1XZOA

Identification of a disulfide switch in bssco, a member of the sco family of cytochrome c oxidase assembly proteins
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
172
structure length
172
Chain Sequence
QQIKDPLNYEVEPFTFQNQDGKNVSLESLKGEVWLADFIFTNCETICPPMTAHMTDLQKKLKAENIDVRIISFSVDPENDKPKQLKKFAANYPLSFDNWDFLTGYSQSEIEEFALKSFKAIVKKPEGEDQVIHQSSFYLVGPDGKVLKDYNGVENTPYDDIISDVKSASTLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Identification of a Disulfide Switch in BsSco, a Member of the Sco Family of Cytochrome c Oxidase Assembly Proteins
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal binding protein
source organism Bacillus subtilis
molecule keywords Hypothetical protein ypmQ
total genus 51
structure length 172
sequence length 172
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-11-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02630 SCO1-SenC SCO1/SenC
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1xzoA00
3GNJA 2IJYA 2FNOA 1AAZA 3EC3A 4DSSA 1Y6EA 2V1MA 5B8BA 1SKWB 4WF4A 3KIJA 2IMKA 3D4MA 5ABRA 2VUPA 1MDKA 2H6YA 2AAWA 4J57E 3US3A 2GQLA 5E59A 4IN0A 1A0FA 5ELAA 2V2GA 3GV1A 4KDUA 2XHFA 2V6KA 3TKSE 3ZFBA 2C3QA 3O3TA 2QC7A 4K0GA 3EMPA 3VWVA 4CW9A 2OKAA 4MLYA 2H70A 3C71A 4IBPA 3GSSA 3M9KA 1SU9A 2IWTA 4K1FA 1FB0A 1O81A 4O92A 4IELA 2WZ9A 3G7YA 2R3XA 4OWYA 1SENA 1OC9B 3N5OA 5CRHA 5C00A 3C7MA 18GSA 5J41A 4HQZA 3LQ7A 4IJ3A 1DSBA 2B6MA 4IGJA 2VCVA 1FB6A 2KUCA 1XWCA 4K0NA 3KTBA 3U5RE 1F37A 2YCDA 1ZMAA 2LJKA 3P7XA 3LYKA 14GSA 1USBA 2WFCA 1I9DA 1TK8B 4N0ZA 1YQ1A 3DIEA 4LLRA 1CQGA 4EXJA 5G2ZA 1LU4A 1JLWA 4J2FA 2FWEA 2VOCA 1TKDB 3DWVA 5ECNB 2I81A 4IJIA 13GSA 2LNSA 3ZL5A 1JZWA 5IO0A 1QGVA 1R5PA 2OJLA 1EP8A 1TOFA 3I43A 1MD4A 