1XW9A

Drosophila thioredoxin, oxidized, p21
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
106
structure length
106
Chain Sequence
MVYQVKDKADLDGQLTKASGKLVVLDFFATWCGPCKMISPKLVELSTQFADNVVVLKVDVDECEDIAMEYNISSMPTFVFLKNGVKVEEFAGANAKRLEDVIKANI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Comparative structural analysis of oxidized and reduced thioredoxin from Drosophila melanogaster
pubmed doi rcsb
molecule keywords thioredoxin
molecule tags Electron transport
source organism Drosophila melanogaster
total genus 36
structure length 106
sequence length 106
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-10-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1xw9A00
1A8LA 2X8CA 3P7XA 2LEGA 2VAFA 4ZXGA 1OAZA 5ECLB 1B4PA 5ENUA 3GTUA 2JSYA 2AB6A 3HHVA 5IIZA 4YQUA 2VIMA 1F9MA 5F05A 1MDJA 1FVJA 1M2BA 3C1SA 4GQCA 3LGCA 2YZUA 1R4WA 4CDOA 2IFQA 3F4TA 4K1FA 6GSTA 2KOKA 2HZEB 2WS2A 3D21A 1GSEA 3UVHA 5IMVA 4G10A 2IN3A 4IP1A 4HZ4A 4XTSA 1JZWA 2WFCA 3VPTA 2K9FA 1ZYEA 4XS4B 3O76A 1IYHA 5EPFA 1OC3A 3BOAA 1ZL9A 5DAKB 4KB3A 3VWVA 2DBCA 5JCUA 4BL7A 3PH9A 2V1MA 2J9HA 4EDYA 3GIXA 4D73A 3P90A 1ZCPA 3ZMKA 2DLXA 1SL1B 2H70A 2B1KA 2OE3A 3IK7A 2VL2A 1V9WA 3ZYWA 5L71A 2K8SA 2GSQA 2V32A 2R6KA 2O8VB 1O8XA 1VF2A 3F4SA 3UAPA 4PQHA 1ZGNA 3CSJA 2PPTA 1A2MA 2H0IA 4GQFA 2HSHA 4XRAA 2NDOA 1GTAA 2RM6A 5B7CA 2JACA 2FY6A 2HT9A 5DQSA 1SD8A 3U5RE 2LJAA 2KHPA 4L5OA 1JLWA 3ZREA 4CHSA 4ZB8A 5LD0A 1U6TA 13GSA 4TVEA 2L4QA 4HQZA 4ILFA 4V1Ag 1CQHA 2AUVA 2GSSA 2I1UA 3F8UA 2E2MA 1R5PA 4MZCA 5GSSA 1PRXA 2E0QA 3LYKA 1NHYA 3ZIJA 4PURA 3Q19A 3VWWA 3ERGA 2GSRA 2GQKA 1TKDB 2HNLA 1XWCA 4RI6A 4BPYA 2KP2A 1AQWA 4KSOA 3GV1A 4XS4A 4ZILA 5IPGA 3FHKA 2CAIA 5DAKA 2PN8A 1GULA 2GTUA 1PD21 4ECBA 12GSA 2XBQA 2R37A 2AAWA 3TDGA 1EV9A 2NBSA 5JWRB 2YWNA 4WXTA 2MMZA 4KSMA 1GLQA 4JZQA 4IKHA 1I9DA 4XCSA 1ZOFA 5A4WA 3HDCA 1K0DA 1TW9A 4EVMA 3BBYA 5ECPB 1ZZYA 3GH9A 1Z5YE 3A5WA 4IJIA 3DEXA 1X0RA 1S3DA 1TK8B 4HZ2A 4J57E 1BG5A 4L0UA 3F6FA 4WETA 4Q5FA 4X43A 3H1NA 2EIRA 1M7TA 5IO2A 2HZFA 