1XFLA

Solution structure of thioredoxin h1 from arabidopsis thaliana
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
114
structure length
114
Chain Sequence
MASEEGQVIACHTVETWNEQLQKANESKTLVVVDFTASWCGPCRFIAPFFADLAKKLPNVLFLKVDTDELKSVASDWAIQAMPTFMFLKEGKILDKVVGAKKDELQSTIAKHLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution structure of thioredoxin h1 from Arabidopsis thaliana.
pubmed doi rcsb
molecule tags Electron transport
source organism Arabidopsis thaliana
molecule keywords Thioredoxin h1
total genus 36
structure length 114
sequence length 114
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1xflA00
1EP7A 4O7HA 2YWMA 2YN1A 2VD0A 5IMAA 2IL3A 1TK8B 5DJLA 2H74A 2NVLA 4HQSA 1AIUA 3M9KA 1GSDA 2FWHA 3F3QA 5HFIA 4WBJA 4DSSA 4MDCA 3CYNA 2LSTA 3HHVA 4QL7A 1Z6MA 3DEXA 5HR1A 3GX0A 5A4VA 4HZ2A 1EOGA 4MZWA 1EP8A 3VI7A 4YQMA 1PRXA 3RDWA 2MZCA 2E2MA 4GSSA 3GMFA 4JU5A 2WJUA 4XIHA 5CRDA 1ZCPA 4PUAA 2VCWA 2TIRA 5CRWA 2IJYA 2CVKA 1K3YA 2V41A 3QD9A 2X8HA 4TVEA 2VLTA 2XPEA 5EVOA 1I5GA 3G9BA 1GULA 2RLIA 4AGSA 4K9ZA 1YKCA 3F0IA 1O8WA 3EU3A 1KTEA 5DDLA 1WIKA 2GDRA 1YKAA 4HU9A 4AJ7A 2PU9C 2YWIA 2HRNA 3EWLA 3VWVA 3LYKA 4EDYA 3Q19A 3TKSC 2D2ZA 5AIVA 1SD8A 5KN2A 4OCFA 3LFLA 4V2MA 4ID0A 5D9XA 2JSYA 3LEFA 1YDKA 3ZMKA 1EV4A 1GLPA 2X8CA 3L9VA 3CRUA 4XS4B 16GSA 3DMLA 1ABAA 5IMVA 2F8FA 3L9SA 2IMDA 2H75A 2DMLA 4E8EA 4HU7A 5DALA 4K1FA 3H8QA 2VL2C 3VPQA 2C0FA 2F51A 3RBTA 3NZNA 2TRXA 1M9AA 1GNWA 3BBYA 3TRXA 3HCZA 3IC4A 3TOTA 4OFTA 4K8MA 4Q5NA 3HVVA 2BTOT 5H5QA 3UVTA 4JEDA 2LNTA 4WEYA 1WE0A 4NHZA 2B5XA 3TCOA 3KTLA 4DSQA 5JWRB 3F9UA 3IK9A 3CMIA 5EY6A 2VL9A 4IP1A 4YH2A 5DAKA 4JR6A 1GL8A 4POBA 5GAPD 4ZBAA 2WZ9A 2MMZA 3ZREA 1MEKA 3KD0A 4EXJA 3W8JA 2OE3A 5ABRA 2HI7A 1MD3A 4NMUA 3KMOA 2C8UA 1LJRA 1SENA 4WKWA 4YAPA 22GSA 3KP8A 2X64A 1YZXA 2HLSA 3QAVA 2WCIA 1K0CA 5IO0A 1WRYA 17GSA 5IMCA 1HYUA 4IP6A 1M0UA 1OC3A 2LJRA 5IOWA 5DCGA 1C72A 3MDKA 4HDEA 2YJ7A 4HJ2A 4GTUA 3Q74A 1Y6EA 3G7YA 1GUMA 2B1LA 4IGJA 4LMWA 2H72A 1YF1A 2ON7A 2DJKA 1NW2A 