1QQ2A

Crystal structure of a mammalian 2-cys peroxiredoxin, hbp23.
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
173
structure length
173
Chain Sequence
SGNAKIGHPAPSFKATAVMPDGQFKDISLSDYKGKYVVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFSDRAEEFKKLNCQVIGASVDSHFSHLAWINTPKKQGGLGPMNIPLVSDPKRTIAQDYGVLKADEGISFRGLFIIDDKGILRQITINDLPVGRSVDEILRLVQAFQFTDKHGEVCPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a multifunctional 2-Cys peroxiredoxin heme-binding protein 23 kDa/proliferation-associated gene product.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords THIOREDOXIN PEROXIDASE 2
total genus 51
structure length 173
sequence length 173
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 1999-06-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1qq2A00
3DD3A 5G1KA 2DJ2A 1M99A 1F37A 2X64A 2XBQA 2DMLA 1V2AA 3HZ4A 1MDKA 3APOA 4E8HA 4ZILA 1EGOA 4G2EA 1DE2A 4Q5NA 3G9BA 1THOA 4MF6A 2J9HA 3C1RA 2IN3A 5IMDA 2HT9A 1QGVA 3IXRA 3D5JA 4TXVA 2HNLA 5AISA 1JLWA 1X0RA 4F03A 1B4QA 1J9BA 2VCQA 4H86A 1SJ6A 4MP4A 2PU9C 3GHAA 4EF0A 3EC3A 3ZRDA 4L5OA 2AJQB 4ZB6A 1K0BA 3KMOA 1Q98A 4I97A 2DJKA 2B5YA 2HZEA 1ERTA 2ZCTA 4MJBA 4PX1A 2YV9A 3GX8A 5DVBA 3P7XA 4ZBBA 1OKDA 1A0RP 4I5QA 2LQOA 5HFKA 3CMIA 1S3DA 3A5WA 3GNJA 4KDXA 4QL9A 3QAWA 1JHBA 1SENA 4KE3A 2C0DA 3L9SA 4POLA 3GUSA 1PGTA 5D9TA 2IMKA 5F07A 1BJXA 4NPBA 4AJ7A 2HRFA 4PGTA 1ZCPA 1OKTA 1W4VA 5F0GA 2O85A 2AUVA 3EMPA 5D9WA 2HI7A 3GTUA 1A2LA 5JWRB 1JZRA 1KEBA 3FYGA 5DJMA 1TK5B 5JWOB 5E59A 1Z6NA 2AHEA 2TRCP 2IL3A 2G0FA 2JZTA 5GZZB 4WKWA 1K0AA 1BG5A 4WBJA 4OFNA 5DQSA 3IOSA 3GL3A 5E4WA 1SL0B 4MZWA 4KAEA 1DBYA 1J08A 2OA7A 2VCWA 1GSDA 3WGXA 2I1UA 3CRUA 1PKZA 2XPEA 5DCGA 