 3PR8A 4Q5QA 3F0IA 2L5LA 1M99A 4XRAA 5CRDA 4NXIA 1PL2A 1ERWA 2C3TA 1EP8A 5ECKB 3U6VA 2JZSA 12GSA 4IGJA 1TRVA 1GLQA 2GZZA 3GKMA 2A2SA 1YKCA 4KUNA 2VLUA 1V58A 4WBRD 3W8JA 5B8AA 3ZIVA 3EMPA 5ELAA 4NV5A 3P8WA 3P2AA 3GTUB 4WETA 5A4VA 5JCGA 1X0RA 3APOA 2FD3A 5D9VA 4WR4A 1OC8A 1G0TA 4WF5A 1RQMA 2N5FA 3GTUA 2H30A 2RIIA 1TKDB 4GQFA 2OBKA 3ZYWA 3C1SA 3I69A 1OKDA 3GL3A 3IV4A 2V6KA 22GSA 5HFKA 4KSOA 3F8UA 3FEUA 1K0OA 3H8QA 4AJ7A 2FCHA 1JZRA 3ZMKA 4PQIA 4FYUA 6GSSA 3TDGA 1YEXA 2R5GA 5DALA 1XFLA 1LJRA 4L0UA 2EC4A 4IQ1A 3RHBA 4NAXA 1CQGA 3L9UA 5DJLA 1I5GA 3DVXA 3UEMA 2HYXA 5D8IA 4XRDA 5IM9A 1KBNA 1XZOA 3IDVA 3H93A 1FW1A 1SYXA 2C1YA 2PN8A 1THXA 4ZB8A 2VL2C 2VM2A 1KNGA 2RM5A 2OKAA 5J9CA 1U87A 3HVVA 4ZL8A 2WS2A 1FAAA 1U6TA 3VI7A 5B6MA 1YQ1A 1GH2A 3CYNA 2RUEA 1Z3EA 1SD8A 1ML6A 3AY8A 4KX4A 2C80A 1GTBA 4GSSA 3KH9A 1A8LA 5IMVA 2C3QA 1T1VA 1SJIA 2FA8A 1K3YA 11GSA 2WB9A 3IA1A 1AQWA 2I4AA 3UJ1A 2F3MA 4JZQA 2LNSA 2JADA 1QQ2A 4KGIA 4LA1A 1A0RP 5HQPA 3R2QA 2WFCA 1T7PB 2J9HA 4AGSA 5HR3A 18GSA 1UA5A 4F82A 1JZWA 4CW9A 5DBQA 1M9BA 1NW2A 3KZQA 2K18A 2J23A 5DJMA 5ECLB 3FR9A 2DMLA 2VCVA 3D4MA 4IBPA 4ML6A 4MABA 1T3BA 1ZGNA 4JR6A 2WULA 2A2RA 4WKWA 4XIHA 4ZXGA 4GF0A 20GSA 2GLRA 2TRCP 4NHZA 2CVKA 5G30A 2K8SA 1X9SB 4IVFA 3RPNA 4MF5A 2FUG2 1PKZA 2L6CA 3KD0A 1G6YA 3HJOA 2VAFA 4KE3A 3D0ZA 3Q19A 3MWHA 4V1Ap 1GULA 4J56E 2HE3A 2PU9C 3MNGA 1USBA 2LNTA 4GXZA 2R37A 4V2LA 1F37A 5DCHA 1EGOA 5AN1A 3FZ4A 4HOJA 1M2DA 3EURA 1BYEA 3TJJA 4DSQA 3UBKA 2AHEA 4MMMA 2LS5A 4IS0A 4YQVA 1XVQA 1X9WB 1A24A 4ZIJA 1AAZA 3LFLA 5CRHA 1F2EA 2OE1A 5C00A 4AJ6A 1BAYA 2H6XA 2YV7A 4HS1A 2DJJA 1M9AA 1MTCA 4TR4A 5G1KA 5DQSA 4F2IA 2B1LA 3CSJA 2EIRA 2ON7A 1JZOA 16GSA 3I9V2 4JBBA 1SYRA 2MMNA 2HT9A 2NTOA 4FH8A 2FA4A 5IO2A 1DUGA 3L9SA 1S3DA 5A4UA 3TJKA 1PN9A 1NHOA 5IMAA 3WD6A 1WPIA 2OADA 2YZHA 1MDJA 4KDXA 1EGRA 4GTUA 1UVZA 1THOA 4J2FA 5IMFA 1VF1A 2P31A 4IJ3A 1GWCA 1GLPA 3UIWA 2CAIA 1TP9A 2OA7A 4E8HA 4EUYA 3G9BA 2LEGA 1A2JA 1DE2A 1Y6EA 3MDKA 4EL1A 1TXXA 2YWIA 3RDWA 2H73A 4TN8A 5A5KA 1BG5A 3Q74A 2ALBA 1XCCA 4PURA 3TJBA 1ILOA 1O6JA 4EF0A 3G7JA 4TVEA 2O87A 2PPTA 1XOAA 3C1RA 3TRXA 3DXBA 2AV4A 4AJ8A 6GSWA 1GSQA 1B9XC 5JWRB 4P3YB 3TJGA 3O6TA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

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#chains in the Genus database with same CATH topology
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1SYRA

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