1XWBA

Drospohila thioredoxin, oxidized, p42212
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
106
structure length
106
Chain Sequence
MVYQVKDKADLDGQLTKASGKLVVLDFFATWCGPCKMISPKLVELSTQFADNVVVLKVDVDECEDIAMEYNISSMPTFVFLKNGVKVEEFAGANAKRLEDVIKANI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Comparative structural analysis of oxidized and reduced thioredoxin from Drosophila melanogaster
pubmed doi rcsb
molecule keywords thioredoxin
molecule tags Electron transport
source organism Drosophila melanogaster
total genus 32
structure length 106
sequence length 106
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-10-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1xwbA00
5G2ZA 4KW6A 5AN1A 4MLYA 2NPBA 3ZVJD 2CX3A 3MAKA 3Q19A 6GSTA 3ZMKA 1KEBA 5D93A 1K0CA 1E6BA 1TK8B 1TKDB 1AC1A 4Q5QA 3GA4A 3EE2A 1XOAA 3PH9A 2LQOA 1XW5A 1PL1A 4KA0A 1BYEA 3LYKA 4DVCA 2YANA 2B6MA 5HR1A 5HFGA 4O32A 3HDCA 2X8HA 2OA7A 2YWIA 1YKCA 3KP8A 1AQWA 3I9V2 4NWYA 3CTFA 4L0WA 4BA7A 5J41A 1Y6EA 1CQHA 4ZB8A 4HU7A 1R7HA 3ME7A 2MZCA 1OVNA 2J9HA 4IQAA 2B7JA 1GLQA 3M0FA 1PRXA 2VOCA 2BJXA 4IJ3A 3APSA 4MF7A 2K9FA 4LMVA 1Q98A 3MSZA 3RAZA 5AIVA 2IFQA 2R3XA 2LQQA 2DJKA 4KH7A 2PMTA 4ZIJA 3QCPA 3TJKA 2H75A 4IGJA 5DALA 2LNTA 3VK9A 5IOXA 2ZNMA 2C0GA 2C0FA 1BAYA 3NIVA 5H5SA 3BBYA 2GZYA 3ZRDA 5CYYA 1FB0A 5B7CA 1OC3A 5E59A 1AAZA 1AXDA 3J7Yb 1GNEA 5ELGA 1JZOA 3ZMLA 1K0AA 2IWTA 3DXBA 3DYRA 2VCQA 3RDWA 4WBJA 3VI5A 4YQUA 4MH3A 1ERVA 3C1RA 1QUWA 2H71A 2L5OA 1G6YA 1VGLA 3WD6A 3GTUB 2IFQB 1TJDA 1K0BA 1VF3A 2HFDA 2GQMA 2VAFA 2HSHA 1PD21 4KDYA 1ZYQB 3VWUA 4K7NA 4GWRA 5AGYA 4TR1A 2O89A 2IL3A 5DQYA 2IN3A 4IP1A 1PQNA 4JBBA 2R6KA 12GSA 5DALB 3L9VA 3EURA 2EIRA 3IOSA 4ZXGA 1XWGA 2WGRA 5D9XA 3U6VA 11GSA 4G2EA 3L9UA 5DDLA 5EY6A 1XCCA 1TU8A 3HJMA 1A0RP 1Z5YE 3DRNA 2XHFA 5CRHA 1DUGA 2V32A 4JEDA 2GZPA 2OBKA 2LV3A 3IK7A 5FWGA 4POLA 2K6VA 2GGTA 3F6DA 3TCOA 1ABAA 1K0MA 3P2AA 4MF6A 1X5CA 2CAIA 5D9TA 1NM3A 3UOMA 4WR4A 3GHAA 1F9MA 4HU9A 1JFUA 3TOUA 1ZGNA 4V1Ap 1XVWA 4PUFC 3Q18A 3I69A 