3F63A 1OE7A 3C8EA 2R2JA 5HR0A 1K0NA 3F4RA 3KTLA 2LSTA 4BVXA 3I9V2 4ZIJA 4ECBA 2HZEB 2NPBA 2DJ3A 4I8BA 2EIQA 5H5QA 3APSA 1AQWA 2B5EA 2EIRA 1SL2B 2AB6A 1YY7A 1YKAA 1PX6A 3QMXA 4KCAA 1Z7PA 3C7MA 5IO0A 4MJAA 4PUAA 3APQA 5CAXA 3HDCA 4RUVA 2PVQA 2I4AA 1WE0A 4TW5A 3ZZXA 3GSTA 3IAM2 1LBKA 3FZAA 5D9VA 5HQPA 4KSOA 1X9SB 3D22A 4MA9A 4JEDA 1V9WA 3BOAA 4PURA 4GCIA 4E8EA 3ZIVA 1GNEA 13GSA 3IA1A 1OE8A 3TOTA 2H0HA 3ERFA 5H5RA 2GSRA 2A2RA 2V6OA 1ZOFA 2GQMA 3GTUB 6GSSA 5L71A 4ACSA 4F0CA 2XC2A 3WT1A 3MAKA 1RQMA 3FKFA 3P90A 1A2MA 1FG4A 4IGJA 3WGEA 1EOHA 3L9UA 5ECOB 3F6DA 1C72A 3EINA 2VM1A 2H1AA 1YZXA 2N5BA 4ZBAA 4EUYA 1URMA 1TRUA 2CVBA 4K7IA 4F0BA 5G2ZA 3PH9A 3IDVA 2VL2A 1R5AA 4WR5A 3UARA 5G5EA 3FZ9A 4XTSA 3IHQA 4GQCA 1H75A 1YDKA 3VWUA 1FHEA 3FR6A 2AAWA 2E2MA 4HQZA 4PQIA 2O89A 4YAPA 2WDUA 4TR1B 4PNFA 1MDIA 1PMTA 1PQNA 1AAZA 4ZL8A 5GSTA 3CXGA 4ID0A 3QOUA 3LQ7A 1JFUA 5B7CA 5DBQA 19GSA 1O8WA 4I2UA 6GSYA 2H1BA 4L0UA 4HJMA 2CV4A 2O87A 8GSSA 1F2EA 4KA0A 1R26A 4GRFA 3UIWA 2NVLA 2IIYA 4L0WA 4PUFC 3M8NA 2K8SA 2O7KA 1EP8A 2FWEA 2RM5A 1FO5A 2BMXA 4NMUA 2FA4A 3KIJA 4XS6A 1KBNA 1M2BA 4MPFA 2Z9SA 2IMIA 2WFCA 1OC8A 1K0MA 3KJYA 5IPHA 4DEJA 1XOBA 1A8YA 1U3IA 1GUHA 5G5FA 3E0UA 2H72A 4I6XA 5LNKe 2R6KA 2HYXA 3NZNA 2XPDA 3IAS2 1XIYA 2DJ1A 2NBSA 4OWYA 1GSSA 2K6VA 1TW9A 1GRXA 5B6MA 2GGTA 1ZYEA 1TXXA 1GSEA 1PD21 1T4YA 2LEGA 1N8JA 3DWVA 4KGIA 3CRTA 3VFIA 3ZMKA 3A2XA 4O7HA 1U3AA 2JZRA 3LGCA 2CX4A 4Z7XA 3ZYWA 5ABRA 3KP9A 2GQKA 1K0CA 1WWJA 2DJ0A 1MD3A 4IN0A 4BA7A 1TRWA 4F82A 5IMZA 2VL3A 4BVYA 1QK8A 2IMFA 2YV7A 1FVJA 1WRYA 1Z6MA 3LYPA 3TJGA 4EC0A 3N5OA 1HYUA 1SKRB 2CAQA 5CNWA 1SL1B 4J56E 5INYA 1K3YA 2QGVA 3D4TA 1O73A 2GSTA 2E0QA 1ZL9A 1WJKA 2VAFA 3IC4A 3GMFA 2CVKA 