1T4Z | Genus

Total Genus 19

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	19
sequence length	105
structure length	105
Chain Sequence	GSSLSPQALAQPLLLQLFVDTRPLSQHIVQRVKNILAAVEATVPISLQVINVADQPQLVEYYRLVVTPALVKIGPGSRQVLSGIDLTDQLANQLPQWLVQQEGIF

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure of the N-terminal domain of the circadian clock-associated histidine kinase SasA. pubmed doi rcsb
molecule tags	Transferase
source organism	Synechococcus elongatus
molecule keywords	Adaptive-response sensory-kinase sasA
total genus	19
structure length	105
sequence length	105
ec nomenclature	ec 2.7.13.3: Histidine kinase.
pdb deposition date	2004-04-30

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF07689	KaiB	KaiB domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	1t4zA01

3CBUA 3TGZA 5AIVA 4EDZA 2L4QA 1A23A 2DSAA 2R4VA 4WF5A 1U3AA 2PGTA 1K3YA 3M0FA 3BCIA 1FAAA 5COHA 4F2IA 5F07A 1QUWA 2H1BA 3TJGA 1SENA 3G7YA 3LQ7A 1SL0B 2LKUA 4LLRA 4ML1A 2AV4A 2LQOA 1YKAA 3RPNA 2DJ3A 3KH9A 1U88A 3HJPA 1XBSA 5G5EA 2OE3A 2YNXA 2V41A 5L71A 6GSVA 1TI3A 2FA8A 4XRAA 3MAKA 3EMPA 1M2AA 1W4VA 4IQAA 2C0GA 2VCTA 2P5RA 2GZPA 4EO3A 2V32A 5CP1A 4MDCA 4FYUA 1PQNA 1JZWA 1PX6A 3IA1A 3EYTA 1FW1A 5E4WA 3C1RA 2X8GA 5ID2B 3VK9A 5IMZA 1JLVA 1TKDB 1NSWA 1MD4A 5G1KA 2GZZA 4OO5A 1PN9A 2MMZA 1X0RA 3HHVA 5AN1A 5IMDA 3GKNA 5D8IA 4Q5NA 3F6FA 4TN8A 5CNWA 1XWGA 2CX4A 3IR4A 1GSEA 2RM5A 3I9V2 3GH9A 1AQWA 2O8VB 3AY8A 2FLSA 4MZCA 4NXIA 3A2XA 4OWYA 2YZUA 1TTZA 14GSA 3GSSA 1TK5B 1YF1A 1F37A 1SJ6A 4IVFA 2Z9SA 3FZAA 5HR2A 3PGTA 4ZB8A 5AGYA 2M72A 3WT1A 7GSSA 2REMA 3GRXA 1ON4A 1PX7A 3GV1A 1A2LA 4QQ7A 4RQRA 1S3CA 1GTUA 2K8VA 3Q6OA 2TRXA 3LYPA 5F8BA 4BWQA 1HNAA 