1THOA

Crystal structure of a mutant escherichia coli thioredoxin with an arginine insertion in the active site
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
109
structure length
109
Chain Sequence
SDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGRPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of a Mutant Escherichia Coli Thioredoxin with an Arginine Insertion in the Active Site
rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN
molecule tags Electron transport
source organism Escherichia coli
total genus 30
structure length 109
sequence length 109
ec nomenclature
pdb deposition date 1993-01-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1thoA00
5J9CA 1JZOA 4HEA2 2O85A 3QFAC 1GULA 4K7IA 2FGXA 3WT1A 3TKRA 4LMVA 4XCSA 5EL8A 2YWIA 3HZ8A 2L5OA 2EIQA 2C1YA 3LWAA 2CVDA 5KN2A 5FT3A 1JFUA 4ACSA 1T4ZA 3HVVA 4V2MA 2WULA 1K0AA 4ZBDA 4DSSA 1ERWA 2K8SA 1KTEA 6GSVA 4LA1A 2HFDA 1T7PB 2TRXA 2IFQB 3DYRA 2N5BA 2FCHA 1NHYA 4MH3A 3C8EA 1GSDA 1XOBA 4XRDA 2VD0A 3IK7A 5CRHA 1EEJA 5G1KA 1EOHA 2AV4A 2IL3A 3VFIA 1A2LA 2ALBA 2GS3A 1PRXA 1V40A 5A5KA 3D5JA 3IE3A 3GMFA 4TXOB 4D73B 4XS4A 3TJKA 1CQGA 2DJ1A 3ZFLA 3D6IA 4OWYA 4F9ZA 3DMLA 3VK9A 5KN3A 1WWJA 2X8CA 2PU9C 2JSYA 2WS2A 2E2MA 3IV4A 2H1BA 3P2AA 1HNCA 4NV5A 2YN1A 2FWGA 3GYKA 1E2YA 4JU5A 4LLRA 3F8UA 2FA4A 4K0GA 4I2TA 2OBKA 4FYUA 2I3YA 2HT9A 2MBSA 3CMIA 2HYXA 2MMZA 1Y25A 4PUAA 3QOUA 4JE1A 3J7Yk 1V2AA 4AJ7A 4RI6A 1NW2A 3ZZXA 4QL7A 3QMXA 4OMVA 2LUSA 4L5LA 4K6XA 1YEPA 19GSA 9GSSA 3L0HA 3PGTA 1GLQA 2H0HA 1AQVA 2H75A 1WMJA 2LEGA 1ST9A 1A8LA 3DVXA 1EV9A 3W6GA 3QCPA 2VAFA 2FLSA 3TCOA 4G19A 2E0QA 4TRXA 5HQPA 2HZFA 4DSQA 3ME7A 1MD3A 1S3CA 2PERA 4XIHA 2H1DA 2YZUA 1GWCA 1KEBA 2DMMA 3GSSA 2KLXA 3FYGA 3C1RA 1EP7A 1OC9A 5A4UA 3WT2A 4K7OA 1Z6NA 5DBQA 2A2RA 4BWSA 5ENUA 2OKAA 4IP6A 4WBRD 4MCUA 5IMZA 2MBTA 3MSZA 3VWVA 1ZZYA 3SWLA 2IN3A 2ZUPA 2LNSA 1TK8B 3H4KA 1EZKA 5ID2B 1WE0A 3KMOA 1MEKA 4KSOA 3KXOA 4IQ1A 5A4VA 3IA1A 1G7OA 3GIXA 1A0FA 2FHEA 1F37A 2MMNA 1FW1A 5LNKe 2V1MA 3I9V2 4JR4A 