1DBYA

Nmr structures of chloroplast thioredoxin m ch2 from the green alga chlamydomonas reinhardtii
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
MEAGAVNDDTFKNVVLESSVPVLVDFWAPWCGPCRIIAPVVDEIAGEYKDKLKCVKLNTDESPNVASEYGIRSIPTIMVFKGGKKCETIIGAVPKATIVQTVEKYLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords CHLOROPLAST THIOREDOXIN M CH2
publication title NMR structures of thioredoxin m from the green alga Chlamydomonas reinhardtii.
pubmed doi rcsb
source organism Chlamydomonas reinhardtii
total genus 36
structure length 107
sequence length 107
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-11-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1dbyA00
1MD3A 1XPVA 4KH7A 4F9ZA 2A2RA 5J9BA 1B8XA 3J7Yb 4X43A 1XW9A 4WBRD 1O81A 2CX3A 2LQOA 3IV4A 1TRVA 5HR0A 2PBJA 3KEBA 2DMMA 4G9HA 1FG4A 3M9JA 3ZMKA 3NOFA 3I43A 2L4CA 1SL2B 3VWWA 2QC7A 2PUKC 3TKSA 4ZL7A 4IQAA 1BEDA 5HFGA 1TRSA 3GMFA 3G7IA 4ULXA 1VRSD 1A2LA 5JWOB 3KMOA 3QAWA 1K0AA 2F3MA 5C04A 4DSSB 2MMOA 2CZ2A 1OVNA 2RM5A 3TUEA 1T4YA 2WGRA 1ZOFA 4LL4B 2WDUA 5GSTA 4TXVA 4ZIJA 2VCQA 2H30A 4IQ1A 4BA7A 4GXZA 5ECNB 4Z7XA 4PNGA 4POKA 4J2FA 2B1KA 1K3YA 1A8YA 1BYEA 2WCIA 1TRUA 1J08A 5KN2A 1TU8A 1JZOA 2EIRA 5ECOB 1THOA 1QQ2A 1TU7A 3VFIA 2AYTA 1EWXA 3BJ5A 6GSVA 2ZNMA 4XRDA 5B8AA 1V58A 2B5XA 4MF7A 2JU5A 1WIKA 1OE7A 2H74A 1T00A 1GTIA 3ZIVA 5DCGA 4XS4B 4AJ6A 4K2DA 3HY2A 4MK3A 3LXTA 1FO5A 12GSA 3QAGA 4I8BA 3H8QA 1JZWA 1B4PA 5GAPD 2WRTA 4I2TA 1ZYQB 3HJMA 4DSSA 16GSA 2DJJA 3C7MA 4KSOA 3QPMA 3Q74A 2X8HA 2HI7A 4EVMA 2I9HA 2P5QA 2AB6A 4K7NA 2BTOT 4Q5RA 3DRNA 3PR8A 3AY8A 2F51A 2LRTA 2C0DA 2GSTA 2VIMA 3ZMLA 2H0HA 5IPHA 1Z9HA 1YDKA 1V9WA 5CO3A 1EZKA 3GX0A 1T1VA 1JFUA 3GKNA 4YQUA 3TJFA 3BD2A 2DJ2A 3C71A 3F3RA 4ZBAA 2MMAA 1GTBA 2V6KA 6GSYA 2FUG2 2CV4A 1ZMAA 2HZEA 1YKAA 3H4KA 3RHBA 13GSA 1THXA 2F8AA 1OYJA 2C0GA 2YCDA 3EWLA 2N5BA 5IMCA 3TRQA 4V2NA 5D9VA 2GT5A 3EURA 3BCKA 2LJAA 2I1UA 4X1UA 3TKQA 1WPIA 1KTEA 4AF2A 1TOFA 4ILFA 3UOMA 5IQYA 2LQQA 3KTBA 4EDYA 3KCMA 5DCHA 3FW2A 1ON4A 1TK0B 