4GSSA 3ZREA 2CVBA 2FD3A 3KCMA 9GSSA 2LUSA 4OFMA 5D9XA 4DSSB 1BJXA 2I81A 2HRNA 3BOAA 3DWVA 2NTOA 1VF3A 3ERWA 2H0HA 1ERWA 3TKSC 4L5OA 3VWUA 4K7IA 4GXZA 3IBHA 2CT6A 2WZ9A 4HZ4A 4V2MA 3W8JA 3VI5A 1XWCA 1GTAA 2R5GA 2K6VA 3GKMA 1TDIA 2H71A 5A4VA 4IKHA 1JFUA 1B48A 1B9YC 2C0EA 2L59A 2VOCA 6GSXA 1FHEA 2BTOT 5DALB 17GSA 1NW2A 1GL8A 3KZQA 2OJLA 1OKTA 2B6MA 2JZSA 20GSA 4XS4B 5INYA 1AIUA 3E3EA 3F8UA 2RLIA 3L9VA 3UVTA 2LQQA 1PD21 2ZUPA 2C1YA 1XIYA 2IN3A 5ENUA 5DJMA 2R3XA 2OA7A 2M46A 3TRQA 3QFBC 2TIRA 2H8LA 3VWVA 4FO5A 1R5PA 2WCIA 1GSUA 2H73A 1Y25A 1PKZA 2YWMA 3CMIA 2B7JA 3QAGA 4AJ7A 1AXDA 1GUHA 1ST9A 2H0IA 3C1SA 4GLTA 3EC3A 4CW9A 4MCUA 1BX9A 1PA3A 1R5AA 5A5KA 2NVLA 4KX4A 3UOMA 1K0CA 3TOUA 3FY7A 2MZCA 1OC8A 3KP9A 4J57E 1FOVA 5CYYA 4NAXA 4MJCA 4JE1A 2O7KA 5ECPB 3HD5A 1G6YA 3TDGA 2KOKA 2A2SA 4OMVA 4O7HA 1W89A 5H5QA 5CRWA 1TXXA 1K0AA 1F3AA 1K0OA 1NHOA 4GQCA 4V1Ap 1KTEA 4JRRA 4WXTA 4YAVA 1YEXA 3TUEA 4LMVA 5AIXA 1SKSB 1SD9A 4ZILA 2YWNA 2KP2A 5J9CA 1VF2A 1N2AA 2E2GA 3P7XA 5G30A 1Z6MA 4MJAA 4OCFA 5G31A 4RI6A 5DQSA 3ERGA 1ERVA 1XCCA 1XOBA 3APOA 4ACSA 3GTUB 2LRCA 2MMNA 1IYIA 3ZL5A 1WRYA 4MF6A 5IO2A 6GSYA 1OAZA 5J41A 4EKZA 1TJDA 3D0ZA 4NPBA 4WR4A 1SD8A 4ZB6A 3HY2A 5E59A 3HJOA 1AW9A 4I5QA 4N30A 1B4QA 3GNJA 2TRCP 3KM6A 1YDKA 2A4VA 4ZB9A 2PBJA 1SJZA 4JBBA 1SKRB 1ILOA 2MMOA 5LCZA 2VAFA 3ZLPA 2PWJA 4L0WA 6GSUA 4OD7A 2E0QA 3EINA 5JCWA 5F05A 2MMAA 5B8AA 3G7JA 2HYXA 1PSQA 2LRNA 3W8SA 4IN0A 5J5NA 1MTCA 5DVBA 4ZIJA 1EEJA 4G19A 1O8WA 3WYWA 4KUNA 4JR6A 4WF4A 3L4NA 4XS1A 1THOA 5D9VA 4KH7A 5F0GA 1ACVA 4ZXGA 2G0FA 2P5QA 1PL2A 2JSYA 1OC9A 2WDUA 3I43A 3K8NA 4PUAA 3IC4A 3IXRA 2GTUA 2HSHA 2VO4A 1MDIA 1WJKA 2OBIA 2K18A 3P90A 4TKYA 4MPFA 3US3A 2CZ2A 4NHWA 1VF1A 