1TXXA

Active-site variant of e.coli thioredoxin
Total Genus 29

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
29
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
SDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCVWCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
TI1 (1-4)EMPTYS3 (54-59)AH1 (11-16)TIV1 (8-11)TI5 (60-63)S2 (22-28)TI4 (59-62)TI3 (29-32)AH2 (33-49)TII1 (49-52)TIV2 (50-53)S4 (77-82)TIV4 (74-77)AH4 (96-106)S5 (85-91)S1 (5-6)AH3 (65-70)TI2 (16-19)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli
publication title The CXXC motif: crystal structure of an active-site variant of Escherichia coli thioredoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (THIOREDOXIN)
total genus 29
structure length 108
sequence length 108
ec nomenclature ec 1.8.-.-:
pdb deposition date 1999-04-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1txxA00
3G7YA 2OKAA 4BVXA 1Q4JA 3BCIA 5IIZA 5HR0A 1G7EA 3C1SA 4AGSA 4DEJA 2MMZA 5IMFA 3SBCA 3APQA 1MDIA 3U5RE 3TCOA 4HZ4A 2IMEA 5IM9A 2TIRA 2LQQA 3O76A 4RUVA 2O87A 2VLTA 3GN3A 3ERWA 1GSEA 3DYRA 1O81A 1OC9B 3KXOA 2HLSA 2B7KA 1PX7A 2LRNA 3QFBC 3CSHA 2I81A 2L6DA 2B6MA 3F9UA 1Z7RA 2E7PA 2K18A 4D73A 1GSQA 1W4VA 2CAIA 2GGTA 3CTFA 5JCUA 3FK8A 3NOFA 1QMVA 5HFGA 3H93A 4MCUA 4YQMA 4LL1B 1I9DA 2L4CA 1ILOA 1MTCA 3FR3A 1WMJA 4NMUA 2OADA 5CAXA 3LSZA 2YJHA 5J4UA 1SU9A 1XVQA 4V1Ap 1XOAA 2GQLA 4EO3A 2L5LA 1GSFA 2LJRA 1K3YA 1OC3A 2DMLA 1ACVA 1K0BA 3DGQA 1A8LA 2HZEA 1GL8A 1WWJA 5F05A 2B1LA 5DJMA 3D4MA 1B8XA 3CYNA 2IPAA 4NHWA 2B3SA 4EVMA 2WS2A 3F3QA 2JL4A 1GSSA 1M0UA 5ECNB 1MD3A 2RLIA 2YPMA 5C00A 2WULA 3UVTA 1SL1B 3GURA 2DJ1A 1GUMA 5IOXA 3LXZA 4EE0A 2ZUPA 2XPDA 5EL8A 1DBYA 3VLNA 3EWLA 