1WJKA

Solution structure of hypothetical protein c330018d20rik from mus musculus
Total Genus 18
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
18
sequence length
100
structure length
100
Chain Sequence
GSSGSSGNLSASNRALPVLTLFTKAPCPLCDEAKEVLQPYKDRFILQEVDITLPENSTWYERYKFDIPVFHLNGQFLMMHRVNTSKLEKQLRKLSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution structure of hypothetical protein C330018D20Rik from Mus musculus
rcsb
molecule keywords C330018D20rik protein
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Mus musculus
total genus 18
structure length 100
sequence length 100
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05768 DUF836 Glutaredoxin-like domain (DUF836)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1wjkA01
2IFQB 4N0ZA 2FNOA 3BOAA 4KDYA 3C1RA 4MP4A 1HNBA 1RW1A 4ZIJA 4NXIA 1R5PA 1O7UA 4ISDA 20GSA 3FZ9A 4I2TA 4MZWA 5JCUA 4XS4A 1R7HA 2YV9A 1C72A 2IMKA 4LL4B 5C04A 4FYBA 4O7HA 4TKYA 2FY6A 1F2EA 1YKAA 2YANA 1Y25A 1ZL9A 3ZVJD 3TKSC 4KAEA 1QMVA 2H66A 1ZYQB 1BG5A 3L78A 1YEXA 4XRAA 9GSSA 4PQHA 4GWRA 2H70A 3IR4A 2N5FA 2VCZA 2PWJA 1V58A 1SL1B 2TRXA 2VCTA 2VLTA 1GSQA 4ZB8A 2NPBA 2C8UA 3C7MA 5AISA 3IRAA 2F9SA 1EGRA 1GSEA 3M1GA 3ME8A 4ECJA 4KE3A 3LWAA 1GWCA 3F3RA 1WJKA 2GSQA 4NHZA 4IGJA 4CDOA 2CV4A 4K9ZA 4PNGA 2O7KA 1DE2A 1AIUA 4GRFA 3TOUA 4Q5RA 1EEMA 4OFMA 1PQNA 1HNAA 2RUEA 3HXSA 3G7YA 1SYRA 4HDEA 4ZBBA 2CA8A 1AUCA 2GZPA 2R37A 1LBKA 2LTKA 1X0RA 3IV4A 2YWOA 1K0DA 4GSSA 2KP1A 1EP7A 2ES7A 1PD21 3CTFA 4MMMA 4V1Ap 1ACVA 1MDKA 3K8NA 3QOUA 4TR1B 4WKWA 4PQIA 2I4AA 4LMVA 3C8EA 4GF0A 4IVFA 1YF1A 4TXVA 5IOWA 3EURA 1EV4A 5F8BA 1PL1A 1GTBA 4AGSA 1O85A 5ECIB 3CSIA 1GL8A 2LS5A 1USBA 4ZB6A 4HQSA 2O89A 2H19A 3ERFA 2ALBA 3I6AA 3FRCA 2GLRA 2VO4A 4HU7A 4WBJA 1SENA 4ECCA 4HJ2A 3IAM2 1GH2A 3DEXA 1A2LA 1OAZA 2VOCA 1WE0A 4OCEA 5D93A 5ABRA 5HR0A 3H79A 5KEJA 1TRUA 2VD0A 1U3AA 2GT5A 1K3YA 3IE3A 4MZBA 3HHVA 1T1VA 2JSZA 2WS2A 3RPNA 5D9WA 4I5QA 3PGTA 1GSYA 3ZFLA 2TRCP 2ZNMA 1DE1A 1UA5A 4X1UA 1G6WA 3DGQA 1EWXA 2FGXA 2M72A 4IN0A 