1Z3EA 2N5AA 1Q98A 2KHPA 1ZGNA 2LJRA 5IMCA 3D6IA 3ZTLA 4X0XA 2IFQB 1EWXA 1CQHA 2YV7A 4MZBA 4TOPA 5JWOB 3KD0A 4TR1A 1ZL9A 4GCIA 5JCUA 4CHSA 4JEDA 2ZNMA 3FRCA 3EURA 1X9MB 4IGJA 2L5OA 2K9FA 1A0FA 4HQZA 2PVQA 1TK8B 3MDKA 1SYXA 2GZYA 4PNFA 2YZHA 3GKKA 2CA8A 2DJKA 3HKRA 1ERTA 4IBPA 3HA9A 2YJ7A 4O32A 1SK0A 2I1UA 4N10A 2H6XA 5B6NA 4HZ2A 1KBNA 4TXOA 4YAPA 5JCGA 1F9MA 3TKQA 1UA5A 1WOUA 4ZBBA 2H70A 3IDVA 4IJ3A 3FW2A 4L0UA 5ECIB 1SJIA 5D9WA 3Q74A 4MF7A 1M9AA 1GNEA 2FUG2 1QFNA 3U6VA 2D2ZA 3ZIVA 1M2BA 2KUCA 4D73A 3IAS2 5IO0A 4DSSA 4ECCA 1YY7A 4KCEA 3F9UA 3L9SA 4ID0A 1TRWA 5ECMB 4TR3A 3IK7A 3RHCA 2C0DA 1A2JA 1TI1A 4WBRD 3F4SA 3HYPA 1PKWA 4F03A 2B5EA 4X1UA 5EPFA 4PGTA 5ECSA 1XZOA 1QK8A 4AJ8A 3G7IA 1UVZA 1JZRA 3VFIA 3QAVA 3DKSA 2YV9A 1OE8A 2ON7A 1JLWA 4JZQA 3RPPA 4XTSA 1G7OA 1G0TA 2B7KA 2HZEA 1VGLA 3HVVA 3GL5A 4F0BA 1GSFA 5DALA 3GIXA 3KTBA 4JU5A 4XIHA 3KTLA 3NIVA 2PN8A 3H93A 2IWTA 5FHIA 2JADA 1AQVA 1YZXA 3EU3A 3LORA 2HZFA 1TW9A 2VM1A 3M9KA 3F63A 5ECLB 4ULXA 3DXBA 3IRAA 1AC1A 3LGCA 4ILFA 4L5LA 1ZYEA 5EL8A 1G7EA 1KNGA 4FYCA 1GULA 3CXGA 11GSA 5DAKA 3LXTA 5H5RA 3A3TA 1GSDA 1GSQA 1JZOA 2O89A 2MBSA 1F3BA 3KGKA 3FR9A 1LJRA 1RW1A 2WULA 1V40A 5KN0A 5J9BA 1A24A 2F8AA 2N5FA 1IYHA 1E2YA 4WKWA 1ZYQB 3ZYWA 2MYGA 2YANA 4K6XA 4I97A 3ED3A 3VI7A 1XPVA 2CAQA 3N9JA 4X43A 2DBCA 4ZBDA 1X9WB 1U3IA 4WBJA 2L5LA 2GS3A 2GSQA 2P0GA 2PVOC 4MJBA 3GX8A 3FZ5A 2OE1A 3C7MA 4EC0A 4EUYA 1ABAA 1CQGA 5IMFA 3LXZA 1Y6EA 1OC3A 4BL7A 2FA4A 3RAZA 1K0NA 2H74A 3QFAC 4HU9A 3GN3A 1A2MA 4PQHA 5AISA 1TRUA 4GQFA 4IQ1A 3GA4A 3IE3A 2JACA 2B1KA 3SBCA 5ELGA 2YOIA 4E8HA 3LG6A 3QCPA 3LFLA 4POMA 3UVHA 4TRXA 2K8SA 4QL9A 2JZTA 1XXUA 4ZL9A 2H30A 4MMMA 2YPMA 3FK8A 4OCEA 1EV4A 1EOHA 3DIEA 2XPEA 