1FOVA

Glutaredoxin 3 from escherichia coli in the fully oxidized form
Total Genus 26
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
26
sequence length
82
structure length
82
Chain Sequence
ANVEIYTKETCPYCHRAKALLSSKGVSFQELPIDGNAAKREEMIKRSGRTTVPQIFIDAQHIGGYDDLYALDARGGLDPLLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title NMR structure of oxidized glutaredoxin 3 from Escherichia coli.
pubmed doi rcsb
molecule tags Electron transport
source organism Escherichia coli
molecule keywords GLUTAREDOXIN 3
total genus 26
structure length 82
sequence length 82
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-08-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1fovA00
4TR3A 4F82A 1XVQA 17GSA 3LFLA 1OE8A 5EY6A 2YWNA 6GSYA 1TU7A 2FWFA 1ZMAA 3ZVJD 5IOWA 2WJUA 1ERWA 1OVNA 3G9BA 1V98A 4HOJA 2YPMA 3L78A 2PMTA 4OD7A 4IS0A 2CT6A 3KJYA 5ID2A 2H71A 2FGXA 5CRDA 2GDRA 2FUG2 5HR1A 3D22A 5HQPA 5H5SA 3NOFA 3DKSA 4YAPA 1Y6EA 1B8XA 1WP0A 5CREA 1GUHA 4KDXA 5GAND 3VWVA 4TXOA 5J4UA 2B5XA 4NAXA 1T1VA 5JCWA 1ILOA 1AC1A 2GZZA 1ML6A 5IOXA 1XPVA 3LWAA 4PNFA 2HZEB 4TN8A 2KP1A 1UC7A 1MDJA 3DMLA 4AJ7A 4IELA 5ECOB 2CX3A 2R6KA 3GURA 4V2LA 4ZILA 5J41A 9GSSA 3HHVA 1MDIA 2OADA 1SK2A 3FW2A 5F8BA 3QDNA 3FKFA 4ZB9A 2LRTA 5DJMA 2PU9C 3IK9A 3M1GA 3QCPA 4CW9A 1EGOA 3O76A 3ZYWA 5DQYA 3FZAA 3W8SA 4WBJA 4HJMA 1K0CA 2YZUA 4JRRA 4D73A 3H1NA 1G7OA 5IMFA 2B3SA 1CQGA 3TDGA 2GGTA 3O3TA 4G19A 2ZUPA 13GSA 2F51A 3IK7A 2CX4A 5INYA 2QSIA 4NMUA 5AGYA 2AJQB 2K9FA 1G6YA 1S3AA 1K0AA 3ZLPA 2B1KA 3M8NA 2N5AA 2TIRA 4KSMA 1J08A 5GAPD 4BPYA 4ZB6A 3TKRA 1BQ7A 2DMMA 2IMIA 3CSJA 2QC7A 5ECSA 1XCCA 2DMLA 2F8AA 4HQSA 3OR5A 3KMOA 5C04A 2KP2A 3HZ4A 2C80A 4XHMA 