2VCTA 3LYKA 3VWXA 5DJLA 1THXA 3ZITA 5D93A 2YWNA 3KZQA 2GZZA 1V98A 4FYBA 2JZSA 1WIKA 3MNGA 3H4KA 3ZVJA 3F8UA 1NM3A 1EP7A 5KN3A 2V6KA 2L5OA 5KN1A 4N0ZA 4O32A 5F05A 2L6CA 2H6YA 5ECSA 4JRRA 3H8QA 3MDKA 3GV1A 3VK9A 1O81A 2WRTA 3GH6A 2FLSA 2HZFA 3ISOA 1KTEA 2GZPA 3NOFA 5ID2A 3VURA 4MZCA 3EU3A 3LWAA 2AV4A 4IS0A 2DC5A 2L5LA 1A2JA 3DVXA 1FB0A 4K7NA 2HFDA 2L57A 2ON5A 3Q19A 4RQRA 1U88A 3GA4A 5LD0A 2DIYA 2K9FA 1WOUA 1TK8B 1GTAA 5IMAA 2HXKA 4CDOA 2ZUPA 4QQ7A 2GTUA 4NV5A 2C0GA 1JZOA 2VCZA 4XS4A 2DIZA 2WCIA 3RPPA 1PRXA 1GSUA 2FCHA 5G31A 4QL7A 2REMA 2OBKA 3SBCA 5HR1A 2FNOA 1M0UA 3M9JA 4Q5QA 1EV4A 2G2QA 4K0NA 3GL5A 3FZ4A 1EEJA 4J57E 4ISDA 5ECPB 5J3RA 3HHVA 3IR4A 20GSA 5DDLA 1T4ZA 3ME8A 4TRXA 4EXJA 1YF0A 2RUEA 2PERA 3EWLA 2P0GA 4G19A 2C8UA 6GSWA 3H79A 4HUAA 2JADA 4TKYA 3G7JA 3O6TA 5C04A 3BCIA 2C80A 3WD6A 3KH9A 4MZBA 4HDEA 1JZWA 1F3AA 2LUSA 5COHA 1GSFA 1VGLA 2FA8A 2FGXA 3VWVA 1EZKA 5ID2B 3OR5A 2BJXA 3L4NA 5CP1A 1A23A 4FYCA 5JCUA 3QFAC 2KLXA 1QMVA 3U5RE 1XW5A 2E7PA 4EO3A 1SYRA 4X0XA 1R7HA 4JZQA 3HVSA 5CRWA 5AN1A 4F9ZA 1ACVA 2F51A 1RW1A 2CZ3A 5IMCA 4XCSA 5FHIA 4IJ3A 4LLRA 4ECCA 4XS4B 4DVCA 1B48A 4OFMA 1NSWA 4WETA 3C73A 4D73B 1FW1A 1ON4A 2JACA 1UN2A 3RAZA 4K0GA 3F6FA 4DSRA 2H75A 18GSA 2C4JA 3FRCA 4HEA2 4RQXA 1PL1A 2CQ9A 2YWOA 1G7EA 1M9AA 4ML1A 1XWGA 1K3OA 4P3YB 2B6MA 1Z5YE 2R4VA 2MMOA 2OJLA 3EVIA 2HSHA 4FYUA 2BTOT 1BEDA 3IBHA 2MMNA 3F3QA 4JR4A 3UJ1A 2OACA 5IMFA 1TI1A 3RHCA 4FH8A 4PNGA 1LU4A 1Q4JA 3GKXA 5FWGA 4GQFA 1TRSA 3QAVA 4XS1A 1FVKA 2B7KA 2JSYA 1S3AA 4EDZA 3TKSC 3GFKA 5CRDA 1ERVA 2YJHA 1GTUA 2X8HA 4WF4A 1CQGA 1GNWA 2GVPA 3U6VA 3QCPA 2YP6A 1Z7RA 1BYEA 1ILOA 4GF0A 3RBTA 2VD1A 1VRSD 2L6DA 4XRAA 2CAIA 2VLVA 4MF7A 3ZL5A 1PX7A 1O8XA 3H93A 