4GSTA 3TB2A 3RHCA 3FEUA 2VLVA 4OD7A 1GWCA 2BTOT 1THOA 1XOBA 1ABAA 1URMA 2CVKA 3VWUA 5ECKB 6GSXA 2VD1A 2X99A 4EO3A 4L0WA 2L57A 1JHBA 3KZQA 3DRNA 4FYCA 1EZKA 3L0HA 5CREA 5ECRB 3LFLA 2MMNA 3HVSA 5HR2A 2M46A 4WF4A 1GL8A 4ZBDA 1G6YA 4TOPA 4TRXA 1Z6MA 2C8UA 1Z3EA 5ECQB 3BD2A 3A2XA 3FW2A 4I2UA 3P8WA 4LA1A 1KTEA 4IW9A 2VLUA 4Z7XA 3F3QA 2C0EA 2M72A 5HFIA 3G7JA 3IRAA 3EURA 2H71A 3N5OA 1NW2A 2K8VA 2FD3A 2HRNA 4V1Ap 1EP8A 3FR3A 3QMXA 1WJKA 3RDWA 3G7IA 5CAXA 5D9VA 5ECHB 4G9HA 1RQMA 1HNCA 5G5FA 2KP1A 4WBJA 1WOUA 1PL2A 1J08A 3CRUA 2O85A 2CX4A 1T7PB 4BWSA 3DWVA 3D0ZA 2N5AA 5GZZB 1GSYA 4LMWA 3LJRA 2GT5A 3GL5A 4YQVA 4MZBA 4BVXA 3V1WA 3GX8A 1SKRB 1MDKA 3IPZA 2H1AA 3GUSA 2H66A 1X9WB 3F3RA 4K6XA 2GLRA 2EIOA 4N30A 4OO4A 5H5SA 4DVCA 1QUWA 2DMMA 1TK5B 1K3YA 2YWOA 5LCZA 4ML1A 2C3TA 4KAEA 3KXOA 3U6VA 1SYXA 1T8EB 3NOFA 2CX3A 2H8LA 1GSFA 5F0GA 3F0IA 2VLTA 1PSQA 5IQYA 2PVQA 1JFUA 4EL1A 2VM1A 3D22A 2FUG2 2H1GA 3IV4A 2VL2C 3US3A 2NPBA 1ERUA 1YEPA 2RUEA 1XWKA 4Q5NA 2WZ9A 3UBLA 2O89A 2FHEA 1TI1A 5ECIB 3E9JB 5DQYA 3TGZA 2HYXA 3M9KA 1UN2A 1XWGA 2VCVA 1XIYA 5IMCA 2PMTA 3FYGA 4J56E 3TRQA 2GDRA 3J7Yk 3ED3A 2YV7A 4HDEA 3H93A 1U3IA 1M99A 1YDKA 3HZ8A 3DGQA 4FYBA 1V98A 1J0FA 3L4NA 2YOIA 2IL3A 4V2NA 2FWGA 1PMTA 4WBRD 3QFAC 4QL9A 2H73A 3TKSA 2LQQA 1B9YC 3O3TA 1FOVA 2JSZA 4GCIA 1MD3A 4ZBAA 5HR3A 4ECIA 2GT6A 4MJEA 1SJIA 2FWEA 2C0GA 2XBIA 4TKYA 3DXBA 3QPMA 2GZYA 3CBUA 1AC1A 4KUNA 2L4CA 1GNEA 3RPPA 2JZTA 1F6MC 3IK9A 2C1YA 4AGSA 4NV2A 7GSSA 1GSSA 1ERVA 4I97A 1G6WA 4LL4B 4N0VA 1Z7RA 5LNKe 3SBCA 1XVQA 4F82A 4IS0A 1XW6A 9GSSA 3MSZA 5CP1A 2JZRA 4GSSA 3TRXA 1FB0A 2OACA 4TR4A 2MBSA 1T4ZA 5DCGA 2HE3A 1SK2A 3GHAA 4F0BA 4WF5A 4BWQA 6GSWA 3ISOA 4PUAA 3F63A 1JZRA 2P5QA 3GMFA 3UJ1A 1BAYA 1SJ6A 2WDUA 3GFKA 2AV4A 3HY2A 5E4WA 1FVKA 4WEYA 3IOSA 4YH2A 3M3MA 4PUFC 2FGXA 3FRCA 1B48A 2TRXA 2CV4A 2OJLA 1MTCA 2YP6A 2QSIA 5HR0A 2TRCP 5IPHA 2CT6A 3BCIA 5CO3A 4ZB9A 1XZOA 4O7HA 4O32A 2D2ZA 1FB6A 4DSSB 4XRDA 3TJJA 1PX7A 1K0OA 1Z9HA 2ZUPA 4EDZA 2VCZA 1SL0B 4KCAA 2IJYA 4LLRA 3FY7A 2LJRA 3QAWA 