4JR4A 4HQZA 3APSA 2CQ9A 1KNGA 2L4QA 2LJKA 3GIXA 4PGTA 5FHIA 2I3YA 1RQMA 4XRDA 4PQIA 4DSRA 1V9WA 3CTGA 3GHAA 3DVXA 2FHEA 1GWCA 4OCEA 2CVDA 3KGKA 3HJPA 2E2GA 18GSA 1YY7A 1HNAA 4AF2A 4ML6A 4RQRA 2ES7A 1EV9A 2VAFA 4BPYA 3WD6A 3DYRA 2IIYA 3P2AA 1N8JA 4XS4A 3GYKA 1XBSA 3HD5A 4G10A 3SBCA 5CNWA 4EKZA 5ELAA 3WT2A 1T8EB 1YQ1A 3HA9A 1T4ZA 1ZMAA 3HVXA 3E0UA 4GCIA 2WULA 4ZL9A 1U3IA 3IE3A 2PN8A 2JZTA 2R5GA 1T7PB 1ZGNA 4MF6A 2R3XA 3GL3A 1ERUA 5D96A 1DSBA 4HEA2 3MNGA 3QPMA 2VL3A 2LJAA 3FR9A 1M2BA 3KH7A 3NOFA 5ECOB 2GQKA 3F8UA 1TDIA 2F9SA 2VCTA 3GURA 3TJBA 5B8AA 5FT3A 2OBKA 3UAPA 3TB2A 3OR5A 1GNEA 3P7XA 3TKPA 1X5DA 3D6IA 3GX8A 3DD3A 2N5AA 4K6XA 1GSSA 3GV1A 2HZEB 1SKSB 1QUWA 4KX4A 1A2JA 2VCVA 1B48A 4TR1B 2DBCA 2FNOA 3UBLA 3TKRA 3LSZA 4G9HA 4KGIA 1A2MA 1SJ6A 1HD2A 4MH2A 2P0GA 4V2NA 4ZB6A 6GSSA 1EZKA 4TKYA 3ME7A 4K0NA 4IJIA 3EMXA 5ID2B 3F4RA 2K6VA 20GSA 2JZSA 1K0BA 3PR8A 1B9YC 1FVKA 1S3AA 3ZRDA 1ZL9A 2YV7A 1OYJA 1THOA 1TI1A 1FB0A 4BWQA 2YJHA 1OC9B 3ERWA 2LKUA 5DVBA 3TJJA 3C7MA 4V1Ag 3ZFLA 1T4YA 1Z7RA 1EWXA 2OE0A 3KP9A 3WGEA 3ZVJD 2H1AA 2LQQA 1UVZA 1R5PA 3CSHA 1TRSA 2DIZA 1GP1A 1X9MB 3F4SA 2K9FA 1U6TA 4J2FA 4L5LA 14GSA 3ZITA 3IHQA 3LQ7A 3A3TA 4YQVA 1W89A 3TUEA 1LU4A 4IVFA 2QSIA 1M2DA 2PVQA 2LV3A 4JZQA 4BL7A 1SL1B 4HUAA 4RI7A 2NTOA 4EC0A 1YJ6A 4IJ3A 4I97A 3VK9A 6GSTA 1TK0B 4PXOA 4FYUA 1GUHA 2CZ3A 1MDJA 4GSTA 3TOUA 2C3NA 3GSTA 9GSSA 4XTSA 3JCML 5ECMB 5B7CA 3DVWA 4V1Ap 6GSWA 5G1LA 2B7JA 1PD21 3FZ5A 5HR3A 5ECIB 2KOKA 1PN9A 5EL8A 4F0CA 2RM6A 1SKRB 3VPTA 2GSRA 2JSZA 2CX3A 1T1VA 4NXIA 3CTFA 1OC8A 1USBA 4OFNA 1TOFA 1TXXA 1ST9A 5HQPA 1GH2A 5GZZB 2J23A 2LEGA 4I8BA 1NSWA 3IDVA 4K7OA 5G5FA 3DRNA 3UBKA 4GXZA 2CT6A 3I69A 4I5QA 1TRWA 1UN2A 2FD3A 1OAZA 4IW9A 4FIWA 4KSMA 1TU8A 1ZOFA 4GSNA 1GTAA 3DIEA 3BCKA 2B5EA 4HOJA 2HZEA 4N0ZA 1OE7A 2K8VA 5DQSA 4JRRA 2XPDA 1XWKA 2M80A 1R7HA 2VLVA 3VWWA 1NHOA 1X9SB 3RHBA 1XWGA 4FYBA 2B1KA 3QOUA 1O81A 1R4WA 3LXZA 1B9XC 1JZRA 1FAAA 2YNXA 5CP1A 3MSZA 1E6BA 5E59A 1F6MC 1V57A 4F0BA 3ZL5A 3TDGA 5IMDA 1AQVA 2QKEA 