1WMJA

Solution structure of thioredoxin type h from oryza sativa
Total Genus 18
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
18
sequence length
122
structure length
122
Chain Sequence
MAAEEGVVIACHNKDEFDAQMTKAKEAGKVVIIDFTASWCGPCRFIAPVFAEYAKKFPGAVFLKVDVDELKEVAEKYNVEAMPTFLFIKDGAEADKVVGARKDDLQNTIVKHVGATAASASA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution structure of Thioredoxin type h from Oryza sativa
rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Oryza sativa
molecule keywords Thioredoxin H-type
total genus 18
structure length 122
sequence length 122
ec nomenclature ec 1.8.4.8: Phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin).
pdb deposition date 2004-07-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1wmjA01
4GRFA 2IMDA 5CO3A 1QQ2A 1XWKA 3KMOA 2CZ2A 5ECHB 3FYGA 2MZCA 3LQ7A 1ACVA 1V57A 5KN2A 5IPGA 4E8EA 1YQ1A 2JSYA 4MF7A 2TRCP 2L5LA 1TRUA 4OFNA 3A2VA 1GUKA 2NVLA 1TDIA 4ZBBA 1T4ZA 1GSFA 1DBYA 5EL8A 2QGVA 3CRUA 2R6KA 1SKRB 3ZLPA 3FY7A 2LSTA 6GSYA 1A0FA 4GSSA 2NTOA 3UBLA 1LU4A 1YY7A 4AJ7A 1OYJA 3TKPA 1M7TA 2LJKA 2XPDA 2H1BA 4MZBA 4I97A 2L6CA 2YJ7A 4ML1A 1H4OA 5DALB 1QUWA 1S3CA 3TRXA 2V41A 3CTGA 2A2SA 1ERVA 1Z7RA 3DVWA 3TKSC 4J56E 1ZMAA 3ZVJA 1FOVA 4QL7A 1JLVA 1OC9A 2YWNA 5J5NA 1G6WA 2ON5A 2IFQA 4FH8A 1KEBA 2YCDA 4JZQA 3M9KA 3Q18A 4NWYA 4X0XA 1U3AA 3TUEA 4MJCA 1GTAA 1TU8A 1QMVA 5KN0A 3VK9A 1WE0A 4CDOA 4KW6A 4WF5A 2VM1A 1MDKA 3FHKA 2LQOA 3A3TA 3PINA 5ECOB 2C3NA 5ENUA 3IDVA 2PBJA 2HI7A 4HUAA 4OFMA 2V32A 3VWWA 4IGJA 3KXOA 5A4UA 1WWJA 1YEXA 4K2DA 1SJZA 4PQIA 3LGCA 1K3OA 2D2ZA 3H1NA 3GYKA 1TOFA 5AISA 3UBKA 3ZFLA 1S3DA 2C0FA 2VL3A 2VCXA 3HCZA 2OA7A 1XW9A 5B8BA 4IKHA 3O6TA 4MF6A 1YZXA 1XOBA 1GSEA 3QFAC 4HJ2A 4KAEA 1A2LA 1PX6A 19GSA 5ECIB 2PU9C 3D21A 1WIKA 2VLTA 1QGVA 3HJPA 3GRXA 4GXZA 1XWAA 1A8YA 4N11A 4Q5NA 2DSAA 2AV4A 1NSWA 3QAVA 5IMFA 1Q4JA 2XBIA 3IXRA 4NAXA 1M99A 2AYTA 4CHSA 2B1KA 4TR1B 3IR4A 3Q6OA 2LEGA 4WR4A 2X64A 2GSRA 4ID0A 1EV9A 1FG4A 2C1YA 4LLRA 5D9VA 2F51A 1EP8A 3HY2A 2VCQA 1U87A 3UARA 2VCTA 