1OC3A

Human peroxiredoxin 5
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
SAPIKVGDAIPAVEVFEGEPGNKVNLAELFKGKKGVLFGVPGAFTPGCSKTHLPGFVEQAEALKAKGVQVVACLSVNDAFVTGEWGRAHKAEGKVRLLADPTGAFGKETDLLLDDSLVSIFGNRRLKRFSMVVQDGIVKALNVEPDGTGLTCSLAPNIISQL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords PEROXIREDOXIN 5
publication title Crystal Structure of a Dimeric Oxidized Form of Human Peroxiredoxin 5
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 47
structure length 162
sequence length 162
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2003-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1oc3A00
3IAS2 1SJZA 2IMKA 3DWVA 1NM3A 5KN2A 2AYTA 1SKWB 1FAAA 1SYRA 4K7OA 2I81A 2CT6A 1X9WB 2HZEB 1MTCA 3G7IA 3TOTA 3ZMLA 1O85A 4AGSA 4ECJA 4KSMA 3FR6A 1GULA 1TRUA 1V58A 3F4SA 1M9AA 4ISDA 5F05A 2YANA 1NSWA 1GLQA 2K8SA 4K7IA 1ZGNA 3EU3A 1CQGA 2O85A 1GLPA 1ERUA 4ECBA 2YV9A 4QQ7A 3F0IA 1THXA 3KH9A 16GSA 2HRNA 2VUPA 2VLTA 3DEXA 2H6YA 1Z9HA 3APSA 5F0GA 2LRCA 4JU5A 3KMNA 5G1KA 5HR1A 3ZFLA 1HQOA 4YAVA 2H0GA 4EKZA 1NHOA 1R26A 3FZAA 1PSQA 2GGTA 5CRHA 2J23A 5KN1A 5A4VA 1XWAA 1K0MA 5ECSA 1G7OA 3VK9A 1K0OA 1SL2B 3UOMA 4I97A 1TTZA 5G30A 3H1NA 2HFDA 3D0ZA 4MF5A 5IMCA 4H86A 4QL7A 1YZXA 3APOA 3IDVA 1EGRA 1GSQA 4KSOA 1PL1A 4HQZA 1GNEA 3Q6OA 2KHPA 6GSXA 3QDNA 5D9WA 3BCKA 4ZB6A 2C3NA 3MNGA 2HT9A 2BTOT 1EV9A 2C8UA 2VLVA 4HU7A 4PX1A 2YWIA 2MMOA 2RM5A 4ECCA 4BPYA 2QSIA 2FLSA 3KP9A 3D5JA 3KXOA 3TKRA 2YWOA 2FWFA 1RQMA 3FK8A 2FA8A 3HKRA 2GZPA 3QCPA 2HRFA 2FWHA 1Z6NA 4BVYA 4RQXA 1GTUA 1B4QA 3CRUA 4X0XA 3A2WA 3F3RA 2FNOA 2HXKA 2B3SA 3J7Yb 2AAWA 9GSSA 3A3TA 3IHQA 5LCZA 5IMAA 2R4VA 2HZEA 2P31A 2LRTA 2A2SA 2YZHA 5D96A 6GSWA 3RDWA 3ED3A 14GSA 2IJYA 4GSNA 4TR1B 3HY2A 3L78A 3O3TA 3N9JA 1ZZYA 3RHBA 4Q5FA 4WKWA 2AV4A 2B1LA 2DJKA 2B6MA 1WP0A 3DVWA 1URMA 4JEDA 4KCAA 1XWGA 2YZUA 2CA8A 1XFLA 3E3EA 3HJOA 4HU9A 4BA7A 2H72A 1FOVA 4IHUA 2WJUA 3H8QA 5D9XA 3C73A 4KDUA 3MDKA 1OC9B 1DBYA 2JZTA 3TJJA 5KN3A 2AHEA 3LQ7A 5ECMB 1JFUA 3TJGA 4TR4A 1WOUA 