1DE1A

Nmr structures of oxidized bacteriophage t4 glutaredoxin
Total Genus 15
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
15
sequence length
87
structure length
87
Chain Sequence
MFKVYGYDSNIHKCVYCDNAKRLLTVKKQPFEFINIMPEKGVFDDEKIAELLTKLGRDTQIGLTMPQVFAPDGSHIGGFDQLREYFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
molecule keywords GLUTAREDOXIN
publication title Solution structures of reduced and oxidized bacteriophage T4 glutaredoxin.
pubmed doi rcsb
total genus 15
structure length 87
sequence length 87
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-11-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1de1A00
2PVOC 3WGDA 2B3SA 3HXSA 2X99A 3HJMA 3TJFA 11GSA 4K9ZA 5G2ZA 4TR3A 3IC4A 2HZEA 5A4VA 2EC4A 4HU9A 3G7IA 1YF0A 2I9HA 2X8GA 3GMFA 1A2LA 1X9MB 3VWXA 4I8BA 2F8AA 1FW1A 5FT3A 2K8SA 3IXRA 1FVJA 3GSTA 2YANA 4PNFA 4XRAA 8GSSA 5HR3A 2DJKA 4OO4A 1JFUA 4PNGA 3OR5A 4DVCA 1XWKA 4ML6A 1M9AA 1W4VA 2M80A 6GSYA 1SD8A 2GQLA 3CTFA 2AHEA 1Y25A 3TKPA 1GRXA 3KEBA 2LEGA 4K0GA 3TB2A 5J41A 4WBJA 3GKXA 2NBSA 2R37A 2LV3A 2YV7A 1GL8A 2XPDA 5FHIA 3KH7A 4RI7A 4I2UA 2K6VA 2LRNA 3A2XA 1OE7A 1AAZA 4GWRA 3SWLA 2VCXA 4DSSA 3UL3A 1X9SB 1XFLA 3FK8A 2IIYA 3UEMA 2NTOA 3J7Yk 1XW9A 19GSA 5CAXA 3P8WA 5GAPD 5IMVA 1YDKA 3Q6OA 3TRQA 2MMNA 2YWOA 2AJQB 3H93A 1B4QA 1U88A 2QC7A 1AQWA 4F03A 1KTEA 4WBRD 3CXGA 1GNWA 5D96A 3GA4A 2GZYA 2NDOA 2V6OA 1A23A 1MEKA 3HYPA 3K8NA 5EY6A 3TUEA 3A2VA 5IIZA 1KNGA 3O6TA 3GFKA 4EDYA 1FVKA 3US3A 4BL7A 13GSA 1BYEA 1FOVA 4IELA 4HQSA 4HU7A 4BVYA 5D73A 2FWEA 3FR3A 1OC3A 4L8EA 1BQ7A 1QUWA 5HFGA 7GSSA 4ZB8A 1Z6NA 3LGCA 2HNLA 4EC0A 3EU3A 2LKUA 4KH7A 1CQGA 2GDRA 1TOFA 3KP9A 3D4MA 3KTLA 4LA1A 3BJ5A 3NOFA 1BAYA 3HY2A 1SKWB 3IAM2 2LTKA 1NSWA 1B4PA 4AF2A 5DAKB 5CRGA 5B8AA 4P3YB 4TW5A 1A8LA 2AUVA 4JRRA 1ZL9A 3VPTA 14GSA 1QFNA 1OAZA 4GTUA 1E6BA 5AISA 2R6KA 1Z7PA 1XXUA 3PH9A 4K7NA 2CZ3A 2V41A 2PUKC 2FCHA 4Z7XA 1OKDA 4IVFA 4GSNA 2JZSA 1W89A 2X8CA 3F63A 4ZBDA 5ECLB 3UMAA 3L9UA 3VI5A 3E3EA 5ECHB 1XWGA 2M46A 2JZRA 5F07A 