1A24 | Genus

Total Genus 44

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	44
sequence length	189
structure length	189
Chain Sequence	AQYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPHCYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEKK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure of reduced DsbA from Escherichia coli in solution. pubmed doi rcsb
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Escherichia coli
molecule keywords	DSBA
total genus	44
structure length	189
sequence length	189
ec nomenclature
pdb deposition date	1998-01-15

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01323	DSBA	DSBA-like thioredoxin domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	1a24A00

4MZCA 3C73A 5A4WA 4I5QA 2YJHA 1BG5A 4XHMA 2GSRA 1RQMA 1WWJA 4MJEA 3ZITA 4TXVA 3ISOA 4BVYA 1FB0A 3M0FA 3MNGA 3JCML 1T4YA 1XPVA 4I8BA 4NMUA 4K1FA 4HEA2 4X1UA 2H70A 2PUKC 1U3AA 4Z7XA 2EIOA 5HR1A 4OO5A 3RPNA 2LNSA 5B8BA 2VLVA 4V1Ag 4FYBA 3SBCA 3KD0A 4ZBAA 5IPGA 1GSEA 4YQVA 3IBHA 2YANA 3DEXA 4GXZA 1JZOA 4IGJA 4QQ7A 2HFDA 5D96A 5KN2A 3FZ5A 2AHEA 2RIIA 2HSYA 3CBUA 5DQYA 1ZMAA 1I9DA 5DQSA 1QQ2A 1ON4A 5A4VA 3DVXA 2F51A 5IO0A 6GSYA 2YZUA 1W4VA 3EE2A 4WXTA 1FB6A 5C04A 3ZMLA 3GH9A 3UEMA 5ECQB 4RI6A 3ZLPA 4HU9A 4DSRA 4ECIA 2HZFA 2DJ3A 3ZTLA 9GSSA 6GSSA 2H75A 3KMNA 1EWXA 4BWQA 2GDRA 2J23A 3QD9A 2GT5A 1TRVA 5G1KA 4HS1A 4FIWA 4QL7A 3KZQA 2L5OA 2C0EA 3L9UA 3UBKA 4IW9A 4XS1A 1YEXA 4PGTA 2KP1A 2R3XA 3QMXA 3C1SA 2C1YA 3TCOA 4KB3A 6GSXA 1SD8A 1CQGA 2IN3A 2GQLA 2VUPA 2L57A 3I43A 1NM3A 1LU4A 4MABA 4IELA 3KXOA 4RI7A 1GSUA 2H73A 2NPBA 3GL3A 2MMNA 2C8UA 4V2NA 1OE8A 4WKWA 4EC0A 17GSA 1MDIA 4F82A 2DJ1A 1O81A 3ZREA 4EUYA 3QDNA 1O8XA 2DBCA 4V1Ap 4IQAA 4D73B 1PX6A 1QGVA 4LL1B 4WBJA 1T1VA 3LEFA 2DMLA 4J57E 2R4VA 2XBIA 2KHPA 2KP2A 2LQOA 1QXHA 5ECSA 3CTGA 1EZKA 3IAS2 1Z7RA 1SYXA 3HJPA 1B48A 5G30A 1ST9A 3FYGA 4IBPA 3RPPA 2M72A 1YZXA 4OCEA 4TXOB 1JHBA 2G2QA 1JZWA 2DJKA 1ZOFA 3ZVJD 5H5QA 12GSA 4WR4A 3U6VA 2H19A 2CZ3A 5D9VA 4K9ZA 3D21A 4KSMA 4MF7A 1XFLA 4POKA 