1T4ZA

Solution structure of the n-terminal domain of synechococcus elongatus sasa (25-structures ensemble)
Total Genus 19
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
19
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
GSSLSPQALAQPLLLQLFVDTRPLSQHIVQRVKNILAAVEATVPISLQVINVADQPQLVEYYRLVVTPALVKIGPGSRQVLSGIDLTDQLANQLPQWLVQQEGIF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure of the N-terminal domain of the circadian clock-associated histidine kinase SasA.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Adaptive-response sensory-kinase sasA
molecule tags Transferase
source organism Synechococcus elongatus
total genus 19
structure length 105
sequence length 105
ec nomenclature ec 2.7.13.3: Histidine kinase.
pdb deposition date 2004-04-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07689 KaiB KaiB domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1t4zA01
2VL9A 4ZL7A 2LS5A 1KBNA 2EC4A 3DXBA 3K8NA 1T4ZA 3GSSA 5AIVA 3UIWA 1QMVA 2O8VB 3P90A 1ERTA 2FGXA 2MMOA 3R2QA 2I1UA 3GH9A 4QQ7A 2VOCA 4IVFA 4XS4B 5FWGA 1H75A 3ISOA 2XC2A 3MDKA 2X8HA 1NM3A 4LLRA 2AV4A 1M2AA 1FVJA 2GT6A 5G1LA 2QGVA 3CSIA 7GSSA 2DIZA 3E3EA 1LBKA 2KHPA 5IO0A 1F6MC 3QAVA 2VM2A 4OMVA 5JWQB 1TI1A 1XWKA 3DKSA 1OYJA 4OFMA 2XPDA 2RM5A 2HSHA 1TI3A 4GTUA 4MK3A 3P2AA 1XPVA 4PQIA 4MZBA 4X1UA 2VL2C 1XCCA 1JFUA 2I3YA 5DQYA 5IMAA 2VCZA 3L78A 1K3LA 3ZFLA 1V57A 5A5KA 1F2EA 3ZZXA 5JWOB 2OADA 1SJZA 2VCVA 1XW9A 2EIRA 2LNTA 1AQVA 1AQWA 4ZBAA 3BJ5A 4Q5QA 1R4WA 3AY8A 1BEDA 1AW9A 3APQA 3QPMA 3W8JA 4CHSA 4K9ZA 2QC7A 2YV9A 2L4CA 2YCDA 3ME7A 2DJ0A 1FAAA 1VF4A 2HNLA 3H4KA 3TKRA 2AHEA 1UVZA 2PVOC 2CZ3A 5JCWA 1VF1A 1A8LA 2AYTA 2REMA 4YQVA 3D0ZA 4PNFA 1YEXA 1TRSA 3CRTA 