1XOBA

Thioredoxin (reduced dithio form), nmr, 20 structures
Total Genus 33

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
SDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
TIV1 (1-4)S1 (5-7)AH1 (9-16)TI3 (60-63)AH3 (65-70)S2 (22-28)TIV3 (59-62)TI2 (29-32)S3 (54-59)AH2 (33-49)TIV2 (50-53)TIV4 (61-64)EMPTYS4 (77-82)TIV5 (74-77)TIV6 (81-84)AH4 (96-107)TII1 (49-52)TI1 (16-19)S5 (85-91)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Electron transport
source organism Escherichia coli
publication title High-resolution solution structures of oxidized and reduced Escherichia coli thioredoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN
total genus 33
structure length 108
sequence length 108
ec nomenclature
pdb deposition date 1995-11-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1xobA00
1A8YA 2H71A 2QC7A 2ES7A 2AYTA 2PN8A 4JEDA 2H1AA 4OFNA 2O87A 2DJ3A 1TU7A 4BL7A 5FWGA 5HFGA 2FD3A 2FWEA 2H30A 1XVQA 4RQXA 2V2GA 2GLRA 4BWQA 2P5RA 5B6MA 1V40A 5COHA 1EZKA 5JWQB 5ID2A 5CRGA 1KBNA 4MF5A 3DWVA 5CRWA 2H6ZA 4JR4A 1Q98A 3LYKA 1SKSB 1XWKA 2VCXA 3GYKA 1GSEA 2LEGA 5LD0A 1TP9A 3TKSE 2HSHA 2YV7A 1K0AA 2L59A 5CO3A 1AW9A 1Z7PA 2LS5A 3VI7A 1R7HA 4ZBAA 4IGJA 1J0FA 2TIRA 1EV9A 3VWUA 3TJGA 5CRHA 4JZQA 4EE0A 5DCGA 4V2LA 1X5CA 2PVOC 2YANA 2GT5A 4JE1A 4HOJA 1XZOA 2G0FA 1K0BA 2NPBA 2G2QA 1PX6A 2X99A 1THOA 5DALA 4RUVA 3UL3A 5JWRB 4WXTA 5H5RA 3CTFA 2O85A 4PURA 3WT2A 5A4UA 4AJ8A 2LQQA 3TJJA 3W8SA 4HDEA 4ZXGA 1EOGA 1O8WA 3KMNA 2REMA 4FYCA 4MH3A 1MD4A 1EGOA 4Q5QA 5CREA 2WCIA 3IOSA 4HU7A 4MJCA 3KCMA 3HA9A 3E9JB 4IKHA 4BVYA 3MSZA 6GSYA 3KZQA 4Z7XA 3HKRA 1NM3A 1XBSA 4J56E 4WR4A 1M99A 22GSA 3E3EA 1R5PA 3K8NA 2H0IA 3ZYWA 4F82A 1TDIA 