2ALBA

Nmr structure of the n-terminal domain a of the glycoprotein chaperone erp57
Total Genus 28

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
28
sequence length
113
structure length
113
Chain Sequence
SDVLELTDDNFESRISDTGSAGLMLVEFFAPWCGHCKRLAPEYEAAATRLKGIVPLAKVDCTANTNTCNKYGVSGYPTLKIFRDGEEAGAYDGPRTADGIVSHLKKQAGPASV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Isomerase
publication title NMR structure of the N-terminal domain a of the glycoprotein chaperone ERp57
rcsb
molecule keywords Protein disulfide-isomerase A3
total genus 28
structure length 113
sequence length 113
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2005-08-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2albA00
4LL4B 2H6ZA 4RQRA 2QSIA 3ZTLA 2EIRA 4YQUA 1TRUA 4IKHA 5JWQB 3UBKA 5DALB 9GSSA 18GSA 3HZ4A 1X5EA 4JZQA 2GSSA 4KDYA 1EOGA 3VK9A 4HS1A 1SD8A 4NMUA 3CTGA 5HFIA 1SYXA 1FOVA 1GWCA 2A2SA 4QL7A 3HJOA 2P5RA 1DE2A 3GX8A 4OD7A 2HZEA 3GX0A 2VD1A 4KB3A 2IFQA 3F4TA 3QD9A 1T8EB 1A23A 3CSIA 4LMVA 2DJ1A 3EMXA 1UVZA 2K6VA 1ABAA 4D73A 1S3DA 3IRAA 1BQ7A 4RI6A 4MH3A 3TKQA 4EC0A 4POLA 2N5AA 1GSFA 2L5LA 2I4AA 4N10A 2MYGA 4EVMA 4O5RA 1GLPA 4AGSA 3VWWA 2LRNA 2XBQA 5G5EA 5IIZA 5IPHA 4XS1A 2IWTA 4RI7A 3KTLA 2HSHA 2RM6A 3QAWA 4YH2A 1G6YA 3KGKA 1BJXA 3ZRDA 1XFLA 4YAPA 3IA1A 2LUSA 3LORA 2VM2A 4L5LA 3KH9A 2VCTA 1X5DA 4X0XA 3A2VA 5KEJA 3LFLA 3UJ1A 2L5OA 2H70A 3FZ4A 3EURA 5DDLA 3QFAC 2YCDA 2B5EA 2JADA 3P90A 4GCIA 5A4UA 3TCOA 1V40A 2FWHA 3GL5A 2YZUA 3KIJA 1U3IA 2H66A 5G1KA 3WYWA 1B48A 3F6FA 3MNGA 2FGXA 3FY7A 2FHEA 3E9JB 5ECQB 6GSXA 1GP1A 2VL2C 4TR4A 11GSA 2H72A 3CXGA 1FHEA 3M9JA 2GTUA 5INYA 2H6YA 5KN0A 1TK5B 1NM3A 1SJZA 1FO5A 2GDRA 2QGVA 1G7OA 2YV7A 3H79A 1ACVA 3KP8A 1B4PA 3APOA 4XS6A 2REMA 2L6DA 1FVKA 3GL3A 4IHUA 2WGRA 4V2MA 1PL1A 3ZFLA 3IXRA 3TJBA 2B6MA 2XPDA 5GSSA 1K0AA 4KSOA 2WRTA 3M3MA 5HR3A 4OWYA 2IMEA 5CAXA 2GSRA 1XWKA 1OKDA 3P7XA 4K1FA 2FNOA 4I5QA 5IMZA 3UL3A 3F6DA 2IMDA 4BWQA 5IMFA 3D4MA 3WT2A 4MZCA 2DBCA 1K3OA 3LEFA 2K18A 1MDKA 2K8VA 2VOCA 1JZDA 