2B3SA

Structure of the dsba mutant (p31g-c33a)
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
187
structure length
187
Chain Sequence
QYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCGHAYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the DSBA mutant (P31G-C33A)
rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein dsbA
molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli
total genus 61
structure length 187
sequence length 187
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-09-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2b3sA00
2CVBA 5IMZA 4F9ZA 5CRDA 3IE3A 4TR0A 4TXOA 2PGTA 2B3SA 4ZBAA 1GSFA 4EDYA 1OE8A 4MLYA 4XS4A 3ZREA 4QL7A 5ENUA 1QGVA 3BOAA 5ECLB 4IQ1A 14GSA 4O32A 3WYWA 1OC8A 3WGXA 1MTCA 2ON7A 3HYPA 1B48A 1A0RP 4HJ2A 4J57E 1XOAA 4ML6A 5IPGA 5J41A 5DBQA 4PURA 4I97A 4WR4A 11GSA 4HI7A 3CRUA 2PVQA 1XOBA 2I4AA 4ZL8A 3QCPA 3QOUA 1Q98A 3VWVA 4ZL9A 4V1Ag 2IL3A 4GSSA 2WDUA 1GNWA 4MH2A 3ZFBA 3ZLPA 1AQXA 1T00A 5HR3A 2YP6A 3TB2A 2X99A 3GL5A 1GUMA 4XTSA 5ECKB 3VWXA 1PRXA 3M1GA 3QFAC 1S3AA 3A3TA 1A2LA 3TJKA 2M72A 1R5AA 4IBPA 1ST9A 4NWYA 4CDOA 2DJ2A 1VRSD 2GSQA 4LLRA 1V98A 3IK9A 5D9TA 4I6XA 4Q5FA 4BWSA 3F9UA 1WPIA 3I6AA 2K6VA 2GLRA 2P31A 1TU7A 1XBSA 1JFUA 3FR3A 4CHSA 1X9WB 4MJBA 1O6JA 2C3TA 5F07A 1ERUA 1AQVA 4OCEA 2R4VA 1J9BA 4XHMA 1QFNA 4WKWA 4ACSA 2YWNA 4RQRA 1X9SB 2IWTA 4IVFA 2JSYA 5J4UA 1NHOA 2HLSA 4H86A 4XRDA 3ZRDA 4MJCA 4N11A 2YPMA 3UBLA 2E2GA 2GT5A 5EL8A 1YJ6A 3US3A 4HQSA 4K7OA 4HJMA 8GSSA 5J5NA 1FOVA 1M9AA 4JZQA 1A8LA 2F8AA 2DJ0A 3TJFA 1OKDA 5HR2A 1F3BA 3P7XA 4MABA 2PMTA 2GSTA 2X8GA 5IO0A 3IV4A 2CT6A 2JSZA 2VCXA 1A2JA 4TR4A 1V57A 4F0BA 5ECOB 1MD3A 3GFKA 1GULA 3W6GA 2V6KA 3TRQA 3WGDA 3LXZA 5GZZB 2QC7A 3CRTA 1BJXA 1YEXA 2C4JA 2VCTA 5AIXA 2K8VA 1QK8A 1TI3A 5KN3A 1LBKA 2JZSA 1FG4A 1XVQA 6GSVA 2OJLA 1T4ZA 3QR6A 3GN3A 2RLIA 2BMXA 5HR0A 4GSNA 2AV4A 4PGTA 1FVKA 2JU5A 1THOA 6GSYA 1JZDA 3KTBA 2VO4A 1EGRA 3M9JA 3C1RA 4HZ2A 1W89A 4Z7XA 1GTAA 3HD5A 3E3EA 5ECSA 2H8LA 