2A4VA 1KNGA 2TRXA 1BX9A 2IMKA 2B7JA 1FVJA 3DKSA 1Q4JA 2R6KA 3GHAA 4ZXGA 3TDGA 4PURA 4KE3A 2L6CA 5IPGA 5D9XA 1XWGA 1XW6A 3QCPA 1Z7PA 1MEKA 3F9UA 3S9FA 1OE8A 2WS2A 1C72A 2IFQA 2MMZA 1K3LA 2KHPA 2HFDA 4HQZA 2JZRA 2HXKA 3CRUA 4HI7A 1VGLA 1URMA 2VLUA 1K0NA 3M8NA 5KN0A 4QQ7A 3JCML 3UVHA 5IMVA 4JU5A 4FYCA 2LKUA 2LNSA 2VCZA 3CSJA 2IPAA 1V98A 2YPMA 19GSA 3FZ4A 2H6YA 3IR4A 5GZZB 5DDLA 2KLXA 4MA9A 3UVTA 1JHBA 3TOUA 2NPBA 4O32A 4EF0A 3KTLA 3LWAA 2OE0A 1ML6A 1K0CA 2E0QA 4TR3A 4TR1B 1YKCA 3VLNA 1Y25A 3HZ4A 4XS6A 2QSIA 1R4WA 1GNEA 1XW5A 2IMDA 1K3OA 3C1SA 4JBBA 1A24A 2VD1A 3ERWA 4XTSA 1A0FA 1XOBA 3F4SA 1VF4A 1IYHA 4BWSA 4KCAA 4PX1A 1PRXA 4OWYA 1TTZA 3FYGA 5A4WA 5DBQA 3ME7A 5CRGA 1HYUA 1XZOA 2C3NA 2K18A 4NMUA 3GH6A 5EL8A 2V41A 1PD21 2FA4A 3VPTA 4NAXA 4O92A 4ZL8A 1W89A 1E2YA 5G1LA 4HQSA 3ZIJA 1S3DA 4JR4A 2GT6A 3UJ1A 5CAXA 2DIZA 1TI3A 6GSXA 4ZILA 3R2QA 4K9ZA 3DWVA 2GSQA 3VWXA 1EP8A 1UC7A 3IK7A 3EMXA 4EC0A 2HRNA 4PNFA 5G5EA 9GSSA 1F2EA 2R4VA 3QD9A 3D4TA 3FR3A 3K8NA 1OC9B 2YP6A 1PKZA 4RQXA 4TR0A 1NM3A 1YY7A 1AIUA 3H1NA 1YEPA 4GSNA 1T7PB 2GSRA 4MZCA 4OO4A 2FNOA 1XWAA 1U88A 2O89A 5H5RA 2PU9C 2LV3A 17GSA 5DJMA 2X64A 3KIJA 1V2AA 1K0DA 5E59A 1OC3A 2M46A 3V1WA 3CYNA 4XRAA 1O6JA 3ME8A 3WGXA 2O85A 2GZZA 5EY6A 1HNBA 1R26A 1TXXA 2M80A 3IDVA 1TRWA 3P90A 4WEYA 3DXBA 4G19A 2OBKA 4JRRA 3ED3A 2CAQA 3WYWA 4EXJA 1G0TA 5IMFA 5JWRB 1WP0A 3ZITA 3UIWA 4K6XA 1AQVA 5ECLB 3ZREA 1GSUA 1MDJA 2LJKA 4KB3A 2L4QA 4CHSA 3IBHA 1YF0A 4K0GA 1DBYA 3D0ZA 3GKKA 4AJ7A 1SENA 4WETA 3PINA 3VK9A 5IOWA 1TI1A 2XPDA 1QMVA 3E0UA 4O5RA 5IOXA 3F4TA 1WMJA 2CAIA 3DMLA 2WB9A 3KH9A 4BVYA 5KN3A 1F3AA 5FHIA 3M3MA 2C4JA 4EDZA 5DJLA 3LFLA 3KXOA 2J9HA 1H75A 4MP4A 3FR6A 3KD0A 2KOKA 4HU9A 4L0UA 1WRYA 2KUCA 2LTKA 1PQNA 1SU9A 3CSIA 4ISDA 1O85A 3H93A 3MNGA 4ZB8A 1PSQA 2MBTA 2E7PA 3ZZXA 4J56E 2YOIA 5J41A 2GQKA 2PGTA 3IXRA 4CDOA 1K0OA 3PGTA 4LL1B 2XPEA 4X0XA 2ON5A 4TW5A 4I2UA 4IJ3A 5HR1A 1SK0A 4HU7A 1Z3EA 5IO0A 4WXTA 2JACA 1SD8A 4J57E 3TGZA 4DSQA 5LCZA 3EC3A 2JZSA 2PMTA 1I5GA 2LUSA 2DBCA 3GX8A 2H71A 