1OVNA 3QOUA 5JCWA 5IO0A 2L4QA 2O87A 3TKQA 1TU7A 5ECHB 1WRYA 3EYTA 5GZZB 8GSSA 2MBSA 2RIIA 5EY6A 5DJMA 1XVQA 4DSRA 1LU4A 1GL8A 4DEJA 3P2AA 3F9UA 1GUMA 1ABAA 1S3CA 1VGLA 3M9JA 2YP6A 3WGEA 5ELGA 2GS3A 5GAND 4F0CA 4AF2A 1XWKA 1OAZA 3GKXA 4HOJA 4OD7A 3HZ4A 1ML6A 22GSA 5DVBA 5IPGA 11GSA 4I5QA 2M46A 1ILOA 2XC2A 4ID0A 1GSUA 1R5AA 4G10A 1TJDA 5H5QA 1V98A 2I3YA 5FWGA 3WYWA 1GWCA 4OFMA 3TGZA 3BBYA 5INYA 5DCGA 4AJ8A 3GYKA 3IC4A 4IVFA 5DQSA 2IMFA 1TKDB 10GSA 3Q18A 3GL5A 5ECPB 3GX0A 4V1Ap 1TP9A 3HA9A 6GSTA 4DSQA 2VL3A 4ZBDA 3VWVA 2ON7A 4NHZA 1YF1A 2PBJA 3BCIA 4IKHA 3CBUA 2WFCA 2GT5A 1ZOFA 4TW5A 1M2DA 4WF5A 2HZFA 1F6MC 3F63A 4TR1A 4PUFC 3ZLPA 1Z6MA 4MJAA 3HXSA 3CRTA 2JSZA 2K6VA 4GXZA 2C80A 1YF0A 2FWEA 3DXBA 3L4NA 3VWUA 1U6TA 1YKAA 1EOHA 3KGKA 2GDRA 4QL9A 3TKPA 2DC5A 3HDCA 1ERVA 3D6IA 1XPVA 1JZOA 1JLVA 1EV4A 2X64A 1O8WA 2FD3A 2K9FA 2YCDA 2XPDA 2P5QA 5B6MA 1PKZA 2FUG2 3GKNA 2DMLA 4N0VA 2LRNA 5LD0A 4Z7XA 2QKEA 2I9HA 1OC9A 5ECLB 2GSTA 5D73A 5F07A 2R37A 1H75A 4WR4A 2JL4A 3I6AA 1A2JA 1Q98A 5F06A 4EF0A 2X8GA 5EPFA 4N10A 3QAWA 4FYBA 4MCUA 4KNDA 3QFBC 3H93A 1K0NA 1YQ1A 1M9BA 3GFKA 2LS5A 3GNJA 4EO3A 5JCGA 2IN3A 1SD8A 2C1YA 4RUVA 1VF4A 1PMTA 1ERTA 3CSJA 3ME8A 1GSYA 3FZ9A 5B6NA 3KIJA 3E9JB 1F2EA 3DMLA 5ECNB 2R6KA 1X9MB 4ZXGA 3UVTA 4XHMA 4GQCA 2GSQA 3UARA 1K0BA 3UL3A 5KEJA 3ERGA 3W6GA 1TU8A 1PRXA 2TIRA 3FW2A 4KH7A 2K18A 1U88A 4PNGA 2H1BA 4WBRD 2LJAA 5CRDA 5D8IA 4BVXA 1AC1A 3MSZA 4IBPA 4K6XA 5CAXA 4TOPA 3QPMA 2GT6A 2YJ7A 1B4PA 1K3YA 4FO5A 3O6TA 1H4OA 5EVOA 4N11A 4KCEA 5ENUA 5DCHA 4V2MA 4EXJA 4FIWA 5D93A 1XOAA 2V6OA 5GAPD 1G6WA 2L57A 3PGTA 1PD21 1USBA 2L6CA 4EDYA 4JZQA 2GTUA 3D4MA 4HZ4A 4NHWA 1S3AA 3CXGA 3IBHA 3HHVA 2F51A 4PNFA 1T4YA 3M1GA 2M80A 3CMIA 4WXTA 1GSEA 3HVVA 1FB0A 1KBNA 3F4RA 4K2DA 2LKUA 3L9SA 1ST9A 3WGXA 1M7TA 2WDUA 4D73A 4MA9A 1R4WA 4L8EA 4ZB8A 12GSA 2HNLA 3H79A 2VD1A 2DJ0A 4PQ1A 1QK8A 3C1RA 3GTUB 4YAPA 3M8NA 3UEMA 4XTSA 4YQUA 1K3OA 4YH2A 5ECRB 4JBBA 4KGIA 3DGQA 5FT3A 2VCXA 2X8CA 2I1UA 4MLYA 2DMMA 2FY6A 4MH2A 4ZBAA 2ZUPA 