1OVNA 1SYRA 3VFIA 2VD1A 2DIZA 2MBTA 5IMCA 2IFQA 4EKZA 4WEYA 1XW6A 3PINA 2M46A 2FWGA 2YJHA 1MTCA 1XW5A 1N2AA 1SK0A 4X0XA 2DMLA 1ERVA 1RK4A 3C1SA 4LA1A 2P0GA 2F9SA 1T3BA 1A2JA 3GFKA 2C80A 3ME8A 4NMUA 4Q5RA 4I97A 3TGZA 2C1YA 4TRXA 1V57A 3DYRA 4KNDA 2ALBA 3GX8A 3GX0A 4YQVA 1SJIA 1SK2A 1GTIA 5ECKB 1SENA 2B5XA 5GSSA 5HR2A 3IK7A 1JZOA 3WGEA 5J41A 1VF2A 3L9VA 1URMA 2QKEA 2HT9A 3GL5A 1B4PA 1U3AA 3HJOA 3VWVA 1X9MB 1JZDA 2RIIA 3QPMA 1OYJA 2LNSA 5IMVA 4TR4A 1K3YA 3M3MA 4KE3A 1GSSA 2X8HA 2JACA 2GT6A 1BX9A 3F4RA 3GN3A 2IMIA 2ZUPA 1XFLA 1XIYA 2A2SA 5KN2A 2DMMA 1Q4JA 2YPMA 1S3DA 1JHBA 1TI3A 3GH9A 2YWOA 1GTBA 2L6DA 2YV9A 5EPFA 2F8AA 1BEDA 1U88A 3WYWA 2WB9A 3EC3A 4EUYA 1K3OA 1JZRA 2L5OA 3D0ZA 4IQ1A 5HQPA 2VL3A 2MMNA 4POMA 4I6XA 1GUMA 2PVQA 4N10A 3KP8A 3BCIA 3GV1A 3UBKA 1M2AA 4K8MA 5IOWA 4HJMA 1XWGA 2FWHA 3PGTA 3P2AA 4O5RA 1U6TA 11GSA 2IMEA 3FZ5A 7GSSA 4IP6A 2VOCA 3QCPA 3L78A 3L9UA 1QGVA 1XWCA 4N11A 3MDKA 1SK1A 1YZXA 3HVXA 2VD0A 4MA9A 1K0MA 2J23A 3P7XA 3GTUA 2V6OA 6GSTA 3FR3A 4O92A 3EE2A 2JADA 3KEBA 4KSMA 2N5FA 3KIJA 1DBYA 3QFAC 1KNGA 1Z3EA 2PU9C 2GDRA 16GSA 5IM9A 1Y25A 4MMMA 3F4TA 2IMKA 4YQMA 1SD9A 1GNWA 1TI1A 1M2DA 2FLSA 3QMXA 4HZ4A 1EWXA 1VGLA 4G19A 1XVWA 2LRTA 5J5NA 1M0UA 4TR1B 5D9VA 1TRWA 2I4AA 1X0RA 1H4OA 4TN8A 4KB3A 4RQRA 1K3LA 4IP1A 2OE3A 4AF2A 2CZ2A 1LJRA 4MH2A 1X9SB 1QMVA 4MF7A 2YWMA 5EL8A 2C8UA 3VWWA 1A24A 4ZBBA 5CYYA 1VF3A 2CX4A 1K0DA 4GSNA 4K7IA 1CQGA 2HRNA 3GSSA 4YQUA 4NV5A 2RM6A 1YF0A 6GSSA 2IJYA 3KD0A 2CQ9A 2PMTA 3VWXA 1GTAA 4F2IA 3HZ8A 3TB2A 1N8JA 1Z9HA 2H73A 5KN0A 2V32A 4JU5A 1G7EA 2RLIA 4FYBA 3F6DA 3GKMA 1F3BA 1WWJA 2C4JA 2R2JA 2X64A 3VURA 3TJFA 4OMVA 4JBBA 3IAS2 4K7NA 4DSQA 2DJKA 4HJ2A 5F0GA 4EVMA 14GSA 3HHVA 4V2MA 