1X5EA

The solution structure of the thioredoxin-like domain of human thioredoxin-related transmembrane protein
Total Genus 21
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
21
sequence length
126
structure length
126
Chain Sequence
GSSGSSGNVRVITDENWRELLEGDWMIEFYAPWCPACQNLQPEWESFAEWGEDLEVNIAKVDVTEQPGLSGRFIINALPTIYHCKDGEFRRYQGPRTKKDFINFISDKEWKSIEPVSSWFSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The solution structure of the thioredoxin-like domain of human Thioredoxin-related transmembrane protein
rcsb
molecule keywords Thioredoxin domain containing protein 1
molecule tags Electron transport
source organism Homo sapiens
total genus 21
structure length 126
sequence length 126
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-05-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1x5eA01
3RBTA 3AY8A 2H19A 4V2LA 2YJ7A 5D9TA 2VL9A 1O8WA 3GX0A 1VF3A 3ZIVA 2F8AA 4ZILA 5J9BA 3VWVA 1QK8A 2HYXA 1EGOA 1R7HA 4P3YB 3BBYA 1O81A 5G30A 4PXOA 4Z7XA 2H1GA 4AJ7A 3TKSA 4MDCA 5HR0A 1X5CA 5ELGA 4IP6A 3GL5A 2DBCA 3LXTA 2V6KA 1SKWB 1Z3EA 4BWSA 3GSTA 4PURA 2EC4A 4K6XA 1EGRA 1EP8A 2H6YA 5A5KA 3DEXA 1V58A 1Z6NA 1F37A 4IGJA 2E2MA 4TVEA 2AAWA 3FY7A 4MMMA 2H72A 4GXZA 1EEMA 2YWMA 3IBHA 5ID2B 2VL2C 1WP0A 5KEJA 5IMFA 5G1KA 4IN0A 2H01A 1Q4JA 2GS3A 4RUVA 3FW2A 1GTBA 1ERWA 1U87A 4TR3A 3EWLA 1TU7A 4ZL8A 1XW5A 1EZKA 1QXHA 3ERWA 2BJXA 3RPPA 1U3AA 2B5XA 4K0NA 1F3AA 3F4SA 1OE8A 3Q18A 2C8UA 4MPGA 1YY7A 2GTUA 4G19A 4X1UA 5DQYA 2DJ1A 3TOTA 4J56E 2QGVA 4FYCA 2DMLA 3FRCA 4K0GA 1H75A 1ERUA 4QQ7A 4WBJA 1SU9A 1URMA 4HS1A 4PQ1A 1GUHA 2ON7A 3VURA 3PINA 3GA4A 4DEJA 3MAKA 2C0FA 1GH2A 3C7MA 2OACA 1HQOA 1NHOA 1ZL9A 2OA7A 2GSRA 3FR3A 2VLUA 2TRCP 4WBRD 