5CO3A 3TKRA 2N5FA 3GRXA 3IAS2 3RHCA 2PWJA 4AF2A 4IHUA 2KHPA 4IELA 3GV1A 2B1KA 3NZNA 3L0HA 5HR2A 3A2VA 2I1UA 1GTBA 2H8LA 4G10A 5GAND 4MPFA 2LQOA 3EVIA 4DSQA 5DAKA 4TXVA 2CT6A 1TKDB 4JEDA 3N9JA 5DQSA 1ST9A 3TJFA 4MJEA 3CMIA 1S3AA 3L9SA 1GUHA 4CW9A 3QPMA 1GH2A 4OFTA 4K0NA 6GSTA 2H75A 5A4WA 3CSJA 5LCZA 5JCGA 1R5PA 3FR6A 2VOCA 2A2RA 1QK8A 1Z3EA 1GUKA 4KW6A 5CRWA 20GSA 4HI7A 5HFIA 4QL7A 5ECSA 5G5FA 3GMFA 2FGXA 4PNGA 1ON4A 2E2MA 4HQSA 5DJLA 1A0FA 3M9KA 1NHOA 3HVXA 2H74A 1HNBA 3KH7A 2HSYA 4OO4A 4WR4A 2JZSA 3C1RA 1Z7PA 4MK3A 2XPEA 4IBPA 3M8NA 1ZOFA 2GLRA 3D6IA 1ZZYA 3FZ9A 4FIWA 2C1YA 3CRUA 1T00A 4OWYA 5LNKe 2H01A 3ERGA 2PVOC 2VCXA 1YEPA 4EKZA 1XCCA 1MDKA 1O6JA 2HRNA 4L5OA 2FY6A 3WT1A 4MZWA 4WBRD 5JCWA 3WGXA 4NWYA 4KUNA 4IQ1A 4GXZA 4EDZA 2H0GA 2GT5A 1H75A 2J9HA 5KN1A 4WEYA 4TR0A 2VD0A 4MH2A 5CP1A 1FVKA 2TRXA 1T4ZA 2V6KA 2OACA 5E59A 4MZBA 1T1VA 2DLXA 1OKTA 4LLRA 4XCSA 1XFLA 2KP1A 1KEBA 2ALBA 4PUFC 4ECBA 4HJ2A 5COHA 4KGIA 1TRUA 2VL2A 2CX4A 3EYTA 1OKDA 3DRNA 2XBIA 3DD3A 2DBCA 5D9XA 3WGEA 5JWOB 2JZTA 2V2GA 5H5QA 2VM2A 2V41A 4F82A 5DDLA 4GLTA 3TB2A 1XPVA 5L71A 1SL0B 1EZKA 1A8YA 3IBHA 3TRXA 1KNGA 4N0ZA 1AAZA 2LNSA 3UEMA 2CAQA 3HYPA 2H30A 1V40A 1EOGA 1R4WA 4FH8A 1PD21 3TKQA 1PQNA 1WRYA 2XBQA 1YKAA 4F0BA 3TUEA 1SK1A 2VCVA 3MAKA 4XS4A 3DEXA 3UMAA 3EMXA 2PPTA 4IJIA 5F06A 4PUAA 1VF2A 1LU4A 3H4KA 5E4WA 5D93A 4HU7A 3V1WA 4ZBDA 1QQ2A 3CTGA 3VPQA 4XRDA 3ME7A 1M9AA 3DVWA 5G1LA 1ZCPA 3G7IA 3KTBA 3I43A 4BVYA 1J08A 3W8SA 1HD2A 4OFNA 5EVOA 4KX4A 2VCWA 1RQMA 2E0QA 2WZ9A 3RHBA 1WE0A 3U6VA 5FT3A 1HNCA 2DIZA 4F9ZA 2JSYA 3BD2A 3LGCA 19GSA 1A0RP 4WR5A 1YDKA 1BQ7A 4E8EA 1DE2A 3W6GA 2C80A 2J23A 1G7OA 5CYYA 4PXOA 2MMNA 4ECIA 1NHYA 3ZVJD 2IMFA 3HJPA 5DALA 4KA0A 4TR4A 4IP6A 