1XBSA

Crystal structure of human dim2: a dim1-like protein
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
137
structure length
137
Chain Sequence
MSFLLPKLTSKKEVDQAIKSTAEKVLVLRFGRDEDPVCLQLDDILSKTSSDLSKMAAIYLVDVDQTAVYTQYFDISYIPSTVFFFNGQHMKVDYGSPDHTKFVGSFKTKQDFIDLIEVIYRGAMRGKLIVQSPIDPK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Biochemical Characterization and Crystal Structure of a Dim1 Family Associated Protein: Dim2
pubmed doi rcsb
molecule keywords Dim1-like protein
molecule tags Transcription, cell cycle
source organism Homo sapiens
total genus 40
structure length 137
sequence length 137
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-08-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02966 DIM1 Mitosis protein DIM1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1xbsA00
3IXRA 1TKDB 4MJBA 2HZEB 1UVZA 3P8WA 4EVMA 4Z7XA 3GL3A 1NHOA 3KIJA 1WE0A 4TOPA 1AC1A 4WXTA 1HQOA 2N5FA 1HNBA 3BCKA 2OACA 2DJ1A 4IELA 3IE3A 4EUYA 1O8WA 1SKSB 4KCEA 2C4JA 1K0NA 1M2AA 2EIRA 1AIUA 2IIYA 4IJIA 2L59A 4PURA 3KTLA 4XRAA 3TJBA 4LL4B 2GT6A 2V6OA 4BPYA 1V98A 2C3QA 3I69A 1GSSA 2RUFA 5IOWA 5G30A 1K0AA 3IHQA 2FA4A 3F6DA 1SJ6A 4I8BA 1J08A 2AUVA 2L57A 2C1YA 2FNOA 2A2SA 3KP8A 3EMXA 3HKRA 1JLWA 3TRPA 1DUGA 4DVCA 5CYYA 4FO5A 1ERUA 3VPTA 1JLVA 4OWYA 5KN2A 2FCHA 2XPDA 4DSSB 2IMIA 1GUKA 2DJ2A 18GSA 1EP8A 4I6XA 2GVPA 4XRDA 2C80A 3ZITA 2VLTA 2LRTA 4L0UA 3ZIVA 2JSYA 2VM2A 1PX7A 1ZMAA 2K8VA 1EOHA 2IMEA 4IVFA 4K1FA 4GLTA 3G7IA 3GKNA 3P90A 2B3SA 1ZL9A 3KZQA 3LJRA 3IRAA 4NWYA 1E2YA 2DSAA 5F0GA 5IM9A 4IKHA 2LKUA 3MAKA 1SKRB 3TRQA 4TKYA 4OFNA 4EDZA 3GURA 4YQVA 5B6MA 4KE3A 2PU9C 3VI7A 2J23A 3MDKA 4L5OA 2IFQA 2LNTA 1J0FA 2MMNA 2WGRA 1SK0A 