4BL7A 2LUSA 1K3YA 1W4VA 1XWAA 2OE0A 2JL4A 5AISA 4TR1A 2GVPA 2WFCA 3LGCA 1SJIA 1WE0A 1SYXA 1BX9A 3CXGA 5D8IA 1VF2A 3Q74A 1AQVA 3UJ1A 3SWLA 3GKMA 5G1LA 1SKWB 2LTKA 4I2UA 3UARA 3I9V2 4HJ2A 4LMWA 1R5PA 4OFTA 1GTUA 4EDYA 3ME8A 3SBCA 3VI7A 2H6ZA 1Z5YE 3CSIA 1YKAA 1SYRA 4NHWA 3ZMKA 3VI5A 2YWOA 4J57E 1OC8A 1I5GA 2GQKA 1GH2A 4X1UA 3QFAC 2CZ3A 1JZRA 3LYPA 3ZRDA 4KAEA 3MSZA 2VLUA 1KTEA 2FNOA 4L8EA 1OAZA 3P2AA 2GZYA 1BEDA 1PQNA 2AAWA 2P0GA 5ABRA 5B8AA 4GCIA 2YANA 3QPMA 4ULXA 1XXUA 3QAVA 1QMVA 5FT3A 4WF5A 4IQ1A 4QL9A 1AW9A 4ML6A 3WGDA 2N5FA 4EF0A 1XWBA 4YQMA 1Y25A 4MJEA 1TI3A 5B7CA 1YZXA 5AN1A 1U88A 1A2MA 4MJCA 11GSA 4O5RA 3P7XA 2RM6A 4PUFC 1WIKA 2H8LA 2YWMA 1M99A 3EC3A 4IQAA 1GSFA 5J9CA 1KBNA 5EL8A 3H93A 4ID0A 5CP1A 1LBKA 5DAKA 2WDUA 4ACSA 2VUPA 3HCZA 1XWGA 1GTBA 3GFKA 8GSSA 2VO4A 4MLYA 1EOHA 1OYJA 1K0DA 4PQ1A 2WZ9A 2PN8A 2V2GA 2LJRA 1THXA 3QAWA 2P5QA 3TKSE 1DBYA 3M9JA 3VK9A 4POKA 2GQMA 1G7EA 4K0NA 4MH2A 1A2JA 2FA8A 1ZZYA 5D9WA 5A5KA 3ZMLA 2JSYA 3MAKA 1PGTA 2IMKA 1E2YA 2HRNA 3DYRA 3VWWA 3UIWA 3F3QA 1V2AA 3F6DA 4HU7A 3GH6A 3IV4A 4PXOA 1GNEA 3EINA 3KTLA 1TRVA 1XOAA 5ID2B 1O73A 4IJIA 4MZWA 5JCGA 2RLIA 1FB6A 4ECIA 1UA5A 4HQZA 4O32A 2IFQB 2H66A 4HI7A 1A0RP 3G7YA 2FWHA 4PUAA 2L4CA 3GX8A 3J7Yb 1T4YA 4HU9A 2GLRA 1TRWA 1V9WA 4TXOB 4O7HA 5IQYA 1T8EB 2CZ2A 2J9HA 4Q5FA 4L0WA 3QD9A 3DGQA 6GSXA 4TR4A 2FWEA 5JWRB 1ERVA 6GSVA 3DEXA 4NPBA 2PUKC 5DDLA 4EXJA 3DD3A 5ECKB 2MMOA 4KX4A 2OJLA 4YQUA 1PN9A 2ES7A 4MK3A 4DSQA 2FWGA 4XCSA 3PINA 1FO5A 1NSWA 1GTIA 4MF6A 3EMXA 3IRAA 3HA9A 2MBSA 2IJYA 3H4KA 1THOA 3ERWA 2ON7A 3TCOA 2I4AA 3HD5A 4CHSA 3GUSA 4D73B 4KDUA 1X5DA 1PKWA 2C0EA 1GULA 1SKRB 3PR8A 1XIYA 1O8WA 3A2XA 4PQHA 4MZBA 6GSWA 3TKSC 1M2AA 