1ERUA 4KAEA 3HCZA 1NHOA 2VCXA 4TR0A 2K8VA 2F8FA 1K0NA 2OA7A 3F63A 3ZIJA 3GKMA 3VWWA 1SL1B 1U88A 1KTEA 3DEXA 4GQFA 4YQUA 1T4ZA 1W4VA 1HNBA 3IXRA 3HKRA 3BCKA 3APSA 22GSA 1HQOA 2DJJA 2G2QA 2L4CA 1Z5YE 4ECBA 3TOUA 3VPTA 1PGTA 1T4YA 1C72A 2H6XA 5F06A 2HT9A 4HJ2A 2K8SA 4L5LA 2HNLA 5GSSA 3QMXA 2H75A 3KEBA 4MJAA 3EVIA 1JZOA 4CHSA 4CDOA 2NBSA 3KM6A 4N30A 4FYCA 16GSA 1V98A 2YWMA 3E3EA 2LRTA 2C8UA 2BJXA 1EGRA 2Z9SA 5A4VA 1WE0A 2IPAA 3GKXA 4FYUA 4TR1A 3F6DA 2FWHA 4D73B 2XC2A 4KGIA 4G10A 5ECOB 2DMMA 4E8HA 5G1LA 1W89A 4TXOB 2WULA 5HFGA 4EC0A 1Z3EA 2GQMA 1JHBA 1ZYEA 1YKAA 2O7KA 2GVPA 2X99A 4ZBDA 1JZRA 3FRCA 1R7HA 3F3RA 2E2MA 3F3QA 3LGCA 6GSVA 3GTUB 1GH2A 3KH9A 5LNKe 4EDYA 4AF2A 7GSSA 4PX1A 1PD21 1YF1A 1X5CA 3P2AA 3VLNA 4KB3A 1TK5B 2CX3A 4ZBBA 1GSSA 2H0GA 4TR3A 2JZTA 3IR4A 5B6MA 4HZ2A 2VCZA 1B48A 8GSSA 2J23A 4LA1A 9GSSA 1OYJA 3HZ4A 3A2WA 4OMVA 4V2NA 1ACVA 5DAKB 1AIUA 3J7Yb 1X9WB 5J4UA 2YV9A 4KW6A 3MWHA 4MA9A 5IQYA 2IFQB 2YWOA 3F4SA 2H8LA 4YH2A 3GSTA 2VL2C 1HD2A 1DUGA 3F4TA 3L9SA 3SBCA 3WGXA 5DVBA 4NV5A 3CTGA 1ZZYA 3VI5A 1PX6A 4KSMA 1RW1A 1O8WA 1WPIA 1FO5A 3A2XA 1CQHA 4Q5NA 4WETA 3MNGA 3C1RA 1YF0A 2PPTA 2C0EA 2XPDA 1TRSA 2PBJA 2CX4A 3FZ9A 1GSQA 3J7Yk 3RBTA 2DLXA 1R5AA 4F03A 3ERWA 2IN3A 3PINA 1A8LA 3IC4A 4TKYA 1J0FA 5CNWA 2GS3A 5IMZA 1F3BA 4BWSA 3U6VA 3DD3A 2QSIA 2AJQB 3WD6A 1O6JA 2H1GA 2A2RA 5KN2A 2H30A 2GT5A 2AHEA 3L9UA 3D22A 3TJJA 4PQIA 2IMIA 5C04A 1UC7A 3IOSA 3SWLA 1G0TA 2R4VA 1XOAA 1BG5A 2NDOA 1XBSA 1BAYA 2IL3A 5IMDA 4BVXA 3FKFA 1EGOA 2O89A 4I8BA 3RPNA 4RQRA 1BX9A 2I4AA 1F9MA 4FO5A 5F05A 19GSA 2YN1A 4LMVA 3HJPA 5D9WA 1QXHA 4NV2A 5HR2A 1K0MA 5B8AA 4POKA 1XOBA 1F3AA 3NOFA 5GSTA 4ZL7A 2X8GA 2DJ1A 3D6IA 4HUAA 4YAVA 2GQKA 3M8NA 2MMNA 2OBIA 1ERVA 2ZUPA 1M2BA 