1PRXA

Horf6 a novel human peroxidase enzyme
Total Genus 64
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
64
sequence length
220
structure length
219
Chain Sequence
LLLGDVAPNFEANTTVGRIRFHDFLGDSWGILFSHPRDFTPVTTELGRAAKLAPEFAKRNVKLIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNSEEPTEKLPFPIIDDRNRELAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVFVFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKKLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a novel human peroxidase enzyme at 2.0 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule tags Antioxidant
source organism Homo sapiens
molecule keywords HORF6
total genus 64
structure length 219
sequence length 220
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 1998-04-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.1020.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 Antioxidant, Horf6; Chain A, domain2 1prxA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1prxA01
4GXZA 5ECRB 3Q18A 2MMAA 3F6FA 2BMXA 1DBYA 3IC4A 4OCFA 1PA3A 1ML6A 1YEPA 2YWIA 2X99A 1F6MC 1SL2B 3KXOA 4IHUA 4XCSA 5DJLA 1S3DA 1B8XA 2O89A 3EE2A 2HNLA 4G19A 3APOA 1XZOA 1J9BA 4V2MA 3IPZA 3ERWA 1EV9A 2YANA 2M46A 2JL4A 1O85A 3TKSE 2HI7A 5ECQB 2IMEA 1HQOA 1YY7A 4IW9A 1TI1A 1G7EA 5D8IA 1LBKA 2L6DA 4ML1A 2CAQA 4ILFA 3TJJA 6GSSA 4I5QA 4MF6A 3TRPA 1JHBA 4BVYA 2AV4A 4NMUA 3SBCA 2G2QA 4X43A 3APSA 1VF4A 3CBUA 2YPMA 2NVLA 5EL8A 2N5BA 2X8HA 3I6AA 1OAZA 3LSZA 4HQZA 1DE2A 3F6DA 3UVHA 3ZYWA 3RAZA 1UVZA 1ZOFA 3HXSA 1YQ1A 4V2LA 1JFUA 4WKWA 6GSUA 2V41A 3KM6A 2G0FA 1WE0A 2FY6A 3P90A 1A0RP 1W89A 1XW6A 1M9AA 4K8MA 1V57A 3S9FA 4I6XA 14GSA 1LJRA 5ID2B 3A2WA 3DEXA 1OC3A 2IPAA 4WR4A 3HKRA 3C73A 4ECBA 2DC5A 2FHEA 3QCPA 1ERTA 4I2UA 2B1KA 2BJXA 1T4YA 3IBHA 3D6IA 2AJQB 2MYGA 1BYEA 3CSHA 2GQMA 4TR1A 3L9SA 4IBPA 3M9KA 1EV4A 11GSA 5IMVA 2ALBA 2C3TA 2MZCA 2H1AA 4N0ZA 4FYUA 2K8VA 3F3QA 4DEJA 4QL7A 4EC0A 2B7JA 3QFAC 4OFMA 4WF4A 4ECIA 1TDIA 2C3QA 5GAPD 1TK5B 1Z6MA 1I9DA 4KDYA 1X9SB 1T1VA 4I97A 4NPBA 3M9JA 3ZREA 3P2AA 4NHWA 2YN1A 1YF1A 2HSHA 4CHSA 1PRXA 