2LSTA 2V2GA 3BCIA 1R5AA 4PXOA 3GNJA 3ZLPA 1TDIA 2H6XA 5J3RA 2GTUA 2OACA 3HYPA 1U3IA 1LU4A 4ZBBA 3VURA 2H6ZA 3L9VA 1X9MB 1XIYA 3LXZA 3E3EA 1YF1A 2IIYA 3SWLA 2VOCA 2REMA 3EINA 3NZNA 1MDIA 3IAM2 3IOSA 3A5WA 2PN8A 2MZCA 2CVDA 2YJHA 4Q5FA 1ILOA 3ZVJD 3L4NA 3ZTLA 3HD5A 4NHWA 4IBPA 4LLRA 3EU3A 3F0IA 2HE3A 3W8SA 4IVFA 1FW1A 3DVXA 5INYA 4ECIA 2H19A 3IC4A 2HZEB 4GTUA 4TXOB 1A8LA 1CQGA 3ZFBA 2JZTA 5G1KA 2BMXA 5HQPA 1VF2A 3U6VA 1XXUA 1BAYA 1X9SB 2YV7A 3GL3A 2YWNA 4KNDA 5ECQB 2G0FA 5ECKB 1HD2A 3FKFA 2CQ9A 1H4OA 4XS1A 1FAAA 3Q6OA 4IP1A 2HLSA 4LMVA 4GLTA 4ML6A 2GZPA 1GSDA 2DMLA 4HOJA 2H1BA 1MTCA 3DEXA 1XVQA 3LYKA 1ZZYA 3UBKA 1EP7A 4XHMA 6GSWA 3VI5A 4IELA 3APQA 3KZQA 3TRXA 3VPQA 1XWCA 2NVLA 3HCZA 4PQIA 2IFQB 3QFBC 4KA0A 3HVSA 3P7XA 3BOAA 4V1Ag 2HYXA 1B4QA 4RI6A 5CRDA 4KDUA 2X8CA 2H73A 4N10A 5C00A 4GQFA 4TXOA 3RDWA 3QMXA 1AQWA 3G7JA 4EL1A 1WOUA 4MDCA 1OC8A 3D6IA 1OKTA 4K1FA 3UL3A 3F4RA 2HZFA 5IM9A 5CNWA 5ELGA 4GSSA 3DYRA 2LEGA 1OKDA 5IMDA 1SYRA 2CVKA 2EIOA 2LNTA 3GV1A 2OJLA 1GSEA 5DQSA 1R5PA 2B6MA 3L0HA 8GSSA 2K9FA 3US3A 2MYGA 3TKPA 4ECBA 2GS3A 4RUVA 4POMA 1MD4A 4FO5A 3WGDA 1T8EB 2YWOA 5DALB 3Q19A 3G7YA 1NHOA 1O8WA 3MDKA 1GSQA 4BPYA 2GVPA 2JSZA 2Z9SA 1ZL9A 3FHKA 1YJ6A 1SD9A 1Z6MA 4E8EA 3EVIA 2XBIA 3EU4A 1EV9A 2YJ7A 3A2XA 3GUSA 4PQ1A 4XCSA 1O73A 2IMFA 2B1LA 5DAKB 4ID0A 1ZYEA 1J0FA 4AJ8A 3VI7A 2XC2A 3CXGA 3M9KA 2IWTA 5D9WA 4WR4A 5F0GA 5GAND 4NXIA 2RM6A 3J7Yk 3WGEA 3C8EA 4F82A 5G30A 2HRFA 2NDOA 1A2MA 4FYBA 4L8EA 3DVWA 4F03A 2VLTA 2VCXA 4MLYA 3GL5A 1X5DA 3IRAA 5AISA 3TB2A 1DE1A 3I6AA 5DALA 2VL9A 4JE1A 5AIXA 3QAVA 1XCCA 3LQ7A 5HFKA 3WD6A 4IP6A 1DE2A 1G6YA 2V1MA 5IIZA 5E4WA 3FZ9A 1GLPA 3GSSA 3GYKA 2B5EA 4YQMA 2H8LA 5AN1A 1XWBA 2H76A 5KN1A 1VF3A 5L71A 1B9XC 5JCWA 4MJEA 1N8JA 1U87A 1FB0A 4K0NA 5ECSA 2K6VA 3APSA 5DAKA 2O8VB 4PUFC 3HKRA 1EGRA 2FWGA 1M2BA 10GSA 2VM1A 3LGCA 5G2ZA 3FRCA 5CREA 5AIVA 4NHZA 2XBQA 2FA8A 1PX6A 2E2MA 2PVOC 5LNKe 3IPZA 1VF1A 1JZDA 1GTAA 4ZB6A 2WJUA 1X5CA 2HSHA 2LRCA 4MJCA 5A4UA 2I4AA 3QOUA 2X99A 4PGTA 2ALBA 2GZYA 1W4VA 