1HNAA 1SK0A 4NV5A 18GSA 2VCTA 4OMVA 2DIYA 4WKWA 1J0FA 2GQKA 4KDXA 1SJ6A 3K8NA 1URMA 2YZUA 3HVVA 2H6XA 2NBSA 2FWFA 1GLQA 5G31A 1M99A 4J2FA 4DVCA 3P90A 3QAWA 4K7OA 5DVBA 2GZYA 3ZYWA 3IR4A 4HU9A 4LL4B 2VCZA 3LORA 2DMMA 4AJ7A 2VLUA 5CNWA 2R6KA 4EF0A 2KOKA 2FWEA 5D9VA 3DXBA 2BTOT 3APSA 2IWTA 1SJZA 4G9HA 4K7NA 3P7XA 1DUGA 4L0WA 2LJKA 2A2SA 3NIVA 1YQ1A 3IPZA 1U3AA 2IMDA 2L5OA 2FNOA 2NVLA 2B5EA 3ZL5A 3EINA 5IO0A 1AXDA 1F3BA 10GSA 1MDJA 4XIHA 4POMA 4MJAA 4ZBAA 2OE1A 1FHEA 1XWGA 1USBA 1SENA 1THXA 2GT6A 2WJUA 2OJLA 2H1DA 4JBBA 1X9MB 3PR8A 4MDCA 3KMNA 1TU8A 2K9FA 3EURA 1M2BA 2WFCA 1GNEA 4EUYA 1EWXA 3FZ4A 3LFLA 4RQRA 3JCML 1XWKA 1TU7A 17GSA 4JRRA 1JLVA 1K3OA 2H19A 4EXJA 1NM3A 4Z7XA 4F03A 3TKSA 3HA9A 2VL2C 2YZHA 4GQCA 1X9WB 3MNGA 5D73A 5B7CA 3F4RA 2XC2A 3FEUA 5IMVA 4KE3A 1FG4A 1YEXA 2X99A 5J5NA 1T4YA 4LMWA 2HZFA 2ON7A 1OVNA 3IK7A 3HJMA 4WETA 5ECOB 4E8HA 1ML6A 2OE0A 1F37A 4I97A 4DSSB 2LRCA 4L0UA 4NAXA 3KEBA 1XBSA 4JR6A 3D4TA 3FR9A 4OCFA 1VGLA 5DCGA 2WRTA 3J7Yb 4IJ3A 3RAZA 5HR1A 5IPHA 2AAWA 2WGRA 4ZL9A 3TKPA 3GNJA 1BEDA 2RIIA 5KN2A 2AJQB 4IP1A 4O32A 1GSYA 3L9VA 3VI7A 3GTUA 3RBTA 1FOVA 5ELGA 1V57A 2DJKA 3M0FA 1YJ6A 4NXIA 4HOJA 2BMXA 1B9XC 1M2AA 3ZITA 1TRVA 3KMOA 3VPTA 4WXTA 2H72A 3HCZA 1Z6NA 2Z9SA 3HKRA 5JWQB 3TJGA 3US3A 1K0DA 2FUG2 5IO2A 1AC1A 2H0HA 1Z5YE 4ISDA 1ZGNA 1BG5A 1XW5A 4MJCA 4LA1A 5DBQA 3GH9A 3H79A 4GRFA 3S9FA 3F3RA 3GX8A 4MF5A 3UAPA 3TJKA 4KDYA 1BYEA 2L57A 3F4TA 4WF4A 5IMCA 12GSA 4TR1B 1U88A 3TRPA 5FHIA 1TDIA 1AIUA 1LBKA 3D0ZA 1ZYQB 4MF6A 3CBUA 1UVZA 2BJXA 2GSSA 1OE8A 4KCAA 1EV9A 2CZ2A 5D8IA 2H6YA 2IN3A 1G6WA 2AV4A 5AIXA 3I69A 3D22A 1PN9A 1DSBA 5EPFA 3UJ1A 3Q74A 1OE7A 2YWIA 3TDGA 1SKRB 3PINA 3E0UA 4BPYA 3TRQA 3IAM2 1EEMA 1NW2A 1SK2A 1GNWA 