5F8BA 3Q19A 5E59A 3DVWA 4PQHA 1IYIA 5B8AA 4AJ6A 2LKUA 2FGXA 2I1UA 1X9WB 5J3RA 4KDXA 10GSA 5DVBA 4TKYA 1QUWA 2VM2A 2I3YA 3FZ9A 2FHEA 3HYPA 3A5WA 2O7KA 1OC8A 2FA8A 4PNFA 3GHAA 1C72A 3GUSA 1YF1A 5ECPB 1PL2A 3EINA 2V6KA 5IMZA 1FVKA 5DQSA 1ST9A 1Z7RA 1GSQA 1FVJA 2RUEA 5JCGA 1XWAA 5IMFA 3WGDA 1PSQA 1B9YC 3VPQA 5F06A 3VK9A 3RHBA 2NVLA 5A4WA 2B7JA 2I81A 5HR0A 3HJMA 3I69A 1O7UA 3GKXA 2OBIA 1JZWA 2LV3A 1A2MA 2MMOA 1WMJA 1AQWA 5ELAA 3QAGA 3KTBA 3GMFA 1ZL9A 3A2WA 4XTSA 1YKCA 2GZPA 1K0OA 4I8BA 3H8QA 2TRCP 4O7HA 2BJXA 2NDOA 4TR0A 4F0CA 3LXZA 3U6VA 2IIYA 2EIQA 1XW9A 1EEMA 1F9MA 3GNJA 3LFLA 4WETA 2CZ3A 3LG6A 2DJ2A 1FB6A 4TR1A 3HJPA 4J57E 3US3A 2CX3A 2E2GA 3ZIVA 3F3RA 2OADA 3UMAA 1XCCA 4PX1A 2R5GA 2XBQA 2P5QA 5IO2A 3M1GA 1OKTA 2R3XA 3IR4A 4MZBA 2H19A 5D73A 2VO4A 3FR9A 3CSHA 5G5FA 5HR3A 5DQYA 4ID0A 2CAQA 5L71A 3ZREA 3M9JA 1PKZA 5G31A 4Q5FA 4LLRA 2LRCA 4HQZA 2GQMA 3FK8A 3MWHA 2QSIA 5JCUA 3W6GA 2GZYA 4MJBA 1GP1A 5AISA 4MPGA 1AUCA 4ZILA 1R4WA 3IA1A 5AGYA 5ECQB 3C8EA 1HNBA 1ZYQB 2HNLA 1GNEA 2H66A 3ZLPA 3F8UA 1PL1A 2OA7A 3VLNA 3O6TA 3R2QA 4ZL7A 5ECRB 1A0RP 5DBQA 1ABAA 2MMAA 4AJ7A 2K8SA 5AIXA 1J9BA 3O3TA 4D73B 2RM5A 4OD7A 2LJRA 4MZCA 3TKQA 1LU4A 3CTGA 4E8EA 1PD21 6GSXA 1ACVA 4XCSA 2DSAA 3CMIA 3GTUB 2VAFA 4ISDA 4K9ZA 2JZSA 1SL1B 3DMLA 3GRXA 2JL4A 4ML6A 4IBPA 4TW5A 5IPHA 1GUKA 3JCML 1TU8A 2JU5A 4MCUA 1B9XC 3DKSA 3UJ1A 3H93A 1E2YA 2DIYA 5GAND 1ILOA 1F2EA 3D22A 3DD3A 3IK9A 1FW1A 2AB6A 6GSVA 1V2AA 3ZVJD 5DAKB 4GXZA 1K0CA 2R4VA 4BPYA 3O76A 1GL8A 1FG4A 2P31A 2AHEA 2B5EA 4ECBA 1K0NA 2KLXA 2WULA 2BTOT 3HVVA 3C71A 4TR3A 4ZB8A 3MAKA 3Q18A 1WE0A 3F9UA 2C3TA 3APQA 4XRAA 3IBHA 3GH6A 1TRSA 3F0IA 4ULXA 5DDLA 2H70A 5IQYA 3G7JA 4KA0A 3TCOA 4TVEA 1DE1A 3IC4A 3M8NA 