1CQGA 3A2VA 3HDCA 3VWUA 2NPBA 3VLNA 5D9VA 1DUGA 2GSTA 3VK9A 4H86A 2R4VA 4ZL7A 3K8NA 1UN2A 5F07A 5AGYA 2R37A 3VFIA 2O7KA 1FO5A 3GUSA 1V57A 2K6VA 4I97A 1OC9A 3H1NA 1S3DA 1T7PB 1JHBA 5IMZA 3J7Yb 2JZRA 3IXRA 2YV9A 4O32A 3HVSA 2OJLA 3DD3A 3ZZXA 5DAKB 2WJUA 3PGTA 4DVCA 2L59A 3C71A 4O92A 3RDWA 2FY6A 3ZTLA 1NM3A 4EDZA 2WZ9A 1GL8A 4N10A 14GSA 1ZGNA 9GSSA 4IKHA 4NAXA 4V2NA 5LCZA 4HUAA 3TRPA 2K8SA 3QMXA 2GZYA 1VF4A 2FWGA 2C4JA 2V2GA 3IOSA 2H6ZA 2YV7A 1QQ2A 2DJ3A 5B8AA 1KNGA 2HI7A 4E8HA 2VCWA 4K8MA 3GYKA 2GSSA 1AQVA 2HE3A 2PU9C 3W8SA 1Y25A 4PQIA 1GTAA 1C72A 1ACVA 5FHIA 4XRDA 5ECQB 3G7YA 3BCIA 3W8JA 3EYTA 3KH7A 3EINA 3ZIJA 3ZMKA 2IN3A 4N11A 4BVXA 5GZZB 3VPQA 3SBCA 5D93A 2PGTA 2VCXA 2VLVA 1UVZA 1MDIA 4NMUA 1EP7A 3KP8A 3FZ9A 5DCGA 4JEDA 2VAFA 3LXZA 2H76A 1IYIA 2VLTA 12GSA 3EMXA 3DWVA 3DGQA 2P31A 5H5QA 2AUVA 3QAGA 3ED3A 1X9SB 5DCHA 4MPFA 2F9SA 4K7IA 1XW9A 5KN3A 2DIZA 3CBUA 2VD1A 3LWAA 1BQ7A 2YP6A 1Z9HA 2HSYA 1A2MA 2M80A 5DAKA 3KMNA 5ECHB 3KMOA 2HZEB 1Y6EA 4CDOA 4IHUA 4IELA 2KP2A 1FW1A 5IPGA 2YOIA 1J08A 2K18A 4MF6A 3GKKA 1PX7A 5J5NA 2FA8A 3IV4A 1BYEA 4OO5A 2C1YA 3WT2A 2RLIA 4MF7A 1SENA 3IPZA 1AIUA 2YNXA 4GRFA 5A4VA 3HJPA 2DJJA 2H75A 1A23A 1K0OA 4EDYA 5A4UA 5ECOB 1GTUA 3H8QA 4KNDA 1WPIA 1TP9A 5HFKA 4EO3A 5F0GA 1TW9A 3NOFA 2LUSA 3GH6A 2GVPA 2PBJA 2BTOT 3GKXA 2WB9A 4I6XA 1XPVA 5EL8A 1GRXA 1BJXA 2IL3A 3J7Yk 4BWQA 4V1Ag 4HOJA 3IAS2 5LD0A 1XZOA 1K0MA 1Z7PA 3GTUB 2LEGA 1XCCA 4JR6A 1SKSB 6GSWA 2M46A 1A24A 4ZIJA 4MJCA 2FNOA 2WULA 1BX9A 3FHKA 3KJYA 2HXKA 2E0QA 1PRXA 2P5QA 11GSA 5C00A 1JLWA 1KTEA 4ISDA 3F4TA 4HQSA 2LNSA 4XIHA 5KN0A 4MJBA 4EF0A 1E2YA 5HR1A 1X9WB 2GQMA 1I5GA 5C04A 4OWYA 3QAWA 4DSQA 2WCIA 1E6BA 3P90A 3KIJA 3ME8A 3UIWA 2YN1A 1F6MC 2L57A 