2C0GA 2L5LA 1U6TA 2OE0A 3DVXA 4ECIA 1UA5A 1FG4A 3TRXA 1WMJA 3KP9A 4Q5RA 3A2VA 2B5YA 1Q98A 1Z6MA 3KTLA 2I1UA 4EKZA 5IOXA 2B5EA 2FA4A 3ZLPA 1XFLA 1O7UA 1R4WA 1JLVA 2HE3A 2GGTA 1G6YA 3GX8A 1SJZA 3BOAA 4H86A 1OVNA 4MMMA 2MYGA 5ECLB 2LRCA 5ID2A 5JCWA 1GUHA 2RUFA 4K2DA 3HY2A 4MZBA 3MAKA 3UVTA 3UBKA 4JBBA 1H4OA 4PQ1A 2KP2A 3LG6A 1FHEA 2WS2A 3KH7A 3TJGA 4AJ6A 3FZ5A 2B5XA 4NAXA 3ZTLA 1XCCA 1QK8A 1OE8A 2OE1A 1E6BA 2HZEB 4BL7A 2YOIA 3MSZA 1WWJA 4KDYA 3UJ1A 1Y25A 3EINA 2ZCTA 2P5QA 2X64A 3L0HA 5H5QA 2GSTA 5D73A 4F2IA 4MCUA 1K0BA 3GH9A 3NZNA 4QQ7A 3QPMA 3BBYA 2VL3A 2A4VA 1WIKA 4L0UA 3Q74A 4IS0A 3ZITA 4N0VA 2IIYA 2PMTA 5G30A 1XWKA 4V2MA 1PX7A 5G31A 3JCML 3LWAA 5D8IA 2PN8A 3N9JA 4XHMA 3TJBA 3LFLA 5AIXA 3EURA 1A24A 1JZDA 3EWLA 4P3YB 4TVEA 5IOWA 3W8JA 1EZKA 4EF0A 4MP4A 5H5SA 2CT6A 1ZYQB 2H0IA 1XWBA 4EE0A 1GTIA 4ECJA 5IIZA 5DJLA 2AB6A 3FHKA 5DALA 2CVBA 1BYEA 4YQMA 1SD9A 1OKTA 4AGSA 1HNAA 1UN2A 1DBYA 1SK1A 1XVWA 2DJKA 3FR9A 2H1AA 4MF6A 1DE1A 4BPYA 3PH9A 2MBSA 2VD0A 2VLVA 3KMOA 2FHEA 5AGYA 1T1VA 1EV9A 3H8QA 2WRTA 2GLRA 3ZFLA 5D9TA 4MJCA 1GTAA 4XS6A 5GAPD 1TI3A 2M72A 2GSRA 2YP6A 3CXGA 1SJ6A 2KOKA 3GL3A 2R2JA 1OE7A 2JZRA 1YEPA 3RHBA 3ZZXA 3TUEA 3H79A 2ON5A 4WXTA 4Q5QA 2LV3A 4TR1B 5CYYA 4OFMA 1MEKA 6GSSA 1PA3A 3Q18A 3RAZA 3DRNA 2DJ3A 4NPBA 4DSRA 17GSA 2C1YA 4HS1A 12GSA 2IMEA 4XIHA 3CBUA 1PSQA 3P8WA 3TCOA 4DEJA 2WCIA 3WT1A 4HOJA 1G6WA 2P5RA 1ZGNA 2F51A 4HI7A 3G7JA 2FLSA 4YAPA 3F9UA 2X8CA 4G2EA 1OC9A 4HDEA 4MK3A 3ZVJD 2G0FA 3UBLA 1GSDA 3IRAA 1HNCA 3TDGA 4F82A 6GSWA 4HZ4A 2NVLA 4GCIA 1XW5A 3LSZA 1XWAA 5ECIB 3L4NA 3L78A 1ERTA 2FD3A 4GQCA 2WGRA 4ZILA 3DVWA 4GWRA 2RUEA 2LRNA 2VCQA 1TU8A 2LEGA 1O85A 1BQ7A 3DKSA 1GL8A 2C4JA 3HJMA 2H01A 1GSEA 1MD3A 3ZRDA 2R6KA 1ON4A 2QKEA 5G5FA 