1XWAA

Drospohila thioredoxin, oxidized, p41212
Total Genus 35

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
111
structure length
111
Chain Sequence
AAAAAMVYQVKDKADLDGQLTKASGKLVVLDFFATWCGPCKMISPKLVELSTQFADNVVVLKVDVDECEDIAMEYNISSMPTFVFLKNGVKVEEFAGANAKRLEDVIKANI

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
S1 (2-4)TI2 (49-52)EMPTYAH1 (8-18)S2 (22-28)S5 (85-91)S3 (53-59)TI1 (29-32)TIV3 (81-84)TI5 (60-63)S4 (77-82)AH2 (33-49)AH4 (95-104)AH3 (64-70)TIV2 (74-77)TII'1 (18-21)TI4 (59-62)O1 (92-94)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Electron transport
source organism Drosophila melanogaster
publication title Comparative structural analysis of oxidized and reduced thioredoxin from Drosophila melanogaster
pubmed doi rcsb
molecule keywords thioredoxin
total genus 35
structure length 111
sequence length 111
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-10-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1xwaA00
4NMUA 3DEXA 1A0RP 1O6JA 4HU9A 3IHQA 2IMIA 5LD0A 1Z6NA 3ZMLA 5IMAA 3KGKA 16GSA 3IA1A 4GRFA 4GCIA 1I9DA 5CO3A 1TRUA 2QSIA 1B9YC 1PA3A 3LORA 2P5QA 3ZFBA 5J3RA 2L5OA 2VCWA 1OC3A 19GSA 1O8XA 3UOMA 1K0AA 3NOFA 5JCGA 5B7CA 3IPZA 4KX4A 5D9TA 1U88A 2X8GA 2X8HA 3QAWA 5HFKA 2IN3A 5GAPD 2LKUA 4IHUA 4K0GA 4P3YB 1R5AA 3N5OA 3Q19A 2LV3A 5F8BA 3HJPA 4ML1A 4FYUA 1XOAA 3ZVJD 5D9XA 4KNDA 4L8EA 1EP8A 1SD8A 4MLYA 1EV9A 1DSBA 1GSDA 2P0GA 4NHWA 2YP6A 2MMZA 2RM5A 4PQ1A 1Q98A 1T3BA 5KN1A 3PGTA 5H5QA 2IMKA 2N5BA 2IMFA 3ED3A 4PUAA 2O89A 5GZZB 1M9BA 4JBBA 2VIMA 4Q5QA 2JACA 2MMNA 4MZCA 2B5YA 2L5LA 2PVOC 1DBYA 2F3MA 2X64A 3SWLA 1FB0A 2GQMA 5ECOB 2YWOA 1GLQA 5HR0A 3US3A 4IP6A 2REMA 4ID0A 1SL1B 5D73A 3GA4A 1SD9A 3IC4A 1GSFA 3LEFA 4JZQA 