1N8JA

Crystal structure of ahpc with active site cysteine mutated to serine (c46s)
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
SLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEVTEKDTEGRWSVFFFYPADFTFVSPTELGDVADHYEELQKLGVDVYSVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVAAHPGEVCPAKWKEGEATLAPSLDLVGKI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Peroxiredoxin Evolution and the Regulation of Hydrogen Peroxide Signaling
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Salmonella typhimurium
molecule keywords Alkyl hydroperoxide reductase C22 protein
total genus 57
structure length 186
sequence length 186
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L, M, N, O, P, Q, R, S, T
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2002-11-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1n8jA00
3I9V2 2KOKA 1R4WA 2FWGA 3ME8A 3UL3A 2C3QA 4O32A 1OE8A 4ZBBA 3I43A 1MEKA 2WULA 3LG6A 1GWCA 2RM6A 2EC4A 3TOTA 4K0NA 4HDEA 3CMIA 3BCIA 3H4KA 4EE0A 1TTZA 3VI5A 2GQKA 2CX3A 2HRFA 4TR3A 4Z7XA 5IMFA 2CV4A 2RLIA 2L5LA 5ECLB 2WZ9A 2LNTA 4IS0A 3FY7A 2VCZA 4WBRD 2CAIA 5ELGA 2WRTA 3H1NA 3V1WA 3PH9A 3L4NA 1JFUA 2VL9A 5FT3A 1T7PB 3ZL5A 3VPTA 2HT9A 1TK0B 4L0UA 2GSSA 3BBYA 4QL9A 3HZ8A 4O7HA 1Y25A 3HJPA 2LJKA 4L5OA 3F63A 1SENA 2VCWA 3ZYWA 1K3YA 1OC9A 1OKDA 3WT1A 1UC7A 1CQHA 3GA4A 1K0MA 1ZMAA 3M8NA 1WRYA 4BWSA 3VLNA 2VUPA 2V6KA 2JU5A 2H1GA 2YV9A 4TR0A 2FGXA 4TOPA 5IMZA 3WGXA 3GV1A 2KLXA 2LV3A 2V6OA 4F82A 4MDCA 1WIKA 2H72A 2C3TA 3BJ5A 1TRUA 2GSTA 5IMVA 3KH9A 1SK0A 2V32A 1M99A 4XS4A 1GNWA 2GT6A 3IDVA 1KNGA 2EIOA 5CRWA 1FOVA 4G9HA 5AIXA 1O81A 2VLVA 5JWRB 1U3AA 4MJBA 2YJHA 1T1VA 3CYNA 3IAS2 1PSQA 3VWVA 1XBSA 1GTUA 4EL1A 3DD3A 1GSFA 3UVTA 3HYPA 2DMLA 3UBLA 1X5EA 3J7Yb 1TK8B 2CVKA 3P7XA 3HZ4A 2DLXA 4E8HA 4ZB9A 2Z9SA 2GZYA 4I6XA 1PKZA 12GSA 4JEDA 2HRNA 3N5OA 1FG4A 4TR1B 4ZBAA 1EEMA 2L6DA 5A4WA 2B7JA 1NHYA 2VM2A 2WS2A 1WJKA 2WFCA 3ZRDA 3F0IA 2R2JA 3F4RA 4YQMA 2CT6A 2FHEA 4KDYA 4NHZA 4WEYA 1EZKA 3LEFA 3WYWA 1YY7A 1XOAA 2VO4A 3KGKA 4ULXA 3UOMA 5DCHA 