4MJAA 1MD4A 2C3QA 3OR5A 1GH2A 3BCIA 1GSDA 4OO4A 4ULXA 1BYEA 2I81A 4EL1A 5D9VA 4J56E 4EC0A 5G1LA 1SJ6A 2HZEB 3D4TA 1S3CA 3UEMA 1Z3EA 1K0AA 1KEBA 5IM9A 2YWIA 1RW1A 2A4VA 4TOPA 4MH3A 3C71A 1FB0A 2DJJA 2OE0A 3FKFA 3GSTA 4PXOA 2XPEA 5GAND 4K9ZA 4LMVA 4EVMA 4K2DA 1AXDA 1JLVA 2N5AA 1E2YA 4D73A 2R2JA 2OKAA 6GSUA 2VOCA 2F51A 3E9JB 4HDEA 4NAXA 5EY6A 2PUKC 3KM6A 3HZ4A 5A5KA 2IMEA 4FYCA 2H1DA 4L0WA 4KNDA 1I9DA 4TKYA 3ZFLA 1YDKA 5HFKA 2R6KA 5AN1A 1BAYA 3HVXA 4G10A 4MJEA 2D2ZA 5IMDA 2YV9A 3D6IA 3AY8A 1TK0B 5IIZA 1AUCA 1DE2A 13GSA 1MDKA 5G1KA 2IN3A 1PX7A 4J2FA 1TP9A 5EVOA 6GSSA 3IAS2 1ERTA 3M9KA 2GVPA 2HNLA 3ZYWA 1J08A 3PR8A 5COHA 4MF6A 4K7NA 4POMA 2L4QA 3FZ4A 3UMAA 2GS3A 4GCIA 1G7OA 3UVHA 4KDXA 2VL2C 2K18A 4PQHA 1VF3A 2V32A 3H79A 1HQOA 2PVOC 4KX4A 1VF4A 3VWUA 3HCZA 1N8JA 2HZFA 3DVWA 1TU8A 2JL4A 2HSHA 3KH9A 4OO5A 2EIOA 2YN1A 1TRSA 2OBKA 3VFIA 4EKZA 2ZCTA 3LJRA 4NMUA 3UAPA 3DYRA 1DUGA 2LKUA 2REMA 1K3LA 3IC4A 5DJMA 1YEPA 3D4MA 1ZYEA 1SKRB 3TJJA 2JZTA 2AAWA 5CO3A 1XWAA 4YH2A 3KP9A 5J9BA 1ML6A 2HE3A 4RI6A 2WCIA 5IQYA 1ILOA 2O85A 4GWRA 3FRCA 3HA9A 2JACA 4L8EA 3KMOA 3ZZXA 2XHFA 2H6ZA 1FO5A 3HDCA 5ECQB 1R26A 3CTFA 3ZIJA 4YAVA 4OCFA 1XW6A 4ZBBA 1T1VA 2H74A 2LRNA 2WZ9A 4ISDA 17GSA 3ME8A 3MWHA 4WXTA 3WT1A 4BA7A 4FYUA 5B6NA 2TRCP 9GSSA 2KHPA 1GUKA 1BG5A 1UVZA 2H70A 3EC3A 2FWGA 2DJ3A 2VLVA 4ZIJA 1ON4A 3HHVA 5ECPB 1J0FA 5DALA 1GUHA 4KH7A 4Q5QA 2HI7A 3VLNA 5G5FA 1T8EB 1V2AA 4KSMA 1Z6NA 1SYXA 2ZNMA 3P2AA 2DSAA 3NOFA 3LEFA 5A4UA 1F9MA 5EPFA 3F0IA 1GSSA 1AW9A 3E0UA 1OC3A 4OFTA 1U87A 3IK7A 1ERVA 3KD0A 2JADA 1K0MA 4HZ4A 2KOKA 3KZQA 4AJ7A 1QUWA 2HSYA 1YF1A 1ZCPA 4WF4A 3KIJA 1U3IA 1V58A 3L9SA 1MDJA 4HUAA 4BL7A 2DMLA 1F37A 5ECHB 3LORA 2TRXA 5KN0A 1A23A 3C8EA 4EO3A 1F3AA 3HJOA 1HNCA 1GL8A 2CQ9A 5DDLA 1EV4A 2LTKA 1B8XA 2VUPA 1NHYA 3IRAA 3KH7A 3VURA 5DAKB 2IPAA 1SJIA 1XCCA 1O8XA 1OVNA 1KNGA 5ID2A 3I43A 3ZL5A 5FWGA 1ZOFA 4KSOA 5F05A 2VLUA 4KE3A 2CX3A 1Z5YE 3HXSA 3UARA 1M2AA 3LG6A 2C0DA 1X5CA 3RPNA 2B5XA 3QFBC 4E8HA 2YNXA 1F2EA 3C1SA 1PQNA 