1DE1A

Nmr structures of oxidized bacteriophage t4 glutaredoxin
Total Genus 15
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
15
sequence length
87
structure length
87
Chain Sequence
MFKVYGYDSNIHKCVYCDNAKRLLTVKKQPFEFINIMPEKGVFDDEKIAELLTKLGRDTQIGLTMPQVFAPDGSHIGGFDQLREYFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Solution structures of reduced and oxidized bacteriophage T4 glutaredoxin.
pubmed doi rcsb
molecule tags Electron transport
molecule keywords GLUTAREDOXIN
total genus 15
structure length 87
sequence length 87
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-11-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1de1A00
1M9AA 1XIYA 4OWYA 1SKWB 1AQWA 3Q6OA 4IQAA 3E0UA 2ON7A 2A4VA 4ZXGA 2CVBA 4NPBA 5E59A 19GSA 3L9UA 5GZZB 3TDGA 3UOMA 2D2ZA 2DBCA 1Z7PA 1TU8A 3UIWA 4CW9A 1K3OA 3HVXA 3M9KA 4YQMA 1YKCA 2V6OA 2OE1A 5IOWA 1GLPA 1DSBA 2H0GA 1YQ1A 4MF6A 1TJDA 3FR6A 2OA7A 1YEXA 1TRVA 3VPTA 4RQRA 2P5RA 4BVYA 1Z7RA 1ERVA 2DJ0A 4L5OA 1EV9A 5F07A 1AQVA 4PNFA 6GSSA 1GWCA 5CREA 1OC9B 1AUCA 3ERFA 5CAXA 2P31A 4AJ8A 4N0ZA 4GQFA 3A3TA 1B8XA 2L6CA 5ECKB 4YQVA 3CMIA 2KLXA 4E8EA 5KN3A 2FWHA 4YAVA 1QGVA 2LS5A 3P8WA 1XVQA 4BA7A 3L0HA 4HQZA 1EGRA 2LNTA 2VCTA 4I8BA 3WGXA 3O76A 2IMEA 4POBA 4EE0A 2BTOT 2PMTA 3CSIA 1GLQA 1DBYA 2VCQA 4XRDA 5DCGA 1OVNA 1SJIA 1K0CA 1T4YA 4EF0A 3NIVA 3QOUA 2CA8A 1PL1A 2OKAA 4I6XA 5J9BA 3HJPA 1N2AA 1WPIA 1AQXA 4PUAA 4NAXA 2F8AA 2I3YA 1WE0A 1SYXA 2I1UA 2X8HA 1FVJA 3F63A 5ECMB 4JR6A 4WR5A 1KEBA 4ZBDA 3DKSA 1ZL9A 4IN0A 3FEUA 2H8LA 3WGDA 5IMDA 1ZZYA 1GTIA 2GSSA 2XPEA 4V1Ap 3TKRA 2B5YA 4OFMA 1TRSA 5D9TA 3GN3A 1A2LA 2X99A 5CRWA 3D22A 2L4CA 2PUKC 3LYKA 2IFQA 2REMA 2FGXA 2VCZA 2LV3A 1O8XA 