2OADA 2VCQA 2FCHA 4F82A 3Q74A 4MZBA 3ZREA 1YEPA 4TRXA 2KP2A 3WD6A 1UN2A 5A5KA 2NVLA 3HYPA 1B9XC 3P8WA 3P7XA 5IOXA 1DE2A 3GA4A 4WR5A 4ZL8A 2JSYA 5J5NA 4GQFA 4J56E 1A0FA 1PQNA 2VCZA 3I69A 2YWNA 2HSYA 3S9FA 1J0FA 2AB6A 4MPGA 2R2JA 3LSZA 3UAPA 1K0DA 2LJKA 1WMJA 2MBTA 5HFGA 3IK7A 3WT2A 4I8BA 2WZ9A 4G9HA 3GSSA 3TRPA 4LMVA 4LL1B 3APQA 4YQMA 2LNSA 3PINA 4Q5NA 4HJ2A 2CV4A 5C04A 2YWMA 2VL9A 2K8VA 5IMDA 5JWRB 3IRAA 3BD2A 5GSTA 4AJ6A 4K7NA 1SYXA 3HVXA 2O7KA 2CVBA 2GZYA 2JADA 2EIQA 3MAKA 2E0QA 3DYRA 4NMUA 2DJ2A 3ZTLA 2F3MA 5AN1A 1VF2A 2KUCA 3SWLA 2VCWA 1W4VA 2WULA 1KTEA 4EDZA 4XRAA 1BAYA 4GF0A 4OWYA 4L0WA 2QGVA 2F8AA 4E8EA 1AXDA 1AAZA 4MZWA 3GH9A 2H73A 1OKDA 2CQ9A 1O73A 3L9VA 1TW9A 3M3MA 4G19A 4ECIA 3A2XA 4J57E 5LNKe 1BX9A 3QD9A 4F9ZA 1GTBA 4KB3A 1XW6A 2VM2A 1QUWA 2XHFA 2WCIA 4O32A 3GTUA 2AUVA 3LFLA 2XBQA 1YJ6A 2YV7A 3VFIA 2H0IA 1YEXA 4XIHA 1SKSB 4XRDA 3M9KA 4POKA 4K8MA 2JZRA 2J9HA 1XCCA 1TK8B 3CTGA 3VLNA 1GUKA 1BJXA 4OO5A 5DDLA 3C8EA 4XS6A 1ZCPA 4XS4B 4K0NA 5CP1A 4EC0A 2X8HA 1TOFA 1OE8A 3I43A 3VI7A 5JCUA 3IK9A 2WGRA 1PX6A 2A4VA 1MEKA 5G1LA 1IYIA 1T8EB 3IAM2 3LGCA 4HZ2A 2LV3A 5IMFA 5CO3A 4I6XA 3LJRA 2BJXA 1SJIA 1UVZA 4OFNA 1X5DA 3TRQA 2H8LA 1FW1A 4MABA 1MDJA 5G5FA 1SJ6A 3GN3A 4NWYA 4KDXA 5G2ZA 1EP8A 3TOUA 2V6KA 3UJ1A 1RW1A 2VL2C 1O6JA 1ZMAA 4JR4A 5AIXA 4IP6A 1A8LA 3TCOA 5DAKB 3G7JA 1EWXA 2O89A 3F6FA 4RI6A 3ZFBA 3D22A 2LQOA 2GQKA 3TRXA 3PH9A 3F3QA 1A2MA 3W8SA 4CW9A 2YPMA 3OR5A 4O92A 6GSSA 1UA5A 4IN0A 1JZRA 2H1GA 1M2BA 1VRSD 3FR3A 4KX4A 3QAGA 5AISA 3UBLA 2PGTA 2EC4A 2PWJA 5CRWA 3C71A 1F3AA 2CZ2A 7GSSA 2GSSA 1A0RP 2VCVA 4IQAA 3UBKA 1B9YC 2B5EA 2NPBA 1XVWA 1B8XA 1AUCA 2GQLA 1K0CA 3DVXA 2XPEA 4OFTA 5ECKB 3L9UA 1MD3A 3NOFA 4HEA2 3RPNA 1FHEA 2PU9C 2EIRA 4ULXA 2CAQA 2C0FA 1EGOA 4MJCA 4GTUA 2NTOA 5G5EA 1SENA 5B8BA 2H0HA 4LA1A 3IXRA 2MMNA 2HSHA 1FO5A 1BEDA 3LYKA 3HZ8A 1NW2A 2NBSA 2VL2A 1A2LA 3N5OA 2H01A 2MYGA 2E2GA 3BJ5A 1X9SB 13GSA 2C0DA 3RAZA 4X1UA 2YNXA 2PN8A 5F8BA 3UMAA 3JCML 5HFKA 2L4CA 3LEFA 4XS4A 3GMFA 5JWOB 4KDYA 1K3LA 