4ZILA 1WOUA 2FUG2 5ECMB 4NV5A 4I8BA 4QL9A 4IP1A 3QAVA 3KMNA 2GZPA 2R37A 4L0UA 2O89A 4HU7A 3TGZA 2QKEA 4GQCA 2V6OA 4KGIA 2GDRA 3TCOA 2DMMA 2LEGA 4IN0A 5INYA 2ALBA 4G9HA 1GTIA 3I9V2 3KJYA 4G19A 4KCEA 2FA4A 3Q6OA 2L57A 2P0GA 4YAPA 4POLA 2VM1A 5D9XA 1GWCA 2GZZA 2YCDA 3F4RA 1Y25A 3CTGA 1EEJA 2FCHA 4O5RA 3BJ5A 1A2MA 2GSRA 2PPTA 5D9WA 2RM5A 1YF0A 1TK5B 4O7HA 4X0XA 3TKSE 3CBUA 1WWJA 2MMNA 2GQLA 1URMA 2IIYA 2H1BA 3FZAA 1SK2A 1NM3A 3CSJA 3BD2A 4KDUA 5JWRB 1E6BA 2H1GA 2B1KA 3VPQA 1R4WA 4EDZA 2FNOA 1XWGA 5DJLA 1N2AA 2AUVA 5DQYA 3FEUA 1FAAA 2H71A 3D22A 3NZNA 1NSWA 2LRCA 3TRXA 4TRXA 1ZL9A 3FHKA 5G2ZA 3TJBA 4OWYA 2YOIA 3TOUA 5H5RA 4LL1B 1K3YA 3GRXA 2O7KA 3A2WA 1ZGNA 4PQ1A 1Z7RA 4AGSA 1XZOA 1CQHA 3TKPA 5HFIA 3N5OA 1HD2A 4L5LA 3GMFA 1SL0B 4K0NA 2OA7A 1ZYQB 2YWMA 3DVXA 2IFQB 3GURA 2NTOA 4POBA 4RUVA 2VCWA 3G7IA 3RPPA 5B6MA 2VIMA 3RAZA 1JLWA 1TRWA 3L4NA 3D5JA 4WF5A 3ZMKA 1Y6EA 3JCML 1KTEA 3Q19A 1GNEA 4YQVA 2C0FA 5ECIB 2LV3A 4PQIA 4YQMA 4ID0A 4MCUA 3L9UA 2CZ3A 1TDIA 1SJZA 2DLXA 2H72A 4XRAA 1ZMAA 2LJRA 3VK9A 4TW5A 1V9WA 3APSA 2HXKA 1OYJA 2WRTA 3RDWA 2LQQA 2VL3A 4GRFA 3LSZA 4AJ8A 4DSRA 4NHWA 2VCZA 4I5QA 2FWHA 5AIVA 3W8SA 1PKWA 2MMAA 2C8UA 2ES7A 2DIZA 1M9BA 3R2QA 4LL4B 2C1YA 3RBTA 2KP1A 4GSTA 3CSHA 2OE1A 5IOWA 2E7PA 3ZITA 4EXJA 2PERA 2MMZA 5J3RA 3J7Yk 3MAKA 1OC9B 1A0FA 4ZB6A 4NV2A 2AHEA 2DBCA 3HJPA 5HQPA 4IJIA 2A2SA 4WR5A 3IXRA 1GLPA 4QQ7A 4JRRA 2IFQA 1PD21 3EE2A 4Q5RA 5D93A 3UIWA 5ELGA 3ERGA 5IPHA 1Q4JA 2FWFA 3LWAA 3ZVJA 1AAZA 2H1AA 1RQMA 5IO2A 4XIHA 1A8YA 4MPGA 2VLTA 4XS1A 3C73A 5ABRA 1MEKA 1ERWA 1B9XC 2IMKA 4MF5A 5B8BA 2FHEA 3GKKA 3MSZA 2HYXA 4I2UA 1GLQA 1X9MB 3G7YA 1EOHA 3IPZA 3UBKA 2NBSA 1PX6A 4DVCA 5HFGA 4OD7A 4MP4A 4KW6A 2B7JA 3CXGA 2K9FA 4HOJA 4DSSB 3FR6A 5JWQB 3RHCA 4O92A 1JZWA 3LYPA 3UOMA 3GNJA 1ACVA 3M8NA 1AQWA 4V1Ap 3A2VA 1EV9A 2DC5A 3FY7A 1X5EA 3H1NA 5DCGA 2AJQB 2HZEA 4BPYA 4ECIA 1EWXA 1PMTA 2G0FA 1O73A 1WIKA 1PN9A 1YZXA 1TRVA 3SWLA 4JEDA 1T7PB 5ECRB 5CRGA 5E59A 1R7HA 2P5QA 5C04A 3DMLA 5E4WA 18GSA 1R5PA 