1NM3A 3FR3A 1O8WA 2A4VA 2V2GA 1XIYA 3WD6A 4MH3A 3UBKA 5F06A 2QC7A 3RHCA 1TW9A 3KIJA 5GAPD 5CO3A 3ZZXA 5AN1A 5JWOB 5LCZA 4J57E 2PVQA 4ID0A 2FUG2 1IYIA 1S3DA 1EOGA 4L0UA 3VWWA 3IK7A 4MF7A 2WFCA 2XBIA 13GSA 1OC8A 2VCVA 3LG6A 1OC9A 4ZXGA 3HCZA 3WT2A 4MH2A 1XFLA 3ZRDA 3VPTA 3ZMKA 4WBRD 3PR8A 4N10A 1G0TA 2PPTA 3HDCA 3FZ4A 2CVKA 2R5GA 3G9BA 3KEBA 3PINA 4Q5NA 1XVQA 2LJAA 3RBTA 4ECBA 5DALB 3GYKA 1JZWA 4KA0A 3L0HA 4QQ7A 4ULXA 4KB3A 1R5AA 2MMOA 1R4WA 5GSTA 1JZOA 2GSSA 1KEBA 1GSDA 2B1KA 2D2ZA 3L9VA 4ACSA 1T7PB 2CVBA 3KGKA 2GDRA 4GCIA 3DVWA 3HVXA 2C1YA 2VUPA 2WRTA 3W8SA 3LGCA 1H4OA 4OFNA 2FA8A 3QFAC 3ERGA 1B9XC 2VD1A 1ILOA 3VPQA 3UL3A 2AHEA 2REMA 2PVOC 3A2WA 2WZ9A 2LRTA 2B3SA 4ILFA 3PH9A 2FCHA 3GUSA 3LXTA 5DVBA 4N30A 3M3MA 1GSUA 1V9WA 2CVDA 3EU3A 1Z7PA 2Z9SA 4GLTA 3NOFA 3SBCA 1XCCA 2DSAA 2H6YA 1G7EA 4N11A 1E6BA 3P7XA 2LSTA 5J5NA 2EIRA 1PL2A 3UOMA 4E8EA 3M8NA 5JWRB 3CSHA 5J9BA 2MBSA 2LQOA 2OE3A 4L5OA 2VLVA 4EXJA 2HI7A 3LJRA 1AQWA 3GRXA 5D96A 4PXOA 2OKAA 4IJ3A 4WEYA 6GSTA 4XHMA 5EPFA 3GX8A 3CXGA 4NV5A 2K8VA 5DJMA 1I5GA 3ZYWA 2H0HA 2EC4A 5L71A 3EWLA 3DXBA 3IHQA 2CX3A 4EE0A 5ID2B 3GTUA 1QK8A 2R2JA 1EGOA 3WGDA 3TOTA 2HZFA 2HZEA 2I1UA 1BEDA 1EEJA 3MWHA 1J9BA 1AQVA 4ZB9A 3ZL5A 5KN3A 5CRHA 5KN2A 4OWYA 3FEUA 4BA7A 2GZZA 2MMAA 5J4UA 2H1GA 4FIWA 3F63A 5D8IA 4IELA 4HS1A 2LJKA 2KOKA 4BWQA 4YAPA 2H8LA 12GSA 3BD2A 4WF5A 3TJFA 3Q18A 3GL3A 2FWHA 5DCGA 2E2GA 5B6MA 2FA4A 1TK5B 3ME7A 1FB0A 2L59A 7GSSA 3UVTA 3L4NA 2B5YA 1SJIA 4EDZA 3ZREA 3HJPA 4JE1A 1PKWA 1FVKA 3LQ7A 4FH8A 2L57A 2PMTA 5ECMB 3GL5A 3C1SA 4MJBA 5DAKA 2JZTA 5DBQA 2DJ2A 2OE1A 5DJLA 3DMLA 3E9JB 1YZXA 2IMEA 2X8GA 3FK8A 3KCMA 2V41A 5ECLB 5HFKA 2LRCA 2GSTA 3G7JA 4TXOB 1Z7RA 4MZCA 2OBKA 4WXTA 1YF0A 1F9MA 1SK2A 1I9DA 10GSA 3KTBA 4ZBDA 3GX0A 1V40A 3L9SA 3IAS2 2C4JA 4E8HA 2FHEA 1HYUA 1ZZYA 2FD3A 2GVPA 2JACA 1J08A 4I8BA 2YZUA 2OE0A 3LYKA 4RUVA 3CRUA 2HYXA 3IOSA 4ZL8A 1U6TA 5J3RA 2HRFA 5A4WA 1LJRA 1ZMAA 3IBHA 2JADA 3EYTA 1QUWA 1AXDA 2RLIA 4FYUA 4F82A 5E4WA 4FYCA 2K9FA 3UEMA 3ERWA 4EO3A 2J23A 4IS0A 1AC1A 