4FH8A 2KLXA 1JZDA 2GSSA 3IOSA 4EDZA 3D5JA 4NHWA 1TI3A 3QOUA 3ME7A 2WFCA 1OYJA 3TJFA 3W8JA 3HHVA 2WGRA 1DSBA 3DIEA 2CX3A 2H1GA 2LV3A 4JBBA 4PQIA 2LRNA 1IYHA 3D4MA 4EKZA 2LJAA 2P0GA 1SK1A 1GTIA 2H1DA 2GTUA 4ID0A 2VL2C 3HXSA 5DALA 4RUVA 2JZRA 3HZ4A 2OADA 2CV4A 3BOAA 2FCHA 5B8AA 3A2VA 3OR5A 1M2DA 4ACSA 2AUVA 2FD3A 1M2AA 1R5AA 3KEBA 3ERGA 1T8EB 1TXXA 3CSHA 4HJ2A 3BD2A 4ZBBA 1H75A 1TRSA 1U88A 1OC9B 1ACVA 3FHKA 2DJ2A 4AF2A 18GSA 4ZIJA 3KP8A 2ZNMA 1XWAA 3WT2A 1GUMA 4F03A 1YQ1A 4YQMA 1Z5YE 5G2ZA 3BCIA 1AAZA 1HD2A 4N0ZA 3ZMKA 1MD4A 1N2AA 2YWIA 1UVZA 2OA7A 2GS3A 4J2FA 3UARA 1GTBA 2BMXA 5J9CA 5JWQB 2X8GA 2MMZA 2JSZA 1YY7A 3IA1A 1SYRA 4I2UA 4JRRA 1HNAA 3GX8A 2B7KA 3DGQA 2VD0A 4FO5A 3HKRA 4KX4A 3GSSA 4HJMA 14GSA 2IMKA 3KM6A 3CSJA 3ERFA 1GRXA 3HJMA 3LWAA 3PR8A 2CVBA 2VCQA 2HYXA 2O8VB 3FR6A 3J7Yb 4XS6A 4WETA 4X43A 4BL7A 1V9WA 3KTBA 3HY2A 5F8BA 2B7JA 2FNOA 4H86A 1OC3A 1OVNA 5CO3A 5B6MA 2AYTA 1YF1A 3UIWA 3APSA 5IMDA 5ENUA 5FT3A 4KCEA 1OAZA 1EV4A 2M80A 3IRAA 3GIXA 3G7IA 4GSSA 3CRUA 1ZYQB 1QMVA 2HNLA 4KE3A 4EF0A 4MJCA 2YZHA 2PU9C 3FKFA 1X9MB 5COHA 3BBYA 4X0XA 2ON7A 1K0NA 2WRTA 1VF2A 2PMTA 2GGTA 4MJBA 5HR2A 3HCZA 1TK8B 4GSTA 1B4QA 3PH9A 2PVQA 4P3YB 2OJLA 4EL1A 1BEDA 6GSWA 3ZZXA 3C8EA 1TJDA 1X0RA 3GKXA 1GLQA 4ZL8A 4F0CA 5CRDA 5B7CA 3TOTA 3L9SA 2LJKA 2A2RA 4EDYA 1GULA 2XPDA 3LJRA 3DKSA 3TKRA 1HYUA 1S3AA 2OE1A 1TKDB 2ES7A 3DMLA 1TP9A 4TOPA 3IK9A 1TRUA 2GVPA 2BJXA 5IMZA 4KDYA 3UL3A 2BTOT 1A2MA 3LG6A 1YDKA 5JCUA 4HQSA 4MPGA 2J9HA 1EOHA 1QK8A 1R5PA 4ZXGA 2C0DA 10GSA 2HT9A 1HQOA 2X8HA 6GSVA 4D73A 2LTKA 3KTLA 3MAKA 2GSTA 3GV1A 3VURA 2VCXA 4IP1A 4K0GA 1URMA 3ZRDA 1GSYA 2WDUA 2O89A 2M46A 1BJXA 5HR0A 4KH7A 3MWHA 2PGTA 2VL3A 2FWFA 2I9HA 5KN1A 4LL4B 4ECCA 1DBYA 1BX9A 5HFGA 2YPMA 1F2EA 1TDIA 4OFTA 2PN8A 3IHQA 1USBA 4OMVA 4TXOA 4JEDA 3TRQA 5FHIA 3ZIVA 1WMJA 1S3DA 3M9KA 4MPFA 1EP8A 1M0UA 3TKSC 4GWRA 1O85A 3EC3A 1MTCA 5F05A 2IMIA 1EOGA 1V57A 3D6IA 5H5SA 2A2SA 5LD0A 2FWEA 5IO2A 4XRDA 2G0FA 1OE7A 3C71A 1SU9A 5HR3A 3LYKA 4HZ4A 3VWVA 3UMAA 3FY7A 4DSSA 2NVLA 1SKRB 3RDWA 4IS0A 2ZUPA 