4JE1A 3QAGA 1OC9A 4KNDA 4HZ2A 4O92A 2H1GA 2CVKA 3LWAA 1WPIA 3LG6A 3F0IA 3F6FA 4GSSA 1Z9HA 1TTZA 1HYUA 3KTLA 4TKYA 2NTOA 3GL3A 2FHEA 4V2LA 1T7PB 4TXOB 1ABAA 2YN1A 2C4JA 3HD5A 1O73A 4MPGA 2I3YA 1JZWA 1R7HA 1YY7A 2MBSA 1AW9A 2VIMA 5B6MA 3BBYA 3FY7A 3FHKA 3MSZA 4I8BA 4ZIJA 1WP0A 2PGTA 3ZFBA 1Z6MA 2LSTA 1JHBA 4AJ8A 5D9WA 4MABA 1GSDA 4ID0A 4XS6A 5CRGA 5H5RA 3VURA 1PL2A 1BX9A 2AHEA 1FO5A 5F8BA 5B8BA 5ID2B 1EOHA 1ERUA 4I6XA 5ECIB 1THOA 2CX3A 3C71A 4PQIA 3TKSC 1K0OA 1UC7A 3EU3A 4O5RA 4MMMA 2KP2A 1YF1A 3C73A 1O8WA 2IJYA 1JZDA 2O7KA 4EDYA 3P2AA 11GSA 2YV7A 4L5LA 4GF0A 1TOFA 4TN8A 1WIKA 3F63A 3TJJA 4CHSA 2IIYA 2B5YA 1CQHA 2KUCA 2PERA 4TR1A 1SKSB 4N10A 4MA9A 3TOUA 4ZBBA 1CQGA 4GSTA 2R37A 4ZL7A 3KJYA 1B4QA 4KSOA 2MMOA 1KBNA 3J7Yk 4WBJA 4BA7A 14GSA 4X43A 4POBA 5IMAA 3FZAA 2R3XA 4ZB8A 1FB6A 4TR3A 2HYXA 2AUVA 3EU4A 3CSIA 2GSQA 4FYUA 13GSA 5B6NA 7GSSA 3KD0A 3IK9A 4JZQA 2HE3A 4K7IA 2H71A 1K0MA 2HXKA 2HSHA 2P5RA 1PX6A 5AGYA 1O7UA 3CRTA 2FWHA 2O89A 1PKWA 3VWWA 1W89A 2NDOA 2YJ7A 4PQ1A 3A2WA 3GSSA 2H1AA 1GTUA 3PGTA 1VF3A 3I9V2 1OC8A 2MYGA 4FYBA 4TW5A 3GFKA 5J9CA 3GYKA 4IW9A 2C0GA 5ECPB 5LD0A 4JR4A 3GKNA 3R2QA 4PX1A 1XVWA 2FWGA 4MF7A 4PQHA 1X9SB 3E9JB 1XIYA 3LQ7A 4PURA 2C8UA 4X0XA 1F6MC 4OCEA 3ZRDA 3EMPA 4CDOA 4FYCA 3L9UA 1XWCA 1WJKA 5G2ZA 4NPBA 2EC4A 3KP9A 4AJ6A 5G30A 2VM1A 2LUSA 2K8VA 4ML6A 1SYRA 3LXTA 5A5KA 4HDEA 5CREA 3GUSA 5HQPA 3Q18A 3BOAA 4HEA2 2LRTA 2LKUA 4KAEA 4KB3A 1B48A 3D5JA 2L4QA 1EGOA 2GZPA 2M72A 4X1UA 1ZL9A 3LYPA 1FW1A 3IV4A 3IE3A 2F3MA 3WT2A 1QXHA 2R2JA 2FLSA 1VF4A 3ZZXA 1X0RA 4MP4A 1PSQA 1F2EA 3QAVA 3ZIVA 2H0IA 2CQ9A 4D73B 2C0DA 8GSSA 4BWSA 1GTAA 2K8SA 2H76A 4ECJA 3WD6A 1EEJA 4TRXA 4F2IA 3Q6OA 4ACSA 2HFDA 3QOUA 2O8VB 3F6DA 3TGZA 1QUWA 