4K7NA 3LQ7A 4PQHA 5H5SA 3R2QA 3DXBA 1I9DA 2H75A 5A5KA 4MPFA 1MDJA 1NSWA 1LU4A 3ZL5A 3CRUA 3G7YA 1M2DA 1N2AA 2DJ0A 4WETA 3GSTA 2L4CA 2DBCA 5DVBA 1K0MA 4TXOA 4K2DA 1GRXA 2HZEA 1VGLA 1O7UA 2OE0A 1GNWA 5CAXA 3ED3A 2DMMA 1V40A 2F51A 2M72A 3LSZA 1GSFA 3FZ9A 1S3AA 5L71A 1XWBA 2CQ9A 3TKRA 1A2JA 2IMFA 2YP6A 2CVBA 14GSA 1GTIA 2GQLA 2H0GA 4AJ8A 5IMDA 3QDNA 4MF7A 2NPBA 4GCIA 4EF0A 1PL1A 3L9UA 1U87A 3UIWA 1LBKA 2H71A 3QFBC 1JFUA 1ZZYA 3F4TA 2VO4A 2R37A 1TRWA 3MWHA 1T4ZA 1YJ6A 4IGJA 2I9HA 1GTAA 4CW9A 4JE1A 5HFGA 3TCOA 3TKQA 4MZCA 1T8EB 1OC9A 2OBKA 1VF1A 3NOFA 4K7IA 4HU7A 2B5EA 3UBKA 1PKWA 3TJFA 4L5LA 1B9XC 4LMWA 3WT1A 4HQZA 2GZZA 3TKPA 3HVXA 1ILOA 5J9CA 4E8HA 3GH9A 1XBSA 4WBJA 1H4OA 1GSDA 3UEMA 5F07A 2A4VA 1YEPA 1XZOA 2PBJA 1XW5A 3GH6A 3EINA 4XCSA 4EC0A 2HYXA 2RM5A 3QPMA 3RPNA 1B8XA 2H6ZA 2VCTA 3TJGA 2YOIA 4V2LA 1A23A 3ZMLA 1G7EA 2GSTA 3M1GA 2MMOA 5JCUA 4GQFA 4KDXA 4KAEA 4AJ6A 5D9WA 20GSA 4NHZA 4YAPA 2LUSA 1WJKA 2HT9A 4TR4A 1TW9A 5ECRB 5D73A 2WB9A 3FYGA 1UA5A 3VFIA 5A4WA 3TKSC 4ZL9A 1B48A 1RK4A 4P3YB 2V32A 1Q98A 1TI1A 3F3RA 5EY6A 5ECLB 5ECPB 4LLRA 2XC2A 1THOA 2KOKA 3GKMA 1SU9A 2E2MA 5F06A 1FO5A 1V9WA 3H79A 4X43A 4NXIA 3RBTA 3CBUA 2C0DA 1DE1A 3HVVA 2CA8A 1AUCA 3HY2A 5CRHA 2R3XA 1O8XA 4IQAA 3HXSA 2CX3A 2B7KA 2VL2C 4DSQA 1WPIA 5HFIA 4CDOA 2AHEA 2PERA 4HZ2A 4MH2A 4YH2A 3PINA 1MDIA 2H8LA 1PX6A 1SJZA 3KMOA 3US3A 5IO0A 3FZ5A 3UMAA 2HE3A 2IL3A 1DE2A 1TOFA 2JZRA 1A8LA 2HLSA 5ECHB 2K8SA 4BWSA 1W89A 2YNXA 1PQNA 1QQ2A 3KD0A 1TK0B 1TRVA 1XWCA 2BJXA 3GX8A 4ZB6A 4LL1B 1GSYA 1A0FA 2O85A 4E8EA 3I6AA 2E7PA 4ECCA 1MDKA 3GKKA 4GWRA 4OFMA 3UBLA 2YWMA 2CV4A 3TOTA 1A2MA 2GSQA 3C1SA 4WF5A 3O6TA 1ERVA 1K3OA 3K8NA 3ZFBA 4GTUA 4POKA 2K18A 3GHAA 3VI5A 3RAZA 