1WE0A

Crystal structure of peroxiredoxin (ahpc) from amphibacillus xylanus
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
166
structure length
166
Chain Sequence
SLIGTEVQPFRAQAFQSGKDFFEVTEADLKGKWSIVVFYPADFSFVCPTELEDVQKEYAELKKLGVEVYSVSTDTHFVHKAWHENSPAVGSIEYIMIGDPSQTISRQFDVLNEETGLADRGTFIIDPDGVIQAIEINADGIGRDASTLINKVKAAQYVRENPGEVC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of decameric peroxiredoxin (AhpC) from Amphibacillus xylanus
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Amphibacillus xylanus
molecule keywords alkyl hydroperoxide reductase C
total genus 46
structure length 166
sequence length 166
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2004-05-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1we0A00
5G1LA 3UAPA 1EP8A 1M99A 1YQ1A 4Z7XA 1OC3A 2DMLA 3KP9A 2IMIA 1QK8A 2OE1A 10GSA 3DVWA 3EVIA 4XIHA 4MPFA 2DBCA 1J0FA 1EWXA 2FGXA 2HNLA 2E2GA 1ZYQB 2LQOA 1C72A 4IP1A 1TK0B 4ZL8A 2DLXA 1O6JA 4ULXA 3SBCA 2REMA 3EU4A 2IFQB 3W6GA 2DIZA 1A24A 2G2QA 1TRVA 3RAZA 3PINA 2CX3A 5H5SA 4PXOA 2ON5A 2H0IA 3AY8A 3IR4A 4AGSA 3PR8A 4K7OA 2LJAA 3GYKA 1YKCA 5LD0A 2M46A 2XPDA 4JZQA 4I2UA 4IGJA 5EVOA 5IMDA 3RPPA 2OE3A 1T3BA 3DKSA 3M9KA 5IPHA 3F4RA 3HDCA 3G9BA 3GNJA 3RPNA 3GKMA 1XBSA 3HD5A 3I6AA 5GZZB 5AIVA 5CRWA 4PNGA 3TUEA 1XWKA 5LCZA 3GFKA 6GSSA 1V9WA 2B5XA 5IO2A 4PUAA 3ED3A 3QFBC 2GGTA 2N5FA 2LEGA 3C1RA 3FRCA 2B1LA 4KH7A 1NHYA 1K3OA 1XFLA 2J9HA 1TDIA 2L5OA 2PBJA 3FR6A 4Q5QA 4TR4A 2YN1A 3GKKA 3I9V2 2V6OA 1XWAA 1AXDA 19GSA 1TK8B 1OYJA 1M0UA 1O8WA 3QD9A 2DJ2A 2DJ0A 1S3DA 3TCOA 1JHBA 2RIIA 1I5GA 1Z3EA 1MDKA 3VWUA 3GH6A 4WF4A 5DALB 2GSQA 4NWYA 3G7YA 4KUNA 3J7Yk 3CBUA 3RBTA 4POMA 3FK8A 3CSHA 1U3IA 