3O6TA 2DJ0A 3U5RE 1BEDA 2GQMA 1EV9A 22GSA 2B5YA 1EV4A 3D4MA 4ECJA 1H4OA 3FZ5A 2O89A 5D93A 3F3RA 1Z6NA 4YAPA 2NVLA 2EIQA 2PN8A 4TVEA 4KCAA 2PGTA 2LSTA 1GH2A 1XXUA 2HFDA 4KSOA 5GZZB 1ZL9A 2K9FA 4ML6A 5LCZA 5J3RA 2HZFA 3F4SA 5AN1A 3TUEA 2I1UA 2LRNA 3L9UA 1A2LA 1VF1A 2C1YA 2VIMA 3HXSA 2RUFA 1TU7A 1XFLA 4EDYA 5B7CA 1B8XA 2FA8A 4ZL9A 5IO2A 5J41A 4AJ7A 2J23A 4KSMA 2VLTA 1AC1A 2HSHA 4HQSA 3MDKA 3D22A 1TRWA 2IMIA 4MPGA 3UMAA 3PR8A 4YAVA 3HVSA 3DXBA 3NIVA 1F2EA 2PERA 2X8GA 3TJBA 1ZYQB 1SK1A 2NDOA 2AB6A 2DJ2A 3G9BA 3W8JA 2I3YA 4IELA 1PKWA 1K0AA 3RAZA 3UEMA 3O3TA 4X1UA 2OBIA 1Z3EA 2X8HA 4GTUA 3P8WA 2MMOA 2K8SA 2CZ3A 3FR9A 1A2MA 5KN3A 1QFNA 1QK8A 2FWHA 4HJMA 4MF5A 4JRRA 2YN1A 6GSTA 3WGEA 3GFKA 7GSSA 2MBTA 2R5GA 1USBA 4MJEA 4PURA 2B5XA 4HOJA 2AAWA 4X43A 1M2AA 1K0DA 1SL1B 3ZIJA 3TKSC 1O85A 2PVOC 3EVIA 5ECRB 2VLUA 4V2NA 4K7OA 3LSZA 1LU4A 3DVXA 3TJKA 1Z7PA 2IN3A 1ZZYA 1XWCA 1FAAA 5ECHB 3CTGA 3LXZA 3SBCA 2IWTA 2L4CA 1PL1A 3CRTA 2E7PA 1A8LA 3F3QA 4JU5A 4I97A 4OCFA 3ERFA 4CHSA 1B9YC 3ZMLA 4F03A 3DWVA 4HQZA 2VAFA 3QAGA 5KN1A 3PGTA 4XS6A 1S3CA 2G2QA 6GSUA 5DQSA 2JZSA 3D4TA 1VF2A 4QQ7A 5J5NA 2N5FA 2M80A 2O8VB 5ELAA 2GZZA 2PWJA 1TKDB 4TR1A 3FKFA 4HZ2A 1RK4A 1Q98A 1KEBA 3QFAC 1XOBA 3LWAA 5CRGA 3D21A 2F51A 5AGYA 1FO5A 1XVQA 5AIVA 2L5OA 2LJRA 3IK9A 3VURA 3GKXA 4GSNA 2PU9C 2NTOA 5CP1A 3CRUA 1ERWA 3KM6A 2REMA 5DDLA 2GS3A 4H86A 4V1Ap 5IPGA 2CA8A 1GSUA 1K3OA 1R7HA 2MMZA 3VWXA 4MMMA 5COHA 1WP0A 1OYJA 2MYGA 5D9XA 3ED3A 1EGRA 2OACA 3IV4A 4GSTA 1A0FA 4GSSA 2K8VA 1ERVA 2YPMA 3D6IA 2OJLA 4ZB8A 2ALBA 2JZRA 1M0UA 2I4AA 3MWHA 1HD2A 4MZWA 5HFGA 2FLSA 4MK3A 1JZRA 5CYYA 2IJYA 2GZPA 3GNJA 2RM5A 3FEUA 5ECMB 2H1DA 4XHMA 1V58A 4MF7A 1PGTA 4ECBA 1EGOA 1AAZA 1NSWA 4ECIA 8GSSA 4EO3A 1PD21 1SKWB 3I69A 5B6MA 1GRXA 5IM9A 4O92A 2OE3A 1VGLA 5INYA 4AF2A 5KEJA 2E0QA 1OC3A 5DJLA 3TKQA 4FO5A 13GSA 1ON4A 4E8EA 3F9UA 5HR1A 3KD0A 1MD4A 5HFKA 2F8FA 1SD9A 4O5RA 1EP7A 2FWEA 2PVQA 1PX6A 1DE1A 3TDGA 2LS5A 1BJXA 5CO3A 1WPIA 4JR6A 3N9JA 4IP1A 5F07A 1A23A 4LL4B 4PXOA 3CTFA 2WCIA 10GSA 4J56E 4IJIA 2L59A 4GQCA 5D9TA 