1T1VA

Crystal structure of the glutaredoxin-like protein sh3bgrl3 at 1.6 a resolution
Total Genus 34
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
34
sequence length
93
structure length
93
Chain Sequence
MSGLRVYSTSVTGSREIKSQQSEVTRILDGKRIQYQLVDISQDNALRDEMRTLAGNPKATPPQIVNGNHYCGDYELFVEAVEQDTLQEFLKLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein
source organism Mus musculus
publication title Crystal structure of the glutaredoxin-like protein SH3BGRL3 at 1.6 A resolution
pubmed doi rcsb
molecule keywords SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein-like 3
total genus 34
structure length 93
sequence length 93
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04908 SH3BGR SH3-binding, glutamic acid-rich protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1t1vA00
3GSSA 1HQOA 2CZ2A 3HZ8A 2WDUA 3ERWA 3F63A 2B1LA 2WRTA 1E2YA 3IE3A 5GSSA 3IBHA 2GQLA 3BCKA 2NDOA 4WKWA 1TW9A 1V40A 2WGRA 5CRWA 1Z5YE 4KNDA 4LA1A 1ERWA 4GCIA 3LXZA 5IMCA 1OKDA 3KTBA 3NOFA 3ZL5A 1PL1A 4TXOA 4XRDA 3HKRA 1U3IA 4OD7A 3QOUA 3TJBA 4I97A 2CVBA 20GSA 4MDCA 4XS4B 2LJRA 1SL0B 4JBBA 2F9SA 3TKPA 3IAS2 2KP1A 2L6DA 4MH2A 4MLYA 1Z7RA 4F9ZA 1OC8A 5J41A 1LJRA 2C0DA 5D9WA 3GN3A 1TJDA 4IVFA 4WR5A 3IR4A 4LL1B 2VCWA 2CAIA 1AQWA 4FO5A 2HSYA 1DBYA 4JR6A 4L5LA 2GZYA 3H4KA 1A8YA 1XWGA 2QKEA 1SK0A 1GSFA 3KH9A 1TTZA 13GSA 1K0CA 1N8JA 2HT9A 2ON5A 1F3BA 1XW5A 3VLNA 3L4NA 2B5XA 1XVWA 1TK0B 2KLXA 5AIXA 1WP0A 2LRNA 4TKYA 1I9DA 2VM2A 4L0WA 1MTCA 3IA1A 2GSQA 2PPTA 1TRWA 5IMVA 3P90A 3APQA 2H0GA 4K6XA 2OACA 4G2EA 1SYRA 2DJ0A 3MSZA 1DUGA 1Z9HA 5LNKe 4F82A 4OO4A 1SK2A 1ERVA 3R2QA 3GTUA 4GQFA 1XPVA 3UBKA 2X99A 3F3QA 2YZHA 1EGOA 4H86A 3O3TA 4IW9A 4TR1A 1XZOA 1GSYA 1PSQA 2C8UA 3ZFBA 1O73A 2H70A 3QMXA 4MZCA 1EZKA 4ILFA 1F9MA 1JZRA 4RQXA 1R7HA 2LTKA 3F3RA 5G2ZA 3M1GA 1MEKA 1PKZA 3EC3A 2H76A 2RUEA 1M9AA 4GSSA 2IFQA 4KCAA 4ECBA 3EMPA 2GS3A 3DEXA 6GSVA 11GSA 5ECLB 4ZXGA 3MAKA 2B7KA 5GAND 2X8CA 1S3AA 5KN0A 4K1FA 5AIVA 3KGKA 5ECOB 2FLSA 3LJRA 2O89A 1WIKA 4GQCA 2FA4A 2RM6A 3VWXA 5ECQB 