3WGDA 4GSNA 2H72A 3GTUA 2CV4A 5IMVA 3W6GA 5FWGA 5D73A 2E2MA 1GRXA 1H75A 4KNDA 4KDYA 4YQMA 1XWAA 1SK1A 4GTUA 2NBSA 2GQMA 1BG5A 2GT5A 3M9JA 1TRSA 3TB2A 5GAND 1RQMA 2X8HA 4ECJA 4K0NA 2LS5A 3HJMA 5DJLA 2DJ2A 2KP1A 3GUSA 1Z5YE 1DSBA 3D4MA 2C0FA 4KW6A 4MZWA 1EEMA 2EC4A 1AQXA 5ECKB 2VL2A 2DJJA 3F4TA 4K0GA 3HVSA 5B6MA 1VF4A 3CSHA 1U6TA 4AGSA 1A8LA 3KIJA 1MDKA 2P31A 3IOSA 3TJFA 1ZMAA 2EIOA 1EP8A 1X5EA 4K7NA 5D9TA 1X5CA 1EGRA 3HZ4A 4V2NA 5ECOB 2VLTA 4V1Ag 1EGOA 3LWAA 3QOUA 2GSRA 2H66A 3TCOA 2IJYA 1GTBA 1K0DA 2IIYA 4RI7A 1SK2A 1K0MA 3JCML 3ME8A 2FWEA 1VRSD 4J56E 2GQLA 3WGEA 3L0HA 1H4OA 1T00A 2ES7A 3C71A 10GSA 3UEMA 3HZ8A 2HLSA 5CO3A 2GT6A 5ECNB 1Q4JA 4ZBAA 1LU4A 4POLA 3FKFA 4PUFC 3A5WA 5GAPD 2H1GA 3ZVJD 3F3RA 4CDOA 3GX0A 2LJAA 2IL3A 1T4ZA 2MBTA 3QAWA 3TKSE 2H6ZA 5G1LA 2VCXA 3TKRA 5HFIA 4Q5RA 1S3DA 2ON5A 3TRPA 3TRXA 1QQ2A 3DVXA 3HCZA 1KEBA 1R7HA 1OVNA 1TK0B 3BD2A 4NWYA 5HR0A 2VIMA 4TVEA 3MNGA 2H76A 3J7Yk 4MA9A 1TOFA 5C04A 4MLYA 3QMXA 4IHUA 1O73A 16GSA 4FH8A 4DEJA 4GWRA 3QDNA 1O85A 1RK4A 2VM2A 2FY6A 2DC5A 5D93A 4Z7XA 4ISDA 2DIYA 2QC7A 1R4WA 2VLUA 5A4WA 4HU7A 4ML6A 1F2EA 3A2VA 2GLRA 5HFKA 2RUEA 3VWWA 5CRGA 3ZITA 5IM9A 2CVKA 1M2DA 3PINA 2LRTA 3CYNA 3WT2A 3ZFLA 1JZDA 3TJBA 3WD6A 1FB0A 2IMEA 1G6WA 3ISOA 5G2ZA 4KGIA 3TJKA 1OKDA 1THXA 2E7PA 2YWOA 4LL4B 2XHFA 2QKEA 1A0RP 3P8WA 3SWLA 5J4UA 2DLXA 4I8BA 5ID2A 2B5YA 5ECHB 5ELAA 1XVWA 1XW9A 1I5GA 1HNBA 4HI7A 4POKA 4TXVA 4IP6A 3EU4A 1SU9A 3ZIJA 4NHZA 2O87A 4OFNA 1J9BA 2RUFA 5GSSA 2AUVA 2QSIA 5D96A 1XWBA 1GH2A 4IELA 4NV2A 3CTGA 5CAXA 3I69A 5FT3A 2GSTA 4IJIA 5IOWA 5KN3A 3EVIA 3KMOA 3UJ1A 2LNTA 1XVQA 2HRFA 5IQYA 2F51A 2GQKA 2H6YA 4MPGA 1Z6NA 2VD0A 3FHKA 1GSYA 3APQA 1URMA 1BQ7A 2JZRA 4BPYA 5B7CA 