1HD2A

Human peroxiredoxin 5
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
161
structure length
161
Chain Sequence
APIKVGDAIPAVEVFEGEPGNKVNLAELFKGKKGVLFGVPGAFTPGCSKTHLPGFVEQAEALKAKGVQVVACLSVNDAFVTGEWGRAHKAEGKVRLLADPTGAFGKETDLLLDDSLVSIFGNRRLKRFSMVVQDGIVKALNVEPDGTGLTCSLAPNIISQL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Antioxidant enzyme
molecule keywords PEROXIREDOXIN 5 RESIDUES 54-214
publication title Crystal Structure of Human Peroxiredoxin 5, a Novel Type of Mammalian Peroxiredoxin at 1.5 A Resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 46
structure length 161
sequence length 161
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2000-11-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1hd2A00
2P5RA 3I9V2 2YNXA 3LG6A 3ZVJA 1F3AA 1T3BA 3TKPA 1VRSD 2CZ2A 3F4RA 1AQWA 2VAFA 3M9KA 2X99A 4HQSA 4MH3A 3VPQA 1SU9A 5CYYA 1TP9A 1TU7A 3L9VA 2GS3A 4Z7XA 2GVPA 1UC7A 3C1RA 3ERWA 1KNGA 4WETA 3M3MA 5EL8A 2NTOA 3BOAA 1ZOFA 3ZIVA 2HE3A 4JZQA 5CRHA 5D8IA 1O81A 5J5NA 3UBLA 1B48A 3A2XA 5G2ZA 5ECOB 3ZFLA 1CQHA 4XS6A 1GSYA 4F9ZA 1T1VA 1S3CA 4NV5A 1YDKA 1EV4A 2VCQA 3RHBA 3F8UA 3Q19A 1YEPA 1GUMA 2FGXA 3ISOA 5GAND 13GSA 3HJPA 2V41A 3APSA 1X9MB 2F9SA 1PGTA 1EWXA 1EEJA 2YV7A 2I81A 1A23A 2CX3A 4YH2A 2H1GA 1XIYA 4NV2A 5HQPA 3Q6OA 3UOMA 4HJMA 2X64A 3LYKA 3UL3A 3O76A 1V98A 3BBYA 2GZZA 5DQSA 2F3MA 1XWKA 2L4CA 5DJLA 2GQLA 4MJAA 3GIXA 5DALB 5J3RA 1ABAA 3FRCA 5E4WA 1CQGA 3W8JA 1WOUA 3G7YA 3UIWA 2WGRA 3F6FA 1TRSA 1G6WA 2VD1A 1SK2A 4X0XA 1NW2A 4LMWA 2NBSA 3M1GA 4YAVA 4POKA 5C04A 4ILFA 2KP1A 1O7UA 3LSZA 1TDIA 5D96A 3EVIA 3FZ4A 2JU5A 5D9VA 2C0EA 1HNAA 1M7TA 2DMLA 4MJBA 3QDNA 4K0GA 4O7HA 4KUNA 1XOAA 1X5DA 2ES7A 