2VM2A 1EP8A 5D9TA 5IM9A 5G1LA 1PA3A 2H0HA 4HJ2A 1AQXA 2BTOT 3U6VA 2X64A 2MMAA 4X1UA 2XBQA 1YQ1A 3LORA 3VURA 3QOUA 5J4UA 2RM6A 2GTUA 1XWBA 5DALB 3VFIA 2IL3A 4K2DA 2I3YA 2DC5A 3GNJA 3E9JB 3VK9A 1T7PB 5ECSA 3D0ZA 3M9KA 1FG4A 1T4YA 2YWNA 3DMLA 4V2LA 5KEJA 2ON7A 4GLTA 1YKCA 4N0VA 4V2MA 18GSA 2QKEA 4GRFA 5CNWA 5GSSA 2LJRA 2CX4A 3UAPA 4N11A 2CVBA 3CMIA 3KTBA 4QL7A 4EXJA 3DVXA 2B5EA 4WR5A 1WMJA 3I43A 5ECPB 4TOPA 1AUCA 3RPNA 5DJLA 1SU9A 3CSJA 5J3RA 3ERGA 4MCUA 1J08A 3IOSA 2IPAA 1Z3EA 4K7OA 2H75A 5IOWA 4KUNA 4TR4A 1YZXA 2XHFA 2L5LA 3KIJA 4WETA 5ECIB 2F9SA 2WDUA 1N8JA 3IPZA 3HZ8A 4OFMA 1U6TA 3H1NA 3BD2A 4IJ3A 2FA4A 5ID2B 2YZHA 1GSDA 2DJ2A 4X0XA 3ZTLA 5HR2A 5J9CA 4NV5A 1SL1B 2L4QA 4J56E 4ZXGA 3WT1A 3FZ4A 4MK3A 1EEMA 4IN0A 1MD4A 4H86A 1FHEA 4JEDA 1HNCA 2MZCA 5LD0A 1V98A 4G19A 1S3CA 3MNGA 2JZTA 4F0CA 2YP6A 4ACSA 1E2YA 1NHYA 2PPTA 1J0FA 2FY6A 1Z9HA 5IMFA 5D9VA 4AJ7A 1FAAA 4AJ6A 1TRSA 2HZFA 4YAVA 3L0HA 2E2MA 1UN2A 1ZMAA 3IHQA 4EE0A 20GSA 4MJEA 1GSYA 4Q5QA 2IFQB 2XPEA 2IN3A 2VLTA 3GH6A 3C71A 2REMA 3TRXA 1K3YA 3GRXA 1JLVA 4OMVA 2A4VA 2B6MA 4KDYA 3O76A 1AC1A 5IOXA 3G7JA 3ZVJD 1TK8B 5AIVA 1THXA 2C1YA 1V9WA 5CRWA 4TR1B 1I5GA 1EZKA 2AAWA 2J23A 1TU8A 1JZRA 2H66A 3FR9A 3M8NA 1ERTA 4PQIA 2M72A 5AN1A 1V58A 4NMUA 4JR6A 1T1VA 4TKYA 3J7Yb 1T00A 4WXTA 2I4AA 2C0FA 1Z7RA 5COHA 1K0DA 3VPQA 3QMXA 1A2JA 1U3IA 1NHOA 5DVBA 1M99A 3QAVA 2GQKA 3L9VA 3GKKA 4F2IA 2IWTA 4POBA 3P2AA 2F51A 3HVVA 3C73A 4XS6A 3CSHA 1PX7A 3F6FA 5G1KA 3EYTA 3QD9A 1RK4A 2WFCA 3W8JA 1V57A 4PQHA 1ZOFA 5ECKB 2YJHA 2VLUA 2YJ7A 3FY7A 4KA0A 4HI7A 3EINA 3GTUB 4K6XA 1DSBA 4GSTA 4LLRA 1K0OA 2H1BA 1OC9B 5D93A 1XIYA 5HQPA 5DAKA 1EOHA 2CT6A 2IMKA 2I1UA 2CX3A 1HQOA 2FGXA 4RQRA 3WYWA 5ECMB 2H74A 4ECBA 3DEXA 4ZL9A 1SKSB 3HKRA 5F06A 1TW9A 4GXZA 4HOJA 2R2JA 9GSSA 1OKTA 3RPPA 1YKAA 2H0IA 1GLPA 5G5FA 4ZB6A 1FB0A 2WULA 1SYRA 5DJMA 4J2FA 1B48A 2I81A 2AV4A 4I5QA 5C04A 3P90A 4ZIJA 2LRTA 4ZBAA 4RQXA 1PL2A 4XIHA 3GHAA 4AJ8A 2HE3A 2G2QA 2DJJA 5D8IA 4JE1A 1TU7A 1F9MA 1GP1A 4KNDA 4MF7A 1S3DA 5DCHA 