3DXBA 1SU9A 3QPMA 3EU3A 2EIRA 2H76A 1H4OA 4K6XA 3HZ8A 4GF0A 3TKSC 3IAM2 1C72A 4EE0A 3C7MA 6GSWA 2NDOA 2B6MA 4ECBA 1B4PA 2CV4A 4K0GA 3CSIA 3Q74A 3ERFA 1AC1A 4LA1A 4F82A 6GSTA 3RHBA 2L6DA 4WEYA 5GSTA 3IOSA 4N0VA 1PSQA 2LRTA 2H0IA 3MDKA 1HYUA 1BQ7A 3KGKA 3W8JA 2PU9C 1EP7A 5FHIA 1U6TA 2XPDA 3IA1A 2C80A 4FIWA 5B7CA 2LNSA 2YWOA 1THXA 2I3YA 3VI7A 1JZRA 3EINA 3EYTA 4TVEA 4IQAA 1K3OA 2R5GA 1GSUA 3GKXA 3EMXA 2G2QA 22GSA 3GV1A 1TI1A 2C3NA 1XPVA 4X43A 1M99A 1TW9A 3GH9A 1K0DA 3TJGA 4RI7A 3TDGA 2YZHA 4GXZA 4CW9A 3VWWA 5A4WA 3GKNA 3APQA 5CRHA 1GSEA 5L71A 5FT3A 4HU9A 5H5QA 4XS4B 4IJ3A 3ED3A 1WJKA 1KBNA 2F9SA 4MF7A 2CA8A 5IMAA 4PUAA 3IBHA 4N10A 2E0QA 1K0NA 2J9HA 4MMMA 2H66A 4GQFA 4PUFC 2CAQA 5CP1A 2VD1A 1W4VA 2WJUA 1M2DA 5JCUA 2Z9SA 4TN8A 3KEBA 5CYYA 3WGEA 3CMIA 4LMWA 2TIRA 2WB9A 2H30A 2V2GA 2IMIA 4E8EA 1QQ2A 3EVIA 3TKRA 4FYBA 2LJAA 3GYKA 1S3DA 3F6DA 2VL2A 3EMPA 1B4QA 1PL1A 3ZMLA 4IW9A 3D0ZA 2N5BA 3EURA 3HVSA 3WT2A 4FO5A 2FWEA 1DBYA 3SBCA 3KTLA 3G7JA 3IDVA 2RUEA 3LXTA 2MMOA 1GRXA 2H6XA 5D96A 1YQ1A 2LUSA 1WP0A 2GGTA 4KAEA 4K7IA 3S9FA 4KUNA 3UJ1A 2FA8A 5DVBA 2NVLA 3VPTA 4JE1A 1U88A 3BBYA 5IOXA 2EIQA 1LJRA 1FVJA 2F3MA 1TOFA 1DE1A 2B7KA 2LSTA 4ZBDA 2LQOA 3HKRA 6GSXA 5AISA 1GTBA 3O6TA 4WETA 2B1LA 2V41A 3Q18A 1I5GA 5JCGA 2L4CA 5CAXA 4IGJA 3CYNA 2WULA 1XXUA 2I9HA 3M3MA 3GKMA 4NXIA 1G7EA 5LCZA 1GP1A 5ECNB 3MNGA 1T3BA 2WGRA 4JR4A 5CREA 4EUYA 3FYGA 2O8VB 1XWCA 16GSA 2XC2A 4MZWA 2MBTA 3A2XA 1M0UA 3V1WA 3IHQA 1YY7A 1TJDA 4RQXA 2BJXA 5DCHA 2HFDA 3D21A 5CNWA 2NPBA 5F8BA 2VD0A 5IMCA 4ML1A 2GQKA 4PNGA 2YJ7A 5J9CA 3TRPA 1BX9A 4XCSA 5DAKA 2N5FA 1LU4A 4IP6A 4AF2A 5G30A 1WMJA 5KN2A 3QD9A 4GLTA 1AIUA 1O7UA 4ZB9A 5HR1A 1NW2A 4FH8A 3F8UA 3GL3A 2I1UA 4I2TA 5F0GA 4XS6A 1EZKA 2X8CA 2OBIA 3DRNA 1SKWB 2C0GA 1IYHA 2P5RA 3FZ9A 4MZBA 2FD3A 3F6FA 3U5RE 4NPBA 1FHEA 3TKQA 3ZIVA 1OAZA 3QMXA 4DSQA 2GSSA 4EF0A 3F4SA 2J23A 4MDCA 20GSA 2CZ2A 1EOGA 3DEXA 1HNAA 5JCWA 1XFLA 1UA5A 2FY6A 4Q5NA 2HRFA 2QGVA 2C0EA 2L59A 1M2BA 1K0BA 1JHBA 3A5WA 3U6VA 1QMVA 1B9YC 