4WEYA 5AGYA 4TR4A 3G7IA 2P0GA 4PNFA 5GSTA 5CO3A 2EIOA 3L0HA 3TOTA 3N9JA 3IK9A 4MJCA 4TVEA 3D5JA 4D73A 1AIUA 3FR3A 3RPNA 4LLRA 2MMZA 4G2EA 3VWWA 5IIZA 4JRRA 1Y25A 3WGDA 4WXTA 5B7CA 2LV3A 1Z6MA 2AAWA 4OO5A 2HNLA 2VL9A 3C71A 3ZLPA 2G0FA 5IO0A 4NAXA 5KN3A 2DIYA 1OE8A 4DSSB 1O73A 1X9WB 3TKSA 1OYJA 5G1KA 3GX8A 3A5WA 6GSSA 4MZCA 5IPHA 3GN3A 2QSIA 3CMIA 1XXUA 3GL5A 4XCSA 2BJXA 4NMUA 1V2AA 2CA8A 3MSZA 5B8AA 3L4NA 2E7PA 5J41A 3D0ZA 1V40A 2EC4A 2QKEA 1BYEA 2OBIA 1X0RA 3CXGA 1BQ7A 2R37A 5ID2A 3D4MA 3ZTLA 2PMTA 1O8XA 4ML6A 3US3A 3GKKA 2H19A 1SK1A 4RUVA 4YQMA 2A4VA 1KBNA 2FWGA 3F3RA 3CRUA 3UBKA 1K0CA 2DJJA 4F82A 3DVWA 2ON5A 5LD0A 2PWJA 2L5OA 1WMJA 5GAPD 2PUKC 2C4JA 1SKWB 4OMVA 2HI7A 3VK9A 3U5RE 1K0DA 3MWHA 3UAPA 4DSRA 4FYBA 2LRCA 3IRAA 4GXZA 4OFTA 5KN0A 4XIHA 3PINA 4ZL9A 1VF2A 1Q98A 2HT9A 2PU9C 3DVXA 3KXOA 1SKSB 1MDIA 2CAQA 1O6JA 4WF4A 1OKTA 1XZOA 2PN8A 2YWNA 2K8VA 3EWLA 5JWRB 3UVTA 2DMMA 4MA9A 2CAIA 1URMA 3CBUA 5IMFA 1DBYA 5G5FA 4E8EA 1FOVA 3TKSC 3GKXA 2HXKA 4MK3A 1GTAA 1GSFA 3FR6A 1NHOA 4GLTA 2O89A 3RAZA 4NPBA 5B8BA 2EIRA 2CX4A 3W6GA 3IHQA 1M2BA 2PVQA 4EC0A 10GSA 5HFIA 5ECQB 3WT2A 4ULXA 4ECIA 3KMOA 5DJMA 1MD3A 1TRVA 1YJ6A 3ZITA 1ZYQB 1J08A 4GRFA 1Z9HA 2XHFA 4J56E 3TRXA 2FA8A 1GL8A 4DSQA 19GSA 1MEKA 2X8GA 1YKCA 3CSHA 4WBRD 1SL0B 3F0IA 1A0FA 3LEFA 2DLXA 4TR1B 5G1LA 4O92A 1OC8A 1PMTA 1PA3A 2I4AA 5G5EA 3GHAA 2V1MA 3IAS2 2RLIA 6GSXA 2H6YA 2H1BA 1U88A 4OCFA 4BL7A 2JZTA 2CT6A 2WRTA 1OAZA 5L71A 1Z3EA 1XW9A 1YQ1A 2VOCA 2C1YA 5F06A 2N5FA 5CAXA 4TXOA 1GTBA 1WPIA 4IVFA 3LFLA 3G7JA 3R2QA 1GTUA 3GFKA 5H5RA 1HQOA 3LGCA 4MZBA 4LL4B 2HYXA 1K3YA 4FYCA 1W89A 3HZ8A 1GSQA 4EUYA 2CQ9A 4BWQA 1TI3A 4CHSA 2IFQB 1NHYA 3GA4A 4YQVA 1F2EA 2YOIA 3GTUA 