1PQNA 3TRPA 2DJ1A 4CHSA 4K7IA 1O8WA 3H4KA 3G7YA 3G9BA 1KEBA 3QDNA 3W6GA 2VL2A 1WPIA 2JL4A 2C3QA 2GZPA 3KXOA 2H72A 4WKWA 6GSVA 1TI1A 1SJIA 1V40A 2B1LA 2FWGA 3LYKA 1O7UA 3V1WA 2RUEA 4E8HA 1F37A 4V1Ag 5B6MA 3ZLPA 2H6ZA 2C80A 1GH2A 2TRCP 1TDIA 1U3AA 1ACVA 4ZBBA 2WJUA 3GX0A 3L9SA 3GIXA 2HXKA 6GSXA 2H73A 2ON5A 2OE3A 3C1RA 3D22A 2O8VB 3ZFBA 3LFLA 1WJKA 2VOCA 5KN3A 4OFNA 3WD6A 4FYCA 4WF4A 2NVLA 3Q74A 2VCTA 3QFAC 1LJRA 3GKNA 3DGQA 4GQFA 2YZUA 1R7HA 2CAIA 1MDJA 3I9V2 1TK0B 3TDGA 4NWYA 1IYIA 4TRXA 1GTBA 5JWQB 5L71A 1ZYQB 5LNKe 3F4TA 1U87A 2H1AA 1ZCPA 1G6WA 3KCMA 5ID2A 1PL1A 3DXBA 4HZ2A 2H6XA 1ON4A 2FHEA 2KUCA 1Q98A 1USBA 4MF5A 1BEDA 1B8XA 4FYBA 3TJKA 2VD0A 3NIVA 1LU4A 4TXVA 4POKA 3LYPA 3UARA 1UC7A 2A2RA 2MMZA 2IMDA 5JCUA 4YQMA 17GSA 1SK1A 1JLWA 4K8MA 1YEPA 2DJ3A 5IMAA 4KSMA 3U5RE 4GF0A 2C3NA 3C7MA 4HZ4A 2JACA 3M9JA 4ZB9A 1PKZA 5J5NA 4KGIA 4LL1B 4OD7A 2IFQA 1ERUA 3KJYA 2L57A 4IP1A 3CRTA 1QMVA 2H30A 5JCGA 4DSRA 1A24A 4L0WA 2XC2A 2LJKA 3D4TA 1UA5A 4G9HA 1O6JA 3ISOA 2C0EA 4PX1A 2DLXA 2LSTA 5B7CA 2YV9A 3A2WA 4POMA 4K0NA 1SYXA 1NW2A 1GUKA 4TR1A 2VCVA 4BVXA 3PINA 4GSSA 1RQMA 2B5YA 2B7JA 1A0FA 2KLXA 2YWMA 1AW9A 2H8LA 1LBKA 1M2AA 2CVKA 4NPBA 2OBKA 4MDCA 5CREA 1R5AA 1AIUA 4LL4B 2YNXA 3M0FA 4XCSA 2V32A 5KN2A 2A2SA 1DUGA 2EIRA 5IQYA 3ME8A 1R5PA 2P5QA 1O85A 3F8UA 5DBQA 1HNBA 3IAS2 5IMDA 4FH8A 2AB6A 2LUSA 2E2GA 3CRUA 3ZITA 2K18A 3F3QA 1VGLA 4PUAA 2H19A 4I6XA 3TKSC 2C3TA 2R3XA 6GSTA 1SENA 2B7KA 3HVXA 2JU5A 4YQVA 2KHPA 1T8EB 2GSQA 1WE0A 4EUYA 5LCZA 1GNEA 2FWFA 3GTUA 5E4WA 1JZDA 4JZQA 1PX6A 4XS4B 3VWWA 1GTUA 1XWCA 4IHUA 4MPFA 6GSWA 2J9HA 2V6KA 1K0NA 1XW5A 2GVPA 2OE0A 1F3AA 3WGXA 1GSEA 4NXIA 1PSQA 4YH2A 3KMNA 3IK9A 1PMTA 3ZIJA 1WOUA 3APSA 1PRXA 5A4WA 2H71A 2R4VA 4N10A 3QR6A 2LS5A 1B9XC 2DBCA 2WRTA 2JSZA 4EKZA 1R26A 4V1Ap 1XVWA 1VF4A 2FD3A 1XW6A 1T4ZA 4QL9A 4JU5A 2AYTA 4IP6A 4X43A 2B5XA 5H5SA 1K0CA 1MD3A 3UOMA 3AY8A 1SL0B 3HVSA 1PGTA 2GZZA 5KN0A 3H8QA 3APQA 3HJOA 1UVZA 2H76A 5INYA 1I9DA 1TRUA 4I97A 1GSQA 4IKHA 4IS0A 1PN9A 3KZQA 2N5FA 3UJ1A 