4XHMA 2YJHA 1M0UA 2H1BA 2WS2A 2H6XA 2O87A 4ID0A 3BOAA 5FT3A 3CTGA 5F05A 3EU3A 4V2MA 1FVJA 4OCEA 1URMA 2V32A 3N5OA 3EE2A 3WGXA 4GWRA 2O7KA 4JR4A 3BBYA 5G1KA 4OO5A 1O85A 2GZPA 1IYHA 4N10A 4KA0A 1OE8A 2C0FA 3Q6OA 2JZTA 1SKWB 3GX8A 1Y25A 4QQ7A 5HR1A 2LV3A 1H4OA 2E2MA 3DVWA 3QD9A 4NV5A 1VF1A 4V2LA 4AJ7A 1Q4JA 1K0BA 1XWKA 2L57A 4YH2A 4MP4A 2YOIA 2YWNA 2YV7A 4POLA 3Q19A 4EF0A 3ZFLA 2P5QA 1O6JA 3GH6A 1V98A 2P31A 3DGQA 1G6WA 2MZCA 1K3LA 4IGJA 3D6IA 2E2GA 18GSA 4Q5FA 5DQSA 3M9JA 3UARA 2XBQA 1RW1A 2OA7A 2GSSA 2C3QA 3IHQA 3ERGA 2F8FA 2MBSA 4F2IA 3DKSA 4YAVA 1EWXA 2H71A 3KJYA 1AXDA 5AGYA 1SD9A 1C72A 3FW2A 4IJIA 4XS4A 1OE7A 2XC2A 5G31A 3A2WA 1B4PA 1ERUA 1SL1B 2H01A 2L5LA 3HZ4A 3N9JA 3J7Yb 2IL3A 4MH3A 4MF6A 1AAZA 5IOWA 1GULA 3FR3A 2VO4A 2YWOA 4EC0A 2PU9C 3ZVJD 4OFNA 4K0GA 1UC7A 4POBA 4RUVA 4POMA 2VL9A 1ST9A 3DXBA 1B9YC 4WR4A 5IMZA 2B7JA 1PD21 4TR0A 1A0RP 2VL3A 3C1RA 1AW9A 3ZZXA 3ZRDA 1GNWA 1GUKA 2TIRA 2LSTA 3VURA 3D5JA 3HYPA 1A24A 4ACSA 4Q5QA 1GRXA 2H6YA 4HU9A 6GSTA 3M9KA 2I4AA 4X0XA 1X5EA 2VCZA 5LD0A 2OKAA 3HXSA 3FEUA 3APSA 4LMWA 5J9CA 3UVHA 4ECIA 4EVMA 2MMAA 3IRAA 1QQ2A 5JWOB 3QCPA 1SU9A 3C71A 1E6BA 4MA9A 5B8AA 4EL1A 3VK9A 3VWUA 3VFIA 4XIHA 5DJLA 3JCML 3WT2A 2YWMA 1FVKA 3ZLPA 4XTSA 2V41A 2YPMA 2WCIA 4Q5NA 1RK4A 3C1SA 3EWLA 1JHBA 1TKDB 1A0FA 1ILOA 2GSTA 2HXKA 2L4CA 1KTEA 2MBTA 1EEMA 2G0FA 3FR6A 1KEBA 1WRYA 3QDNA 3BD2A 1UA5A 4ML1A 5ID2B 2V6OA 2DLXA 3HJMA 3TGZA 4N30A 3KP8A 4CDOA 1QMVA 1YF1A 4X1UA 4NHZA 3EYTA 4ECCA 3MDKA 2DMMA 3L78A 1SKSB 2N5BA 2JL4A 1YDKA 1N2AA 4GLTA 4IJ3A 2GZZA 4ZBBA 4PGTA 4TW5A 1IYIA 4BA7A 1TP9A 2N5AA 3D0ZA 3F8UA 3CXGA 1QUWA 5G5EA 3FHKA 5COHA 1SJZA 3KCMA 4F03A 3LXTA 1HNAA 1SJIA 1KBNA 3ZREA 3BCIA 5INYA 2E0QA 4K0NA 4KH7A 5F0GA 3P2AA 3RPPA 5EL8A 2LEGA 3GURA 5C00A 2DJ3A 2C80A 2KHPA 4XCSA 5B6NA 1PL2A 3ZTLA 1GP1A 2YCDA 3L9UA 4ZL7A 1VRSD 3DVXA 4FYUA 1XW9A 4KUNA 3TKSE 2IMIA 4NHWA 5D8IA 3D4MA 2VCTA 4WBRD 3FRCA 3GRXA 4KE3A 2D2ZA 1TU7A 1RQMA 1WOUA 2AV4A 1T4YA 3PR8A 4V1Ap 4MF5A 2TRCP 3HDCA 1GTUA 3KIJA 3ZVJA 3KM6A 5ABRA 3NIVA 5IOXA 1ACVA 3ZYWA 2DBCA 