3NOFA 2PUKC 3LEFA 5CRDA 2B6MA 2OJLA 4RQRA 1M0UA 2QKEA 2IN3A 2XHFA 3M8NA 2H6YA 1EP7A 3EURA 3G9BA 3KM6A 2E2GA 3H93A 1EOGA 2LRTA 1K3LA 3A2XA 4K7OA 1S3AA 4GTUA 5LCZA 6GSUA 3FR9A 3H79A 4EDZA 1JZDA 1C72A 2LTKA 2VAFA 1ZYQB 1K0AA 2JZRA 1NHYA 2HT9A 1X9SB 4RUVA 1X9MB 1U6TA 3DYRA 2HZEB 2LRNA 1FB6A 4XCSA 2IIYA 3UOMA 1M2BA 2HRNA 2N5FA 3GMFA 1FVKA 4RQXA 2YZUA 4BA7A 1OE7A 3KP8A 2L6DA 4HZ4A 3QFBC 3EMPA 1IYHA 3GKNA 1J08A 3RHBA 3G7YA 4KH7A 3APSA 1EEJA 3S9FA 1A8LA 5DDLA 2EIQA 2ON7A 5D73A 3BOAA 5HR2A 1K0NA 5D9XA 2YV7A 5ECLB 4K7IA 2JZTA 3CSHA 4QL9A 2H19A 4V1Ap 3BD2A 4TXVA 5J9BA 3Q74A 2FGXA 2LUSA 2FWFA 5GAPD 2WB9A 5DJLA 1BAYA 5H5RA 3EYTA 3MSZA 2GGTA 1GLPA 3KCMA 2DJJA 4F0CA 5GZZB 1ABAA 5JCGA 3KP9A 4L8EA 5ID2B 4ZXGA 4ACSA 1F6MC 1XW5A 4I8BA 1GRXA 4X1UA 5B8AA 3VWXA 4DSQA 4P3YB 3L0HA 2CZ3A 4TOPA 5ABRA 1B4QA 4NMUA 4TVEA 3AY8A 5CYYA 4ECJA 3RBTA 3HDCA 3EINA 4IBPA 1ILOA 1XWGA 5IOXA 2F9SA 2WGRA 4TRXA 4V2LA 3H4KA 1BQ7A 3LXZA 2DC5A 3HHVA 2ALBA 3TOTA 2CX3A 1FAAA 3GUSA 1PL2A 2H0HA 3GHAA 3GURA 3J7Yk 1OKDA 2HSYA 2DJ3A 2PMTA 5EPFA 2XC2A 2XPEA 3ZMLA 3EMXA 1VF1A 4FYUA 2M80A 2X8GA 2P5QA 4KB3A 3A5WA 3U6VA 1G7OA 3F8UA 3TJJA 1Y6EA 3LORA 2VL2A 1B8XA 4WKWA 1A24A 3IK9A 2HZEA 22GSA 2CT6A 1QFNA 5ECMB 4IJIA 3P90A 3QMXA 4GSNA 3ZMKA 1BG5A 1PX7A 4HI7A 4V1Ag 3I69A 1HNAA 1OC8A 3UMAA 3CSJA 5DVBA 3L9SA 4XRDA 2MMNA 5DBQA 1T00A 1GL8A 4EVMA 3W8JA 2YNXA 3LJRA 2GSTA 3VLNA 1WOUA 2ZNMA 4X43A 1GTBA 1XOAA 9GSSA 5D9TA 1PGTA 3F4SA 5AIXA 3D5JA 2WS2A 3VWUA 2FCHA 4JE1A 4BVXA 5CRGA 4D73B 1TK8B 5D93A 1V40A 4MCUA 2H30A 2R4VA 3TGZA 5HFIA 3DXBA 3RPPA 5IO0A 4POMA 3PGTA 4POBA 4LMVA 3KGKA 3VURA 2IJYA 4XIHA 5ID2A 1ML6A 1B4PA 4YQUA 3RHCA 2OKAA 2JSZA 4YAVA 2R3XA 1WJKA 4JU5A 1G7EA 2CAIA 1GWCA 8GSSA 4OO5A 2B5EA 5COHA 1F3AA 1U88A 4IQ1A 4ECBA 3KZQA 1GSSA 1ON4A 5AN1A 3UL3A 1V9WA 1IYIA 3P2AA 4F82A 4ML6A 4TXOB 5CAXA 2OBIA 5G2ZA 2NDOA 2I1UA 3J7Yb 2H76A 3E3EA 1JHBA 1R26A 1SJ6A 3KTLA 1BJXA 3DIEA 4MJEA 3RDWA 4PUFC 4EF0A 1VGLA 1FB0A 4GF0A 4YH2A 1A23A 1YKAA 5HR3A 2GTUA 1TRWA 2C3TA 3US3A 3KEBA 4J2FA 1EZKA 3P7XA 5DCGA 1RW1A 