4KDXA 2HRNA 2IMFA 5J9CA 1YJ6A 3OR5A 1M2DA 1TI3A 3ZITA 4POLA 2ON5A 4IJ3A 1FHEA 5HQPA 1GLPA 4TXOB 4KGIA 3APSA 3CXGA 4GSTA 3CTGA 3IDVA 2DJKA 2HZEA 3L78A 4TOPA 1ABAA 3WGEA 3LQ7A 2LNTA 4QL7A 2FD3A 4PQHA 2NDOA 2L4CA 2AHEA 1SJIA 4DSSB 3ZLPA 4XTSA 1FOVA 1GSUA 2A4VA 3QDNA 2C0DA 2V41A 1GSDA 2B3SA 2FHEA 4HU9A 2JU5A 2REMA 2H0IA 5D8IA 5H5RA 4TN8A 2CX3A 1VGLA 1SL0B 4MCUA 1HNBA 4F0BA 2KHPA 2N5BA 1NW2A 2L5LA 2C3QA 3HVVA 2CZ2A 2CT6A 3ZREA 2GSQA 2FWHA 1ST9A 4J2FA 5D9WA 1M9BA 1AW9A 3KP9A 1B9XC 3M9JA 1TRUA 1TKDB 4BL7A 3IR4A 3ZFLA 1GUKA 1TK0B 4Q5NA 2VO4A 3QCPA 4ZBAA 1A8YA 2OADA 1ZYQB 3HXSA 3RPNA 5GAPD 2XC2A 5CO3A 3KGKA 1GTIA 2HLSA 3GTUA 2H30A 4OMVA 3EMPA 1XWAA 2G2QA 3US3A 2H0HA 4GLTA 2X64A 4K1FA 1O85A 4HJ2A 4J57E 1K0BA 2F8FA 3DVWA 2VL2A 4V1Ap 2CAIA 2DIYA 4L0UA 2IMKA 4N30A 3LJRA 5HR3A 4MZCA 3ZVJD 2FUG2 3G9BA 2H71A 4RI7A 3DXBA 1A0FA 4NWYA 3RHBA 4TXOA 4Q5QA 4EVMA 1LU4A 4MK3A 3WGXA 4DSRA 4PNGA 2OBKA 1OC9B 1SL2B 4GSNA 2ALBA 5CREA 5D9XA 1XWCA 5G5EA 4WETA 4DSSA 4ULXA 2I4AA 3GKNA 4BPYA 3A2XA 3QFAC 1G6WA 1J0FA 3S9FA 1PD21 2FA4A 1FB6A 4HZ4A 2HZFA 22GSA 2I1UA 3RHCA 2NVLA 6GSXA 1MTCA 3HCZA 2VUPA 5E59A 4EL1A 1F2EA 2JSYA 1PSQA 4QL9A 1K0AA 1EWXA 1G0TA 1K3OA 3LYPA 1PL1A 2GQKA 1JZWA 3HZ8A 2NBSA 1SK0A 2X8CA 5H5SA 1XVWA 2IPAA 5AIVA 4TKYA 4KCEA 4BA7A 2L4QA 4MA9A 2GDRA 5ELAA 3GFKA 4L5OA 2H8LA 5LNKe 1ZZYA 3TDGA 5IMAA 1PA3A 19GSA 2GZZA 1FG4A 4WKWA 2P5RA 3DKSA 3F0IA 3M1GA 1YEXA 4OD7A 3C1RA 2LJAA 5ABRA 4TXVA 2N5FA 3O3TA 1ZMAA 2CZ3A 5B8BA 10GSA 1AQXA 5F06A 4K7OA 5L71A 1OAZA 1TDIA 2LV3A 1DBYA 3N9JA 3P2AA 5ECLB 3H79A 2CX4A 2E2GA 4POMA 1OE7A 3H4KA 1DE2A 2FLSA 2X8HA 1H4OA 3UARA 1MD4A 1THOA 2RIIA 1KEBA 3APOA 3UBLA 1M99A 4OCFA 1SYRA 2LRTA 3E9JB 4FYUA 4I2TA 4OFNA 4L5LA 3KD0A 