1M2AA 3FR3A 2YN1A 1SKSB 1PKWA 2CZ3A 2I3YA 5ABRA 2ON5A 3SBCA 2VL3A 4ZBDA 2OE3A 5C00A 3QMXA 3KJYA 1ACVA 2TRCP 2L4CA 2FHEA 1TU7A 4PURA 1UC7A 1A23A 2WULA 1V2AA 3TKRA 4L5OA 20GSA 1B4QA 3ZLPA 5G5EA 3ZTLA 2RM6A 4HQZA 3HA9A 3R2QA 1U6TA 2OBIA 3FEUA 2LTKA 3A2XA 2MMNA 3BOAA 3TUEA 2FY6A 2ALBA 2L6CA 5HR0A 1OC8A 4TW5A 2XPDA 1THXA 1SK0A 4POKA 2DMMA 4K0GA 4E8EA 4FYUA 3IC4A 3W6GA 1YF0A 3LYPA 4F82A 5JWOB 5G1KA 3ZFBA 2OE1A 2ES7A 1MDKA 2CVKA 1OAZA 4EVMA 5KEJA 1O8XA 2MMOA 3HY2A 1XBSA 1B4PA 2VL2C 1QQ2A 2FLSA 2C80A 2PVQA 2FUG2 2X99A 3D0ZA 2JZSA 1I9DA 4OO5A 1GSEA 5CRGA 2FNOA 5KN3A 1C72A 2FWFA 4WBRD 2GQKA 4I5QA 1MDIA 3VWVA 1ZCPA 3UIWA 1GL8A 2DJ1A 5G1LA 4L0UA 2CVDA 17GSA 3IPZA 3H79A 1TTZA 3I43A 1FG4A 4JR6A 1WPIA 4N0ZA 5IMVA 1XWCA 3D22A 4KDXA 2K8VA 4WEYA 3WYWA 5DAKA 3A2WA 2WRTA 1FB6A 3E0UA 1WMJA 1QGVA 1EEMA 1FVKA 2VCXA 3WT2A 3HZ8A 2FWGA 3C71A 3O6TA 3BCKA 3CXGA 3GV1A 3L4NA 4OCFA 5J9BA 2O85A 1U88A 1W89A 4JU5A 2OACA 4GXZA 3GUSA 2KP2A 1X9SB 3LG6A 1GSUA 1N8JA 2E7PA 4JR4A 2GT6A 4N11A 2V6OA 2A2SA 5H5QA 2CAQA 1FOVA 1BEDA 1AIUA 14GSA 1DE1A 2I81A 2MYGA 1R5AA 1KNGA 4OWYA 1MD4A 2OJLA 4N0VA 4F0CA 2JU5A 2CVBA 3WT1A 4BL7A 1URMA 4TRXA 2XBQA 3A5WA 3F9UA 3F8UA 3QAVA 2HLSA 4K1FA 1BJXA 3TKQA 1AUCA 1GRXA 5AIXA 4L8EA 1HNCA 4LA1A 2G2QA 1YF1A 1O6JA 2H1DA 1V98A 1UVZA 2DSAA 2LJAA 1ERTA 1CQGA 3APQA 1M9BA 4MMMA 3UBLA 1S3DA 5IPHA 3CYNA 3ERGA 4XRDA 1AQVA 1M99A 3FRCA 2JADA 4YQVA 2GT5A 2L57A 3FR9A 4K7OA 1SL2B 4DSQA 3RHCA 4ISDA 2LJRA 4MJAA 3U5RE 1NHOA 2QC7A 1SKRB 1VF2A 5GAPD 4ZL7A 1VF1A 1YQ1A 2RUEA 1K3LA 2H0HA 3VWXA 4V2NA 1O7UA 3RBTA 1RQMA 1QK8A 4HQSA 1TRSA 3CMIA 4ILFA 4F2IA 3IV4A 5A4VA 3EINA 2H8LA 4GSNA 2XC2A 1EP8A 3GFKA 5IM9A 2ZUPA 2RLIA 2LNSA 1LBKA 19GSA 4KSOA 4BVXA 13GSA 4GLTA 1TRVA 3UAPA 1SKWB 4NHZA 3G9BA 3LJRA 6GSVA 3HYPA 1R26A 10GSA 3NZNA 4MA9A 1Q4JA 2X8CA 2A4VA 1PL2A 5AISA 3BJ5A 1O81A 5B6NA 5ECOB 4KUNA 1MEKA 1PA3A 2EIOA 1GSFA 2IJYA 3E9JB 4WKWA 2P0GA 1F3BA 1WOUA 1ZOFA 4ECBA 3DVXA 2CZ2A 3TRQA 5A5KA 2OKAA 4LL1B 2H1BA 3HD5A 4KDUA 1TRWA 2VD1A 1U3AA 1K0OA 2H6ZA 1EGRA 2YPMA 