3WYWA 1XCCA 3BD2A 3CRTA 2X99A 2MBTA 2AJQB 1U88A 1JZOA 1OKDA 3FR3A 3VWVA 5DALA 1A24A 2YWOA 4TRXA 4OCEA 2VD1A 1X5EA 2YZHA 2V2GA 3M8NA 3CTGA 1NHYA 5IOXA 4RI7A 5D9XA 4TR1A 3TGZA 1T3BA 2C0GA 4IN0A 4NV2A 3LYPA 2H19A 3DMLA 3LYKA 1DBYA 3LGCA 2LRNA 4YQMA 3IC4A 3TJJA 1JHBA 4JEDA 5G5EA 3UVTA 2FLSA 1BX9A 3L4NA 4MCUA 1GSEA 3VWXA 2C0EA 1T7PB 1WP0A 1U6TA 3UVHA 1CQGA 1Y6EA 1XFLA 2VL2A 1XPVA 5AIVA 4QL7A 5ECKB 4KDUA 2FA8A 2OJLA 3KTBA 2BTOT 3KP9A 1WIKA 3QFAC 5KN3A 4TXOB 2O8VB 4KX4A 4Q5NA 2L6CA 3H93A 3LXTA 1GUMA 3LEFA 3GTUA 1X9WB 4HJMA 1HNAA 1EV9A 5FWGA 3C8EA 5J3RA 1VRSD 3V1WA 3BOAA 3P2AA 3OR5A 1BG5A 5IMZA 3GKXA 2LNSA 2WDUA 2JL4A 2GQMA 1YEXA 2DLXA 4KSOA 4NAXA 3UAPA 2N5BA 1JZWA 5A4VA 2GLRA 3L0HA 4ZBDA 1M2BA 4OD7A 4ECIA 3RHCA 4MABA 5ECOB 4L8EA 3L78A 2FD3A 3RPPA 2F8AA 2IPAA 4JBBA 2F3MA 1OC9B 2O89A 3W6GA 3EWLA 3HVSA 4IBPA 5ECNB 2G0FA 5CO3A 3L9SA 3IA1A 3E0UA 5G1KA 1JZRA 4J56E 1B9YC 2ZCTA 4HI7A 5D9TA 3ZRDA 2VD0A 3ZYWA 5J9BA 1SD9A 2VM1A 2KUCA 2KP1A 5GAPD 2Z9SA 1TXXA 4FYBA 5D96A 1TU8A 2QSIA 3WD6A 5GSSA 1SL0B 1MD3A 2KLXA 4Q5RA 3VWWA 5IPHA 2HSYA 2R6KA 3NZNA 2AAWA 1ZYEA 2LV3A 2X8HA 1OKTA 3MSZA 3A5WA 2GZYA 2XBQA 5C00A 4EO3A 5IMCA 1G6WA 3LG6A 4ML1A 5IMVA 4K8MA 3DVWA 1TP9A 5A4UA 1I5GA 2YWNA 2C3TA 1GNEA 2R4VA 4JZQA 5J5NA 2HRNA 4ZL7A 1X9MB 2H1DA 5HR0A 3GX0A 1X0RA 4K6XA 3VWUA 3ZLPA 5ECIB 4ECBA 1JZDA 2MMZA 4H86A 1ST9A 1YKCA 4TVEA 5EL8A 4XS4A 1X9SB 2GZPA 3D22A 1M9BA 2C8UA 6GSWA 1THXA 4G2EA 2ON7A 1ZCPA 2B1KA 2DC5A 2I4AA 2NVLA 3LXZA 3TDGA 5FT3A 3KM6A 4Q5FA 1SK2A 2IJYA 3A2XA 3IV4A 1YF1A 4IJ3A 3VLNA 2LQQA 2YZUA 3FR9A 5G5FA 2V41A 4EL1A 1YDKA 3QR6A 2N5AA 2GSRA 5ENUA 2PVOC 4AGSA 3HCZA 1Z6MA 4ILFA 4MH3A 1YQ1A 3DIEA 5B8AA 4N30A 3UJ1A 1WMJA 1OC8A 5HQPA 5ABRA 2O7KA 2P31A 