2JSYA 2DJKA 3IR4A 4ZXGA 3GSTA 2DJ2A 5FWGA 4K2DA 3DRNA 3M8NA 2H66A 1JZDA 3CRTA 2HLSA 1KEBA 1A0RP 4Q5NA 3GYKA 1WWJA 4EKZA 2JSZA 4PQHA 3LXTA 2B6MA 1BAYA 2HSHA 4KB3A 3ME7A 5CRDA 3F4SA 1G7OA 1XCCA 1ZL9A 2C0GA 2I1UA 4KCEA 4G19A 3QCPA 5ABRA 4ZBBA 2AYTA 1F6MC 2GSSA 4O5RA 1GLQA 2FWFA 3TCOA 3ZMLA 3ERGA 1U87A 2WFCA 2B5XA 3AY8A 4ZB8A 4MH2A 2F8FA 4HUAA 4OFNA 2IMDA 1IYHA 2B5EA 1M2AA 1BEDA 4YQUA 3VWUA 4POBA 2PVOC 1K3LA 4AJ7A 1AAZA 1K0OA 2REMA 4J2FA 4I8BA 3CSJA 4IW9A 4KAEA 2CVBA 2L6DA 1SL1B 2ALBA 4ACSA 4ECBA 5LNKe 2TRCP 3HJMA 3DMLA 4ZBDA 1TTZA 3IAM2 1YY7A 1T00A 4F0CA 4K7IA 1Z6NA 2X8CA 3E9JB 1O85A 3EC3A 4KGIA 2L4QA 4LL1B 1TK8B 3RBTA 3LWAA 3OR5A 1HD2A 1PD21 1QXHA 4Q5FA 5IMZA 2C3QA 1XWAA 3QPMA 5DQYA 2YWIA 2LS5A 4TN8A 1FO5A 3I6AA 4L5LA 1HYUA 3H93A 5B6NA 3FY7A 1G0TA 2B7JA 2YWMA 3GKNA 22GSA 5HR2A 3CTGA 4ZB9A 3DWVA 1R5PA 2VL2A 3IOSA 2LNSA 2N5BA 1ZCPA 2DC5A 4HEA2 3EU4A 3HVXA 4ECJA 3H8QA 1V58A 5KEJA 1TU8A 1FVJA 4JBBA 3ZL5A 2X8HA 3P2AA 4K1FA 4WBJA 3HA9A 2H30A 1AUCA 1JZWA 1X9SB 1WJKA 1Z7PA 3KIJA 1PL2A 1KTEA 5EVOA 3VFIA 1EOGA 2GSRA 2H01A 1THXA 1USBA 1PKZA 2YV9A 5IOXA 3ME8A 2AUVA 4D73B 2YJHA 2XBQA 1FVKA 4ZL8A 1IYIA 3HVVA 3Q74A 3O3TA 2ON7A 1JHBA 1OKDA 3J7Yb 3TJFA 2I9HA 1SJ6A 4ZBAA 1R4WA 1GRXA 2NVLA 2C3TA 3GURA 1JFUA 3J7Yk 4XRDA 5F07A 3IDVA 4Q5RA 1NSWA 2C3NA 1AW9A 2PERA 2K6VA 1GSSA 1GULA 2LJAA 2K18A 2V6KA 4NHWA 2IIYA 1TJDA 2KOKA 1LBKA 3FR9A 3EMPA 5ELGA 2MMNA 3C1SA 4MMMA 2O85A 5D9TA 2GTUA 5CP1A 5IO2A 1GUKA 2R6KA 4N0ZA 4XRAA 5ID2B 3KD0A 5D93A 2YCDA 3DXBA 1QK8A 4ZL7A 1AXDA 2VM1A 4WKWA 4RI7A 1EV9A 2CV4A 1ZGNA 1YEXA 2AHEA 2VL2C 2XBIA 3IXRA 3EE2A 2A2SA 1XVWA 4TOPA 3UEMA 4PQ1A 1TKDB 3VI5A 1PX6A 5COHA 3UJ1A 1EZKA 1W4VA 1MD4A 2GSTA 5J9CA 4XS4A 