1YDKA 3TKRA 2F9SA 4PQHA 1M99A 1T8EB 1FVKA 4QL9A 4GF0A 1GNWA 5ECPB 4RQXA 2VD1A 3UMAA 1TTZA 5LD0A 2DSAA 5A4UA 1GTBA 1MDJA 3GA4A 1GRXA 2CZ2A 4BA7A 1SYXA 1PQNA 1TRWA 3O6TA 4DVCA 2I9HA 3TKQA 4ULXA 3EU3A 5L71A 2H6ZA 5E4WA 1B4QA 2VL2A 5ECRB 4KUNA 3HD5A 3M3MA 1SK0A 3IV4A 3KP8A 4I5QA 1A8YA 2V32A 2AYTA 2EC4A 3APOA 3Q19A 2YJHA 3VWXA 4ZB8A 2GZPA 1Q4JA 5IPHA 5IO2A 1TRUA 2F8AA 2LUSA 4DSQA 1Z7PA 3WYWA 4KE3A 1EV4A 4V1Ag 1G7OA 2R5GA 5ENUA 4X1UA 1TI1A 3PGTA 1OAZA 4MPFA 2HFDA 4WBJA 2P0GA 4EL1A 5A5KA 1B8XA 3TRPA 4POBA 3TB2A 1WOUA 1IYHA 3V1WA 4O5RA 4RUVA 3LYPA 1ABAA 2EIQA 2B3SA 3GHAA 1B9YC 5HR3A 3HJOA 3ZIVA 2GT6A 2PUKC 5G5EA 4LMWA 3DMLA 4TXOA 2CZ3A 2LKUA 2CVDA 4NXIA 2R37A 5INYA 2HRFA 1KBNA 1NSWA 1AXDA 1SKSB 1M7TA 2D2ZA 3GN3A 1ILOA 2GZYA 3GURA 2CAQA 1YJ6A 5IPGA 3MDKA 1XWGA 4L5OA 1ST9A 1E2YA 1VF3A 1THXA 1DE2A 3GTUA 5DDLA 3WGDA 2TRXA 5CRWA 3HDCA 3UEMA 5KN0A 5D9VA 3KCMA 3GYKA 4JRRA 4N10A 2CAIA 2H19A 2L59A 2B7KA 4TOPA 3CSIA 4TW5A 4I6XA 2CV4A 2FA8A 3DXBA 2PWJA 5DCHA 4JR6A 2P31A 4QL7A 4XS4B 5ID2B 3F4RA 2BMXA 3EYTA 2CQ9A 3ERFA 3DYRA 2TRCP 2O87A 3DGQA 3CSHA 2IFQA 3HZ8A 2QGVA 1TJDA 3M9JA 3UIWA 1FW1A 1BJXA 1V9WA 1U3AA 2B1KA 4G19A 4YQVA 1PN9A 1GSUA 3IDVA 2H71A 1U3IA 5JCUA 2MMAA 2VM2A 1SJIA 4Q5FA 3L9VA 5G1KA 5KN3A 2FWGA 1GSYA 2ON7A 5IMFA 4JZQA 4ZB6A 1RK4A 1XPVA 3F8UA 5JCGA 4MH3A 4BWQA 4EDZA 5CAXA 2GSSA 4V1Ap 3TKSC 3C8EA 2YJ7A 3GIXA 1AQXA 3HVXA 4KNDA 2HRNA 1GUKA 1IYIA 1UVZA 4WF5A 3EU4A 3ED3A 1NM3A 4HU9A 1GP1A 2LJRA 1GUMA 2WJUA 4POMA 2K9FA 1QMVA 4IP6A 1URMA 4F9ZA 4JE1A 1ML6A 4DSSB 4XRDA 4AJ7A 2VO4A 2WB9A 2VAFA 3BCIA 4GLTA 4GTUA 2YPMA 2DC5A 6GSTA 4K8MA 3TRQA 3HHVA 1V40A 2C0FA 3CMIA 1KEBA 4OFTA 4XCSA 2H1BA 3QFBC 4JU5A 3RDWA 3TOTA 2VM1A 4K7OA 5J5NA 3GH6A 3KJYA 2L4QA 4ZXGA 4WEYA 