1A24A

Solution nmr structure of reduced dsba from escherichia coli, family of 20 structures
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
189
structure length
189
Chain Sequence
AQYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPHCYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords DSBA
publication title Structure of reduced DsbA from Escherichia coli in solution.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 44
structure length 189
sequence length 189
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-01-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1a24A00
5ECRB 1AW9A 4GLTA 3BOAA 2D2ZA 2HSYA 3H4KA 4MMMA 1JZRA 3NOFA 5DQSA 1J08A 3Q19A 1GSQA 2GTUA 1OVNA 4IJ3A 3WD6A 1K3YA 2VCZA 5EPFA 2XBQA 4MZCA 1YDKA 4PNFA 1T00A 3D21A 2QGVA 2A4VA 5CRGA 4ZBBA 4O32A 2IFQB 2XPEA 3LEFA 1N8JA 1M2DA 3NIVA 1F6MC 2HZEA 19GSA 4NPBA 4TR0A 2WCIA 3DGQA 4I6XA 3IOSA 5F0GA 1NSWA 3HKRA 4TXVA 1YEPA 1LBKA 2V41A 2DJ1A 3L9UA 1SKRB 3BCKA 1WIKA 3C71A 3GMFA 3VK9A 5J9BA 2QKEA 1ML6A 3FKFA 3I43A 1BAYA 2QC7A 1XPVA 7GSSA 1EEMA 1FG4A 3SBCA 4F82A 5B6MA 5IPGA 1H75A 2P5QA 1X0RA 3DYRA 1WJKA 5B8AA 4I97A 3LYPA 3HHVA 5IPHA 2WJUA 3GKMA 4ZL7A 3EVIA 1G7EA 3M9KA 3QR6A 5CREA 1DUGA 3A5WA 2MZCA 2LNTA 3FR3A 2X64A 2IJYA 1A2JA 1NW2A 3GTUB 4TR1B 2DC5A 2H8LA 2YWOA 5ELGA 3CBUA 5ELAA 1FW1A 3PH9A 5ECIB 1GRXA 2PUKC 5ECLB 4QQ7A 4XS4B 3KMOA 4IP6A 1K0BA 1BEDA 2LRTA 3GIXA 3CSIA 1TKDB 4P3YB 4ZB9A 2HLSA 2CV4A 3MDKA 2LKUA 1XWAA 1MDIA 1XWCA 2LUSA 1W89A 1U6TA 3C1SA 1ZL9A 1YQ1A 2IMIA 2F51A 1A24A 2XC2A 3E9JB 1G6WA 1BG5A 4OFTA 2DIYA 2HXKA 4ZL8A 3W8SA 1OE7A 4HU7A 1SL1B 3GHAA 1T8EB 3FZ9A 4F03A 1T7PB 4POKA 1X9MB 3CTFA 2DSAA 2KP1A 1O6JA 2VIMA 2GDRA 2CZ2A 5JCUA 2X8GA 3BCIA 3HVVA 1WWJA 3UL3A 4V2MA 1Q98A 3VWUA 1KNGA 3ME8A 4G10A 3D4MA 4OD7A 3ZVJA 2PGTA 4WETA 4BA7A 3APQA 1SJIA 5LCZA 1GH2A 3IBHA 5HFGA 2GS3A 2F8AA 2H6XA 2PU9C 1O73A 4HZ2A 2CAIA 4ECBA 5D96A 4MJAA 8GSSA 2I4AA 1GL8A 2LSTA 12GSA 2NVLA 2GSTA 4O92A 3TDGA 5G1KA 1QMVA 4BWSA 3TJJA 17GSA 4HEA2 3GH6A 