5B7CA 4MP4A 4XS1A 2DMMA 2KLXA 4MZBA 2J23A 1SKRB 4L8EA 3QFBC 2HRFA 3EU3A 1ML6A 2OE0A 5AISA 1AUCA 2CVBA 16GSA 3R2QA 1X9MB 4IP1A 2LKUA 3HVXA 4GWRA 3WGDA 2LQQA 3L9VA 1XFLA 1SK1A 2JZSA 4HDEA 3TJKA 1HYUA 1JLVA 4IQAA 3EC3A 4ZL9A 1S3CA 1SD8A 5IO2A 3QAVA 1GSYA 3CYNA 5DBQA 1O73A 1AXDA 4AF2A 1BAYA 2H6XA 3LSZA 3UJ1A 2R3XA 1SD9A 2LS5A 4MF5A 5JCUA 1B9YC 2HT9A 2H73A 2I3YA 1A8LA 1TOFA 4FH8A 3FZ4A 3W6GA 1JZDA 1OC3A 3CSJA 5AN1A 1OKTA 2V32A 5HFGA 4KAEA 3G7IA 3NZNA 4NXIA 4MH3A 2IIYA 3TB2A 4F2IA 1QMVA 1WOUA 3APQA 1UC7A 4NV5A 1XWGA 3GKMA 4GQFA 4IVFA 4NPBA 5IIZA 1O8XA 2IMEA 4MZWA 2IMDA 3KEBA 1WMJA 2RM6A 3HJMA 1X5EA 3CSHA 3ZVJA 4IS0A 1TI1A 4WF5A 1TK5B 2V6OA 1R5PA 3QPMA 3P8WA 1T1VA 3TKRA 3LG6A 2FWFA 1FVKA 2VL3A 1PL2A 3EE2A 3CMIA 2B7JA 1XOAA 2YPMA 4KW6A 3EU4A 1V98A 3P7XA 3TJGA 1A0RP 1SJZA 1R5AA 4HU7A 1ZCPA 4N0VA 5D73A 2CQ9A 5HR2A 1PX6A 1RW1A 2MBTA 1M7TA 5CRWA 1TRVA 5G5FA 1T8EB 4XCSA 4ZBDA 3GH9A 1U6TA 3HKRA 4EKZA 4F03A 1YF0A 3GV1A 2K8VA 2TIRA 4HQZA 4GCIA 1G6YA 2L6CA 3HA9A 2H1DA 1G7EA 3L9UA 1WWJA 1AC1A 1JFUA 1XXUA 2B1KA 5ECMB 4OO4A 1MDJA 4FIWA 1MEKA 2PERA 5INYA 2F3MA 1SJ6A 2H74A 5IOWA 2ES7A 4JE1A 2JZTA 5DJLA 18GSA 3L4NA 4POKA 3ERGA 4KCAA 2AB6A 2B6MA 5G2ZA 4V2MA 3D21A 4KB3A 1TXXA 3A3TA 3GX8A 3HJOA 5D96A 1HNAA 3F63A 4BVYA 2LJKA 2WGRA 2MMZA 2AYTA 4WR5A 2B1LA 4FYBA 3DVXA 3M3MA 3ME7A 5ECPB 3GSSA 5F05A 6GSUA 1V40A 4GTUA 1MD3A 5ECNB 3JCML 5DQSA 1ZYEA 1T3BA 1GNEA 2YCDA 1F3BA 1T4ZA 1TJDA 3I9V2 4KA0A 2EIRA 2ZUPA 3L9SA 1QFNA 1XVQA 1DE1A 1M9AA 4K7NA 3TJBA 1WJKA 2FWEA 2LQOA 2PUKC 5ECSA 1I9DA 2EIOA 1M2BA 3QD9A 3TJJA 2QSIA 3D0ZA 5J3RA 2P0GA 4G9HA 1ON4A 2R6KA 3IRAA 4D73B 2TRXA 5CNWA 1GP1A 1OVNA 3DIEA 4Q5RA 1FB0A 1GULA 5CRDA 2I9HA 3TJFA 2LTKA 2V1MA 4O5RA 4NHWA 