1TTZA 6GSSA 2FLSA 4Q5RA 2R5GA 3TRPA 1HQOA 2IMIA 4KDYA 3NZNA 3E0UA 1THXA 2DMLA 1GH2A 1PRXA 2TRXA 4O92A 2CA8A 5ECKB 3I6AA 2L57A 1ZZYA 2GVPA 2VUPA 2FWHA 3F0IA 1TXXA 1USBA 4CW9A 3N9JA 2PGTA 3CRTA 4ZBDA 6GSVA 5F05A 3ZIJA 4E8HA 5G5EA 1T4YA 2A2RA 2PVOC 5IMDA 4IW9A 1Z3EA 3C8EA 3MAKA 2H75A 1GSUA 5D8IA 1H75A 5GAND 1LJRA 2FA8A 1O81A 2B7JA 2K9FA 4L0UA 4AJ6A 1XWCA 3ZREA 2RLIA 4JR4A 1VF4A 2JL4A 3QCPA 2V1MA 3MDKA 3HKRA 4WBRD 1DUGA 3TB2A 4KX4A 2VD0A 4NV2A 4KDXA 5IQYA 4I6XA 5G1LA 1YJ6A 2EIOA 2H1GA 5F0GA 2HFDA 2GSSA 4G10A 1JFUA 4JRRA 2PERA 4MDCA 1K0DA 2K18A 3CXGA 4MA9A 3C71A 4Q5FA 1FO5A 3HJOA 5L71A 4XHMA 1DSBA 1O85A 5DAKB 3IV4A 3ME7A 5INYA 2IMKA 6GSTA 5CRHA 2I3YA 4EC0A 5CNWA 2GT5A 2VCWA 2VD1A 4JEDA 4GLTA 3NIVA 2VCZA 3QAGA 4I2TA 1JZRA 1YF1A 2RUEA 2IPAA 4MPFA 4DSRA 2C4JA 1X0RA 3UJ1A 3CYNA 3G7JA 5IPHA 2PVQA 3DEXA 3K8NA 4TXOA 1AIUA 4HQSA 2WDUA 3TKSA 1A0RP 2OADA 3UIWA 3GTUB 2H0IA 3TKSE 2GZZA 3L4NA 3ZITA 4MZWA 2VO4A 2OE1A 4TR4A 2CVBA 1NW2A 4IJ3A 3PH9A 2EC4A 1T7PB 3LYPA 2KHPA 3O3TA 1SD9A 3WGXA 1OE8A 2LJAA 1AQWA 3CSIA 1CQHA 4G19A 1SKSB 3E9JB 4ZBAA 3A2WA 1MDIA 1SJIA 5DALA 4KUNA 1XW6A 3VWVA 3F9UA 3VPTA 5JWRB 1KNGA 3FZ9A 2B1LA 2LS5A 1XVWA 1BEDA 3G7IA 3GL5A 4IP1A 2KP1A 1W4VA 2A4VA 1OVNA 1I9DA 4F0BA 4HU7A 4KSOA 4EL1A 2CV4A 4V2NA 2AJQB 2CQ9A 1K3YA 1M9BA 3F63A 4HOJA 1O8WA 5DQYA 2CVKA 3TDGA 1HYUA 4KNDA 1EOHA 4L5LA 2P5RA 1SL1B 1TW9A 3BJ5A 2CVDA 1AXDA 1W89A 2X8CA 4ZILA 1KBNA 5F07A 2DMMA 3GH9A 1T1VA 5IMVA 2E7PA 4MP4A 4ZL7A 3UVHA 4YQMA 4TR3A 4FO5A 4Z7XA 2I81A 1PQNA 3D0ZA 4PUAA 1GSDA 3D4MA 2B5YA 1ERTA 5J3RA 1BX9A 3IHQA 5DCHA 4N30A 1M9AA 2MMOA 3F3QA 3C1RA 3KIJA 5A4WA 4MABA 2REMA 1EWXA 2L5OA 1GUHA 3WYWA 1WPIA 17GSA 1AQVA 1F2EA 2TIRA 1XWBA 2KLXA 2C0DA 4BWSA 2VL9A 3GKMA 3BBYA 4K0NA 1PA3A 4IN0A 2FWGA 4EUYA 3FK8A 2LNTA 4KGIA 2JACA 20GSA 4K7NA 4EO3A 2VOCA 1WRYA 1M2DA 3TJFA 3GTUA 4EE0A 2JZSA 2WFCA 2FD3A 5KEJA 3ZFBA 2YJHA 1FVJA 3VFIA 4FYCA 4TR1A 5D9WA 2H1AA 3DGQA 1Q98A 4TKYA 4BL7A 1F3BA 4O32A 1I5GA 3VPQA 2HNLA 5LD0A 2WULA 1PL1A 3SBCA 2HXKA 4HQZA 4GQFA 2IWTA 2K6VA 2RM6A 2YANA 4OCEA 