1F9MA 4K7OA 3QFAC 2VUPA 4BVXA 4D73A 2ZUPA 3C1RA 1A2JA 3IK9A 4LMWA 2H1DA 1XFLA 2P0GA 5H5QA 4KCEA 4F2IA 3VWUA 1ST9A 3HXSA 1ABAA 1NHYA 5F07A 4NV2A 1PMTA 4GSTA 4V2LA 1XBSA 2RUFA 3APOA 4ML1A 2VL2A 1IYIA 1ERWA 4TRXA 2QKEA 2L57A 3ZFLA 2VM2A 4KW6A 1Y6EA 4DEJA 2QGVA 1ERUA 3LG6A 3GH9A 3O6TA 4TOPA 4HZ2A 4QL9A 4TVEA 4DSRA 4IN0A 2EIQA 2ES7A 1BG5A 4MH2A 1XVWA 2P5RA 3CRTA 2YN1A 3KM6A 2FCHA 5J5NA 4IS0A 4MJBA 1JLWA 2DIYA 3EMPA 3FZAA 1E6BA 1F6MC 1QK8A 3ERGA 1XWKA 4L5OA 1KEBA 1GUKA 5LD0A 18GSA 1EEMA 1T3BA 3GTUA 1M7TA 1AAZA 1AQXA 4I97A 5DQYA 1TKDB 2O87A 5F05A 1T4ZA 2GLRA 2F9SA 1XOAA 5FT3A 3HJOA 2PPTA 2JL4A 2IMIA 3W8JA 5DVBA 2J23A 4TR4A 2H70A 3HA9A 5B7CA 2YWIA 1GTUA 2GSSA 1AC1A 3L9UA 1M2AA 2MMNA 2NBSA 4HS1A 5JCUA 1BQ7A 3MSZA 4ZL9A 3H79A 3FR9A 2FWFA 3RPPA 1EOHA 4E8HA 4HJ2A 4ACSA 2C3TA 1A0RP 3TJGA 1GULA 3TJJA 4ECJA 2D2ZA 2KP1A 2IJYA 4OCEA 5B8BA 5CRHA 3TCOA 4MPGA 4LA1A 1JLVA 1GUHA 2I81A 2HNLA 4WR5A 3GN3A 2M72A 1EEJA 2C0EA 1GLQA 3CTFA 2K8VA 3IA1A 1SK2A 3L9SA 2H0GA 3TJBA 4OCFA 2TRCP 5B6MA 1ZGNA 3KP9A 4EKZA 1OAZA 5J4UA 3GA4A 3D5JA 5ENUA 20GSA 5ECMB 1UVZA 2IL3A 2IMEA 1SJIA 5G31A 1QFNA 2G2QA 3D21A 3SBCA 4OMVA 3HZ8A 2FWEA 2FGXA 2H72A 3GFKA 3KP8A 1ERVA 2N5FA 4MJAA 4HZ4A 4KX4A 1WE0A 2OBIA 4POLA 3A2WA 2H01A 3D22A 3MWHA 3QR6A 2OE1A 4F0BA 5ECPB 4OD7A 4P3YB 2O7KA 4BL7A 3OR5A 1M99A 1TW9A 1X9WB 2AUVA 2DLXA 4WKWA 4EE0A 4L5LA 2FWHA 3NIVA 3GKXA 3WT2A 3IHQA 1F37A 2WFCA 4GF0A 2VLVA 4G10A 5ID2A 5COHA 4GRFA 4GCIA 1FVKA 2E2GA 2OADA 3KH7A 3LORA 4JZQA 4V1Ap 2DJ3A 2OE3A 4ECCA 3RHCA 1BJXA 2GDRA 1HNCA 1A23A 1KBNA 2VL3A 5EPFA 2V6OA 4BWQA 2RLIA 3F6FA 4Q5NA 1U3AA 2H75A 1Q98A 1GSFA 3M0FA 5HR3A 1Z5YE 3LJRA 2C8UA 3P8WA 3GSTA 3U5RE 1PX7A 2A2SA 4MCUA 4GWRA 1TJDA 4YAPA 4RQRA 4XIHA 2DSAA 1O7UA 1M0UA 3G9BA 1HQOA 3TJKA 3M1GA 2GGTA 3FY7A 3KMNA 5ECIB 4FH8A 4NPBA 1SKRB 3ERFA 5F8BA 2RIIA 1O8XA 4Q5QA 4EUYA 1V40A 2FLSA 2V32A 1SKWB 2H1AA 4I6XA 4N30A 5A4VA 1YEXA 1Z7RA 2B3SA 1FHEA 2KP2A 2VO4A 4IJIA 5F06A 3UBLA 2HSYA 4ZB9A 3RAZA 4YH2A 3O76A 2X8GA 4WF5A 4WBJA 3DD3A 2MBSA 3N9JA 5ELAA 2JADA 