4HUAA 3LG6A 3ZL5A 4GF0A 3HCZA 3GH9A 2V32A 1HD2A 4LMWA 3ME7A 3DEXA 2JSYA 2MMAA 1DSBA 3WGEA 5C00A 3FRCA 3L9VA 3A2XA 3APSA 3GKXA 5FHIA 3Q6OA 1TU8A 4PQ1A 1GUHA 18GSA 1TU7A 2HZEB 3ZREA 1GTBA 4IQ1A 2HRNA 1K3OA 3CXGA 5IMCA 3AY8A 3U5RE 5COHA 1Z9HA 6GSVA 2RUFA 3ZFLA 3DIEA 3GYKA 2L59A 4G19A 3H1NA 2A2RA 4X43A 3FY7A 2NDOA 1QGVA 2CX4A 4KA0A 5CAXA 1TOFA 3GFKA 4TRXA 4FIWA 3VWXA 2YWIA 2YN1A 5HR0A 3F0IA 2H1BA 1Z3EA 4MH3A 4ZXGA 3LQ7A 3QD9A 2HT9A 1SK2A 1ZOFA 2HNLA 1T4ZA 4ECJA 4OCEA 2HRFA 1IYHA 2YCDA 3P7XA 4K7IA 3Q18A 1ON4A 3HXSA 1J9BA 5HFKA 4FO5A 4N11A 3GUSA 3IR4A 2MMOA 4KB3A 4JR4A 4EDYA 4KNDA 5ECQB 1O81A 2V6KA 4PQIA 4ISDA 4E8HA 1K0NA 1XWBA 3F63A 3KMNA 1QK8A 2IIYA 3GRXA 3TKQA 1V58A 4WF5A 1M0UA 1XW5A 1GSYA 3G9BA 1GUKA 1B4PA 2WULA 1OE8A 3EU4A 4XTSA 2KUCA 1ABAA 3EYTA 3DVWA 4IBPA 2VM1A 4L5LA 2N5FA 3IV4A 3OR5A 3VFIA 4EVMA 2H01A 3KP8A 4K1FA 3KZQA 2EC4A 4MPFA 1FHEA 1Z6MA 1SKWB 4JRRA 3LFLA 3FZ4A 1MD3A 5DJMA 3TKSE 1TK0B 1S3DA 1YEXA 4YAPA 10GSA 4AF2A 1OKTA 1GNEA 2IMDA 1B9XC 2DMMA 1URMA 3CYNA 3R2QA 4WBJA 2CVDA 4ZBAA 3TUEA 5DDLA 4G2EA 4XRAA 4KSMA 2WRTA 3H93A 1C72A 3LSZA 3ZFBA 5DJLA 3UBKA 4K0GA 3N9JA 3D22A 4N30A 1EZKA 4K7NA 3FR6A 1OC9A 2H1AA 2VCVA 1LU4A 4Q5QA 3QFAC 5CO3A 2GGTA 1XIYA 4WXTA 3TKSA 4V1Ap 2AUVA 4ZIJA 2OE1A 2C80A 2IN3A 4JU5A 3CRUA 2YV7A 1XW9A 5GAPD 2IWTA 3GV1A 2KLXA 2GQLA 4XIHA 4JBBA 4QL7A 3PINA 4IP1A 4GQFA 5ENUA 5JWOB 2B7JA 2L6DA 3VURA 2GQKA 4NMUA 2F9SA 2JSZA 5HFIA 3EWLA 2FA8A 3F6DA 1QXHA 2H0HA 1THOA 3HVSA 2NTOA 1F2EA 2X8HA 3RDWA 1EOHA 4EL1A 1M7TA 1O7UA 22GSA 2B6MA 4DSQA 4GSSA 1E6BA 4NHWA 1XVQA 3PGTA 2GT5A 2GSSA 6GSUA 3SWLA 1ZYQB 3L9SA 5D9VA 2YZUA 3FHKA 2L5LA 2OBKA 1B4QA 3BJ5A 1DBYA 4XCSA 2P0GA 2DMLA 1PX7A 2O85A 3D0ZA 3TKPA 6GSWA 1TDIA 4JZQA 2H0IA 4IN0A 4GCIA 2VM2A 4ECIA 4KAEA 1SD9A 4WR5A 4HU9A 4IJIA 3UJ1A 1G6YA 2TIRA 4IW9A 3O6TA 4V1Ag 4YQMA 1I5GA 3TRPA 1B8XA 2CVBA 3IAM2 3QOUA 2CA8A 1PD21 3FEUA 1K0DA 2VLVA 4EE0A 4OO5A 2JZRA 1TJDA 5KN3A 3WGDA 4NV2A 3N5OA 4XS6A 2P31A 1SD8A 2PVQA 1R5AA 1UN2A 5HR3A 5KN2A 2VL2C 2HE3A 4QL9A 