5ECSA 3IPZA 4ZB6A 2H8LA 4N11A 4X1UA 1SD8A 4JU5A 3IA1A 5FT3A 2IMEA 5ECRB 1SJIA 1QMVA 1K0AA 2H70A 3PR8A 2B1KA 3LQ7A 2H0HA 2ZCTA 2IJYA 4OWYA 4KW6A 4RQRA 2C0DA 3KJYA 1GLPA 4P3YB 3W8SA 1GNWA 1WE0A 1ERVA 1GUHA 3H1NA 1BJXA 3GX0A 3NOFA 3TKQA 4HU9A 3VWXA 4MLYA 5F0GA 1T7PB 1E6BA 4IQAA 2GDRA 3EINA 1DE2A 2GT5A 5JWQB 1PQNA 4TR3A 2LKUA 3WGEA 3ERFA 3TB2A 5H5SA 2TRXA 18GSA 5CRGA 1XBSA 3BCKA 2VLTA 3SBCA 2TIRA 3IK7A 5G30A 5J9BA 4RQXA 1PX7A 5D9XA 3LYPA 4HQZA 5IM9A 2WCIA 5KN1A 2VLVA 4I97A 3WT1A 1SJZA 1TXXA 4K7NA 2MZCA 3BJ5A 4K8MA 3A3TA 1DE1A 1EGOA 1O8WA 5INYA 1B4PA 1TRUA 2M80A 4IP6A 4JEDA 1GNEA 4XHMA 2E2MA 1TK0B 2IL3A 4GWRA 2R2JA 5F05A 3TOUA 1H4OA 4HOJA 4EXJA 3V1WA 4JE1A 2JADA 1A8LA 4IJIA 3UMAA 3ZMKA 3DEXA 2FA4A 3LORA 3VURA 1Y6EA 4MP4A 1I9DA 4BVXA 1U3IA 4ISDA 2MMAA 4HZ2A 2MYGA 4KH7A 2YANA 1SK0A 4XTSA 5AIVA 2A2RA 3E0UA 3HXSA 5HFKA 3RDWA 4HDEA 3NZNA 3UARA 4EDZA 1A2MA 3H4KA 1Z7RA 1ERWA 2J23A 3LJRA 2LSTA 2H6XA 1GWCA 4L8EA 6GSTA 2DIZA 1GSUA 4JR4A 2RM6A 1F37A 3FHKA 2H76A 1FAAA 12GSA 1M9AA 1QGVA 5HR3A 1EEMA 1ZYEA 3QFAC 3I43A 4GTUA 4TKYA 4HI7A 4MF7A 1VF1A 5CNWA 5AIXA 2IMFA 2GQKA 1QQ2A 3IBHA 1TI1A 3P7XA 2HZEA 3JCML 1TW9A 4TR0A 1U6TA 4N0VA 2IMKA 1JLWA 1FW1A 1AQVA 2LNTA 3L9UA 1PL1A 4XS1A 4G10A 2C8UA 3TJKA 4I6XA 3D4TA 4IN0A 3RHCA 2LEGA 3HY2A 3APOA 5CREA 5ECPB 4NXIA 1M0UA 4HJ2A 3GRXA 4DVCA 2VCZA 2GLRA 2JZRA 5IQYA 2R4VA 1ERTA 2JZSA 4IGJA 4IJ3A 3ZIJA 1M9BA 2D2ZA 3EMXA 3KM6A 1SL2B 2P5QA 1ON4A 4GQCA 1Z5YE 2GGTA 3D21A 1UVZA 2B5YA 4POLA 2LRTA 4PURA 2L57A 1AC1A 4G9HA 3E3EA 2VLUA 2WS2A 3NIVA 1T8EB 4GSTA 1EP7A 2FUG2 3CTFA 3VI7A 5DAKA 4MABA 2VIMA 1YZXA 1FHEA 1EOHA 1MDKA 1SENA 2H73A 4F2IA 3TJBA 5JCUA 1HNBA 2AV4A 5LCZA 3GUSA 4K0NA 3C73A 4BWSA 1WIKA 