2BJXA 5IMFA 1KBNA 2CVBA 1TRUA 3F6DA 3EURA 5J41A 2P5QA 4ZBBA 4L5OA 1OC9A 1A2JA 5E59A 2LNSA 5DAKB 2L6DA 1NHOA 5HQPA 1GULA 2YJ7A 2FD3A 2Z9SA 5CRGA 1YDKA 3IK9A 1JLWA 3GX8A 3M1GA 3ZVJD 3EC3A 1OAZA 3E3EA 1X5CA 2KUCA 1JZOA 1M2DA 5G1KA 4PURA 1PMTA 4EVMA 2DMMA 2WZ9A 1CQGA 5HR0A 4X43A 3BCIA 2VCXA 2AB6A 3EYTA 3SWLA 5A4WA 2RUFA 4HS1A 1SKSB 2P5RA 1BEDA 1VRSD 2XBIA 2R2JA 1GSYA 3QAGA 1FAAA 5H5QA 1ABAA 2C80A 5DJLA 1YF1A 2CT6A 8GSSA 2F8AA 2VOCA 1FG4A 1A8LA 1SL0B 1ERVA 4HQSA 4JR6A 2WFCA 4MPGA 4ZIJA 3GTUB 2E0QA 4WBRD 3L9VA 16GSA 1PD21 3QMXA 3ISOA 1ZGNA 2GT5A 2H66A 5D8IA 1HD2A 4MJAA 2MMOA 13GSA 5C00A 1PX6A 1FVJA 4TR1A 4YH2A 4ZILA 3KCMA 3KMOA 1ERTA 3L9SA 2QGVA 2F8FA 4TN8A 1MEKA 1B9YC 1PX7A 1UA5A 5ECPB 1Z7PA 5HR2A 2GVPA 3R2QA 4IQAA 1GL8A 1QGVA 2GTUA 2YZUA 4NV5A 1G7OA 4TOPA 4E8HA 5J3RA 2XHFA 3KMNA 1F6MC 1TRWA 4YAPA 2H6XA 3RHBA 3BJ5A 2JZSA 4QL7A 4OFNA 2VLVA 1SJZA 1URMA 2CZ3A 5A4UA 3KTBA 2PU9C 2R3XA 5G2ZA 4MDCA 2MZCA 5CRHA 3FR3A 2H30A 4PNFA 3DD3A 2VL3A 3I43A 5CYYA 1E2YA 1ZZYA 2LNTA 2I9HA 5ECIB 4GWRA 5JCGA 2GZPA 1SK2A 2IJYA 5IQYA 4IP6A 2DIYA 5F06A 4MH2A 1F3BA 1GSFA 3M8NA 1EOGA 3M0FA 1R5AA 3D22A 2VCZA 4KDUA 2HXKA 1F3AA 2HSYA 4MABA 3MDKA 2MMNA 3W8SA 3D4TA 1LJRA 1IYHA 3TJGA 4PGTA 5HFIA 2A2RA 2WGRA 3VURA 4J57E 1AQXA 1G6WA 2OA7A 1GTBA 1PKZA 4F82A 1EP7A 2AUVA 4O32A 2H70A 4HDEA 2H1DA 1PRXA 3LYPA 2CAIA 2VL9A 3I69A 1EV9A 2VCVA 4IVFA 2DC5A 2LKUA 1UC7A 1DE1A 2HSHA 2B1KA 4BWQA 4NHWA 1PL2A 2H1BA 2PERA 3HKRA 2ES7A 5HFGA 1XW5A 3UBKA 4J56E 4ML6A 4E8EA 2GZZA 1NSWA 4EO3A 2TRCP 3CTFA 1RW1A 3UVTA 3ZTLA 2FWEA 3CYNA 3UJ1A 2GT6A 1XW9A 1SD8A 3LXTA 3O3TA 4L8EA 1JZWA 1TU8A 3GSSA 2MBTA 4KA0A 1G0TA 2MMZA 1KEBA 2OBKA 1JLVA 1X9MB 1A0FA 5DCGA 4EXJA 3ZFBA 1GSSA 1M2BA 