2PU9C 3H4KA 4DSRA 8GSSA 3I6AA 4TR4A 3ZMLA 4KAEA 2WRTA 2HI7A 3FEUA 3R2QA 4IW9A 1HNCA 2YN1A 3FR3A 4XRDA 4EDYA 5LNKe 1YF0A 4ZL7A 5CRHA 2N5BA 2R2JA 2GSSA 13GSA 3WGXA 4KDXA 1WPIA 1GTIA 4GRFA 1EOGA 3DYRA 1NM3A 1WWJA 3C8EA 1O8XA 4PQ1A 4BWSA 4AJ6A 5DQYA 4N0ZA 2IMKA 2BMXA 4KB3A 5KN2A 2FNOA 1PRXA 3GL3A 3O3TA 4RUVA 1FVJA 2HSYA 5A4UA 1Z9HA 4GSTA 2B3SA 2V6KA 3M8NA 1X9SB 1TP9A 5DDLA 4EE0A 3DEXA 1S3AA 4PURA 3NOFA 2GGTA 3KMNA 3P2AA 1EP7A 4HS1A 3ZFBA 1V98A 1T8EB 2FGXA 2J9HA 2X64A 4Q5QA 5HR3A 3H8QA 4G2EA 4F82A 2PERA 2FWFA 1FB6A 2L4CA 4AF2A 2OKAA 3TKSA 4XS4A 3C73A 2LTKA 2JSZA 3VWXA 3BBYA 4E8EA 5EVOA 2BJXA 4I2TA 3FZ4A 3EE2A 2R6KA 2LEGA 1SL1B 2ALBA 3UBLA 1NHYA 5B8BA 1M7TA 19GSA 2VCZA 1OC9B 3E0UA 1T4YA 4Q5FA 2AYTA 3ZZXA 2X8CA 2IPAA 3M1GA 1MD3A 2L57A 3CRTA 5IMAA 2VL3A 4YQVA 2X99A 3QD9A 1FO5A 2HE3A 4BVYA 4EVMA 2L6DA 4PXOA 3CSJA 2LV3A 2LJKA 2YCDA 18GSA 5DCGA 4NMUA 1PL1A 1M99A 2LNSA 1TRVA 5ECRB 4TR1B 1USBA 3UMAA 4KSOA 1ERUA 4L8EA 1DBYA 4PNGA 4PX1A 5C00A 2OBKA 1J08A 2WS2A 3U5RE 1V58A 12GSA 2B1LA 5IOXA 2R37A 3IPZA 5HR1A 5DBQA 4K2DA 4GF0A 2KLXA 4NV5A 4MH3A 2VCVA 2VCWA 4MABA 5HQPA 4BVXA 3LYKA 1M9BA 6GSTA 1FVKA 1TU7A 1B8XA 2XBQA 3O76A 2B5XA 3FYGA 4O5RA 4TXOB 6GSWA 2F9SA 5GZZB 3BJ5A 1V57A 2OE0A 3BCKA 3DD3A 2OADA 3KEBA 3N5OA 3DRNA 4KSMA 2EIRA 4N11A 2I4AA 4D73B 1B9XC 3D22A 3CRUA 4K8MA 2HNLA 3VPQA 2DMMA 2XPDA 1Z7PA 2HT9A 3QR6A 4N0VA 1V9WA 1X5DA 1ZZYA 4KDUA 3GSTA 1OYJA 3MWHA 2YJHA 4YH2A 1K3OA 4HQSA 1XOAA 1PMTA 3TKPA 2PUKC 2A2RA 4MF5A 1T3BA 4FIWA 5G5FA 4IP1A 3TOTA 3L78A 2AJQB 3RDWA 1AAZA 3ERFA 1O6JA 1I9DA 3DGQA 4HOJA 2H01A 4WETA 4LMWA 3A2WA 1QGVA 3F4RA 2PMTA 2HZEB 3EMXA 4V2LA 1OE7A 3RBTA 1XWKA 2CVDA 1TU8A 1QXHA 4KE3A 3G9BA 5LD0A 3F0IA 1XW6A 4O92A 4BA7A 