1OC3A

Human peroxiredoxin 5
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
SAPIKVGDAIPAVEVFEGEPGNKVNLAELFKGKKGVLFGVPGAFTPGCSKTHLPGFVEQAEALKAKGVQVVACLSVNDAFVTGEWGRAHKAEGKVRLLADPTGAFGKETDLLLDDSLVSIFGNRRLKRFSMVVQDGIVKALNVEPDGTGLTCSLAPNIISQL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of a Dimeric Oxidized Form of Human Peroxiredoxin 5
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
molecule keywords PEROXIREDOXIN 5
total genus 47
structure length 162
sequence length 162
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2003-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1oc3A00
3ZITA 3CYNA 5DALB 6GSXA 4LLRA 2GZPA 3KXOA 3N9JA 1ERUA 3TCOA 1QXHA 2C4JA 3GYKA 1YF0A 3A2XA 2LRCA 5FWGA 4KX4A 2R6KA 1HYUA 4XS6A 1ILOA 3KMNA 4JBBA 1Y6EA 4TR0A 1OC9B 4F0CA 4HQZA 1G0TA 4IBPA 2I9HA 2MBSA 4GSNA 2MYGA 4YQVA 2EC4A 1GSDA 2IMFA 4K7NA 4FYUA 5L71A 1A8YA 12GSA 5DALA 4CW9A 3TOUA 1XWBA 4ECBA 2PPTA 4IW9A 4YQUA 4MZWA 5G5EA 1O85A 2YJHA 1TP9A 3C8EA 4XS4A 2WULA 3FZ4A 1WIKA 1J0FA 2DJ1A 1R4WA 1E2YA 2DLXA 3FR3A 1GP1A 1VRSD 2J9HA 4EVMA 5ELAA 3J7Yk 1OC9A 5F0GA 5F8BA 4IGJA 2JSYA 3HVXA 4ZBDA 2MMNA 1A2LA 2V32A 4ECIA 4BVXA 2V41A 4YQMA 5D9XA 5J9BA 5EL8A 3D4MA 2M80A 4JU5A 1U6TA 2AV4A 2REMA 1YKAA 2RM5A 3GURA 2FY6A 3QDNA 3D22A 2YWIA 4LA1A 3CSIA 1JHBA 4BL7A 1XZOA 2MZCA 3IXRA 3VI5A 2VD1A 1YF1A 1Z6NA 1KBNA 3Q19A 3ERGA 4MK3A 4CHSA 5GAPD 2H75A 1EGOA 2X8CA 1G7OA 1VGLA 3QAVA 4ZBBA 3L9SA 4MZBA 1SJ6A 2X8HA 3L0HA 4GLTA 2NDOA 3GUSA 1M7TA 3C1SA 1K0BA 2LV3A 1F9MA 4ULXA 4MJBA 5DCHA 1GSFA 4YAVA 3HDCA 2JACA 4GSSA 5JCGA 1SL1B 5AISA 2GSRA 4Q5QA 2GQLA 4DVCA 1GL8A 3WGXA 2F8AA 3O6TA 3D6IA 2DJ2A 2CVBA 2N5BA 1A2JA 22GSA 5HQPA 3EC3A 1W89A 3TKRA 2DJKA 4FYBA 2CZ3A 3P90A 2LEGA 3AY8A 2AB6A 3G7IA 2LJRA 3D0ZA 1PA3A 3Q18A 1M9AA 4JE1A 4Z7XA 2H6XA 2HFDA 4ID0A 1Z6MA 1A0RP 2LJAA 3EE2A 4NV2A 3ZYWA 2YWMA 3UEMA 5ECKB 4HZ2A 1IYHA 3G9BA 3CTFA 1O7UA 1O8WA 2IMDA 3L9VA 2ON7A 3TGZA 3CRTA 3TJGA 4HJ2A 19GSA 2FUG2 1NHOA 4WBJA 2H1BA 1R5AA 4GCIA 2LNSA 4BPYA 1TU7A 1XWAA 