3QFBC 4OWYA 2ZCTA 1Y6EA 4GF0A 3UEMA 4NHWA 4ZB6A 4HUAA 3DIEA 4KX4A 3EMPA 3EWLA 4HQSA 5GSTA 5KN3A 2VCQA 2N5AA 1WJKA 5GZZB 4J2FA 2XPEA 1GSYA 1G6WA 5D93A 1SJZA 2PERA 3KMOA 4GLTA 2WS2A 2GSSA 4L0UA 1U3IA 1JFUA 3ZIJA 1YEXA 3IDVA 4OCEA 2WJUA 2BMXA 2K6VA 4NV2A 2DJJA 1TRVA 3ZMKA 1ML6A 4KCAA 4ECJA 1ERWA 4G2EA 3UBLA 3EURA 4MP4A 4H86A 2B7KA 5J4UA 3L0HA 1WIKA 1ERUA 1G6YA 2DJ0A 5F05A 4P3YB 1MDJA 1HD2A 3D4TA 5D9TA 3QAVA 1FOVA 4XIHA 2V1MA 1WRYA 4WBJA 4EXJA 3HCZA 2YOIA 2YNXA 2IPAA 1FO5A 1I5GA 8GSSA 1PRXA 3CBUA 4F0BA 4D73A 4LMWA 13GSA 4JR6A 2GGTA 12GSA 4EC0A 4K2DA 1TTZA 2H1GA 2WDUA 4ZB9A 3WGXA 2X8GA 4WF4A 4XS4B 5HFKA 2L5LA 1M9AA 2PUKC 5B7CA 2IMFA 1Z5YE 2A4VA 1SYXA 1F6MC 2HSYA 4IS0A 3IPZA 1OC9B 5D9WA 3ZL5A 5G1LA 5B6NA 2NBSA 1OKDA 1J08A 4OFTA 4ILFA 1SJ6A 4K0NA 2C0EA 1XWBA 5DCHA 2EIOA 5DAKA 2VCTA 4RI7A 1ZYEA 1GWCA 2M72A 3WT1A 1NHYA 2IN3A 3ZFLA 1H75A 2VM1A 1FAAA 1NHOA 4L8EA 4BA7A 2VLUA 1GSDA 3FW2A 1QK8A 2F8FA 2YN1A 1AQXA 5A5KA 1AAZA 4MZWA 5DJMA 2H1DA 1YY7A 1V9WA 3ZZXA 5EY6A 3RPNA 5D96A 4FO5A 1X5EA 2YZUA 3DXBA 5KEJA 4LMVA 4E8HA 3GA4A 1YKAA 2V41A 3FZAA 3KTLA 1ON4A 4PQ1A 5KN1A 3BOAA 1MD3A 3CRTA 2IL3A 3FHKA 1ZGNA 1Z6NA 1XXUA 4XHMA 1SL0B 4GWRA 4MLYA 2L4CA 2YWIA 1S3CA 4KW6A 2KP1A 1WPIA 1O85A 3F3QA 1YDKA 4KSOA 1TW9A 3ISOA 2X8CA 3TKRA 4OO5A 1PQNA 4ZL8A 3FZ4A 3C7MA 1AC1A 3CXGA 4IELA 2WRTA 3DGQA 1GTUA 5IPGA 4PUFC 1G7OA 3Q74A 1EP8A 1JLVA 2WFCA 3P90A 4TOPA 1GRXA 3WD6A 3FKFA 3VPTA 3J7Yk 1MDKA 4K0GA 4FIWA 3DRNA 4GTUA 2CVDA 3HD5A 2L6CA 4N0VA 3D5JA 1UC7A 4HU9A 5ELGA 4L0WA 2H76A 3J7Yb 4ZBDA 1OE7A 4F9ZA 18GSA 5AN1A 2H6XA 2AAWA 1TJDA 4IVFA 1S3AA 2DBCA 4PUAA 1PKWA 9GSSA 3KH9A 5FT3A 1KTEA 2HZEB 4CHSA 4XS4A 5FHIA 2FA4A 1SKWB 4X43A 1B4QA 2H0GA 1GLQA 2VCVA 4IW9A 1PGTA 