1W89A

Structure of the reduced form of human thioredoxin 2
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
110
structure length
110
Chain Sequence
HGSTTFNIQDGPDFQDRVVNSETPVVVDFHAQWCGPCKILGPRLEKMVAKQHGKVVMAKVDIDDHTDLAIEYEVSAVPTVLAMKNGDVVDKFVGIKDEDQLEAFLKKLIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of Oxidized and Reduced Forms of Human Mitochondrial Thioredoxin 2.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN
molecule tags Electron transport
source organism Homo sapiens
total genus 33
structure length 110
sequence length 110
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-09-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1w89A00
1W89A 4BWQA 2VO4A 2AHEA 5IMCA 4XRAA 4RQRA 2WDUA 4TR1A 4MJEA 3IA1A 2RM5A 1XPVA 1XWCA 5IMFA 3ERGA 3A2VA 3BD2A 4ECBA 3DRNA 2XPDA 1AQWA 1Y25A 3WT1A 4EDYA 1A23A 2LRNA 3DIEA 1SU9A 2VM2A 1YJ6A 2L6CA 3IRAA 3QFBC 4N30A 4NHWA 1SK2A 2J9HA 2O87A 2VLUA 4POMA 4JZQA 4TR3A 3KD0A 3KTBA 2LJRA 1EP7A 5A5KA 1AIUA 3R2QA 4MJCA 3WGDA 3F6DA 3KH7A 4EL1A 14GSA 4LL4B 1SKSB 2H1DA 2HZFA 1GTIA 4ECIA 3F0IA 4POKA 4DSSA 5ECMB 5DBQA 1Q4JA 1QUWA 2VCWA 1T1VA 1DE2A 4MPGA 4O5RA 2VOCA 1SK1A 3IOSA 5H5RA 3HD5A 3KH9A 3TGZA 4WXTA 1SJZA 3H79A 4IQAA 3GA4A 3KCMA 2C3QA 1NW2A 3D4TA 3VWXA 2FCHA 1Z7PA 3GURA 2DJKA 1OC8A 1TK0B 2LJKA 1FHEA 4PNFA 1B9XC 4PQHA 1CQHA 4JRRA 3CMIA 1T00A 3EE2A 3ZIVA 1XWAA 5J4UA 2MBSA 2B5EA 3Q6OA 3TDGA 1SENA 5G5EA 5D93A 2EIOA 4HQZA 2VCXA 4IHUA 1C72A 4ID0A 1BX9A 1FG4A 1GUHA 1Z6MA 3EURA 1RW1A 4YAPA 5KN3A 5AGYA 8GSSA 1GSQA 16GSA 2RIIA 5IM9A 4DSQA 2VCTA 1ERWA 2E7PA 2F8FA 2H66A 4ZBDA 2MZCA 4XS6A 3LXTA 1YY7A 2LSTA 3O6TA 3D6IA 3GV1A 1N8JA 2LV3A 1GSUA 2FY6A 3GFKA 1FAAA 3C73A 4KCEA 1R7HA 2B1KA 3P8WA 3RHBA 2WULA 3D5JA 4FO5A 4OD7A 1XW9A 3F4SA 4Q5FA 1O81A 1TRSA 3FZ9A 2DJ0A 2VLTA 3GKKA 1M2BA 1YF0A 5IQYA 3GYKA 3GSTA 2IFQA 2HRNA 2AAWA 2EIRA 5CRGA 3D21A 2C3NA 2WFCA 4OFTA 5CYYA 2L4CA 1NM3A 2GVPA 1TI3A 3O76A 2MMNA 1GNWA 2LUSA 2IJYA 2ZCTA 1G6YA 6GSSA 2YANA 2YJHA 2DIZA 2YJ7A 2CVBA 4ML1A 2F8AA 1OYJA 