2AAWA 1OC8A 4XS4B 5D9WA 2CZ2A 4NXIA 2OBKA 3I9V2 5G5FA 1FO5A 1F9MA 2C0FA 4OD7A 4IHUA 2CT6A 3GMFA 4NAXA 2OACA 3LORA 2LRCA 4ML1A 1X9SB 1MDJA 3GL5A 2VL9A 4IJIA 3P90A 1WJKA 3ZL5A 3QAGA 4XIHA 3TJBA 3P8WA 1FG4A 1OC9A 2FLSA 2HRFA 1A8YA 3CXGA 4IJ3A 4MDCA 1TK5B 4HU7A 2X99A 5AN1A 2L4CA 1SK2A 3FZ4A 5ABRA 1ZL9A 5HQPA 1F6MC 3SWLA 3F3RA 4TR4A 3KJYA 4TW5A 2VCVA 5HFKA 3DRNA 3ZIJA 2V1MA 2YV7A 2B5YA 5IMAA 5CREA 1J9BA 4YAVA 1YKAA 3CYNA 5B6NA 2V6KA 2WCIA 2E7PA 4WF5A 3GN3A 5J9BA 2MMAA 1TRWA 1A0FA 3GYKA 3V1WA 3FK8A 3UOMA 3HZ8A 4FYCA 2KUCA 1X9WB 2QKEA 1T3BA 4Q5NA 3WT1A 3R2QA 2DMMA 1ERUA 4RQXA 2V32A 2IMFA 3DD3A 3QAWA 2C4JA 2B5XA 3Q19A 2IJYA 1EEMA 1THOA 1SJIA 5D9TA 5F06A 7GSSA 2YWOA 1GP1A 5E59A 4TR1B 8GSSA 22GSA 1SJ6A 5CP1A 4V2MA 2XBQA 5EY6A 2B1LA 1XW5A 3LFLA 2FWGA 2IMDA 5D93A 5KEJA 3GKKA 2L5LA 2GZZA 4MF5A 3FZ9A 1GNEA 4I6XA 2H8LA 2VCWA 5D8IA 1EEJA 4K8MA 1NHYA 2IMEA 3DVWA 3F0IA 5IOXA 5ECLB 1SENA 5DAKB 1FVKA 3LQ7A 2GQMA 1K0MA 2B6MA 3IE3A 3HYPA 5ECOB 2PBJA 1XOAA 1IYIA 1T4ZA 4WEYA 2LNTA 1E2YA 2N5FA 1X5CA 4TKYA 2C3QA 1K3YA 2OKAA 5ECNB 5EL8A 3L0HA 3N9JA 3VPTA 1VF4A 3CSIA 4KW6A 4OFNA 3VPQA 4E8EA 1MD3A 1EV9A 2PVOC 1TOFA 2DIYA 3F3QA 2NBSA 2MYGA 2X64A 2B5EA 2I3YA 2TRXA 4E8HA 1NW2A 2IWTA 2AB6A 4F0BA 3W8SA 2X8CA 1AW9A 2F8FA 1X5EA 1Z6MA 3F6FA 3IK7A 4PUAA 2MMOA 1V58A 1A0RP 3ZFBA 3IC4A 2P5QA 4PX1A 2FWHA 4JZQA 2YWNA 3LXTA 1X5DA 2VLUA 3GRXA 2IIYA 1WIKA 2RUEA 1AQVA 1SL2B 2LEGA 4CW9A 3TGZA 2B3SA 1JLVA 3QAVA 16GSA 3EINA 1KEBA 3E3EA 4KA0A 1NSWA 3GX0A 3H93A 3TRXA 2FA8A 2ON5A 1ERVA 2VO4A 2IFQB 4TN8A 3QFAC 3L9VA 4KDXA 5CRHA 3M9JA 5ECPB 3TKSA 2FY6A 3GHAA 5GAPD 5DDLA 3HDCA 1XWCA 2QC7A 3RBTA 1WPIA 4FYUA 2L59A 5EPFA 1A2JA 3GTUB 1C72A 5D9XA 3WGDA 1EGRA 3GA4A 1M9BA 3GKNA 2CA8A 3EMPA 4AJ6A 3E9JB 4GRFA 3M3MA 2DIZA 2DSAA 4OWYA 4PXOA 3S9FA 1DE2A 4ML6A 4MZBA 4JR6A 2QSIA 1GSSA 2PERA 4MH3A 3D0ZA 4KGIA 2I81A 4HQZA 4WR5A 2WJUA 4YQUA 2AV4A 4AJ7A 4O7HA 2K8SA 1PKWA 1TW9A 1JLWA 5HFIA 2VLTA 5IM9A 1AUCA 3NOFA 2H76A 1K0CA 4GSNA 2P5RA 2RUFA 3KIJA 4K7IA 5ECRB 1FAAA 4IKHA 3TKPA 4RQRA 2O87A 4L8EA 1U3IA 4HZ2A 2B1KA 2AJQB 