1XIYA 3FR6A 3UVHA 3E0UA 3HY2A 2VCVA 3O6TA 3ZMLA 1V2AA 3Q19A 2C0EA 4K9ZA 2JSZA 1K3YA 4ECIA 4YAPA 3WD6A 2CA8A 5EVOA 2OE1A 1N2AA 1ZOFA 2IWTA 2ZNMA 2MBSA 4JU5A 1EV9A 2B5EA 3HHVA 2KUCA 1FAAA 2E7PA 4F9ZA 2N5AA 2O8VB 5EPFA 2IMIA 1O6JA 4I2UA 1RK4A 3ERFA 1XWBA 2JACA 2G0FA 3KCMA 3GHAA 3D5JA 3ZL5A 1VF2A 1M2AA 3TKQA 4ZB8A 2XBIA 1ERTA 1T4YA 2O87A 3GL3A 1RQMA 5JCWA 1T00A 2O85A 2YZHA 3HD5A 4YQVA 1WRYA 1W4VA 4YQMA 4JBBA 1J9BA 3KM6A 1DSBA 3LYKA 4YQUA 3L0HA 4GQCA 3GMFA 2QKEA 4ZB9A 4KSMA 1XWKA 1XBSA 2YANA 2GGTA 6GSYA 4EUYA 4ID0A 2MYGA 3MDKA 4KDUA 1QGVA 5GAND 4AGSA 4D73A 2VM1A 3G7JA 2PVQA 5CRGA 1V9WA 2XPDA 2DJ0A 1PN9A 1GNWA 1Z6MA 1SL1B 5GSSA 2VM2A 1K0DA 3IC4A 5G1LA 5J4UA 1A2JA 2KOKA 1OC8A 1CQHA 2WFCA 2XBQA 2CVKA 2FCHA 1GUMA 4AJ8A 5JWRB 3HYPA 4JZQA 3M0FA 3FYGA 5JCGA 1GWCA 3KH9A 2IFQB 3C73A 2RM5A 2DSAA 3I69A 3TKSC 4WR4A 2PVOC 4ML6A 2DLXA 1LJRA 3WYWA 5IMDA 1Z5YE 4POBA 3UOMA 3IE3A 3M8NA 20GSA 2DJ2A 2HNLA 2NTOA 4HEA2 3LEFA 4ECBA 4LLRA 2D2ZA 3BD2A 3BOAA 1HNCA 1K0CA 1NSWA 3EURA 5ECIB 4OCEA 3ZYWA 3E3EA 1U3IA 6GSTA 6GSVA 1YDKA 1GLQA 7GSSA 4GF0A 3H93A 3VWWA 4YAVA 3VPTA 4X43A 1WIKA 3LFLA 1X0RA 3FEUA 17GSA 4I5QA 3DRNA 3F8UA 3GIXA 1TTZA 5A4WA 1Z7RA 4XS6A 5HFIA 2OE3A 3Q74A 3LGCA 6GSSA 4KH7A 5CAXA 5IOXA 4EE0A 2VCQA 3D4MA 3DYRA 1R4WA 3V1WA 2LSTA 5IO0A 4ZBBA 4LMWA 1BEDA 2X8GA 5ID2A 2YWNA 4RQRA 4TW5A 5DVBA 3ISOA 1G7OA 2C3TA 1K0NA 5G31A 2L5OA 1QUWA 3C1SA 3TCOA 3QR6A 3TKSE 3PH9A 2KP1A 2R2JA 3FZAA 1EEJA 2C0GA 1THXA 2Z9SA 2YWOA 2PWJA 4K2DA 4PUAA 2H1BA 2HFDA 5B6MA 3BJ5A 3U6VA 4X0XA 3SWLA 4LA1A 2H0GA 1JZRA 2IFQA 1YQ1A 4WEYA 2MZCA 2GT5A 1F9MA 3HZ4A 2LJRA 4E8EA 1A2LA 3WT1A 3TUEA 1N8JA 2ZCTA 2MMNA 3F9UA 4EC0A 4KUNA 2H70A 1Q98A 2A2RA 4MJAA 2DC5A 1PKWA 2WS2A 3KZQA 4JRRA 