1M9AA 1V40A 1ML6A 2JSZA 4K0NA 1XWBA 2TRXA 4TXVA 3E9JB 4EKZA 2HZEA 3ZFBA 1GUMA 5AN1A 1TTZA 4JR6A 2K9FA 1JZWA 2H76A 2RUEA 3WT2A 5G30A 4NPBA 2MMAA 2JADA 2F51A 3H93A 3HXSA 1YKCA 2XBIA 1SL0B 1DE1A 3LG6A 2A2RA 1KNGA 1Z5YE 1PL2A 4P3YB 2NPBA 2H01A 1LU4A 1VF1A 4GTUA 4MLYA 5ECHB 2FGXA 5KN1A 1Z7RA 2HFDA 5A4UA 1EWXA 4HQSA 1GNEA 1S3DA 1WIKA 2X8GA 1QMVA 1MTCA 4CDOA 2ZNMA 2V41A 4NWYA 4J57E 3Q19A 1TDIA 2H72A 1R26A 4XS4B 5F8BA 4ISDA 3GX0A 3GRXA 5DDLA 4HJ2A 3FR6A 4X43A 5HR1A 4BL7A 4BVXA 3DGQA 3E0UA 3UARA 4MH2A 5JCUA 3DEXA 1M2DA 2FWFA 5J41A 3OR5A 4EUYA 2PBJA 4MZBA 5ECPB 1AQXA 3GSSA 2DSAA 4TKYA 5DAKA 5DCGA 5HR3A 2IMDA 1WE0A 3UVTA 3HYPA 4CW9A 4MF7A 2JU5A 1Z9HA 4AJ7A 1B9YC 1V9WA 2L57A 3LQ7A 5JWOB 1G7EA 1F6MC 4K2DA 2YNXA 5ID2A 3EYTA 3QAWA 4IW9A 1ABAA 2NVLA 1UN2A 3APOA 1FVKA 3DWVA 1A0FA 1T4YA 3AY8A 2FLSA 1SD8A 4KDXA 2B6MA 4ZIJA 2O89A 3J7Yb 4ECJA 4TN8A 1TOFA 3IXRA 2FA8A 5G5FA 1Z6NA 2B7JA 2M72A 5FHIA 5B8BA 2VAFA 2N5AA 2WB9A 3KZQA 1KBNA 2A2SA 1E2YA 3GIXA 1EOGA 3HHVA 3U6VA 2HI7A 1TKDB 1AQVA 1MDIA 2OADA 4V2NA 5EPFA 2PGTA 4TXOA 2PN8A 1T7PB 4V1Ag 3O3TA 2FWGA 2YN1A 2DMMA 5HR0A 1M2AA 1QFNA 4ZB8A 3F8UA 2YPMA 4HEA2 1PQNA 5IMVA 3H8QA 2RUFA 2IN3A 5ABRA 3GKMA 4MF5A 1XCCA 3F4TA 1THOA 5EVOA 3TRPA 3RAZA 3DXBA 1U88A 3MSZA 3FKFA 3SWLA 3UIWA 4NAXA 2NTOA 1X9MB 3C1SA 2H75A 3M9JA 4G9HA 3IBHA 3L9VA 3ED3A 4KSOA 1JLWA 3DVWA 4DEJA 3WGEA 5CNWA 5LD0A 2H71A 4X0XA 3FR3A 2C4JA 1XFLA 1SK0A 2XPEA 4TW5A 1ZYQB 3GL5A 4MJAA 3M1GA 2PMTA 3GKNA 1HQOA 3QMXA 2EC4A 4K7NA 4DSSB 4WF5A 4HS1A 5A4WA 4HU9A 3VLNA 4KE3A 3ISOA 2P5QA 4I6XA 5G1KA 1CQGA 4KW6A 3LSZA 2P31A 1A2LA 2LQOA 3TCOA 4MPFA 1M0UA 3TJFA 4E8HA 4L0UA 2I81A 2QGVA 2GZZA 1LJRA 5KN2A 1JLVA 5HQPA 1T4ZA 2H73A 3CSJA 2BMXA 5E4WA 1NHOA 5AIXA 3IC4A 1GTBA 1WP0A 2DJ3A 1TU7A 4ILFA 2RM6A 2CZ3A 1WMJA 2YV7A 4GQFA 5ECIB 3RPPA 3UBLA 19GSA 3FZ5A 2C0EA 3FY7A 4I97A 3ZITA 2FNOA 1K3LA 3GUSA 1ERUA 2YWIA 1XW6A 2WJUA 1RK4A 2JZRA 1F3BA 2L5OA 3LYKA 3ZMLA 5J5NA 2B5XA 2K6VA 1JFUA 4TR4A 2IMKA 1SL1B 4O92A 2CV4A 4IELA 3ZMKA 3LEFA 4K9ZA 2ALBA 2YP6A 3ZVJD 1ZZYA 