4KA0A 1I9DA 2C3TA 1TKDB 2XHFA 4F9ZA 5COHA 3KH9A 3EVIA 4MPFA 1U88A 2CAIA 4IS0A 3MAKA 3VLNA 3HZ4A 4XCSA 4RUVA 5ECNB 1URMA 4ML1A 3CXGA 4NV5A 4HZ4A 4ZB9A 2H6YA 3I43A 1AAZA 2WFCA 2VOCA 2HSYA 3M8NA 1MDKA 2I9HA 8GSSA 3FR6A 1GUKA 1AUCA 1AQWA 3A5WA 2DJ3A 2N5BA 5JCWA 4PQ1A 2YPMA 2M46A 3TJFA 4LL4B 3A2WA 4TXOB 2JZRA 1XW9A 1HQOA 2GT6A 2AJQB 1T3BA 4MF7A 1GSEA 1K3OA 4L5OA 1TTZA 2K18A 4EF0A 2LRTA 4FH8A 2L6CA 2PPTA 2IMKA 3FY7A 1XIYA 2N5FA 4LLRA 3ZMLA 2YZHA 4N0VA 2ON5A 4EUYA 3VURA 3KM6A 2IFQB 2NBSA 5ELGA 4OFMA 2GZZA 4PUFC 3CSIA 1BAYA 2H0HA 1RK4A 3F6DA 2EIOA 1DUGA 3GSSA 2H70A 3R2QA 2P5QA 5D73A 3TJKA 4KSOA 1Z3EA 1GRXA 1GLQA 1AQXA 2RIIA 1Q98A 5F05A 2YWNA 1M99A 3M9JA 4WXTA 3ZVJA 1JZOA 1SU9A 2CV4A 3HJOA 3FZ4A 3TKSE 4TR4A 1BQ7A 2C80A 2HT9A 5JCUA 3QAWA 2WDUA 4ECIA 4PNGA 1VF2A 5DJMA 3LGCA 1PSQA 4GWRA 1X5CA 2H71A 3GNJA 4OO4A 4D73B 1SYXA 1TI3A 4Q5QA 2HYXA 3QAGA 3HKRA 3CRTA 4ECCA 1XWAA 1XVQA 1TU7A 4ZB8A 2ZCTA 1SL0B 1YEXA 2YWOA 1RW1A 4K2DA 1ERWA 1FVJA 1J0FA 4RI6A 3GKNA 4TR3A 2I1UA 4TXVA 2MYGA 5KN3A 1AXDA 2H0IA 4RQXA 4J56E 3FYGA 4K0GA 1KEBA 5AISA 2HNLA 1LBKA 3PINA 2WB9A 4TR0A 3QMXA 5H5RA 5F0GA 2HRFA 4L8EA 3J7Yb 3IAM2 3D21A 2GT5A 2VCZA 4FYCA 1S3CA 4KCEA 1ZZYA 1ML6A 2L59A 3C1RA 5D93A 3GTUB 5G5EA 2YOIA 4ILFA 5G2ZA 1VGLA 3KMNA 1BJXA 1HNBA 4E8HA 1K0DA 4L0WA 2DC5A 2FY6A 4HS1A 2GSQA 5DCHA 5CO3A 4AJ6A 5CAXA 1F3AA 2OJLA 3FEUA 4BWSA 1XW5A 4PX1A 2LTKA 13GSA 1WMJA 2GQLA 2CA8A 3UOMA 3QR6A 3ZYWA 3QDNA 1AC1A 3DWVA 1ILOA 1GTUA 3UMAA 4ZBDA 3GKKA 4MJCA 2LRNA 4O32A 4WR5A 2OADA 5D9WA 3KZQA 5INYA 3US3A 5B8BA 4NAXA 2PERA 4NV2A 1Z5YE 4OWYA 4PURA 3QFAC 1GSQA 4V2LA 5ECSA 3C71A 3D4TA 1PX6A 1V2AA 2PMTA 2WS2A 2HZFA 3HXSA 1PA3A 2RUEA 1SK0A 2V2GA 3FZ9A 1TK5B 3APOA 3A2XA 2PGTA 4XS6A 3HYPA 3ZIJA 4YQUA 1XOAA 3VWXA 3H79A 4QL9A 1O73A 3ZFBA 1XW6A 4WETA 3GFKA 1U87A 2EIRA 4HI7A 1NHYA 4POKA 5HFKA 1QXHA 2I81A 1QGVA 1O6JA 4KDUA 1XWBA 1OVNA 4EO3A 5G31A 1HNCA 2FA4A 5KN0A 1MTCA 3A2VA 3LXTA 4X1UA 1Z9HA 4ULXA 1G6YA 5DBQA 3FRCA 4JBBA 2M72A 3P90A 1GSYA 2IMIA 4IN0A 1A24A 4K7NA 4DSSB 