1ZYQB 3TRPA 2JZSA 2H6YA 4GTUA 2Z9SA 4JZQA 5E59A 3L4NA 1V58A 3GTUB 2R2JA 1VF2A 3VWUA 2JZRA 4I8BA 1XFLA 4BA7A 4YQVA 2B5YA 2VCQA 5D9XA 3LGCA 4XS6A 3CYNA 3G9BA 4IELA 1GLPA 3KP8A 5D73A 3IC4A 3GUSA 18GSA 2JU5A 3DIEA 1XWBA 1G6YA 3FZAA 3HCZA 1I9DA 4F03A 4KAEA 2VL3A 4F0CA 2H66A 5DCHA 2A4VA 3TDGA 1Z7RA 5DALA 4ZL8A 4I97A 1RQMA 1XW9A 3A2WA 4MH2A 3GKKA 3C73A 3M9KA 2C3QA 3C7MA 2GVPA 1B4QA 2AAWA 1JLWA 5IO2A 1QFNA 4ML6A 4ECIA 1O8WA 2KOKA 1X9SB 2J23A 2GT5A 2M72A 1EV4A 5D93A 2CA8A 3ERWA 1X9MB 1TK5B 2N5FA 2LNTA 5AGYA 4DVCA 1O81A 1QQ2A 1TRWA 3HJPA 1GH2A 1M7TA 1GNEA 4PGTA 1GUKA 3GH9A 1GSQA 3LFLA 3KTBA 5B6MA 4HI7A 3DRNA 3NOFA 4OFTA 1O7UA 2H6XA 2H70A 1HYUA 3TJFA 2KP2A 3KP9A 4BL7A 4K2DA 1AXDA 4MDCA 10GSA 1SYXA 2FNOA 2CT6A 1SU9A 1TRVA 2ZCTA 1XZOA 2H73A 1H75A 2DJJA 2M80A 4IHUA 4MF5A 4YH2A 5IOXA 3TJBA 3GV1A 2DJ3A 3BCIA 3TB2A 2EIRA 2QSIA 3MNGA 1OVNA 4PXOA 3D22A 3AY8A 2GSQA 3CRTA 3DEXA 5D96A 4TR4A 1VF1A 1WIKA 2RM6A 4KH7A 2NPBA 1K0NA 1K0BA 4XTSA 1R5AA 3IAS2 5HFIA 4FYCA 1Q4JA 3EC3A 2QKEA 3DVWA 4L5OA 1V9WA 2YNXA 4K0NA 5F0GA 3HHVA 1T4YA 4HJ2A 4TR1B 2LV3A 2AYTA 2R4VA 1GSYA 4QL9A 1A24A 2RUFA 1ZOFA 2HXKA 2YPMA 3EU4A 1WPIA 1KBNA 5D8IA 2L6CA 1X5EA 4IQAA 4DSSB 2PUKC 2V6OA 3ERGA 3C1SA 1TJDA 4PNGA 5JWQB 2GQMA 3ZITA 3MDKA 2YOIA 3CSIA 2F9SA 1A0RP 2VL9A 1K3LA 4MP4A 3F4SA 3A2VA 2H0GA 3FHKA 4QQ7A 3CBUA 2HLSA 4HS1A 3VLNA 3TKSC 3E3EA 5CO3A 4V1Ag 1U6TA 2YWNA 3L9SA 2CQ9A 3FR9A 2FWHA 2P0GA 2DJKA 3PINA 3BD2A 2GSRA 4I5QA 4TKYA 4BVXA 4ZBBA 1A8YA 3APSA 3GKXA 1LU4A 4MABA 1GUHA 1GP1A 2B7KA 1FG4A 4MZCA 4E8HA 4HDEA 2GT6A 3I69A 2XHFA 1SK1A 3BCKA 1XWAA 3F3RA 3L9VA 2YZHA 1ERTA 2N5AA 3GX8A 3HA9A 1J08A 2HI7A 3US3A 1QXHA 4HZ4A 1OC3A 2WDUA 2PVQA 2GLRA 3F4RA 6GSXA 3EMXA 2GZZA 2HRFA 5HFKA 2OA7A 1SK0A 3TJJA 5ECHB 4V1Ap 4OO4A 1CQHA 4GLTA 5EVOA 2DMLA 4ULXA 2G0FA 2YJ7A 2CV4A 3GURA 2NTOA 4IGJA 3HJMA 4MZWA 4XRAA 1PSQA 2R3XA 1AQXA 1MDIA 2VM2A 1ON4A 1AW9A 6GSTA 2OADA 4NHWA 4AJ6A 3GX0A 3GKNA 5AN1A 4Q5NA 3GL5A 4EKZA 1THXA 1BEDA 2GDRA 1PKWA 4GCIA 2B5EA 5B8BA 3HZ4A 4EVMA 3F6DA 3QAGA 2E7PA 4E8EA 