4XS4A 3C73A 4N0ZA 1QXHA 2CZ3A 3LYPA 4EO3A 4WF4A 2R3XA 1SJZA 2NTOA 4KDYA 4NWYA 4NV5A 4MPFA 1PL2A 2FHEA 3GRXA 6GSTA 2IN3A 4MF5A 2LJRA 5HR2A 5D93A 2I3YA 4TN8A 4O7HA 1PL1A 3ZVJA 1PA3A 1TP9A 2PVQA 2OA7A 5H5SA 4POBA 4ZBDA 3BBYA 1LBKA 4IGJA 11GSA 3TOTA 2VL2C 1HNAA 5JCGA 3UAPA 5B6NA 3WT1A 2C80A 3HJPA 4IW9A 4QL7A 2VCWA 5J9CA 1MDKA 2LS5A 2R37A 3P2AA 5D96A 1RQMA 2K8SA 4GQCA 3W6GA 2R5GA 3TKRA 3N5OA 3KGKA 5D73A 22GSA 1FOVA 3PH9A 4JEDA 1U6TA 1TK5B 5FWGA 2RUEA 3VWVA 1SL1B 3FEUA 3HVVA 2H0IA 3TRPA 2BJXA 3IE3A 2XHFA 3E9JB 1G6WA 1WWJA 1DUGA 2AV4A 3DGQA 3ZYWA 6GSUA 2PWJA 4KGIA 5HFIA 1M2DA 4F0CA 1YZXA 4HEA2 4OFMA 4RI7A 1LJRA 5IO2A 2R2JA 4D73B 2YNXA 4KSMA 3LSZA 3CMIA 3I9V2 2VCVA 1USBA 2DC5A 3FK8A 1Z6NA 2LRNA 4CW9A 4G2EA 1S3CA 5D8IA 1GSSA 2L59A 1AW9A 4I5QA 2DJ0A 1QGVA 1PGTA 2CVBA 4YAVA 4PQHA 4KDXA 4L0WA 1EV4A 2L6DA 1RK4A 2YV9A 1X5EA 4DVCA 2AJQB 1DSBA 3F6DA 2FD3A 4K7IA 2GQLA 2ZCTA 1K0BA 3Q18A 2B5YA 1NW2A 1J9BA 1ZCPA 1F3BA 3HVXA 4N0VA 3F63A 3TKSE 3F3QA 1GRXA 1GNWA 3GURA 3O3TA 3CSHA 2TIRA 5G5FA 1SKSB 4HUAA 5ECRB 2FY6A 3ZRDA 2L5OA 3D4MA 1PN9A 1FB6A 2AHEA 4TR1A 1NSWA 4HJMA 2PERA 3ZL5A 1AUCA 1S3AA 1I9DA 1UN2A 2GQMA 3FZ5A 3L78A 5D9TA 3UARA 3GTUB 4V2MA 3EYTA 1SL0B 1EGOA 1TK8B 2B7KA 4OO5A 3UEMA 5CYYA 3TKSC 4PUAA 1B48A 3F8UA 3MAKA 2DJKA 5CRWA 3QDNA 3RBTA 1JZRA 2EC4A 2C1YA 1YQ1A 1ACVA 1X0RA 5GSSA 2P31A 2ON7A 4K8MA 5A5KA 2F8FA 1M9BA 1AXDA 2C0FA 3I69A 2OKAA 2JSYA 4IKHA 4N11A 1G7EA 4FIWA 4IHUA 5JWQB 3RPNA 4FYUA 1V57A 4MZBA 3LEFA 5EVOA 4YQVA 1B9YC 2YWMA 14GSA 1WJKA 1OC9A 3HHVA 3KJYA 1R7HA 5IMZA 1GWCA 4OFTA 2C3QA 1PKWA 2VAFA 2YZUA 3EE2A 5KEJA 4H86A 2VCTA 1N2AA 2HT9A 1G7OA 5AGYA 4MH3A 1CQHA 1SK1A 2CX4A 2N5AA 4TKYA 1EOGA 4HDEA 5ECHB 5IMAA 3UMAA 5ABRA 1SYXA 4MF6A 2DJ1A 3ISOA 6GSSA 3CTGA 1RW1A 2WZ9A 3A2VA 3HDCA 2H66A 2H1GA 4OFNA 4JR6A 5CP1A 2CA8A 4KAEA 7GSSA 2L5LA 3GIXA 1GL8A 2AAWA 1GH2A 1GP1A 1K0MA 2CT6A 2WULA 3GKMA 1GUMA 3IAS2 3A3TA 3DIEA 4AGSA 1UA5A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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