4KDXA 1A2JA 1N2AA 1O8XA 2H72A 4TXVA 2REMA 5JWOB 1F2EA 4ACSA 5IMAA 2OACA 3R2QA 4WBRD 3IA1A 5D96A 2HZFA 1K0DA 1K3YA 4TR4A 1SK2A 2BTOT 3E9JB 1LJRA 1X9MB 4IHUA 5GZZB 3D21A 3S9FA 2L6DA 5IMVA 4HJMA 3CRTA 4JEDA 3FEUA 2MMZA 3GUSA 1Z7RA 11GSA 2JSYA 1KNGA 2MBTA 3QR6A 5DQSA 1XZOA 1V57A 3WT2A 4MH2A 3IAS2 1OC3A 2YWNA 2C80A 1AQWA 5CRGA 4EVMA 1EEJA 1AW9A 3FK8A 4PURA 4OCEA 2H66A 2VL9A 5DBQA 1ZL9A 4KX4A 4POLA 1XIYA 4XTSA 1WRYA 4MJBA 4X0XA 1FVJA 1HYUA 1AC1A 1SL2B 10GSA 1EWXA 1TK0B 2FWFA 2E0QA 5J3RA 5J9CA 3CRUA 4I97A 3M1GA 3G7IA 5CO3A 1VF1A 2V41A 4KH7A 3ZMKA 1A23A 2YNXA 5EY6A 4FIWA 3PR8A 2B7JA 2F3MA 4BVYA 4V2LA 2HZEA 3GL5A 3ERGA 2JSZA 3KXOA 1ERWA 5ECSA 2JACA 4ML6A 2CVKA 3QOUA 4O7HA 4ZBAA 2LTKA 3KGKA 4IQAA 2ZNMA 1OKDA 3Q6OA 2VLTA 5JWQB 2AV4A 1VGLA 1X9SB 5KEJA 1S3CA 1PMTA 1TU7A 4EUYA 3KD0A 4O32A 1M9AA 1PRXA 1A2MA 2JZSA 3D4TA 1Z6NA 20GSA 3HXSA 5ECHB 1XVQA 2O85A 2HYXA 2DIYA 1J08A 2H76A 3UOMA 1QQ2A 2PU9C 3UARA 2YZUA 3AY8A 1O73A 5J9BA 1GULA 3H1NA 3CSJA 5B7CA 1GLQA 4OCFA 4NHZA 1TXXA 2C0DA 1F6MC 3M0FA 1M9BA 1S3AA 3QFAC 3QAVA 3CYNA 1YEXA 3D5JA 1QFNA 4NMUA 3C1SA 5EPFA 1GNEA 3GRXA 4GSSA 1X5DA 4ILFA 2MZCA 1VF4A 2XPEA 1FAAA 2IMFA 2ES7A 3K8NA 5JWRB 2HI7A 5HFKA 3BD2A 4GRFA 2JADA 3ZVJA 2FY6A 4RI6A 3FYGA 3TKPA 3H93A 4OFNA 5AN1A 2WDUA 2NPBA 4L0WA 4LL1B 2GTUA 1ZCPA 3FR3A 1PKWA 3I69A 4N11A 4MF5A 4MJEA 3O76A 6GSXA 2O8VB 3HYPA 4KA0A 2PGTA 2A2SA 2VCTA 5FWGA 4HEA2 3VURA 2VLUA 4PUFC 1EOHA 1X5EA 1VF2A 3F0IA 1GLPA 1T00A 5HFIA 1K0OA 4IVFA 2DJ0A 4ZL8A 2NTOA 1H75A 2ALBA 3HVSA 5COHA 4ML1A 4IW9A 4K6XA 4JR4A 1PL1A 4ISDA 3LORA 5ECMB 2IMDA 4XS1A 3VI7A 1G7EA 1MDIA 2C3TA 1S3DA 3UAPA 1SL0B 5HR0A 4ECCA 1BEDA 2PVQA 2XBIA 1SYRA 2KHPA 3ZREA 4J56E 1T7PB 1WJKA 2PERA 2LS5A 3KMNA 2RM5A 2J9HA 4NWYA 2N5FA 2K18A 