1GULA 1TXXA 3VWUA 1X9WB 2VL9A 1NSWA 1AC1A 2DC5A 1JLWA 2PWJA 3D6IA 2WS2A 2P31A 4XHMA 1OYJA 1TK8B 1C72A 4EF0A 2KLXA 4F03A 4L8EA 3KJYA 4JE1A 5IQYA 3I6AA 2FY6A 1TU8A 4I97A 5HFGA 3P8WA 1GNEA 2OACA 3FK8A 4K6XA 2FCHA 3EVIA 2CZ3A 3U6VA 3GFKA 4WR4A 2L4QA 4WBJA 3TGZA 3F63A 3FR3A 4OO4A 1AQVA 1ZYEA 5EL8A 3F9UA 3EMPA 2CZ2A 3LYKA 3TOTA 1YKCA 4OFNA 2PMTA 1BYEA 1V58A 1XBSA 3TRPA 5B8AA 6GSSA 4BWSA 2O85A 5L71A 3WD6A 4BVYA 2AB6A 1UN2A 3RPPA 4P3YB 4TW5A 1U6TA 5IOWA 5DALA 2H74A 1SK2A 1LU4A 3HZ8A 2R3XA 2KOKA 3GSSA 2DSAA 4ML1A 2VCVA 3Q18A 4IN0A 3KMNA 3GKNA 1A0FA 2ZNMA 1X5CA 4HU9A 4DVCA 3HDCA 1O6JA 7GSSA 2WFCA 2H1GA 5HR2A 1SJIA 1YKAA 5J4UA 4MP4A 4ECBA 1T3BA 4MJBA 5GZZB 3ISOA 4XRDA 1DUGA 4EKZA 3J7Yk 5HR0A 4BVXA 4ACSA 3UBLA 2GZPA 4OCFA 1SKSB 3LXTA 3US3A 2WB9A 6GSWA 3HHVA 4KX4A 1K0CA 4IS0A 1R5AA 5J9BA 5JCUA 5DCGA 5D9TA 3EU3A 1MDJA 5G31A 1ZZYA 5AGYA 3UVTA 3LSZA 4ZBBA 4HJ2A 3W8SA 1F2EA 4OMVA 5COHA 1QQ2A 3VFIA 2VCWA 2ES7A 2IMKA 4NHZA 2ZUPA 1OC9A 2G2QA 2VCXA 4HZ4A 3ZIJA 3LJRA 2JL4A 2WULA 2H1BA 2I81A 2C3QA 1M2AA 4G10A 1B8XA 5LCZA 4K8MA 1GTUA 3VWVA 1W89A 1V9WA 4GWRA 3TRQA 5F06A 1QXHA 1ON4A 1PD21 2LNSA 3HCZA 5EPFA 5H5SA 2AJQB 4ZB9A 1URMA 5AIXA 2CVKA 3SWLA 4OFTA 3UARA 2GSQA 2IJYA 3H93A 4AJ7A 2YANA 2YN1A 4K0GA 1UC7A 4PX1A 3L9UA 3QR6A 4MK3A 1FG4A 4TN8A 4O7HA 3CRUA 2HNLA 1EZKA 2M46A 1XW5A 4NHWA 2E2MA 5H5RA 4DEJA 5J9CA 3ERFA 3EINA 4WEYA 1TJDA 2FWGA 2LKUA 2LJRA 1TI1A 2H19A 2FD3A 4JU5A 4TXOB 3TJJA 1WRYA 3ZLPA 4CDOA 5IOXA 1B4QA 4HOJA 4TR3A 2FA4A 4K7OA 3KEBA 4TR1A 1O73A 1EOHA 1Q98A 1OE8A 1Z9HA 2D2ZA 2H75A 2I9HA 4MF7A 1BX9A 5E4WA 1R26A 4X1UA 1TRVA 3D4TA 2JSZA 2R4VA 1ZYQB 4TXVA 2KUCA 2LQOA 4WXTA 5J3RA 4ECCA 4ECJA 4N30A 2B7JA 1RK4A 1RQMA 4XCSA 1Z3EA 3N9JA 3H8QA 3A2WA 1T1VA 2CX3A 1KBNA 3DKSA 2H73A 4IVFA 4TKYA 1F9MA 1DSBA 1OC3A 2R2JA 2VCQA 3ZYWA 4EE0A 4XRAA 1ZL9A 2PU9C 4KDXA 3TUEA 1TP9A 2IIYA 1ZCPA 3D5JA 1XXUA 2HRFA 4GSSA 5D9VA 3HD5A 2M72A 1YDKA 2H1DA 4MH2A 2PN8A 5ABRA 1AXDA 3IHQA 4L0UA 1O7UA 1NHOA 1AIUA 1F3AA 1M2BA 3IK7A 2LTKA 3G7JA 5HQPA 2V6OA 2NBSA 3C73A 1OAZA 4J57E 4NWYA 1HQOA 4GRFA 4DSSB 1MDIA 2B3SA 2GLRA 4IP6A 3F3RA 5A4VA 2JSYA 1SK1A 5AIVA 2OKAA 1R4WA 3VI5A 3GN3A 4KDUA 3HKRA 1K0DA 1VGLA 3GTUA 1K3YA 5G5FA 4GTUA 1PA3A 1XWAA 3L9VA 1S3AA 2LV3A 1HD2A 4MJAA 2NPBA 19GSA 1GTIA 3BBYA 2HYXA 1EEMA 3DD3A 1GSSA 1OC8A 2A4VA 1XVWA 4QL9A 3EU4A 5B6NA 3NIVA 4DSRA 5DBQA 1N8JA 3CSHA 2GT5A 5ECLB 4AJ8A 4GLTA 2TRCP 2MMAA 2C1YA 3H1NA 2WJUA 1MEKA 5JCGA 4EDYA 3FRCA 4V1Ag 1TI3A 1WJKA 4PUAA 4PUFC 2VL2A 1PQNA 4HDEA 1SKRB 3HXSA 3ZZXA 4N0VA 3LGCA 2IL3A 4KA0A 3KM6A 2NTOA 2O7KA 3TKSC 3CBUA 1GSDA 4IJ3A 2I1UA 4N11A 4I8BA 4K9ZA 5ID2A 5ECNB 4GQCA 3GNJA 12GSA 4ILFA 5KN3A 4V1Ap 2GVPA 2DJ0A 3DWVA 3HYPA 2G0FA 2OA7A 4MPFA 4ECIA 4EL1A 3GSTA 3M9KA 1FVJA 3RHCA 3DMLA 5CYYA 3OR5A 2LJKA 2TIRA 2HI7A 3O6TA 3NZNA 4Q5QA 1TDIA 1Z6MA 3ZMLA 4ID0A 1WPIA 4XS4B 3E0UA 1QFNA 4KW6A 3TOUA 5ECPB 4FIWA 2DIZA 2QKEA 3F4RA 4JR4A 5ELAA 3Q74A 4JBBA 4O92A 3GRXA 3QFBC 4JRRA 1EGOA 22GSA 4MF5A 4AJ6A 1LJRA 4F9ZA 2YZHA 1TRWA 5ECMB 5J5NA 4GF0A 3I9V2 4KH7A 2F51A 3ZITA 4IJIA 2LRTA 3IDVA 1M99A 5C04A 5CP1A 1RW1A 4MLYA 2CAQA 1XW9A 2V41A 1PN9A 2FWFA 4TOPA 4POMA 2X8GA 1T00A 1TRSA 3ME8A 4L0WA 1SK0A 1MD3A 3M8NA 2CVBA 4LMWA 3A3TA 3FZAA 2JU5A 2YJ7A 1ZOFA 2H1AA 2WZ9A 4E8HA 1X9MB 4F0BA 2R37A 1YEXA 4HQZA 1JZOA 3N5OA 5GAPD 5CO3A 2P5QA 2RIIA 5DJMA 4ML6A 1KTEA 1Q4JA 4BPYA 5F07A 1K0MA 1XOAA 4NPBA 2F8FA 2X99A 1OVNA 3U5RE 1B9XC 3D0ZA 3HVXA 5JCWA 1VF3A 2EIOA 3QCPA 5IMVA 16GSA 5DAKB 3EYTA 3GIXA 1DE1A 3IV4A 2V32A 1OE7A 2F3MA 5D9WA 2B7KA 1XOBA 5HR1A 1I9DA 1GH2A 1GSQA 3F3QA 4CW9A 3LWAA 3HJMA 1XVQA 1MTCA 3UIWA 1WP0A 2CQ9A 1XWBA 4KCEA 2X8CA 4LL1B 1VF1A 1YF0A 5ECHB 2BJXA 4V2LA 2VO4A 1A2LA 5GSTA 1IYIA 5CRWA 4CHSA 2CAIA 5GAND 3FR6A 3CMIA 4MCUA 3C7MA 4PQ1A 1YJ6A 2RUEA 2HZEB 2ZCTA 1XW6A 3H4KA 2VLVA 2IFQB 2YNXA 2VLUA 1V2AA 3G9BA 1VF2A 5LNKe 1G6WA 2XPEA 2WDUA 4D73B 3TKRA 1M7TA 4WF4A 2GZYA 4PQIA 2H76A 2TRXA 1EV9A 3QAVA 2YWIA 3SBCA 1PX7A 3WT1A 5DQSA 5CRHA 2RLIA 3E3EA 2AYTA 1WMJA 2I3YA 3VLNA 3WGEA 3AY8A 2EC4A 5A5KA 2HE3A 2LJAA 2MBTA 3LXZA 1FW1A 1R7HA 4MA9A 1F6MC 4K0NA 1H4OA 1T4YA 4ZILA 5EY6A 2CX4A 3TB2A 5H5QA 1M9AA 2WCIA 3D21A 4RQXA 3GMFA 5IPGA 5CNWA 1M9BA 2J23A 1B9YC 4G19A 10GSA 4IELA 2FUG2 3HVSA 2J9HA 2B5YA 4OCEA 3G7YA 2YOIA 3APSA 4MPGA 3I69A 2XBIA 4MMMA 1KNGA 2GGTA 2CA8A 4TVEA 3W6GA 1JFUA 2OE0A 5JWOB 3RPNA 1MD4A 1A8YA 2KHPA 1PL2A 2PPTA 3JCML 3IR4A 4IW9A 2QC7A 4LLRA 1SENA 3L4NA 1U88A 5F8BA 1M2DA 3HY2A 3Q6OA 2HSYA 1GLQA 1ZGNA 3ZVJD 5DCHA 2ALBA 2R6KA 5C00A 2OADA 3GKKA 3KZQA 2HRNA 3KCMA 2HZFA 4OO5A 4OFMA 3C1SA 2MZCA 3HA9A 1ERWA 4NV2A 4HZ2A 5FWGA 2OBKA 3IAM2 4POBA 1G0TA 4HUAA 3D22A 4Q5RA 3PH9A 4WKWA 3HVVA 5B8BA 2LRCA 3BD2A 3UOMA 2LSTA 5CRDA 4ZL7A 2X64A 2HT9A 1WIKA 3CSJA 3RAZA 1CQHA 2L59A 2E7PA 3DVWA 4NAXA 4F0CA 4MZBA 4HI7A 1SL1B 4HQSA 1XPVA 4Q5NA 1GRXA 2KP1A 2RM5A 3APQA 1ZMAA 2X8HA 2OE3A 5B7CA 4FYUA 1GSUA 2PERA 2MMNA 4POKA 1GL8A 1A24A 4HEA2 2DMLA 2YV9A 3PGTA 2AV4A 3ME7A 2E0QA 1AUCA 2YP6A 2PBJA 2A2RA 3MAKA 1GTAA 1O85A 1PKZA 3KD0A 2C0FA 1F3BA 2KP2A 4K7NA 4TR0A 3G7IA 2CVDA 1JLVA 2H0GA 4K2DA 4GXZA 1V98A 3DGQA 4MDCA 20GSA 2GS3A 4RUVA 4XIHA 1X9SB 1HNAA 3KTBA 1QK8A 1EWXA 1E2YA 1BG5A 3DEXA 3EE2A 1ERUA 1JZRA 3R2QA 3TKSA 4GSNA 4ULXA 2MMZA 4ISDA 2XHFA 3TJKA 5ECKB 2VAFA 5HFKA 3KP9A 1XIYA 4KAEA 5G1LA 2R5GA 3QOUA 2GZZA 1A2MA 1VRSD 3FW2A 3FHKA 5ELGA 2B1KA 3WGDA 1VF4A 2K8SA 1DBYA 3IOSA 1XZOA 2OBIA 1BEDA 3FZ9A 1X0RA 3CYNA 4YQMA 3O76A 4F82A 1Z5YE 3IBHA 3F8UA 4ZB8A 1AAZA 2H30A 2L57A 2ON7A 3A5WA 3O3TA 5G2ZA 1GTBA 1T4ZA 3GKMA 2Z9SA 5F0GA 3V1WA 1O8XA 3DIEA 1PRXA 1U87A 6GSUA 2H0IA 1YEPA 1J9BA 4ZBDA 4PURA 2YPMA 1OC9B 2B1LA 1K0NA 2JACA 4KSMA 1U3AA 1EEJA 1GUKA 1YF1A 2L4CA 3QPMA 2GQLA 1HNBA 3GV1A 2DJ2A 5ENUA 1O8WA 1K0OA 1XWCA 2BTOT 2YWNA 1H75A 1EP7A 1GUHA 2EIQA 2VCZA 1G7EA 1JZWA 5D9XA 5D96A 4X43A 3ERWA 5A4WA 2HFDA 2IMFA 4AF2A 3C8EA 5AISA 3QDNA 3F4SA 1T7PB 2JZRA 5F05A 1OKTA 1SKWB 1TOFA 4YAVA 2MMOA 3M0FA 2PUKC 4GQFA 1WOUA 3RHBA 1YY7A 3ZIVA 3RDWA 14GSA 3KMOA 4KNDA 3GYKA 5KN1A 1K3LA 1SU9A 4ZXGA 5CRGA 3GA4A 3IC4A 2LQQA 6GSVA 4FO5A 3ERGA 1FAAA 5EVOA 1PGTA 2CT6A 1Z7RA 2V2GA 2YWMA 4KGIA 4TXOA 1WWJA 2N5FA 4K7IA 1XWGA 1YZXA 4TR1B 3DRNA 6GSTA 1AW9A 3DXBA 2NDOA 1W4VA 3UMAA 1A2JA 4KE3A 1SD9A 3TRXA 2XC2A 3FEUA 2VM1A 1PSQA 3FZ5A 2LNTA 1EGRA 4O32A 3EWLA 1GNWA 5IO0A 1EP8A 2N5BA 3CTFA 4MABA 3S9FA 2B5XA 4JEDA 2FWEA 2NVLA 5DQYA 4ZL8A 1S3CA 1A0RP 3KH7A 5D73A 2AHEA 4WBRD 4H86A 3C71A 1A8LA 4MF6A 5DJLA 4EDZA 3K8NA 5CREA 4NXIA 1USBA 1WE0A 2O8VB 4PGTA 5IMCA 3C1RA 4I2UA 3L78A 1F37A 1FB0A 4YQVA 2PVQA 4WETA 2F8AA 4ZB6A 4KUNA 5FT3A 1PX6A 3UVHA 1QMVA 1SYRA 5IM9A 2C3NA 3P2AA 2E2GA 3MDKA 1UA5A 3DYRA 1M0UA 1O81A 1V57A 3IE3A 2H0HA 3GUSA 2FA8A 5FHIA 3GURA 3WGXA 3RBTA 1GUMA 4IBPA 4GSTA 1TW9A 3VURA 4DSSA 4ZIJA 2VIMA 1N2AA 3PINA 8GSSA 2DIYA 1QGVA 1GSYA 3FR9A 4G2EA 1IYHA 4ZBAA 2GQKA 5D8IA 4PQHA 3MWHA 5ECOB 2C0EA 2DLXA 2GT6A 4PNFA 2DMMA 5ECIB 13GSA 3ZVJA 17GSA 3ZMKA 3FYGA 4IQAA 3GTUB 3I43A 4HU7A 3EC3A 5IMAA 2PGTA 1AQXA 1EV4A 4FYCA 3ZL5A 4IP1A 3W8JA 1ERVA 2BMXA 3TDGA 4IQ1A 4ZL9A 3GHAA 2FLSA 2C4JA 2LS5A 2OE1A 2IN3A 4G9HA 4NV5A 4V2NA 2H8LA 4BL7A 3TJFA 1TTZA 3J7Yb 1Z6NA 4WF5A 1PKWA 3IAS2 1HYUA 2CV4A 2L6CA 4MZWA 3VPTA 1J0FA 3QAGA 1TU7A 4LA1A 1AQWA 3GH9A 3CRTA 3GKXA 4MJEA 1ML6A 2C0DA 2RUFA 1KEBA 2GSTA 5ECSA 3BJ5A 4Q5FA 5ID2B 2VLTA 4XTSA 2K9FA 3L0HA 3UEMA 1LBKA 2F9SA 3TKSE 3LG6A 1SL2B 2AUVA 1THXA 2VL3A 3GH6A 3QMXA 1FB6A 4KCAA 4J56E 1TK0B 3VWXA 1BAYA 3UAPA 4HJMA 5G30A 1Y25A 2IMIA 4L5OA 2JZTA 2GQMA 2MBSA 4XS4A 3LQ7A 2H01A 4EXJA 2DJ3A 3ZREA 1ST9A 3ED3A 1THOA 4PNGA 1R5PA 2P0GA 3FKFA 1SJ6A 1J08A 4I6XA 5D93A 2DJJA 5LD0A 1I5GA 3BOAA 5KN2A 4E8EA 3M1GA 4IGJA 3NOFA 3VPQA 5IMDA 2DJKA 2VUPA 4EUYA 1Y6EA 2VD0A 2V6KA 5B6MA 4I2TA 5ECRB 1HNCA 2YWOA 2IPAA 2PVOC 4F2IA 1K0BA 2C3TA 4FH8A 2HLSA 1SL0B 2JZSA 4JR6A 1PMTA 4BA7A 3HJPA 3TJGA 3LYPA 1CQGA 2AAWA 3ZFBA 4EO3A 4DSQA 2M80A 3PR8A 4PXOA 3TKPA 3L9SA 5DVBA 2ON5A 3VI7A 1JHBA 1NHYA 1E6BA 5IO2A 1TKDB 5JWRB 3BCKA 2H71A 2HXKA 4J2FA 3A2XA 3Q19A 3F0IA 2LEGA 2YJHA 1QUWA 4QQ7A 2H6XA 1Z7PA 2C8UA 2V1MA 3IK9A 4FYBA 1XCCA 5DAKA 1ILOA 4Z7XA 2O89A 5AN1A 5J41A 4TRXA 4MJCA 3DVXA 3BCIA 1NW2A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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