2C0EA 5G1KA 3QR6A 2QC7A 1N8JA 2V32A 4QQ7A 2RM6A 2VO4A 4GTUA 3HVSA 1HQOA 1XW9A 2EIOA 3BJ5A 3IXRA 1TI3A 1XWBA 1M2DA 4POKA 3KP8A 4OO5A 5ELAA 2E2GA 3QCPA 3ZFLA 5IPGA 1F9MA 2JACA 3F8UA 1F3AA 2HZEB 4K6XA 4KDUA 1X5EA 4K2DA 1AQXA 5ECMB 1XOBA 5JWRB 6GSVA 3IRAA 3WYWA 1T3BA 5KN3A 1XWAA 3UVHA 1I5GA 4EL1A 2REMA 3ZIJA 3GKKA 1V98A 2X64A 2GVPA 3CXGA 4I5QA 1WOUA 1GULA 2LNTA 1SKWB 3E3EA 2F9SA 3C7MA 2OBKA 1IYHA 3WGDA 2YWNA 3QFAC 2WDUA 1TRSA 3AY8A 3P8WA 2G2QA 1YZXA 4RI6A 5A4VA 4YAVA 3A2XA 2GQMA 2G0FA 3KH9A 3LEFA 1TXXA 2DJ2A 4NHZA 3HJOA 1EP7A 1SYXA 3TKSE 1M7TA 2YANA 4BWQA 2WCIA 3GKMA 4YAPA 5DAKB 4RQXA 2IMIA 1VF1A 2XHFA 1DE1A 2F8FA 4MJBA 1GLPA 3ZTLA 3GKXA 2H66A 4YQUA 3GSTA 5D96A 1TP9A 5B8AA 2VD1A 2F8AA 3I6AA 1BAYA 2GSRA 1TK8B 3ERFA 4Q5RA 1A2MA 3RDWA 2LJAA 1G6YA 3M3MA 4ECCA 5AISA 3GIXA 4HS1A 1QGVA 1UN2A 1AQWA 4I2TA 2CVDA 3A3TA 1H4OA 1TK0B 2HT9A 3HHVA 3KCMA 3VI5A 1EP8A 4IS0A 4J56E 2DJ3A 5ECHB 2C3NA 3H8QA 2GTUA 5EY6A 1YKCA 1RW1A 5KN0A 5C04A 3KGKA 2LTKA 1TI1A 1RK4A 3QD9A 16GSA 1Q98A 1Y25A 5GZZB 2ZCTA 4OFMA 2NPBA 2TRCP 4EC0A 3L78A 5HFKA 5INYA 2LV3A 4ZILA 4V2MA 2VL3A 1U87A 3UL3A 1VRSD 2KLXA 5AN1A 5ECKB 4POLA 2PMTA 2P31A 3IA1A 2I9HA 2H6ZA 4PGTA 5HR3A 4K8MA 3G7JA 5CRDA 1V9WA 6GSWA 5F0GA 6GSUA 3ZMKA 1GTIA 4JU5A 1FB0A 2RUFA 3MWHA 4J57E 3UIWA 3M1GA 2AYTA 2RUEA 3QDNA 2P5QA 2M80A 2VLVA 3D21A 2QGVA 1YF0A 4K9ZA 1X5DA 1C72A 3IHQA 2N5AA 4DSSA 1OYJA 3OR5A 1XZOA 3G9BA 4XS1A 3EC3A 1SD9A 3SWLA 3UBKA 4Q5NA 3RPPA 1U3IA 4N30A 4GQFA 22GSA 2GZZA 2IMKA 2O85A 3GL5A 4YQVA 5D9TA 3VWXA 1OAZA 4HUAA 3A5WA 4XS4B 1A24A 2HRFA 3HDCA 5IMDA 2FCHA 1AUCA 5ECRB 1U6TA 3GX0A 4G19A 2H73A 2C0FA 1TK5B 4I2UA 2JZRA 2FA8A 3ZVJA 1ERWA 2FA4A 2LS5A 5F07A 5ECQB 1UA5A 2EIQA 3RPNA 2OBIA 1SD8A 2R4VA 9GSSA 2EIRA 