4EKZA 1ZCPA 3SWLA 4KA0A 4OWYA 5J9CA 2R37A 3GV1A 2V2GA 2N5BA 2GZPA 4XS4B 2YV9A 2HE3A 3FRCA 4OCFA 2X8HA 2DBCA 4I2UA 4GCIA 2ES7A 2K8VA 2H72A 1VF3A 4JR6A 5IO2A 1RQMA 5ELAA 4HZ2A 4IELA 2YOIA 1ZYEA 3EU4A 3UAPA 5G1KA 5ELGA 4J57E 2PN8A 4KCAA 5IMAA 5F06A 4LA1A 4IHUA 4ZB9A 1M2AA 5FT3A 13GSA 4PNGA 3GKKA 2V6OA 2WCIA 4WBJA 3TJBA 1MD4A 1T3BA 2YZHA 4PURA 1T8EB 4MMMA 3ZVJD 4FYBA 4RI6A 2IL3A 2E2MA 4F9ZA 2G2QA 4JBBA 4MH3A 3GA4A 2BMXA 4DSSB 2B7KA 1PMTA 2CX4A 2FUG2 1XZOA 4K8MA 1B48A 2HZFA 5ECQB 2GSQA 4ISDA 4OO4A 1SKWB 2G0FA 4O5RA 2FHEA 1GNEA 1G0TA 3F3RA 3ERFA 1HD2A 1RK4A 1Z6NA 4KE3A 2GT6A 2KOKA 1GSYA 1Z7PA 2VIMA 4G9HA 3R2QA 4KCEA 3HZ8A 2F3MA 2I4AA 3QAWA 1XFLA 2B5XA 2J9HA 2ZUPA 4ZL8A 4DEJA 1EGOA 1WMJA 5C04A 2GQMA 3FZ5A 3PR8A 3UEMA 3C7MA 4LL4B 1F9MA 1XBSA 1CQGA 1ZL9A 3EWLA 1BYEA 2FY6A 4IQAA 1TRSA 2H74A 2DJKA 3IBHA 5FHIA 3H8QA 5AIVA 2BTOT 10GSA 5EY6A 3TKRA 3IC4A 5C00A 1QXHA 1DE1A 3HYPA 3LWAA 1O8XA 5G31A 3LSZA 1PSQA 1R4WA 5JCUA 2MMZA 3BCIA 5H5SA 1YF0A 3CTFA 5IM9A 2GQLA 4N0VA 5EVOA 1AQXA 3TCOA 2O89A 3ZL5A 3WGEA 5KN1A 2L59A 5F8BA 4QQ7A 3D4TA 2VLVA 2C0GA 4YAPA 5IIZA 1PN9A 2OBKA 2DJ0A 4MPGA 3LG6A 1EGRA 2C80A 3FR6A 3QR6A 2KUCA 4ZIJA 2NBSA 5B7CA 2I9HA 2LJRA 3TJGA 2R2JA 4ILFA 1R7HA 1PKWA 2H01A 2FWEA 5G5FA 2AB6A 2OE3A 2WJUA 2PWJA 1GULA 5DQSA 2Z9SA 3FKFA 5CRWA 1FHEA 2H1DA 4NPBA 4HJMA 3IRAA 3GSSA 4F2IA 5KN3A 3ME8A 4PQ1A 4DSSA 1WP0A 1TKDB 3C73A 1TK0B 3Q19A 2AHEA 1HNCA 2C0EA 2HLSA 4NHZA 5DJMA 1AW9A 2IMEA 3HZ4A 3GN3A 2JADA 3RAZA 4GSTA 1SENA 3TRQA 3TJKA 1V58A 1E6BA 4D73A 1Z9HA 4NHWA 4YQVA 1GNWA 1J0FA 4F03A 1B9YC 1R5AA 2DIYA 4ECIA 4MH2A 2NPBA 2N5AA 3IOSA 1X5EA 1G6YA 2EIRA 2FNOA 1LBKA 5B6MA 4DVCA 1UN2A 4RI7A 4AGSA 3IPZA 4ECCA 4V2MA 3EE2A 1SL2B 3M9JA 1ERUA 5IOWA 2LNSA 2B3SA 2DLXA 1JZWA 3ZTLA 3QDNA 5HQPA 2C8UA 2RM5A 3LYKA 5G30A 2H66A 2H70A 3M1GA 5HFKA 1AAZA 4WF4A 3QD9A 1V2AA 1ST9A 1YDKA 2P31A 6GSXA 12GSA 5LNKe 1ZGNA 3EU3A 4HU9A 3BCKA 2H6ZA 4XRAA 1E2YA 2OACA 5ECSA 1QK8A 2IMFA 1TP9A 2HYXA 4G2EA 1TJDA 3HD5A 3IAM2 2C3QA 1PKZA 3APQA 1ZOFA 2O87A 3DWVA 3GH6A 4NV5A 2HRFA 1MEKA 4Q5QA 