3GHAA 1TRWA 2C3QA 3FRCA 2IWTA 2L4QA 3BJ5A 4HJ2A 3TOTA 1EZKA 1I9DA 3D4TA 4POMA 5G1KA 4N10A 3UVHA 4MLYA 5B6MA 4X43A 17GSA 1GUMA 2YWIA 2WDUA 3KMNA 2TIRA 4WF4A 5IM9A 2H19A 4IS0A 1Y25A 3LG6A 1Z3EA 2YJHA 2LJAA 2HRNA 4N0VA 2V41A 1KBNA 2YZHA 2XHFA 2C0FA 4MJAA 2N5BA 3S9FA 2HLSA 2DSAA 5ECHB 2WB9A 5INYA 5GSSA 2JSYA 2IL3A 2MMOA 4XS4B 1M9BA 1ZCPA 4MF7A 4LL4B 1WRYA 5CRGA 2OE0A 4IGJA 3ZIJA 5LD0A 4HDEA 2CAQA 1JZRA 4ECBA 6GSTA 1HNAA 6GSXA 5FT3A 3Q19A 4P3YB 2VD1A 3UBKA 3DD3A 1YDKA 2N5AA 4KDYA 4TRXA 2DJJA 2DLXA 1VF4A 3DWVA 3HCZA 1R7HA 3KH9A 3VWVA 2B6MA 2H76A 1GTAA 2DMMA 3ZTLA 2RUFA 4JR4A 3HA9A 1OE8A 4OMVA 5CO3A 1W89A 1BJXA 4N11A 2TRXA 5ENUA 5G5EA 4GSTA 1SL0B 4QL9A 2GTUA 4MDCA 2OBIA 2GDRA 2C4JA 3DXBA 10GSA 4LL1B 3QDNA 4I2TA 4Z7XA 2IFQB 3I69A 4GCIA 3ERGA 2FUG2 2K18A 1PX6A 4O32A 4GSSA 3NZNA 9GSSA 1B9XC 2YP6A 4RI7A 1OAZA 2I9HA 1O81A 3H1NA 4BL7A 1SL1B 2F3MA 1A2MA 1M0UA 3CTFA 4PXOA 2VCWA 4MJCA 2CZ2A 1CQGA 4ID0A 2YWOA 2RM5A 2LRNA 5JWRB 4PUFC 3LWAA 4V2LA 3IAM2 1Q4JA 3MNGA 5L71A 4GQCA 4HZ2A 5ELGA 1ZGNA 2E2MA 1YF0A 1R5PA 1F3BA 1GSUA 4IW9A 2L57A 3ME7A 3NOFA 4J57E 5IOXA 2FHEA 4ML6A 2M80A 1Z6MA 3IE3A 3G7YA 2WGRA 1TTZA 1TI3A 2IMIA 3EWLA 4G19A 1Q98A 3VI7A 2AV4A 2HXKA 1V9WA 3ZIVA 3HHVA 2B7JA 2IJYA 5C04A 3CSHA 5ECPB 3TGZA 4BWQA 2JU5A 2PWJA 3TJBA 4KSOA 2MMAA 3QPMA 2GLRA 4CDOA 1XOBA 11GSA 3HYPA 3Q74A 3PINA 4IJ3A 5F0GA 5D9XA 2YWMA 4TXOA 4HUAA 2OBKA 5EY6A 5COHA 2HSYA 3GFKA 2VUPA 3GMFA 5ECNB 1LJRA 2JL4A 4LMVA 4HU9A 4PQIA 2K8SA 4HS1A 4RUVA 1U6TA 4K8MA 3C1SA 3WGEA 5B8BA 1XCCA 3GURA 3GA4A 3W6GA 3ZL5A 2KOKA 2LEGA 4JZQA 4CHSA 3FZAA 4HZ4A 1JHBA 5CRDA 3GSTA 4GLTA 4DSRA 2B5EA 4K0NA 2FA4A 1VRSD 5KN1A 1SK2A 4DVCA 5H5SA 1FB6A 3GKMA 4K7OA 4NV5A 2H0IA 3GH6A 2PN8A 