3HZ4A 4MA9A 2OBKA 4X1UA 2CV4A 1JFUA 3PINA 4KSOA 5IOXA 1K0OA 4NHZA 2VO4A 3LWAA 2IMKA 1T7PB 1XVQA 5DBQA 1YEPA 1DE2A 4DSSB 5DDLA 4WBRD 1QGVA 4OO5A 5D8IA 3DD3A 1TXXA 2F9SA 3GRXA 3ZMKA 1G7EA 1GUMA 4G9HA 2DBCA 2H8LA 3QCPA 1FW1A 1EV4A 2HYXA 2C3TA 4X0XA 1V2AA 3O3TA 3IR4A 2L6DA 2BJXA 2HI7A 4WR5A 2X8GA 11GSA 3DKSA 1M9BA 5ECQB 1K3YA 3M1GA 3U6VA 3KTBA 1NM3A 3ZREA 2WCIA 4ILFA 5LNKe 5HR0A 3HHVA 2E2GA 2ZCTA 1A2MA 4DSSA 4JR4A 1ERTA 2I81A 4RQXA 3IV4A 1WP0A 2VM2A 3RDWA 1W4VA 3RHCA 4PQHA 4MCUA 1JZRA 2YCDA 4HUAA 3F0IA 1ERVA 5G1LA 5GAND 2I4AA 1SK2A 2N5FA 3CRUA 1NHYA 3WYWA 1PL1A 2H19A 2ZNMA 4HDEA 1I5GA 4ECJA 1AQVA 3GKMA 5C04A 1X0RA 2L4QA 3KD0A 3VFIA 4XS1A 3L4NA 1FO5A 1PMTA 2IIYA 3WT1A 4TXOB 3EYTA 3KJYA 3W6GA 5ECIB 1SJIA 4LL1B 1GTBA 2GT5A 5CRDA 1F37A 5EPFA 1DSBA 1GSYA 5ECOB 4MF7A 2AUVA 1K0AA 5KN3A 1AW9A 5CREA 3UL3A 4POLA 2XBIA 5A4VA 1ZGNA 5JWQB 2VL2A 3GSTA 4MABA 3GNJA 4ZB9A 2OJLA 1Q4JA 3F4SA 5KN1A 1FB6A 5G1KA 4K2DA 3Q74A 1AQWA 4ZB8A 1TJDA 2MMOA 4PUAA 18GSA 4PQIA 1MDIA 3HY2A 4MDCA 1URMA 4TXOA 3TRQA 4AF2A 1B4PA 1O81A 1FAAA 3KCMA 3TKSE 2LUSA 5IPGA 1F6MC 2H74A 1GNWA 4F0BA 4IN0A 4EDYA 1OKDA 3QMXA 4E8HA 5HFIA 4IKHA 5ECPB 4I8BA 3DXBA 4HQSA 1UC7A 14GSA 4KAEA 4N30A 2H71A 4XIHA 4IP1A 2LTKA 1B8XA 5IMZA 2P5QA 4V2NA 2OKAA 1RW1A 1ZL9A 2PMTA 5E4WA 5G2ZA 5C00A 5IMFA 1U88A 4IVFA 1TDIA 1AC1A 1SENA 5B7CA 4I5QA 3GN3A 3IAS2 4IQAA 3FR6A 1YQ1A 2H1AA 2VL3A 2H66A 3L9UA 1Y25A 1UVZA 1TOFA 1B9YC 1XWKA 3J7Yb 1EV9A 4KH7A 3LYKA 4K7OA 4IP6A 2B1KA 3TKSC 3UIWA 4XCSA 2LQOA 1U87A 3IC4A 1MD3A 1QK8A 6GSTA 1PSQA 2C0DA 1GTUA 3H93A 2IMEA 1XOAA 2HNLA 4FYCA 4XTSA 3LYPA 9GSSA 3IOSA 2EIOA 4N11A 4TN8A 3EMXA 3BCKA 1SJZA 2EIQA 5IQYA 1R26A 2H0GA 1BG5A 2PVOC 4TR1B 4K0GA 1EOGA 4KNDA 4POBA 3QFAC 1F3AA 2HLSA 3RAZA 4HU9A 3H1NA 1T8EB 2O8VB 2BMXA 1JLVA 2VM1A 3L78A 1QUWA 1KNGA 4PQ1A 20GSA 4FO5A 3EU3A 3LXZA 1JZOA 2C8UA 1HNAA 4GSTA 4EDZA 3JCML 3O76A 1TI1A 3EU4A 5ECHB 4DSQA 2H0IA 3HZ8A 4I97A 5JCUA 1YZXA 3KIJA 3OR5A 4MH3A 2WRTA 4KW6A 1C72A 1BEDA 1XBSA 4F9ZA 1FB0A 3VWUA 1ST9A 4KE3A 