2CZ3A 5KN3A 2HSYA 3ZMLA 2JU5A 1M9BA 3I9V2 5HFKA 3VI7A 5G1LA 5J9BA 2IMFA 5F8BA 4ECCA 1Q98A 1GUMA 5B6NA 3I6AA 3GSSA 4G19A 3WGXA 4X1UA 2LS5A 1YKCA 4MP4A 1T4YA 1EEMA 5COHA 2BMXA 3GRXA 5AIVA 8GSSA 4OMVA 5JWOB 4NWYA 1WIKA 2VCXA 3KTLA 2C3NA 1GNWA 3FZ4A 1GTIA 2OE0A 1BEDA 3P2AA 1XFLA 2V41A 3EU3A 4DSQA 2LNSA 1QQ2A 4K7NA 2B7JA 5IMZA 3I69A 4N10A 3GYKA 14GSA 1F3AA 2VUPA 3SWLA 4HJMA 3L9VA 2C80A 3TJFA 5ELGA 4IVFA 2OE1A 3D5JA 2YV9A 4K0NA 3C7MA 1GP1A 2IMEA 1GTBA 1PKWA 2LNTA 1JZDA 1GSUA 1T3BA 1U3AA 3ZITA 2AJQB 2QKEA 2LTKA 1LJRA 3F4RA 5D9TA 4I2TA 1J9BA 4ID0A 1M9AA 2RIIA 4KH7A 4KW6A 1Z7PA 1N2AA 2FLSA 6GSVA 2IMKA 2IMDA 1NSWA 2G0FA 3GH6A 1E2YA 5ELAA 4N11A 2V2GA 2DJ0A 4K8MA 4DSSA 1NM3A 1YEXA 1GLPA 1XXUA 1A0RP 4HUAA 1TP9A 4KNDA 4EXJA 3VLNA 3GKNA 3HKRA 2LUSA 2H72A 2H30A 1V40A 4PQIA 3L78A 1WWJA 2F8FA 2HZEA 1N8JA 2WGRA 2P5RA 4H86A 3HXSA 1A8YA 5DCHA 1H75A 3EMXA 3WT2A 1YJ6A 2OA7A 5FHIA 2DJ1A 2XHFA 1GTUA 3MWHA 4GTUA 5H5QA 2ALBA 1K0BA 2CVBA 2XPDA 1VRSD 4XS1A 2HRFA 2AYTA 3H79A 4LMVA 1ILOA 4MLYA 1JLVA 3WYWA 1O8WA 2E7PA 4KDYA 4JEDA 4TW5A 3W8SA 1PX6A 4Q5QA 3ZL5A 1GUKA 2GZZA 4MCUA 3W6GA 2HFDA 1JZOA 4NMUA 4F2IA 3KMNA 4MF6A 3UOMA 3ZZXA 2JADA 4KGIA 1GUHA 4IBPA 1A2JA 4F0CA 3KJYA 4IHUA 1DE1A 3A3TA 4FH8A 4HU7A 3TKSC 1UA5A 1B9XC 2BJXA 5ID2B 5C00A 2PUKC 4J2FA 3N9JA 4ZBBA 1B8XA 2G2QA 1X9MB 1QK8A 2F51A 1USBA 2MBTA 5B8BA 4ISDA 3CXGA 3TKSE 5G30A 4MF5A 2DIYA 3HVVA 5HR1A 3DKSA 2H0HA 3KP9A 3NIVA 1M2DA 1LU4A 11GSA 2KLXA 1UVZA 2REMA 1VF4A 1GSQA 2GQLA 2VCTA 1TTZA 2DMLA 3L9SA 5KN2A 4NAXA 1H4OA 1CQGA 3KGKA 4GF0A 2YANA 3D6IA 4L8EA 4RQRA 4OCFA 4IP6A 5IOWA 1E6BA 3TJBA 3IAS2 2X8HA 5F07A 5ECSA 1RW1A 2EIQA 3UEMA 4WKWA 1EOGA 2V6OA 3APOA 5IOXA 2FA8A 1KEBA 2VCQA 4ZL9A 6GSYA 3LSZA 2ZCTA 2IWTA 3DVXA 22GSA 3ZVJD 5AN1A 3BJ5A 3KH7A 2LV3A 1TU7A 4MABA 2YCDA 1A0FA 3CRTA 2CAQA 1O6JA 1FW1A 3GL3A 4GSNA 5DVBA 2LJKA 4MDCA 2B5XA 5EL8A 1W89A 5DJMA 4DEJA 1EGOA 4JE1A 1YQ1A 4O5RA 2TIRA 1O81A 2PVOC 3LORA 3DD3A 4PXOA 2H01A 1S3CA 3ZLPA 5ID2A 4V2LA 4O92A 1VF3A 4QL7A 5ABRA 4AJ7A 5CRGA 3A2WA 1DBYA 18GSA 