2MBSA 4AGSA 2H6YA 1SKRB 1QXHA 2NBSA 2VCQA 1ACVA 18GSA 4NWYA 4NPBA 3L78A 3TKSE 2H0HA 3ZTLA 3KP9A 3QPMA 1YF0A 3C1RA 5D9VA 4FYBA 4IQ1A 1G6YA 2P5RA 2VL2A 1T8EB 2KP2A 2C0EA 2CZ2A 1M9BA 2L6CA 3ZMKA 2ZNMA 3BD2A 2F8AA 1JZDA 2PMTA 2IIYA 5G31A 2VD0A 5IQYA 2V1MA 1SYRA 1HYUA 2LQOA 2TIRA 4TW5A 1MDKA 4HU7A 1A0RP 3HVVA 3MAKA 4J2FA 3S9FA 1FHEA 3H8QA 2YWOA 3VPQA 1YF1A 2A4VA 1GSYA 3E9JB 4MLYA 3WT2A 2H19A 2C8UA 3GMFA 1PX7A 3F6FA 4ISDA 4Q5FA 3RHBA 6GSSA 3IHQA 4K6XA 5DBQA 4N10A 5CAXA 5ID2B 4Q5QA 3Q6OA 1GNEA 2OE0A 2AJQB 3D0ZA 3LORA 1K0CA 2OBKA 4KH7A 3KMOA 2IL3A 4PQIA 4L0WA 1FB0A 2H1AA 1V40A 2IFQB 2YP6A 4HJ2A 3W6GA 3EINA 3ZITA 2DBCA 4MABA 4PNGA 2C0DA 3BOAA 3GKKA 4EXJA 4TXVA 2FD3A 2VL3A 4KUNA 4NHWA 2MZCA 2CVDA 4PX1A 3DVWA 2YWIA 2B1LA 2BJXA 1DUGA 1EWXA 1Y6EA 1EOHA 1G7EA 1V2AA 2DC5A 3QAWA 1XW5A 4G10A 1ZGNA 3O76A 3IRAA 1CQGA 2CQ9A 1R5PA 3APSA 4EKZA 3FYGA 3KZQA 1GUHA 3FR3A 4OFNA 3A2WA 4V2MA 5G1KA 2OADA 2C0FA 4JE1A 1KBNA 3DYRA 4KDUA 3RHCA 4TKYA 1BYEA 1GLPA 3IA1A 2H76A 5ECKB 1LJRA 1S3AA 5JWOB 4HS1A 5A4UA 1W4VA 5J9BA 1NW2A 4MP4A 5FWGA 3CSIA 3IAM2 1F3AA 6GSYA 3TCOA 4IHUA 2L4QA 3HKRA 3I6AA 1Z9HA 3TJGA 1YZXA 4GWRA 1GTIA 2YV7A 4POLA 2DJ1A 2QGVA 1KTEA 3MNGA 3VWUA 4XRDA 2LEGA 4K7IA 2VCXA 2X64A 1V9WA 2HYXA 1DE2A 5IIZA 1ERUA 4MA9A 1K3LA 4WXTA 2H6ZA 2O87A 1A8YA 1O8XA 5CRDA 2IMEA 5D8IA 4WR4A 16GSA 4MH2A 1GULA 1SYXA 4BA7A 3RPPA 2GT5A 2KHPA 2VCVA 3IXRA 3M1GA 4L5LA 5DCGA 2LKUA 1YKAA 4PQHA 5FHIA 6GSWA 3IE3A 1GSDA 1VF4A 5JWQB 4G19A 2YCDA 4NAXA 1GP1A 2C0GA 2WGRA 5J4UA 1XWAA 3PINA 4PNFA 4LMWA 1AQVA 1GUKA 4BVYA 1JLVA 6GSXA 1EEJA 3ZZXA 1ZCPA 4WBJA 1XWKA 1GLQA 1NM3A 5F0GA 2GDRA 4LLRA 2R6KA 4DSQA 4OD7A 1T4ZA 2LRTA 4WR5A 1A24A 11GSA 4K1FA 4WKWA 3OR5A 2FWFA 4MZCA 2EIRA 1JZWA 2XBIA 2DMMA 3KJYA 1GL8A 4EUYA 3IOSA 1PQNA 4TN8A 2GGTA 5ID2A 3HJMA 3APQA 1F37A 1JLWA 1JZOA 4PQ1A 2R3XA 4ACSA 2NPBA 1PA3A 2LJAA 2ZCTA 4RI6A 1SU9A 3DRNA 1ML6A 4WETA 5L71A 4GLTA 1AQXA 3LYKA 1DBYA 3GRXA 1QMVA 3GL3A 1MTCA 2H30A 4EVMA 3NOFA 1K0NA 4HZ4A 1R26A 2WB9A 4PGTA 2PPTA 3GTUB 1GSQA 4IW9A 5G5FA 4XCSA 4OO4A 3TRPA 3FZAA 3HJOA 4X0XA 2HXKA 