2V32A 2KOKA 1WOUA 2H6YA 3IK7A 4V1Ap 3UJ1A 1YJ6A 1IYHA 2L4QA 3E9JB 2YN1A 3VLNA 4DSQA 1KNGA 4V2MA 3FZ5A 4NV5A 4LMVA 2E0QA 4F2IA 5F0GA 4DEJA 2OACA 4N11A 4EXJA 3TOTA 2P5QA 6GSTA 1GTAA 3APSA 3TKSA 4WXTA 3MAKA 4MF6A 4V2LA 2VD0A 19GSA 3QFBC 1GUKA 1WMJA 1YEPA 3EMPA 2RUFA 5IMVA 5DAKB 4G9HA 2A2SA 4MA9A 3FYGA 2HYXA 2CAQA 2CX3A 3CBUA 1ERWA 2WFCA 3TGZA 4KDYA 3ZIVA 1AXDA 2E2MA 4K0NA 1G6WA 2R6KA 1T8EB 4J57E 3KH9A 2KUCA 1ACVA 4ILFA 2MZCA 3KMOA 3QDNA 4V2NA 4WKWA 5D96A 5ECMB 3HVSA 3HXSA 5E59A 4GSTA 5HR1A 3RDWA 4GWRA 1DSBA 3FY7A 1S3DA 1DUGA 5CAXA 3G7YA 4GXZA 4EF0A 3CXGA 2H1DA 4ZB8A 1PX6A 4OCEA 3LXTA 3Q74A 3LYPA 1M7TA 4TN8A 2QKEA 3EU3A 3ERFA 4V1Ag 1GSSA 1ZYQB 1XVWA 2LRNA 5KN1A 2A2RA 1WE0A 2JZTA 1TP9A 1GSEA 3KEBA 2NDOA 1XXUA 4MH2A 3GFKA 5CRGA 4PQHA 2IFQB 3F3QA 3UEMA 4ECIA 4ZL9A 3HD5A 2YV7A 3J7Yk 2XBQA 3QOUA 4PGTA 3KIJA 1U3IA 2C3TA 1ST9A 4HQSA 1GLQA 4N30A 4HOJA 1N8JA 1OKDA 2GVPA 3HJOA 1Z9HA 4ID0A 1T7PB 1GSDA 3UL3A 4AGSA 1MEKA 4I97A 2C8UA 3QAWA 4RI7A 3GL3A 1K0NA 2GS3A 5J9BA 1EP8A 5C04A 4ZB9A 1K0BA 2XHFA 3VWVA 4EL1A 5HR2A 1U88A 5J9CA 1PKZA 5F05A 4TKYA 1TRVA 3L0HA 5IOXA 5IMZA 13GSA 2CQ9A 3TRPA 3L9VA 4GRFA 1XZOA 1R7HA 1M9BA 1FOVA 1B9XC 2PUKC 1QUWA 4TXVA 3KXOA 5G2ZA 3Q18A 1G7EA 1Z6MA 2FY6A 1N2AA 2PGTA 2LJAA 4K8MA 3EE2A 2K18A 2B5YA 2L6CA 1SD9A 3A2VA 2C3QA 2K9FA 3F6FA 4LMWA 1G6YA 4IKHA 4PQ1A 3IOSA 2GZPA 1FHEA 3M1GA 3WGDA 1SYRA 1SK1A 1BG5A 1JZWA 3GMFA 2PN8A 4ISDA 3HVVA 2HZEA 4IHUA 4EKZA 4YAVA 1T00A 2FWGA 2QSIA 2YJ7A 2IWTA 1T4YA 3UBKA 3RHCA 2FNOA 2P31A 2PERA 5KN0A 3HZ8A 2CVKA 2DC5A 2WZ9A 4E8HA 2LV3A 1PQNA 3F8UA 5DDLA 2O89A 1FO5A 1DBYA 2R4VA 4NWYA 4TR1A 3SBCA 1A2JA 2OA7A 2OE1A 4WR4A 3F6DA 5DCHA 2IN3A 5D93A 2CVBA 4D73B 2VUPA 3CYNA 5B8BA 2DMLA 4I2TA 2N5FA 6GSYA 4EE0A 