2B1KA

Crystal structure of e. coli ccmg protein
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
149
structure length
149
Chain Sequence
LESALIGKPVPKFRLESLDNPGQFYQADVLTQGKPVLLNVWATWCPTCRAEHQYLNQLSAQGIRVVGMNYKDDRQKAISWLKELGNPYALSLFDGDGMLGLDLGVYGAPETFLIDGNGIIRYRHAGDLNPRVWEEEIKPLWEKYSKEAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of E. coli CcmG and its mutants reveal key roles of the N-terminal beta-sheet and the fingerprint region
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein dsbE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli
total genus 48
structure length 149
sequence length 149
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2b1kA00
2C1YA 2CZ3A 3TOUA 3VLNA 1R5AA 2HE3A 2C0FA 4IBPA 5CRHA 2HYXA 5D93A 1WWJA 4KW6A 5CREA 1B9XC 4E8HA 1ACVA 1O8XA 3KEBA 1N8JA 1SL0B 18GSA 3R2QA 4OO5A 2R4VA 2CVDA 3WGXA 1AC1A 4OMVA 3Q74A 5AGYA 1X5CA 1PRXA 4IS0A 3TGZA 3QAVA 3FYGA 1G0TA 8GSSA 2GZPA 4POKA 1T3BA 2K6VA 3DGQA 3QAGA 3TRXA 3CBUA 5ECMB 3D4TA 14GSA 2V32A 1Y25A 2LNTA 1A2LA 2BMXA 1THXA 4X0XA 2CZ2A 5EL8A 1QXHA 1U6TA 5IPGA 1KNGA 2VCVA 1URMA 1T4YA 1U3AA 5B8BA 5JWRB 4GTUA 3M8NA 3VWWA 2GSSA 2PGTA 5EVOA 2JADA 5J4UA 3Q18A 1JZDA 5F05A 4DSSA 2DMLA 3EVIA 4BVXA 1RQMA 1XXUA 1XWKA 4TR4A 3KM6A 2H1DA 3K8NA 1EOGA 1AQWA 2KP1A 3HVSA 1MDKA 3PINA 2LV3A 4IQAA 3D22A 3ZREA 4KDYA 2IMKA 4IHUA 2RUEA 5IQYA 1HYUA 3C71A 3KIJA 1GSYA 1MEKA 2P31A 2X8CA 1I5GA 1IYIA 1SD8A 4JEDA 1EGRA 4Q5NA 1GH2A 5DDLA 3SBCA 3BCIA 2GQKA 4IP6A 2VAFA 1KTEA 4EE0A 1NHYA 2GT6A 1AIUA 2ALBA 3UEMA 4BA7A 4BVYA 4DSRA 2GSRA 1TK8B 5AIXA 4G10A 1TRSA 1PKWA 1PD21 2VCXA 3KH9A 3H1NA 4OCFA 3TRQA 4X43A 2E2MA 2V2GA 3HVXA 3MNGA 5EPFA 3C1SA 4AJ8A 3CSIA 2FY6A 3A2VA 3U6VA 2QSIA 1XCCA 3PR8A 3F3RA 4POLA 2JZRA 5B6NA 3IK9A 1SL1B 1AQXA 2KP2A 1OE7A 3UVTA 4ML1A 1K0BA 3U5RE 2PVOC 1TP9A 1USBA 4EKZA 3HDCA 4G9HA 2LS5A 3E0UA 4LLRA 2LTKA 3W8SA 2CQ9A 2IWTA 4WKWA 1FB0A 2H19A 3VWUA 4ECCA 1OC3A 3IRAA 1S3CA 1ON4A 1A0FA 2WRTA 3E9JB 4V1Ap 2CT6A 2KHPA 5G1LA 1T7PB 2NBSA 1B4QA 3GUSA 5CRDA 5G31A 