1GUHA 3VWWA 1GTAA 4TVEA 4MA9A 5IMVA 1J08A 2DJJA 4XS4A 4G19A 1WE0A 4HDEA 2F9SA 3ME8A 1Q98A 4DVCA 1ZZYA 2LUSA 1ILOA 1LJRA 1ZGNA 3H4KA 1TTZA 4K0NA 20GSA 2GQKA 2HRNA 3F4RA 4XCSA 3KGKA 1PQNA 3LSZA 4ZB8A 3A3TA 1OKTA 1T00A 3ED3A 4OO4A 6GSTA 1K3OA 1NHOA 3GFKA 1Q4JA 1XWKA 2REMA 5DJLA 5CAXA 2PPTA 2V2GA 2YWMA 1TK0B 2EIRA 4MCUA 2JZSA 1G7EA 1G6WA 3QR6A 2ALBA 3TJGA 2H71A 2MBTA 3VWUA 3US3A 2IL3A 1K3LA 1YJ6A 3TUEA 3L78A 1GNWA 3TDGA 5C00A 1W89A 5ID2B 4JU5A 4K7NA 1SD9A 3EWLA 1AIUA 1K0AA 1A24A 2JZTA 5D73A 4NPBA 3Q74A 1R7HA 4GQCA 2TIRA 4Q5QA 2MBSA 5ECKB 1V40A 5E4WA 3WYWA 1R4WA 1G6YA 2V41A 4OFMA 1ZCPA 1WP0A 3H1NA 3IDVA 1SL0B 2JSYA 2O85A 5J3RA 1SL1B 2OBIA 2N5BA 4ZB9A 3LYPA 1A23A 4G10A 1F3BA 1A2LA 2FHEA 1PL2A 3K8NA 5DVBA 4TR1A 3A2WA 2CVKA 2H0IA 1GH2A 1RK4A 3FR9A 2HLSA 1GUKA 2R2JA 4ZBDA 5ELGA 4MZWA 2VL2A 1V2AA 2L6DA 3E0UA 4F9ZA 2HSHA 3I69A 3EU3A 1GL8A 2YP6A 2GLRA 3G9BA 3H79A 1XW6A 3F4SA 4MK3A 3CRTA 3DWVA 1GTUA 1N8JA 4IN0A 3FW2A 5IPHA 3TKSE 1Z7PA 2H30A 2VIMA 5DAKA 4KUNA 2GZYA 5GSTA 3Q18A 2A4VA 4ZL7A 4K7OA 4IVFA 2H6YA 2YCDA 4N30A 3GURA 2EC4A 2H0GA 1SJZA 1SK0A 1YKCA 5A4UA 5G1LA 2D2ZA 1AQXA 2TRCP 1H4OA 3APQA 4K6XA 3APOA 4POLA 3ZYWA 2DJ0A 1YF0A 1JZRA 19GSA 3F4TA 3TOUA 5KN3A 3I6AA 3G7JA 1KNGA 1XXUA 3FR3A 5G31A 2LKUA 3G7YA 4ECJA 2K18A 1V98A 2IPAA 1XVWA 3NIVA 1JFUA 2LQQA 2VD1A 3MSZA 5GSSA 4F2IA 5DJMA 2K8VA 1CQHA 3WGEA 1Z3EA 1F3AA 4L0UA 2HZEB 4LMVA 4OCFA 1O6JA 2CAQA 1GSQA 3C1RA 4LMWA 1RW1A 3W6GA 2DC5A 3CMIA 2C0GA 5F0GA 1B4PA 1PX7A 2NDOA 4BVXA 1AC1A 3NZNA 3TRPA 5EVOA 1FW1A 3CTFA 1SKSB 3KH9A 1A8LA 5KN0A 1M9AA 3BCKA 5GAND 1KBNA 1QFNA 2IFQA 4DEJA 1G7OA 1ZYEA 1GWCA 3EU4A 1ML6A 3MDKA 1I5GA 4EXJA 1QUWA 3M8NA 2I4AA 3VWXA 2H6ZA 2R37A 2RLIA 2P31A 3IV4A 3GTUA 3N5OA 4BPYA 3HD5A 3KH7A 1MDKA 1PA3A 3FEUA 3VK9A 1XCCA 1B9XC 2HXKA 2R5GA 2R6KA 4ZL9A 4ZILA 1Y6EA 4N0VA 1GSFA 2GSQA 5DBQA 1K0OA 3VFIA 4ZB6A 4KAEA 3AY8A 4JE1A 1Z9HA 3M1GA 2GZPA 5G5EA 3O6TA 4MJAA 3WGXA 5GZZB 1MEKA 4MMMA 1WRYA 5ELAA 4O92A 1UA5A 1XZOA 2I1UA 2O7KA 1J0FA 1PMTA 1R26A 2LRTA 2VCTA 4EO3A 4NV5A 3ZFLA 5JCWA 2XHFA 5J5NA 4AJ8A 