4ECJA 1GWCA 5IMDA 3VPQA 1B4QA 4EDZA 4FO5A 2FA8A 4NMUA 4TRXA 2I4AA 1K3OA 2OBKA 3MSZA 3BBYA 3F63A 4OD7A 5E4WA 2GTUA 3EMXA 1A23A 1VF2A 3GKKA 2MMZA 2CVDA 4XS4A 1YKAA 2GSRA 3CMIA 2M80A 4GQFA 5DALB 2LSTA 2XBIA 4ZILA 3F3RA 3TJKA 1OAZA 4IP1A 3EU4A 1ML6A 4KA0A 1HQOA 1CQHA 1XFLA 4PX1A 3FR6A 4ZIJA 1SKWB 1G0TA 5HFGA 2H75A 4K7NA 1O85A 3IHQA 4G10A 5CRWA 5B7CA 4QL7A 1NSWA 6GSWA 3ZIJA 3RPPA 1UA5A 3I9V2 2IMIA 3HKRA 1YQ1A 3DRNA 2CAIA 1USBA 3WYWA 4N0VA 5AISA 1QQ2A 1R5AA 2H8LA 2R2JA 4F0BA 4IP6A 5JWRB 2MYGA 4JZQA 4HDEA 1S3AA 4NHWA 3GTUA 1SKSB 4AJ6A 2VL3A 4JR6A 4L0UA 4POMA 2MBSA 4XRAA 2VO4A 1EZKA 1AC1A 4GLTA 2K8SA 1ZMAA 1O6JA 5LNKe 4HZ2A 2ES7A 1JZDA 1NHOA 2HXKA 4BVYA 4HUAA 1HNBA 1E2YA 2JZRA 5COHA 1SJ6A 3WGEA 5G5EA 2GZZA 5H5SA 3DIEA 2PVQA 2V6OA 4L0WA 1XOAA 2N5BA 12GSA 1F37A 1R5PA 4IELA 6GSUA 1GULA 1X5DA 1GTBA 2K8VA 1ILOA 1M99A 3WD6A 1EEJA 3HVXA 1B48A 2H71A 1URMA 2PMTA 2AB6A 2GQLA 5ECKB 3GH6A 3BOAA 4KCAA 4E8EA 3KD0A 4I6XA 2N5AA 4X43A 2RLIA 1Z7PA 2H30A 1XWGA 3QFAC 3G7JA 1ZGNA 5A4UA 5JCUA 3ME8A 4ULXA 20GSA 4KNDA 1EWXA 1QXHA 2YWMA 5G31A 5HQPA 1V98A 3DD3A 4IJIA 3A2WA 3CSJA 1WRYA 3EVIA 4MF5A 2B1KA 2YZUA 5J3RA 1PKWA 3UVHA 1J9BA 2FWEA 5ELGA 3A5WA 4K2DA 2LEGA 4J2FA 4XS6A 4IBPA 3VWWA 4MZCA 4P3YB 4OFNA 5DAKA 5ECHB 3VI5A 1ZOFA 4DSSB 1EEMA 2NBSA 2LRCA 4AF2A 4KGIA 1SENA 1TRWA 2CV4A 2IMDA 4Q5NA 4IQ1A 5H5QA 2JL4A 4IS0A 1PGTA 5G5FA 4MDCA 1J0FA 4KDXA 1GLPA 1JHBA 2C4JA 5F07A 4IJ3A 4K1FA 2DJJA 1T3BA 4LL1B 3VK9A 2JACA 3KZQA 3IE3A 3D4TA 2CA8A 2IJYA 4G2EA 1B8XA 2KP2A 3TKPA 3MWHA 1U87A 4WBRD 3WT1A 2JZSA 5HR0A 4BWSA 3VURA 2PPTA 3GUSA 3PGTA 3TJBA 4N0ZA 4L5OA 2B6MA 5HR3A 3C8EA 2IFQA 3F4RA 5CYYA 3VWUA 1SKRB 5ELAA 3GHAA 1PL2A 3FEUA 3UBLA 2BTOT 2LJRA 1TTZA 2G0FA 2EIOA 2E2GA 1HNCA 4MZWA 