1J0FA 4L5OA 1CQHA 5IIZA 1H75A 3FZ9A 2NTOA 5JCGA 2A2SA 2RM5A 4HS1A 1GNEA 1Z6NA 4WETA 1FHEA 3HD5A 3L9SA 3UMAA 1O8XA 1XW6A 3H1NA 2JSZA 3A3TA 3UJ1A 1PGTA 2VD1A 1AUCA 1DE1A 3ZMKA 5KEJA 4LL4B 3CMIA 2BMXA 1K0AA 1J9BA 1GWCA 2F3MA 2X64A 2QGVA 1A23A 4I6XA 3FZ4A 5CRGA 3UOMA 2CV4A 2HLSA 4XS1A 3GKMA 3F6DA 2WULA 1FW1A 3KTLA 1XWBA 4HUAA 1KNGA 4IELA 1F2EA 3WYWA 5HFGA 1T00A 2CQ9A 1BAYA 5EY6A 4AF2A 1SK1A 3W8JA 1FG4A 1NHYA 4LLRA 2VCXA 2VLUA 1B8XA 5KN1A 4YQVA 3TCOA 1QGVA 2GTUA 1OC9B 3GL3A 4OCFA 2PERA 3E0UA 2B5YA 3VWVA 2AJQB 2I3YA 2IJYA 1OAZA 4FYCA 4G9HA 5DQYA 2YV9A 4YQMA 3BJ5A 4WBJA 3GH9A 3H8QA 1GUMA 2PMTA 2YNXA 4HJ2A 4GRFA 2JZRA 3A5WA 1GSSA 1OVNA 3ED3A 4HU7A 4OFTA 2B5EA 4K7IA 1HD2A 5DBQA 5J3RA 1WE0A 2Z9SA 1WPIA 12GSA 3RBTA 2KOKA 3QFBC 4QL7A 1A8LA 3EINA 2H30A 4BVYA 4KDXA 5H5SA 2MYGA 2K8SA 4K7OA 4KB3A 2N5FA 4NV2A 2CVDA 3TJGA 4HEA2 2I81A 3I69A 4HZ4A 4PQIA 3E3EA 3RHCA 3GIXA 1GTBA 1EOHA 2GLRA 2R3XA 1K3YA 1A2LA 5ECKB 5IM9A 3S9FA 4ZBDA 19GSA 3VPTA 1Z6MA 4L8EA 3QPMA 5ID2A 1T3BA 1G7EA 3LYKA 3TRPA 1W4VA 1V2AA 1X9SB 1XOBA 2GVPA 4IHUA 4MMMA 2YP6A 4GSNA 1U87A 4TR4A 3QR6A 1ZCPA 1XVQA 3I43A 3V1WA 3NZNA 5IPGA 4BWSA 3TOTA 4ZBAA 3IV4A 4MPGA 2OE1A 1K3OA 3WGDA 4TN8A 2V6KA 2MMZA 5ELGA 2LJKA 2HE3A 4IQ1A 3RHBA 2NPBA 2EIRA 2GDRA 1FOVA 3HVSA 3US3A 5HR2A 5GAPD 1VF2A 2EIOA 3W8SA 1BQ7A 3O6TA 1LBKA 2JACA 2AUVA 2VL2C 1ABAA 1ZYEA 3GX0A 1EV9A 2OE3A 3EMXA 2H72A 5DCHA 4F0CA 1JLWA 5LCZA 6GSUA 1X9MB 2RIIA 4MCUA 4MZWA 5DAKB 2NBSA 2IWTA 4FH8A 5EPFA 1G0TA 3EURA 4EUYA 4ZB8A 2OBKA 4BWQA 3LGCA 3A2XA 1JFUA 1EOGA 5CYYA 2L6CA 2C3NA 4YQUA 2DJKA 2TRXA 2FWHA 5JCWA 1T1VA 4MPFA 2ES7A 4N0VA 4NPBA 2JU5A 1EEJA 5CREA 1AQVA 1MDJA 2FWFA 4IN0A 1JZDA 2LS5A 1EV4A 3GA4A 1M2BA 2R4VA 1THXA 3TKSC 2QC7A 4KDYA 3CSJA 2DJ2A 2NVLA 1XIYA 1LU4A 3IC4A 2IMKA 1YKAA 5DCGA 3L9VA 2YN1A 1MD3A 2K18A 1A2JA 4JE1A 3GKKA 4G19A 5IMAA 4KGIA 3C7MA 2O85A 2FUG2 1O7UA 1QXHA 5FHIA 3IDVA 4DSSB 4NAXA 1OC9A 8GSSA 4MZBA 2JADA 1PKWA 5ECSA 2C4JA 3P8WA 4RI6A 1F6MC 2AB6A 3G7YA 3TKQA 1S3CA 2IIYA 1X5DA 3DYRA 3Q18A 4EE0A 4EO3A 3PH9A 4WF5A 5ECMB 3O76A 3CTFA 