2GGTA 7GSSA 5JWQB 1EOHA 2O87A 3GL5A 2FWEA 1Z7PA 2HE3A 3WT1A 5HFGA 1M9BA 2DJ1A 5LNKe 2DLXA 3APQA 3UVHA 3TKQA 2C0DA 4PNFA 4OD7A 5A4UA 4OO5A 3M0FA 3ME8A 4Q5RA 2Z9SA 2EIQA 5A5KA 1A23A 1QQ2A 3VI5A 1K0MA 2H1BA 2WRTA 4MPGA 4ZL7A 5CYYA 2VCXA 1ZYQB 1ACVA 3WGXA 5CREA 5GAND 1NM3A 1XCCA 2OBIA 5F8BA 5G1KA 1SJZA 3PH9A 1QMVA 2H66A 1OE8A 4IHUA 1OKTA 3C8EA 1F2EA 1DE1A 5IPGA 1CQGA 4MJEA 2GZYA 4N10A 1F37A 1BYEA 5J4UA 2XBQA 1WJKA 4X43A 4KCAA 4KE3A 3TRQA 5J9CA 5IO2A 2AYTA 3D4MA 5CRHA 4FO5A 3KJYA 5J41A 3GKMA 2CX4A 3D5JA 2E0QA 2V1MA 5L71A 4BVYA 1JFUA 4Q5FA 3DGQA 5AGYA 1PGTA 1TJDA 4LMVA 1DE2A 1QFNA 1S3DA 4IBPA 1GSUA 1VF3A 2DMMA 2BMXA 2GVPA 3IOSA 3TJGA 2A4VA 2V32A 3EE2A 3U5RE 2ZUPA 3ISOA 4NWYA 5KEJA 3ZTLA 3L0HA 3F6FA 5DALB 2G0FA 2C0GA 3UJ1A 2L57A 3P8WA 2OA7A 4GRFA 2MBTA 4NPBA 4XHMA 4MH3A 1XZOA 4WF4A 2QGVA 4MMMA 5IMFA 4J57E 3ERFA 3RHCA 1K0AA 3BJ5A 2TRCP 3GN3A 1EEJA 5G30A 1A0RP 4AJ8A 1ERVA 3LWAA 4MZBA 2BJXA 2XC2A 1UA5A 1VRSD 5J3RA 3N9JA 4TRXA 4ZXGA 1GTIA 4IELA 1X0RA 3Q6OA 3FK8A 3HVSA 4MA9A 2OE1A 3FW2A 2IN3A 4MF5A 2B3SA 5DAKB 1SL2B 2H6ZA 4I2TA 2ALBA 4F2IA 1H4OA 2P5RA 3C1SA 5IMZA 4CHSA 5A4WA 4TR1A 3I6AA 3IBHA 4POLA 2DJJA 1WOUA 2REMA 3LJRA 6GSUA 5ECPB 3SWLA 3CSJA 4GQFA 4MK3A 2I4AA 1PX7A 3FR3A 4KUNA 3MWHA 5ID2A 1B4PA 1FOVA 2FUG2 2GS3A 3KEBA 4P3YB 3QFBC 1B8XA 4ZILA 3PGTA 3S9FA 5F07A 2IPAA 1G7EA 3WYWA 1K3LA 2RUFA 2F8AA 4LA1A 5ECQB 5ECLB 1PKZA 1XOBA 2KP1A 1OC9A 2VO4A 3RAZA 2YV9A 1IYHA 5D8IA 2PUKC 2KLXA 5J9BA 1FO5A 1BG5A 5J5NA 2PWJA 2YP6A 4Z7XA 4WF5A 1A0FA 2L5OA 3H93A 1N2AA 2GSTA 3GKXA 3KXOA 5HR0A 1A8YA 1F3BA 3J7Yk 2LUSA 3C73A 4CDOA 2DJ0A 4JE1A 2WGRA 2CVBA 3GH6A 2VD1A 4KH7A 2F3MA 2GTUA 2AB6A 2A2SA 3HZ8A 4N30A 4F82A 4O92A 2FLSA 3WGDA 2B6MA 2P31A 5GSSA 2JACA 5D9TA 1CQHA 2OKAA 3VWUA 6GSYA 4I6XA 1DBYA 3U6VA 4MLYA 1KBNA 2B7KA 4KAEA 5ECKB 2H76A 1VF1A 1TRUA 1JLVA 3LORA 1XVWA 2YZUA 1X5EA 1FG4A 1ZYEA 3M3MA 3I9V2 1PMTA 1EGOA 2AV4A 2VIMA 4PQHA 5AIXA 2PBJA 3FZAA 4TW5A 3GUSA 2LQOA 4EDZA 2LNSA 1SD9A 1XWCA 4O5RA 2E7PA 4ISDA 2AHEA 4BVXA 2GZPA 2OACA 2V6KA 