3GH9A 5IOXA 1MD3A 3EU4A 2IMIA 3GA4A 1TDIA 3NZNA 4BWSA 2H76A 4K2DA 3KP9A 2GT6A 1MDIA 2AV4A 3D5JA 4TR1A 1TK8B 3E0UA 2CT6A 4AJ6A 4POMA 3ED3A 1GTIA 1QFNA 2IMFA 2LKUA 4CW9A 3BJ5A 1HNCA 3D22A 4YQVA 1SU9A 3U5RE 2O85A 2KP2A 3VWUA 4G19A 3RHBA 1K0CA 2CAIA 1TP9A 2CQ9A 4MJCA 4ML1A 14GSA 1IYHA 4AJ8A 1XOAA 1M2DA 1FHEA 3UVHA 2OJLA 1SYXA 2JL4A 3FY7A 1EOHA 3IDVA 1SL0B 4KCEA 3W6GA 2DJ1A 3P8WA 4PUAA 2IIYA 2C3TA 3FZAA 1JLWA 2IWTA 4K1FA 1K3OA 5CYYA 4PX1A 4F2IA 3KMOA 3GN3A 2FWGA 5G5EA 1JHBA 2H72A 1GTAA 1V2AA 5HFIA 1SJZA 5C00A 5LNKe 1PMTA 1VF2A 2GGTA 1BQ7A 4KNDA 4YQUA 1M9AA 4WETA 3H1NA 1X5DA 1Q4JA 1O81A 1M2AA 3DYRA 3QAWA 1H75A 3KJYA 5ECRB 2MMZA 3CBUA 2C0EA 4LL1B 3U6VA 1EZKA 1GULA 2XBQA 2VCQA 1NHYA 3DWVA 2HRNA 2DIZA 2O87A 4EKZA 3RPPA 2G2QA 1V57A 2H6XA 1EP8A 3M9KA 5AIVA 1Q98A 2VL9A 4V2NA 2VLUA 4WF4A 4EC0A 4OFTA 1OE7A 2IMDA 2RM5A 1OC3A 3W8JA 4KGIA 1J0FA 8GSSA 3IPZA 2MMNA 1T4ZA 3GV1A 1WWJA 3WT1A 3C71A 4D73B 16GSA 2NBSA 4K0NA 1YJ6A 2IL3A 2DMMA 1TRSA 4POLA 4IBPA 3FHKA 1TI1A 2VL2C 5JWQB 5EL8A 1K3LA 1QXHA 1FW1A 2B7JA 4BVXA 2LV3A 4G10A 5DALA 5J9CA 2RIIA 1Z6MA 1PN9A 1TRVA 4G9HA 2DJJA 2NVLA 2H01A 5HR1A 5HR2A 5G30A 4IP6A 5IO0A 2I81A 2C3NA 2K8SA 2PBJA 1K0OA 3QAGA 1T8EB 4K0GA 6GSSA 1GRXA 3MNGA 3QD9A 1SKWB 1XOBA 1FB6A 1TK0B 1N2AA 4RQXA 3NIVA 5ECSA 3DKSA 5A5KA 2GQKA 2HT9A 3ZMLA 4HZ4A 2B6MA 2YPMA 3LEFA 4J2FA 1SL2B 2OBIA 1EV9A 1PSQA 3H4KA 3GKKA 5FHIA 5ECQB 1MDJA 3GSTA 1TKDB 1UVZA 2P0GA 4L0WA 5H5RA 4F0CA 3RAZA 2JZSA 1YKCA 2VCXA 3TJBA 2TIRA 3WYWA 3CRTA 1YQ1A 2ZUPA 19GSA 4YAVA 1Z9HA 1E2YA 2KLXA 2XPEA 2B5XA 2LQQA 2PERA 5ELAA 2KUCA 4QL9A 2H1AA 4YQMA 1SKSB 3UIWA 3QPMA 1OYJA 3APOA 3QMXA 2F8AA 1TXXA 4JRRA 1GLPA 3QCPA 2NDOA 5B8AA 2L4CA 4JEDA 2ON7A 3D21A 4V2LA 4ECIA 3I69A 5F07A 1QGVA 4RI7A 4TN8A 2MBTA 2H71A 2R3XA 4MPGA 1K0BA 2M46A 4XCSA 3WGXA 4L8EA 1FOVA 1Y6EA 1KBNA 2WGRA 1AQXA 1GNEA 3TKSA 3KMNA 1K0AA 4GQFA 4V1Ag 3GSSA 4HJMA 5D9XA 2O8VB 1GNWA 2X8HA 2LUSA 3KTLA 3QDNA 4NWYA 2H73A 3TGZA 4O32A 6GSUA 22GSA 1JZRA 1A2MA 2DJ0A 4MCUA 2HSYA 1NHOA 1XVWA 4PUFC 5EY6A 4DSSB 3F4TA 