2QKEA 2VCZA 1EEJA 2G0FA 2AB6A 3FY7A 1NHOA 3IE3A 5ECPB 3UBKA 1QXHA 4IP1A 5B6MA 1E6BA 4YH2A 4POMA 2KHPA 1J9BA 2L5LA 1GSDA 3KIJA 1ZGNA 3F4RA 2L6DA 4K7NA 4X0XA 5F07A 5IO2A 2MMNA 1PKZA 1GSSA 3TB2A 2X99A 4KNDA 5G2ZA 5J5NA 3IR4A 4Q5NA 5CRGA 4LL1B 2YV7A 2HRFA 2PWJA 2L6CA 1ZYEA 3GL5A 4GRFA 4HDEA 2CV4A 4L5LA 2H0IA 3EWLA 2E0QA 1R7HA 1B9YC 3CRTA 5IMDA 4TR1B 2C0DA 2TRXA 3TKSA 1VF4A 5D9TA 4I6XA 3L9UA 4LLRA 4P3YB 2XHFA 3GX0A 3FYGA 2VCQA 4ZB8A 1BG5A 3L9VA 2RIIA 1TK8B 3BJ5A 20GSA 2VOCA 3A5WA 3MDKA 3LXZA 5E59A 1FVKA 5EPFA 4JEDA 1QQ2A 3EE2A 4GTUA 1M7TA 1T7PB 5B8BA 5DBQA 5ECMB 1WRYA 5CNWA 3RPNA 1JZDA 1B9XC 1XWCA 1Z6MA 1H4OA 5E4WA 5HFKA 4FO5A 2HSHA 1NM3A 2IFQA 1SU9A 3FR3A 4K7IA 3LXTA 2V6OA 1TW9A 1JLWA 2GZPA 3KXOA 2R3XA 2FD3A 4FIWA 1GSEA 1RQMA 3E3EA 1OE7A 2LJKA 3EMPA 2MYGA 4G2EA 2GQLA 4XS4A 1X9WB 2J23A 5HR2A 3WT2A 3F0IA 1FAAA 2LJAA 3RDWA 1J0FA 2C1YA 3E0UA 3TOUA 3EURA 1YQ1A 5DAKB 1TJDA 3IXRA 1OC9A 3TGZA 4OO5A 5LD0A 3ME7A 2OA7A 2A2SA 2FHEA 1GUMA 2B6MA 4K9ZA 3QR6A 2LNSA 2F8FA 3HDCA 1AQXA 1SL2B 1QK8A 1LJRA 3MWHA 1TRSA 4E8HA 1URMA 2OBIA 1F3BA 4KCAA 1TI1A 4F0CA 3M3MA 4MMMA 1Z7RA 2HXKA 3RPPA 1JZOA 3GH9A 4NV5A 1V40A 4TKYA 3GNJA 4EC0A 1K0BA 4GSSA 2G2QA 5IM9A 2HE3A 18GSA 3CTGA 3A3TA 2XBIA 3A2WA 2KLXA 3QOUA 4OCEA 4WR4A 2HFDA 2B5EA 2I81A 2A2RA 1ST9A 12GSA 1BYEA 3CBUA 5KN1A 4JU5A 1S3CA 3TKPA 2F3MA 4MF7A 1WMJA 4GSTA 1X5CA 2DLXA 5CRHA 2LV3A 1TRUA 3F4SA 3KH9A 4F0BA 4GQCA 1FW1A 3LSZA 4V2MA 2K6VA 4RQXA 1AAZA 3GV1A 4HUAA 3CSHA 1PRXA 3BCIA 3ZREA 2IIYA 1X0RA 3FK8A 5G1KA 1TKDB 3DRNA 2YZHA 3D6IA 3F63A 3HVXA 3VPQA 1R4WA 3F9UA 2QGVA 1LU4A 4ZIJA 4E8EA 2CAIA 2V1MA 3E9JB 2IMDA 4DSSA 3PGTA 1PA3A 1FVJA 2H30A 3HJOA 4AJ8A 4XIHA 4ZXGA 2E2MA 4TOPA 3VLNA 1M9AA 