1XVQA

Crystal structure of thiol peroxidase from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
166
structure length
159
Chain Sequence
AQITLRGNAINTVGELPAVGSPAPAFTLTGGDLGVISSDQFRGKSVLLNIFPSVDTPVCATSVRTFDERAAASGATVLVSKDLPFAQKRFCNVMPASAFRDSFGEDYGVTIADGPMAGLLARAIVVIGADGNVAYTELVPEIAQEPNYEAALAALGATS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Functional and Structural Characterization of a Thiol Peroxidase from Mycobacterium tuberculosis.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Mycobacterium tuberculosis
molecule keywords thiol peroxidase
total genus 45
structure length 159
sequence length 166
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2004-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1xvqA00
1O6JA 3HJMA 1S3CA 1XOAA 5F06A 1K0BA 2CA8A 3C8EA 4ID0A 4L0WA 1UVZA 2F51A 2P5QA 4MMMA 1J9BA 3GUSA 4Z7XA 3KTLA 4K6XA 3DRNA 3TRPA 4PUFC 2H75A 3CSJA 5IMZA 1A24A 3LEFA 2B1LA 1ZCPA 3N9JA 4ZL8A 1GSSA 3EE2A 6GSSA 3QCPA 1RK4A 3F0IA 3UIWA 1A0FA 5FHIA 4EXJA 2KP1A 4O92A 1G7EA 2DIYA 3K8NA 12GSA 1PL1A 2X99A 1ST9A 2I1UA 1X0RA 2LSTA 2PVOC 4ZL9A 2VAFA 4K7NA 1UC7A 2CAIA 4NWYA 1NHYA 4MCUA 5DVBA 3A3TA 3CSHA 3L9SA 5G1LA 5H5QA 3IAS2 5G5EA 4WR4A 3S9FA 2L59A 2JL4A 2MZCA 4G2EA 1AW9A 2C0DA 4TN8A 1K0CA 2IMEA 3UMAA 1PGTA 5CP1A 4FYCA 2LRCA 2I3YA 2FUG2 2GSRA 2RLIA 2GLRA 5D9WA 2L4CA 1KEBA 3M1GA 5AISA 1EP7A 3IK7A 4GQFA 3LFLA 5IMAA 3HXSA 3QAVA 3A5WA 1WIKA 4POBA 1WMJA 2HZEB 4CW9A 1G7OA 1PQNA 5JCUA 2QGVA 2XBIA 4EO3A 2DSAA 1OKTA 4JEDA 4K8MA 1SENA 3HVSA 2MMOA 3MAKA 1QGVA 2FNOA 4JR4A 4TXOB 4IQ1A 1M99A 3O3TA 3I69A 5J41A 1HD2A 2X8GA 4GWRA 2YJ7A 5ECRB 2HE3A 2X8CA 3PH9A 2VOCA 3RPNA 3FY7A 4J56E 4TXOA 2NVLA 3L4NA 1GRXA 1QXHA 1BEDA 2TIRA 1JZRA 1FG4A 1X5EA 1NM3A 2VL3A 2K6VA 3IA1A 3TJJA 2OE3A 7GSSA 1I5GA 1AXDA 3BJ5A 4ISDA 4PUAA 1ERWA 3WGDA 4GTUA 1Z3EA 2IMKA 3M9KA 2R2JA 5ECQB 2OBIA 2O8VB 3KTBA 4XS4A 4XRDA 5A4VA 3D4TA 2RIIA 4OWYA 1M7TA 1PN9A 3GURA 3GH9A 4KW6A 4ECJA 4OMVA 3ZIVA 4IJIA 2H76A 1MTCA 1V2AA 2N5AA 1WWJA 1ZGNA 2LKUA 1A0RP 2CT6A 5G30A 1K3LA 