2LSTA 2K18A 2WCIA 1CQHA 3Q74A 4WXTA 12GSA 2CAQA 3GSTA 1TRWA 2JADA 5ECLB 4X1UA 1J0FA 5LNKe 1KTEA 1X5CA 1B4QA 3PR8A 4L5OA 1CQGA 4CDOA 4MF5A 5JCUA 1WMJA 1GSUA 2H74A 3HVXA 1ZOFA 5ECKB 1VGLA 4WR5A 4WKWA 5C04A 3QD9A 1MDIA 3CBUA 1PD21 2I9HA 2C0GA 4CHSA 3F63A 5IO0A 4AJ7A 4EO3A 5A4UA 2C3NA 3GL5A 4J57E 1Z5YE 4J2FA 3EINA 4K2DA 3F8UA 2OE3A 3HCZA 4HQSA 3ME8A 1G7OA 1X5DA 2IMDA 1QGVA 4YAPA 4BVXA 4O32A 3M9JA 4HI7A 4N11A 3C8EA 3ZREA 2B7JA 5B8BA 2ZNMA 2V6OA 1O7UA 9GSSA 2LNSA 2FUG2 3P7XA 3VPTA 2GZYA 4H86A 1GSSA 2LQOA 3UAPA 2GZPA 1EV4A 17GSA 2OJLA 2MBSA 1E2YA 2VLTA 1JZOA 1TP9A 2WZ9A 2CVDA 4XS6A 4NPBA 3DMLA 1GUHA 4MJAA 2N5AA 5G30A 1GH2A 1W89A 1JZWA 4OO5A 1B8XA 2VM1A 5GSSA 2WS2A 4OWYA 2O7KA 3ZIJA 2YOIA 3QDNA 5GSTA 5G2ZA 5ABRA 2G2QA 3I6AA 3RHBA 3GV1A 1V57A 2H0IA 2C0EA 4XCSA 1LBKA 2GZZA 3RPNA 1XWGA 2IMEA 5HR1A 3F0IA 1RQMA 3M0FA 1MEKA 3QPMA 3H4KA 5GAND 1TI3A 4MF6A 1TK5B 3C71A 2OE1A 4K8MA 3L9UA 3ZFLA 4PURA 4IJIA 3IDVA 4KCAA 2CZ3A 1WJKA 4KSOA 2DSAA 3D21A 2GS3A 1V9WA 1A0FA 5ECNB 2C4JA 3IAS2 4HDEA 4POBA 4MH2A 4K7NA 1WOUA 3D6IA 2C0DA 3VPQA 4N10A 2HLSA 3P90A 3QCPA 4XS4B 3TKSA 2DIZA 1G7EA 2FA4A 1ERWA 5DVBA 2CV4A 2AV4A 6GSWA 1OAZA 1OC9A 2EC4A 2GQKA 4DSSA 5KEJA 4IW9A 2MBTA 3F4TA 1K0MA 3L4NA 2PU9C 4PQIA 1Z9HA 4WBRD 1FHEA 1GP1A 2G0FA 4F0CA 4TR4A 1U6TA 3H79A 3C1SA 4YH2A 1BJXA 1F6MC 4JU5A 4GWRA 1ZL9A 4TVEA 5D93A 3GKKA 1V58A 1A23A 3HVVA 1YF1A 2LJAA 1J9BA 3GFKA 1FO5A 1FVKA 1EGOA 2J23A 1XW9A 3FZ9A 3EMXA 2IJYA 2F9SA 4TR1B 5IOWA 2FWGA 5A4VA 5CYYA 1PKZA 1JZRA 3PINA 1THXA 2NPBA 4EVMA 4DVCA 1SK0A 2N5FA 2FWHA 3A2WA 3ME7A 4KW6A 4ZL8A 2H6XA 1SENA 2LRCA 1R4WA 2HZEB 5INYA 1EOHA 4HS1A 3VWVA 3TKSC 4FYCA 1ST9A 3NIVA 1PQNA 2YN1A 3D5JA 3TKRA 2GSTA 1AQWA 4HZ4A 1X9WB 2TRXA 3I9V2 3TKPA 2PVQA 4AJ8A 