2O85A 4MP4A 1SL2B 2HFDA 2DJ1A 3IHQA 4YQUA 4LL1B 3NZNA 2H1DA 1HQOA 3V1WA 1V2AA 5IPHA 4TW5A 5J3RA 2JU5A 1GLPA 2QGVA 1WE0A 2CAIA 3D5JA 1K3LA 1YQ1A 1T7PB 1C72A 3LSZA 3KH7A 3O6TA 5DAKB 1WIKA 5IIZA 2VLVA 2AAWA 22GSA 3Q19A 4RQXA 5JWQB 3GKXA 2DIZA 3UIWA 4DSQA 5F06A 3KXOA 3ZRDA 5GSTA 4F0CA 3HDCA 1O7UA 5H5SA 2C80A 3GFKA 5EY6A 3ZMKA 2DMLA 1MEKA 3L9UA 3ME7A 4HUAA 1WMJA 1F6MC 3DMLA 1GP1A 3OR5A 3CSIA 1SYRA 4K9ZA 4XCSA 1JHBA 1O81A 1QMVA 1BYEA 2FWGA 2H1AA 2IFQA 1EZKA 2AHEA 3VPTA 2OACA 1PGTA 2F3MA 4F9ZA 2C3TA 1DUGA 1YJ6A 5JWRB 3KJYA 3LJRA 4MJEA 2C3QA 4J2FA 1ZOFA 3IV4A 4OFTA 4P3YB 4ECIA 3DVWA 4HJMA 5DCHA 2GDRA 3GURA 1J0FA 3FZ9A 3UBKA 3HXSA 3D4TA 2YWIA 2HXKA 3EWLA 2FHEA 5IPGA 1M0UA 1GLQA 2C4JA 1XFLA 2XBIA 3IAM2 2JL4A 3APSA 4MH2A 4POBA 4HJ2A 2VD1A 3F3QA 1FG4A 1BAYA 4G10A 2L6CA 3RHBA 1K0BA 2CX3A 3LEFA 4K7OA 3HVXA 4ECBA 2F8FA 2FCHA 1GWCA 2M80A 3FR6A 2YP6A 3IK9A 2VL9A 4TR0A 2RM6A 1T1VA 2H19A 2DJ0A 1DE1A 1XW5A 3M3MA 2CZ3A 5KN1A 4DVCA 2AB6A 3GMFA 1MDJA 4HEA2 2VL2C 3UARA 4IS0A 3KP8A 3MSZA 1Z7RA 1UC7A 2V2GA 2CQ9A 4XS6A 1N8JA 4EXJA 5CREA 2IMIA 3S9FA 2IMFA 1GNWA 3TJJA 5HFGA 4K1FA 2H0GA 1WP0A 4ZL8A 1ZCPA 3UAPA 2V6OA 5ABRA 2EIQA 1YEPA 2V1MA 1EV9A 3H79A 4OO4A 3F6DA 4G9HA 4I6XA 4KCAA 2NDOA 2I3YA 2LSTA 1GUMA 2C8UA 1AUCA 1U87A 1R26A 4H86A 2J23A 3PH9A 2GVPA 6GSSA 4KA0A 4EL1A 3CTFA 2WB9A 4QL7A 3GHAA 4MK3A 2VUPA 4JR4A 1E6BA 4XHMA 1B4PA 2WFCA 3ZVJA 4WR5A 1GSSA 3H1NA 1GUKA 3VURA 1HYUA 2ZCTA 3J7Yb 1UN2A 4HDEA 2NPBA 2XC2A 5CRDA 1SKWB 2FWHA 3PR8A 3D21A 3GH6A 3E9JB 4LA1A 2C3NA 2IMDA 4WEYA 5KEJA 2PPTA 1DE2A 2G2QA 1A8YA 2RIIA 1HD2A 4FYBA 2VCQA 3QPMA 1ML6A 3UL3A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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