1PGTA 4TW5A 3EYTA 5DAKB 2C3NA 2O7KA 3GKXA 2HT9A 3U6VA 1GSEA 4K0GA 4ZBAA 4E8HA 5GAND 1V58A 2O8VB 1YY7A 4HI7A 1WOUA 3ZFBA 1S3DA 4MH2A 4NXIA 1JLVA 4KB3A 5HFIA 3WT2A 4GSNA 4TR4A 2EC4A 3F6FA 2GS3A 1G6YA 2V2GA 2B5XA 1R4WA 3K8NA 2VAFA 4JRRA 2FWGA 3LJRA 3AY8A 2EIQA 3ZZXA 3ZREA 5D96A 3GX0A 3J7Yb 2HZFA 4LLRA 4DSSB 4MP4A 1MEKA 1S3CA 1VGLA 3US3A 1RW1A 2LJRA 2H1AA 3LGCA 5D93A 5IO2A 4XS6A 1FHEA 2GQLA 2VL2C 2FA8A 2XC2A 4WBJA 4RQXA 5HR1A 3R2QA 1SYRA 3HZ8A 1VF3A 5FHIA 2VL2A 3KP9A 1GSFA 1GUHA 2FWFA 2LRTA 5F8BA 5J3RA 2GQMA 1W4VA 1X5CA 2IPAA 2GVPA 4OO4A 2LNSA 2LKUA 1EOGA 4TXOB 3H93A 5F06A 2HZEA 3DGQA 3D4MA 2LSTA 4PGTA 2L5LA 3TOUA 3IK9A 1A8YA 5ABRA 2FNOA 2LQQA 4OO5A 1SKSB 4WXTA 2LRCA 1EOHA 3TKSE 5B6NA 2IIYA 2CVDA 2R37A 2GGTA 3IV4A 3HDCA 3F4RA 1XW6A 4X1UA 3BCIA 3F4SA 5H5RA 2CV4A 4PQHA 4ZB8A 1EP7A 3GRXA 5HR2A 1GL8A 3EVIA 5HFGA 4DEJA 4MPGA 2CAIA 3HJOA 3CYNA 5HQPA 2YV9A 4L0UA 3GNJA 1FAAA 2QGVA 4EVMA 3ZLPA 2XBIA 1OE7A 5KEJA 2OJLA 5EPFA 2VD0A 3HJMA 3TKQA 5ECQB 1SL2B 4AGSA 5EVOA 4ECIA 2HSHA 5AGYA 2GQKA 5ECLB 1OYJA 3DRNA 5ECSA 2C0EA 2FWEA 2C1YA 4IJIA 1TK0B 4OCEA 5DVBA 3PH9A 4XCSA 3GKKA 2DIZA 3A2XA 1A23A 1KNGA 2EIRA 2JZRA 3I6AA 1PQNA 2H75A 4V2MA 4OD7A 1NSWA 5IIZA 1S3AA 3DYRA 5JCGA 1SK0A 3UL3A 4XTSA 2DC5A 1R26A 3VPQA 4KDUA 2VCXA 4K7IA 5DQSA 4TVEA 4J56E 1X9WB 5G30A 3I9V2 3JCML 3UBLA 3G7IA 1C72A 2HZEB 2E0QA 3ZMLA 3F4TA 4MK3A 2J23A 3GKNA 4EUYA 3D21A 4HU7A 3LQ7A 2G0FA 1PD21 3GL5A 3VI5A 3D6IA 4ZILA 5D9VA 3ZMKA 4WETA 2VL9A 2O89A 2K6VA 4KW6A 1PKWA 3LXTA 2X8GA 18GSA 1NW2A 1EEJA 3LXZA 3QAGA 4MZCA 5DBQA 4FYCA 3KTLA 4MABA 3RHBA 1K0MA 3HY2A 3KM6A 1OKTA 4ZIJA 4JEDA 3P2AA 1TK8B 4K6XA 4ZB6A 7GSSA 5IPGA 4F0CA 1JZDA 3F6DA 3ZRDA 1T4ZA 4FYBA 4HEA2 1NHYA 