2C3NA 2VL2C 2XC2A 2GVPA 1TRVA 1THOA 6GSVA 1UN2A 2QC7A 5ECIB 2GTUA 9GSSA 1G7OA 4K2DA 3QAVA 4IQAA 3ERGA 1OVNA 4IKHA 4MZBA 4IVFA 3MSZA 2FA4A 2QSIA 3F4TA 3FRCA 4K0GA 2E2MA 4ZIJA 4TXOB 4KDXA 1EP8A 3FZ9A 4TRXA 3VK9A 3A2VA 1TU8A 4KNDA 2V41A 1XIYA 3TJFA 2LQQA 2P5QA 1I5GA 3SWLA 3VFIA 2WJUA 4AJ8A 3LGCA 1FVKA 4ZL7A 2ZUPA 3E3EA 2QKEA 2CX4A 4F0BA 1AUCA 4V2LA 4HU9A 4MF6A 4N0VA 4J57E 5E59A 4KX4A 2JZTA 2J9HA 1C72A 2E2GA 5ECQB 4ML1A 1IYHA 3KP8A 1PL2A 5LD0A 3GX0A 1ST9A 3JCML 3GH9A 3H79A 3H93A 3P2AA 1IYIA 3HVXA 2JSZA 3F6DA 3EU3A 3GUSA 2ON5A 5HR3A 4BVXA 3HDCA 3M0FA 2XBQA 3L9SA 4KE3A 5C04A 1XWGA 2N5BA 5EY6A 1THXA 5DJMA 1GTAA 3QD9A 1WE0A 1B48A 3QDNA 1FB6A 1SL2B 3G7IA 4JR4A 2LUSA 2GLRA 1X9SB 1B9XC 2VM1A 4N30A 4IGJA 3IR4A 5IOXA 3ZFBA 5LNKe 5EPFA 2H6XA 3EE2A 2A2SA 1FW1A 4P3YB 2P0GA 3KTLA 4F2IA 5DQYA 4MH3A 4OFMA 2V2GA 1E2YA 2GQLA 4RQRA 2OE1A 2TRCP 1TJDA 4Q5RA 1X5CA 3EU4A 4ID0A 3ISOA 1YEXA 5GSTA 2CAQA 2H0GA 1JHBA 1X0RA 2B1KA 4IBPA 1WMJA 3G7JA 1QGVA 4ZBDA 3F8UA 2R4VA 3KMNA 4NMUA 1QUWA 1SD8A 4N11A 3GKNA 3GTUA 1SJIA 1VRSD 5B8AA 1G6WA 4IP6A 4XTSA 4CW9A 3WGDA 1HQOA 2MMNA 3IPZA 4G2EA 2AHEA 1X9WB 1LBKA 3FW2A 4GCIA 1U6TA 4ECCA 1GSSA 1SK2A 3LXTA 2R37A 2A2RA 3NZNA 3HY2A 1YJ6A 4JBBA 5KN2A 1XPVA 3CSJA 4MCUA 4LMVA 1U87A 2AUVA 4K9ZA 1GSEA 3UIWA 2DIYA 1OE7A 4TXOA 3LYPA 2HSYA 2H75A 5C00A 4PUFC 5DALB 5E4WA 3KTBA 3J7Yk 3ZIVA 5ECSA 4F0CA 2B7KA 3K8NA 3GSTA 2O85A 3TRXA 4DEJA 4KCEA 4KW6A 3TOUA 4XRAA 3FZ4A 5G30A 4MJCA 3QFBC 2O7KA 4GRFA 5G5EA 3EC3A 3TKPA 1ERTA 4I2TA 5DAKB 3FHKA 5ABRA 2HNLA 5ECPB 2DSAA 3CSHA 5IMDA 3WD6A 2YJ7A 1Z7RA 3GN3A 1F3BA 4I8BA 4FYUA 17GSA 1TI1A 3HA9A 3UBKA 1RQMA 2D2ZA 1A2JA 5JCUA 4KB3A 2DJKA 4LL1B 1X9MB 4OMVA 1HNBA 2IMFA 1MDIA 2I9HA 2M46A 4POMA 3EMXA 1PMTA 3Q19A 3HD5A 1AIUA 1GUMA 3UAPA 2VD1A 4KGIA 1PRXA 4IN0A 2YANA 5DVBA 3APOA 4FH8A 2B3SA 4GF0A 4D73B 2BMXA 4I2UA 4LA1A 3KEBA 5GSSA 3M9KA 3IBHA 1SJZA 3KIJA 20GSA 3ME7A 2FNOA 4ILFA 1H75A 2B6MA 3LFLA 14GSA 4DVCA 4YH2A 3QR6A 5A5KA 2H71A 4TR4A 2K18A 1BX9A 4CDOA 5JCWA 5IPHA 1HNCA 1TP9A 1TW9A 1URMA 1ZOFA 1I9DA 3IC4A 4JZQA 3IK7A 3DGQA 