3D22A 1G6YA 4MF6A 2H1DA 5JCWA 2OE3A 3TDGA 2HZFA 2MMOA 2DJ3A 4FIWA 2RUEA 1F3BA 2GZPA 2YZHA 4IQ1A 4GSSA 1TRWA 2H74A 3QMXA 2ZUPA 3VPTA 1OC9A 4F0BA 2IFQA 3HHVA 2YP6A 2JACA 1RW1A 4N30A 3TJJA 3ZZXA 5FHIA 4IP1A 1SKRB 3HD5A 1RQMA 2PBJA 2YJ7A 2V2GA 3ZREA 3L9SA 2H1AA 2DSAA 4EO3A 3BCIA 2GQMA 2LRNA 2WULA 5EPFA 1MDJA 3M0FA 4PGTA 4IHUA 1MTCA 4MCUA 1X5CA 2OE1A 5IMVA 1K0MA 2GSQA 1OE7A 3QAGA 1R26A 2KUCA 3WYWA 20GSA 2GZYA 1SYRA 2RUFA 1X5EA 1F9MA 2E0QA 5CRWA 5AISA 3FW2A 3H79A 1VGLA 5A4UA 3EYTA 3KH9A 2OKAA 3GKMA 3MDKA 2WJUA 1GSEA 1YKAA 2WB9A 2YPMA 2VD0A 1A2JA 1E2YA 16GSA 9GSSA 5JWOB 4OFMA 1UN2A 5B6MA 1XVQA 2K8SA 4GSNA 2FY6A 1A8YA 4CDOA 1ZMAA 4V1Ag 2P31A 3PH9A 3QAVA 1QUWA 3M9JA 5ELAA 5EY6A 3APQA 3TJGA 4GF0A 4V2NA 1U3AA 1WRYA 4WR4A 1A2LA 1K0BA 2WDUA 2M46A 2HRFA 3TRPA 1XW6A 5G31A 3RPPA 2IN3A 3GH6A 2LQOA 4PQIA 3EURA 4O32A 4BA7A 3VLNA 3ZRDA 5ECLB 3IC4A 4MJEA 3GH9A 4TW5A 3UVHA 5ECIB 1N8JA 4KX4A 3L78A 1TK5B 2DJ0A 3S9FA 2HSYA 3K8NA 5DCHA 2L59A 5IMAA 4X43A 4FYUA 3LXZA 2VCWA 1HNCA 8GSSA 4WF5A 4L0WA 3F63A 4HZ4A 4XS4B 3ED3A 4AJ6A 4KDUA 3QR6A 3HVSA 2PPTA 4IKHA 1SYXA 2NDOA 4H86A 4BPYA 3C7MA 3FK8A 7GSSA 1V57A 2J9HA 4KCAA 2H72A 5A4VA 4WR5A 1XWGA 5KN2A 1JZRA 3KMNA 3P90A 3KH7A 1K0NA 2YWOA 2EIQA 1NM3A 1OC3A 3QOUA 4AGSA 3N5OA 4AF2A 4N10A 3BD2A 1Q4JA 4KSOA 4AJ8A 2K9FA 2VO4A 4KDXA 3KCMA 1YF1A 2C0FA 5IOWA 2VCVA 2H71A 4K9ZA 2VUPA 2KP2A 3CSIA 5DALA 2F51A 2CVKA 4I2TA 4V2MA 5E59A 3HCZA 2FWEA 6GSYA 1R7HA 2B1LA 1EGRA 1GH2A 2YZUA 5GZZB 3DKSA 1XWBA 2V32A 5DCGA 1B9YC 3VWVA 1G7EA 1H75A 1ILOA 2JL4A 4ECCA 2RM5A 3TGZA 3FEUA 5J4UA 2FD3A 4CW9A 2BTOT 2QGVA 1XW5A 4KA0A 1WP0A 1J9BA 2O87A 3IV4A 2YN1A 1ACVA 2OJLA 2QC7A 1V9WA 3A2WA 2OADA 1PSQA 2KHPA 2FHEA 6GSUA 1SD9A 4GQFA 