2R3XA 1FG4A 4WKWA 4KGIA 6GSVA 3TUEA 4OFTA 3WD6A 3O3TA 5A5KA 2PERA 3A2VA 2HRFA 4EC0A 2JACA 12GSA 20GSA 3CTGA 4O7HA 1HQOA 3DEXA 5KN0A 4IQ1A 3GSSA 5G5FA 1OKDA 1GULA 2H6XA 2QKEA 2RUEA 3FR9A 2I81A 2X64A 4IP6A 3TJGA 2YOIA 1X5EA 1G7OA 8GSSA 1T8EB 2RLIA 1VF1A 1B4QA 1JZWA 2JZTA 4KE3A 2ZUPA 1V2AA 1U3IA 3KH7A 4HJMA 2G2QA 4AJ6A 2DJ2A 4XHMA 4IP1A 1GSDA 1RQMA 4KA0A 4NWYA 5AIVA 4HOJA 1VF2A 1J08A 2VM2A 2CVKA 3M1GA 3FW2A 1T7PB 1AW9A 4NV2A 2ZCTA 4FO5A 2O87A 4HQSA 2DIYA 4IELA 3FKFA 1XWAA 5IMAA 3IXRA 2H6ZA 6GSYA 2BMXA 3BOAA 2TRCP 4I2UA 2ALBA 3VWUA 2C8UA 3IHQA 2IMFA 2JZSA 4POLA 1O8WA 3KIJA 1M2DA 4KDXA 2DJKA 1Z5YE 3EINA 2O85A 3C1RA 5CP1A 1EEMA 2GT6A 3FYGA 1PSQA 4IHUA 3IOSA 4Q5RA 1ML6A 2L59A 4LA1A 1F3AA 2JSZA 2HE3A 3EU3A 2V6KA 2CZ3A 4WEYA 2WCIA 3CBUA 1QK8A 2PU9C 4GF0A 5ELAA 1WP0A 4KH7A 2YCDA 2CX4A 1M7TA 1V40A 4MH3A 1GTUA 3QFBC 4IKHA 2AYTA 4D73A 5CYYA 2FD3A 1ZYEA 2ZNMA 5A4UA 4QL7A 5G2ZA 1NHOA 1QFNA 3RPNA 1GSSA 1UC7A 4MMMA 4PNGA 1H75A 1BEDA 1IYIA 2NPBA 1EV4A 3GX8A 2H6YA 3Q18A 1ACVA 1T1VA 1BAYA 1SD8A 3DVWA 5A4VA 1XZOA 3M8NA 3A2WA 2R2JA 4ZL7A 2FLSA 5LCZA 4KAEA 2AUVA 1R5AA 1FOVA 1QQ2A 3QD9A 5AN1A 4TR0A 2VM1A 2X8CA 3F3QA 3IPZA 5DALA 3ZVJA 4GRFA 3EURA 3ZVJD 4PX1A 3FR3A 4EDYA 3PR8A 22GSA 3DMLA 2J9HA 3WYWA 3KP8A 3QR6A 4I97A 1AIUA 1WJKA 3D5JA 1ERUA 3VFIA 1V57A 4XIHA 1HNBA 1EP8A 5G31A 2KP2A 3KCMA 2B1KA 2AHEA 1A2JA 4ZB9A 3PGTA 3RPPA 4BWSA 1ZMAA 2FCHA 1B48A 4K2DA 1GH2A 5ECIB 1QMVA 1F2EA 1ERTA 1GTBA 4YAPA 4BVXA 2WZ9A 6GSUA 1YF1A 1Y6EA 1A0RP 4YH2A 1T00A 2PVQA 2YPMA 5H5QA 1PMTA 5D8IA 4MJEA 2VCVA 4F0BA 1TXXA 1GUKA 3SBCA 3ME8A 3MSZA 4Q5QA 2C80A 1WMJA 1EGOA 13GSA 2B7KA 1Z9HA 3IC4A 1MDKA 5DQYA 5ECRB 2WFCA 1K0DA 1SU9A 3QCPA 2PVOC 5AISA 5HFKA 3IAS2 