3KCMA 1YEPA 2YNXA 1K0BA 1TK5B 1J0FA 3DMLA 5GAND 4OO5A 1TDIA 1VF3A 2JSYA 3AY8A 1U88A 2HE3A 2JACA 2H8LA 2LTKA 4NXIA 3TRQA 3A2XA 2X8CA 4IJ3A 1AXDA 1DSBA 1X5DA 4BPYA 1BG5A 2HZEB 3EYTA 1TOFA 1TI3A 2FY6A 2LRCA 3EWLA 2C4JA 3G7YA 3W8SA 3TJJA 2YWNA 4N0ZA 3ZREA 3GHAA 2YZUA 1O8WA 1O7UA 1GTBA 4EF0A 3TB2A 3C71A 3LJRA 4GQFA 4NV5A 4XIHA 4K7NA 2I81A 3GYKA 2RIIA 1V57A 5EL8A 3US3A 1TXXA 3BCKA 1TRSA 5G2ZA 3UARA 3GSSA 1XCCA 2IMDA 3Q18A 4PUAA 1O73A 1AW9A 1HNAA 5D73A 4KA0A 5DALA 1J9BA 5GAPD 5A4VA 3GKMA 4WF5A 5H5RA 3RDWA 1S3DA 2HI7A 3M9JA 4YQVA 5H5SA 2DIZA 1T3BA 3C7MA 1MDJA 1N8JA 1U3IA 3DKSA 4OWYA 2IFQA 3C8EA 1MD3A 2OA7A 2PBJA 5DAKA 1YQ1A 5CNWA 3HCZA 2PUKC 5ENUA 4DSRA 5EVOA 3GL5A 5F05A 1BAYA 5CREA 5KN0A 5ECNB 3ZVJA 4EDZA 4DSSB 2M72A 2H0IA 1UA5A 3QMXA 3M3MA 3E0UA 3R2QA 2KUCA 5IOWA 2RUEA 1V98A 1XWBA 2H01A 5B8BA 3TGZA 3CBUA 1M2BA 5HR0A 1N2AA 2JADA 2K6VA 3GURA 4MPFA 3U6VA 2FUG2 1FVJA 1YKCA 2MMAA 5HQPA 1K0OA 4WF4A 2WDUA 4HI7A 2CVBA 2TRXA 3GIXA 4OCEA 2VOCA 2C80A 4GXZA 2H70A 2F9SA 1Z5YE 2AYTA 2KP1A 5HFIA 2XPDA 3TKRA 5D9WA 2L57A 4D73A 1T4YA 3GH6A 1YDKA 3UJ1A 3KH7A 2H73A 3C73A 3L9VA 19GSA 2XHFA 4BWQA 1QQ2A 2ON7A 4QL7A 3EMPA 4V1Ag 2VCTA 1G0TA 5CRHA 2G0FA 3CXGA 3KXOA 4ZB6A 2AV4A 3DIEA 4RUVA 1BQ7A 1AQWA 1OC9B 2H66A 4Q5NA 4POBA 2X99A 3HHVA 3UVHA 4FYCA 1RW1A 5F06A 4HUAA 3RBTA 2YZHA 2B5EA 4ZILA 3A3TA 1O6JA 2XPEA 3VI7A 3L0HA 2FCHA 5HR2A 4FIWA 1B4QA 1UVZA 2GSQA 4XS4B 4F9ZA 3QOUA 2H1BA 3ZFLA 4AJ6A 1ABAA 2BTOT 2IMKA 4BL7A 2HZEA 1SJ6A 1M7TA 1Z6MA 4L8EA 4ZL8A 4NV2A 3C1SA 3FR6A 1SL0B 3GX8A 4YQUA 2F3MA 1F9MA 1R5AA 1NHOA 1XVWA 4MJAA 5AISA 3ERWA 1OKTA 4K8MA 1W89A 1OC8A 4EC0A 1SKSB 2OKAA 5IO0A 3LQ7A 4I5QA 2HLSA 5D96A 2DJJA 3DEXA 4OFTA 3VWWA 5ECOB 1ILOA 3Q74A 1M9AA 1XW9A 4POKA 2IPAA 2YOIA 4HEA2 5F8BA 4XS1A 1WOUA 1T00A 1E6BA 2H74A 3EURA 2ES7A 3FK8A 4ZXGA 1F6MC 3P90A 4KAEA 3TKSA 1WWJA 3A5WA 3D5JA 3ZVJD 1Q4JA 5H5QA 3QCPA 1XZOA 1J08A 2DJ3A 2P31A 1EOGA 3RPNA 4DSSA 3ZLPA 5IMCA 1B4PA 2LNSA 1M2DA 2JL4A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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