1TU8A 2YWIA 5H5QA 2VOCA 4MK3A 2HI7A 5B6MA 4ZL9A 3GYKA 3QFAC 3LWAA 1YZXA 5CNWA 5IPHA 2P5RA 2PBJA 1FB6A 10GSA 5G30A 1K0DA 1T7PB 3D22A 1Y6EA 4KCEA 4NXIA 1EP8A 4N11A 1SL2B 3UEMA 4O32A 3HHVA 1YF0A 3DIEA 2IMFA 1YEXA 1R4WA 5EVOA 4DVCA 1TK5B 3KZQA 3TRQA 2CVKA 1M2AA 3KP9A 5E4WA 2REMA 2R2JA 4I2UA 2B6MA 2PWJA 2AYTA 2V1MA 1EGRA 4OWYA 3G7JA 3E9JB 1G6YA 1V58A 2GGTA 1UN2A 5DVBA 3LORA 1T4ZA 3G9BA 2VL2A 4PURA 4PQ1A 4BPYA 3CSIA 3Q74A 2BJXA 6GSWA 3ME7A 4I5QA 2H0IA 1R5PA 1Z7PA 4ZIJA 1O81A 3EVIA 3DMLA 16GSA 4HI7A 4YAPA 1ZZYA 3ZITA 4EKZA 1YY7A 3IK7A 3UBLA 2IN3A 4TVEA 1ZL9A 5AN1A 3TB2A 2YANA 4TXVA 1XWCA 2XBIA 5B8BA 1GLPA 3VI5A 5HFIA 3HVVA 3TOUA 5KN3A 1ZGNA 1DSBA 3CYNA 3KXOA 3UVTA 4EXJA 3QAGA 2FWEA 3F4TA 4I2TA 2WFCA 1B48A 3ZIVA 3LG6A 3MNGA 4BVXA 3VPQA 1PRXA 1QFNA 1SYXA 5GZZB 4IKHA 1GSQA 2K6VA 4IS0A 9GSSA 4POKA 1VF4A 3IOSA 4JEDA 3TKSA 1M7TA 5HR0A 3UIWA 1XWAA 2GQMA 3GUSA 1T8EB 5DAKA 4V1Ag 2FY6A 4TRXA 2GSRA 3WD6A 2PVOC 2HNLA 2FA8A 1TOFA 2YJ7A 2PUKC 4GF0A 2CT6A 3D21A 5GSTA 1GUHA 2J23A 1AQXA 4L0UA 1Z3EA 4DSQA 1XBSA 4CW9A 3CRUA 5HFKA 5JWRB 2H6ZA 3GNJA 3KH7A 5DALB 3ZIJA 5CRHA 1U88A 2C0EA 3I6AA 3GV1A 3FKFA 2FHEA 3F6FA 1NHOA 3HJOA 5KN2A 2M80A 3IPZA 3TUEA 4RQRA 3IK9A 4ECJA 2IMEA 3GFKA 2C1YA 1TI3A 4HZ2A 2VLTA 6GSYA 2KP2A 3PGTA 5G5FA 4BL7A 2VCVA 2X8HA 1XCCA 3FR9A 3M8NA 2DIYA 5D9TA 4ZILA 5J4UA 4E8EA 4WEYA 2XPDA 2ALBA 2LRTA 5AISA 3M3MA 1CQGA 2ON7A 4ULXA 4D73A 1K0OA 1TRUA 4HOJA 4EDZA 5JCUA 3CSHA 2LKUA 5ECHB 4DSSA 4KDUA 3F4SA 3ZMLA 1GL8A 2IPAA 3TKRA 2A2RA 1TXXA 1YEPA 3I9V2 5CAXA 1R5AA 4IQAA 2FCHA 5IQYA 2G2QA 4MJEA 5H5RA 2R5GA 2L4QA 4V2NA 2LRCA 4K8MA 4AJ6A 2FD3A 1I5GA 2MMNA 2CX4A 3HCZA 3KEBA 3TJKA 2H74A 1S3DA 2PN8A 4QL9A 1K0MA 1ERTA 2LNSA 5J9BA 3TDGA 3FZ5A 1HNCA 3GKXA 7GSSA 4NWYA 4OFMA 5IO2A 4HJMA 3LYPA 2MMOA 1WJKA 3SWLA 2ZCTA 4N0ZA 3UL3A 2VUPA 1TRSA 1V57A 4NMUA 2HRNA 5F07A 5HR3A 4GSTA 3HA9A 1SJ6A 3KMNA 4CHSA 1BYEA 3F9UA 1QK8A 2P0GA 4J56E 2VIMA 1PQNA 2ZNMA 3FY7A 1YQ1A 2LJAA 2PGTA 4Q5RA 2A4VA 3WT1A 1WMJA 5A4VA 2JZSA 3C73A 3HVXA 2B1KA 2LQQA 4LMVA 2PVQA 3GSTA 2CX3A 4P3YB 4RI7A 4TOPA 