5G30A 5LCZA 3A2VA 1OC9A 2OE0A 3PR8A 5D9XA 2IWTA 2HRFA 2C0DA 4NHZA 3FEUA 4POKA 1HNCA 3HXSA 1O8XA 5ECIB 1YJ6A 5J9CA 3VI5A 5INYA 1BJXA 2LJKA 2DJ1A 1HYUA 2E7PA 2K18A 2HE3A 1PMTA 3ZFBA 2JZRA 2C3NA 1TK8B 2GQLA 3TKPA 4BWSA 3D6IA 4NWYA 4KDUA 5G1KA 1CQHA 1Z6MA 4PGTA 1F37A 4DSRA 2L57A 1WOUA 1BYEA 3DEXA 2AV4A 4L5LA 3RHCA 5C04A 1SKRB 1TOFA 3GSTA 3P8WA 4MK3A 2JSYA 5GAPD 2ZNMA 1U87A 2Z9SA 2XHFA 2H75A 3HY2A 3LQ7A 3EU3A 1UA5A 2OBKA 4RI6A 3KH7A 4MABA 1RQMA 3V1WA 1G0TA 5CP1A 4PQIA 1GLPA 1I9DA 3H79A 3UARA 4HZ2A 2ON7A 2YP6A 2VIMA 3KM6A 2LTKA 2GQKA 4XS1A 3TRXA 2GTUA 3RDWA 1BAYA 3ME7A 2YWNA 1YQ1A 2LJAA 2LNTA 2O89A 1EP7A 2XPDA 3GKKA 5IOXA 2JSZA 3BJ5A 5ECSA 2J9HA 1R26A 4I2TA 5J9BA 2WGRA 4IJ3A 2NTOA 2GS3A 4PXOA 5AIVA 3M0FA 1A0FA 1DUGA 2FUG2 2DC5A 2K8VA 2OJLA 2OE1A 3UOMA 2OACA 1B48A 3LEFA 4IN0A 2MZCA 2B1LA 4FH8A 4MDCA 2AUVA 4WBRD 5D8IA 4QL9A 5A4VA 1QFNA 1PX7A 1USBA 4LL1B 4K7OA 1O73A 1SD8A 1XPVA 1VF1A 3C1RA 4XRDA 2E0QA 3BD2A 3CRUA 3F4SA 3IAM2 2HZEA 1YEPA 4GRFA 4HS1A 4TXOB 3TUEA 2B6MA 4ACSA 3TDGA 5ECLB 4XS6A 4NXIA 3HVSA 1XOBA 2QGVA 1A23A 4ECCA 1E6BA 3C73A 3A3TA 3ERFA 1IYHA 4KGIA 1LBKA 1F3AA 2PPTA 4WR5A 4EO3A 5G2ZA 1T7PB 2YJ7A 2L4QA 3ZITA 1VF4A 2FCHA 3TJKA 5HR1A 4GQCA 1T00A 1AIUA 1TK5B 2C0GA 2K9FA 4EDYA 1VRSD 1FHEA 1W89A 3I9V2 4HI7A 4N0ZA 1T4YA 2B5YA 3HDCA 2CAIA 1DE2A 2CT6A 1UVZA 4V1Ag 3IRAA 2YZHA 1KEBA 1V58A 2AJQB 3SWLA 5HFIA 1GULA 3W8JA 3BCKA 3RBTA 1ZCPA 1TKDB 4YH2A 3GURA 6GSUA 1MDIA 1TXXA 4POBA 5ECOB 3GL3A 3LSZA 2XBIA 5DJLA 2H72A 2MBSA 1TRUA 1M7TA 4G10A 3MNGA 2FY6A 2MMZA 1SU9A 1ERTA 4N30A 4CDOA 5B8BA 3APSA 2I9HA 2KHPA 1ZMAA 2JZTA 3NZNA 2RUFA 2HI7A 4KAEA 1NSWA 4CW9A 1BQ7A 3TKSA 3PH9A 3TRQA 3G9BA 4K1FA 2KUCA 3U5RE 5IIZA 17GSA 1BG5A 3BBYA 1AXDA 3ZRDA 