5JWOB 5D96A 3BD2A 3HHVA 1M2AA 5D9WA 1SL2B 1WRYA 4MZWA 3HZ4A 2CX4A 4LL4B 3FHKA 2ON5A 3IOSA 5A4WA 1JLWA 3ZVJA 1DUGA 3F4RA 3TJGA 2PGTA 3S9FA 4IKHA 3TB2A 2XBIA 3GTUA 1KEBA 3DRNA 4MF7A 1BAYA 2GT5A 5CRDA 4BVYA 1KNGA 4KDXA 2LRNA 3JCML 6GSTA 3SBCA 1U3AA 4N0VA 5ID2B 2PWJA 4MPFA 3LG6A 3GMFA 1Z7PA 4WF4A 3PH9A 5DQYA 3A2XA 2A4VA 3ZMKA 2VUPA 1GSYA 3UEMA 3HJOA 1K0OA 2YPMA 4GTUA 1A2JA 2E2GA 2NVLA 4ZL7A 2IL3A 4K6XA 5EPFA 2CA8A 3LXZA 1ZYQB 1YEXA 1Q4JA 1LU4A 4V2LA 5C00A 2YWNA 2KUCA 1X9MB 2H6ZA 5G1LA 1OE7A 5DCGA 2HSYA 1YDKA 2AAWA 1PX6A 2DMMA 5AN1A 3WGDA 3CSHA 2H0HA 3KEBA 5DALA 1H4OA 1A2LA 1SJ6A 4TXOB 4JRRA 2OADA 2LJRA 3J7Yk 2L57A 5HFGA 3ERWA 3RDWA 5HFIA 2DIYA 3FRCA 2B7KA 4F82A 2B5EA 1XXUA 2FWEA 2AB6A 5A5KA 3K8NA 3O3TA 2H1GA 4KDUA 4OCEA 3FYGA 3GH6A 2HZFA 3KCMA 3Q6OA 3BCIA 4KGIA 5G5FA 3GURA 2EIQA 1WP0A 5CRWA 2M72A 5JWRB 5ECPB 1SJIA 3DVXA 5IMZA 1MD4A 1THOA 4FO5A 3E0UA 1XIYA 3EWLA 3WT2A 4MABA 4WR4A 2GVPA 1YF0A 1Z7RA 4QQ7A 4BPYA 4YQVA 4K9ZA 2M46A 1A2MA 3TJFA 1FOVA 3ZIVA 4DSQA 1T00A 3DXBA 1U87A 2YZHA 4Q5FA 3LQ7A 2I4AA 3QFBC 3R2QA 2GSRA 1UC7A 3NZNA 3TUEA 1AUCA 4GQFA 2RUEA 1XOBA 1NM3A 2F8FA 1A8YA 3EMPA 1YZXA 2CX3A 3GNJA 3QMXA 3KTLA 1ZYEA 5H5SA 1PL2A 3ZZXA 4F0BA 4I2TA 2L6DA 2M80A 2DJ0A 1GWCA 2H73A 4ISDA 5F06A 4IVFA 5KN3A 3FZ4A 3VI7A 2VM2A 1TRSA 4XHMA 2VL9A 1TJDA 4OFNA 4I2UA 3DGQA 3HJMA 3G9BA 3KH7A 3KH9A 5D8IA 1PRXA 3I69A 2KP2A 1M7TA 5LCZA 1HNBA 2B1LA 1W4VA 4TR3A 2GSSA 1ILOA 4HZ2A 2K8SA 1SU9A 1U3IA 4DEJA 4HJ2A 4G19A 5FWGA 4ZBBA 1V98A 3W8JA 4AJ6A 1G0TA 4Q5NA 3LSZA 1G6WA 4PX1A 3EURA 5CAXA 3IV4A 4OMVA 5J9BA 4POMA 2VOCA 3BBYA 2YWMA 3H93A 3FR6A 2TIRA 5IIZA 1GRXA 1OVNA 2BTOT 3HY2A 3UVHA 1JLVA 1TXXA 4L0WA 1FAAA 4NHZA 1AC1A 3IE3A 1A24A 3LYPA 1JFUA 2PN8A 1XCCA 2JZSA 3GX0A 4IS0A 2RLIA 