4RQRA 1JFUA 4N0VA 1UN2A 3GKNA 2PBJA 4ECCA 5HR3A 1M9BA 3WGXA 1TP9A 2BJXA 5J3RA 4KA0A 2VM2A 1R26A 3KH7A 1QGVA 3F8UA 4IP6A 2LQQA 4BVYA 2YJHA 3CTFA 5LNKe 4MCUA 3LQ7A 2VL2C 1V58A 1SD9A 2WGRA 4EVMA 1PL1A 4J56E 2BTOT 2L59A 5B6NA 1HNCA 2LQOA 2P5RA 4HZ2A 1ERTA 1AUCA 4IKHA 4O92A 3DVWA 2DBCA 4IGJA 3WT1A 4GXZA 22GSA 3KGKA 4FYUA 1XFLA 4KUNA 5G31A 2H19A 1FHEA 4HZ4A 2CA8A 1B4QA 4OMVA 4XTSA 2H70A 3K8NA 2V6KA 4I8BA 3EVIA 5D93A 4MJAA 2EC4A 3ZL5A 1YEPA 1KNGA 3TRXA 2CVBA 5HFIA 4MDCA 4KB3A 1YEXA 1R5AA 4BWSA 1TTZA 2H6YA 1DSBA 1DUGA 2GSRA 2VCXA 2LNTA 4ZBAA 4N30A 1TOFA 6GSSA 1Q4JA 2NTOA 2GSTA 4POLA 3WYWA 3APQA 1X5EA 1SD8A 4OCFA 5ECQB 2H1AA 4POBA 5IPHA 2X8GA 2C3TA 2VL2A 4GLTA 4PGTA 3HJMA 4XS1A 2M46A 3M0FA 4NV2A 1A2LA 2MZCA 3D0ZA 3APOA 4YQVA 5ECHB 5L71A 5F0GA 5HR0A 1XWKA 3VWUA 4TW5A 2VD0A 1DE1A 4WEYA 1TK5B 4JE1A 1M2BA 1CQHA 1UVZA 4JR4A 5IO0A 3FHKA 1GSUA 3MNGA 4DVCA 4XS4B 1W89A 1EV4A 4IN0A 4PX1A 4XS6A 3ISOA 2HYXA 4V2NA 2IWTA 1GL8A 5KN2A 4CDOA 1YF0A 2X64A 1C72A 2E2GA 3IHQA 2B5YA 2VLTA 1F6MC 1GNWA 4MJBA 1OC9B 3EU4A 3UAPA 1F3AA 2IN3A 3HJPA 4WR5A 5A4VA 3PH9A 2OE3A 5GSTA 1WJKA 3KD0A 3RHBA 4N10A 4WKWA 1AXDA 2I1UA 4BA7A 4IVFA 1MDKA 3UVTA 2VLVA 4OWYA 3FRCA 3M9KA 4IHUA 2H1GA 2MBTA 3IBHA 3GRXA 1WWJA 5KEJA 3H79A 5D73A 5IMZA 2ZNMA 2GSSA 1M0UA 1RW1A 4Q5RA 2C8UA 2YCDA 2YP6A 1SL0B 1G6WA 2R2JA 4IBPA 1KEBA 3DVXA 5C00A 4KE3A 4WETA 2K18A 5ECRB 1OKDA 1ABAA 3ZTLA 1ZL9A 1YKCA 1EP8A 5ELGA 3AY8A 4NWYA 5H5QA 1PMTA 2AUVA 1JZWA 2DIYA 1Z3EA 1MEKA 3P90A 2JACA 3GTUA 3LORA 2PPTA 4EO3A 2R5GA 3VPTA 2LS5A 1NHYA 5G5FA 4AGSA 4ZL7A 4QQ7A 3EU3A 4EKZA 1YJ6A 1YY7A 2H72A 5KN3A 1PX7A 2LSTA 4V1Ap 4MZCA 3HVVA 1ZOFA 2GS3A 1O8XA 2B1LA 1XBSA 6GSTA 4V1Ag 1SJZA 4H86A 4FH8A 4PQIA 