3BCKA 5ECMB 4KUNA 2WZ9A 3QPMA 1GSQA 4HQSA 3H1NA 2H6ZA 2FWFA 2K18A 3UL3A 2VIMA 3TB2A 4L8EA 3W8SA 4IELA 2YANA 2DSAA 4TVEA 6GSTA 2YNXA 2PGTA 2MMZA 1XOAA 4MLYA 5IM9A 2O8VB 2YPMA 4N11A 1DSBA 2IWTA 2A4VA 1IYIA 3KXOA 2C0FA 4LMWA 3LJRA 1F3BA 3IK7A 3TRQA 5EPFA 2KP2A 2IFQA 3QD9A 1GH2A 4RI7A 3W6GA 4IKHA 1M2AA 3I43A 6GSXA 3ZREA 1PKWA 4KB3A 4K8MA 3TJKA 2GT5A 3LEFA 4TR3A 3GX0A 1K0DA 1X9WB 1DE1A 4EDYA 2PN8A 1YJ6A 3A2VA 2LKUA 3RDWA 4HZ2A 2CX3A 2C0EA 3GURA 4HI7A 3JCML 2YJ7A 3E3EA 16GSA 3KD0A 2VCVA 2X8CA 2GSQA 1ST9A 2WULA 1K3LA 5JWQB 14GSA 3J7Yb 2ALBA 5AGYA 4N0VA 2R37A 4F2IA 3KGKA 2YWIA 1GLPA 1M2DA 3KTBA 2H66A 4V2MA 1SKSB 3TKSE 3DVWA 1XWBA 17GSA 3CBUA 3ZVJD 3TKRA 4WR4A 3ZTLA 1SKWB 3AY8A 2DMMA 3A3TA 1Y25A 1V57A 3DEXA 4OD7A 1VF2A 2LJRA 5EL8A 1TTZA 5AIVA 4I2TA 5IQYA 5KN2A 2LV3A 2L59A 5B8AA 2GQLA 3IPZA 1K0OA 2B1LA 2M46A 3GH9A 1T1VA 1VF3A 2H70A 4MJCA 2LNSA 1AUCA 4K1FA 4KH7A 4DSSA 3RPNA 5ECQB 2VD0A 1XFLA 5CRHA 2PVOC 3G7IA 2CVDA 4N10A 1TU7A 3TRXA 5D8IA 2GS3A 2H0GA 1HD2A 4ML6A 4YQVA 1AC1A 2DBCA 4KNDA 4KX4A 4ZXGA 2QKEA 4NWYA 1XBSA 3D4MA 2HLSA 1ZMAA 1GP1A 5EVOA 3US3A 4OCFA 4MCUA 10GSA 5CYYA 4IQAA 4EVMA 4Q5FA 2FWHA 2OE1A 3RHBA 3FK8A 5J9CA 1YF1A 1TRVA 2C1YA 4IJIA 5JCWA 2VO4A 3FZ5A 2OBIA 2FWGA 3FW2A 3SWLA 1EWXA 1MDJA 1T8EB 2DLXA 9GSSA 1G7OA 2VOCA 2IJYA 1LJRA 4FIWA 5IOWA 1R4WA 4MH3A 2R5GA 3EURA 3IRAA 1G6YA 4GSNA 1XWAA 3ERGA 2F9SA 4NHWA 4CW9A 4TR0A 1X9MB 5ELGA 3G7YA 1ABAA 2B7JA 4G9HA 4HOJA 5HR2A 3EU4A 2YWMA 1YEXA 3LFLA 4DSSB 3Q6OA 2AYTA 4ILFA 1PSQA 1E2YA 2XBIA 5KEJA 2J23A 1TDIA 3HJMA 2KOKA 3QAGA 2GDRA 1ZYQB 3TGZA 3TOUA 5F8BA 1TP9A 1B9XC 2YN1A 2N5AA 2PMTA 1QUWA 3ERWA 3A2WA 3HJOA 1PL2A 1SD9A 4YH2A 4HZ4A 1TOFA 5J5NA 1USBA 5A4VA 1GUMA 3M1GA 2OADA 4WF5A 