4DSSA 4ZL7A 5IMAA 1Y25A 2M72A 3DEXA 2L59A 2C1YA 4BA7A 1PN9A 4XTSA 4EKZA 2C0EA 1H4OA 2PVOC 5IMCA 1PA3A 4O92A 4LMWA 4QQ7A 3IBHA 2K8SA 4HEA2 4RQXA 3UL3A 1VF3A 4J2FA 3E9JB 3UMAA 5JCUA 2EIOA 2M80A 4AJ7A 4POBA 4JU5A 4ECCA 1V57A 1B4PA 4OCFA 3IHQA 4HU7A 1V58A 2HZEB 4JRRA 3GURA 4OFMA 2GSRA 4ZL9A 2BMXA 5EY6A 3BOAA 3F0IA 4I97A 1GTUA 2I4AA 2GSTA 4LL4B 4RQRA 2WCIA 2FWFA 3QFAC 4IJ3A 5AN1A 3GRXA 2C3QA 4ECIA 3LJRA 2K9FA 4TR3A 3A3TA 2GS3A 1TRSA 4NAXA 1JFUA 4FYBA 1TW9A 3ERFA 3HY2A 1GUKA 2VIMA 3VK9A 5F07A 3FZ9A 5B7CA 1HNCA 4FO5A 1TKDB 2H1AA 4HOJA 2H74A 4HZ2A 5ECNB 4YQUA 2O85A 1MD3A 4IKHA 4CW9A 5DCHA 2FCHA 4GSNA 4MJEA 1XXUA 4MJBA 3RDWA 4ML1A 4ECBA 1AUCA 2B7KA 4OO4A 3N9JA 1A0RP 3QCPA 4K6XA 2VM1A 3W8JA 4WETA 2EIQA 3LQ7A 3LWAA 1SENA 2H1GA 5ECSA 2HRFA 5ENUA 2PMTA 4K9ZA 5DBQA 2NVLA 2FY6A 1QFNA 7GSSA 3ME8A 1LU4A 5AIXA 3IDVA 2OJLA 3LEFA 1S3CA 1Z7RA 2ZCTA 2CVDA 4TXVA 4KSOA 5B8AA 1O85A 4OO5A 1DUGA 1NM3A 5D73A 1VF2A 2GQLA 2RLIA 2VCWA 3UEMA 4GLTA 2VLUA 1V2AA 4K7IA 22GSA 2TIRA 1SYRA 2MYGA 5CO3A 4XS1A 3A2WA 3KGKA 3LORA 4XS4B 5CNWA 1Q4JA 1XOAA 2VAFA 2AHEA 3U5RE 3GL3A 2L5LA 4OD7A 1V98A 2DJJA 2H19A 3QR6A 2RM5A 4XCSA 3IRAA 3PGTA 1XIYA 2TRXA 5CRDA 1WRYA 3ZIJA 5IOWA 3PH9A 1YKAA 4GRFA 3TKSA 2GQMA 2L57A 1TU7A 5GAPD 2NTOA 3GH9A 3UARA 1GNEA 1ACVA 1ERUA 5IM9A 5IIZA 4ZB8A 2J23A 3FKFA 1EEMA 5AGYA 4EDZA 1CQHA 1WOUA 2F3MA 5IMVA 4PX1A 4LMVA 2OBIA 3V1WA 3ZLPA 1W89A 5ELGA 3GA4A 1WJKA 2AJQB 3VFIA 1YF0A 3BBYA 3HHVA 3ZMKA 1A23A 1IYIA 3ZZXA 3F3RA 3HJMA 2FNOA 1T1VA 2I1UA 5IOXA 4EF0A 2FWGA 4N10A 2B5YA 1YEPA 5ABRA 2C8UA 2KP2A 1GSQA 1R26A 2X99A 3H79A 1GSDA 5E4WA 4X1UA 3EE2A 4N30A 4WEYA 3F6FA 2H0HA 4JBBA 4GSTA 4D73B 3CRUA 1SK1A 1XW6A 1THOA 2KHPA 1HQOA 2HLSA 4DSQA 4WR4A 