4TR1A 1OE8A 2IN3A 2OACA 3C7MA 4MF6A 3KH7A 3DRNA 4IJIA 2LS5A 4L8EA 3ZFBA 1J08A 1EEMA 4V1Ap 1XOBA 2GTUA 1YKCA 3CSHA 4L0WA 2F8FA 3PH9A 3MWHA 5DJMA 2WGRA 4G19A 4GF0A 2ES7A 1KTEA 3GL5A 1UA5A 3QOUA 5A4WA 5J5NA 2V2GA 4IS0A 3A2VA 3KEBA 3ISOA 2H1DA 1ZMAA 2WFCA 3IE3A 3BD2A 1M0UA 2X99A 3VK9A 1PX6A 4EL1A 4MP4A 1WWJA 2GGTA 4JEDA 1QQ2A 1U3IA 3ME7A 5CRWA 1XFLA 1PX7A 1HNBA 2YWOA 2H0HA 2FLSA 3UBKA 4TRXA 3U5RE 5KN0A 1XW9A 3F63A 3TUEA 2GZZA 1ZZYA 2XPEA 4IQ1A 2ZUPA 2HRNA 3P2AA 3NOFA 5GSTA 2H72A 2C3NA 3H79A 3F3RA 4K1FA 3ERWA 3GMFA 5AN1A 1GULA 5J3RA 4HEA2 2VCZA 1ON4A 1X5EA 1RQMA 1Z7PA 2OA7A 5G5FA 2OADA 5F05A 4GRFA 8GSSA 1SL0B 5ECRB 2M72A 4HS1A 1U3AA 3F9UA 2A2SA 3E3EA 3Q6OA 1V9WA 1Z3EA 1GH2A 2K8VA 2JZTA 1GNEA 4OCEA 4L0UA 5CYYA 3GHAA 3I9V2 3E0UA 4TW5A 5ENUA 3VLNA 4POMA 1HNCA 2O89A 2D2ZA 3CTGA 2CA8A 2DC5A 4TR4A 4JZQA 1TRUA 3LGCA 3NZNA 3ZZXA 2L57A 4EXJA 2GQKA 1R7HA 5JWOB 4WXTA 5F06A 4KA0A 4DEJA 3P7XA 1A8LA 3KZQA 3H4KA 5CRGA 3GKXA 4JRRA 4P3YB 1GSUA 2PBJA 2F3MA 2PGTA 4KUNA 4HJMA 3W8SA 13GSA 2B7KA 2WZ9A 3QD9A 2LSTA 3W8JA 2VUPA 1EOHA 1TTZA 3APQA 5ELGA 1F2EA 3M3MA 3WD6A 1AIUA 1V58A 2G0FA 1SYRA 5LCZA 4I2UA 5DQYA 4WF5A 1SU9A 2HSYA 2VIMA 2C1YA 2I1UA 4NPBA 3GIXA 4PURA 4AJ6A 5EVOA 2GT6A 4QQ7A 2GDRA 1ML6A 1SK0A 3ED3A 5IO0A 5JWRB 1A23A 4MJAA 1SYXA 4G10A 3VWWA 4N0ZA 1BAYA 5JCWA 3TKQA 1GSSA 2E0QA 4I6XA 4ML6A 3D21A 1UN2A 1HQOA 2H73A 1S3AA 1TRVA 2CAQA 2CZ2A 1Q98A 4WETA 3H8QA 1A0FA 4KGIA 2R2JA 2RUEA 1E6BA 3GH6A 5E59A 2FWGA 3UAPA 2IFQB 1SKRB 1JLWA 2DJ3A 2HZEB 4K7IA 2N5AA 2LRTA 3GSSA 1ZCPA 4RQRA 2GSSA 4O32A 3IK9A 4V2LA 3EMPA 3FZAA 5IIZA 2PERA 2LQQA 3FR9A 3IBHA 5IMVA 16GSA 5COHA 2TRXA 4O92A 1BJXA 1XWGA 2A4VA 4PXOA 2CVKA 3IA1A 2E2MA 5H5QA 2FWFA 1V98A 1X9MB 2H6ZA 4OFNA 2DSAA 4GQFA 1HD2A 3M8NA 4NHWA 2MMZA 3HCZA 1NSWA 4ZB6A 4HZ4A 2YZHA 5KEJA 2NTOA 2YPMA 3FEUA 2HZEA 2B7JA 6GSYA 5G30A 3UJ1A 3F6FA 3ZVJD 1GUHA 4EKZA 1K0DA 4F2IA 3FY7A 4KSMA 1TKDB 1O73A 3PR8A 1XIYA 3K8NA 3CMIA 2VCTA 5INYA 2R3XA 4ZBAA 1J9BA 3I6AA 2LRNA 2P0GA 3A2WA 2YOIA 5B8BA 2O85A 1N2AA 4BA7A 