3C1RA 1EP7A 3QMXA 1GH2A 4OMVA 1T00A 2H70A 3AY8A 1YZXA 3UOMA 1K3YA 4KSMA 1VF4A 4KH7A 10GSA 2YANA 1Z9HA 2HI7A 3JCML 3N9JA 1MTCA 1UN2A 4HU9A 2PVQA 3HZ8A 2FHEA 2X64A 1HYUA 1K0BA 2F9SA 1U3IA 3ERFA 1ACVA 4G10A 2TRCP 3CTFA 4IS0A 4IHUA 3Q18A 3KMNA 2LEGA 4FH8A 2AB6A 4L0WA 2MMAA 3FY7A 5AN1A 2JZSA 4NHWA 1LJRA 2FUG2 6GSSA 1IYIA 1N8JA 1EOGA 3DRNA 4HQSA 3J7Yk 2VAFA 3GNJA 5LD0A 4KCAA 4QQ7A 2FWFA 1GUHA 1Z3EA 4EKZA 3LWAA 2GGTA 5KN0A 3CSJA 6GSXA 5AGYA 1J9BA 1XWKA 2KHPA 5DALB 2H76A 4ECJA 2RUEA 4BA7A 4YQUA 3APSA 3QAWA 1DSBA 1BJXA 4NV5A 2XPEA 2B5XA 4TR1B 5EPFA 1O81A 2GTUA 1XVQA 2VLUA 2LS5A 1K0OA 2YV7A 4BWQA 3W8JA 1SENA 1ZGNA 1URMA 1B4QA 16GSA 3F4RA 4KNDA 4WR5A 3TRXA 1KTEA 4CHSA 1KBNA 4BVYA 3WGEA 3KCMA 4FYCA 3N5OA 5J4UA 3P7XA 3APQA 2JSZA 4OO5A 5COHA 5ID2A 1SJIA 4F82A 1W4VA 1PD21 2MYGA 4KUNA 4O92A 5CRWA 4IW9A 3GYKA 1F6MC 4RI6A 3GTUB 2VL3A 2VL9A 2GT5A 2YN1A 5CRGA 4V2NA 3F63A 2VCWA 4WR4A 1R26A 1EWXA 3ZMKA 5ELGA 2B1LA 4LMVA 12GSA 4JR6A 1ERWA 2DIYA 3O3TA 4HOJA 5DDLA 3S9FA 3ME7A 4MZBA 2B7JA 4IP1A 2H74A 3IOSA 4YAVA 4BL7A 3M9JA 5D93A 2GSSA 2H01A 2YV9A 5B8BA 2FY6A 2CAIA 3TKSE 1XIYA 2RIIA 5DAKA 1TK8B 2OKAA 2LJKA 3IAS2 4F0BA 5DBQA 4DEJA 3Q74A 4J57E 1S3CA 4IP6A 4LA1A 1AW9A 4O32A 4N0VA 4O7HA 1XOBA 2H6YA 2EC4A 1F3AA 2HZFA 2MBSA 5DJMA 3EYTA 2LSTA 1YY7A 2NTOA 2V6KA 3EURA 1A2LA 3EVIA 1OAZA 1ERTA 4HJ2A 4MK3A 5IIZA 3TKSA 3Q6OA 2VCZA 2YJ7A 5F05A 2M46A 3BCIA 1HNCA 2IWTA 3BJ5A 19GSA 1R5PA 3EU3A 5AISA 3GA4A 6GSYA 3GV1A 3GMFA 4JRRA 3BBYA 3H8QA 3M9KA 4XS6A 4AF2A 3U6VA 3ZTLA 1Z5YE 3D4MA 4AJ7A 5KN1A 1FB6A 3DEXA 4ULXA 1RQMA 3F9UA 1F2EA 2DIZA 2PN8A 2BMXA 3A3TA 4ZL8A 1ABAA 4X0XA 4EXJA 4IQ1A 4G19A 2R5GA 2REMA 3GFKA 1CQHA 1KNGA 4ACSA 2QKEA 1FB0A 3KH7A 2L6DA 1PL2A 4MDCA 