1WWJA 4BPYA 3A3TA 3HCZA 1XVQA 2PN8A 1XBSA 2YWIA 4KX4A 5JWOB 4EO3A 2X8HA 2WGRA 2VL9A 1TI3A 3Q18A 3BBYA 5GAND 3TCOA 4EDZA 4POLA 1EGRA 2C8UA 4MZBA 3EE2A 3A5WA 4YAPA 2QGVA 1TK5B 2K8VA 1THOA 4E8EA 3ZZXA 1EV4A 2DJ0A 4ECIA 4O32A 4O92A 2F8FA 1K3OA 2TIRA 1F3BA 4F9ZA 3IR4A 3QPMA 2IMIA 5H5QA 1Z6MA 2VD1A 4MJCA 3VWVA 3F0IA 5IO2A 2ALBA 2DMLA 3CTGA 2IJYA 2CZ2A 2DIZA 4MH2A 3TKRA 4ULXA 4TR0A 4L0UA 3QAWA 1EEJA 1URMA 2OE1A 3DRNA 2BJXA 4EF0A 5AIXA 1XOBA 2RUFA 4KCEA 1RW1A 2C0DA 3ZIVA 4Q5RA 4WR4A 3F6DA 2VIMA 1TTZA 3IV4A 3GUSA 2NPBA 1GSUA 3DVWA 3O3TA 5HFKA 5ELGA 1DE1A 2YCDA 4OCEA 3FR6A 1TRWA 4HS1A 1S3AA 5ECQB 2HI7A 2N5BA 4XRDA 3DIEA 4BA7A 2VCWA 4F0BA 3P7XA 2F3MA 4IW9A 3APOA 2L6CA 1FO5A 2VLVA 3ZMLA 1B9YC 1X9WB 2VL2C 3GL3A 2GSTA 3IBHA 1C72A 1MTCA 3N5OA 1WP0A 2PWJA 3FW2A 5B6NA 1XZOA 2RLIA 5IPGA 3TGZA 3HA9A 4KW6A 2YPMA 3HDCA 6GSUA 16GSA 4D73B 3CSIA 2C4JA 5GZZB 4ML1A 3C8EA 2GGTA 2CV4A 2P31A 3BOAA 3TKSE 10GSA 2VCQA 2PU9C 3D21A 1JZWA 4F82A 1YF1A 2R5GA 4KAEA 1TXXA 2H1GA 3RHCA 1TKDB 2HLSA 2MYGA 3VLNA 4HDEA 3MSZA 4PURA 2CQ9A 2PVQA 3TJBA 2Z9SA 4NHWA 1ILOA 4MPGA 4HUAA 1Y6EA 1HNAA 4AGSA 5JCWA 2HRFA 3MDKA 1H4OA 2FUG2 3L78A 1GSFA 3PGTA 2VCZA 1JZOA 1K0MA 3EWLA 5JWRB 2D2ZA 3SBCA 3FRCA 5DALA 1A0RP 1XPVA 2LQOA 4NHZA 3GYKA 1M7TA 2FWHA 5A5KA 1O81A 2WCIA 1A2MA 5FWGA 3ED3A 2WS2A 1YEXA 2GT5A 5ENUA 4NV2A 4G2EA 2YOIA 4WF5A 2QSIA 4ECJA 4ZILA 3D5JA 3L4NA 4MJBA 3QFBC 1GTIA 2L59A 2GSSA 2KOKA 4TVEA 4IQ1A 2JSYA 4ISDA 2ZNMA 1T3BA 3F4RA 3KM6A 4XHMA 2E0QA 2MBTA 4XS4A 2FNOA 5IO0A 3ZFLA 1GWCA 3UVTA 1TRVA 1EP7A 5CP1A 4MA9A 2H6YA 4OWYA 2GT6A 1M0UA 1VF2A 3GL5A 1BX9A 4MF6A 2LRCA 2V1MA 2LNSA 1Z5YE 4I2TA 3CBUA 5F0GA 4DEJA 4PQ1A 3MWHA 1XOAA 1X5EA 4OCFA 5ECNB 1PKWA 3RHBA 2EIOA 5EL8A 4Q5NA 1TP9A 3DKSA 1EGOA 3GKMA 3E0UA 5G31A 1H75A 4BWSA 4N0ZA 4PGTA 2L6DA 3HJPA 1ZZYA 4O7HA 5IMZA 2HYXA 3W8SA 2FA8A 3KD0A 2IMEA 3UBLA 3M1GA 1K0AA 3HD5A 1NM3A 2EIQA 4TXOB 3UVHA 3LEFA 1O8XA 5G30A 1M2BA 2PGTA 5ECOB 2OACA 1AXDA 2O87A 4MMMA 2L4CA 1MDIA 1G7EA 2TRXA 3RDWA 2OJLA 6GSSA 3GV1A 3ZYWA 1OYJA 4FO5A 2HZEB 2OKAA 1ZGNA 2L5OA 3QCPA 1G7OA 2ZCTA 1SK0A 3GSSA 3LXTA 3LG6A 1R4WA 4J57E 3R2QA 1QK8A 3FEUA 5H5RA 2GSRA 3H79A 2ZUPA 3FHKA 3LSZA 1SJ6A 1N2AA 3I69A 3GX8A 3WGEA 2H0GA 1YY7A 5CYYA 2OBIA 1JHBA 1K3LA 5F8BA 5DCGA 1XWAA 2DSAA 22GSA 4MH3A 2PERA 4OFTA 1GUMA 2VAFA 2LNTA 3UIWA 1PD21 4CDOA 4DSQA 2PBJA 1EV9A 2VO4A 5HR1A 3ZL5A 1AQVA 3TKQA 1G0TA 2H70A 4DSSB 1ABAA 5AGYA 3VWUA 4MZWA 4EVMA 2JADA 4HQZA 3LWAA 4KDUA 3ERFA 1IYHA 2DIYA 4NAXA 5EPFA 1QXHA 3TJGA 3IDVA 4PUFC 3BCKA 5ECRB 1OE8A 1QQ2A 1SKRB 1G6YA 3RBTA 1DBYA 3Q19A 2ES7A 2V2GA 3ZMKA 3ZRDA 3EURA 1F6MC 4KSOA 5D9XA 3S9FA 1OC9A 2E7PA 4ECCA 1SK2A 3DYRA 1GLQA 5CRHA 4TN8A 1ERVA 3N9JA 2VUPA 2VM1A 4CW9A 1FB6A 2P0GA 2CA8A 5J9BA 4RI6A 3HHVA 2LJAA 3M3MA 1QGVA 1O73A 4LMVA 1BJXA 2BMXA 4D73A 4Q5FA 3F9UA 4IJIA 1F2EA 2B1KA 5ABRA 2OADA 4WEYA 1WRYA 3EMXA 1GTAA 3FZ9A 3F3RA 1GULA 1SJZA 2HSHA 1EWXA 2HSYA 4KB3A 2H01A 5CRDA 2DMMA 2G0FA 1ERWA 3KP8A 2FLSA 2N5AA 1GSSA 2CVDA 2O7KA 1VF1A 4MABA 1Q4JA 1VF3A 3EVIA 2WB9A 4HJMA 1A8YA 3LXZA 2LQQA 4MZCA 4ZL7A 2IMFA 4XTSA 3TKSA 3PR8A 3KH9A 2YN1A 4OO5A 3EC3A 5IPHA 1X0RA 5E59A 3GURA 1EOGA 1X5DA 4YQUA 1OC8A 3TOTA 2KP2A 2XBIA 3BCIA 3I6AA 2OA7A 4O5RA 3F4SA 3LQ7A 3UBKA 4EL1A 3LJRA 1M2DA 1WIKA 2H1DA 3VI7A 2P5RA 3FZ5A 4MP4A 5DQYA 3RAZA 2CAQA 4PXOA 4JR4A 5HR0A 3ZREA 5IMCA 2GS3A 5DQSA 1GUHA 1J9BA 3FYGA 4RUVA 2K9FA 5A4UA 4KCAA 3IE3A 3CYNA 2O85A 3EMPA 5G5EA 3TJJA 1ML6A 5EVOA 4XS1A 4ID0A 3ZVJA 4IQAA 4JBBA 1CQHA 2WZ9A 5DDLA 3IK7A 5D9WA 4ILFA 1ST9A 3NZNA 3FKFA 1KBNA 4V2NA 5F05A 1VRSD 4KDXA 1ZYEA 2O89A 3KMOA 3ME7A 1K0BA 3DWVA 1YJ6A 3FZAA 2GQMA 5ELAA 2C0GA 4IBPA 4L5OA 4MLYA 3DD3A 2MBSA 1SD9A 2VL3A 5HFIA 2PMTA 3GH9A 3JCML 3GN3A 3ERWA 1OVNA 1MDKA 2RM5A 1M9BA 3MAKA 4HEA2 3QAGA 4ZL8A 4G10A 4MJAA 5GSTA 4L5LA 2HT9A 5CO3A 1BG5A 4IGJA 2RIIA 3EU4A 4GQCA 3WT2A 4K1FA 5KN1A 2GLRA 3KGKA 2HRNA 3IRAA 4GCIA 2HFDA 2KP1A 4FIWA 1SL2B 4N30A 1V2AA 3HZ4A 4LMWA 3TOUA 1HYUA 4BWQA 1TJDA 12GSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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