3QAWA 2MBSA 3F4TA 3VFIA 4JRRA 3PH9A 3HZ8A 2GZYA 5DAKA 5AIVA 2GVPA 6GSWA 1EP8A 4IP6A 12GSA 1G7OA 3C71A 1PKZA 3F63A 1OC8A 1ZYEA 2I81A 1BX9A 3H93A 2V1MA 5IMDA 1VRSD 3F4SA 2WGRA 1V9WA 2OJLA 2CVKA 2GZZA 1XOAA 1GLPA 3KJYA 1SK1A 3J7Yb 1ABAA 3FHKA 2GGTA 2KOKA 3BBYA 1XW5A 5G2ZA 2DIZA 4GQCA 2C80A 2NTOA 1GL8A 1DE1A 3TKRA 3GFKA 4Q5QA 2N5FA 5D9XA 2NPBA 1OE8A 5D9VA 1Z7RA 1E6BA 1RK4A 2WDUA 3NOFA 4TN8A 2FCHA 4FO5A 3CTFA 4G9HA 4RUVA 3ZVJA 4KH7A 4LL4B 2B7KA 4EKZA 4PQ1A 1EGOA 3VPQA 5A4VA 1TRVA 3GYKA 2A2SA 4PQHA 4WXTA 4N10A 2CQ9A 1GSDA 3KTBA 2CT6A 3GRXA 4PNFA 1DUGA 5JWRB 4ISDA 4TR4A 1J0FA 2HZFA 2H72A 4CDOA 1Q98A 2VD0A 5ENUA 4MH2A 1FHEA 4NAXA 5H5RA 1VF2A 2VO4A 4KE3A 4HJ2A 2LNTA 2YV9A 5IO0A 4KGIA 2DIYA 1XVQA 5ECPB 5DQSA 5B7CA 4X0XA 5C00A 2H1BA 1K3LA 2GQLA 4GQFA 2L6CA 4ML6A 3FK8A 3TOTA 3APQA 2VCQA 1GTUA 1FB6A 1GTAA 4NHZA 4BWQA 18GSA 3D21A 4LMWA 1WPIA 4OWYA 1GNEA 5B8AA 1ILOA 2LRTA 3C7MA 5ECHB 4F0CA 5LNKe 2CX4A 5DQYA 2PWJA 2H73A 4BWSA 3W8SA 4OO5A 1GTBA 3CSIA 2VLUA 3ED3A 2ZCTA 2X8CA 2ES7A 3DMLA 2MMOA 1THOA 2E0QA 1YKAA 1V2AA 4GSTA 2PBJA 1USBA 2AUVA 2QGVA 5KN3A 1XWGA 1PGTA 4MF7A 3TCOA 4ZBAA 1EEJA 1JLWA 2IIYA 2JADA 5JWQB 1H4OA 3ZMKA 2DMLA 1PX7A 1Y25A 5G5FA 2H71A 3GKXA 1OKTA 5GZZB 4ZL9A 4NV5A 3HHVA 4JE1A 2H0IA 4QL9A 1XVWA 2KUCA 1T00A 1SENA 5LCZA 5H5SA 1SYRA 4BA7A 2B3SA 2RUFA 1V98A 1AAZA 3M3MA 2GT6A 4OFNA 1GUHA 2CVDA 2B5YA 5IIZA 2F51A 2WRTA 1K3YA 3F8UA 1VF3A 3F9UA 2GSQA 3TB2A 4DSSB 3QAGA 4L5LA 3BCIA 1QFNA 2V6KA 8GSSA 3FZ5A 1FOVA 3GIXA 2H1DA 2X64A 3DRNA 3KMOA 1NM3A 2C0DA 3U6VA 2E2GA 2I9HA 4MP4A 2VCTA 3LORA 4MPFA 1T7PB 1DSBA 1KEBA 4POMA 3MSZA 1FW1A 2EC4A 3LGCA 3H79A 2WULA 4KDUA 1XFLA 1MDIA 3IOSA 5HFGA 2OADA 4KUNA 1TP9A 2B5EA 4IQAA 2PUKC 5AN1A 4HJMA 2YWMA 1QMVA 2EIRA 3UMAA 2GLRA 2XPDA 3V1WA 3IK9A 3VWXA 3VK9A 1HNCA 2TIRA 2R3XA 2H6ZA 3I69A 1XXUA 5INYA 4PXOA 5G5EA 2P0GA 3GUSA 1GSQA 1BG5A 1FAAA 4PQIA 2DJ0A 4LLRA 4KW6A 3EVIA 4JU5A 2H19A 5CAXA 1XOBA 4HDEA 1U3AA 2CX3A 3EYTA 2VL2A 3I43A 1KBNA 4RI6A 5H5QA 2JSZA 3FW2A 2BTOT 3GNJA 1TW9A 2R4VA 19GSA 2YZHA 5DVBA 1WOUA 2WS2A 4YQUA 5CREA 1GULA 2HT9A 5D9TA 2RLIA 4I2TA 1TI3A 