4K9ZA 4AF2A 4POLA 3MNGA 3VFIA 1EOHA 1ST9A 3TKRA 4EE0A 5D93A 1EGRA 10GSA 3VK9A 5CNWA 2DC5A 5ECNB 3JCML 2L6CA 3NZNA 1BX9A 3EWLA 1QXHA 4RUVA 2A2SA 4BA7A 1FO5A 4EKZA 3RBTA 2HXKA 1G7OA 3Q18A 4RQXA 2EC4A 2CVDA 4ACSA 3PR8A 3QR6A 1VF1A 4TR1B 2FCHA 3GKKA 3MDKA 1BJXA 1OVNA 1YZXA 4HQSA 5CRWA 5INYA 2L59A 2WB9A 1TRWA 1BYEA 4MJCA 1PKZA 5IM9A 5JCGA 16GSA 2ES7A 1FAAA 2GZPA 5J3RA 4TXVA 3EU4A 5IMDA 1V57A 4FYUA 3C1RA 4TN8A 1OC9B 5ECMB 3CYNA 2C0FA 2XC2A 5D8IA 3R2QA 3FR9A 1O73A 2B7KA 3KIJA 4RI7A 2KUCA 4MMMA 2B1LA 3IR4A 2H6YA 3GSTA 2DIZA 1K0MA 4TR3A 2IFQB 5IO0A 2VO4A 1YF0A 4PX1A 1ZMAA 4GWRA 4EF0A 5CYYA 3L9UA 3CSIA 3ZTLA 1PL1A 1TXXA 1K0NA 2B5EA 2GSTA 1SU9A 2VL3A 1K0AA 1K3OA 4MPGA 3DYRA 3VPQA 2I9HA 3KH9A 3TJKA 3TJGA 2YWIA 1AW9A 4IN0A 2L5LA 1ZYQB 3FKFA 2RM5A 2H76A 3S9FA 4CW9A 1TRVA 2WJUA 1TRUA 1XBSA 1TDIA 2CQ9A 2K18A 1M0UA 4TR1A 3ERFA 1O7UA 1OC8A 2F3MA 4POBA 3TKPA 1K0CA 2H74A 1RK4A 4P3YB 4IQAA 3ERWA 3M1GA 4MF7A 1YF1A 1AXDA 5C04A 4HI7A 1X9SB 1R7HA 3GKMA 1S3AA 1LBKA 1Y25A 3J7Yb 1AAZA 3EMPA 5D73A 4EUYA 3HJMA 3EE2A 3FZ9A 3ME8A 2R4VA 3LG6A 1K3LA 4K0GA 19GSA 4MJBA 3APQA 2O7KA 3IC4A 1EV4A 1OC9A 5HFGA 1V2AA 3EVIA 1WE0A 1AQXA 3RAZA 4E8HA 4I6XA 4E8EA 3C71A 5E59A 1SKSB 4NPBA 5J9CA 4YAVA 4K7OA 1FG4A 1EP7A 2Z9SA 1QMVA 4AJ8A 5AGYA 3E3EA 4XS6A 2GS3A 3UMAA 1THXA 2R3XA 4DSRA 5B6MA 2K6VA 2FA4A 4JBBA 1W4VA 3ZFLA 2HI7A 5ECOB 4NXIA 1MEKA 2LRNA 5GAND 2F9SA 2B5YA 2A4VA 2IMIA 4KA0A 2P31A 2FWHA 1XWAA 3DVWA 1C72A 3PINA 2B6MA 3MAKA 1V58A 4PQ1A 2WRTA 4HOJA 1OYJA 3K8NA 4MA9A 3FZ5A 4OFTA 4OCEA 3TOTA 3ZIVA 2PBJA 4F03A 4PNFA 2OKAA 4GRFA 4POKA 3LEFA 3GNJA 1M2AA 1PN9A 5IMFA 3OR5A 3IHQA 2DJ2A 1ERTA 4NHZA 2LRCA 3TKQA 4KDUA 3E0UA 4OFNA 2H1BA 5HQPA 4XIHA 3UARA 5A5KA 1MD4A 3QCPA 2LKUA 2C4JA 3GA4A 3DIEA 3C8EA 5B8AA 2NTOA 1X5CA 5EY6A 2GVPA 3M8NA 3LYPA 4KCEA 4NHWA 3KD0A 3ZRDA 2JZSA 3KM6A 2HLSA 2C3QA 2H19A 2E2GA 1IYIA 3O6TA 4HU9A 2IPAA 3WT1A 3KEBA 5GSTA 3DMLA 1XCCA 3HD5A 4K2DA 5KEJA 3GKXA 1SK0A 3I43A 3ZFBA 4GXZA 3UBKA 5JCWA 1ON4A 1XOAA 1BQ7A 1DSBA 1F3BA 4YQMA 1PA3A 2X8GA 3D4MA 3D4TA 