3IK7A 5CREA 3HXSA 5GSSA 4IP6A 4KDUA 1Z5YE 1GTIA 1TK5B 1O6JA 1A2JA 2GS3A 2DJ2A 2DIZA 4GQCA 5E4WA 3N5OA 1YEPA 3EC3A 3F6DA 1TI1A 5CP1A 1DE2A 1EV4A 5ECPB 3FEUA 3WD6A 1TU7A 3GX0A 1SYXA 4MJBA 2BJXA 4NXIA 3FR3A 2M46A 1TRVA 1NHOA 4MJAA 3CBUA 2LV3A 1K0CA 3MWHA 14GSA 2AUVA 2GLRA 2XBQA 2QSIA 3ED3A 3U5RE 2JU5A 3F4RA 5H5QA 11GSA 4OMVA 2PPTA 1HNBA 1K0MA 3ZZXA 4WEYA 4XS6A 4POLA 4BPYA 2YN1A 2YWIA 3IE3A 5HR0A 2KP2A 3FZ4A 1MD3A 1GLQA 4LL1B 1UA5A 4PGTA 3D6IA 1TI3A 4PNFA 4HS1A 3LFLA 1N2AA 4PX1A 3IAS2 3IA1A 4K0GA 2LKUA 5DAKA 1K0BA 2F8AA 2LQQA 3KD0A 6GSWA 4KSMA 5AGYA 4WXTA 3DMLA 3ISOA 4XS1A 1AUCA 1THOA 16GSA 4XTSA 2RIIA 2DJ1A 2H71A 1XXUA 3DRNA 3GX8A 1GSQA 3KH7A 4IVFA 4O7HA 3ZYWA 4BWQA 1K0OA 2OE0A 1SL0B 2YWOA 5ECRB 5JCWA 1Z6MA 2VL2C 4OFTA 2YP6A 3EVIA 3DVXA 4K1FA 3F6FA 1JZOA 1N8JA 4MZCA 1AC1A 4WR5A 1VRSD 2VM2A 3ZIVA 4EXJA 2H6XA 2VCVA 1SD8A 3APOA 1VF2A 2LRCA 4MF5A 3DKSA 4MLYA 5HR1A 3HA9A 1URMA 1V98A 4ZB8A 4LMWA 1X5DA 3KMNA 3RPNA 1GTUA 1KTEA 4FIWA 3QPMA 4EDYA 2ZCTA 3JCML 5B6NA 1JLWA 2H8LA 2MYGA 1U3IA 3ERWA 2L4QA 3FW2A 4GWRA 3UVTA 4ZL9A 3P8WA 2J23A 3GL3A 5IMZA 2YPMA 1SK1A 3W8SA 1MTCA 3I43A 4L5OA 4TN8A 4N10A 3M3MA 2O8VB 3V1WA 5JWQB 2AAWA 4PQHA 1GUMA 3ZRDA 2WZ9A 3L78A 1O73A 5HFGA 2GDRA 3OR5A 2K8SA 1B9XC 3TOUA 5JWOB 1X9WB 1ERWA 1A2MA 2O85A 4ZB6A 3W6GA 4TR0A 4I5QA 4K9ZA 3O76A 2FA4A 4H86A 1OAZA 1Y25A 4HDEA 2M72A 4TW5A 2H73A 3L9VA 3GKXA 2P0GA 1XVQA 4AJ8A 1UC7A 3CMIA 5E59A 4PXOA 2GZYA 1OKTA 3FZAA 1SYRA 3GSTA 7GSSA 3HVXA 1O7UA 4AF2A 2CAQA 1J9BA 3VI5A 1FW1A 2MBTA 4IS0A 3HJMA 3DD3A 5FWGA 4ULXA 1OC9B 3WT2A 3KJYA 2IFQB 3GFKA 3GNJA 4POKA 1SK0A 3MNGA 1MDJA 3VI7A 2E0QA 4OD7A 5GSTA 3M0FA 2MMAA 3L9UA 5D96A 18GSA 5A4VA 1OC3A 3GIXA 1YKCA 4HEA2 3KH9A 2X99A 1R5PA 1GP1A 1XPVA 1SK2A 4WETA 4BVYA 3F4TA 3ERGA 4K6XA 3C1SA 3QOUA 1XIYA 3LXTA 2QC7A 1F37A 3WT1A 3TKQA 5J41A 5J4UA 2O7KA 3I9V2 2F8FA 3HVVA 2MBSA 3KTBA 2GQKA 4MK3A 2H0GA 5A5KA 4L0WA 2RUFA 3WGDA 2L4CA 4N0ZA 2WRTA 2VLUA 4XS4A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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