4MLYA 1BQ7A 4TXVA 4MJAA 2WRTA 1UC7A 2HRFA 4KDYA 5JCWA 4MPGA 1SYXA 5JWRB 2NBSA 4KB3A 5INYA 4XS4B 3TJKA 4XTSA 3GRXA 2WJUA 4X1UA 2J9HA 5CRDA 3I43A 4GRFA 3HYPA 4MZWA 1GWCA 3IDVA 4Q5QA 2I81A 5D9VA 2L5LA 1F9MA 1RW1A 3EC3A 4OO4A 3TOUA 3IPZA 4PNGA 1G7OA 1GLQA 2AV4A 1A0RP 2EIQA 2RLIA 4I2TA 4O5RA 3PGTA 1OVNA 3ZIJA 2WFCA 3KXOA 2H1BA 1M7TA 1R5AA 1QGVA 5CREA 1PRXA 1FOVA 1AQWA 4POBA 2M80A 5DQYA 4TW5A 3A2VA 5DJLA 2TIRA 1OE7A 1QMVA 3FW2A 1AXDA 5DCGA 3RDWA 2H0HA 2K9FA 4PUAA 4JR4A 4PGTA 4MF5A 4POLA 4ID0A 4ZILA 2JU5A 3A2WA 3QCPA 4WKWA 2F8FA 4KGIA 2IMDA 3ZVJA 4NMUA 5HR3A 3PH9A 2L4QA 3UARA 1USBA 2CVDA 2H1AA 5HR2A 3F4SA 3KH9A 1TI3A 3IK9A 4QL9A 2VCQA 1EV4A 2VCXA 4PXOA 4N10A 5FHIA 5IO2A 7GSSA 1X5CA 2NDOA 4J2FA 1EGRA 1KEBA 3M0FA 4PX1A 1TDIA 3VURA 4BVXA 3O76A 1SK1A 1Z6NA 3KJYA 2B5YA 2OADA 1BYEA 4EE0A 6GSTA 1V57A 3EMPA 2VLVA 3WGXA 2ALBA 3VPQA 2VCVA 2YCDA 2GQKA 2OE1A 3DKSA 1IYHA 4GF0A 2FWEA 3UL3A 1TTZA 1S3DA 2DJJA 2IN3A 5ECSA 2KP2A 3ERWA 1AAZA 5LNKe 2OBIA 3ZVJD 5B6NA 1NW2A 5H5RA 2CZ2A 2LJAA 1PA3A 4MJEA 4N0ZA 2E0QA 5KEJA 2P5RA 2OA7A 4ISDA 4V2MA 1EEMA 2VOCA 3MNGA 2OE3A 4XHMA 3LFLA 4FIWA 5F8BA 3APOA 1R7HA 5ID2B 1GLPA 2PWJA 3Q19A 2L5OA 5IPGA 1M9AA 2CT6A 3FKFA 3I9V2 2ES7A 4OCFA 3WT2A 2PGTA 2H66A 2H72A 3FR6A 4HUAA 3SWLA 2DMLA 2FGXA 4EDYA 3DVXA 3VK9A 2XBIA 4V1Ag 1X5DA 1QK8A 3ZFLA 3HA9A 4XS1A 4ZBAA 2YWIA 5H5QA 2YPMA 5CP1A 1MEKA 4PQ1A 4ZB9A 3D4TA 1T4YA 2DJKA 3L9VA 1PKZA 5IMAA 4F2IA 5IQYA 5GAND 3C71A 3G9BA 1PSQA 2WCIA 1O6JA 5GZZB 3GL5A 3FK8A 4ML6A 1H75A 3D0ZA 1A8YA 2QGVA 3D5JA 3DYRA 2V1MA 3ME8A 5JCGA 4ZB8A 4MA9A 3U5RE 2VUPA 5E59A 5DAKB 2D2ZA 3CYNA 11GSA 1GTBA 5J41A 4F03A 4DSSA 1WWJA 1FVKA 1YF0A 1GULA 1ZYQB 1XW9A 4JU5A 1C72A 1K3LA 1XWAA 4K0GA 1YKAA 2TRXA 5G31A 