3I43A 5IQYA 1USBA 1GSQA 2RUFA 3N5OA 3IA1A 3TKPA 3MWHA 4MLYA 4AJ6A 3GNJA 2B5YA 4ECJA 1GSSA 3CSIA 2GLRA 4HJMA 5B6NA 1K3LA 2CAQA 2OKAA 2VCZA 4PUFC 4WF4A 4ACSA 2YWIA 1M0UA 5ECRB 3FZ5A 3EVIA 4OFMA 1B48A 2LRCA 1MDKA 3DMLA 4LL4B 4MABA 1NHYA 5KN2A 2CVDA 1IYHA 2VIMA 5JWOB 2VOCA 1R26A 2L6DA 2O89A 3LORA 2C3NA 2GT6A 2VCTA 3CTFA 1AQWA 3O76A 4XS4B 5ENUA 5J41A 3CRTA 3D22A 3F3RA 4KSOA 2WRTA 1X5DA 2WDUA 4PX1A 5AIXA 2JL4A 1PQNA 4TRXA 2R5GA 1PMTA 5IMVA 4O7HA 3C8EA 4YH2A 3UAPA 1W89A 3PR8A 1AAZA 4MJEA 5FWGA 4XRAA 1TRWA 3FKFA 2GZPA 4ML1A 3UBKA 5IMCA 2K9FA 3U5RE 2LRNA 2CV4A 4ILFA 3ZRDA 4G10A 8GSSA 1OKDA 4TR1B 2RUEA 2XHFA 2MMAA 3IAM2 3UVTA 1TRSA 3M9KA 1OYJA 5EY6A 4I8BA 4IW9A 3TRXA 1FVJA 3NIVA 3MNGA 2AV4A 5JWQB 1B4PA 4JR4A 2C80A 1B8XA 4ECCA 3QOUA 3A5WA 5DALB 3IK9A 4IQ1A 1KBNA 4IBPA 1VRSD 1PGTA 4HI7A 4NV2A 3KXOA 13GSA 5IPHA 3IK7A 4PNFA 4L0WA 1ILOA 3TRQA 4KE3A 2GQLA 1SK2A 3A2WA 4CW9A 2F51A 2XPEA 5E4WA 4N0ZA 2AJQB 2H66A 2PMTA 3FR9A 1EV4A 4TR0A 4F0CA 1EOGA 2BMXA 4EXJA 5ECKB 4XHMA 1EOHA 3GRXA 4XS4A 4GSSA 3UL3A 1TK8B 3IHQA 3I6AA 4PGTA 1XOBA 2YZUA 3ZFBA 2IJYA 2YJHA 4G2EA 4OFTA 4ZXGA 3D4TA 1S3AA 1YKCA 5CRHA 4RQXA 3CRUA 4TR4A 4KDYA 3GURA 4IJIA 2A2SA 1ERVA 3F6FA 3KTBA 5DJMA 1XW6A 2HSHA 3MSZA 4ZB6A 4LMVA 1LBKA 2PPTA 2JADA 1BG5A 1WE0A 2M72A 5KN1A 1SYXA 1YZXA 3TOUA 2FGXA 3F4RA 3BCKA 2I81A 4WXTA 5GSTA 4F82A 3D6IA 4FO5A 4RI6A 4MH2A 3TGZA 5COHA 3UMAA 2PN8A 3KTLA 5F8BA 3GN3A 5CYYA 1B4QA 5FT3A 2X99A 2B7KA 4KX4A 4Q5FA 1YKAA 3F3QA 1O7UA 4NHZA 1HD2A 2J9HA 4TR1A 1PKZA 5IM9A 3UEMA 3VI5A 4CHSA 2VD0A 1GSEA 3F6DA 5DDLA 4HZ2A 3Q6OA 2EIQA 1JZOA 2MMOA 4LL1B 3VI7A 1TU8A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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