2DJ0A 2ZNMA 4MLYA 1EV4A 2PUKC 3O3TA 3FW2A 1MEKA 2FD3A 4Q5FA 2GSTA 4Q5QA 2DJJA 1ZYEA 1J9BA 1ERVA 1G0TA 2YP6A 3KZQA 2HI7A 1B4PA 1QFNA 3ZMLA 3VWUA 1KTEA 1S3CA 2PBJA 4K0GA 1E6BA 2QKEA 4YH2A 3PH9A 3DIEA 6GSYA 2CV4A 5AIVA 1SJIA 1FVJA 3LJRA 2MMAA 3FZ5A 4ILFA 3ME8A 4TVEA 3UARA 1XXUA 2JSZA 2IL3A 5DALB 1O85A 4ZXGA 3HXSA 2PVQA 5G5EA 1SL2B 3MDKA 2YV9A 2AB6A 2CA8A 4QL9A 2YWMA 1PRXA 4V1Ag 3GH6A 4H86A 3ZLPA 4GWRA 1T8EB 1TJDA 1Y6EA 2C3QA 2K6VA 3GA4A 5DCHA 4N11A 2X8HA 4IN0A 2CVBA 1O8XA 2IFQB 4HQZA 2D2ZA 4ZL8A 3LYKA 3DVXA 1R5AA 4OD7A 1TW9A 4ZB6A 1K0CA 2DC5A 4K1FA 3HY2A 2YCDA 1V58A 1JZRA 3ED3A 2DSAA 1GP1A 4XRAA 2YOIA 1JZOA 5ABRA 1JFUA 2YNXA 3N5OA 1X5CA 4P3YB 4IKHA 1PMTA 4KH7A 3FRCA 5GAPD 4LMVA 5ENUA 5H5SA 2HNLA 1V2AA 1N2AA 2B5XA 4ULXA 2CZ3A 1PA3A 3IDVA 1PGTA 4TXOA 1PL1A 1E2YA 1NSWA 3TJBA 3FKFA 1K0NA 3IC4A 3UBLA 5A4UA 1ZMAA 4F0CA 2B7JA 4PNFA 5DQYA 3DWVA 1JLWA 3IOSA 1ERTA 5J3RA 1FAAA 5IOWA 2P0GA 2L59A 2LEGA 3QMXA 5IQYA 3M9JA 3C8EA 2H70A 4V2NA 4IQAA 2RM5A 4NV2A 4G2EA 2I4AA 2WB9A 2GDRA 1BJXA 2OA7A 3EE2A 5J41A 5J9BA 2PU9C 5ID2A 3APOA 2PN8A 1EGRA 6GSSA 3FYGA 4FO5A 4DSRA 2JADA 2VCQA 3GHAA 1TRWA 2YWOA 2MZCA 3BCKA 2ES7A 1XW6A 4TOPA 1LJRA 3H1NA 2L6CA 3HZ4A 1M9BA 1PKZA 2OE3A 4KSMA 3HZ8A 4WF5A 2C3TA 3KIJA 4XHMA 3VK9A 4ZB9A 4IVFA 5GSSA 4ML1A 4HJMA 1A2JA 2F51A 2V6OA 4GCIA 3Q19A 2R5GA 2VAFA 2H1BA 1GRXA 4RI7A 5ECLB 3DKSA 2ON5A 2VUPA 2X8GA 6GSXA 2IFQA 3TOTA 1R26A 2JU5A 5FWGA 1S3DA 3GTUB 3ISOA 2X8CA 4O7HA 5IMZA 3KM6A 3UOMA 3VWVA 2N5BA 1K0AA 2M46A 4MZCA 3VFIA 2A4VA 2GS3A 4L8EA 1GSUA 2V1MA 1AQVA 4MH3A 1MD4A 5CRHA 1A2LA 1B9YC 2MBTA 2VL9A 3W8JA 3DMLA 3F4SA 4IGJA 3ZREA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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