5F06A 4F9ZA 1ZCPA 5IPHA 3UOMA 3FW2A 1XVWA 2KP1A 3RPNA 3M3MA 5H5QA 1EGRA 2A4VA 3F3RA 1A8LA 2N5BA 3IAS2 1USBA 1B4QA 3FZ4A 5ELAA 5DQYA 4Z7XA 2VL9A 2JACA 2C8UA 1O73A 1BYEA 2OA7A 4L5OA 1OAZA 3GTUA 5DJLA 3EC3A 4WR4A 3UJ1A 2VUPA 4K0GA 5CRWA 1XOBA 3HDCA 2ZUPA 2C0GA 1X9SB 1JHBA 1I5GA 3FRCA 2KHPA 6GSWA 2G2QA 4KAEA 1GTAA 1PX7A 1SD9A 4XHMA 1A2JA 4N0ZA 3LGCA 5L71A 3CTFA 2GDRA 4KUNA 1GLQA 1J0FA 5DALA 2JL4A 4MJBA 3FZAA 1OKDA 4MMMA 1OE8A 1YZXA 5C04A 4XIHA 3CYNA 1S3CA 4EE0A 2H1BA 4AF2A 1W4VA 2E0QA 1ST9A 2GLRA 2VD0A 1WJKA 4I2UA 4N11A 4LMWA 2B5YA 3G7IA 5ECRB 1OKTA 1K0CA 4D73B 5HFKA 1K0AA 5EL8A 3ZIJA 2I4AA 2O7KA 4AJ6A 2MMOA 2AYTA 4ZBBA 4ZL7A 1K0NA 3D0ZA 1TI1A 5CP1A 3GX8A 4GSSA 5D9WA 5GAPD 4EXJA 4JR4A 1U3IA 1F3AA 3A2WA 1DBYA 1SKWB 4F0BA 20GSA 3GKXA 1YDKA 4ZILA 1B8XA 4OWYA 3VWWA 2I3YA 3ZTLA 4DVCA 1F9MA 4IS0A 2VIMA 4K7OA 3KMOA 3W8SA 1EZKA 1YEPA 2PVOC 2K8SA 2AUVA 2B7KA 3BCIA 2OBKA 3ZZXA 5DQSA 2DJJA 2VCZA 4ECCA 3IE3A 2LRCA 1TW9A 2FWEA 1TRVA 3F6FA 5D9VA 1X5EA 2M46A 1AXDA 3GMFA 1PKZA 3QOUA 4MP4A 3FEUA 1DSBA 1MEKA 2E2GA 1M9BA 2LTKA 1T8EB 4I5QA 4OFNA 1WWJA 1ERVA 2J23A 2WGRA 5ELGA 1OC9B 2GQKA 2CAQA 2KLXA 5J9CA 4EVMA 3E3EA 3APQA 2B3SA 4L8EA 4K1FA 1GULA 2QSIA 2FHEA 1VRSD 1QQ2A 2GSQA 3NZNA 3J7Yk 4WBJA 4V2MA 3PINA 1GUKA 4JE1A 1EV4A 2P0GA 3HJMA 3ZRDA 1EOHA 5IO2A 1HYUA 5IMZA 2QC7A 1YF1A 3KM6A 3MDKA 3JCML 2L5LA 5EY6A 4WF4A 1Z3EA 4BVYA 2BTOT 1O8XA 1V98A 1RQMA 1QXHA 2H6ZA 1THXA 2V2GA 2XHFA 4LMVA 4NMUA 5ECSA 4MABA 3HVSA 1UA5A 5D8IA 4TOPA 2WCIA 3IR4A 3IV4A 5F05A 5ECKB 2X99A 4ZB9A 2I9HA 3MNGA 4LL1B 2V32A 2YZUA 4YH2A 4FYBA 4JEDA 1V57A 1K0DA 4K8MA 4L0WA 5DVBA 1V2AA 4MH3A 4KDUA 1XVQA 3A5WA 4HI7A 4NV5A 1OVNA 2HT9A 18GSA 3RBTA 1UVZA 2C0FA 2AV4A 4ML6A 3HVVA 4QL9A 1FOVA 3KP8A 1PSQA 4EF0A 1PD21 3H4KA 1X0RA 2JSYA 3M9KA 1KTEA 3BJ5A 2C1YA 2PUKC 1A8YA 3CRUA 1ZGNA 4XRDA 4FIWA 5HFIA 2GS3A 3K8NA 3VWVA 3UL3A 2PWJA 1SJ6A 3S9FA 2RLIA 1AW9A 5F0GA 2IWTA 4GF0A 3VWUA 4WETA 2GGTA 1E6BA 4YQUA 5GSTA 4EO3A 2OE3A 4HDEA 1M99A 1SYRA 3FYGA 4POBA 3DYRA 3IPZA 1ZYEA 3DD3A 4OCFA 3Q74A 2CZ2A 