5D8IA 1EGOA 1G6YA 1EEJA 3FHKA 2ZUPA 5CNWA 2CAQA 4WEYA 4RQRA 3NIVA 4HEA2 3WGDA 1NM3A 1XW6A 3D6IA 2K6VA 3DD3A 1XOAA 2GDRA 4I97A 1Z7RA 4OFTA 2HNLA 4DSRA 4RUVA 4V1Ap 3LORA 2YJHA 4NPBA 3ZZXA 2CVKA 4MMMA 3F0IA 1OE8A 3GUSA 1K0DA 4K7OA 3HDCA 3KEBA 4MF6A 2PMTA 5DQSA 3KGKA 3PR8A 4D73B 4FYUA 1TRUA 2HFDA 3DWVA 5IMFA 3C73A 1AQXA 17GSA 4GQCA 3M3MA 3CSIA 3QAVA 3ZREA 4N11A 3FRCA 5G1LA 1FW1A 1GL8A 4MP4A 1ON4A 1PGTA 1G0TA 1Q4JA 2LTKA 4TN8A 3GIXA 6GSUA 3F6FA 5ECQB 2H6XA 1QFNA 3CSHA 3GSSA 2PPTA 6GSVA 3IK7A 5HFKA 1K0CA 1PMTA 5JWQB 3SBCA 2XHFA 5LCZA 2P5QA 9GSSA 1SL2B 2QC7A 3QAGA 1U3AA 4WBRD 3ISOA 5ELAA 2JACA 3HD5A 1BAYA 5GSTA 2X8CA 4GXZA 3F3QA 4I5QA 2LRCA 3IBHA 4RQXA 2I1UA 1TU7A 5ECMB 3CMIA 4GSNA 2CZ3A 3F8UA 2JZTA 22GSA 3H1NA 3H4KA 4HDEA 3FZAA 1FG4A 2HXKA 1FHEA 5HR1A 2FWHA 4K9ZA 2JADA 2WS2A 1FVJA 1GTUA 5JWOB 3E9JB 3HZ4A 2HSHA 3E3EA 4WF4A 3HJMA 1FAAA 4ZXGA 3D21A 2WULA 1Y25A 2X8GA 2WZ9A 2IMKA 1O73A 3HJOA 4MJCA 1TJDA 2MZCA 3HHVA 4ZBBA 4PNFA 1T1VA 1SYRA 1V2AA 1V58A 1BEDA 4I2UA 8GSSA 2P0GA 1GSQA 4ZIJA 3IR4A 1OYJA 3DGQA 1TRSA 3W8SA 1F3BA 2EIOA 2G2QA 1F37A 1GP1A 1QXHA 5E4WA 1HD2A 1ML6A 1R4WA 1XXUA 3CXGA 3QD9A 2VIMA 2ZNMA 4KA0A 4GSTA 5B7CA 2LQOA 5C04A 2LJRA 2C3NA 4PQIA 4TR3A 2FWGA 3G7JA 2H73A 3IAM2 1SKWB 1SL1B 4G9HA 2B6MA 1SD8A 2DJ3A 2H1GA 2PUKC 1Z7PA 4K0NA 4F9ZA 1TK5B 4TR0A 1EZKA 1WOUA 3EU4A 4D73A 3QOUA 4POMA 1O85A 1M0UA 3FEUA 2RM6A 2A2RA 1XVWA 4HS1A 2H0IA 1GSUA 2GS3A 5DCHA 3TB2A 1XWGA 2R2JA 1OC3A 2E2GA 2I3YA 1E6BA 4XIHA 3TUEA 2IFQB 3GN3A 4F0CA 13GSA 1PN9A 2O87A 1ZOFA 4KW6A 2ON5A 1B4PA 2C0FA 4PUFC 3RHBA 1M99A 1AQVA 1VF2A 4HZ4A 1WRYA 3J7Yb 1QUWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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