3BBYA 4N30A 3VURA 5JCUA 3KZQA 4ACSA 1G6WA 2V32A 2K8VA 1IYHA 1GP1A 4D73B 2VOCA 3P7XA 1K3YA 3TJFA 5IMVA 1THXA 3IA1A 2XBQA 2VIMA 2BJXA 4TOPA 2LUSA 5DCHA 1O6JA 1XXUA 1RK4A 2A2SA 3TRPA 4GWRA 5HR0A 1GNWA 4OCFA 4XRAA 1SJZA 1ERWA 2ES7A 3WT1A 4EXJA 3HVSA 4K9ZA 2AB6A 3KD0A 4KCEA 5DALB 3UVTA 3MAKA 3LYPA 5C00A 1THOA 3GTUA 3N9JA 1AAZA 1URMA 1K0AA 3E9JB 2I4AA 1F37A 3CSJA 1TW9A 3FZ9A 5KN2A 1MDJA 1X0RA 1H4OA 2KUCA 1TK5B 2E2GA 1Z6NA 1XPVA 3CRTA 4Q5NA 2R6KA 3DVXA 1M99A 1HYUA 4V1Ag 2YJ7A 4KX4A 3E3EA 1A8LA 4GXZA 2A2RA 3APSA 4MA9A 1B9YC 5IMZA 3J7Yk 3TCOA 3TJJA 1XVWA 3KTBA 4ZL9A 5A4WA 1BYEA 2MMNA 2GSQA 1XWBA 4XS4A 1BG5A 1JFUA 1TP9A 3EE2A 4FYUA 3HKRA 1PX7A 5DJMA 4G10A 5AIXA 5ECOB 3W8JA 2R4VA 3TB2A 1PN9A 1GSQA 2H66A 5GSTA 2IMDA 3IRAA 1PKZA 3ISOA 3L78A 3GYKA 2MZCA 3GIXA 3EMXA 3QMXA 5J5NA 2AJQB 3KJYA 2NDOA 5IO0A 2H73A 1F9MA 3TRXA 3QAVA 3BD2A 1J9BA 1MD3A 1U88A 4MCUA 1XW5A 3ZYWA 16GSA 3LSZA 4POKA 2WRTA 2H1DA 3W8SA 1PA3A 2RIIA 1K0BA 6GSWA 4MF5A 3L4NA 2XPDA 1LBKA 1PL2A 3FZ5A 5JWOB 4WR4A 4ECJA 4WF5A 1DE2A 3QAWA 4IVFA 3EU4A 1O7UA 3GTUB 4PQ1A 2H74A 1K0OA 2C3TA 1GSYA 4L5LA 2FY6A 4ISDA 3LEFA 4ULXA 1DE1A 2EIOA 3D0ZA 4Q5FA 1MTCA 1XWCA 2E7PA 3ZFLA 1YKAA 4EDZA 2NBSA 3C71A 4ZL8A 2GSRA 3U5RE 2WJUA 1YZXA 1HNCA 2DJ3A 2VL3A 3A5WA 4JU5A 3KEBA 3QFAC 1G7EA 4K1FA 5B8AA 4NHWA 1NM3A 1ON4A 4V2NA 3TKSC 3UMAA 3M0FA 5D73A 2L5OA 1T3BA 2CQ9A 2MBSA 1A0FA 1QXHA 1K3LA 4G9HA 4F03A 2OADA 3GL3A 3APOA 4AJ7A 1UA5A 4FIWA 3TKSA 1BX9A 2H71A 5DDLA 1X5DA 3G7JA 1M2AA 3F0IA 4ILFA 3OR5A 2LTKA 4YQUA 1ABAA 3EMPA 4G2EA 4NHZA 1B4PA 2KHPA 1LU4A 2OE3A 1TU7A 1FB0A 3IBHA 2L6DA 1AC1A 4J2FA 2NVLA 3IK7A 3VLNA 1GRXA 1K0NA 3V1WA 2HI7A 2WS2A 2MMZA 1DUGA 1ZOFA 4JE1A 1U3AA 4F2IA 4ML1A 3HXSA 4K7NA 