1DSBA 4Q5NA 3FKFA 1R5AA 4Q5FA 1YJ6A 1A2JA 4LMWA 1TK5B 3SBCA 4O32A 1ERVA 4IP6A 4YQMA 1H4OA 2WS2A 1MD4A 4LA1A 5ECOB 4WF5A 3G9BA 4N0ZA 1GSDA 2GGTA 5HR3A 2JSYA 1GUKA 3PGTA 4TR1B 3U5RE 4I2TA 3KEBA 2LRNA 2YV9A 5COHA 4E8HA 2YWNA 4MPGA 4WETA 4LMVA 5HFKA 5CNWA 3LXZA 1U6TA 1W89A 4YAVA 4KB3A 1JHBA 3FHKA 1JZWA 4KE3A 4IJ3A 1ACVA 5G5FA 4I2UA 2YV7A 4TR1A 1GNWA 1F3BA 3G7YA 3EINA 1XVQA 5B6NA 1J08A 2P0GA 3RHBA 2H74A 4IELA 3OR5A 2AHEA 5AGYA 1N2AA 5JWQB 1EV9A 3TKPA 1Z6NA 5CREA 4AJ6A 2MBTA 2AV4A 5HR0A 1JLWA 1XW6A 2H1BA 3W8JA 5DAKA 1M9BA 1JLVA 2H72A 2H8LA 3L78A 3VURA 3VWWA 2CX3A 2C3TA 2LS5A 2JU5A 3W6GA 4OCFA 5LNKe 4ZB6A 2CX4A 5D8IA 3IRAA 3GL5A 1OC9B 3UEMA 1CQGA 1GTBA 1N8JA 2VUPA 4K1FA 4V1Ag 22GSA 4KCAA 4ILFA 3CTGA 2NBSA 16GSA 3FZ5A 1WPIA 4HU7A 2ZUPA 3J7Yk 1PL2A 6GSYA 2LEGA 3RBTA 2VM2A 2WRTA 5J9BA 2GS3A 2FCHA 2HFDA 5D9VA 3HVVA 5ECMB 2L5LA 5GSTA 1TRWA 1EP8A 5G1KA 1SK1A 2LQQA 5DALA 3WT2A 3F4TA 2C4JA 2B1KA 4K0GA 3IV4A 4EE0A 2OACA 4ZBBA 2RUFA 3TJKA 1GLQA 3TJFA 3IHQA 3BD2A 5ECPB 2L6CA 2ON7A 3AY8A 1TRUA 4MK3A 4N0VA 3HYPA 2PVQA 4KCEA 2V1MA 3VWXA 4BVXA 3TKSC 2VCQA 1T3BA 3ZVJD 4ZBDA 2C80A 2M46A 5EY6A 4WEYA 1XFLA 2H30A 2D2ZA 1VGLA 2WDUA 1LBKA 2A2SA 4AF2A 1DUGA 1QK8A 4EC0A 3UOMA 4D73B 3CXGA 1XWAA 2LRTA 3DKSA 5D9TA 1DBYA 1OC8A 4ZBAA 2I4AA 2F8AA 3WD6A 5FT3A 3F3RA 4G9HA 19GSA 4EKZA 1EWXA 4TVEA 3A2WA 4NAXA 4HI7A 4ZL7A 1UA5A 2X64A 5J3RA 1GUHA 4V2MA 4HJ2A 3ZRDA 1NW2A 1TDIA 2REMA 2YNXA 1O7UA 1R4WA 1XW9A 3FZAA 2K18A 5IQYA 4F0CA 4MPFA 1TOFA 1F9MA 2R4VA 4ML6A 1SD9A 3PINA 1TP9A 3IDVA 5JWOB 2YJHA 3G7IA 2LUSA 5D93A 4ZB9A 4V2NA 3H1NA 2MMZA 3GL3A 4KNDA 4RUVA 4MZWA 4HUAA 3FZ9A 4YAPA 3CMIA 3TOTA 2Z9SA 1ML6A 1RQMA 4P3YB 1HNAA 4HZ4A 3FR9A 1WJKA 2OE0A 4TR0A 5GSSA 1WRYA 2G0FA 3TKSE 2YZUA 4F2IA 3KH7A 4NHWA 1QUWA 4OO5A 2H73A 2PPTA 3TJGA 3GX0A 1EOHA 5ECIB 4X0XA 2WJUA 2C0EA 4PX1A 1VF3A 5B8AA 3F9UA 3GNJA 2FWHA 4KUNA 1Z7RA 4MJBA 3LG6A 2PWJA 2LNTA 3M3MA 2P5RA 1ZYEA 3KMOA 1TK8B 4EVMA 4L0UA 3QD9A 4YH2A 4PURA 3D21A 2KOKA 3NOFA 2H66A 3QFBC 2JADA 1OC3A 3WT1A 2V41A 2GTUA 4IHUA 2HNLA 2PERA 3CYNA 4KX4A 1SJ6A 1O81A 4MP4A 1HYUA 1X5CA 4KDYA 4AJ7A 4K0NA 4PNGA 3FEUA 3ME7A 1V9WA 2DLXA 1PA3A 5CRWA 3QOUA 2HXKA 5G2ZA 5A5KA 2CZ3A 1ON4A 3ZLPA 1ZYQB 1KNGA 1MEKA 4FYBA 8GSSA 2MMAA 1YY7A 1FVKA 3CRUA 3KJYA 5ELGA 1GTAA 3E0UA 3JCML 4QL7A 2VM1A 3VPQA 1OYJA 1AIUA 2K8SA 5H5RA 2I81A 4GLTA 1VRSD 3ZMLA 2L5OA 3F3QA 5IOWA 5F0GA 3P2AA 2C3NA 1EEMA 2WZ9A 3GRXA 5H5SA 3FK8A 2R37A 2H71A 5HR1A 2H70A 3APQA 2ALBA 1PMTA 3J7Yb 4HU9A 2G2QA 3EVIA 3N5OA 2PU9C 1A2LA 14GSA 3WGXA 5IMCA 2GSTA 5DJLA 3VFIA 5IIZA 2DJ1A 2YWOA 3ZZXA 1XBSA 20GSA 3Q18A 4Q5RA 4OFMA 3HHVA 2L4QA 2VO4A 3BCIA 4PXOA 1K3OA 3UAPA 1Z7PA 1ERUA 5J5NA 1BYEA 4FIWA 5CRDA 5DBQA 1AQWA 2HRFA 4XS4B 3F63A 4LLRA 2F9SA 3CRTA 3ZFBA 1ZOFA 17GSA 2VCXA 3GA4A 3FZ4A 3KXOA 3A2VA 2X8HA 2VLUA 3GV1A 2YZHA 3EC3A 1AAZA 1NSWA 1BX9A 1PX7A 2OJLA 3QDNA 3WGEA 4JZQA 4HEA2 5D96A 3D5JA 5ECSA 1TU8A 2OADA 3M8NA 1SKRB 3US3A 5KN2A 3ZL5A 5C00A 1K0AA 3BCKA 3C73A 4XS6A 2JZRA 2KUCA 3FR3A 4FH8A 2H6YA 4KH7A 1DE2A 4EL1A 5LCZA 2QC7A 1SK0A 1Z6MA 3FYGA 1GWCA 2YCDA 5E59A 2H6ZA 1HNBA 4X43A 3GYKA 5IM9A 3E9JB 3F4SA 5B7CA 1MDJA 1XWGA 3ERFA 3EMPA 1LU4A 2OE1A 1QFNA 4EDYA 2HSYA 3G7JA 3H8QA 3WYWA 3FR6A 2FD3A 2VL2A 1EZKA 1V40A 1B4QA 3BBYA 1BJXA 2CZ2A 4PNFA 1PD21 4K2DA 1YKAA 4EF0A 4POKA 2EC4A 4JBBA 4L5OA 3EURA 1F37A 2DJ0A 1EEJA 2JZTA 1K0OA 2TRCP 4XRAA 4QL9A 1XZOA 3I6AA 4POMA 4GSTA 2AB6A 1F6MC 1GUMA 5JCGA 4O5RA 3M0FA 3GSSA 3ZVJA 2LTKA 1XPVA 2ZNMA 3IR4A 1ZZYA 2IMDA 3HVXA 5DAKB 4X1UA 3HY2A 4V2LA 3VLNA 3RAZA 2A4VA 1Q4JA 1Y25A 4NPBA 1TW9A 1BQ7A 2VD1A 3R2QA 3VK9A 5IOXA 3V1WA 4I8BA 5ECKB 3VI7A 4OCEA 3HJPA 2ZCTA 5DCHA 3APOA 3DMLA 3CTFA 1B9XC 1ZMAA 2VL2C 2ON5A 5IPGA 1ERTA 1GLPA 1FHEA 2YP6A 4IP1A 3IXRA 2IN3A 2B7KA 3DGQA 1XCCA 4K7OA 1TRVA 3KP8A 3C1SA 4RQRA 2J9HA 1TKDB 3RDWA 4PQHA 2E2MA 4DSSB 2LNSA 5E4WA 2M80A 1K0DA 5CYYA 2H0GA 5DALB 2CQ9A 2AUVA 3DIEA 1UN2A 1KBNA 4OFNA 4GSNA 3KCMA 5GAND 4WR5A 5EPFA 2VCZA 1MDIA 4CHSA 4CDOA 1TJDA 2H1DA 2VCVA 3ME8A 4DSSA 3TJBA 3KIJA 4ULXA 2YN1A 3ERGA 1SL2B 1Y6EA 5KN3A 2M72A 4AGSA 4HZ2A 1U3AA 2N5BA 3H93A 1KTEA 2DJ3A 4DSRA 2H6XA 4IS0A 4G10A 2AAWA 4WKWA 2YANA 4RI6A 3DD3A 4OO4A 4OFTA 5DDLA 3QFAC 9GSSA 1SL1B 1C72A 4KA0A 2MBSA 3TKRA 1PRXA 4I6XA 5CRGA 3ZREA 5ECNB 3HDCA 1SYXA 4WF4A 13GSA 6GSUA 2PUKC 3LQ7A 3ZIJA 3DVWA 3E3EA 3EU3A 3GKNA 1X9SB 1OE7A 2H0HA 1NHOA 3QAWA 1B4PA 1THXA 4NHZA 4DSQA 2OBKA 1PKWA 4I5QA 5CRHA 3RHCA 3IOSA 2ES7A 5DCGA 6GSXA 1HNCA 3VWUA 2GSSA 4JRRA 5F07A 1Z9HA 4IQAA 1URMA 2V2GA 1QQ2A 3GN3A 3F8UA 3TUEA 1K0MA 1V98A 3IK9A 4NXIA 2GT6A 5JCWA 1F2EA 1GTIA 3VI5A 2IL3A 4MJCA 2XPDA 3GKMA 4QQ7A 2OA7A 5A4WA 5ECLB 3IE3A 3RPPA 3IC4A 3EWLA 4N10A 3C71A 1XVWA 1YQ1A 4ECIA 3DVXA 3UBLA 2I9HA 3C7MA 3TB2A 5D9XA 2P31A 4FYUA 3KM6A 2RM5A 1GSYA 1GNEA 5HQPA 4AJ8A 3FRCA 3GSTA 5B6MA 2FA8A 6GSTA 1XWBA 2FLSA 3IAM2 2H19A 3H4KA 1GSEA 2KLXA 3UL3A 3TKQA 3P8WA 1JZDA 2DIZA 3H79A 3VPTA 1EV4A 1SKWB 5IO2A 5IO0A 1OAZA 3ZFLA 2DC5A 1GSUA 2C8UA 1M0UA 1V57A 3F6FA 2LQOA 4ZIJA 3KZQA 4JE1A 3KGKA 5IMDA 2H1AA 2C0FA 5INYA 5KEJA 1FVJA 3TDGA 1XOBA 2JZSA 3DXBA 3P90A 4TKYA 2V6KA 4HOJA 3TRQA 2F3MA 5KN1A 2FA4A 1THOA 2V6OA 1TTZA 3D4MA 3KH9A 4N30A 1M2BA 1XW5A 2YWIA 2B3SA 3UARA 1AUCA 2LJAA 1R7HA 4KSMA 2RM6A 3GKXA 4L5LA 4MZBA 1EGOA 1SD8A 2AYTA 2R5GA 3Q74A 4HJMA 2VLTA 1R5PA 2DJ2A 3Q19A 4MJAA 4JR6A 2B7JA 1XWCA 5D73A 4GSSA 5J4UA 3EYTA 3MSZA 2GQMA 3HD5A 1SL0B 2GT5A 1YF0A 1PKZA 5HFIA 1IYHA 1WE0A 3TRXA 4BPYA 5ID2B 4KGIA 2HRNA 2GQKA 1T7PB 2VD0A 5ECHB 3ZMKA 5G31A 4TXVA 4HDEA 4XCSA 1BAYA 2NDOA 3HA9A 3NIVA 4ECCA 4PGTA 5ID2A 2B6MA 2HSHA 2E0QA 1GL8A 2QKEA 3DEXA 4XIHA 2GZYA 2J23A 5ABRA 2FWEA 3IPZA 4KDXA 4ECBA 2A2RA 3TGZA 1MD3A 3EU4A 3CBUA 2IMIA 2VCTA 1DE1A 2HLSA 2CAQA 5EL8A 1VF1A 2GQLA 1PSQA 2RUEA 2DMLA 1K0NA 4MF6A 5AIVA 4GF0A 3QAGA 3W8SA 2YOIA 4POLA 5CAXA 4V1Ap 2WB9A 4NV5A 3U6VA 4RI7A 5HFGA 1FB6A 2DJKA 2WCIA 1J0FA 1B8XA 1T4ZA 3ZTLA 3MDKA 3I9V2 2BTOT 3KD0A 3TCOA 3C1RA 1YEXA 5AIXA 3D22A 1PX6A 1B48A 1MDKA 1YDKA 4ZXGA 5IMVA 2NPBA 2HZEA 4MF5A 5DQSA 4O7HA 2WGRA 2HYXA 1GSFA 4MDCA 2V32A 3O6TA 1BG5A 4YQVA 2PMTA 3LYKA 3QR6A 2JACA 1O73A 2PBJA 2BJXA 4PQ1A 5C04A 1FW1A 1T8EB 3HZ4A 1U3IA 1FO5A 2C1YA 1QMVA 4TR4A 2XC2A 3ZITA 1SYRA 1R26A 2HZFA 4J57E 2B5YA 1YF1A 4HQSA 4IGJA 1XWKA 4IKHA 1M2AA 1CQHA 3ED3A 3UBKA 4FO5A 2C0GA 1Q98A 4LL1B 1USBA 1SU9A 2O89A 2EIQA 1XXUA 4XS1A 2H01A 3LYPA 1E6BA 1O8XA 5A4UA 5GAPD 4BL7A 1WOUA 2K9FA 3HCZA 3UVHA 4ML1A 1GTUA 6GSWA 3F4RA 2PN8A 4K7IA 1T4YA 2O87A 2E7PA 2B5EA 1SJIA 1GP1A 2VIMA 3LGCA 4E8EA 2N5FA 3F6DA 2R3XA 1ABAA 1T1VA 5FWGA 3A2XA 4F9ZA 1YKCA 2YPMA 4EUYA 2HT9A 1OE8A 2TRXA 6GSVA 2MMNA 3GHAA 1SKSB 2LV3A 3QMXA 4WBRD 1YZXA 2AJQB 2DBCA 1O8WA 4J2FA 4TRXA 1GSQA 4JU5A 1G6WA 4NMUA 5JWRB 3D0ZA 2CVKA 2IIYA 1K3YA 5DJMA 3VWVA 2C3QA 1AQXA 3DWVA 5J9CA 4Q5QA 4DEJA 5F05A 2CVDA 4MZCA 4GQCA 3GH6A 4K9ZA 2IFQB 1GULA 2IJYA 3GKKA 3P7XA 1AQVA 1VF2A 4IW9A 3UVTA 3FW2A 1ILOA 2E2GA 3APSA 2QSIA 1FOVA 1S3DA 2O85A 1A2MA 4H86A 4MLYA 2L6DA 3D6IA 2IFQA 2VCWA 4WXTA 4MABA 4MA9A 1G6YA 2PGTA 3KP9A 1T00A 4IBPA 3HJOA 5LD0A 1WP0A 1VF4A 5HR2A 2XPEA 3TKSA 1OVNA 1TI1A 2FWGA 1V58A 4IVFA 2WFCA 2LJKA 3GTUB 3ZYWA 5AN1A 1U88A 1XIYA 1X9WB 4TW5A 3ISOA 3LSZA 2H1GA 1TI3A 2FY6A 2CV4A 1A23A 1EGRA 3LXTA 2EIOA 3LJRA 4F03A 2F8FA 1SK2A 1X5DA 3LORA 3IBHA 3M9JA 3BOAA 1M9AA 3L9UA 1OC9A 3KMNA 4OD7A 1S3AA 2DJJA 4G19A 2NTOA 2KHPA 3GTUA 4ACSA 4EDZA 3ERWA 2VLVA 1ZL9A 4N11A 4XTSA 4KDUA 1M2DA 1EOGA 4NV2A 2VL9A 2L57A 2K8VA 1A8LA 2FHEA 2WULA 4ZILA 3NZNA 4MJEA 2DMMA 4HS1A 3QPMA 5L71A 4TR3A 2KP2A 3Q6OA 3CSIA 4XHMA 4BA7A 5CO3A 18GSA 1H75A 2XBQA 1W4VA 1YEPA 5DQYA 1U87A 2FGXA 5B8BA 2OKAA 1SJZA 1TRSA 3GMFA 4MF7A 1JZOA 3GFKA 4F0BA 2FWFA 3O76A 4BVYA 2O7KA 3SWLA 4WBJA 1IYIA 2IPAA 4I97A 1B9YC 3EMXA 4YQUA 1I9DA 2CVBA 2YWMA 3DYRA 4PQIA 5GZZB 2H0IA 3MWHA 1FAAA 10GSA 1E2YA 1OKDA 2BMXA 5F8BA 3UJ1A 4D73A 2GZPA 3HKRA 2JSZA 1FB0A 4ZB8A 2B5XA 4LL4B 4GCIA 5IPHA 1LJRA 3I43A 2MYGA 3TOUA 4HQZA 1X9MB 2R6KA 1O85A 2LJRA 1AC1A 4MH2A 1TK0B 4DVCA 2GSQA 1A8YA 5KN0A 1TXXA 2IWTA 1JFUA 4TOPA 1HQOA 4F82A 4BWSA 3L0HA 3L9VA 5IMFA 4KAEA 4RQXA 1GH2A 4GRFA 2GZZA 3GX8A 4IN0A 4GXZA 4KSOA 5ELAA 3HZ8A 5EVOA 2EIRA 1G0TA 1F3AA 4BWQA 1TU7A 2XHFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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