1HD2A 3CSHA 3HCZA 4JR4A 3GN3A 3PGTA 2WULA 3KP8A 4OWYA 3LQ7A 2VOCA 1PQNA 4MH3A 2XPEA 5J41A 4JU5A 1R5AA 4ULXA 3UIWA 2I3YA 3VWXA 1F2EA 5F06A 2VCWA 3IAM2 3QAVA 4POMA 2NVLA 2F8AA 1HNAA 5G2ZA 4ZB6A 2O87A 1MDIA 4HJ2A 4LL1B 2J23A 2QC7A 1X5DA 3ME7A 3W8JA 2JL4A 2PERA 1T1VA 2L5OA 2C0DA 5DALB 1OE7A 1EWXA 1NHOA 4PGTA 2PGTA 1SJZA 2VL9A 5H5RA 1AUCA 2FWFA 3F9UA 1OKDA 5DJLA 2MMOA 2GGTA 2H1DA 2M80A 2LRTA 2YPMA 4ZL7A 5D9XA 1TU8A 2P0GA 2H6XA 2LQOA 3H8QA 1KNGA 4JR6A 4FIWA 1SKWB 1YKAA 2I81A 4KDXA 4NV5A 2VM2A 2YZHA 2OBKA 2YWMA 3TCOA 3UVTA 1UC7A 4MPFA 1I5GA 4K7IA 3H4KA 3WD6A 1ML6A 1ACVA 1TOFA 3LWAA 3QDNA 1XVWA 3VURA 3QOUA 3HA9A 2AHEA 1HYUA 2H75A 2N5FA 2PU9C 3IDVA 5J5NA 4L5LA 2V6KA 5AIXA 2FNOA 2LSTA 3QD9A 1WPIA 4G2EA 2RLIA 2MZCA 1Y6EA 2YN1A 3KMOA 2X64A 5D9WA 2I4AA 2CZ2A 1XWBA 3APSA 2PWJA 1FHEA 3KTBA 5EVOA 1A2LA 1GSDA 1Z6NA 3M9JA 4HEA2 1WMJA 3HJOA 4FO5A 3UL3A 4MK3A 2YNXA 4YAPA 4AJ6A 4I5QA 1XW9A 2H0GA 2R2JA 3WGDA 2H6ZA 5D96A 1A23A 4MH2A 1XW5A 3GX0A 5DALA 1U87A 4ECJA 3EINA 4WR4A 4ML6A 3FK8A 3VI5A 4TXOB 2QGVA 2VD0A 4IJ3A 1ERWA 2GQMA 3G9BA 3G7YA 3RPNA 5A4UA 2MYGA 5G1KA 3LXTA 1OE8A 4XHMA 5G5EA 2MMAA 2IIYA 2DJJA 2WCIA 3RHBA 5G31A 3A2VA 2DSAA 3IBHA 2ZNMA 1QFNA 3ZVJA 3IE3A 3AY8A 4I8BA 4TR0A 1Q4JA 4Q5RA 3QFBC 5IMAA 3TRPA 2OBIA 5KN0A 5FWGA 5GAPD 1PGTA 3HVXA 4MJAA 4MZWA 4JRRA 1A24A 1G7EA 2A2RA 2B3SA 4OFMA 1WRYA 1VGLA 3C73A 4IGJA 1GH2A 20GSA 3QAGA 1SD9A 1DE2A 1EEJA 2ON5A 3F6DA 3IA1A 1F37A 4QQ7A 3HYPA 4IELA 3CTGA 3EC3A 3HZ4A 3GTUB 1TJDA 2N5BA 2ON7A 3HJPA 1X5EA 3KCMA 2OADA 3GURA 1AQVA 1SENA 6GSUA 4PNGA 1TK0B 2RUFA 3EYTA 17GSA 3TUEA 5DBQA 6GSSA 4KE3A 5DDLA 2CA8A 4HS1A 4TXOA 3IXRA 3FR6A 4WR5A 1YY7A 5CRHA 4KX4A 4GLTA 5CRDA 3LXZA 4BVYA 2YJHA 4OO5A 4ZL8A 3FZAA 3Q6OA 3CMIA 5FT3A 2L6DA 3WGEA 3M0FA 2R5GA 3BCKA 1SK1A 3TOUA 1KBNA 5A4VA 2YJ7A 3Q74A 5KN1A 5AISA 1R26A 4D73B 4ZIJA 1HNBA 1T00A 1AIUA 5JWQB 1U88A 1B4QA 4N0ZA 1G0TA 1OKTA 1GRXA 1TI3A 1HQOA 1O85A 4V2MA 1SL2B 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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