3QAWA 4ULXA 2CQ9A 1V57A 4BL7A 1UC7A 3TOUA 5DBQA 1GTUA 3TKSC 1XVWA 1YKCA 3FR9A 4F0CA 4TXOA 3GNJA 4RUVA 2EIQA 2WS2A 4JR6A 1GSFA 4F2IA 1QUWA 2V6OA 5L71A 2LJKA 4KE3A 11GSA 4RI7A 1U3IA 3I9V2 5D9XA 4CW9A 1SL0B 1FO5A 5HR2A 3IXRA 5LD0A 1FB0A 1X5CA 3RPNA 2MYGA 2FWEA 1V2AA 3C8EA 4XS1A 4KH7A 3C7MA 1T4YA 5C04A 2IMKA 3LYKA 2AHEA 6GSXA 1WE0A 5J3RA 2JADA 4GRFA 1EV4A 5LNKe 3L78A 2YNXA 2KOKA 3MNGA 2IL3A 1AXDA 2DJ2A 3K8NA 1PQNA 3F3RA 1PA3A 5ECOB 1OC9B 3F4TA 1Y25A 1YJ6A 5DAKA 5IO2A 1EOGA 2HYXA 3HZ8A 1BX9A 1NHYA 3TGZA 3UAPA 2O7KA 2H6ZA 4IGJA 3WGXA 1UA5A 1U87A 2FWFA 1R26A 1HNBA 2ALBA 1A0FA 5EVOA 3D5JA 2R37A 5IOXA 1ZYEA 1GSEA 3EE2A 4OWYA 3TJGA 3IE3A 1GWCA 2AJQB 1GULA 3DVXA 2XPDA 2GZZA 4DSRA 4J56E 4AGSA 3GN3A 3KIJA 1XWGA 3Q74A 6GSTA 3GSSA 3IPZA 2PWJA 2CZ3A 2ZUPA 3F8UA 1QQ2A 1RQMA 2AB6A 4TW5A 5F06A 1G7OA 2OACA 1YF1A 4J2FA 3KH9A 2CX3A 4BVYA 3M9JA 4F0BA 5B7CA 4K8MA 4NXIA 4BVXA 3IHQA 2H30A 1U3AA 2YWNA 1WPIA 4TVEA 5G5EA 3C73A 4EF0A 5ID2A 3I69A 1WRYA 3D6IA 2ZNMA 2TRXA 1AIUA 2IMEA 1AQWA 1PX6A 3VI7A 1OC8A 4PQHA 3UVTA 4N0VA 5B8BA 1EWXA 4BWQA 3HY2A 2MMZA 2LTKA 4ZILA 1RK4A 4KDYA 5G2ZA 4WBRD 3KJYA 4LLRA 5GAND 3IK9A 1FOVA 2O87A 1HYUA 3C1RA 3L0HA 2LJAA 3P2AA 4IQAA 4PX1A 1XBSA 5H5RA 4IS0A 3F4SA 1HQOA 4IKHA 4HI7A 2LQOA 4NAXA 4O7HA 2JZSA 1FAAA 3PR8A 3US3A 3TOTA 1OYJA 1ACVA 3E3EA 4LMVA 1SYRA 1GLQA 4TR4A 1KEBA 2LS5A 4EC0A 2B5XA 2G2QA 4X1UA 3UEMA 2B5EA 3J7Yk 3A2VA 3F9UA 3TRQA 5F05A 3IRAA 1F9MA 2LJRA 2E2MA 4DEJA 3TJFA 1V98A 2PN8A 3VI5A 2BMXA 1A2LA 3IAS2 2HSHA 1PMTA 2H72A 5J41A 1PL1A 2TRCP 2I3YA 3DXBA 1X9SB 1EP8A 4TXOB 1SJ6A 3ZIVA 2RUEA 4TOPA 2L4CA 4POBA 2ZCTA 2R4VA 1GSSA 2AYTA 2IMFA 5GSSA 5F07A 4HJ2A 2PVOC 1Y6EA 2V2GA 3FZ5A 1Q4JA 4K9ZA 2DJ0A 2EIOA 3ISOA 2G0FA 4JEDA 2AAWA 3UIWA 1W4VA 4OFNA 2LEGA 1YY7A 4N0ZA 2VCQA 3FK8A 1VRSD 3WYWA 1Z7RA 1LJRA 5IMZA 3GURA 4L0UA 1SK1A 1DE1A 3F4RA 5DAKB 1V40A 2L4QA 1MEKA 1SK0A 1A8LA 3A3TA 4MABA 3CSJA 2FUG2 4HJMA 3V1WA 2C0FA 1PSQA 2PMTA 5IIZA 1GSDA 1T1VA 2K9FA 3QAGA 5AISA 1GP1A 1SKSB 5IO0A 4FH8A 1AUCA 3TJBA 2R6KA 3MSZA 