3O3TA 1XWCA 1GSUA 14GSA 2LQOA 3D4TA 2EC4A 3ZREA 3KH9A 4Q5RA 1F3BA 5FWGA 4KX4A 4HU9A 2NDOA 3IHQA 2V32A 1XOAA 4K8MA 2DJ2A 4MK3A 4Q5QA 5A4WA 3CSJA 5HR3A 2IPAA 4MJAA 1FB6A 3TKSA 1GSEA 1ABAA 1URMA 3H79A 3CRUA 1TTZA 1QGVA 1OKTA 2HNLA 4DEJA 1JLVA 1S3DA 3U6VA 2WRTA 3FEUA 1MD4A 2AHEA 1EP8A 4HZ2A 2X99A 2OE3A 1SKRB 3FZ5A 5J3RA 2YP6A 3IAM2 2G2QA 3KM6A 2ZNMA 2VLUA 1GNWA 3KJYA 3LEFA 4LMWA 1ZYEA 5G2ZA 2L6DA 5H5SA 1F3AA 3RPNA 1NHOA 2LRTA 3PR8A 3ED3A 4OFMA 5DDLA 3ZLPA 1AC1A 4MZBA 3TRQA 5CREA 3LYKA 2O89A 2OBIA 4K9ZA 2K9FA 2H74A 4J56E 4OO5A 1FOVA 3V1WA 2XPDA 4I6XA 4TXVA 3M1GA 4N10A 4WETA 5KEJA 2B7JA 5ECLB 3RDWA 3EINA 4GSNA 1V57A 2C4JA 3D21A 5CRGA 1JZWA 4WR4A 2C3TA 1K3YA 2H0IA 1G6WA 5IO0A 1OE8A 3SBCA 1N2AA 4JRRA 4IJ3A 3UJ1A 3W8JA 4G9HA 1B9YC 1DUGA 7GSSA 4KB3A 4ISDA 2CZ3A 4GQCA 1IYHA 2GTUA 1XVQA 1Y6EA 3DXBA 1K3OA 4IN0A 1N8JA 1VGLA 5IMCA 1AIUA 6GSUA 1TI3A 3WGXA 2LJKA 3HXSA 3EURA 2JZTA 2HZEB 1SL0B 1ZL9A 2IMKA 4XHMA 3VWXA 4RUVA 5JWOB 5B8AA 4PQHA 2YCDA 5CNWA 2M46A 2GQLA 2V41A 2IFQA 2L57A 1OC8A 1XIYA 5IMDA 2R37A 3EYTA 1XWKA 2MMAA 2PN8A 4TR3A 5C04A 2IMDA 4KUNA 1UA5A 3RBTA 3QAWA 3ZVJA 2H8LA 2OACA 3E0UA 3TJGA 5HR0A 1FB0A 3LXZA 4TXOA 3EE2A 4D73A 3F9UA 2VD1A 4EUYA 1J0FA 3HVXA 1DBYA 1TI1A 1TOFA 1YY7A 1S3AA 2VCXA 1YF1A 4KE3A 5J4UA 1ERUA 3H8QA 5B6NA 2AJQB 4MLYA 3IBHA 4POLA 1XXUA 2WFCA 2ON7A 5INYA 3HVSA 1JZRA 4KGIA 5IMVA 2YJHA 4EXJA 2FD3A 1Z5YE 5ECPB 3DGQA 3RHCA 4EO3A 2VL2C 1BG5A 2K18A 4V2NA 4ZB8A 2RUEA 2B1KA 1XW5A 5D9WA 3TKSE 2H19A 1K0CA 3VI7A 4WF5A 5J5NA 2V2GA 3EVIA 3Q19A 1BX9A 4YQMA 3ZYWA 2L4CA 5FHIA 5GSSA 1U3AA 1SJZA 1PX7A 3VWWA 1X5CA 2DIZA 1YDKA 3F4TA 1TDIA 1EOGA 4FH8A 1SL2B 4NWYA 4IKHA 2HRNA 2LRNA 1ZGNA 2D2ZA 2CX4A 4OCFA 16GSA 5G5EA 1U87A 6GSWA 2PGTA 2DBCA 4EDZA 3MWHA 2VM1A 3UVTA 4MPGA 3A2XA 3GFKA 1DSBA 1W89A 5ECKB 4IW9A 2P5RA 2QC7A 5JCUA 4KCAA 3TKPA 5DAKA 2C3NA 3KD0A 1TU8A 1SD8A 2QGVA 3LXTA 3QAVA 3UMAA 1ZMAA 3P8WA 2XBQA 3TGZA 1M9AA 3LYPA 5L71A 4O32A 2XBIA 1A2MA 4POBA 5ID2A 1VF4A 1T1VA 4XS1A 1A23A 2H71A 3LJRA 4N30A 4ZL9A 4X0XA 1B9XC 5CYYA 1WP0A 