2VUPA 2LQQA 3ZFBA 1OC3A 2GT6A 3PGTA 2VCXA 2YZUA 5J9BA 2YZHA 3HCZA 1EV9A 3EE2A 3MSZA 2ES7A 3C1SA 1TK0B 2MMAA 2C3TA 4MH2A 2X99A 2NTOA 2JSZA 2VL2C 3PINA 2JU5A 4LA1A 5ECHB 5LCZA 2H8LA 3EYTA 3QDNA 4GWRA 4TXOA 1S3CA 11GSA 1AQXA 2LRNA 4O92A 5ELAA 4WEYA 4HU7A 1O7UA 5IOXA 1MEKA 4AJ6A 3VI5A 6GSUA 3CTFA 3F9UA 5CRGA 2TRXA 3Q18A 1XZOA 5G30A 5G1LA 4V2NA 1YKCA 4K6XA 3WGDA 4ZL9A 1QXHA 1HNCA 2V1MA 1X5CA 2IMEA 1GL8A 3HKRA 3O3TA 3HY2A 2LRCA 3F3RA 1TI3A 1EOGA 5A4WA 5IMVA 1GLQA 2KUCA 1W89A 1J0FA 1MTCA 4EKZA 1MD4A 1A24A 2A2SA 2PPTA 3GKNA 5DQYA 1UVZA 1EGRA 4BWSA 2H01A 3F4SA 4FO5A 2MYGA 2QC7A 3WYWA 4OMVA 1OC9A 4GXZA 3J7Yk 4POMA 5D96A 4PXOA 3V1WA 1M9BA 2P5QA 1IYHA 2H6XA 2LJAA 1JZDA 2LS5A 2VL9A 2LTKA 1FAAA 4GLTA 2KHPA 1TJDA 3W8JA 3IV4A 3DRNA 5D73A 5H5SA 4RI6A 2I3YA 3TCOA 2RUFA 1SJZA 4JU5A 1GSYA 4TXOB 2FUG2 4KDUA 4XHMA 2B3SA 4WBRD 1CQHA 1TU8A 2M72A 2L4QA 1XWCA 1JLVA 1E6BA 2EC4A 4YQUA 1B9YC 3CTGA 3ME7A 1XVQA 1UC7A 4OO5A 3BD2A 3BJ5A 4MMMA 2DJJA 3VWWA 5FT3A 2PWJA 5A5KA 3O76A 5J41A 1RK4A 4NHZA 1OVNA 3GRXA 2LNTA 3VLNA 3HZ8A 1Z3EA 4EL1A 1WMJA 5B8BA 2D2ZA 1SD8A 2RM6A 3E9JB 5IIZA 1VF1A 1PN9A 1BX9A 4LL1B 1NHOA 5D9XA 3CYNA 1ML6A 4IHUA 4BPYA 1SYXA 3S9FA 1FOVA 1NHYA 4KDYA 1ERWA 3IK9A 4V1Ag 1SU9A 2F8FA 2MBSA 3ZLPA 1GTBA 1U6TA 3UVTA 1BAYA 3KH7A 2F3MA 3TRPA 2GZYA 5IO2A 4HU9A 3GN3A 3QR6A 3GIXA 2H74A 1OAZA 1GULA 4TR4A 4TR1A 1OC9B 3KP8A 4OFTA 5EY6A 1GUKA 1ZGNA 4ZB8A 1T00A 2FHEA 3I6AA 4NXIA 1AXDA 2WB9A 5A4UA 3FR9A 4OO4A 1UA5A 4HJ2A 1U87A 4POBA 2K8VA 4TOPA 2P5RA 5GAPD 2TIRA 3UEMA 4MK3A 3I69A 4NAXA 3DKSA 2HSYA 2WS2A 3UBKA 3M3MA 4BWQA 4N30A 2ZNMA 2X8GA 1XW9A 2VM2A 2MZCA 2VLUA 3N9JA 12GSA 2PUKC 3HXSA 1FB6A 1HNAA 3DXBA 1T3BA 2CT6A 2KP1A 2OE0A 1ERUA 2IMDA 1XXUA 3C71A 