1LU4A 2L6DA 1A23A 4MZBA 5D9VA 1THOA 5IO2A 4XS1A 3GL5A 2JL4A 1JLWA 4K2DA 2MMZA 3KTLA 2YNXA 1X9SB 4O32A 2K18A 5KN0A 5IOWA 3AY8A 5EY6A 3F4RA 4F82A 5C04A 3LYPA 2WB9A 3ERGA 4ZBAA 3WGEA 5ABRA 2A2RA 2YWMA 3GTUA 2RLIA 4H86A 1SKWB 2YV9A 2C80A 4RUVA 1EEMA 2A4VA 3IV4A 4WR5A 3I6AA 1R5PA 2PERA 2HNLA 4MZCA 1WPIA 2BJXA 2F8AA 4FH8A 4HI7A 4MABA 2YN1A 1JFUA 1FB6A 1ZYEA 1QGVA 5J9CA 5ECLB 4GQCA 2CVBA 2IJYA 1XW9A 2OBIA 4TR3A 3CTGA 2WGRA 5CNWA 4HQSA 4MJCA 5IMCA 3WYWA 1KBNA 1G7EA 1GTIA 2VL9A 5ECHB 4E8EA 12GSA 3G7YA 5HFIA 2WDUA 1ERTA 3GKMA 1SK0A 5D9XA 3IA1A 4EVMA 5HFGA 3F4TA 3Q19A 3RAZA 4PQIA 3A2XA 4I2UA 5C00A 3F6FA 3GTUB 3L0HA 1EWXA 5FWGA 2H0IA 1VF3A 2GQMA 4GCIA 4TN8A 2F8FA 3LFLA 4KSOA 5ELAA 3A2WA 3RBTA 2DBCA 3S9FA 3FRCA 2X8GA 4Q5QA 2H0GA 4HZ2A 1F3AA 1B8XA 2PWJA 5LNKe 3TKPA 11GSA 4AJ6A 1JZOA 4PQHA 4PQ1A 3TJKA 3HJMA 1RW1A 4P3YB 2H72A 1YY7A 4YQVA 3KP9A 2V1MA 4ZL8A 2DC5A 1O73A 3TJBA 3ZVJA 5IMFA 1QQ2A 3LG6A 2B7JA 3DIEA 3SWLA 1ZGNA 3HJPA 4KH7A 4MK3A 2AJQB 3FR6A 1F2EA 2C3TA 3FR3A 5GSSA 1CQHA 5CAXA 1TRUA 3LYKA 1A2JA 1ABAA 2L5LA 2H6YA 4KA0A 3HVVA 2AB6A 3H93A 4KDXA 2GZYA 3DRNA 3GKNA 3CSJA 3GKXA 3FKFA 3IPZA 1OVNA 1ERWA 1PKZA 2HZEA 3DWVA 2PMTA 1F9MA 4ZILA 2H70A 4L0UA 2VLUA 5J3RA 2H73A 3ERWA 5CP1A 5IMDA 4GSTA 1B4PA 1YZXA 4XTSA 3HYPA 4IKHA 1EOHA 4OCEA 4N30A 5CO3A 2H01A 1J0FA 3F4SA 1BAYA 2OBKA 4XRDA 5F0GA 2C0EA 4MPGA 4HDEA 2L6CA 3ZRDA 5DVBA 2V6OA 20GSA 2LRNA 1X0RA 2MMNA 5CYYA 2N5AA 2YV7A 1GNWA 3VFIA 4L5OA 1XVWA 3EMPA 4BL7A 2DJJA 1FHEA 3GA4A 2DMMA 2FWFA 1F37A 3HA9A 2CAQA 4XS4B 4IN0A 2IMIA 1YF0A 1EP7A 2C0GA 4ULXA 1YJ6A 2LJRA 2K8VA 2CAIA 3QFAC 5LD0A 2C3QA 4F2IA 5GAPD 3D6IA 2VCZA 3QAWA 1K3YA 1FW1A 3M3MA 3APOA 5A5KA 4ILFA 4TKYA 1UA5A 2IL3A 3TCOA 4HQZA 4IVFA 1U3IA 4YAVA 4TR1B 2LKUA 1X5EA 5ECOB 4TW5A 1XZOA 4HJMA 3G9BA 3J7Yb 1BYEA 4RI6A 2YPMA 2LSTA 4ID0A 2M72A 4ZB9A 4OFNA 4LMWA 5CRWA 1IYHA 3W6GA 2CV4A 2I3YA 1TKDB 1SKRB 3GHAA 3V1WA 1VGLA 1ML6A 1KEBA 3C1RA 3DYRA 2HLSA 2LQQA 10GSA 5GAND 4FYUA 5B8AA 1XW6A 3EC3A 1MDIA 3IAS2 3HJOA 2M46A 4GSNA 1BEDA 1O8WA 3CRUA 2JSZA 