5EL8A 3P8WA 1T00A 1ERWA 3F63A 4G10A 4K8MA 2O87A 2FA4A 4TXVA 1F6MC 4FYBA 5DBQA 4EXJA 5HQPA 3HVXA 4Q5FA 5IQYA 4BWQA 1GTIA 2GSTA 3QOUA 1ILOA 3QAGA 2VCZA 2HZFA 2GVPA 1Z7PA 2WJUA 4TR3A 3TGZA 3IAS2 1OKDA 5HR2A 4OMVA 2VM2A 1S3CA 1E2YA 3GTUA 2YNXA 3UEMA 3GRXA 4EDZA 4IVFA 3ZFLA 4J56E 3FR6A 4KGIA 3ZITA 2PWJA 1OE7A 4I2UA 1ST9A 3LSZA 1U3IA 2PU9C 4F0BA 4V1Ag 4Q5RA 4NPBA 2CA8A 5ECMB 3W8JA 3V1WA 3DKSA 4L5LA 1J0FA 1YDKA 1J08A 4ZILA 1GSDA 2TIRA 2GLRA 3GNJA 5B8AA 2H30A 3LXZA 4PQIA 3UARA 5F05A 5E4WA 2E2MA 5ID2B 2V1MA 3VI7A 2B5YA 1W4VA 5F06A 3PR8A 1XWKA 2H73A 2H70A 1Z9HA 3MNGA 3KM6A 1XW6A 4ZBAA 1B9XC 3RHBA 1LU4A 1O8WA 4CW9A 4DSSB 5IIZA 4Z7XA 1EEJA 1TXXA 1WE0A 5D73A 3DMLA 2CT6A 3LFLA 9GSSA 1G0TA 1H75A 4ACSA 5FHIA 3GYKA 5DQSA 4IS0A 4G19A 3L78A 2L4QA 2P5QA 4PX1A 3ZYWA 1Y25A 1Z7RA 2H01A 4X0XA 4MZWA 1FVJA 1BQ7A 5F0GA 1EOHA 8GSSA 4TXOB 4J2FA 5ECSA 7GSSA 4RQRA 2YOIA 4ZL8A 4TOPA 3C73A 4JRRA 3IR4A 3VURA 3MDKA 1YY7A 3EMPA 2IMDA 5B6MA 1YJ6A 4OO4A 1JZRA 4MABA 1M9AA 1TOFA 2M72A 4TKYA 2G0FA 4NV5A 2DIYA 2VL2A 5D9VA 4AJ7A 6GSYA 3LEFA 3M9JA 4Q5NA 1JZWA 3LQ7A 2E0QA 3J7Yk 1AW9A 3TDGA 3GURA 1PMTA 1T1VA 1WJKA 3PINA 2H76A 1ZMAA 2DBCA 2HI7A 1HD2A 5JWRB 2WS2A 3L0HA 4HI7A 2PPTA 5KN2A 2BTOT 6GSUA 5CREA 3GKXA 1A24A 2NTOA 2VCTA 4HJMA 3ERFA 2DLXA 3ZZXA 1RW1A 4KX4A 1SENA 3N5OA 4LLRA 5DJLA 2WB9A 2DJ0A 5DCGA 1M7TA 3DWVA 2P5RA 2YWMA 4XS6A 4NXIA 1T4YA 3ISOA 5ENUA 5D96A 4OFNA 1BX9A 3O3TA 2MMZA 4LL4B 4KNDA 4MZCA 1EP7A 5DCHA 4HUAA 2YCDA 2GS3A 3UVHA 2LKUA 4K0NA 2FWHA 1SU9A 2DJJA 1OKTA 2B5EA 2GSQA 3MWHA 4MPGA 2H6XA 4TR0A 1X5EA 1SJIA 2R2JA 4KE3A 1XPVA 4OFMA 3P7XA 1JHBA 18GSA 3KXOA 3GIXA 2VLUA 4K9ZA 2FA8A 3CTGA 1TK5B 4MJEA 2YV7A 3HVSA 3KMNA 3QD9A 2RM5A 1WRYA 4MH2A 3D6IA 2PUKC 2I1UA 1QFNA 2V6KA 2B1LA 2EIQA 5IMCA 2XBIA 5IO0A 3GL3A 4ULXA 3ZVJA 4K2DA 2OE0A 4PXOA 3PGTA 4MPFA 1O73A 2H72A 4WR5A 3IAM2 3H1NA 2VLTA 2Z9SA 4NAXA 2REMA 3FZ4A 3KZQA 1USBA 1ZYEA 1GTBA 2B3SA 4WETA 3TOTA 3RPNA 1K3OA 4V2LA 3FW2A 4DEJA 2GQLA 5CNWA 4XS4B 5INYA 4PUAA 4MZBA 2E2GA 2KUCA 1ZZYA 4IBPA 2FWEA 4IJIA 4IKHA 2V41A 