3GHAA 2H8LA 1PX7A 5ECIB 3LSZA 1W89A 2HZEB 1M2DA 2DIZA 3DRNA 4ZL8A 1GSUA 2QSIA 1J08A 3P7XA 1TI1A 5L71A 4DEJA 2I9HA 1M9BA 4KAEA 1ZOFA 5CRDA 2FGXA 4AJ8A 4IP1A 3RPNA 4MF7A 4I8BA 3KD0A 3MWHA 4PXOA 1PMTA 17GSA 5D73A 1BEDA 1X5CA 5A5KA 2C3TA 1GLQA 5J5NA 2ZUPA 2H66A 1YKCA 1JZOA 2VAFA 2IMDA 4PUFC 5HQPA 2BTOT 4KSOA 5IMDA 1TDIA 3CBUA 4ZB6A 1JZWA 2JSYA 2O8VB 3L0HA 3F4RA 2M46A 1ZMAA 5D93A 1VF3A 3UAPA 2DC5A 2X8GA 3HJPA 2GT5A 1DE2A 1X0RA 5CP1A 1F37A 1B9XC 1FAAA 2AAWA 2H19A 3H79A 1TRVA 2VLVA 2DJJA 2R37A 3QAVA 4Z7XA 1MD4A 3EU4A 1O8WA 2L59A 5D96A 2C0GA 1VGLA 5DALA 1ZYQB 1U6TA 4PNGA 1R26A 5E59A 1K0NA 3J7Yk 4K9ZA 2VD0A 1FO5A 3ME8A 1AIUA 4TXOB 4G10A 2H1GA 1ML6A 2LUSA 6GSXA 3DWVA 4MJCA 1PX6A 5ECRB 6GSSA 1BG5A 4E8HA 2F8AA 1FB0A 1WWJA 5B7CA 3RDWA 3GMFA 4MJAA 2VM1A 1MDIA 1USBA 4IBPA 5DJMA 5IO0A 3IAM2 5A4UA 5F06A 4FYBA 4OMVA 1BJXA 1PN9A 3TJJA 4D73B 4TR3A 1HYUA 4X43A 3CRTA 3TRXA 1M99A 4PQHA 4JRRA 4HDEA 2R6KA 2OE0A 2RUFA 1TK8B 3QAWA 5CO3A 3ISOA 2KUCA 2GT6A 1A2MA 3KMOA 5IMFA 2FNOA 14GSA 2H1AA 5F8BA 4KW6A 3LQ7A 2OJLA 3OR5A 1XFLA 3FZAA 22GSA 4O7HA 3LFLA 4HQSA 1EP7A 2DSAA 1GTIA 1G7OA 2HSHA 4WXTA 2L5OA 5ENUA 4ZB9A 1Q98A 4EDYA 4GXZA 2LNTA 2RLIA 3U6VA 3AY8A 1BX9A 2K9FA 2H0HA 4AGSA 1NW2A 1SKRB 2OBIA 4O5RA 3GTUB 1UVZA 1THOA 1X9WB 2M72A 1F3AA 5DDLA 2H1DA 4J57E 4TR1B 2YZUA 4HQZA 5C04A 1NM3A 3GL5A 1GTAA 2H73A 4K7NA 5D9VA 3APOA 2H75A 4MJBA 3FYGA 2I1UA 4FIWA 2HYXA 1GH2A 2B3SA 4PX1A 2IFQB 2CZ3A 2K8VA 5JWQB 4K2DA 1XOAA 2WB9A 1ON4A 3A2VA 1OKTA 3LEFA 3G7IA 4KX4A 4KSMA 5D9XA 1AC1A 3HY2A 3U5RE 4XRAA 3VI7A 4GTUA 1B4QA 3FK8A 2DJ1A 1XXUA 1HNBA 1NSWA 2EC4A 3PINA 4PNFA 2HZEA 3D4TA 2HZFA 3H93A 2J9HA 3K8NA 2CA8A 3W6GA 2FWGA 3ERFA 4F0BA 4O92A 2DMLA 4DSRA 4MABA 1U3AA 2E7PA 4WF4A 1PA3A 2GQKA 3RAZA 5FWGA 4ISDA 2OADA 3WGEA 3M0FA 2XHFA 4XS6A 4IP6A 5ECPB 5ECNB 3SBCA 1OC3A 3DD3A 1GSEA 5G1LA 5ELAA 2VCQA 4JZQA 2HRFA 1YJ6A 4J2FA 2EIQA 3GKNA 3TJFA 2HFDA 5A4WA 2AHEA 2V2GA 1SD8A 2F51A 4JU5A 4PUAA 2WJUA 1SENA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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