22GSA 1M7TA 5DALA 5ECKB 4LL4B 4ULXA 5GAND 7GSSA 3HVXA 6GSVA 1XCCA 3GKMA 4L5LA 2CZ2A 1N2AA 2H1DA 3P8WA 3Q74A 2H1GA 3FR3A 2YOIA 1XW6A 4MABA 4JE1A 4KW6A 3ED3A 1XWKA 3UAPA 1I9DA 2H73A 1X5DA 2HRNA 1SK0A 1SJIA 4IBPA 3F0IA 2GSSA 2VLTA 2H30A 3HJPA 3PR8A 4V1Ap 5HR3A 1VF4A 2EIOA 2B1KA 5CREA 1A0FA 1AQVA 3GKKA 2C3QA 2V32A 2V41A 5J4UA 3ZFLA 5ECNB 3LG6A 1EEMA 4XIHA 1HQOA 1ZZYA 4CHSA 1SK2A 4MPGA 4AJ8A 3UBLA 1XVWA 4XRDA 3F4TA 4IVFA 2RLIA 3ZIJA 4X1UA 3HA9A 1QQ2A 1Y6EA 3UOMA 5ECLB 2PBJA 3LXZA 5DAKA 5B6NA 1X5EA 3DIEA 4YQMA 3KEBA 4GSTA 2IFQB 4IP6A 4GSSA 4K9ZA 3KM6A 4MDCA 3R2QA 1I5GA 2WGRA 2LRTA 5C00A 5DALB 1XPVA 1O85A 5GSSA 4HS1A 4Q5RA 2H0IA 3TKPA 4X43A 5CO3A 1OYJA 3CSHA 4POKA 4J2FA 3TJFA 3UVHA 4K2DA 2I81A 4ZBDA 1F6MC 4WXTA 4ECJA 4AF2A 3NIVA 1NW2A 1AW9A 2V2GA 1B8XA 3L78A 2I9HA 3LXTA 1AIUA 4MF5A 1H4OA 2C3NA 3L0HA 4MJEA 3GSSA 2FY6A 3VPQA 5HFGA 3WT2A 1BQ7A 3FY7A 2JL4A 4ZB9A 2NDOA 1V40A 3FEUA 4DSQA 3VPTA 3CSIA 3DMLA 3DYRA 2YCDA 4NV2A 1YQ1A 2CA8A 1T7PB 4O5RA 5ECRB 1HNBA 2P31A 3TJJA 2E2GA 3VI7A 4K7OA 3M0FA 3LSZA 3TKSA 2N5FA 2HE3A 2ON7A 2H19A 3TJBA 3FHKA 1GWCA 5IPGA 3D6IA 2OE3A 4IQ1A 5DAKB 2IPAA 4EE0A 3BBYA 1QFNA 1V58A 3MWHA 1GTIA 3KCMA 1DUGA 2RIIA 1R5PA 3EMXA 1WP0A 5AIXA 3GYKA 4JR6A 3LORA 3D0ZA 1PA3A 2WJUA 4IP1A 1G0TA 3D21A 1O6JA 2QSIA 4ECIA 2H71A 5HFIA 1B4PA 4KSMA 4G10A 4AGSA 4KCEA 1SK1A 1G6WA 4IW9A 4PQ1A 2LJKA 3HVVA 3HYPA 1A8LA 3TDGA 3K8NA 2B5XA 3P2AA 5F06A 1WPIA 3CSJA 3KMNA 3TUEA 1TKDB 4YAVA 3IE3A 4BL7A 5DCHA 2M80A 2R3XA 2OKAA 3DGQA 3HD5A 2XHFA 4TN8A 1KNGA 5KN0A 3L9VA 5ECIB 3M9KA 2GLRA 2L4CA 2MBTA 5JCGA 4GTUA 4ZL7A 3QFBC 3TKQA 2F8AA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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