3QMXA 1GSQA 2HI7A 1TW9A 1Y6EA 3QCPA 4PNGA 2H74A 4RQXA 4EUYA 1BJXA 4FYCA 1Z7RA 3IA1A 4BPYA 2LQQA 3M9KA 4ZB6A 1SU9A 2C0DA 2AJQB 3M0FA 4MH3A 4PURA 3F4TA 1NHYA 3GKNA 2NVLA 3IK9A 4OCFA 2L5LA 4KSMA 1EP7A 3FZ4A 5F06A 5D9VA 4TR4A 4WR5A 5DJMA 1F3AA 2DMMA 5ECLB 3F9UA 1Q4JA 2TIRA 4WF5A 1SJIA 1O81A 3QD9A 3TDGA 2OE0A 5ECOB 4KH7A 1S3CA 4LL4B 2H6ZA 5G1KA 2M46A 1R26A 4IW9A 1EV4A 2C0FA 1Y25A 2C80A 4ACSA 4TVEA 1PN9A 3C71A 3LYKA 3F0IA 3UAPA 2E7PA 1W4VA 1UC7A 1K0DA 2HFDA 2WB9A 1THOA 2X8GA 3DYRA 4MCUA 1SYXA 3RPNA 1A8YA 1RQMA 5IOWA 1SK2A 5EPFA 3VFIA 4HEA2 4NAXA 1AQXA 2M72A 5ENUA 5IO2A 3ZVJA 5D9TA 4HJMA 4WBJA 1PRXA 4I2UA 4I5QA 4RUVA 3ZMLA 3G7IA 1XW5A 3J7Yb 2DJ1A 3BD2A 2H1BA 1MD3A 2NPBA 5GAPD 3C7MA 3FW2A 3ZFBA 2D2ZA 3HJPA 4IN0A 1O73A 3M8NA 4IQAA 1HD2A 4D73A 1TK0B 2AAWA 1XWCA 3IR4A 3O3TA 2FD3A 1Z3EA 5GSSA 2OE3A 1TOFA 1JLWA 3HYPA 4TR3A 3HZ4A 3FZAA 5IMFA 4HS1A 1Z6NA 2FLSA 2NTOA 2YANA 2H01A 3O6TA 3DMLA 1XIYA 1TXXA 3LORA 3LJRA 4FYBA 1ABAA 3H8QA 2OKAA 3G9BA 4J56E 1A24A 6GSXA 3Q19A 2EIQA 4JE1A 4ZXGA 2ON5A 1I9DA 4GF0A 2ALBA 3W8SA 3EINA 2R3XA 2VAFA 2CZ2A 1GUMA 1W89A 1YF1A 4JEDA 1M0UA 4MJEA 1TU8A 2H0GA 4HU7A 5DALA 1XOBA 3QR6A 5F8BA 3ZLPA 4WEYA 1RK4A 1F9MA 1QGVA 3IDVA 4Z7XA 3HHVA 3GV1A 5JCGA 3CRUA 4XRDA 3KGKA 2GQMA 2A4VA 5B6NA 2ZCTA 4POBA 5ECQB 2FWHA 1X9MB 1T1VA 1TDIA 1XBSA 3NZNA 3ZVJD 3IXRA 2IMEA 2F9SA 5DCGA 1EV9A 18GSA 3P7XA 3OR5A 3FZ9A 3UARA 4DSRA 5D73A 5HFIA 4ECCA 4K6XA 1GSUA 3O76A 1TJDA 1B9YC 4JRRA 3H93A 4KUNA 1V58A 3DWVA 3D6IA 3ZL5A 4KB3A 4TW5A 1O7UA 2FCHA 5CRDA 3Q6OA 2L6DA 2JU5A 4X0XA 3TRQA 4FIWA 3GKXA 1GP1A 5CNWA 1PX7A 3H1NA 2MMNA 4NPBA 5GSTA 2VIMA 4DVCA 1GSFA 2GSQA 2HRNA 2IMFA 3A3TA 3DEXA 3GX0A 3TJJA 5KN3A 1KTEA 8GSSA 1YDKA 1OC9B 4TXOB 1EOHA 4HU9A 4POKA 1Q98A 