1EP8A 4V2LA 2I3YA 3F6DA 4J57E 1J0FA 3QD9A 4E8HA 2XPDA 3TRQA 4QL7A 1BG5A 3C8EA 3GL3A 2AB6A 4OCEA 2B7KA 5ENUA 3A2VA 3PGTA 2HRNA 2B3SA 2V6OA 3IE3A 4IELA 5DVBA 4LA1A 4DSSA 2OA7A 1T4ZA 1GP1A 2FCHA 3Q18A 4ML1A 1YF0A 1VF3A 1XWCA 4EF0A 5DDLA 2PGTA 1ERUA 1OVNA 2H75A 2OE0A 5C00A 1GSDA 4KDYA 3DGQA 5IMCA 4FO5A 11GSA 3KZQA 3F9UA 3ZVJD 2L5LA 5ECNB 2L6CA 4QQ7A 1N2AA 4RI6A 3I69A 2NPBA 17GSA 3HKRA 3GNJA 4MF5A 1QFNA 4HU7A 4EDYA 2ZNMA 3TKRA 2VCTA 3MNGA 3FZAA 4TXVA 5IMDA 4K7OA 4TXOB 1ML6A 2OBKA 3FZ9A 5ECKB 5JCGA 2LJRA 1VF4A 5D73A 2HZEB 4KSMA 2E2GA 1PKWA 2OACA 6GSWA 1FG4A 1GTIA 1FB6A 2O7KA 3KTLA 4L0UA 1DUGA 1R5AA 3HZ4A 1C72A 4IS0A 4ID0A 4JR6A 1A24A 4YAPA 1B9XC 2DJ1A 5HFGA 5F8BA 2M72A 1BX9A 3O6TA 2CVDA 1ZZYA 2O8VB 3GTUB 2LQQA 5A4WA 2IPAA 1XFLA 2FLSA 4K6XA 3FZ5A 2XC2A 2XPEA 4EL1A 4KE3A 2VCXA 3HYPA 2MBTA 2N5AA 3EU3A 4PNGA 2DBCA 5ECHB 1XOBA 3WGXA 3HDCA 2R3XA 4NHZA 3F4TA 3GV1A 4IBPA 2R5GA 1AQXA 1TOFA 1XPVA 3KGKA 4OO4A 1ST9A 1LJRA 4EE0A 1DSBA 1LU4A 4EVMA 5IPGA 1B4QA 4PUFC 2KLXA 4PX1A 1PN9A 2VL3A 5DAKB 4OD7A 1S3AA 3QFBC 1JZOA 4PUAA 5A5KA 5H5QA 5HR0A 4MZWA 1UA5A 3GSSA 2CZ3A 3ZFBA 2FNOA 1THOA 1FB0A 1T4YA 2RIIA 3KTBA 5DBQA 6GSVA 4DEJA 3KEBA 4I5QA 4HS1A 3G9BA 4KNDA 2GT6A 3HJOA 4F03A 2IWTA 3MAKA 4I2UA 2BMXA 2LJKA 3D6IA 4BVYA 2FWHA 2G2QA 3DIEA 1OC9B 1B8XA 2LUSA 2MBSA 2WZ9A 2HFDA 4NWYA 3DYRA 5ECMB 4TR1A 3U6VA 3DD3A 1K3OA 4PXOA 4TRXA 3KP8A 3P8WA 2LTKA 1M2DA 2H0GA 3SWLA 2H0IA 3WD6A 3FYGA 5HR1A 3QAWA 5D9WA 2H6ZA 4V1Ap 2IMIA 3TUEA 3GMFA 4POMA 14GSA 3ZYWA 1PRXA 1I5GA 1M99A 4L5OA 3KP9A 2Z9SA 4QL9A 4LMVA 3FKFA 1JLVA 2F8AA 1RK4A 4FH8A 1S3DA 4MDCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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