5F0GA 1A24A 1XCCA 1M99A 1NW2A 2YJ7A 4F82A 2QSIA 1TK8B 5KN1A 3NZNA 5HR1A 1OC9B 2VLTA 4XTSA 1JZDA 1WP0A 2B5XA 3LWAA 1HNAA 4F9ZA 2R2JA 2YWNA 1H75A 4MLYA 5CRGA 1IYIA 4MMMA 4X1UA 3ZFBA 3ZL5A 4V2NA 2F8FA 2JU5A 2ZUPA 3LFLA 3E9JB 4PUFC 1MTCA 2LV3A 1M2BA 1K0BA 4MZCA 4NWYA 2PN8A 4YQMA 1K0CA 2B1LA 3FKFA 1O73A 2RIIA 2FD3A 2PU9C 4PURA 5D73A 1GNWA 2HZEB 1E2YA 1FG4A 3F0IA 3KIJA 3BOAA 1MD4A 2GS3A 3O76A 2CA8A 2HLSA 2VLVA 2A4VA 2P5RA 1FB0A 1NHOA 3GKNA 3HJOA 4RQRA 2C0GA 3KP9A 1ZCPA 1PL2A 3RBTA 2F9SA 4ZB8A 4V1Ag 2D2ZA 5ABRA 2YOIA 2FWHA 2IFQB 3HVVA 2DLXA 3HCZA 2O87A 1PX6A 5JWOB 3VURA 4E8HA 3M1GA 1K3OA 1SK2A 4DSSA 3TRQA 1WMJA 1T4ZA 1NHYA 5FWGA 3LYPA 3UEMA 4FYBA 1XWAA 3QPMA 3GHAA 2NBSA 3DKSA 2C1YA 4OCEA 4POBA 5FHIA 5CNWA 1K0DA 4AJ7A 2YJHA 2JZTA 4HOJA 2M80A 2QC7A 1ACVA 1K0NA 1Y6EA 4KAEA 2TRXA 4O7HA 3MAKA 3F4RA 5IO2A 3CXGA 1A2MA 3U5RE 2CAIA 1ZYQB 1XWBA 1T3BA 4GSSA 1O8XA 1AQVA 2KHPA 1Z5YE 3BD2A 3TUEA 1U6TA 1EOHA 3JCML 4P3YB 3TJFA 3VLNA 2JZRA 5DDLA 2L57A 2MMNA 4AGSA 3IE3A 3TKSA 2LTKA 2LEGA 22GSA 2VCVA 5CO3A 3KD0A 1EOGA 3E0UA 2C0FA 3ERFA 2C0EA 5AISA 3DGQA 1Z3EA 3KH7A 4QQ7A 2AB6A 4JZQA 4K7IA 5A5KA 4GLTA 1AXDA 4IKHA 3RDWA 2H74A 1WWJA 5JCWA 6GSXA 3HVSA 4WF5A 3FY7A 3VI5A 3ERGA 3EINA 4DSQA 3HVXA 4ULXA 1TJDA 5IMZA 3C1RA 5ECOB 3FR6A 4YAVA 2QKEA 4N0VA 4EXJA 4HUAA 2M72A 2K6VA 1ON4A 3PR8A 2IMFA 3TJKA 2VCXA 3G7JA 1XPVA 4KSMA 1G6YA 2CZ2A 2YP6A 2IN3A 5IPHA 1YZXA 3L4NA 1F9MA 5HR2A 5F8BA 3QFBC 1ZGNA 1HYUA 4EF0A 1U88A 2WJUA 3LQ7A 1QXHA 1T8EB 3GSSA 1URMA 2FWGA 5G31A 3GTUB 3L78A 1A0FA 3DWVA 2R5GA 4ZB6A 4IVFA 2IWTA 3VPTA 1GTIA 1S3AA 10GSA 4ECJA 1SL1B 3F3RA 3WGDA 4BVXA 4OO4A 5F05A 5HR3A 3G7IA 1ZMAA 1XWKA 1BQ7A 2XBIA 2O7KA 5GSSA 1O81A 2VOCA 1ERWA 2GSRA 2A2RA 2WFCA 3IK7A 3G7YA 2B6MA 2C4JA 2HZEA 4RQXA 3GX8A 3VWUA 3DD3A 4CW9A 2VAFA 4GCIA 4TR3A 4KNDA 4GSNA 5J3RA 1N2AA 4J57E 4EL1A 2H0GA 4XRAA 4K0NA 4OMVA 1RQMA 2VCWA 3EC3A 4JBBA 1MDJA 4ZBDA 4EE0A 2H75A 5ID2A 1PMTA 2VL3A 2F8AA 5G1LA 1YF0A 4MJBA 1B4QA 2FUG2 2DJ2A 1TU8A 2H0HA 1R26A 4KDXA 4IS0A 1HNBA 3KEBA 1V58A 3O3TA 2VM1A 1OVNA 1A8LA 3FRCA 5ECIB 2K9FA 4ZIJA 4TVEA 5G30A 1MDKA 3HA9A 