2WULA 4H86A 2X8CA 4O32A 1GRXA 3L9SA 3LEFA 2IPAA 4XTSA 1HNAA 4POLA 2ZNMA 3M3MA 3RBTA 1A2LA 3JCML 4O5RA 1ERUA 4KAEA 2H76A 3KH7A 4F0CA 1WJKA 2JSYA 1OE8A 3ZMKA 1YZXA 4TR1B 11GSA 3D21A 3I69A 2IL3A 4Q5FA 1ZL9A 3BCIA 1U3AA 1VGLA 1AUCA 3IPZA 2VCQA 3DGQA 1X5EA 2DIYA 4NHZA 1O8WA 1ZYEA 4L5LA 14GSA 3KJYA 3E0UA 1OC3A 3GYKA 5CREA 3TKQA 3ZREA 3IC4A 1M9AA 2LUSA 2HZFA 5G30A 3GX8A 4DSSA 2B5EA 3KTBA 3GL5A 3TOUA 1GH2A 4MJBA 4ZBBA 5J41A 1TK8B 1ZZYA 2MMAA 4PXOA 5IIZA 3TCOA 4ZBDA 2J9HA 1B4PA 3KMNA 2YWOA 1H4OA 2YZHA 4RI6A 4OWYA 2YWNA 4F82A 3M9JA 3WT2A 1C72A 2VLUA 2DJ3A 5ID2B 4EC0A 2L59A 3L9UA 3ZYWA 2VLTA 2C0GA 5B6MA 5ECSA 4K7OA 4LA1A 2FUG2 1MDKA 4ZL8A 5KEJA 2B7JA 2Z9SA 3ERGA 2GSTA 2V2GA 2LRTA 3S9FA 1TKDB 2LJKA 1A0FA 1F3BA 3HJMA 3HCZA 4GCIA 3C1SA 4KX4A 3GTUB 2V1MA 2F3MA 2VM1A 2RM6A 1JZRA 3HY2A 1FW1A 3LQ7A 4CW9A 2GDRA 1XVQA 3TUEA 2YOIA 1E6BA 2GLRA 2CT6A 2VLVA 4YH2A 3GSTA 1FVKA 4MABA 4XS1A 2H1GA 1TK5B 3I6AA 1EGRA 4BL7A 4GSNA 2DJ2A 1FG4A 2GZYA 4AJ7A 3TRXA 2K6VA 5FHIA 5DBQA 3LWAA 3HA9A 3ZITA 4JR4A 2RUEA 2MBTA 2HT9A 3UMAA 1HYUA 1X9WB 2FWFA 2GSSA 4WF4A 4KE3A 1JLVA 9GSSA 2YJHA 1VF3A 2KLXA 3TJFA 3U6VA 2JADA 5IM9A 5J4UA 2I81A 1K3YA 3UVTA 2H0HA 1X9SB 2PWJA 2V41A 1QK8A 3NOFA 3KP9A 2IMKA 3L4NA 2H6XA 4KDUA 3N5OA 3PR8A 4FYUA 5EY6A 1X0RA 3IBHA 3CSHA 2YNXA 3RAZA 2OJLA 1BAYA 3D22A 4YQMA 2BJXA 3FRCA 2X64A 1K0OA 2PU9C 3CTFA 4OO5A 1AIUA 1TRUA 2O7KA 2L57A 1XWBA 3APOA 1EGOA 4XCSA 1WP0A 2I9HA 1WIKA 1ERVA 1ON4A 3NIVA 3N9JA 1OVNA 3ERWA 3H79A 5LCZA 5ECRB 3HDCA 4K0GA 5ECNB 5A4VA 3I43A 2WJUA 1MD4A 3KCMA 4AJ8A 4MLYA 4ML6A 5GZZB 5CRHA 3IAS2 2LQOA 2FA4A 4BA7A 5DJLA 2AUVA 1OE7A 5J5NA 3IV4A 1J08A 3KP8A 1A2MA 2H0IA 4TOPA 4G19A 2H72A 5AGYA 3FR9A 16GSA 1JZOA 5HFKA 2HE3A 3MNGA 4GQCA 5LD0A 2HRFA 