1FVJA 4OCFA 3ZIJA 1FHEA 4CDOA 2DMLA 2JU5A 2PU9C 1FVKA 4F03A 2K18A 4KDYA 4KDXA 4V2MA 3N5OA 2VCQA 3S9FA 4POKA 1B4QA 4BWQA 5D9VA 1ZYQB 3ZVJA 1Z5YE 4QL9A 2F51A 3D5JA 4X43A 3US3A 3BCIA 4I2TA 3V1WA 1OVNA 3BBYA 4MF5A 3ZMLA 1FOVA 4EUYA 2B6MA 6GSVA 5AGYA 1GSQA 5LD0A 2C0EA 3VURA 4PNGA 4AJ8A 4WF4A 4MJCA 5HR2A 1T4ZA 2CX4A 5HFKA 3MSZA 2OBIA 5CP1A 2DMMA 3RHBA 6GSUA 4NXIA 2IPAA 3VPQA 5IO2A 2CX3A 1JZDA 4K9ZA 5HFGA 1X5CA 2TRCP 3E9JB 1S3DA 3UBLA 2YANA 1XW5A 2G2QA 4O7HA 4TR3A 3UVHA 3HXSA 2R37A 5HR1A 2HT9A 3KP9A 3TRPA 4XHMA 5ECSA 1T1VA 4IHUA 2Z9SA 3F3QA 3CXGA 1A24A 3C73A 4RI7A 3APOA 4FIWA 1SKWB 2B5XA 2H6YA 2X64A 1AAZA 1OAZA 2B1LA 4KCEA 1M2AA 1NW2A 4BVYA 3FK8A 4HI7A 1QFNA 1XXUA 3GKNA 3FYGA 4H86A 1EGRA 3HVVA 3MNGA 2GZYA 2VL9A 4J56E 2GSTA 2JZSA 2FNOA 3SBCA 1V40A 3I69A 1OC3A 2IL3A 1M2BA 4ML1A 1K3OA 2YJ7A 1WE0A 2GVPA 3VPTA 3F6DA 2CT6A 4GWRA 4EE0A 4ZILA 4TVEA 2DJ0A 5B6NA 1MDJA 3IPZA 5D73A 4EF0A 2L5LA 3FRCA 2QKEA 1EP8A 4MZCA 3PGTA 2NBSA 1T00A 4FH8A 2RUFA 4JR6A 5F07A 1ZYEA 3FW2A 2V6KA 2TIRA 3ZFLA 2ON5A 1PL2A 4OFTA 1T3BA 3CBUA 4L5OA 3KTLA 3LSZA 1XPVA 3SWLA 5J4UA 4XS4B 5KN2A 3I43A 4OMVA 3DWVA 4WEYA 4F82A 5H5RA 1LJRA 1GUKA 2DJJA 2YN1A 4ZL7A 1FG4A 3RBTA 2KOKA 1ZOFA 5IMDA 3GTUB 5EY6A 4KCAA 1GSEA 1WRYA 5A4UA 3FHKA 2JADA 1DE1A 4YAPA 2H01A 5IMAA 1X5DA 2AHEA 3IRAA 2HSHA 2VLTA 4EC0A 4LMWA 2L5OA 3TJBA 3WGEA 6GSSA 4TXVA 5H5SA 3DIEA 2JZRA 3ZRDA 5D9WA 3QR6A 4NAXA 2IMIA 2B3SA 4Q5RA 4KB3A 1PD21 2QGVA 3GTUA 3GX0A 5G31A 3EWLA 2H30A 3KGKA 1G6WA 4K8MA 1MD4A 4MH2A 2XBQA 1MEKA 2K9FA 2YV7A 2HRFA 3M0FA 4TKYA 4PNFA 1K0MA 2LNTA 1SK1A 1PN9A 3C1RA 1V57A 1O6JA 4LMVA 2KUCA 2VCWA 3F4TA 2YZUA 5CAXA 5D93A 2E7PA 2WJUA 3UARA 3ZTLA 4NWYA 2H70A 3DGQA 3HJPA 1PGTA 4LL4B 2AYTA 2RIIA 3EURA 4RUVA 1OC8A 2I3YA 3TJJA 5IOWA 1XVWA 3HJMA 4J2FA 3G7YA 3GKKA 2XPDA 3APSA 3HVSA 4PGTA 2FHEA 4BWSA 1YY7A 1LU4A 3QAWA 3TRXA 1OE7A 4TOPA 3GA4A 1PRXA 1TRWA 2HXKA 1QMVA 1EWXA 5DQSA 2YP6A 3HJOA 1GRXA 2FGXA 2GS3A 3VWXA 3VI7A 1AUCA 3IK7A 2WDUA 1USBA 1VF1A 3CSJA 3QPMA 4G2EA 5J41A 5CO3A 3F4RA 4OWYA 