5H5SA 4EE0A 1TW9A 1THXA 2DJ2A 1Z6NA 3HJMA 19GSA 4KW6A 2FWGA 5AN1A 1O7UA 4NHWA 2YANA 3ZIVA 2H01A 2O85A 2CZ2A 5C04A 4QQ7A 3HY2A 3ED3A 4L0UA 4MJAA 1T00A 1WWJA 3DKSA 5IQYA 2YCDA 1XPVA 4GF0A 2HFDA 3FKFA 3W6GA 3M1GA 2C4JA 3G7IA 1W4VA 4MP4A 2VM1A 1EEMA 4EL1A 3DXBA 4XS1A 4GLTA 12GSA 1B4QA 4ACSA 2NPBA 1FB6A 10GSA 3W8SA 3G7JA 3EURA 2G2QA 2AUVA 1J08A 3NIVA 3L4NA 2R4VA 1X9WB 4XRAA 2FWFA 1G6WA 4WR4A 3IA1A 3KCMA 4POMA 1WP0A 3EC3A 3L9UA 3E9JB 3K8NA 3UARA 2KUCA 2V6OA 1JZDA 1V58A 3IK7A 2R6KA 3UIWA 3QCPA 5ECHB 3D0ZA 4X0XA 5E4WA 3IV4A 1BEDA 2VM2A 4TXOA 4KB3A 2PVOC 2H30A 3EMPA 1M2AA 4KDXA 2LRCA 4I2UA 1WPIA 3O3TA 1QK8A 2H1DA 5IOXA 1TRVA 2IMEA 3RPNA 4BA7A 1SJIA 3D22A 1YF0A 3KTBA 1U3AA 1GSFA 5JWOB 2KP2A 2H1GA 2GSSA 2IFQA 1JHBA 3CBUA 5F06A 1A2LA 1SYRA 3EU4A 3TGZA 1FW1A 2J9HA 5KN1A 5B6NA 5ECRB 4MABA 1TP9A 2HSHA 2DIYA 2CAQA 1JZWA 5JCGA 5IM9A 5B6MA 1O85A 3AY8A 1A8LA 2LS5A 3BCIA 4LL1B 2MMAA 1M7TA 2GQMA 1SK1A 2MBSA 3Q18A 4WBRD 4IQ1A 5GSTA 3HDCA 5DQYA 3GA4A 1G0TA 5ENUA 3BOAA 3F63A 5C00A 1K0OA 3IRAA 3F4TA 4TN8A 1JLWA 3ZLPA 2K8SA 2XBIA 4D73A 1Q4JA 1K0NA 2C3QA 4CW9A 4ECBA 2L5LA 4MCUA 1ERTA 2X99A 2H73A 3FHKA 3TRPA 3V1WA 1PKWA 5HR2A 2IWTA 4F03A 1F9MA 1O8XA 6GSVA 1PQNA 4ZL8A 3TKSA 2KHPA 1MDIA 2EC4A 1MD4A 1GTBA 2QC7A 4DEJA 3UL3A 3H1NA 1PL2A 3VFIA 2C1YA 1PL1A 2DSAA 2VCQA 2VUPA 4ZBBA 2B5YA 4ZIJA 5IPHA 2R37A 3IR4A 2VL2A 4IQAA 1Y25A 1SKWB 3ZZXA 3GTUA 1XXUA 3IPZA 5FWGA 3IXRA 4N11A 5IIZA 5LD0A 3IAS2 6GSXA 2C0EA 3ERGA 4ECJA 3KIJA 2RM5A 4MJBA 11GSA 2HXKA 3LYPA 1G7OA 3GRXA 3BD2A 2JU5A 3EYTA 2A2RA 2X8GA 4G19A 4KDYA 2NDOA 4EVMA 2FGXA 4MZCA 1SK2A 3L78A 5LCZA 1V40A 2L6DA 2JL4A 1FHEA 2R2JA 2GLRA 1AW9A 3GH9A 3O76A 1ON4A 4TOPA 3F3RA 1UC7A 4OMVA 3O6TA 1R26A 2MMNA 1EGRA 2FA8A 2H0GA 4GQCA 1VF4A 1H75A 4HJMA 2O89A 3E3EA 2H6XA 4G2EA 3RPPA 1XFLA 2FCHA 3UEMA 1OKDA 1J9BA 2JADA 2O7KA 4DVCA 1YEPA 2L4CA 2H8LA 3N5OA 5D9VA 1IYIA 5EPFA 2O8VB 1BX9A 1E2YA 2H19A 4K7IA 5CRGA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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