1SD8A 5CRDA 1TOFA 5EVOA 5ELGA 4WEYA 3KMNA 4ECCA 3KH9A 4J2FA 4TR0A 5JCGA 4IN0A 1F3BA 1GUKA 4MH3A 1Z7PA 3ZLPA 3KCMA 5ECLB 5E59A 4XIHA 1I5GA 2VL2C 5A4WA 2X8GA 3UL3A 2K8SA 5J9BA 2AYTA 4N30A 2O85A 2GZPA 4TXOB 4LL1B 4KX4A 1GP1A 4FH8A 3MWHA 3KP8A 2XC2A 1R5AA 4WR5A 5GSTA 2E2MA 2JSYA 4Q5NA 4WETA 5IM9A 1SD9A 1PKWA 4L0UA 3LG6A 4EDYA 2P31A 1QQ2A 3C8EA 3A3TA 5DJMA 3VWWA 2FA4A 2L5OA 4L0WA 3TJBA 3D0ZA 1SKRB 1ZZYA 4XS4B 3GKMA 3CMIA 2JACA 3CSJA 3IAS2 2N5AA 1WIKA 1KNGA 1OE7A 2LNSA 2HRNA 1CQHA 3TKPA 2IL3A 4K7NA 4O32A 1SJZA 1R4WA 5COHA 3CRTA 2DMMA 2LJRA 2V32A 2LRCA 2OA7A 1X5EA 3MDKA 3J7Yk 13GSA 4N11A 3BJ5A 5C04A 4IQ1A 3UJ1A 3QOUA 4JR6A 4TR1B 2O8VB 2DJKA 3M8NA 3G9BA 1TXXA 2MBTA 2KP1A 1VF1A 1MD3A 3ZIVA 5EY6A 1G0TA 3DIEA 2HXKA 5IPGA 1TRUA 5JCUA 3DVXA 2HSYA 4MA9A 4AJ8A 5DALB 4GRFA 3TOUA 1TRSA 2J9HA 4K1FA 5KN2A 1EP7A 2GDRA 1GWCA 3RPNA 1QUWA 5HFKA 5AGYA 2JZSA 3WYWA 1U87A 5D96A 2EIQA 3GH9A 2H70A 1BEDA 1EEMA 4G2EA 1B9YC 1TRWA 3D4MA 2L4CA 1AC1A 1KTEA 3C1SA 4HU7A 9GSSA 2VD1A 3D22A 3P8WA 3DYRA 4I8BA 4LMVA 4KSOA 5L71A 1GRXA 3FR3A 4D73B 2RM5A 4ZXGA 4K7OA 3TGZA 1O6JA 4LA1A 3FZ4A 4TXVA 3VI7A 2LUSA 2GQKA 2IMKA 1JLVA 3ZIJA 4MJEA 5F06A 3FZAA 5AIXA 4DSRA 4K9ZA 1G6WA 3UAPA 3AY8A 4ZB9A 1AUCA 3TRXA 1TKDB 2PVQA 4K0GA 1UN2A 3BCKA 2DJJA 3M0FA 3WGXA 3DVWA 3HY2A 1GH2A 3TKSC 1AQWA 4AF2A 3IHQA 2HFDA 3GA4A 2F3MA 3WGEA 3KTLA 2OKAA 5KEJA 3FEUA 2XHFA 1PN9A 1SU9A 4POLA 4PUAA 2AHEA 1K0OA 3UARA 3RPPA 1UC7A 3HJMA 4L8EA 1Q4JA 4TXOA 5IOXA 2IJYA 3NIVA 3IAM2 1XW9A 2LJKA 1AIUA 1PD21 3GURA 1OYJA 3UIWA 4KA0A 4TOPA 5G1KA 5J4UA 2PERA 2P5QA 3US3A 1B48A 3IR4A 3L9VA 2DJ3A 3A5WA 3RHBA 2XBQA 5J41A 1C72A 1SKSB 3W8JA 4YAPA 2H6YA 3IA1A 4HEA2 2OBIA 1SYXA 3FR9A 3LEFA 1O8WA 4XS4A 3IXRA 4F2IA 4HZ2A 4EUYA 2R6KA 2CVBA 4XRDA 4IP1A 1B4PA 4IGJA 1W4VA 2FWEA 3D5JA 3GV1A 2LQOA 5J9CA 4TRXA 2H01A 4ZL8A 4F03A 4MF5A 1WJKA 3L0HA 4ZL7A 3IV4A 3PGTA 3RHCA 4MDCA 2HYXA 2LS5A 4MABA 1UA5A 4G10A 3HYPA 2I1UA 2WB9A 5HFIA 3ISOA 6GSVA 1ERUA 4NXIA 1A2LA 4EDZA 4KCEA 3GH6A 2YCDA 3WT1A 3IRAA 3LXTA 1PSQA 2H76A 3H4KA 4MCUA 2VCZA 5B6NA 3EURA 2GSSA 2KLXA 4Z7XA 3SWLA 2GT5A 3GSTA 1NSWA 