4DSSB 2EIQA 3ZFLA 1T3BA 2L4QA 4ZBBA 4K1FA 2ZCTA 3GIXA 1MD3A 2L5OA 2FCHA 2O87A 2DJ0A 3U6VA 3ZIJA 5CYYA 3IC4A 2VL3A 2HI7A 4RI7A 5F06A 3FR9A 3UBLA 4KSOA 1TU8A 2VCVA 1MTCA 2A4VA 2AHEA 1Z6NA 3I6AA 19GSA 1ON4A 1VF3A 3HZ8A 4NXIA 2WCIA 2PERA 4KGIA 4F2IA 2DJ1A 4F9ZA 2DJ2A 2O7KA 5DALB 4JR6A 1PX6A 4WBRD 5CAXA 3KEBA 2HLSA 5IPGA 2JADA 2RUEA 4HEA2 4X43A 5D9VA 14GSA 1A8YA 3D4MA 2XPDA 2OACA 4K2DA 3IAM2 10GSA 3ZFBA 2ON5A 3C71A 3KTBA 4K8MA 3CRUA 1XW5A 3WD6A 4F03A 4MF5A 2O8VB 1HNBA 1O85A 1XZOA 2BMXA 3QFBC 3GSSA 3G7JA 2OE1A 5IMVA 5G5EA 3RHCA 1BJXA 2VM1A 2X8HA 3BBYA 4NHZA 2R4VA 2FLSA 5AIXA 2CVKA 3ZVJA 1V57A 1DE2A 3U5RE 4N11A 1XVWA 2IL3A 2C0FA 1JLVA 1EOGA 1WPIA 1XW6A 3NZNA 3GMFA 2REMA 1N2AA 3TJKA 3KCMA 4TRXA 3D21A 3C1SA 4K0GA 2KOKA 3BCKA 5HFGA 1X9SB 5GSSA 1PL2A 1YDKA 2H74A 3TJFA 1VGLA 1HQOA 3Q19A 2OBKA 2JU5A 2DC5A 4ISDA 3C8EA 3W6GA 2K8VA 3TRPA 3TJJA 2KUCA 2ALBA 2MMZA 5DCHA 1G0TA 3H8QA 3R2QA 2LRCA 2E7PA 3S9FA 3TUEA 3A2VA 4XRDA 1GUKA 4GQFA 2OKAA 3QMXA 1U87A 4ILFA 5D96A 2NBSA 4EL1A 4KH7A 2PGTA 3GKKA 2N5BA 1ERUA 2IMEA 3UL3A 2MMAA 4LMVA 2DJJA 1T4ZA 2DIZA 2XBQA 4L5OA 3IA1A 4K7OA 1EP7A 1M2DA 2B7KA 1GWCA 2NDOA 3L4NA 1O6JA 2H76A 2V32A 3GL3A 1IYHA 3TKQA 3KMNA 2F9SA 5DQSA 3EYTA 1O7UA 3IDVA 1GLQA 4TVEA 5ECNB 2M72A 3RBTA 3KP8A 2L57A 4OO4A 1GLPA 3TJBA 2LKUA 4HS1A 2WULA 2CQ9A 3FZ4A 4EE0A 2I3YA 2H01A 2WB9A 2PVOC 2HT9A 2H0GA 3KP9A 1YF1A 4MPGA 1HD2A 4WXTA 2YNXA 4J2FA 4IW9A 2DSAA 3WGEA 2VCWA 2AYTA 1B48A 2VAFA 5COHA 2WS2A 1TDIA 4EDZA 2R37A 2YN1A 4BVXA 3CMIA 4G9HA 2IPAA 2DJ3A 1GRXA 1HYUA 4GF0A 1Z7PA 6GSUA 5IIZA 2YOIA 5ENUA 1S3DA 5CRWA 4N0ZA 3Q6OA 4Q5QA 2VD1A 5H5RA 4FYCA 4ML1A 3GHAA 1A23A 3DXBA 5DALA 1Z9HA 2O85A 2YV9A 3VURA 4MABA 5A4WA 3I43A 3Q18A 