4KCAA 4K0GA 1K0CA 3DVXA 3D0ZA 4JEDA 5F0GA 1WIKA 2VM2A 3O76A 2PGTA 2P31A 5INYA 5EL8A 1X5EA 3IAS2 3IXRA 3HVSA 1JZDA 1UN2A 1X9SB 3GUSA 5GSSA 1S3AA 5J9CA 4L0WA 2KLXA 4V1Ag 12GSA 4TVEA 1N2AA 5COHA 3NOFA 3DRNA 2K8VA 3HXSA 5ID2A 3IAM2 4N0ZA 1Z6MA 1BG5A 3KZQA 4IQ1A 2N5BA 5J4UA 2OE0A 4GQFA 4O5RA 3ZYWA 1F9MA 1GTAA 1EEJA 2PVQA 5D96A 2YWIA 2YOIA 5KN0A 2F51A 6GSVA 5FHIA 4NXIA 4BL7A 3WGEA 5G5FA 9GSSA 4V2LA 2O7KA 2FWHA 1ZMAA 2GQKA 2HI7A 2H72A 3A5WA 2H76A 3HYPA 5HFKA 1F37A 5DVBA 4GF0A 5JWQB 3LG6A 1VGLA 2I3YA 5G31A 2CA8A 4WBJA 2VLTA 1T4YA 5CP1A 3F4SA 14GSA 3HZ8A 2DSAA 5FWGA 3MSZA 2ZNMA 3GMFA 4ACSA 2IMFA 4K2DA 4CDOA 4OMVA 3TRXA 1GUHA 2NPBA 1GSEA 1T4ZA 2FA8A 3EMXA 5G30A 4AF2A 1A2MA 3CTGA 2YJHA 1AAZA 1UVZA 3S9FA 2H8LA 2QSIA 2CV4A 2LTKA 1A2LA 2CVKA 1K0BA 3EWLA 4ISDA 5B6MA 4KAEA 2V32A 1SK0A 2QKEA 3E0UA 4KCEA 1RQMA 3TRPA 2IFQA 2JACA 1GP1A 3LYKA 4ECJA 2X8CA 4OCEA 2V2GA 2X8GA 2LV3A 3WGXA 1PQNA 4ZBDA 3IV4A 3A2XA 3TGZA 4OFTA 1WWJA 4G2EA 2WB9A 3KP8A 3VLNA 3OR5A 3WGDA 2WDUA 3HVXA 3ERWA 3WD6A 4Q5RA 2I81A 2YNXA 1QQ2A 2LRNA 5ECHB 2L6CA 3TKRA 2FHEA 1EOHA 3M3MA 1SYXA 4JE1A 1OC9B 3FYGA 3EINA 4X0XA 1TOFA 6GSTA 4GTUA 2O87A 3KJYA 1GNWA 4HQZA 1OKTA 4IHUA 1ON4A 3GKXA 2LS5A 1B8XA 1VF4A 4MF7A 1BYEA 2DJKA 2QC7A 4KSMA 1MDIA 5ECKB 2VUPA 4L0UA 3F3QA 2YV7A 1K3LA 2H0GA 3WT1A 5IPGA 4MLYA 3C73A 3BD2A 2KP1A 2JADA 3QOUA 1AQVA 3UIWA 2VD0A 2X64A 1ZYEA 4BWSA 2CQ9A 2WRTA 5D9TA 5DALA 4PUFC 4WXTA 2R6KA 4IJIA 3HVVA 4EC0A 2RUEA 4MMMA 6GSYA 2PWJA 3HCZA 2E7PA 2C0GA 1M7TA 5F05A 3EMPA 1B9XC 1GUMA 5DAKA 2H73A 4YAVA 3ZITA 2O89A 3MNGA 1SL1B 1ZL9A 1GH2A 1XCCA 3CRTA 5JWOB 1FW1A 2O8VB 2V1MA 1TI1A 1KNGA 3ZMLA 3C1SA 3DWVA 1TTZA 1TXXA 2H6ZA 3D21A 3NIVA 3Q74A 1WE0A 1OE8A 1OVNA 4TKYA 