2FLSA 3UMAA 5CRWA 1YKAA 4OCFA 1R4WA 2MBSA 1M9BA 2LV3A 3DD3A 5D9TA 1XOBA 2XHFA 5ECMB 2VLUA 3KEBA 5A4WA 2C0DA 2N5AA 4LL1B 2OKAA 2R5GA 3CSHA 5GSTA 4H86A 5J5NA 2VD1A 2B1LA 1GTAA 1AAZA 2H71A 4MLYA 4GXZA 4KW6A 2R2JA 3D4TA 3GKKA 2REMA 5E4WA 4RQXA 1JFUA 2VL2A 3M0FA 2ON7A 5ID2B 2WGRA 4K6XA 3HDCA 3P8WA 4MDCA 2GZPA 2VD0A 1F37A 2X99A 2LQQA 4I2UA 2FWGA 4EKZA 3J7Yb 4NHZA 1WOUA 5JWQB 3GL3A 4FYBA 4G9HA 3ERGA 1ZCPA 2J23A 2N5BA 1MDKA 3FZAA 2FGXA 2VLTA 1TP9A 4KDXA 1T3BA 4EUYA 2BJXA 3HJPA 1X9WB 1KBNA 1U88A 1ZMAA 5CYYA 5FT3A 3BD2A 3ED3A 1J0FA 3MAKA 3P90A 4J57E 1K0AA 4IELA 1ZGNA 5E59A 3HJOA 1NHOA 14GSA 4MJBA 5G30A 4XRDA 2C0EA 2I9HA 3W8JA 6GSYA 5GZZB 2KHPA 3VWVA 4MPGA 2C3QA 4N10A 2HI7A 3RHCA 2H74A 1WP0A 5J4UA 3U6VA 4OFMA 2P5RA 3W6GA 1JLVA 5CP1A 1V9WA 2YV9A 2YPMA 4PUFC 2X8CA 2DJ3A 4HS1A 4MJCA 3VPQA 1TI3A 5D9WA 4L0WA 1XW6A 1IYIA 3ERFA 2GQMA 3KGKA 3F6FA 2V1MA 4L8EA 2NBSA 1JLWA 4K7OA 5IMFA 1A23A 2H19A 5IMAA 1M2BA 3IDVA 2DLXA 4MF7A 1Z5YE 2DIZA 3UVHA 5KN1A 3ZZXA 4POMA 5A5KA 4FYUA 1PRXA 9GSSA 4HQZA 2CAQA 2OE3A 4DSSA 4Z7XA 2YJ7A 1FVKA 4PURA 2VL9A 3CRTA 4V2LA 2OA7A 4GTUA 1YZXA 4KDUA 2OBIA 2MBTA 4O5RA 2FY6A 2H66A 1M2AA 2JACA 1SYXA 4ML6A 3VPTA 1PL2A 3M8NA 2C3NA 3LWAA 4GSNA 5A4UA 5KEJA 1VF3A 4PUAA 3EMPA 2GSQA 1ERUA 5A4VA 5JCWA 1R5PA 2F8FA 2YOIA 1JZOA 1TRUA 3GKNA 16GSA 1Z6NA 3LGCA 1ILOA 1XCCA 5ECNB 4RI6A 4Q5RA 2C4JA 3HJMA 2B3SA 5AIVA 4WR4A 1GLPA 3CTGA 4KX4A 3GSTA 4I8BA 4YQVA 2L6CA 1B9YC 1K3LA 5D73A 1H4OA 4FYCA 5DQYA 1SU9A 2K8SA 4MCUA 4D73A 2H75A 1AQVA 2GSRA 5HQPA 4YAVA 1WMJA 2A2SA 2R3XA 3TB2A 3QCPA 4V2NA 3RBTA 1A0RP 1PKWA 2GLRA 2FHEA 4EO3A 4ACSA 3IA1A 4K2DA 3TJKA 1SENA 1CQGA 2HZFA 2C3TA 5IOWA 1OC3A 2VCWA 5JWRB 5IMDA 3O76A 3KTBA 1VF2A 4ZBDA 3KXOA 1X5DA 5IMVA 5EY6A 2KP2A 2QSIA 2JU5A 3F3QA 4NWYA 2J9HA 3VLNA 5F8BA 2VOCA 3DRNA 3DWVA 2GT6A 1TTZA 1M9AA 5DALA 1ERVA 1TRVA 4ECCA 4MJEA 2I1UA 3A2WA 3IC4A 1VGLA 4EDZA 1GTIA 2WZ9A 2WFCA 2NPBA 2YP6A 2M80A 2LNSA 4L5OA 4KCAA 3QFBC 1ST9A 3EMXA 4KUNA 4F9ZA 1FVJA 1XZOA 4PNGA 4Q5FA 13GSA 4MK3A 1O8XA 2H70A 