2X8HA 1E6BA 1WJKA 2CVKA 2RM5A 2WJUA 4HQZA 4WBJA 2MZCA 4GSTA 2FY6A 3NIVA 4AGSA 2FWFA 5ABRA 3TRXA 3FRCA 3GTUA 2BMXA 3G7JA 3F0IA 5GZZB 4NAXA 4PX1A 2C80A 4WF4A 2VOCA 2VL2A 4TR0A 1PN9A 5F05A 2DIYA 1EGOA 1FO5A 5AIVA 3KMNA 3R2QA 2JSZA 2LJAA 1T3BA 1X0RA 4POMA 1T00A 3ZTLA 5G30A 3D4MA 3MAKA 1K0OA 1AUCA 1H4OA 2P31A 4CDOA 1YJ6A 3ZVJD 3M8NA 1TW9A 2PVOC 5KN0A 2FUG2 4KW6A 2YANA 2PPTA 22GSA 4JBBA 3GN3A 1O8XA 4HU7A 4NMUA 2LJRA 20GSA 1KNGA 3UOMA 4EDYA 1GUMA 2VCZA 3Q18A 3RHBA 3FK8A 2L59A 4O7HA 4GF0A 4O5RA 4YAPA 3W8SA 1R26A 1YEXA 4L8EA 4XS4B 1TRSA 3WD6A 5HR1A 4V2LA 2J9HA 4NXIA 2H01A 5ELAA 4ECCA 4L0WA 4AF2A 2IMFA 2VCWA 4EL1A 5GAPD 3VPQA 4GSSA 5CAXA 3ZIVA 3GH6A 2R5GA 4Q5FA 4ZBAA 2B1LA 3QDNA 1LJRA 3FR6A 1GTIA 1ML6A 1PMTA 3WGEA 3A5WA 2GSSA 3TKQA 1V98A 1Z7PA 1F6MC 1GTBA 3UAPA 5DQSA 2X8GA 4WR5A 2VO4A 3KZQA 5G31A 2RLIA 3HKRA 1Z9HA 3IRAA 4TW5A 4YQUA 4TOPA 3LQ7A 4N0VA 1K0DA 2IJYA 1NM3A 1QK8A 3Q6OA 1Z3EA 1DE1A 5JWRB 4FIWA 3UL3A 3LSZA 3S9FA 5DVBA 4JEDA 1XBSA 2MYGA 1SKWB 1AAZA 4GWRA 5IIZA 3GRXA 2NBSA 2ES7A 4PQIA 3H93A 5B7CA 4P3YB 1UN2A 4ZB9A 2BTOT 3HY2A 1OC9B 3G7IA 1G0TA 3ME8A 4GQFA 1PL2A 1T8EB 3UBKA 2PBJA 4IBPA 4TR1A 3WGDA 1G7EA 3M9JA 2LSTA 1I5GA 4RI7A 3L9UA 4G10A 4LL4B 3QD9A 1ERVA 1ACVA 1PA3A 2I4AA 1GSFA 3HYPA 4HQSA 1XCCA 3BOAA 2HSYA 3CSHA 3WYWA 1OKDA 4PURA 2GZYA 1YF0A 3UVHA 5C00A 5LD0A 1GSSA 2VCTA 2VCVA 1TP9A 4HJMA 2YWMA 4IJIA 3GNJA 2L4QA 2JADA 3OR5A 4NPBA 2KUCA 3KIJA 5EY6A 5E4WA 4ZIJA 4TN8A 4ECBA 1XVWA 3M3MA 2VUPA 3D0ZA 4MJCA 1TU7A 1QMVA 1WOUA 5CRWA 1Z6MA 5IPGA 5CP1A 5HR2A 4FYBA 1TKDB 1YZXA 2P5QA 3CXGA 3G7YA 4X1UA 2RIIA 1TK0B 1NSWA 1VF3A 3P7XA 3KTLA 11GSA 3TUEA 2DLXA 4PNFA 3IDVA 5IMFA 5DALB 2GSTA 3TOUA 1W4VA 4PUFC 2PWJA 1USBA 3I6AA 4L0UA 8GSSA 3FZ9A 2WGRA 4KDYA 3DD3A 3JCML 4ZXGA 3H1NA 5DJMA 3F63A 1U3IA 1IYIA 2MMOA 3QPMA 5ECOB 2H30A 4KDUA 4X43A 2H72A 1SL1B 2FA8A 1VRSD 5IOWA 2C8UA 1YQ1A 1M2AA 1X9WB 1R5PA 5IQYA 3C71A 2I9HA 4MA9A 4DSRA 1MTCA 12GSA 1EEMA 3EU3A 3ZIJA 3K8NA 1PL1A 2L5LA 4OFNA 4YAVA 1BJXA 5DAKB 4CHSA 2BJXA 1C72A 4ZB6A 1RW1A 1MDKA 5G5FA 