1EZKA 1FHEA 1R4WA 2AHEA 2ON7A 1GLPA 1V57A 4GSTA 4IHUA 4RUVA 1Z6MA 2C3QA 1A2MA 2H0IA 4RI7A 2M46A 3CRUA 2AAWA 3E3EA 1OC9A 3W8SA 1WWJA 1S3AA 4DSRA 3F4RA 3TJBA 4HJ2A 5IMZA 4FO5A 1U87A 3FYGA 1WP0A 5CO3A 4HEA2 1SK2A 3ZL5A 4EF0A 4XTSA 4OD7A 5DVBA 4IN0A 4MJCA 2TRXA 2HRFA 1SYXA 4EC0A 3ED3A 3KTLA 2IMKA 5J9CA 1YEXA 1R5PA 3L9SA 2MMAA 1MTCA 5JCWA 2HZEB 2WFCA 4OCEA 3DIEA 1XXUA 1ON4A 2B1KA 3TKSE 3US3A 2GSRA 2R4VA 1LJRA 2C8UA 3IA1A 2VLVA 3IK9A 4MF5A 2VM1A 1X9MB 2HXKA 4LMWA 4EUYA 4F9ZA 1TK0B 3FY7A 2JSYA 2L6DA 3VWWA 2CX4A 2RUFA 1X5DA 3QPMA 3FKFA 1OC9B 1TP9A 2C0EA 3C1SA 5JCGA 4PNGA 3GL5A 3K8NA 3APOA 2EC4A 1MDJA 3UMAA 5HFKA 2QSIA 3EYTA 4EE0A 2MBSA 3BCIA 2DJ3A 4HS1A 4I6XA 5ECHB 2FD3A 2DJ2A 5HR3A 3GH9A 5F07A 5KN0A 3KP9A 3KD0A 3F0IA 2GSSA 3F6FA 4ML6A 2OADA 1FO5A 4QL9A 2IIYA 3TRPA 2N5BA 2M80A 2JZTA 3C8EA 4I8BA 5G31A 3CRTA 3WGDA 3Q6OA 1JZDA 6GSSA 1FW1A 1XW9A 3FZAA 1GSYA 2VIMA 5EPFA 3OR5A 1SL0B 4AGSA 5LCZA 4QQ7A 1THOA 2D2ZA 1XWBA 5ECKB 1PX6A 4ZB9A 1M2DA 2VO4A 4D73B 5ID2A 3F3QA 2H66A 2K18A 2C3TA 4OFTA 2R37A 5GZZB 1JLVA 2QKEA 2H19A 2IMEA 1SD8A 4H86A 3D4MA 5D9WA 2FCHA 3HJPA 3LORA 3CBUA 1XIYA 5FT3A 1HNAA 4N10A 3EMXA 5IMFA 4DSSA 5C04A 1TDIA 4IP6A 4NV2A 4X43A 1V40A 4WF5A 2JSZA 4HZ4A 3FZ9A 1PGTA 4E8HA 2F51A 2KLXA 4ML1A 3G7YA 3IXRA 1K0NA 2X64A 3TB2A 3KMOA 3FZ5A 4MK3A 6GSXA 4TVEA 3TKSC 3KIJA 1X9WB 1A2LA 4ECCA 1J9BA 4EL1A 2AB6A 4POBA 3M8NA 2YV9A 1EWXA 5J4UA 4ZL9A 5IMAA 4TXOA 4MP4A 1WIKA 4HOJA 3HHVA 4GSSA 5G30A 3F4SA 4KB3A 6GSWA 1PSQA 2F3MA 1YKAA 2AYTA 3F4TA 2BMXA 3D21A 3GX0A 5JCUA 4I2TA 1VRSD 4PQ1A 4EKZA 1EV4A 5ECNB 4FYCA 1SL1B 2HNLA 3WGXA 4NHWA 3UVTA 3TKPA 1IYIA 2YP6A 4KAEA 4JE1A 4ID0A 3A2VA 4GRFA 1Z3EA 1GULA 3D5JA 3CSHA 3GKKA 2C0DA 5LNKe 2X8GA 5GSSA 2PERA 4KCEA 2MBTA 1NW2A 1TW9A 4HZ2A 1A8YA 1SJZA 4IQ1A 3UL3A 3KH9A 4HDEA 4P3YB 3FK8A 1B9YC 3CSIA 2HE3A 4ECIA 2O7KA 4GTUA 4V2MA 1TI1A 2WZ9A 3D4TA 3N9JA 4CDOA 5GAND 2J23A 3EVIA 4QL7A 3P90A 1TI3A 5ECIB 2L5LA 5LD0A 2YZHA 4YQMA 4G9HA 2HT9A 3DD3A 2DMLA 2YWOA 4IELA 4O5RA 1KTEA 1SK1A 1HQOA 5HFIA 2YJHA 22GSA 4PNFA 