4MMMA 3F4SA 5DAKB 4TN8A 2D2ZA 4GF0A 3MSZA 5F07A 2ZUPA 3UMAA 3TKSE 3FW2A 1TW9A 4O92A 1YQ1A 3APQA 3VWWA 3BCKA 2H75A 2LJKA 3HVSA 3MWHA 1Z6MA 3LFLA 2XBQA 2ZCTA 5ECSA 1X5EA 2GT6A 1QXHA 1URMA 1QQ2A 1S3CA 1WPIA 2L4QA 1NHYA 3J7Yb 2H19A 3M9KA 4JR4A 4TRXA 2HRNA 4ZBAA 13GSA 2LRTA 1K0CA 4YQUA 3WD6A 2NTOA 2WGRA 1GNEA 1GTUA 5DDLA 4RI7A 1IYIA 4NXIA 1M2BA 3CSIA 1G6YA 4F9ZA 2C80A 4Z7XA 4ILFA 1F2EA 2MMOA 3A3TA 2DBCA 18GSA 5F0GA 4MA9A 1OC8A 4GLTA 5HR3A 5IPHA 2NBSA 4PNFA 1QK8A 3M8NA 4MCUA 3HA9A 2MYGA 4EL1A 4JE1A 1T1VA 3QR6A 1FG4A 1R5PA 2B3SA 4CW9A 1GL8A 2WULA 4I5QA 2OACA 3F3RA 4O5RA 4EXJA 2F8AA 2AUVA 4RQRA 2R2JA 5EVOA 5COHA 4FH8A 1WIKA 2PERA 5ECQB 4KDYA 2DJ2A 3GX8A 1GUKA 2E2MA 2ALBA 3LGCA 1EEMA 4GSNA 4XS4A 2C3QA 5J41A 1VRSD 3LXTA 4TW5A 5JWQB 2QGVA 2HE3A 1UA5A 3TCOA 4D73A 4I8BA 11GSA 3GRXA 2YV9A 1XWKA 3ZTLA 4XRAA 2VAFA 3DVWA 3IRAA 1XBSA 1GLPA 1ACVA 4EKZA 3A2VA 4K7OA 4NWYA 1ERVA 3CRTA 2HYXA 4QL7A 2NDOA 2JSZA 3TKQA 1EGRA 1UVZA 4MJEA 2FA8A 2O85A 4HJMA 4RI6A 1SYRA 5AISA 2GTUA 1HNAA 4ML6A 1M0UA 3V1WA 2DC5A 6GSYA 2O8VB 2RIIA 1GUMA 1K0BA 4IBPA 2PBJA 3RPPA 3D0ZA 5IOXA 1VF1A 2OBKA 2WJUA 4O7HA 3KP8A 2PMTA 5F05A 2KLXA 2TRCP 4NV5A 2R4VA 4KUNA 2CT6A 2H1BA 4BL7A 4WBJA 3F6FA 1PMTA 5E4WA 1AQXA 2GGTA 1SKWB 2B5XA 7GSSA 2C0FA 4MJBA 2EIRA 4LLRA 1VF4A 4F2IA 4AGSA 1FW1A 4JR6A 3CSJA 2YJ7A 3HYPA 3L0HA 2VCTA 5JCWA 2J9HA 5EL8A 2CAIA 1PSQA 22GSA 4KAEA 3H1NA 2F51A 5DJMA 4Q5RA 1XZOA 4ECIA 2LQQA 1C72A 3ZLPA 3HKRA 3FZ5A 2DJJA 4WF5A 4FIWA 3AY8A 3G7JA 3O76A 2FHEA 2YJHA 1N2AA 3EVIA 5KN0A 3CTGA 2MMAA 1B4PA 4EF0A 2H66A 2A2SA 5IM9A 5KN2A 2V41A 2IFQA 4IJ3A 2FY6A 3VI5A 2OA7A 2FLSA 3RHCA 4TR0A 3CYNA 1USBA 5IMDA 3KD0A 1EEJA 1HYUA 2E0QA 3GTUB 3CRUA 1V40A 1A8LA 1B48A 5IMVA 1XWAA 2YNXA 1PL1A 1ON4A 2HRFA 