4K9ZA 2E2MA 4TR0A 4Q5QA 4WF4A 3GKKA 4K0GA 4JRRA 2MMAA 4ZL9A 2VOCA 2R3XA 3KTBA 4TKYA 3P90A 2GLRA 2F8FA 2FGXA 1V57A 2TRCP 1U3IA 3DD3A 4MPFA 3IR4A 2F9SA 3Q19A 4ILFA 3TJFA 5DALB 3VURA 1GSDA 1PGTA 3TJBA 1TK0B 4X43A 2XBIA 5D9VA 4GSSA 1PKWA 4MZCA 4TR3A 2VAFA 1DE1A 1T4ZA 4JE1A 5DAKA 1OC8A 5HR2A 1G0TA 4ZIJA 1GH2A 3LXZA 1GSSA 3KJYA 1LBKA 3IPZA 4LMWA 3E0UA 4XS1A 4P3YB 4POMA 1RK4A 2N5BA 2VCTA 1F37A 4ZB9A 4BWQA 2V2GA 1EOGA 2G0FA 5ECOB 3EMXA 2KP1A 1M99A 1N8JA 5CNWA 5ECIB 4GLTA 1MD4A 3EMPA 3UVHA 2HYXA 2PPTA 1T3BA 3GUSA 1R5PA 2YJHA 1XW9A 2RLIA 1KEBA 1C72A 2ZCTA 2P0GA 3GX8A 3TB2A 3R2QA 4LLRA 4NPBA 3DIEA 4FYCA 2OBIA 3ERWA 3QMXA 2CX4A 2DLXA 3VWXA 1EP7A 4PQHA 4V2NA 1OE7A 5JWQB 3RBTA 3GSTA 1ZYQB 2B7KA 4IJ3A 1GRXA 2YN1A 5G31A 4HS1A 1WJKA 1XIYA 4ZILA 3F4TA 4I2UA 2M72A 3NIVA 2IFQB 3TDGA 4FH8A 1T00A 1S3DA 1LJRA 1OKTA 2JZSA 3KZQA 3TJKA 4K1FA 1KNGA 5H5RA 4RQRA 1Q4JA 2VLUA 1Y6EA 1PL2A 1IYHA 4JR6A 4LL4B 4OCFA 4KW6A 1E2YA 1QFNA 3FY7A 4MMMA 4EE0A 2DIZA 4L5OA 4F03A 3NZNA 3HVSA 5EL8A 1J9BA 1EEJA 4KUNA 1Z5YE 1WIKA 2C0GA 5IPHA 2TRXA 3KEBA 2ZNMA 1I9DA 3FRCA 4ACSA 3G9BA 2RUEA 5HQPA 2H75A 4PQIA 3UIWA 5A4UA 4ML6A 1O81A 2IPAA 1J08A 4PXOA 2DJ1A 4OO4A 5KN0A 4MF6A 1GUHA 1WWJA 3GV1A 2MZCA 3GHAA 5DALA 3RPPA 1GP1A 1WE0A 5IMVA 2GVPA 4GSTA 3EWLA 3M0FA 3RHCA 3D21A 1U3AA 4V2LA 5GSSA 4TXOB 3EC3A 1EEMA 3TUEA 2DSAA 2OJLA 3KMOA 1DUGA 3US3A 2PVOC 3A5WA 3ZYWA 5L71A 1XXUA 1SKRB 4KAEA 1BQ7A 3ISOA 4FYUA 2V41A 1AQXA 2OE1A 5E59A 2O8VB 1SK2A 4I2TA 5A4WA 4MP4A 1PX7A 3ZL5A 1GNWA 4MJEA 2PVQA 1MDKA 1HNBA 2H66A 1V9WA 1THOA 2QC7A 2LJRA 5IMZA 1AIUA 4POLA 5H5SA 4IW9A 5IOWA 1XBSA 2DIYA 3QR6A 4HI7A 20GSA 1QGVA 5CRGA 1X5EA 1OYJA 2V32A 4TXVA 2REMA 4PGTA 5IQYA 3GKMA 3SBCA 3LG6A 2WS2A 4NAXA 1OC3A 3G7YA 4IJIA 17GSA 1SU9A 4IELA 2H1DA 1Z3EA 2IFQA 5IO2A 1FG4A 2IMIA 5B7CA 5ELAA 1XWBA 1EZKA 2RM6A 5HR3A 1Z7RA 1DSBA 2OE0A 4PURA 3ZVJD 3EVIA 3ZZXA 4BL7A 4GCIA 3DKSA 3TKSC 1G7EA 2YOIA 4O7HA 1FB6A 5J9BA 5E4WA 5COHA 4AJ7A 4PUAA 2KOKA 1HNCA 3ZITA 1GTAA 4G2EA 1CQHA 5DJLA 4YQVA 1HD2A 2WRTA 3HJMA 