3IRAA 2H19A 3DVWA 1G7OA 5ABRA 3LGCA 1XWAA 1YY7A 1SL0B 3LG6A 1TU7A 3TB2A 3ZTLA 1PMTA 3GNJA 5KN2A 2TRCP 1GL8A 1OC8A 4MPFA 1MDJA 3W6GA 4HQZA 1BYEA 2ZUPA 4MJCA 1ZCPA 3GIXA 1DE2A 3UOMA 1V40A 6GSVA 4PUAA 2HLSA 3C1RA 3SWLA 1GUHA 1EOGA 4MJAA 2YPMA 17GSA 3KM6A 3WGXA 4F03A 2YP6A 3RHBA 3FHKA 3KTLA 4L8EA 2J23A 1V2AA 3GA4A 4CDOA 5D8IA 3ED3A 2IIYA 5DVBA 1PSQA 2B7KA 1PL1A 2R5GA 2LKUA 3P8WA 2O87A 4O7HA 2B5XA 1THXA 3GURA 2P5RA 1PA3A 3IAM2 4MF7A 4EO3A 2VCXA 1SD8A 2PBJA 1MTCA 5C00A 2B3SA 2H73A 5DQSA 4KCEA 4RQRA 1M2BA 4N10A 2GQKA 1M2DA 3ZRDA 4KW6A 2XPEA 3PH9A 1A0RP 2CX4A 2VCWA 2G2QA 3LFLA 2LNSA 1YF0A 3EWLA 2L5OA 4Q5RA 1K0CA 5H5RA 2WRTA 2YWIA 1GSYA 3TKSC 3D5JA 1DE1A 5IMCA 4OO4A 2RIIA 1GTIA 2VD1A 5FT3A 6GSSA 3QAGA 1OC9A 4WETA 2ON7A 2WGRA 4TXOA 3A2XA 4K7IA 2H70A 5IQYA 2JSZA 3EURA 1V9WA 5B8AA 2OBIA 1U6TA 5INYA 10GSA 2GT5A 3D4MA 4MP4A 3C73A 1LJRA 3GN3A 2V6KA 2DJKA 4FH8A 4NV2A 4EVMA 1UN2A 1GTUA 4BVXA 2WS2A 1QFNA 4YQUA 4ECBA 4OFTA 5D9XA 1SK0A 5EL8A 3EYTA 4QL9A 1Z5YE 2H66A 1AAZA 1WPIA 5EVOA 4XHMA 1K0AA 5CP1A 5AN1A 4HZ4A 5L71A 4MMMA 4HI7A 3F4SA 4PUFC 5ECIB 3VI7A 4KSOA 4BWQA 1WWJA 2O85A 2VL2A 1SL1B 2GGTA 3TJGA 4MPGA 1IYIA 4GSSA 1I5GA 5AIXA 2C0EA 2TRXA 3FKFA 2DLXA 4HJ2A 4I8BA 4XIHA 2LTKA 3V1WA 2C1YA 4EDYA 1K0MA 2P0GA 3VPTA 2DBCA 3GRXA 3FR3A 1BX9A 3LXZA 2X99A 1O8XA 3FK8A 2WCIA 4JBBA 1YKCA 2HZEB 1CQGA 1RW1A 1NW2A 1GNWA 2WDUA 5IPGA 3BCKA 1XW6A 4F9ZA 4JU5A 5ECPB 1MDIA 2F8AA 3LSZA 2F51A 3VWXA 1BQ7A 1PD21 2H1AA 4NXIA 2B1LA 5GAND 3US3A 1X5CA 3CTGA 2KP1A 5A4WA 3EC3A 2FHEA 4IGJA 5ID2A 1FB6A 2C3NA 2F8FA 5D9WA 1OKTA 1VRSD 3U5RE 2R37A 1FB0A 22GSA 3TKSE 5IPHA 4ML1A 1KEBA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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