5IIZA 6GSWA 5KN1A 3ISOA 3CSHA 3ZVJD 3GH6A 1M99A 1T00A 3EU4A 4I5QA 1TXXA 2HRNA 3VWVA 4POBA 1PN9A 1YEXA 3WD6A 4FYCA 2OKAA 1SK2A 1XWGA 3FZ9A 4YQMA 4PXOA 2NTOA 3L78A 1R4WA 1ILOA 2ZNMA 1H4OA 3P2AA 3APSA 4N10A 3TKSE 1PA3A 3MAKA 4HEA2 5B7CA 1R7HA 1NHOA 3QR6A 1BJXA 2HSYA 2VOCA 3GIXA 4KX4A 2MMOA 3FK8A 3MDKA 4KGIA 5KN2A 1DBYA 1Z9HA 2WULA 4O92A 1TOFA 1F3BA 3ZFBA 2OJLA 2OADA 1B9YC 4K7NA 2K8SA 2H1AA 3LORA 3WT1A 3F8UA 5IMAA 1TI3A 1AAZA 4CDOA 2VD1A 4YQUA 2GS3A 4KUNA 3TDGA 1GRXA 1SL2B 3UBKA 3LJRA 4J2FA 2TIRA 1Z6MA 4NXIA 3A3TA 1WRYA 1TTZA 1RK4A 2KUCA 4ZL9A 2EIQA 3O6TA 5ECQB 2RM6A 1PSQA 1OYJA 6GSSA 2OE0A 3KCMA 2WZ9A 3ZL5A 4I97A 1M7TA 4WETA 4FIWA 2AYTA 4NV2A 2VL2A 1GTBA 4MPFA 4KE3A 2WJUA 1PL2A 2CX4A 1F6MC 4QL7A 1QFNA 5DQYA 2KLXA 1ZOFA 3L9SA 1XOBA 1MTCA 1YDKA 3GMFA 2D2ZA 1WE0A 1MD4A 3IAM2 3RHBA 2O8VB 1Q4JA 2DSAA 2GSTA 2WCIA 4IELA 1K0NA 4D73B 2H76A 5HR0A 1GNEA 5JCUA 2P0GA 2P5RA 2V41A 1FVKA 2I4AA 2OE1A 5D96A 4MF6A 3UVHA 4BPYA 2ON7A 3D5JA 1V40A 3TJGA 4PNFA 4ZL7A 1EZKA 3NZNA 4OO4A 2GTUA 4RQXA 4PUFC 4GRFA 1GULA 3DEXA 4LL1B 4NMUA 5G5EA 3H79A 4WR4A 4MH2A 3C7MA 1XPVA 3LQ7A 5ECNB 4GQFA 3QFBC 2YJHA 2E7PA 4WBRD 1JHBA 1X5DA 3H4KA 5F07A 2CVKA 2FA8A 3DXBA 3GFKA 4GXZA 2VM2A 1XFLA 4LMVA 4ECBA 5JWQB 2KOKA 3GRXA 4ZIJA 1FVJA 1TU8A 3P90A 3GN3A 1TJDA 3GX8A 2GDRA 1HD2A 4EF0A 2VUPA 1Z3EA 2FWHA 4K7OA 1TW9A 4N0ZA 5ID2B 5J5NA 2TRXA 2F51A 2XPDA 3KGKA 4LA1A 4GF0A 4MZWA 1WP0A 2GLRA 2NDOA 5ENUA 4IQ1A 3CYNA 3FHKA 1H75A 1ZL9A 2JZTA 1GSEA 2ON5A 1K0AA 3FZ5A 1SK1A 2XC2A 4GWRA 4NPBA 4TXOB 3HZ4A 3P7XA 2GQLA 2M80A 1MD3A 2H71A 5A4UA 2VM1A 4MMMA 4F0BA 1ZMAA 3G7JA 1V9WA 1R26A 2VCWA 3PGTA 4PUAA 3VPTA 1SU9A 2VL2C 3VK9A 2YOIA 1EP8A 2I1UA 2EIRA 3O3TA 1WMJA 5D9TA 3GSTA 2ZCTA 4ECIA 2HZFA 2R2JA 4EXJA 1N2AA 4KAEA 1O7UA 1VF4A 4WEYA 4XS6A 1EV9A 2DLXA 5HFKA 4ACSA 16GSA 3QMXA 2O7KA 5G1KA 3FY7A 4ISDA 2YZUA 2B5YA 1PGTA 2FCHA 1G6YA 4EC0A 1E6BA 3N9JA 1XW5A 2B7KA 4F0CA 3ZIVA 3IK7A 4F03A 5DALA 4N11A 2R37A 1T1VA 2H8LA 3QD9A 4I2TA 2X99A 2FWEA 2VIMA 2MBSA 2GT5A 3N5OA 2CA8A 1M9BA 2XPEA 4V1Ag 2RM5A 