1G6YA 2FHEA 3KP8A 2R5GA 3HCZA 1JZWA 1TRSA 2HI7A 2NDOA 3VI5A 1TI1A 3I9V2 1ACVA 2DJJA 5CYYA 2WB9A 5ID2B 2B5XA 4EVMA 1X5CA 5HR0A 4EUYA 2H6XA 3KTLA 1SK1A 4MJBA 1UC7A 6GSVA 2IIYA 4POBA 1XWCA 3GL3A 4ZL7A 4TXOA 2PERA 4RI7A 5DBQA 4DSSB 1SL0B 3CTFA 2H74A 3DRNA 2LQQA 4HDEA 3HJPA 1E6BA 5IIZA 4KA0A 2N5AA 3CSHA 2X99A 4GWRA 3IA1A 3EE2A 4HJMA 3ME7A 3KCMA 3TKSA 1QXHA 1K0AA 2KLXA 2PUKC 1M2AA 1M0UA 4EL1A 1AW9A 2PMTA 1VF3A 4N0ZA 3F8UA 2JACA 4MF7A 3KM6A 3ERFA 5D9TA 2ES7A 2CVDA 4F0BA 1T7PB 1ERWA 4IGJA 1PA3A 2LSTA 3AY8A 5ECQB 3FHKA 4TN8A 3MWHA 4TVEA 2CAIA 1O8XA 2D2ZA 2B1KA 1X0RA 3FZ4A 1FVKA 2LTKA 1BYEA 4XCSA 6GSYA 2VIMA 3IV4A 1SK0A 3V1WA 2H1AA 2C3QA 3QAVA 3VPTA 1O7UA 2DBCA 3U5RE 3PR8A 5J4UA 1BG5A 3FKFA 1NHYA 1XW5A 4IQ1A 1R7HA 3IE3A 1V40A 3FYGA 2AJQB 4IS0A 3F6DA 18GSA 5J9CA 2EIOA 1F3BA 2C3TA 2FA4A 3IOSA 4BWSA 2IMEA 5HFIA 2ON5A 5CREA 1MDIA 5IM9A 4MK3A 1B48A 3EU4A 4ZBBA 2V1MA 3W8JA 1V2AA 1YDKA 1YKCA 2Z9SA 2VD0A 3ZRDA 1TI3A 1HYUA 4WETA 3KD0A 1AQVA 2VO4A 1F9MA 2DJ3A 4D73B 2B5YA 4L0UA 1JZDA 1Z7PA 2ALBA 1A24A 2L5OA 1U87A 4NV2A 5ID2A 1TXXA 4Q5RA 2RUFA 2GSRA 2I4AA 3L0HA 1PN9A 5B8AA 3GURA 1QQ2A 1A23A 3LWAA 1HNAA 4HQSA 4ML1A 3BOAA 4DSSA 2H76A 3J7Yk 4DVCA 3C7MA 5C00A 3K8NA 2OACA 1TRWA 3ZVJA 4NXIA 3ZMKA 2P5RA 2L5LA 1VF1A 4F2IA 2H6ZA 2LNTA 3TKSE 2IWTA 5AIVA 2L6DA 2H70A 3HD5A 2N5FA 3VWWA 1TRVA 19GSA 3EURA 1SL1B 4J2FA 1I5GA 3EINA 4CHSA 4E8HA 2IMDA 3O76A 4IP1A 2JU5A 2OE3A 2GQMA 1XOBA 2IL3A 3QFAC 5J41A 2LEGA 3ZIJA 1TDIA 3FZ5A 2E7PA 2OA7A 3GIXA 1JHBA 4N30A 3H4KA 1GSFA 1YY7A 1JLWA 1SD9A 4KE3A 2MMZA 5J3RA 2A2RA 2HE3A 2H30A 2G2QA 1Y25A 3LXTA 4MDCA 2H71A 1FVJA 2L59A 3GH6A 1QMVA 2CZ3A 2GZZA 1ZYEA 5DQYA 3U6VA 2C4JA 4CDOA 5AGYA 3WGDA 3VPQA 3ZIVA 1T1VA 4OCEA 2H19A 2C0EA 3A2VA 2OKAA 4WBJA 3LYPA 3WT1A 4L5LA 3CSIA 1AQWA 4WEYA 3FEUA 1N2AA 4GRFA 3LORA 4OMVA 3GRXA 4MH3A 2CX3A 4HUAA 1XZOA 4O5RA 1A8YA 2BMXA 3C1SA 2HLSA 5ABRA 2FWGA 4NV5A 1TK5B 1GTIA 2LUSA 2CVKA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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