3QR6A 1PA3A 1JLWA 4DEJA 2MYGA 4PNGA 2CVKA 2A2RA 2H1BA 3QD9A 4IHUA 3DVXA 1OC3A 3UVHA 2CVBA 4V1Ap 4DSSB 4BVXA 2C0FA 2LSTA 3QAWA 1GH2A 3LXTA 2E2MA 1RW1A 3EVIA 3ED3A 3NOFA 3APOA 4MF6A 2F3MA 2HYXA 5IO0A 3N9JA 2HXKA 1DSBA 4JRRA 4MJAA 4GSSA 4Q5NA 3KP9A 2IMDA 4EL1A 2B3SA 2YCDA 3CSIA 3FY7A 3I6AA 4KDYA 5H5QA 4IQAA 5ECHB 3A2XA 4EDZA 1R5AA 5E4WA 4YAVA 4GQFA 1XOAA 19GSA 2H74A 4LL4B 6GSWA 3UAPA 3LJRA 4I2UA 2VUPA 1ZOFA 3EYTA 5CAXA 2LUSA 1EGRA 2CA8A 1THXA 3FR6A 3L4NA 3M9KA 1V98A 3F6FA 4MPFA 2VL2A 3HZ4A 2PWJA 4QL7A 3TOUA 4TXOA 1GUHA 1QQ2A 5IMAA 3ERGA 2VLTA 1M9BA 1EEJA 1A8LA 3CSJA 2FWFA 5C00A 2VLVA 5JCWA 2HZFA 2ON5A 3EU4A 2VL9A 4I5QA 4POLA 1T1VA 5EVOA 1OE8A 2OKAA 1O6JA 2H6YA 3S9FA 2PGTA 2H01A 2TRXA 5F07A 4ZL9A 3TOTA 4WF5A 3D4MA 3ERWA 3I43A 3ZMLA 3AY8A 1SL2B 1UN2A 2HLSA 3IHQA 2XC2A 5ID2B 3L9SA 4L5OA 5ENUA 4OFMA 1PN9A 3TKSC 4FYUA 3UVTA 1HNAA 1T8EB 4TXVA 5ECNB 2DLXA 2GZZA 2O8VB 2FNOA 3CYNA 3F63A 3IE3A 2GSTA 4ECIA 4HEA2 3G7YA 3EMXA 4O32A 4KUNA 3H4KA 2M80A 1WP0A 4WKWA 1QXHA 4QQ7A 2HFDA 5ECMB 2F51A 4MJEA 3ZVJA 3ZTLA 1HQOA 1ZZYA 4GSTA 3KJYA 2C3QA 1GSFA 3LORA 4KCEA 2EC4A 3IXRA 1T4ZA 2LQOA 4IJIA 1MEKA 1EV4A 5H5SA 5DALB 3G7IA 2CV4A 1AQVA 2GSQA 3RAZA 4V2NA 3TRPA 3IV4A 2VCZA 5CRDA 4K6XA 2D2ZA 3H1NA 3E0UA 3KXOA 4OO4A 3SBCA 4G9HA 4DVCA 1O81A 4OCFA 2B1KA 3QDNA 4DSSA 2N5BA 5ABRA 1A2LA 3OR5A 2VL2C 1FB0A 20GSA 4GCIA 4EF0A 4KH7A 5LNKe 2VCWA 2H0HA 3NIVA 1X5DA 3UIWA 4ML1A 2WZ9A 3N5OA 4F03A 2R6KA 3D21A 2KP2A 5G5EA 3RPPA 2H8LA 3GIXA 1TK0B 5IMDA 3LYPA 3LGCA 2PBJA 2GSRA 1M2BA 2GVPA 5JWOB 3Q6OA 4NPBA 4NAXA 4AGSA 1EOHA 3FRCA 1NW2A 1B8XA 3LWAA 1W4VA 5CNWA 2IFQB 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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