2HSYA 3GYKA 2P31A 3HKRA 3GTUB 3UOMA 1X9MB 1ZYQB 3US3A 2GT6A 4GSNA 3C73A 3W8JA 2V41A 1U3AA 3NIVA 2HZEA 4K6XA 1NW2A 1SL1B 3F4TA 5AIVA 3V1WA 3ERFA 1AIUA 1BAYA 4AF2A 1GTAA 5IMAA 2C3QA 3HVSA 1USBA 1RK4A 4OFMA 2FA4A 4ZL9A 1SKSB 5KN0A 3GA4A 2DJKA 4TR0A 1I9DA 2H75A 2RM5A 3UVHA 5IMCA 1EWXA 2JZTA 5EVOA 1TK0B 4PURA 2JZRA 4LL4B 3DIEA 3TOTA 4JZQA 2JZSA 1VF1A 1QUWA 3CYNA 3N9JA 3JCML 4WF4A 4XRAA 1N8JA 2K8SA 1PD21 3VFIA 4MH3A 1T00A 5A4UA 3D4TA 2HZFA 5FHIA 7GSSA 2I9HA 2CAQA 1K3LA 5DVBA 3GKXA 3C7MA 1F37A 2VL9A 1FG4A 4ECJA 2GSQA 1TXXA 1EGRA 4ZBDA 3GN3A 3VWXA 1XW9A 3TJGA 5FWGA 1QFNA 4I2TA 1GSQA 2IMFA 2TRCP 2XPEA 4BWQA 1EEMA 5ECLB 4PNGA 1A8LA 3LEFA 3O6TA 3KM6A 2WRTA 4I5QA 3C1RA 4YAVA 3DWVA 5DCGA 3G7IA 1FOVA 2H73A 3HY2A 3FR6A 1B4PA 2C3NA 3ZITA 5G30A 1SK0A 1A24A 2LEGA 3J7Yk 1K3OA 4TXVA 3KZQA 1SENA 2YJ7A 1ACVA 1EV9A 2JSZA 4AJ6A 3BD2A 3D5JA 5JWOB 4MPFA 5ELAA 3L0HA 2C4JA 3TRQA 1Q98A 2YWIA 4LA1A 1SJ6A 1MD4A 5F05A 2XC2A 3FZ5A 4KCEA 4KW6A 5D9XA 4MA9A 3LG6A 3ED3A 1HNAA 3IAS2 3HYPA 5JCUA 4Z7XA 4QL7A 2Z9SA 2EIRA 2FY6A 5LCZA 1GSYA 2H6XA 1PSQA 3N5OA 3ZZXA 2PVQA 2H1BA 2HNLA 2VIMA 3RAZA 1O81A 2B7JA 3UMAA 3LYKA 5CO3A 3LJRA 5GZZB 5JWQB 3I69A 2NPBA 4MP4A 2H0HA 1XOBA 1K0OA 1WOUA 2C0GA 2LRNA 1A0FA 1AQWA 4IJ3A 3IPZA 4L0UA 3UEMA 2VCTA 3P8WA 1OKTA 3GSTA 3ZIVA 2X8CA 4JBBA 1K0MA 3APSA 1U6TA 4EUYA 1IYIA 4DSRA 2CVDA 5J9BA 3QAGA 1FB0A 2GTUA 2D2ZA 1U3IA 2M80A 4ECBA 1EZKA 1GP1A 2O89A 2NVLA 4I97A 1JHBA 3L9SA 1F2EA 2RUFA 3F6FA 4KDYA 2H1DA 1SK1A 3FZ9A 3HXSA 3FEUA 1OC3A 2EIOA 4RUVA 3F3RA 5DJLA 4RI6A 1K0NA 4ZL8A 1F9MA 16GSA 1H75A 4FYBA 3IOSA 2AV4A 4G10A 5ECIB 4OFNA 4DEJA 3BOAA 4GWRA 3ERGA 2GT5A 1ZCPA 1VRSD
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite