1FOVA

Glutaredoxin 3 from escherichia coli in the fully oxidized form
Total Genus 26
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
26
sequence length
82
structure length
82
Chain Sequence
ANVEIYTKETCPYCHRAKALLSSKGVSFQELPIDGNAAKREEMIKRSGRTTVPQIFIDAQHIGGYDDLYALDARGGLDPLLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
molecule keywords GLUTAREDOXIN 3
publication title NMR structure of oxidized glutaredoxin 3 from Escherichia coli.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 26
structure length 82
sequence length 82
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-08-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1fovA00
1AW9A 3HJMA 2H1AA 1PA3A 3GURA 3UJ1A 2FLSA 2A2SA 3UIWA 3GSSA 1RW1A 1Y6EA 1PKWA 4TW5A 3GTUB 2VCVA 1QQ2A 1FOVA 3FKFA 2JSYA 2ON7A 3IV4A 4BA7A 2IPAA 5ECPB 3ZRDA 3LYKA 2YV9A 2GDRA 1DSBA 4OMVA 4MF6A 1GLPA 1JZRA 1JFUA 3H93A 3IK9A 5IMVA 1GL8A 1PRXA 5G5FA 1B9XC 3ZVJD 3TRPA 1HYUA 6GSXA 1V40A 4WR4A 3ZFLA 5AISA 2LKUA 1XCCA 3M1GA 4PUFC 3BCKA 3M9KA 2K8VA 4ECIA 1T7PB 2GVPA 2HFDA 2H8LA 3IOSA 1WE0A 1A0FA 2YANA 2H19A 3A2WA 1X5EA 4AGSA 3HA9A 1UA5A 3QD9A 5G30A 2FWHA 2LV3A 4XCSA 3KMOA 2AUVA 1X5DA 1CQGA 4MPGA 3UAPA 3L9UA 2O8VB 3IC4A 4JEDA 3TCOA 2XBIA 4IHUA 5CYYA 2CZ3A 5DQSA 5B7CA 4J57E 4I6XA 1S3AA 2HSHA 4IGJA 18GSA 3F63A 2H30A 2ZCTA 4XHMA 1K0MA 3V1WA 3EURA 2B5XA 3EVIA 2X8CA 2CVDA 3CSHA 5IMFA 1XWKA 1K0CA 2GS3A 3F9UA 4JR6A 1ABAA 4IQAA 2X99A 1YEPA 2C3TA 2F3MA 1V57A 2DJ2A 2WRTA 5IO0A 1J08A 2R4VA 3E3EA 5ECOB 1E6BA 4EDZA 3LGCA 4LL1B 1KNGA 4AF2A 4K7IA 4HS1A 1Z5YE 5GZZB 1JZDA 1X5CA 1TXXA 3FR6A 2OACA 2QSIA 3QFAC 2H66A 2H71A 3U5RE 4L5LA 1NM3A 1EZKA 1XWBA 5KN1A 5AN1A 22GSA 1A23A 2IMEA 3O3TA 1EV9A 1K0DA 2I4AA 4MK3A 3HJPA 4D73A 1SL0B 1U87A 14GSA 1B4PA 1SJIA 3DYRA 3VLNA 4IKHA 2MBTA 5JCWA 2JSZA 5IO2A 2G2QA 3IRAA 1XWAA 3DMLA 2HNLA 2YN1A 2V6KA 5ECSA 1XW6A 2V6OA 4GF0A 5JWRB 2XC2A 1Z6MA 5D73A 3BBYA 5E4WA 4FYBA 3GL3A 2K8SA 4IBPA 4WF4A 5ECIB 2DJJA 3UVTA 1KEBA 5DJMA 3UBKA 1YEXA 4ML6A 17GSA 1QGVA 3GX8A 1NW2A 2KP1A 4QL9A 3DD3A 3ZIVA 1DE1A 1GRXA 3HVSA 3EYTA 5ENUA 2X8HA 2DIYA 5B8AA 1O6JA 2RLIA 4N11A 3GUSA 1FAAA 1Z9HA 1FVJA 4HQZA 3H79A 3AY8A 4ECCA 3WGEA 2KUCA 1ZMAA 3VWVA 2KLXA 2HRNA 2PGTA 3C71A 1PX7A 4BL7A 4ZL8A 2CQ9A 5KN2A 4TR3A 1Z7PA 2B6MA 2GSTA 3UOMA 5HFKA 3CXGA 4F0CA 1XFLA 1Q4JA 3APQA 3LJRA 4XS4A 3HKRA 2R2JA 1VF1A 4DSSA 5J9CA 1ERWA 4YQMA 5FT3A 5DAKA 2RUEA 4OWYA 1ILOA 1TRVA 2OJLA 5IMCA 3QOUA 4EKZA 4CDOA 4K2DA 5CAXA 1EWXA 3NIVA 2VCXA 4ULXA 1Z3EA 2VO4A 4ZIJA 4KUNA 3D5JA 2NPBA 5DQYA 5LCZA 3TJKA 4N10A 1HD2A 3BOAA 4DSRA 5HR0A 4D73B 2HSYA 2LEGA 3GKNA 2H73A 1K0NA 3KZQA 2PN8A 1R7HA 4HU7A 2WDUA 3WGDA 2CT6A 2LUSA 1HNBA 3D4TA 4V2NA 4TN8A 3ED3A 1EOGA 4MF5A 3D21A 1K0AA 5DDLA 1S3CA 2H0GA 4O5RA 5IMDA 3KXOA 1EEMA 20GSA 1VRSD 1TRWA 4IQ1A 3BD2A 2E0QA 2VL9A 3H8QA 5A4VA 1G7EA 5ECKB 3RHBA 2K18A 2A2RA 3E0UA 5G31A 3I9V2 4X1UA 3HZ8A 2RUFA 2GGTA 2L4CA 3P8WA 1G6YA 1A2JA 1RQMA 3D4MA 5A4WA 3IR4A 3RDWA 3KTLA 2TRXA 1M0UA 3W8JA 5CREA 2V41A 4I8BA 5G1KA 3VK9A 2H6YA 1TRUA 3EINA 1GUMA 2IFQA 1OVNA 3A5WA 4PQHA 1V98A 4O92A 1EOHA 1VF2A 3CTGA 6GSUA 7GSSA 4ECJA 2C1YA 2YNXA 4WBJA 1ON4A 5COHA 4H86A 4KSOA 4MP4A 1TI1A 5JCUA 2V1MA 3ME7A 6GSWA 2C0DA 4Z7XA 4DSSB 1R5PA 2F8AA 2VLVA 16GSA 5DAKB 1SKWB 3F3RA 3GL5A 3P2AA 4LLRA 4OO4A 2H0HA 2PERA 2LNTA 1VF3A 5D9WA 4EVMA 2HE3A 2CAIA 3TB2A 1JZWA 5ECMB 1T8EB 5IMAA 3GKMA 5ECLB 2DJ0A 2LRCA 1UVZA 4K1FA 3APOA 1TK5B 4ACSA 1OKDA 2YOIA 5KN0A 4OD7A 2RIIA 1F9MA 4F0BA 3GRXA 1H75A 4GSNA 1SENA 2TIRA 1AXDA 4L5OA 2GSSA 1A2MA 1WJKA 2IWTA 4XRDA 4XRAA 1MDJA 1WPIA 3QMXA 1FVKA 2I9HA 1XOAA 4IJIA 2H70A 5JWQB 5IPHA 2YP6A 4MZBA 4ILFA 4EDYA 2LNSA 5GAND 4XIHA 2R3XA 4RI6A 1F3AA 3TJFA 4JU5A 3F3QA 3GHAA 3TRQA 4G2EA 1ZZYA 1F3BA 2AAWA 1GWCA 3FK8A 3G7YA 3I69A 2L57A 3DXBA 3NOFA 5F06A 1PGTA 5D9XA 5B6MA 2MMAA 2VM1A 3FYGA 1O8XA 4WKWA 5D9VA 3HDCA 1GP1A 1SJZA 2IMFA 4HU9A 3KMNA 5IM9A 1SJ6A 2EC4A 3GKXA 4TR1A 4O32A 4MPFA 2VM2A 1TDIA 2AHEA 2JU5A 2GSQA 2KOKA 2LSTA 4WEYA 3ZYWA 4KCAA 1RK4A 4V1Ap 3PH9A 1OE8A 5B6NA 2BJXA 1M2AA 3I43A 2IFQB 2CV4A 5HR1A 1A2LA 3MDKA 2B7JA 2YWOA 1XOBA 2FWGA 2OE1A 3FW2A 4OCEA 2HXKA 2VD1A 4HJMA 3RPPA 4K7OA 4LA1A 4EUYA 4TR4A 3FR9A 4TVEA 2LQQA 5AGYA 2P5QA 2C8UA 1MDKA 2FCHA 2REMA 3IK7A 4G19A 2EIQA 1XVWA 2GSRA 1SK1A 3LORA 2C0EA 3UL3A 1XPVA 4FYUA 1OE7A 2L5LA 2CA8A 5GSTA 4G9HA 2VL3A 4N0ZA 3GMFA 3L9SA 1GSYA 2GZYA 1NSWA 4I2TA 4F9ZA 1O73A 4MCUA 4ID0A 2B5YA 2YZUA 2GZZA 1N2AA 1VGLA 2VUPA 1MEKA 4ISDA 3VPQA 2H1BA 3N5OA 2H72A 4V1Ag 1OAZA 2I1UA 1FO5A 3FEUA 3FZ4A 3EC3A 3ZL5A 3K8NA 3RHCA 1LJRA 3VI7A 5CRWA 3VWXA 2PBJA 2WGRA 1WWJA 2LRNA 3MAKA 2YV7A 2VD0A 1ZOFA 1F2EA 1BEDA 2C4JA 3W6GA 2JZTA 2FUG2 4EF0A 2IMKA 5EY6A 3IXRA 2FA8A 3ZTLA 3HHVA 2DMMA 3CSIA 1YF0A 3ZMLA 5B8BA 3E9JB 4POLA 5CRHA 3F4RA 3FY7A 2MMOA 2OE3A 3GSTA 3HVVA 2DBCA 6GSYA 3IHQA 2B3SA 5C04A 4KW6A 4YH2A 5JCGA 1AAZA 2MMNA 4NXIA 3LQ7A 1U3AA 2QKEA 2R5GA 1WP0A 2MMZA 1MD3A 1Q98A 1MD4A 2JZRA 4I2UA 2L59A 3HYPA 5J41A 4FO5A 2E7PA 2DC5A 3GYKA 5DBQA 3KGKA 1OC9A 3GKKA 3TDGA 2O87A 4TR1B 1WOUA 4Q5NA 1OC3A 2E2MA 3VWWA 4BVYA 5EL8A 4HJ2A 1Z7RA 4E8HA 1PQNA 5F0GA 2HRFA 4MDCA 1XIYA 4ZB6A 6GSVA 1B9YC 6GSTA 4LL4B 5CP1A 1X9MB 1G0TA 3ZIJA 3ZITA 2CX3A 5D8IA 1W89A 5J4UA 4HZ2A 3KH9A 2M72A 4KH7A 1QXHA 1ZCPA 2GZPA 2H6ZA 2ON5A 4RQXA 4ZBAA 3L0HA 2O89A 1TI3A 2BMXA 3H1NA 2WFCA 3HCZA 4QL7A 1ML6A 2HI7A 3FRCA 2FWFA 4ZL7A 1GSEA 2P0GA 10GSA 5ECNB 3VWUA 3L78A 4DSQA 3DVXA 3F6FA 1YKCA 4JZQA 3C8EA 3WT1A 2H74A 4GLTA 5AIXA 1LBKA 4NWYA 3RBTA 2L5OA 3GH9A 2B5EA 3CSJA 3EMPA 3KD0A 2GQMA 4PQ1A 3ZREA 4FIWA 1VF4A 5DVBA 4IELA 4KAEA 4YAPA 1PL1A 2JACA 1KTEA 4K7NA 2RM5A 1TRSA 1K3LA 4NHWA 2FHEA 19GSA 1XBSA 3ZMKA 1Z6NA 1MDIA 4L0UA 1TKDB 2YWMA 1NHOA 5IIZA 3PGTA 5ECQB 4OFMA 4F03A 3TJJA 3WD6A 3MSZA 1UC7A 3CBUA 2PWJA 3QAVA 3GIXA 2FD3A 1BX9A 4PNGA 1SD9A 1WIKA 3ZLPA 3IPZA 2MYGA 1M9BA 1E2YA 1U3IA 1R5AA 3UVHA 3KH7A 2N5BA 3D0ZA 3EMXA 1GUHA 2MZCA 1OC9B 2F51A 1YJ6A 3NZNA 3Q19A 5J5NA 2BTOT 1ERTA 5G1LA 3FR3A 2YWIA 3L4NA 3CTFA 4OO5A 5KN3A 5CNWA 2G0FA 6GSSA 1HNCA 1UN2A 3W8SA 4ZB8A 4G10A 3PR8A 4AJ6A 1T4ZA 5JWOB 1C72A 3SBCA 3VFIA 2XPDA 4EE0A 5F07A 1X9SB 3TGZA 1YY7A 1YZXA 2H76A 2CAQA 2I3YA 4LMWA 3UMAA 4MZWA 4GCIA 3GTUA 3J7Yb 1SK0A 3FZ9A 2GTUA 4N0VA 5G5EA 2HT9A 3APSA 2EIOA 2QGVA 3ZZXA 1BAYA 4NV2A 3HY2A 3LG6A 3A2VA 4EO3A 4J2FA 4GWRA 4V2LA 2QC7A 3DEXA 4GQCA 2CVKA 2WB9A 2IMIA 3ISOA 1FB6A 4GQFA 2K6VA 1K3YA 4HOJA 4MH2A 4POBA 1GNWA 3IAM2 3G7JA 4IVFA 3J7Yk 1IYHA 2C0FA 3KIJA 3TJGA 5IQYA 4NPBA 5CRDA 2M46A 1JHBA 3UARA 4GSSA 4POKA 4XS4B 1XWCA 1O85A 1TW9A 2IMDA 2ALBA 3EWLA 3BJ5A 2KP2A 2JZSA 5DCHA 5ID2A 5EVOA 3KCMA 2Z9SA 3LXZA 2IJYA 2LJAA 1QK8A 2DSAA 3HXSA 4ZBDA 1N8JA 4K0GA 4EC0A 2N5AA 2VCWA 1TJDA 4AJ8A 1GULA 3LSZA 3DKSA 1J9BA 2YJ7A 2NDOA 1JLWA 2DJ3A 1QFNA 2B1LA 1QMVA 1GTBA 2V2GA 3CYNA 1M99A 2WS2A 1THXA 1ZYEA 3WYWA 4X43A 4TRXA 5IPGA 1GTIA 2VLTA 4YQVA 1A24A 5DCGA 2OADA 4V2MA 5F05A 2L4QA 1T4YA 1SKRB 2ES7A 2F8FA 1TK8B 3O76A 5AIVA 1GTUA 2WCIA 3TJBA 3F0IA 2OE0A 5KEJA 4KSMA 4K8MA 5D93A 3UBLA 3DVWA 1URMA 3RPNA 3TRXA 2VCZA 1GSDA 1A8LA 1WMJA 4TXVA 1GSFA 2NTOA 2P31A 5DJLA 2GLRA 2YPMA 1OC8A 4CHSA 1EV4A 4ECBA 2VL2C 1I9DA 3ERWA 2LS5A 1XWGA 4WR5A 1ZL9A 1YKAA 2AV4A 2B7KA 3R2QA 3TKPA 3DRNA 2LQOA 2FNOA 1NHYA 2H6XA 4PNFA 2TRCP 5GAPD 3Q6OA 1O81A 1R26A 4KDUA 3TKSE 5HQPA 2XBQA 1BJXA 2V32A 1TOFA 2OA7A 2L6CA 1SKSB 3HZ4A 3Q74A 3TKRA 2C80A 1USBA 1AQXA 3LYPA 4HI7A 1TK0B 4MJAA 3UEMA 4GRFA 1G6WA 2OBIA 2H01A 2FY6A 4RUVA 5LNKe 4WETA 1BG5A 4MABA 1T3BA 1GSSA 13GSA 1YDKA 2I81A 1PN9A 5IOWA 3PINA 3ZVJA 3M8NA 1A8YA 2F9SA 3F4TA 3MNGA 1B48A 3CRTA 1ERUA 4NV5A 2AYTA 2FWEA 5ID2B 5A5KA 2HLSA 4FYCA 2R37A 4TXOA 5A4UA 3TOTA 1V9WA 1F6MC 3C7MA 3FHKA 1K3OA 1DBYA 3F6DA 3H4KA 3TKSC 1SL1B 3CRUA 4XS6A 1JZOA 3KJYA 3KTBA 4Q5FA 3IAS2 3G7IA 2C3QA 2YWNA 5DALA 12GSA 4CW9A 5HR3A 4ML1A 4ZBBA 4MJBA 4OFTA 2E2GA 5HFIA 1T00A 4ZL9A 4FH8A 3M9JA 4IP6A 1DE2A 3ZFBA 3F4SA 1WRYA 1M2BA 5FWGA 2J23A 2VL2A 4MH3A 2AB6A 2H1DA 3KP9A 1TU8A 4JR4A 3O6TA 2DMLA 2VCTA 4KGIA 4MF7A 1SL2B 2RM6A 4HQSA 1PKZA 4Q5QA 3QAGA 1SYXA 1GSQA 4E8EA 3P90A 2OBKA 4DVCA 2L6DA 3A2XA 2PMTA 2MBSA 1GNEA 4KDXA 4TOPA 1T1VA 1PL2A 5ABRA 2K9FA 2CX4A 4O7HA 3LFLA 2EIRA 5INYA 4PURA 2PVOC 5D9TA 1PMTA 1LU4A 3QR6A 4K0NA 5H5RA 4WF5A 1B8XA 2YJHA 5G2ZA 3C1SA 1O8WA 5H5QA 5J9BA 1EGOA 3OR5A 4EL1A 3QCPA 4EXJA 3GA4A 3HVXA 4N30A 2PVQA 4IP1A 2DIZA 1EP7A 4IW9A 4HUAA 4YAVA 2DLXA 3RAZA 2D2ZA 2FGXA 3HD5A 3FZ5A 1OYJA 5E59A 4TXOB 3M0FA 4L8EA 3WGXA 3GN3A 4WBRD 3QDNA 5ELGA 3QFBC 2N5FA 1BQ7A 3QAWA 4KB3A 3ERGA 3ERFA 2IL3A 1XW9A 2ZUPA 3TKSA 2B1KA 2YCDA 4X0XA 4IJ3A 3IE3A 1M9AA 4TR0A 3N9JA 4DEJA 4PQIA 3A3TA 2LRTA 2CZ2A 1PX6A 5DALB 1V58A 1FB0A 2VLUA 1V2AA 1SD8A 2JL4A 4Q5RA 2LTKA 4HDEA 4F2IA 1ERVA 4NHZA 1AUCA 9GSSA 1O7UA 3D22A 1HQOA 1H4OA 1CQHA 1BYEA 3DGQA 3LEFA 1EEJA 1ZYQB 5H5SA 1AC1A 4LMVA 5ECRB 1R4WA 1M2DA 3M3MA 5CO3A 2HZFA 1ZGNA 3VI5A 4IS0A 1XW5A 3KM6A 2HZEA 4ZILA 2X8GA 1W4VA 2DJKA 4K6XA 3WT2A 2R6KA 3IA1A 1FHEA 1SU9A 5IOXA 3FZAA 1M7TA 3EE2A 2KHPA 3I6AA 1G7OA 5FHIA 2H0IA 3EU4A 2ZNMA 3HJOA 3L9VA 1MTCA 2J9HA 2VOCA 1SK2A 1AIUA 4NAXA 1EGRA 1THOA 1A0RP 4NMUA 1F37A 1SYRA 4ZXGA 1TP9A 3JCML 4OFNA 2GQLA 2PPTA 1PD21 1GSUA 2H75A 3G9BA 1YF1A 2H1GA 2PU9C 1I5GA 4MZCA 2NVLA 3GFKA 4P3YB 3TOUA 4HZ4A 2LJRA 1X0RA 4KCEA 3DWVA 1X9WB 2AJQB 3VURA 2LJKA 2YZHA 1HNAA 8GSSA 1J0FA 4JRRA 2O7KA 4MMMA 2JADA 5D96A 5HR2A 5ECHB 4L0WA 4PX1A 4QQ7A 1AQWA 5F8BA 3LXTA 4TKYA 4BPYA 5J3RA 2VIMA 3BCIA 2VCQA 3KEBA 2CVBA 4J56E 2XPEA 2OKAA 1GH2A 2XHFA 4JBBA 3TKQA 5IMZA 5GSSA 5CRGA 4ZB9A 3ME8A 3GX0A 1TU7A 3MWHA 1PSQA 2M80A 4MA9A 4GSTA 5ELAA 5EPFA 1ACVA 3SWLA 3F8UA 4BWSA 4BVXA 4RI7A 2WULA 3CMIA 3C73A 2NBSA 1JLVA 4RQRA 4F82A 3D6IA 1QUWA 4KA0A 1S3DA 1GUKA 4WXTA 1K0OA 5C00A 4HEA2 2FA4A 2WZ9A 1B4QA 4KX4A 3P7XA 2IN3A 4MJEA 1IYIA 3S9FA 1FG4A 4OCFA 1DUGA 11GSA 2GQKA 2A4VA 3US3A 2C3NA 3C1RA 1OKTA 3LWAA 1XZOA 4BWQA 5HFGA 1ST9A 3EU3A 4PXOA 4XS1A 4IN0A 4XTSA 3GH6A 1U6TA 4PUAA 5LD0A 3IBHA 4KDYA 3VPTA 3TUEA 2HYXA 4GXZA 2WJUA 4PGTA 2HZEB 1K0BA 4GTUA 1EP8A 2PUKC 1Y25A 1XVQA 3DIEA 4I97A 3Q18A 1TTZA 4I5QA 1U88A 2X64A 4YQUA 2DJ1A 5L71A 3IDVA 4KE3A 1GLQA 2IIYA 4MLYA 4K9ZA 2O85A 4JE1A 3KP8A 2C0GA 3U6VA 4POMA 2GT5A 1GTAA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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