1AXDA 2K6VA 1XIYA 4V2LA 5J4UA 1VRSD 3GSTA 1OKDA 2JADA 4XTSA 2K9FA 5CNWA 3EVIA 2L4QA 3A2XA 3VI7A 1B8XA 1XWBA 2LJRA 4HUAA 3EMXA 4J56E 4HI7A 3HVVA 4QL9A 4G9HA 4GCIA 3UVHA 3TKQA 4GTUA 3UAPA 3QFBC 4CDOA 1TU7A 2VAFA 4JR4A 2OE0A 3QPMA 4DSSB 1FVJA 3GNJA 2N5AA 4MLYA 3RAZA 1K0BA 1EGOA 3U5RE 4MP4A 3LGCA 4NWYA 3EURA 4IQ1A 2H74A 2YJ7A 3FZAA 5JCGA 2L6CA 3IPZA 4ECBA 5LNKe 4PQHA 1TI1A 3UJ1A 5LCZA 2WULA 3F6DA 2JL4A 4G2EA 1M7TA 3HA9A 13GSA 4ILFA 1FOVA 1PKZA 4PURA 1UC7A 5ECHB 1E6BA 3IXRA 1Y25A 4PUFC 2CAIA 4YAPA 4Q5FA 5ECIB 3BJ5A 3TB2A 2E2MA 5AIVA 3ERWA 4I2TA 4GQFA 1Z6NA 4KCAA 1DE1A 2H1AA 5JWRB 4K2DA 2WS2A 5ID2A 2WB9A 1PGTA 5A5KA 4BWSA 2C3NA 4LLRA 4N11A 1M2BA 3PINA 1XWGA 3ZVJA 4LA1A 4AGSA 5IQYA 3O76A 1PN9A 2XPEA 1DUGA 3QCPA 5FWGA 2NTOA 1PL1A 3RHBA 1AQWA 3EYTA 1GSDA 3UVTA 2FGXA 3DXBA 3GKMA 1B9YC 3UBLA 3A5WA 4GF0A 3P2AA 4BA7A 5J41A 2C80A 3H8QA 1ABAA 2WZ9A 2YV9A 4CHSA 2C3TA 4TRXA 5JWOB 2ZCTA 4GLTA 4NHZA 1XVQA 6GSUA 4O32A 2CX4A 3Q6OA 1ERWA 1ERTA 1WOUA 3GH6A 2V6OA 2JACA 2YOIA 4NV2A 3KMOA 2H0HA 4PQ1A 1K0DA 2F3MA 2LS5A 1BYEA 4EVMA 2QGVA 1SKWB 4I97A 1PD21 2RM5A 3DYRA 4HOJA 2H1BA 1BAYA 2YNXA 3D22A 5IMFA 2H66A 1U87A 3L4NA 3TJKA 3IR4A 2H72A 4MH2A 1F37A 2HI7A 4TR0A 3FRCA 4XRAA 5ECMB 2RM6A 3HVXA 4ULXA 1O8WA 5DCGA 3HVSA 1HNCA 4L5OA 5INYA 2E2GA 5DCHA 1EP7A 2VOCA 1U6TA 3LXZA 3KP9A 4N10A 1S3CA 1KTEA 1O73A 5AISA 3RHCA 4L5LA 1VF3A 2HE3A 4TR3A 1G0TA 1HNBA 2E0QA 4POBA 2EIQA 4IP6A 2HZEA 3WD6A 1FHEA 5DALB 2Z9SA 3P7XA 1LBKA 4POMA 2KOKA 3PGTA 5H5RA 2VM1A 5CRGA 2YN1A 3F63A 5CYYA 1M99A 1O7UA 2H6XA 4EE0A 3O3TA 3KCMA 1THXA 3TJJA 11GSA 2FA4A 3GUSA 2MZCA 4KSOA 5IIZA 4YH2A 5L71A 5IOWA 5CRWA 3J7Yk 1YEPA 4KNDA 5F07A 1XW9A 1VGLA 5AIXA 1BQ7A 1TU8A 2JU5A 2PWJA 3VI5A 3F9UA 1PSQA 3HJOA 2H01A 1T7PB 2LSTA 1UN2A 4Q5RA 3C7MA 4PNFA 2VM2A 2XC2A 1GLPA 1VF1A 2OE3A 4ISDA 2CQ9A 1PRXA 4DSQA 2CVDA 3F8UA 4WF4A 2FUG2 4WBRD 4L0WA 4KDUA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1A24A

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Chain Sequence

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