4OMVA 1URMA 3A2XA 5GSSA 2VM1A 2LJAA 2PU9C 2V1MA 3FK8A 2C3TA 3F9UA 3HA9A 2JZSA 1EP8A 3PGTA 4ZXGA 3KIJA 4PNGA 1HNAA 5IIZA 2HSYA 4Q5RA 5D96A 1MD3A 4XTSA 3C8EA 1MD4A 4F82A 2CQ9A 5LCZA 4N0VA 4IP6A 4AJ8A 3MWHA 2PERA 1EGOA 3KP9A 5HFGA 2GSTA 2DLXA 2VLVA 5H5SA 4TR1B 1M7TA 3UEMA 1AUCA 2KOKA 3QAVA 4QQ7A 2TRCP 2M80A 4RQXA 3F4RA 1G6WA 5ECQB 3C71A 3VFIA 1GSEA 4IP1A 3W6GA 1HNBA 3GNJA 3VPTA 2DJ2A 3QFAC 4O32A 1XIYA 3TRXA 4XS4A 1SYXA 4LA1A 1I9DA 2K18A 1XW5A 2H0IA 2VL2A 2ES7A 1ZOFA 3TKPA 3ME8A 2WS2A 4PQ1A 5CAXA 3VI5A 1T3BA 12GSA 3LJRA 5CRDA 2X8HA 3VPQA 4RI7A 3TJJA 2HRFA 5DJMA 5IMDA 1GP1A 2LS5A 5B6MA 2H19A 2CA8A 4GQCA 1O6JA 3BBYA 4HZ2A 3ERFA 4IKHA 3SBCA 3N9JA 4PUFC 3VI7A 3TKSE 5B8AA 2G0FA 4WBRD 2LQQA 4I2TA 2P5RA 4IQ1A 3QPMA 4L5LA 4PQIA 5COHA 5HR2A 4K7IA 2VD1A 3Q18A 4G2EA 1U87A 3TKQA 3P7XA 3UMAA 1BQ7A 2IMIA 5ECLB 5JWRB 4WR5A 2NBSA 1HNCA 3CXGA 4TR0A 1JZDA 1ON4A 3UVHA 2PVQA 2YZHA 3LXZA 5B7CA 4HU7A 5D9TA 3CSIA 4KSMA 1IYHA 3IDVA 4E8EA 3L0HA 2R4VA 2AB6A 4OFMA 4X1UA 1TRWA 2CX4A 5GZZB 2X64A 1H75A 3G7YA 1UC7A 1U6TA 1XXUA 2MBTA 3KMNA 1BJXA 2L59A 1K0MA 3APSA 3KJYA 1JZOA 4TVEA 3TJBA 4V2LA 3G7JA 1R4WA 3UAPA 2I1UA 2YWNA 1GRXA 4GLTA 4IGJA 1VF2A 3QDNA 1EEJA 5IMAA 4G10A 2L6DA 4G19A 2YCDA 1K3YA 4NHZA 4MZCA 1OC3A 5ECOB 4BWSA 3MAKA 2VL2C 2GT5A 1ZL9A 1AC1A 1SJIA 5CREA 2ON7A 3CSHA 1MDJA 5GAND 3LWAA 1VF3A 1NSWA 2VCVA 1XWKA 1GTUA 4O7HA 1TK8B 2IFQB 2TIRA 4MCUA 5FT3A 1N2AA 1TXXA 2CVKA 2GTUA 5CO3A 3DMLA 4HJMA 2GT6A 4XCSA 1BEDA 2F9SA 3WYWA 2PPTA 3GH6A 4XS1A 1B48A 1FB0A 2WRTA 1PA3A 1PX6A 1KEBA 1O8WA 2CT6A 6GSUA 3PR8A 3LFLA 1AAZA 1PKWA 2NDOA 4N10A 2LNTA 2V6KA 3QR6A 4MK3A 1XZOA 4EDZA 2DJ1A 1X5CA 3ZREA 3TUEA 4GCIA 4MA9A 3HJPA 4IJ3A 2K8VA 2HZEB 4GRFA 1S3AA 3KEBA 2V6OA 3ZVJA 3I6AA 3TRQA 1EV9A 1O7UA 3M0FA 3TJGA 3TJKA 4OO4A 1NHYA 4IBPA 3TKSA 3UBKA 1WOUA 4AGSA 1TP9A 2CX3A 2Z9SA 1GSSA 3BOAA 3W8JA 2HSHA 4V1Ap 3QCPA 2H1GA 1PL1A 2C0DA 2H74A 5KEJA 1A2MA 1TJDA 5E59A 1SL2B 2KUCA 2H6XA 3HVXA 1O85A 3TB2A 1B4PA 1J9BA 3IK7A 1GL8A 1K0BA 1ILOA 2BJXA 4TRXA 2FA4A 5CRHA 3D22A 2OE0A 2DBCA 