2XHFA 2V6KA 4ZIJA 2FGXA 2V1MA 1T4YA 2KOKA 2L4CA 2Z9SA 1TKDB 1EWXA 4QL9A 5DQSA 1B9XC 4K0NA 4RUVA 4IP1A 3APSA 3TDGA 4IQAA 20GSA 1TU8A 2VL3A 3GUSA 1RW1A 2X8CA 3ERFA 4KCEA 4FYBA 14GSA 1M2DA 3FR9A 3LJRA 4G9HA 2VD1A 4ECJA 5DALB 4IQ1A 4TXVA 1XW6A 4OD7A 4V2MA 1H75A 1PKWA 4WETA 3VFIA 4TOPA 1I5GA 1S3AA 1F37A 2OE0A 5ECHB 1NSWA 1PN9A 2YANA 2K6VA 3UBLA 3GHAA 5B6MA 2XPEA 4OCFA 4OFMA 4MDCA 3MAKA 3FK8A 2ES7A 4V1Ap 2GLRA 2IPAA 4HUAA 4ZILA 6GSSA 3C73A 3VWUA 4N30A 5H5RA 1Y6EA 3ZL5A 2R3XA 2IWTA 2L59A 2LNTA 1KBNA 4X0XA 3EE2A 1YY7A 3M1GA 3HD5A 1DE1A 1K3LA 2BJXA 3C1RA 1Y25A 1YEPA 3W8SA 5FT3A 4HQZA 2H1DA 4MK3A 3H8QA 1Z3EA 2H72A 2VCVA 2CQ9A 1PX7A 1QUWA 1EP7A 1AIUA 4E8EA 1GTAA 3IK7A 2YWIA 5DCHA 1M99A 2CVKA 3ZITA 5IMCA 2YCDA 2V2GA 4EDZA 3Q18A 1HQOA 5IPGA 4X43A 4LA1A 1T8EB 1FVJA 4ZXGA 1HD2A 5ECRB 3DKSA 1HNCA 2E7PA 4G2EA 2C8UA 3G7IA 4J56E 1AAZA 3TRXA 2WDUA 1OKDA 1SKSB 5ECIB 5AIXA 3GKMA 2XC2A 4IGJA 4L5LA 2HSHA 3FKFA 2KP1A 1GULA 4XRDA 1N8JA 3EU4A 1ERUA 3GYKA 1TU7A 3QAGA 1XVWA 4OO4A 1UN2A 3TOUA 2X99A 4BA7A 1LJRA 3IK9A 1O8WA 4TKYA 3BOAA 1F9MA 1XW5A 1TK0B 3HZ8A 2GSQA 1GSEA 3CTFA 1GTBA 1TK8B 2B1KA 3A5WA 3O6TA 3UJ1A 1X0RA 4LMVA 2HT9A 2EIOA 3D4TA 2DJ3A 3F9UA 5ELGA 2LUSA 5IMFA 3KMNA 3N9JA 5G5EA 4AF2A 1AW9A 1EZKA 5AIVA 3GSSA 3TJJA 1JZDA 1IYHA 2O87A 4PQHA 1F3AA 1XFLA 1J08A 5DBQA 2K8VA 3KMOA 1ZMAA 2FD3A 2LTKA 4F03A 3G7YA 4K1FA 4KH7A 4HEA2 3LYKA 1XWCA 1RK4A 4MH3A 1MDKA 3WYWA 4ZB6A 3FY7A 5DAKA 6GSVA 1WE0A 2V32A 3D4MA 2FNOA 1NW2A 3TGZA 1ML6A 3E3EA 2I1UA 2R6KA 3P2AA 2H71A 4PNGA 2VLUA 3U5RE 2RM6A 1YKAA 1EOGA 3L78A 5CREA 1K0NA 2C1YA 3E9JB 2VCXA 2VCQA 1WWJA 5D9VA 1E6BA 3UL3A 1DE2A 1YJ6A 4IELA 1TI1A 2H70A 4V1Ag 3GKXA 1TTZA 2H76A 2A2RA 1ZCPA 3F6DA 4KSMA 2QKEA 3FZAA 5J5NA 3M3MA 1JHBA 1X9SB 3FEUA 