1QGVA 3EU4A 3HZ4A 2C3NA 5ECKB 1ERVA 2R37A 1FVKA 1XIYA 2I3YA 3QR6A 4GF0A 4OD7A 5CYYA 4PX1A 3OR5A 1QK8A 5DALA 3D4TA 2VM2A 5ECSA 2ZNMA 1HD2A 1PQNA 2OBKA 5CRHA 2H66A 1SK0A 4BL7A 4RI7A 2VL9A 1GSFA 4TW5A 2I4AA 1M9BA 2DJ1A 4Q5FA 1JZOA 1A23A 2PGTA 3ME7A 3QAVA 1JZWA 1FO5A 2FA8A 1XWCA 4ID0A 4FYCA 3LJRA 3UVTA 2OE1A 4V1Ap 5ELAA 6GSTA 4D73A 2H8LA 4GWRA 4HU9A 4OFTA 3TKQA 4WBRD 3IDVA 2YZUA 2HRFA 5ECNB 2E7PA 4BPYA 1VGLA 3KGKA 2FNOA 3EWLA 5B8BA 4O92A 3CRUA 2C8UA 4ZBBA 3WD6A 1F3AA 2EIOA 2OACA 1OC9A 2LJAA 3GN3A 4MZBA 4WBJA 1SJIA 3PINA 5B6MA 1SKWB 2K18A 1AW9A 3LXZA 3HD5A 3QDNA 5DCHA 3GMFA 1WRYA 3Q74A 3TJGA 4XS6A 1SL0B 4NV2A 4HI7A 5F07A 2PVOC 1LU4A 4L5OA 5CP1A 2RM6A 4J56E 1XBSA 1OKDA 3EMXA 3WT2A 3ZRDA 3EMPA 4K2DA 2LQQA 1YKCA 1M7TA 3Q19A 3FZ9A 3N5OA 1J08A 4MJCA 5ECMB 5HQPA 4KB3A 3DXBA 3N9JA 2IFQA 1PL1A 5GAND 4GTUA 17GSA 1BJXA 1SJ6A 3LYKA 3A2XA 1CQGA 3KZQA 1V40A 3ME8A 4XS1A 2V2GA 3TDGA 2IMIA 2HE3A 4HQSA 5IMAA 1YDKA 1X0RA 3ZVJD 4POKA 4DVCA 5KN0A 4K6XA 2YV7A 5HR0A 1K0AA 6GSYA 1EGRA 1GLQA 1AQXA 16GSA 4F0BA 2DBCA 4JEDA 3FYGA 5D93A 1X9WB 3O6TA 20GSA 1A8YA 1M0UA 4TKYA 4MK3A 4MZWA 3GL3A 2OE3A 3H1NA 4XHMA 5DCGA 1GSSA 2ON7A 1M2DA 1GSYA 3ZZXA 2CV4A 2XPEA 2J23A 4PNGA 1EWXA 4YH2A 7GSSA 1R7HA 3GX0A 5IMFA 2AAWA 3ZFLA 1TK0B 4HZ4A 2YWOA 5CRWA 3ZTLA 1A2JA 4YQVA 1N8JA 2LKUA 2GSTA 1JZRA 4Q5RA 2REMA 2YNXA 5EPFA 1M2AA 5IQYA 2GTUA 1MEKA 5IMCA 4HS1A 2WCIA 1Z6NA 4AJ6A 3Q6OA 2CZ3A 1ZL9A 2V6OA 1IYHA 2DSAA 1THXA 1S3CA 1R5PA 4MPGA 2TRCP 3K8NA 1Z9HA 1F37A 3W6GA 3QD9A 3P7XA 1GSEA 4O5RA 2OE0A 3L9UA 1RW1A 4IJIA 2PPTA 2L4QA 3A2VA 5A4UA 3GKKA 3VWVA 2MMZA 3E3EA 1YEXA 1O7UA 2FWFA 1TTZA 3ZITA 3CTGA 2VUPA 5E4WA 1TU7A 1GSUA 4IJ3A 3GTUA 4EVMA 2RUEA 5J5NA 2PMTA 3GL5A 3UOMA 4IELA 2L5LA 5D9WA 1BAYA 4ZILA 3H8QA 1FVJA 1F2EA 1ST9A 4ACSA 1X5DA 1YJ6A 1X5CA 3UBLA 2ON5A 4KCAA 5IOWA 3R2QA 1GUMA 3MNGA 2FGXA 2NDOA 2H6XA 3EU3A 3HJPA 5DBQA 4JR4A 2H30A 4MJAA 2LSTA 2Z9SA 5FT3A 3I9V2 4EO3A 4PGTA 2H1GA 4H86A 1K0MA 2FLSA 1EZKA 3UBKA 1U3IA 3CYNA 5DAKB 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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