4GTUA 5G1LA 3H79A 3ZITA 2VLVA 3HZ4A 1AXDA 4TR1A 1X9SB 1QUWA 5CRHA 3GV1A 4KCAA 1TOFA 2CT6A 2F51A 2M72A 2V1MA 2GZZA 4TKYA 2H0HA 1SENA 5EL8A 1V98A 2LJKA 2HFDA 3HD5A 1N8JA 4TR3A 5JWQB 2GZPA 2WULA 3P90A 2DJ1A 2PGTA 1TRUA 3ED3A 1JZOA 3C7MA 4F9ZA 1J0FA 2YWNA 2AAWA 1ST9A 3H4KA 1BQ7A 3APQA 4X0XA 3N5OA 5IMCA 2H30A 5FWGA 2GT5A 5IPHA 5LNKe 2KP1A 1GNEA 1JLWA 1UVZA 3C73A 1PRXA 3KXOA 1ILOA 3GUSA 1UN2A 3M9JA 1SD9A 5DAKA 1ZYQB 4H86A 2HYXA 3FK8A 1FVKA 5IQYA 2LQOA 3F9UA 2N5FA 2M46A 4KSMA 1XWKA 1WIKA 4ECCA 1E6BA 4DSQA 3BCKA 4EO3A 2F9SA 4BPYA 5ID2A 5E4WA 4EKZA 3LFLA 14GSA 3VK9A 3FY7A 3UJ1A 2H72A 3GH9A 1O73A 1TKDB 1XBSA 4JBBA 3UAPA 1X9MB 3O6TA 4NMUA 3IDVA 5F05A 1E2YA 2MYGA 2P0GA 4DSSA 3RAZA 5JCWA 1G0TA 1FW1A 3HVVA 3M3MA 3UEMA 2YZUA 1A24A 4XS1A 2PPTA 1XW9A 3TKPA 3L9SA 3F8UA 2H1GA 4I5QA 1YJ6A 3CXGA 1I5GA 2ON5A 2B3SA 2K9FA 2Z9SA 2RM6A 5GAPD 3UARA 1TDIA 2QC7A 1F6MC 3IR4A 4RI6A 1U87A 2R5GA 4MZWA 2MBTA 3LORA 4IBPA 4TR1B 2C0GA 3TJKA 3F3RA 4LMWA 1YEPA 4MJBA 3MWHA 3ERWA 5IMFA 2OACA 4L8EA 2F8FA 4ZBBA 2PBJA 2YANA 2H70A 3I43A 1XFLA 3RDWA 1O85A 1TI1A 1WWJA 2GZYA 2H01A 1OC9A 2DMLA 2HNLA 2P5QA 1OC8A 5J41A 1MD4A 4KNDA 2C0DA 1KTEA 4MPFA 4WBRD 2VO4A 1XWGA 3RBTA 4AF2A 2IN3A 3FHKA 3L9VA 3MDKA 3CRUA 4FH8A 2CX3A 3FZ4A 2NTOA 5D9WA 1XOAA 2VLUA 1HD2A 4TN8A 3RHCA 2B1LA 5J9CA 3SWLA 3KMOA 1OC3A 2YV7A 4L0WA 4O92A 2JADA 1MDIA 2GSTA 3TRQA 3DIEA 5DJLA 1USBA 4O5RA 4F82A 3VWXA 1SKRB 5J4UA 3G9BA 3C8EA 5CNWA 1FO5A 2QSIA 1SJ6A 5HR3A 3EC3A 5ID2B 4PURA 2VLTA 3KGKA 1M2BA 1SK1A 3H8QA 4OFNA 1EWXA 3VWWA 4EL1A 5B7CA 2H1BA 2YN1A 1CQHA 2IMKA 4KUNA 4QQ7A 2YNXA 4TXVA 4MZBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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