3FR3A 2CVBA 5AGYA 3GL3A 1SJZA 1GNWA 4NV2A 3DYRA 3TJKA 3GH9A 4EE0A 4JEDA 1SK1A 2WFCA 1ZGNA 1SYXA 2L6CA 2IIYA 3W6GA 3TJBA 3VWXA 5HR2A 5IO2A 4XTSA 5J4UA 1K0DA 2AJQB 2QC7A 1GTIA 1BYEA 1SKRB 5L71A 2R5GA 3P8WA 2CZ2A 3CMIA 2VCZA 4KE3A 4BWQA 2H0GA 5G1KA 1BX9A 1SL0B 3DD3A 1T7PB 2JL4A 4PUFC 3KIJA 5B8AA 6GSXA 1K3YA 4E8HA 1S3DA 4MP4A 3UVTA 3UIWA 1MDJA 4HU7A 3WGXA 1R7HA 5G31A 2K9FA 4WEYA 1FB6A 3APOA 4HOJA 4OFTA 3VURA 3KM6A 2R37A 1OYJA 4ZB9A 4PXOA 4D73B 2H30A 5J9CA 2KHPA 2DLXA 3U6VA 1OKTA 1OC9B 1TRVA 2VLVA 3L9SA 4DSSB 2JZRA 2H8LA 4V2NA 1TDIA 2PPTA 5FHIA 3KZQA 2GQLA 4YQMA 5EY6A 1BQ7A 2HXKA 4POKA 4TR1A 1QFNA 2ON7A 1V2AA 2HFDA 3BJ5A 4I97A 3TRQA 4ZB8A 4PGTA 2FWFA 4MJCA 4EC0A 4XS1A 2FCHA 4YAVA 3IBHA 3GN3A 2HZEA 4MZBA 4N0ZA 2H1AA 5DJLA 1VF3A 4ACSA 2OBIA 8GSSA 2JSYA 2JU5A 3TRPA 2VL2A 3QAVA 2WRTA 3RBTA 2I81A 2MZCA 3ISOA 2I3YA 1O81A 3I43A 4K7IA 1QMVA 3CXGA 1AXDA 4GSTA 4GXZA 1AQVA 1T4ZA 5ELAA 3D22A 1XVQA 3RAZA 4KA0A 3EYTA 2AHEA 2DMLA 4ECCA 5CNWA 2VD0A 3IXRA 4L0UA 4EUYA 1BEDA 4BWSA 4NAXA 3LWAA 1YKCA 4ULXA 5ECMB 1XWBA 3ZRDA 5CRHA 2B6MA 4G10A 4KB3A 2BMXA 2P5RA 3KXOA 1K3OA 1O73A 3GIXA 2H6YA 2GDRA 3DWVA 4MPGA 1ERTA 3KJYA 5ID2A 2LS5A 5HQPA 1M9AA 2LEGA 6GSUA 4XIHA 5B6NA 2C3TA 3DIEA 4ZL9A 2HI7A 2YV7A 1BG5A 2RUFA 2WB9A 3MNGA 4EDYA 3IAM2 5E59A 2AYTA 3UARA 1MTCA 4I6XA 1MD3A 3GKNA 3TOTA 3L9VA 1VF2A 3WGEA 2XPDA 4LL1B 2IFQB 3HDCA 1R26A 10GSA 4ECBA 1F3BA 2DJ1A 2VL2C 1GSQA 3KP9A 3QOUA 5CP1A 3VLNA 2HNLA 4IN0A 3UBKA 4RQXA 3EU3A 4POLA 1NHOA 2OKAA 3MDKA 1ABAA 1TOFA 2PUKC 4TXOA 1XPVA 3WT1A 3EC3A 2H01A 3ERGA 2VO4A 1PGTA 3OR5A 4GQCA 3VK9A 3QFAC 4DSRA 2DJKA 2JZTA 3KTBA 2YZUA 1SK2A 5IQYA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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