3P2AA 2JL4A 3G7IA 2JU5A 5L71A 2G0FA 4TR1B 1XWGA 3DGQA 2IN3A 3LGCA 1THXA 1Z9HA 1SD9A 3U6VA 2PUKC 1BJXA 4KDXA 1XVQA 2HRNA 3FW2A 4NV2A 6GSXA 2HFDA 4G9HA 3D5JA 5KN1A 1XZOA 1J08A 4ZB9A 1GLQA 1V40A 2IPAA 4WKWA 5ECLB 1K3YA 3APSA 1SJ6A 1N8JA 1X0RA 1R5PA 5AISA 1FO5A 1PGTA 2E2MA 3H93A 1AC1A 1XOBA 3IOSA 1FB0A 4F2IA 2YCDA 3GTUA 1EGRA 4FYUA 2XBQA 2ZUPA 1MTCA 2DJ3A 3TOUA 4KB3A 2MBSA 5IMZA 3Q19A 5D93A 2A4VA 4LA1A 2HYXA 2AV4A 1PKWA 4NPBA 3UBLA 5A4VA 4PQ1A 3P90A 3KM6A 4BPYA 4MJCA 1O7UA 4XRAA 1TK5B 2YPMA 4MZWA 3VWXA 5J5NA 3C71A 4I2TA 3IC4A 1G7EA 1DE2A 3ZFLA 3BCKA 3N5OA 5GSTA 4RI7A 4L5LA 1U3AA 3TKSE 2B3SA 3VPQA 1R7HA 3Q6OA 5JWRB 5D9WA 4TXOB 4JR4A 1I9DA 3GV1A 4I8BA 2PN8A 3LSZA 4I5QA 4F0BA 2MMAA 4EE0A 1W4VA 4DEJA 3DMLA 2AYTA 4KE3A 3TB2A 1PL1A 4XS6A 4IN0A 2WULA 2V41A 2H6YA 4IS0A 4P3YB 2L4CA 3DXBA 2VL2A 2R37A 1U87A 1TJDA 4ID0A 2D2ZA 3GKNA 5CAXA 2LRCA 5J9BA 2B5EA 3KIJA 4RI6A 2FUG2 6GSWA 4RUVA 2LUSA 3ME7A 3TOTA 4ILFA 3VI7A 3QDNA 4DSRA 1AIUA 4GCIA 3CXGA 3C7MA 3M9JA 2JZTA 3QPMA 2H71A 2OKAA 4LL1B 3TKQA 4KGIA 2DJ1A 2KOKA 4ZXGA 2NBSA 3TJKA 2LQQA 4CHSA 4G19A 4DSSB 3FY7A 4MF5A 3QAVA 4EL1A 2IMKA 2IMDA 1O8XA 4KX4A 2AAWA 4V1Ap 4F03A 4WR5A 4YQMA 1Z6NA 3DYRA 4K8MA 4HU9A 4MP4A 1BAYA 4FH8A 1WMJA 3L78A 1OE7A 1HNBA 3HJOA 4QL9A 3FEUA 3F63A 1ZOFA 2HE3A 2CAQA 5H5RA 5G5EA 1M9AA 3NZNA 4Q5NA 5ECMB 11GSA 18GSA 4N0VA 3CMIA 2IL3A 2X8HA 4XRDA 4PQHA 4K1FA 1GWCA 1ML6A 2HZFA 3TJJA 2YZHA 3TDGA 3KH9A 3MAKA 3HA9A 3HZ4A 1FVKA 3HJPA 1YJ6A 3QAWA 1ZCPA 3IA1A 1AW9A 4TRXA 3GIXA 5F8BA 4HI7A 2H01A 3FZ5A 3L4NA 3KH7A 1XWCA 3UOMA 3TRQA 5KEJA 2WS2A 3VPTA 1YEXA 4K0NA 1SL2B 2IWTA 1EGOA 2YWOA 4GSSA 1FOVA 1T00A 3GL5A 5GAND 4EDYA 1YZXA 2FLSA 2CX4A 4YQVA 1Y6EA 1WPIA 5DQYA 1PSQA 1FHEA 3FR9A 2HZEA 3KXOA 4EUYA 1JZRA 1YY7A 4KW6A 1Q98A 4MA9A 1ERWA 3FZ4A 4DVCA 2ALBA 2H75A 2JZRA 3KTLA 4XHMA 4AJ6A 3J7Yb 4F0CA 4KNDA 3JCML 4MF6A 2GSSA 5KN3A 4N11A 1O73A 2K18A 5C04A 4V2NA 1MDJA 2OACA 1USBA 4ZBAA 3ERGA 4BVXA 1K0AA 5DDLA 4FIWA 3WT2A 4AJ8A 2OADA 4OWYA 2CZ2A 2C3TA 3F9UA 3P7XA 4BVYA 1H75A 3DIEA 2JSYA 1GRXA 1TP9A 1MD4A 5ELAA 5HR1A 3H1NA 3Q18A 3D4MA 1ILOA 1XPVA 4KDYA 3IPZA 1GLPA 1GTIA 1EV4A 1BX9A 2EIRA 4NHZA 2F9SA 2PPTA 4H86A 3FZAA 4K7NA 1E6BA 3H8QA 2VCTA 4PQIA 4NMUA 3EU3A 2C0DA 1DBYA 5DQSA 3F8UA 1BQ7A 2LRTA 3ZRDA 4MZBA 3US3A 5ECQB 3LXZA 1SKWB 4V2MA 3CSJA 4POKA 5D9VA 4TXOA 1XWBA 5B6NA 3A2VA 1WP0A 2L4QA 3IK7A 1AQWA 1VF1A 1NW2A 1ST9A 4HZ4A 1U6TA 5EPFA 2VO4A 1A8YA 2WJUA 5LNKe 3L9UA 3GN3A 2VD1A 2ON7A 1U88A 2VCQA 4HUAA 3GX0A 4WF5A 5FT3A 3APQA 5ECOB 2VL2C 2YANA 3O6TA 4XS4A 2GZYA 2LJKA 1XVWA 2C4JA 2XPEA 1O81A 3H4KA 3TJBA 4MZCA 1QXHA 2GDRA 4POLA 2V6KA 5D9XA 4MH3A 2FA4A 3KEBA 4GQCA 3ZREA 3FHKA 3TKSC 1GSUA 3MWHA 3ZVJA 1T8EB 1HYUA 1EZKA 2N5AA 4IBPA 2B7JA 2GLRA 2HT9A 4ZB6A 3VWWA 1K0OA 1Z5YE 5CREA 3D6IA 1T7PB 2IMEA 6GSUA 2IIYA 2P0GA 3P8WA 4GXZA 3KD0A 4HJMA 3WYWA 20GSA 1M9BA 2NDOA 3GSTA 3TJFA 1F2EA 2LJRA 1KTEA 1SKRB 1B4QA 17GSA 2R4VA 4IELA 3ZL5A 1B48A 1FB6A 3L0HA 3APOA 4I6XA 4G10A 5JCWA 1QUWA 1LBKA 1OKDA 5IO0A 1RK4A 2C3NA 5ECRB 5B8BA 1TI3A 3CSIA 3K8NA 3VI5A 1X5DA 3ZIVA 2YWNA 1OC8A 1R4WA 4O7HA 5DJMA 4MK3A 3G7JA 5ID2B 4LLRA 2K6VA 2YP6A 4F9ZA 2YWMA 3F4TA 4MCUA 2A2SA 2JSZA 1SJIA 5KN2A 5HR3A 4IW9A 2XC2A 4D73A 2B6MA 3RHCA 4TR0A 3GHAA 1K0MA 5A5KA 3VWVA 3LFLA 3C8EA 2BTOT 2RM6A 1HNAA 3TKPA 1DSBA 2YV9A 1M2AA 1G6YA 2C0FA 2R5GA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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