4Z7XA 4F0CA 4F0BA 4MF7A 1V2AA 3EMXA 4I2TA 2LJAA 6GSYA 3VPQA 1U87A 5DQYA 2I3YA 3GKKA 2OADA 2KLXA 2HLSA 4TN8A 3TJFA 2MMOA 1I5GA 1V58A 4NHWA 2CA8A 3TJKA 1OC8A 4XRAA 5AIVA 5D9XA 4KCAA 2DJ2A 2EIRA 4OD7A 5A4WA 4L8EA 4MZCA 3RPPA 5EL8A 5ECKB 2GSQA 3CTFA 3BJ5A 1XW9A 2YWIA 3LXTA 1FOVA 1AQVA 1TW9A 4IP1A 4KSOA 1ZOFA 2XBQA 3D0ZA 1GWCA 2YV7A 4PNFA 5AISA 2M80A 4AJ8A 4D73A 1NHYA 2L57A 3FR6A 3IE3A 5B6NA 3TGZA 1LBKA 1B9XC 5KN1A 1VRSD 3P90A 1Z9HA 1AUCA 4HQSA 1M2DA 2AUVA 1N8JA 3ISOA 3EE2A 1XXUA 5H5RA 5DCGA 4I2UA 2KP1A 1PKZA 5F0GA 3QDNA 5ECQB 2JU5A 2OE3A 2X8HA 2N5BA 3QAWA 2C3NA 1B4PA 4K7NA 4K9ZA 5DJMA 2L6CA 3IK9A 1MTCA 3I6AA 3OR5A 2VCWA 3QD9A 2H74A 2FUG2 5CRDA 3HA9A 4PUAA 1TP9A 5D93A 1GSFA 1R26A 1K3OA 1RQMA 2FGXA 4MABA 5CP1A 1M0UA 3IAM2 1M2AA 2EIOA 4ID0A 4KCEA 4EO3A 3VWUA 3WGEA 3LEFA 4PGTA 4OO5A 4GXZA 4IQ1A 5DAKA 3W6GA 1JFUA 1YZXA 2L5OA 5IMCA 2E7PA 2H0HA 3TKSA 3LJRA 1K0CA 3GFKA 4HU7A 2DIZA 4TRXA 4MZWA 4WKWA 2M46A 1SD8A 4GSNA 2RM6A 1TDIA 3GKNA 5FHIA 2H1DA 5EVOA 4WR5A 3E0UA 2DBCA 3F6FA 2HSHA 2FCHA 2V6OA 5HR1A 3NIVA 4OO4A 4IKHA 3W8SA 4ZL9A 4MDCA 1GTUA 3A3TA 3ME8A 1A2LA 2E2GA 2YZHA 1YY7A 5F8BA 3ME7A 4GSTA 1TRVA 3FZAA 1SKRB 5IM9A 3VK9A 3FW2A 3G9BA 3A5WA 5ELGA 2LNTA 3FY7A 3KZQA 6GSUA 1EOGA 1NW2A 3UL3A 2RIIA 2K6VA 1K3LA 3QAGA 1WP0A 4WR4A 4FH8A 4XS4A 1QUWA 3IBHA 2N5AA 4PNGA 4MPGA 4G9HA 1T3BA 4ZIJA 2VIMA 1YKCA 5CREA 2HSYA 3HVVA 2DMLA 3I9V2 1A0RP 4PXOA 5DALB 3IHQA 2B1LA 1K0AA 2H73A 2GDRA 4K7IA 4LL4B 2LQQA 5HQPA 1EEMA 2LSTA 3H4KA 3ZYWA 3GMFA 3IPZA 4ZB9A 3IK7A 4E8EA 3GX0A 1J9BA 1THOA 2GZZA 2HXKA 2LQOA 3VFIA 3APQA 5F07A 3LXZA 1EP7A 3QCPA 5FT3A 1X0RA 2OBKA 3ZMLA 4X43A 2YANA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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