2HE3A 2E0QA 4LA1A 3VI7A 2LNTA 3HZ8A 1XBSA 2K18A 1GUMA 3N5OA 5FWGA 3DRNA 2H6ZA 4X0XA 2V32A 3DD3A 4KSMA 3UJ1A 2YZHA 3TKQA 1XW6A 1O6JA 5GAND 5H5QA 4LMWA 4BL7A 5GSSA 3VLNA 4BVYA 4FO5A 1K0NA 2H74A 5G1LA 4IP1A 4OMVA 3GMFA 4NAXA 5G31A 1WP0A 4Z7XA 5F05A 2PU9C 5DCHA 4F9ZA 4F0BA 2CZ2A 3VFIA 2BTOT 2PN8A 4KUNA 2PGTA 5G5FA 1ERWA 5COHA 4KDXA 4K8MA 2GQLA 1YY7A 3EMPA 1SD8A 3HYPA 1A8LA 4CHSA 5EVOA 2FWFA 1X5EA 2H0GA 4TXOA 4WR4A 3TRPA 5HR3A 1X5CA 4H86A 5KN0A 2YWMA 2C3QA 1DSBA 3D4TA 2A2RA 1WMJA 2GSRA 4DSRA 4XTSA 1FO5A 3QFBC 3ISOA 2FLSA 4OO4A 1ERTA 1G6YA 4O5RA 3TUEA 4XIHA 2IFQA 3VWVA 4JBBA 4Q5QA 1XWGA 2YNXA 3J7Yb 2NTOA 2YWIA 3EINA 4EDYA 5D73A 2VM1A 5DQSA 1W4VA 3OR5A 1B8XA 3ZITA 6GSWA 2DJ3A 2JU5A 2YCDA 3DVXA 5AIXA 1XW5A 2N5BA 1RK4A 2VIMA 4MLYA 2HLSA 3FR6A 1R26A 2C0GA 4GQCA 2WCIA 3M0FA 2HSHA 3Q74A 1GUKA 3P2AA 4EUYA 2X8CA 5IMAA 3A2VA 4K7OA 4KW6A 3F6FA 4F03A 2M80A 3O3TA 4POBA 3QAVA 1ZYEA 2DJKA 3AY8A 2AUVA 3H93A 1XWKA 1T3BA 2E2MA 2RM6A 2X64A 3D4MA 1JZDA 3LSZA 2MZCA 1OKDA 4HUAA 2B1LA 1SK1A 1TU7A 1THXA 1W89A 1Z5YE 1CQHA 2WULA 4I97A 1VF1A 1F37A 3LXZA 1KNGA 3HA9A 2HNLA 1ZCPA 4K7NA 1X9SB 1GSSA 2DC5A 4KDUA 2HXKA 5ECHB 1Z6NA 2RUFA 3I9V2 2CX4A 1A23A 1YEPA 5A4UA 2C0DA 4KX4A 2KHPA 5ENUA 2QSIA 1Z3EA 1URMA 5DAKB 4MJEA 4QL7A 1GTUA 1XWAA 3CTGA 3DIEA 4MA9A 3LORA 3KXOA 1V98A 3TJGA 3GKMA 2AJQB 2C0FA 3TDGA 4EF0A 1S3AA 5IO2A 1XW9A 1BX9A 5DDLA 4HQZA 2VL3A 2B5EA 2P5RA 1VF4A 2F51A 2F3MA 5HFGA 2J9HA 3EMXA 1TU8A 4RQRA 3FZ5A 4GTUA 5IPGA 2HFDA 2OADA 5JCGA 2P31A 3C73A 2P5QA 2ON5A 3F4RA 2H30A 4AJ7A 2IPAA 2LJRA 5IIZA 2XHFA 4PURA 2OACA 3IA1A 3VK9A 1U88A 4XS4B 3TJKA 1MEKA 1AW9A 3TKRA 5HQPA 4MK3A 5B6NA 2YJHA 4D73A 3APSA 1MD4A 3BBYA 4G2EA 5CRDA 3ZIVA 1M99A 1VRSD 4JR6A 3GIXA 3N9JA 3ZIJA 3GKXA 4I2UA 1XWBA 2VM2A 1ZGNA 3MDKA 4MJAA 4L5LA 1DUGA 3FYGA 3V1WA 4BPYA 2DIYA 3F4SA 3GKNA 4MABA 1ST9A 5D9TA 1DBYA 1XZOA 2GS3A 5CAXA 2VAFA 2WB9A 2YJ7A 2YV7A 3F8UA 3IK9A 1LU4A 2V1MA 1TJDA 3TCOA 4TR3A 2GQMA 5CRWA 3ZTLA 2EIOA 1F6MC 2VCWA 5IMZA 4EVMA 1ERUA 3HY2A 2B7KA 3HKRA 2L4QA 1SKRB 4LLRA 1SK0A 3IC4A 