4AJ8A 4MZWA 2OE0A 5D93A 1SJZA 2C0GA 5DCHA 2WDUA 1TRSA 1O8WA 4KCEA 2M46A 3G7IA 3VWWA 5ABRA 3JCML 6GSSA 4NV5A 3RHBA 1JZWA 1X5EA 4BPYA 3HVXA 3LJRA 4POLA 5EL8A 2B1KA 2M72A 1EEJA 4CDOA 3GL5A 4K0NA 1NM3A 3LXTA 3KM6A 1DE2A 2I81A 2JL4A 3CMIA 2LRCA 2DBCA 3KD0A 4MF5A 3ZITA 1THXA 3EURA 1F3BA 4GQCA 1M99A 4DSSB 2H1GA 1GNWA 2C1YA 4XHMA 4WKWA 3G7YA 2VUPA 1UVZA 3BBYA 5D8IA 1TW9A 4AJ6A 4HDEA 2H6YA 4MH2A 3LORA 5B6NA 2PPTA 1XWKA 2BTOT 3UARA 1I9DA 3DKSA 1TK5B 3FW2A 3ZRDA 2FA4A 2C8UA 5AGYA 1EGOA 1F3AA 3ZVJD 2DJKA 1TI1A 1EP7A 3ZYWA 5G5FA 4TKYA 2F3MA 4TR3A 3HD5A 2FCHA 1MDJA 2O89A 3MWHA 4MA9A 5INYA 2K6VA 5IM9A 2B5YA 5AN1A 3APOA 4HQSA 2E7PA 2EIRA 2H73A 2YANA 4WF4A 1CQHA 4OO4A 4E8EA 3HYPA 3TKRA 4I2TA 2GVPA 3GA4A 1BQ7A 1PN9A 4LL4B 4D73B 3RAZA 4PGTA 3EC3A 2OJLA 3EINA 1S3CA 1AQXA 4MF6A 2MMNA 1OKDA 4WEYA 1R7HA 2ES7A 2YJHA 1AC1A 5ECPB 4ZB8A 3QAVA 4CHSA 3G7JA 1ZZYA 3ZMLA 2H76A 2K18A 1SL2B 1TRWA 2VCTA 2IFQA 2RLIA 2H0GA 1PKZA 1TXXA 1K0CA 2XBIA 2E2GA 3ZTLA 2FWHA 1S3AA 5ECHB 3ZIJA 5IQYA 4PXOA 4RQRA 5DVBA 2RIIA 3H79A 2CVKA 1G0TA 1MTCA 3DMLA 1QFNA 2VL3A 3M1GA 4ILFA 1EV9A 4YQUA 4AJ7A 4LA1A 5DALB 1USBA 1XOAA 4MZBA 2E0QA 1EGRA 2K8VA 4HZ4A 5CRDA 3GX8A 5ECSA 5FWGA 1K0MA 2YZHA 2HFDA 3UOMA 3TCOA 2B7KA 2Z9SA 1VF4A 3EU3A 3KCMA 2L5OA 3O3TA 3HZ4A 2VO4A 2CT6A 3FYGA 1ERWA 5DCGA 2OADA 4IHUA 1N2AA 5G1LA 1K0OA 4ID0A 1B48A 2H1DA 2PBJA 1E2YA 2DJJA 3GX0A 4HOJA 5HR1A 1Z7PA 1PGTA 3ERWA 2AV4A 5AIXA 1TK8B 20GSA 1HNAA 4KSOA 1BJXA 4EXJA 3KH7A 3WT2A 4ZL9A 4GWRA 5CNWA 3GTUA 5J9CA 4TR1A 2O8VB 4OMVA 1XXUA 2LRNA 2RM6A 1VF1A 4XS4A 5KN0A 1BYEA 1OAZA 3S9FA 1YF0A 2FNOA 4ML1A 2YWMA 1KTEA 3QPMA 2WB9A 5G31A 3I6AA 3QDNA 3RPPA 1RW1A 2FD3A 4JE1A 5H5SA 5CRHA 3ZLPA 3NZNA 4YH2A 3KP9A 1GSUA 1O85A 3KTLA 5JCGA 3H8QA 1GUMA 2VCXA 3TRXA 2PERA 1JZDA 1MD4A 4I5QA 2JZTA 2ON5A 1A2MA 2VAFA 3L4NA 4ZB6A 1ERTA 4Q5NA 4DVCA 3HA9A 5H5QA 4X0XA 1HNCA 1A8YA 2RM5A 3LXZA 4MP4A 3UBLA 3E0UA 1JHBA 2L57A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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