2H75A 2N5FA 3L9VA 4L8EA 1OKDA 1XBSA 2GVPA 1GUMA 3LSZA 2DIYA 4JRRA 3Q6OA 3EURA 3GX0A 4Q5RA 5ECSA 3DMLA 2YJ7A 4XS4A 4IJIA 1K0OA 2FGXA 4IP1A 1O6JA 3C8EA 5DCHA 2B1KA 2B1LA 2O89A 4NHWA 2YANA 4TOPA 4EDZA 4HZ4A 1YQ1A 5L71A 1DE1A 2CX3A 3EINA 4TXVA 5DALB 1GSQA 2Z9SA 4TR1A 1SENA 3VPQA 1W4VA 3NOFA 1NM3A 3IE3A 2H0HA 2YWNA 3UOMA 1AXDA 2R3XA 2L4CA 3HKRA 1VF1A 2B6MA 1Q98A 2HSHA 1QUWA 4XIHA 5GZZB 2R5GA 3KZQA 3UIWA 4J57E 1QK8A 3TJFA 3NIVA 2O87A 3LXZA 5ECPB 2VCTA 9GSSA 2MBTA 3F0IA 4LL4B 3QPMA 4K9ZA 4HUAA 2IMFA 3QDNA 4J56E 5F06A 3D4MA 4XHMA 3M9JA 3UMAA 3W8JA 2DIZA 2X8HA 2HI7A 3DD3A 3EWLA 2MZCA 5IPHA 2OACA 3VURA 1LBKA 5A4VA 4G2EA 2EIOA 3TB2A 1G7OA 2QC7A 1TRVA 4NV5A 4IJ3A 1SKSB 2B3SA 2VD0A 2IMEA 4DEJA 2B5XA 2P5QA 1J08A 4HJ2A 4Z7XA 1SJZA 3I43A 3BBYA 1A24A 2IPAA 2LQOA 5KN3A 3KJYA 3IR4A 3QOUA 4MDCA 4KNDA 4MCUA 1M2BA 3A5WA 2FWGA 3TJJA 4AJ7A 4JU5A 3KMOA 2NPBA 4CW9A 22GSA 3F6DA 5HR1A 4FYBA 5D8IA 5FHIA 2C4JA 5D73A 4TVEA 2PBJA 4K6XA 4FO5A 2H66A 3KTBA 1TRWA 3OR5A 4AGSA 19GSA 4JR4A 4CHSA 4L0WA 4PX1A 3LEFA 3VI7A 1GSSA 5DBQA 3GL3A 1GTAA 4X1UA 5F8BA 3UARA 1OAZA 3FEUA 4JBBA 3M0FA 2OA7A 2IMDA 3UAPA 1G6WA 3RPNA 2XHFA 3BCKA 5GSTA 4PGTA 4K8MA 2IFQA 2VLVA 4K0GA 2H1BA 3ZMLA 4ZBDA 1Z6NA 4MF7A 1K0DA 1FG4A 4KCAA 5KEJA 2BTOT 3LXTA 3IOSA 4MA9A 1K3OA 13GSA 4MLYA 4ZB6A 1BG5A 1X9WB 1S3AA 2A2SA 1E2YA 1ZYQB 3P8WA 4JZQA 1UC7A 4D73A 2DJ1A 4MJEA 3HCZA 4Q5FA 3KXOA 1NW2A 4MJBA 7GSSA 2J9HA 1ERUA 4N0VA 3IXRA 1SYRA 1UVZA 3C73A 2FHEA 1YEPA 3FZ4A 4V2MA 1Z7PA 1MDJA 3VI5A 3HXSA 3GV1A 4DVCA 3GSSA 3BJ5A 3DVXA 2ZUPA 3L4NA 5E4WA 3WGDA 1GWCA 1DUGA 4EUYA 4MJAA 4RQRA 2X64A 4WF4A 4I8BA 3TKQA 4V2NA 2FA4A 2IFQB 4IGJA 2F3MA 2ES7A 1XWCA 1EEJA 1AQVA 3RDWA 4OD7A 3HZ8A 3DKSA 1DE2A 2LRCA 5AISA 5INYA 3UJ1A 4MH3A 5ECIB 3L9UA 1GP1A 3TKRA 1A0RP 5IM9A 1V57A 5IO0A 3EE2A 2FNOA 4DSSB 1EV4A 3F9UA 1SYXA 2VLTA 1C72A 3M9KA 4GSSA 5HR3A 2O85A 2F9SA 1ZCPA 5HQPA 5ID2A 2XBQA 1LJRA 5J41A 4DSQA 2JU5A 3ZITA 5H5QA 3RPPA 3UBLA 1K0CA 2L57A 6GSXA 5G30A 3VWXA 1BQ7A 2R6KA 1ERVA 4KSMA 1XIYA 3HHVA 3D21A 4ZXGA 1TDIA 2HFDA 