2LUSA 1N2AA 2H74A 3EU3A 2PN8A 3H4KA 3M1GA 1QXHA 4FIWA 4XS1A 3VPQA 1F2EA 1V9WA 1SJ6A 3EC3A 2YZUA 2H1AA 2O8VB 5J5NA 1YEPA 1MD3A 5ECRB 1SD9A 5EVOA 1OE8A 2VD0A 1ZL9A 5ECLB 1I5GA 5DJMA 1A8LA 3GSTA 4TR1B 3IRAA 5KN1A 3C7MA 2NDOA 4EDYA 2LSTA 5GSTA 1G7EA 3Q74A 4GQCA 1VF4A 1XVQA 2WCIA 1T3BA 3AY8A 4ECJA 2H0GA 5ECQB 4BWSA 1XFLA 1M2BA 3GN3A 4O92A 2F9SA 2N5AA 4O7HA 3DGQA 3TJFA 3IBHA 1K3YA 3F3RA 1B8XA 3IHQA 2AUVA 4XIHA 1T8EB 3JCML 3KH7A 3EU4A 2AJQB 1XZOA 4IW9A 2C3NA 3DEXA 2KHPA 3GX8A 3ZIJA 3IDVA 3VLNA 5G5FA 2LS5A 1M0UA 3G7IA 3KGKA 4XCSA 3M9KA 2CV4A 3ME8A 2YWNA 4XS4A 1GNWA 3TJGA 5F8BA 2LRCA 2B5XA 1KBNA 4WF4A 5A4WA 4NMUA 2PVOC 1ERUA 3ERWA 3A3TA 4AF2A 2NBSA 4F03A 2F8AA 4K6XA 1T4ZA 1FAAA 3TRXA 2H1GA 2AV4A 2VUPA 2C4JA 2HRNA 5IO2A 2DC5A 4YH2A 1UN2A 2LJKA 3M3MA 1GP1A 2H6YA 5J3RA 2PGTA 5CRDA 3GMFA 1F37A 4WXTA 2B7KA 2F8FA 4XRAA 1GUKA 4JZQA 2FGXA 3KCMA 2IPAA 3QFBC 1GWCA 3I6AA 3TJJA 2V2GA 5CP1A 3CSJA 5A4UA 4FH8A 4YAPA 2HYXA 2JL4A 4K7IA 2LEGA 3ZREA 3GSSA 3KEBA 1PN9A 4YAVA 1SYRA 2C1YA 4PQHA 4X1UA 3NOFA 1HNBA 1GSQA 2HZEA 3BD2A 5D8IA 1RK4A 2K8SA 1JLWA 4TN8A 3RPPA 5JWQB 4CHSA 1F3AA 1YZXA 2YJ7A 4MDCA 1AQXA 5CRWA 5IPGA 2PBJA 5L71A 2GZZA 2P31A 3HZ4A 1XWAA 4GCIA 3GH6A 1GSSA 1PX7A 3SWLA 2L59A 1T7PB 3KTBA 1ML6A 4POMA 2LRTA 1H4OA 3QAWA 4GF0A 4EO3A 1A0FA 1NSWA 3UBKA 4AJ8A 4GQFA 3HJOA 4BPYA 1DBYA 3QR6A 2XPEA 4MJBA 4N30A 3HKRA 1BG5A 3LXTA 2QGVA 1QMVA 3IE3A 3G7JA 2KP1A 3QFAC 5DAKB 4KCAA 1EGOA 3WGEA 2JACA 2DIZA 3S9FA 3GKNA 2CQ9A 3ZIVA 1O85A 2VCWA 2GDRA 2IMFA 4KSMA 5ELAA 3H93A 1V58A 5B8BA 5IMDA 1IYHA 4PGTA 16GSA 1Z6NA 3VPTA 4I97A 3DVWA 1GUMA 2A2RA 3HXSA 1DSBA 4RQXA 3LGCA 1G6WA 3UJ1A 4MCUA 2RIIA 1GH2A 2NVLA 2ZCTA 3LWAA 1G7OA 1TRUA 2N5FA 4ZB6A 2LRNA 2GTUA 4XHMA 4AJ6A 5CAXA 2IMIA 1A2JA 1EOGA 1K0DA 1HYUA 1OYJA 3FHKA 4D73A 5H5RA 2I9HA 3QDNA 2HSYA 3VFIA 5IOWA 2I4AA 2VL9A 5ECPB 2KOKA 2JZRA 1X0RA 1GUHA 1GTAA 3H8QA 1EV9A 3EWLA 1GTUA 3O76A 3HCZA 4TR4A 2WDUA 1B48A 2VCVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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