3GHAA 1GL8A 2HSHA 4MJBA 1R4WA 2B5XA 2F3MA 6GSYA 3APOA 1EWXA 2LKUA 5AIXA 2REMA 3NZNA 5COHA 17GSA 4BWQA 3VI5A 3DKSA 1SKSB 4EE0A 4POKA 2GQKA 3FY7A 4GXZA 2XPEA 1Q98A 5IPHA 3IOSA 3KGKA 1EGRA 3GKMA 1GTAA 3O6TA 3A3TA 4KCEA 1M0UA 2F8AA 4Z7XA 2F8FA 5JCGA 4ZL7A 1A2JA 5LCZA 4WKWA 2YV7A 3IR4A 1THOA 2TIRA 1JZDA 3N9JA 1M2DA 4J2FA 2C0DA 1UVZA 1SYRA 2I81A 2XC2A 3ZRDA 4FO5A 4RQXA 3IK9A 1M9BA 4WXTA 3EWLA 5DCGA 2DJ0A 3IPZA 1X5DA 5F8BA 4F82A 4LL1B 3EMPA 1MDJA 3ZMKA 5ECIB 5J41A 3BBYA 5IM9A 3Q74A 3UEMA 5HFGA 2OJLA 3FZ4A 1O85A 4K7NA 4MF7A 2AB6A 2X64A 5DQYA 4ILFA 3GSTA 4PQ1A 1UC7A 5ELGA 1YKCA 2DSAA 5D9TA 1O6JA 2KHPA 3APQA 1YKAA 2IIYA 4CW9A 3FKFA 1PX6A 13GSA 2CAIA 5KN1A 4NV2A 1FHEA 4MPFA 2VLVA 4I2UA 3F6FA 3GL3A 1OYJA 1FVJA 2FWEA 3M0FA 2H6ZA 5H5QA 1B8XA 2DC5A 1B48A 1HD2A 3HDCA 5EPFA 2LTKA 2YWOA 4MMMA 4N0ZA 1PGTA 1TXXA 2F51A 2OE0A 1SJ6A 2PMTA 3I43A 4EC0A 1B4PA 3HD5A 2HZEA 2WCIA 1F9MA 2CZ2A 3LG6A 4KNDA 4EF0A 4IVFA 1ZCPA 1M99A 5IMAA 1HQOA 2IWTA 4AJ8A 2K8VA 2AUVA 4O92A 2V6KA 2I1UA 4HOJA 3U5RE 4ML1A 1U88A 2GZPA 1SD9A 2YV9A 5ECNB 2CVBA 1LBKA 1PKZA 2GGTA 4KA0A 2C0GA 4JR6A 3FR3A 3KCMA 4N11A 3DWVA 4ECJA 3RPPA 1SENA 3F3QA 4IS0A 5ECSA 1SK2A 4BVYA 2VLTA 1BAYA 4F2IA 2H1AA 4RQRA 2IMEA 5D9VA 3IXRA 4GRFA 2LRCA 5GAND 2O7KA 1PQNA 3ISOA 3BJ5A 3O76A 3KEBA 1F2EA 2EIOA 1GTUA 2LS5A 4OCEA 5ECRB 1O73A 3UARA 2CAQA 5JCWA 3GA4A 4NHZA 1OAZA 2C0EA 2NVLA 6GSSA 3ZMLA 1BYEA 4BPYA 1PD21 3ERFA 2K6VA 1TRUA 4J57E 3LORA 1HNAA 5H5RA 4MJEA 4WEYA 2R6KA 3HJOA 5DJLA 3E9JB 5J9BA 2WZ9A 2B3SA 2E2GA 4ID0A 3KH7A 2ON5A 4KSMA 2CX3A 3FW2A 3ZFBA 1SJIA 1GRXA 2WB9A 2JL4A 2IMIA 3VPTA 3QFBC 1BQ7A 5F06A 1DE2A 5ECQB 1HNBA 3N5OA 1XWGA 1OE7A 3UBLA 4OD7A 4HUAA 5AISA 1ILOA 5G1LA 4ZILA 3TOTA 4K1FA 4G2EA 1R7HA 5F07A 1XW6A 2A2SA 2HE3A 3CTFA 3PH9A 4KDXA 4MF6A 3L78A 2H1GA 2H76A 3VURA 2OE1A 1FVKA 5GSTA 2JACA 2B6MA 1QUWA 2O8VB 4F0BA 3QR6A 1RK4A 3ZL5A 2LQQA 4H86A 1WRYA 2O87A 1XPVA 2C0FA 4TVEA 4IP1A 3CTGA 1JHBA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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