3MSZA 5ECOB 1SD9A 1A24A 2DMLA 2AB6A 2L5OA 2V6KA 3HJMA 1F3BA 1FG4A 3F0IA 1FVJA 1OE8A 1ERVA 2CZ3A 1PX6A 1NW2A 5F0GA 4I6XA 4N0VA 2YWNA 2I9HA 2EIQA 3TB2A 2WJUA 3J7Yk 1TRWA 3KD0A 3WGEA 3F9UA 1UN2A 3GHAA 2XPDA 4HU9A 1B4QA 1M0UA 4ML6A 2GZYA 5IQYA 2R6KA 2OA7A 3M9JA 2N5AA 3FR9A 3ZFBA 1CQGA 3TKPA 1AAZA 5KN1A 3MAKA 11GSA 4OCFA 3S9FA 1OKTA 1WPIA 2K6VA 1NSWA 2DBCA 1N8JA 1PKZA 1GLQA 3KH7A 3R2QA 1PGTA 6GSXA 3VI5A 4JU5A 3UBLA 4P3YB 2FWEA 5LD0A 4NPBA 5ECKB 2YP6A 3VWXA 2L5LA 2L6DA 4V2MA 4WR5A 3LYPA 2LNSA 3O6TA 2BJXA 3I43A 6GSYA 4DSSA 4KSOA 1BAYA 2ZCTA 4RI6A 4JZQA 4YH2A 1RQMA 3P90A 1ML6A 3ZLPA 3UARA 4X43A 3F6DA 2L6CA 18GSA 3GNJA 4TW5A 2H1BA 2H0IA 3KP8A 1PX7A 2A2SA 2V6OA 5DQYA 3GFKA 3UAPA 5IMCA 5ECNB 5ID2A 4IQ1A 1U87A 5CP1A 2CAQA 1BJXA 5CREA 5IMFA 1F3AA 2G0FA 3TJJA 4DEJA 1ABAA 1A8YA 1OC9B 4PQ1A 1WOUA 4NHWA 1T4YA 5G1KA 5JCWA 3FKFA 2AAWA 4OD7A 4ZBAA 4IJIA 4Q5FA 4POKA 1M9BA 5G2ZA 1TTZA 1VF3A 4IQAA 3TRXA 2YN1A 4JR4A 1A0FA 5CNWA 4TVEA 1A0RP 3UMAA 1B9YC 5FT3A 1GSFA 3LFLA 4TRXA 4MDCA 2E7PA 4GSNA 2H75A 2IN3A 1PA3A 3JCML 3SWLA 3HVSA 1PRXA 2GTUA 1GUHA 3A3TA 2QKEA 5D9VA 3BCKA 4J56E 3CYNA 4XRDA 2LRNA 1ON4A 1K0MA 4ZL9A 3F3QA 3ZVJA 4TOPA 3RDWA 5A4VA 4PGTA 3Q6OA 4DVCA 5IMDA 4MF6A 3GH6A 3HZ4A 5GZZB 2XC2A 2LEGA 3FW2A 4IKHA 3Q19A 4HOJA 1WRYA 1S3CA 3BCIA 1XPVA 4MF5A 2C80A 2PUKC 3O76A 4XS6A 4GSTA 2JSYA 4KH7A 3KM6A 1UC7A 1FAAA 3EE2A 3HD5A 2IJYA 4EL1A 5AGYA 3A2XA 2I3YA 3CMIA 4OO5A 1OVNA 4IW9A 4PNFA 3KZQA 3GURA 5ECPB 1QQ2A 4XS1A 2DLXA 1XXUA 4O92A 4GXZA 4KCAA 5INYA 3TKSE 3A5WA 1JLVA 1VGLA 3EC3A 1XWCA 2WDUA 4IHUA 4HZ2A 3G7IA 3KH9A 3VURA 2R4VA 4K7IA 1HD2A 2MYGA 2QGVA 5IM9A 1KTEA 5H5SA 1YDKA 4NV2A 4TR4A 2AYTA 4K6XA 3US3A 3QR6A 17GSA 3TRQA 1TOFA 1T00A 4AF2A 1WIKA 1A2JA 3H8QA 4ZL7A 1M7TA 1ZOFA 2H1DA 1B4PA 1GP1A 2JZRA 3APQA 3GTUB 1M2BA 5E59A 4DSQA 1SJ6A 5B8BA 4MPFA 3L9UA 5IMVA 2HZEB 3E3EA 3IXRA 5CRGA 3D6IA 2VL2A 3EVIA 3HJOA 2YOIA 5IPHA 1X9WB 4TR0A 5ELGA 3CSJA 1MTCA 6GSVA 4NMUA 5B7CA 1B48A 2F8FA 1THOA 2X99A 1U3IA 4ZILA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite