2AYTA

The crystal structure of a protein disulfide oxidoreductase from aquifex aeolicus
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
230
structure length
230
Chain Sequence
MLLNLDVRMQLKELAQKEFKEPVSIKLFSQAIGCESCQTAEELLKETVEVIGEAVGQDKIKLDIYSPFTHKEETEKYGVDRVPTIVIEGDKDYGIRYIGLPAGLEFTTLINGIFHVSQRKPQLSEKTLELLQVVDIPIEIWVFVTTSCGYCPSAAVMAWDFALANDYITSKVIDASENQDLAEQFQVVGVPKIVINKGVAEFVGAQPENAFLGYIMAVYEKLKREKEQAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights on a new PDI-like family: structural and functional analysis of a protein disulfide oxidoreductase from the bacterium Aquifex aeolicus
pubmed doi rcsb
molecule keywords glutaredoxin-like protein
molecule tags Oxidoreductase
source organism Aquifex aeolicus
total genus 81
structure length 230
sequence length 230
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-09-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13192 Thioredoxin_3 Thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2aytA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2aytA02
4OO4A 4Q5RA 2WJUA 4YQUA 5KN2A 2GQKA 1GSDA 3G7JA 2RM5A 5DAKB 4F03A 3KMOA 3QD9A 4ZILA 2GZPA 2XC2A 4N0ZA 4FYCA 5B7CA 5DAKA 1TOFA 4PNGA 3UMAA 5ELAA 1QMVA 5E4WA 4IHUA 1I5GA 2H1GA 3U5RE 3R2QA 3PGTA 4QL9A 1ZOFA 2GZZA 1FAAA 3PINA 2LRNA 2GSSA 4HS1A 3GN3A 3CXGA 1PGTA 2K8SA 2YP6A 3HYPA 4MPGA 1T8EB 2YWIA 2OA7A 1GUMA 3M8NA 3IE3A 5GSSA 3F4RA 1BQ7A 3KTLA 1SJZA 2I9HA 4JR4A 2XPDA 1SK1A 4ZL8A 2AHEA 2JADA 4CDOA 3IK9A 5DVBA 5AIVA 3GV1A 4Q5QA 2H71A 12GSA 4K2DA 4IS0A 2LNSA 5IIZA 5H5RA 2C3TA 2LJKA 4EO3A 4OMVA 1A2JA 22GSA 2QSIA 1O73A 2LNTA 1SKRB 1WPIA 3C71A 3KD0A 1GSQA 1M9AA 3GL5A 3FZ5A 5IMCA 3LQ7A 1Z3EA 2FLSA 4ILFA 3QAGA 5FHIA 4WEYA 1K3LA 2MMNA 2VLVA 3HJMA 3ERWA 1PL1A 4MCUA 11GSA 2YNXA 1XCCA 3F4SA 5D93A 1XPVA 1XVWA 2FD3A 1QXHA 2IMKA 2PMTA 3NIVA 3QAVA 2C8UA 1XXUA 1WWJA 2V1MA 1TTZA 4LL1B 1SENA 3J7Yk 5D9TA 4ACSA 1GSYA 1SD8A 3LEFA 2IMEA 2HLSA 4MJEA 1OKDA 3FEUA 2EIQA 4NMUA 1FVJA 2GT5A 2LSTA 1HNAA 1F9MA 3UIWA 5G30A 2KHPA 1OC8A 4GSTA 4KH7A 1Q4JA 3F8UA 2REMA 4OD7A 4ECIA 4MF6A 2WS2A 1R5PA 5G5FA 1I9DA 4GSSA 5JWOB 3G9BA 1OVNA 2AV4A 4KDUA 2P31A 4K8MA 1OE7A 2XBIA 5CRDA 4BVXA 1FOVA 1WE0A 5GAPD 3BBYA 3F0IA 13GSA 5HFIA 1K0AA 2WULA 3TB2A 3A3TA 2MMOA 4IGJA 5EPFA 4OO5A 4ZBDA 1ZMAA 3D21A 4CW9A 3TRPA 2VL9A 3PR8A 1X0RA 2HRFA 3DVWA 3WGXA 1Y6EA 2V2GA 4I5QA 5J41A 2E0QA 3GA4A 4TW5A 1EGRA 1V98A 3IRAA 4HZ2A 3TJGA 2RIIA 2C80A 1R5AA 4I2TA 1ILOA 4POMA 3E3EA 5C00A 3M9JA 3I6AA 1YF0A 2KP2A 2B5YA 3EMPA 4PXOA 1XVQA 4YAVA 3H93A 2P5RA 5HR2A 2YPMA 4ULXA 1MDIA 1TRVA 3G7IA 3UARA 1TP9A 2HZFA 4O5RA 5B6NA 3KP8A 4MF5A 3D6IA 3BD2A 5ECOB 4HOJA 1ZYEA 3VWWA 3UAPA 4D73B 1AAZA 1A2MA 3O3TA 2F3MA 3UJ1A 3GKXA 2WRTA 3ZREA 5CP1A 4D73A 3C7MA 1YEXA 1V58A 1WP0A 2H1DA 1OAZA 3DEXA 2O85A 4LL4B 5AGYA 3ERGA 2A4VA 2A2SA 4EC0A 1X9WB 2NVLA 3KMNA 1SKWB 3I9V2 2R6KA 4KDXA 1JHBA 2TRXA 1EV4A 1GSUA 1GSFA 3D4MA 3KIJA 1GNWA 3ZYWA 4NXIA 3LG6A 4Q5NA 3RHBA 3O76A 2VUPA 1SL0B 4MZCA 3WYWA 4MDCA 1O85A 2FWEA 4GQFA 4QL7A 1EOHA 4KCEA 5L71A 1F3AA 3D0ZA 5DDLA 3HVVA 2N5FA 2ON7A 3H1NA 1M2AA 4J57E 5JWRB 4PGTA 9GSSA 2CVDA 2A2RA 3EURA 3EVIA 1SJIA 2YZUA 4BPYA 3OR5A 5D9WA 3GHAA 3MWHA 3FW2A 2TIRA 3FYGA 4ZIJA 4WR5A 2FWHA 4EF0A 4F0BA 5IOXA 2C4JA 1WIKA 2YANA 20GSA 5J9CA 1XWCA 2K6VA 3APQA 2TRCP 3L78A 2IPAA 2AYTA 4HQSA 1F6MC 4EE0A 4LMWA 3CSJA 2GLRA 2GVPA 3KH7A 1X5CA 2IN3A 1TKDB 3IXRA 3NOFA 2YCDA 4HI7A 2BTOT 5DJMA 4ECJA 1RK4A 2LRCA 4OFMA 2H0GA 5FT3A 1R4WA 2WGRA 2K9FA 2RM6A 4ZXGA 2ON5A 6GSTA 4FH8A 5B6MA 4MZWA 2L4CA 3GSSA 1QQ2A 3D22A 5LCZA 3IAM2 2H8LA 1QGVA 5G1KA 1HNCA 2D2ZA 4OCEA 4FYUA 1Z7RA 3EMXA 5DCGA 4G2EA 2GQMA 2OE1A 3WGEA 3KH9A 4OWYA 1JZWA 1HYUA 4ZL7A 4JU5A 2O89A 3KXOA 2B5XA 2HZEB 2L5LA 1MD3A 4K0GA 1N2AA 1J0FA 3QCPA 4KNDA 2IMIA 2LTKA 2B7JA 3HHVA 3BOAA 2AAWA 2VL2A 4IN0A 2CX4A 2DC5A 1UN2A 3CBUA 1G7EA 2V6OA 1Z5YE 3TJJA 4KUNA 2I1UA 1TK5B 1MDJA 4EVMA 1NM3A 3F4TA 1A2LA 3LXZA 6GSXA 1SK0A 3QR6A 1U88A 2JSZA 2L59A 2R2JA 3DIEA 3F9UA 3DXBA 1VF3A 2P0GA 1MEKA 3FR6A 3HZ8A 5IMVA 2I3YA 16GSA 4L5LA 3ZTLA 2DJKA 2FGXA 1ZYQB 1B4QA 3VK9A 5IOWA 5F8BA 3M3MA 1Z6NA 2MZCA 1TK8B 4F9ZA 1RW1A 3H8QA 1KEBA 1XZOA 3GRXA 3VLNA 1XIYA 3CRUA 2CA8A 3A2XA 3EE2A 2FY6A 1K0DA 3VWVA 4K7NA 4KSMA 4ML6A 3U6VA 1E6BA 5ECPB 1T1VA 1O8XA 3Q6OA 1U3IA 5ECSA 3WT2A 1T3BA 19GSA 2XBQA 3ZVJD 1ACVA 4V2MA 1AQXA 3HZ4A 1HD2A 4K7IA 3LYPA 3I69A 5B8BA 2F8AA 4TRXA 1PX7A 1PKZA 1DSBA 3HJPA 4X43A 3ZFBA 3L0HA 4OCFA 4K0NA 2AJQB 2H72A 3CSIA 1TRUA 4TVEA 2DJJA 4V2LA 1FO5A 1UC7A 4FYBA 3TGZA 5JWQB 3GTUA 2NTOA 2VCWA 2B1LA 3KJYA 1USBA 2B5EA 1M7TA 4WKWA 3E0UA 2XPEA 5D73A 2IMFA 1SK2A 5HR3A 3UVHA 3LWAA 2H70A 3L9VA 5G1LA 2HT9A 1J9BA 2MMZA 3E9JB 2KUCA 1EZKA 3EC3A 4IP6A 4KW6A 4OFNA 3VI7A 1VF4A 2N5BA 4BWSA 1F37A 2H19A 3P8WA 2FNOA 3ZRDA 2H66A 3TKSA 4I2UA 1R26A 2LV3A 5H5QA 5F0GA 3HVXA 2HRNA 5CRHA 1SU9A 4XIHA 4ID0A 4MZBA 1R7HA 2LQQA 4YQVA 4F2IA 1TI3A 1DBYA 2GS3A 2KLXA 2ZUPA 3UOMA 2IL3A 1BYEA 3TUEA 2J9HA 1BAYA 4XS6A 6GSYA 3QPMA 2IMDA 3WT1A 4GF0A 4KSOA 4QQ7A 4KB3A 2B6MA 2PGTA 3TKPA 4E8HA 1X5DA 5ENUA 3ZITA 1GUHA 4MA9A 3DYRA 3IPZA 3TKRA 1F3BA 1XWKA 2C0EA 4V1Ag 3DMLA 1VGLA 2R5GA 4JZQA 3TDGA 3IOSA 4MK3A 4N0VA 4PUFC 1NHYA 1WOUA 1K0NA 1SYRA 5HR0A 4NHZA 1PL2A 2WDUA 1ST9A 2YWNA 1B48A 5J5NA 5GSTA 3GL3A 4MP4A 2YJHA 4GCIA 3P2AA 1ZGNA 5ECLB 2G2QA 2QC7A 1VRSD 1EP7A 4XTSA 4HJ2A 4PQIA 3QMXA 5CYYA 5ECQB 1WMJA 1FVKA 1PA3A 4HZ4A 1WJKA 3K8NA 5ECNB 2MBSA 1AQWA 4JE1A 4YQMA 2VM1A 5LD0A 1Y25A 3KGKA 1A0RP 3GSTA 2H1AA 4MH2A 3TJBA 4GTUA 5CO3A 14GSA 2KP1A 5HR1A 4DVCA 3TKQA 1TW9A 2K18A 4H86A 4XS1A 3JCML 2M46A 2OBKA 2JZRA 2PBJA 2VO4A 4O32A 4ZB9A 5GZZB 4TXVA 2LRTA 1T7PB 3DWVA 1O7UA 2RUFA 4MJAA 3GH9A 2B7KA 3LJRA 1QFNA 5ABRA 1ERTA 1IYHA 4OFTA 3BCKA 4TOPA 1TI1A 5HFGA 1K0CA 4CHSA 3IHQA 5B8AA 3WD6A 3DRNA 5G2ZA 1GP1A 1QK8A 4POKA 4V1Ap 1EV9A 3IK7A 1M2BA 4DSRA 1N8JA 1NSWA 2VL3A 1FB6A 3M0FA 5AN1A 2DJ1A 5IMFA 1K0MA 4HQZA 4F82A 5CRWA 1YZXA 5HFKA 4K1FA 2C3NA 5DQSA 3ZMLA 4ZBBA 2DJ3A 4IKHA 4GRFA 2CZ2A 3LFLA 1AIUA 1CQHA 2V32A 1YQ1A 4XCSA 2E2MA 4FIWA 6GSWA 1S3AA 4DSQA 1THXA 4K7OA 1JLWA 1S3CA 3ZFLA 2VCXA 4JBBA 5A4VA 4GQCA 3APOA 2RUEA 3MSZA 1AUCA 5IPGA 5DQYA 2LEGA 3LYKA 2NBSA 3ISOA 2WB9A 2PERA 5EL8A 3DGQA 1GRXA 1SYXA 2JSYA 1GWCA 5D8IA 2CQ9A 3CTFA 5ECRB 5A5KA 1OE8A 1JZDA 3HA9A 2G0FA 3MAKA 4IVFA 3KP9A 5J4UA 3KCMA 3TCOA 3CMIA 1PKWA 1TJDA 2CV4A 1C72A 3EINA 2O7KA 2JZTA 2VD1A 1B4PA 2GGTA 3VPTA 4JRRA 1OC9A 2IFQA 1V40A 3LSZA 18GSA 2GSRA 2LQOA 4GXZA 3F3RA 1WRYA 3EWLA 3I43A 2HFDA 2PVOC 2L6DA 1F2EA 2ALBA 1PRXA 1T4ZA 3P7XA 1IYIA 4EL1A 3HVSA 1A0FA 1YF1A 2PN8A 3MDKA 3ZLPA 4NAXA 4DEJA 2H73A 4WETA 2J23A 3W8JA 3TJKA 4MF7A 2WFCA 4AJ6A 4GLTA 2C0FA 1AC1A 3G7YA 2BMXA 2GSQA 5EVOA 2PU9C 1BEDA 3UBKA 4HJMA 2H01A 2GZYA 4AF2A 3FHKA 4KA0A 1ZL9A 3QAWA 3GUSA 3A2WA 1LJRA 6GSUA 2L57A 5F05A 2EC4A 2YJ7A 1TU8A 2YN1A 4NV5A 1XOAA 1T00A 3EYTA 5A4WA 3KTBA 4IJ3A 4I8BA 3D5JA 5KN3A 2O87A 4AJ7A 4X1UA 3TJFA 1AW9A 4TXOA 4RQRA 3W8SA 2YWMA 1V9WA 3ZIVA 3FZ4A 3W6GA 5FWGA 5COHA 2MBTA 1B8XA 4NWYA 3M9KA 5DALA 1M2DA 2H74A 1ZCPA 2GT6A 4IP1A 3N5OA 2N5AA 2AB6A 1PX6A 4LA1A 3F6DA 2FCHA 3ZZXA 4LLRA 3FZAA 2C3QA 2DJ0A 3HCZA 1PN9A 3US3A 4IQAA 1TK0B 5DJLA 3ED3A 4RQXA 4WBJA 4BL7A 3ZIJA 3EU3A 3H4KA 5F06A 4MH3A 3WGDA 6GSSA 2X8CA 2L5OA 1K3YA 4MJBA 1ABAA 4KDYA 1JZOA 2FUG2 2H6XA 4JEDA 1ZZYA 2H0IA 3UVTA 2LS5A 3NZNA 1OC3A 1XWBA 4N10A 1XW6A 3A5WA 2EIRA 5J3RA 4XRAA 4X0XA 4WF5A 3HJOA 1B9XC 2X8HA 4BVYA 2C0GA 4KGIA 2GDRA 3GKNA 5H5SA 8GSSA 1GLPA 1SKSB 1XOBA 6GSVA 1AQVA 4WF4A 2YV7A 4XRDA 1EWXA 1BJXA 2LKUA 3LGCA 2Z9SA 5ECIB 3VWXA 5KN0A 5ID2B 5IO0A 4GSNA 1VF1A 4TR4A 4WBRD 2V41A 3J7Yb 1JFUA 3GTUB 2OBIA 2AUVA 5ID2A 1NHOA 1FW1A 1J08A 3VFIA 4AJ8A 4PX1A 4ZB8A 1M99A 4RI6A 2QGVA 3TRQA 3FKFA 2DJ2A 4I6XA 4J56E 3BCIA 4J2FA 1URMA 2I81A 1GTBA 2CVBA 1QUWA 2VCVA 3RDWA 3C73A 1KNGA 5IO2A 4L0WA 4IELA 5EY6A 1OKTA 3IC4A 1FB0A 1LBKA 4ECCA 4L0UA 1UA5A 4XHMA 3L9UA 5LNKe 2IJYA 1ML6A 2VCZA 2H30A 3L4NA 5ECMB 2NPBA 2VL2C 1SL2B 3Q19A 1CQGA 1TXXA 2L4QA 2OE3A 4HUAA 1EP8A 1KTEA 1DUGA 4FO5A 5INYA 4MABA 1NW2A 4PUAA 1ERUA 2F8FA 2PPTA 4TKYA 3GX8A 4KX4A 5KEJA 4K6XA 3KM6A 3AY8A 5IMZA 3ZL5A 3CTGA 1Z6MA 2E2GA 1AXDA 4LMVA 2CAIA 3H79A 4O7HA 2OADA 1XBSA 1YKCA 1VF2A 5F07A 4IJIA 2I4AA 2DIYA 1K0OA 4TR1B 4KCAA 2R37A 2VLTA 5DBQA 1TRWA 1UVZA 3CSHA 3F63A 2O8VB 3IV4A 2VM2A 4TR1A 5IMDA 3FR9A 4EXJA 4YH2A 2VIMA 1W4VA 3DD3A 4TR3A 3L9SA 1X5EA 3A2VA 1V2AA 2H6ZA 2HI7A 5ECKB 4IQ1A 1HNBA 1GH2A 2MMAA 4Q5FA 5IM9A 4TN8A 4EUYA 2HSYA 1A23A 2H6YA 3ME7A 3GYKA 2OE0A 1X9MB 4EDZA 2X64A 3HD5A 3C8EA 2DBCA 3IR4A 3C1RA 5JCGA 1TRSA 2FHEA 1ON4A 1JLVA 3O6TA 4ISDA 5JCUA 3UL3A 4DSSB 4HDEA 1Z7PA 3TOUA 5AISA 2V6KA 2F51A 4DSSA 1SL1B 3CRTA 3ERFA 2VLUA 3DVXA 2H76A 1EGOA 1SD9A 2H75A 1O8WA 1DE1A 2X99A 1EEJA 1H75A 5G31A 2ES7A 2E7PA 4WXTA 1XW5A 2DMLA 3Q74A 3LORA 1Z9HA 1RQMA 3HKRA 2CAQA 3LXTA 2DIZA 2R4VA 3GNJA 4G19A 4POBA 2FWGA 3QFBC 1EEMA 1O81A 2JU5A 2EIOA 4BA7A 2C1YA 4O92A 3TKSC 1M0UA 4GWRA 2DLXA 2GQLA 4Z7XA 2LJRA 3C1SA 5E59A 1K3OA 2LJAA 1ERVA 1G0TA 2HXKA 4BWQA 2GSTA 3RHCA 4POLA 1MTCA 3VPQA 3N9JA 4IW9A 1YJ6A 1ERWA 4YAPA 1GUKA 3GX0A 4MLYA 2MYGA 1H4OA 2VD0A 3FZ9A 2YZHA 5IMAA 1U3AA 1PMTA 4N11A 1YKAA 4PQHA 3FR3A 5CREA 5J9BA 3FY7A 1FHEA 3KEBA 3QOUA 4XS4B 3RBTA 2K8VA 2YOIA 2FWFA 3TRXA 4E8EA 1U87A 3GKMA 2F9SA 2HSHA 5CAXA 4XS4A 4HU9A 4IBPA 2M72A 2JACA 4NPBA 3GURA 1B9YC 1TU7A 1PSQA 4EDYA 1PQNA 1OYJA 5G5EA 2OJLA 5IPHA 2XHFA 4AGSA 1S3DA 1GSSA 5KN1A 1G6WA 2GTUA 1THOA 3IAS2 4MJCA 3ZMKA 4K9ZA 1Q98A 3APSA 3P90A 5A4UA 5HQPA 5GAND 3GMFA 1PD21 2VCQA 4JR6A 4NHWA 3RPNA 1OC9B 2DSAA 2IFQB 2JL4A 4NV2A 3EU4A 1A24A 1BX9A 3HY2A 2KOKA 1E2YA 17GSA 1M9BA 1GLQA 1XW9A 2JZSA 2PWJA 3HXSA 1SJ6A 4PQ1A 4ECBA 2QKEA 1LU4A 2NDOA 1G6YA 3RAZA 2P5QA 1JZRA 4HU7A 4P3YB 2FA4A 5D9XA 3FRCA 2PVQA 1KBNA 1FG4A 4G10A 1A8YA 2IWTA 3GFKA 2WZ9A 1GTUA 1V57A 3F6FA 2ZCTA 2PUKC 3GKKA 4ML1A 4MMMA 4ZB6A 3UEMA 5ECHB 4F0CA 3TOTA 1XFLA 3VURA 1XWAA 2YWOA 5CNWA 2VAFA 2LUSA 3S9FA 3ME8A 4TXOB 4I97A 3IDVA 1W89A 5CRGA 2WCIA 1MD4A 2HE3A 3VWUA 3TKSE 2BJXA 1T4YA 3V1WA 1YDKA 5DALB 2HZEA 3QDNA 2RLIA 4TR0A 3F3QA 4KE3A 1K0BA 4HEA2 5IQYA 1XWGA 3IA1A 4L5OA 3DKSA 2X8GA 2HNLA 1GL8A 2CX3A 2DMMA 3QFAC 2M80A 4RUVA 4ZL9A 3M1GA 2HYXA 1U6TA 1EOGA 1TDIA 4EKZA 3GH6A 1GTIA 3BJ5A 4G9HA 1BG5A 4V2NA 1GNEA 3KZQA 5D96A 2H1BA 3RPPA 2IIYA 1X9SB 3HDCA 5AIXA 5JCWA 1HQOA 3VI5A 4PURA 3PH9A 2H0HA 3SBCA 4N30A 1GTAA 2OKAA 3FK8A 2L6CA 3UBLA 1G7OA 3CYNA 1YY7A 1A8LA 4RI7A 5D9VA 2B1KA 3MNGA 2FA8A 4PNFA 3Q18A 2YV9A 1GULA 7GSSA 2OACA 1O6JA 3IBHA 2R3XA 2ZNMA 3SWLA 5DCHA 3GIXA 5C04A 2VCTA 2B3SA 2VOCA 5ELGA 4MPFA 4ZBAA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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