2C80A 2LRTA 1F2EA 1PGTA 4MDCA 2OE1A 4POLA 1VF4A 1GH2A 1WRYA 1K0OA 1YKAA 2MYGA 3KTLA 1F37A 5IO0A 4GSNA 3DVXA 2D2ZA 1VGLA 1DUGA 3CRTA 22GSA 5FWGA 2X8CA 1GSYA 1K3OA 5DAKB 4DSRA 1ZMAA 2LKUA 3N5OA 1R5PA 3C7MA 2REMA 1R5AA 2GSRA 2OKAA 4RI6A 3PH9A 1FB6A 5B6NA 3ZLPA 3TOUA 1TK5B 4ZL9A 3NIVA 5F07A 5ECNB 2R3XA 2HLSA 1U3AA 3WGXA 6GSYA 5C00A 2OACA 3LORA 5ID2B 4J2FA 4FYCA 4ULXA 4CHSA 4KH7A 2H6YA 4F2IA 2CVDA 2GZYA 4LLRA 6GSXA 1A0RP 4F0CA 1J08A 3RDWA 4D73A 4I8BA 5ENUA 4BPYA 2F3MA 4PUAA 3I69A 4YQMA 3EWLA 3US3A 2HNLA 4WKWA 4IN0A 2HYXA 2IMEA 2IL3A 2R6KA 3GL3A 1GSFA 2OJLA 1YQ1A 1IYIA 3GN3A 2AJQB 1FW1A 4TXOB 4PX1A 4KGIA 2WZ9A 4PURA 1Q98A 2YV9A 1YEXA 3TKSC 13GSA 2FUG2 4KCAA 1QK8A 3LYPA 4KX4A 3U5RE 5AIVA 2L4QA 1GSDA 1XBSA 1OE7A 3QD9A 2H0HA 4KDYA 2YWMA 2H8LA 3ZL5A 2VL3A 3IAM2 4BA7A 2DC5A 2XC2A 1JZRA 1PRXA 5G1LA 1XWGA 4MZWA 4Q5QA 2JZTA 5JCWA 3KGKA 3DKSA 1Y6EA 3P2AA 5DCHA 4J56E 4JBBA 4FH8A 5AISA 1OC9A 3C1RA 2CAIA 3A3TA 1GLPA 3VURA 3EU3A 2GQMA 4Q5NA 1LBKA 3HJOA 3BCKA 2B1LA 5IOWA 1G7OA 2MMZA 1GWCA 3H1NA 1QGVA 3D4MA 3ERWA 5JCGA 3L9UA 5D73A 5J3RA 1ERTA 3EU4A 4QL7A 4WEYA 4IVFA 4GXZA 2EIQA 3HKRA 4PGTA 1X5DA 2YWOA 4K6XA 3RHCA 4KA0A 5J9BA 4ZB6A 4YQVA 3QAGA 1BG5A 4ZBAA 11GSA 2O8VB 3HCZA 4JU5A 3FR9A 2FWHA 4RUVA 2KP2A 2LEGA 2IPAA 6GSTA 1SKRB 1FVJA 3F63A 1A24A 3L4NA 4HOJA 3VK9A 3TOTA 4IJIA 3EMPA 2YOIA 1BAYA 2FD3A 2H0GA 1EEMA 1FO5A 10GSA 1TU8A 2E2MA 5G2ZA 4HUAA 5LNKe 4GSTA 4ZL8A 4KNDA 5IOXA 1X9WB 1PN9A 4EC0A 7GSSA 2GSSA 5JWQB 3G9BA 4KB3A 2IMFA 2ON5A 3NOFA 2GZPA 4NV2A 2H30A 2H1AA 4YAVA 3KXOA 4MF6A 3WD6A 4FYUA 2R5GA 2R2JA 3EINA 3ZYWA 1V58A 2IIYA 1WPIA 3L9SA 2HE3A 3GH9A 1MDKA 3GTUB 3F3QA 1ACVA 2GQLA 4GWRA 2R37A 3CBUA 1TRUA 2O85A 2OBIA 3ME7A 3EMXA 3IK9A 1XOAA 4F03A 2LNSA 3M8NA 3P90A 4OO5A 3ZFLA 3L78A 1G0TA 9GSSA 4PXOA 5DALB 3V1WA 2VCQA 2N5FA 5D9XA 5KN0A 1HD2A 4HZ4A 4NXIA 2HXKA 3I9V2 3EVIA 4OCEA 6GSVA 5A4VA 3CTGA 3HZ4A 2H70A 2DIYA 5IPGA 3HY2A 3I43A 2XBQA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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