5LCZA 1Y6EA 2FD3A 4TRXA 2L5OA 2J23A 1PX7A 2C3NA 4TXOA 3BD2A 4KDUA 3CRTA 3ZMKA 1PMTA 3FW2A 3ZYWA 4WBJA 1YF1A 3HY2A 3KD0A 1ST9A 1VRSD 1M9AA 1K3LA 2L59A 5DCGA 1TK0B 2YWOA 1U87A 3UL3A 2LJKA 3J7Yk 5A4WA 1ZZYA 4QQ7A 2VCQA 2YCDA 3ZIJA 2B5EA 2C0DA 5HR2A 5JWOB 2I9HA 5G5FA 3ERFA 3TKSA 2AV4A 3CMIA 2REMA 1AUCA 1YKCA 2G0FA 4NWYA 1GUHA 2DJ3A 2QGVA 5JCGA 3ME7A 3JCML 6GSYA 6GSUA 1XVQA 1HNBA 3HD5A 3APQA 1O85A 4QL9A 3G7IA 4ML6A 2PVQA 3O76A 2IIYA 3M1GA 2PU9C 3BOAA 2HXKA 1GSDA 3H8QA 2HRFA 1GLPA 2FUG2 3CTFA 1GSFA 5J9BA 3GNJA 3KH7A 2GZZA 3RHCA 2E0QA 2XBIA 2C8UA 2E2GA 2PPTA 4ZB8A 1SD9A 1OKTA 1TK5B 4O7HA 6GSTA 1XWAA 2YWIA 1A2MA 5DQSA 4XCSA 2LEGA 1PQNA 1K0MA 4HOJA 2AUVA 1GTUA 3LGCA 1NSWA 1JLVA 5ECRB 4NAXA 2QKEA 4XRAA 2PN8A 2VO4A 1WOUA 4KB3A 3IHQA 4ZBBA 1A8LA 1OC8A 4YAPA 4WF5A 2YP6A 1V2AA 3GKKA 2MYGA 3IDVA 4OWYA 2LJAA 4K1FA 1XOAA 1HQOA 3EMXA 4JR6A 2L4QA 5COHA 2LRTA 2YZHA 1WJKA 2K9FA 5DJLA 3EYTA 1T4ZA 5ELGA 2WS2A 2IN3A 3CXGA 3FR9A 2G2QA 2RIIA 5E59A 2FLSA 1B48A 5ECKB 4O5RA 1WIKA 5IMVA 3TUEA 4GLTA 3ME8A 5JCWA 3FZAA 1SJ6A 2I81A 2DJKA 4OFTA 3ZTLA 4EO3A 3QCPA 1HNAA 1JZRA 1YKAA 4MF5A 4HS1A 3TKSC 3KP8A 2TRCP 4MP4A 1V58A 3I9V2 5CRGA 1O81A 3F3QA 3GYKA 3D0ZA 1OE8A 1QMVA 3TRPA 1XWBA 5G2ZA 1PX6A 4AF2A 5DAKA 1UN2A 3ED3A 4WXTA 1AW9A 4G19A 3I69A 3IC4A 2H30A 1GL8A 4POMA 1X9MB 1GUKA 1DSBA 1A8YA 17GSA 2N5BA 4K0NA 2JSYA 4HU7A 3ZLPA 3MWHA 1U88A 1FO5A 1T8EB 1I9DA 1TU7A 2NVLA 3E3EA 1HNCA 4EL1A 3EU3A 1GLQA 5IMZA 3GH9A 1M2AA 2V6KA 1EGOA 5H5SA 2OE3A 2GSQA 3ZZXA 3LWAA 2H74A 4IW9A 1OC9A 3WT2A 4RI7A 2HT9A 3KMNA 4OFMA 2AHEA 1J9BA 1PL1A 4I6XA 1V98A 2H6ZA 2DJ0A 4KCEA 5DJMA 1JZWA 1M2DA 5AIVA 1FOVA 2GGTA 2JACA 3GURA 2LNSA 6GSVA 2PUKC 5DAKB 4PNGA 4K7IA 1BX9A 1GSUA 1FAAA 4ECJA 4V2LA 3ZFLA 3MSZA 4TR0A 4HU9A 2DJ2A 2HZEB 1VF2A 1Z7RA 3DVWA 5B6MA 4F9ZA 5H5RA 3TOTA 4BWSA 1Z5YE 3US3A 4PURA 2H6XA 3PH9A 2AAWA 2WFCA 2MMAA 4JE1A 4BWQA 2RUFA 5D9WA 2JZSA 1M0UA 2EC4A 5FT3A 3IBHA 1OC9B 1CQGA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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