1SD8A 2H1GA 2C0GA 4PX1A 1GWCA 1K0NA 2XC2A 1RK4A 1TRSA 2QSIA 2A2RA 4ISDA 2V6OA 3A3TA 1TI3A 1XW6A 5B6MA 1GTAA 1GLPA 1YDKA 3IDVA 1YEXA 2CQ9A 1H75A 2NPBA 1XWCA 3GFKA 2BTOT 2O7KA 2KHPA 2R5GA 2MMAA 1DUGA 5DCGA 2AAWA 2C0FA 3LFLA 2VOCA 1K0CA 5D9TA 3A5WA 2DIYA 3ZLPA 4ACSA 2VCXA 2XHFA 1EP7A 2JSZA 2YWNA 1ABAA 3HKRA 5ID2B 3VWVA 2K8SA 4MPFA 1TK0B 1B9XC 3MAKA 3G7JA 2CVDA 3GH9A 1YJ6A 1XCCA 1WMJA 3DVXA 2EIRA 2L59A 4WR4A 1WJKA 1GTIA 2C3QA 1BQ7A 3LXTA 2C80A 1X9WB 2CAIA 5B8AA 2YV9A 4XRDA 1O8XA 4ZIJA 4K0NA 4DSRA 2GQMA 3TKPA 5ECMB 4J57E 3M9KA 3TB2A 3FKFA 1I9DA 4MLYA 3HA9A 4ZXGA 5A5KA 1G6YA 3TJKA 1TK5B 1OKTA 3ERFA 3WT2A 1CQHA 1OYJA 1EZKA 5ID2A 1ERWA 4MMMA 4D73B 6GSWA 1LBKA 2KP2A 1M2DA 1MTCA 4AJ7A 3LEFA 2FA4A 1Z7RA 4ECCA 3ME8A 4PUFC 1S3CA 5HR3A 10GSA 1X9SB 4Q5NA 3EINA 4NMUA 1B48A 2FD3A 2WB9A 3RPNA 1PKZA 3BJ5A 1IYIA 1BX9A 3RPPA 1WOUA 5IMCA 7GSSA 2IFQA 1JZWA 1MDKA 2HE3A 2FA8A 2LKUA 2L4CA 3DMLA 5CNWA 2IJYA 2OE1A 3UMAA 3LG6A 1BYEA 2YNXA 3QFBC 4D73A 3ZIVA 4MJEA 1AXDA 4HU7A 3HYPA 2M46A 4GTUA 2VD0A 4OO4A 5ABRA 3NIVA 3WGDA 2RM6A 4HOJA 3LJRA 1SL2B 1ACVA 2L6CA 2FCHA 3DYRA 5FHIA 3FZ9A 4NV5A 5CRHA 3KH9A 2RLIA 2VL2C 2LJKA 3TDGA 4ZL9A 2KP1A 4WKWA 3QAGA 4ZL8A 4L5LA 4K6XA 3EVIA 3MDKA 1KEBA 1THOA 1VF2A 2B5YA 1SKSB 5GZZB 3UVTA 2GLRA 3TOTA 4E8EA 2VLVA 1SD9A 3IHQA 2K6VA 1AQXA 4MPGA 5AIVA 17GSA 3LORA 3D4TA 2AJQB 2PN8A 4QL7A 2QC7A 1Z9HA 1PQNA 3LQ7A 5DAKB 2V1MA 5DVBA 1WPIA 3KM6A 2VCVA 3GX8A 3GV1A 4EO3A 4GXZA 5ECLB 1THXA 4AGSA 5ECNB 4KDUA 3P8WA 3M9JA 5AIXA 1H4OA 2KLXA 1TW9A 3DEXA 2VLUA 5DJLA 4Q5FA 3BOAA 5IPHA 2J23A 4O5RA 2R4VA 4GQCA 1N8JA 2H76A 1F3BA 5DAKA 1EEJA 3FZ5A 2IWTA 3UOMA 2FWEA 3F8UA 4XRAA 1TK8B 4N10A 4V1Ag 1PKWA 2FWHA 3C71A 2P31A 2PUKC 3KMOA 2B5EA 3TJFA 1K3LA 2WS2A 2OE0A 1M99A 1R5PA 2HZFA 2O87A 3TKSA 1CQGA 2OE3A 5FT3A 5GSSA 1VF4A 5D96A 1DBYA 5J9CA 3GL3A 5IM9A 1GLQA 2PWJA 2P5RA 1TU8A 2MBTA 2ALBA 2JL4A 2VAFA 3DVWA 4IJ3A 1VF3A 3ZL5A 2DIZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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