3GTUB 1PKZA 2M46A 2XBQA 1H75A 3H4KA 4P3YB 4ZL7A 3P90A 1X0RA 3F4TA 3LQ7A 1TRUA 4TXVA 4POKA 4BWQA 3TOTA 2PN8A 4D73B 2L5OA 1PL2A 3DIEA 5D8IA 2CAIA 3PH9A 1GTUA 3LYKA 2E2MA 3H93A 4F2IA 3ME7A 1WE0A 2X64A 2L5LA 1QXHA 3N9JA 4V2LA 1SYRA 2JZRA 1OE7A 3WD6A 2F8FA 1Z9HA 4L5OA 3KCMA 3L9VA 2B5EA 1UN2A 12GSA 1YKCA 3ZVJD 4MK3A 3DKSA 3ISOA 3HY2A 4KDYA 3GIXA 2VL9A 2O87A 2CVDA 1TTZA 3FW2A 4BVXA 5LD0A 3M0FA 2RM6A 1Z6MA 5JWOB 4MPFA 5H5SA 2FLSA 4G2EA 2QSIA 4JU5A 1UC7A 4KCAA 1G0TA 1EP8A 2FGXA 2WS2A 1OKTA 4K1FA 4BVYA 2LS5A 3GTUA 4IHUA 3PGTA 2H73A 2LNTA 1SD8A 1T4YA 2DJ1A 4KB3A 4KA0A 3GH6A 2RIIA 2ON5A 19GSA 1SD9A 5D73A 4MZCA 1XWBA 5KEJA 5LNKe 2B5YA 3LGCA 3EU4A 2GT6A 3GX8A 1U3AA 3F3RA 1SL2B 2AB6A 2H01A 1SENA 3F63A 4V2NA 5CRWA 4ZXGA 1V40A 4IS0A 2MZCA 3QAGA 5A4VA 3HJMA 1CQGA 3FK8A 2M80A 3APOA 4OFNA 4PX1A 3IR4A 3VI5A 2IMFA 1VF2A 3NIVA 2RUFA 1OC9A 1ABAA 1PA3A 1XWKA 1TKDB 5G31A 4OFMA 2AYTA 2VM2A 3BCKA 4WBJA 1YKAA 4N30A 2GZYA 2DJKA 3GUSA 4HS1A 2CVKA 7GSSA 3UVTA 4ZB8A 5DALB 3H8QA 1XW9A 5DQSA 2H6YA 1JZOA 3DGQA 3L0HA 2R3XA 5GSSA 3I69A 1G6WA 1FW1A 3QDNA 2OACA 2GTUA 4JR6A 5IMFA 1GSYA 2L6CA 4YQUA 1SKSB 4TR1B 3LFLA 3P8WA 2IJYA 4TR3A 4DSSA 4NHZA 1TXXA 1TK8B 2MYGA 4AJ6A 3QAWA 1VGLA 3F3QA 3FZ5A 3KP8A 4OMVA 3J7Yb 4WBRD 4PNFA 10GSA 1WRYA 3O76A 2X8HA 2OE3A 5C00A 2MBSA 2PBJA 1EEMA 3ERWA 4F03A 1O8WA 3O3TA 5F06A 1G6YA 5G5EA 2VCQA 1PGTA 1BEDA 3GSSA 3GHAA 5ELAA 2GQMA 1IYIA 4MA9A 2VCVA 5B8AA 4TXOB 3ZTLA 2DIYA 2ZUPA 2XBIA 1SK0A 3L78A 4ECJA 2VAFA 4IELA 2PWJA 5AGYA 1X5DA 4F0CA 1DSBA 2KUCA 4IKHA 1GSQA 2H19A 2WFCA 2YJHA 1XW5A 1XVWA 4X1UA 1EGOA 5ID2B 3FR9A 3GA4A 4JBBA 1HNBA 2K8SA 3GX0A 3G9BA 2BTOT 3DD3A 4GTUA 1O81A 1SK1A 5KN1A 1A24A 2LJKA 2KLXA 2IMDA 2HT9A 3TUEA 2HRNA 1F6MC 1K0CA 1XIYA 4TR1A 3KXOA 1MDIA 1VF1A 1O85A 2YV7A 1Z7PA 2YZUA 2OADA 3HVVA 3PINA 4K8MA 2CX4A 2KP2A 1ZZYA 2YANA 1SL1B 3UL3A 3K8NA 1USBA 1FB6A 3DWVA 4N0ZA 4ECCA 4HQZA 3EWLA 4DEJA 2H0GA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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