2B3SA

Structure of the dsba mutant (p31g-c33a)
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
187
structure length
187
Chain Sequence
QYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCGHAYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the DSBA mutant (P31G-C33A)
rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein dsbA
molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli
total genus 61
structure length 187
sequence length 187
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-09-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2b3sA00
4HQZA 3HVSA 1ACVA 1XW6A 4K0GA 2VOCA 3F4TA 2VCZA 1EZKA 4TXVA 1K0OA 5L71A 1GTIA 1V40A 3ERGA 1YZXA 3HY2A 4EKZA 1ERWA 2IN3A 5CO3A 4CHSA 2DMMA 1XWCA 2YZHA 1F3AA 3J7Yb 2XBIA 2GS3A 5B8AA 3G7YA 13GSA 3QFBC 4KDYA 1B9XC 1TW9A 2A2SA 4ZB8A 5EY6A 1AQXA 3HVXA 3ZVJA 3TKSC 2AYTA 3NIVA 1AQWA 2YANA 2GQMA 2DIYA 1FHEA 4HS1A 1XPVA 5CNWA 3GN3A 5KN3A 2O7KA 4YQUA 1JZOA 2H1GA 2R5GA 4F03A 3HJPA 2GZYA 2FLSA 5DJLA 5HFKA 1SL2B 2GT6A 3FRCA 2ZUPA 1X9WB 3EC3A 3TKPA 2L6CA 2H75A 2C1YA 4HZ2A 1HNBA 5DQYA 2DJJA 2WB9A 4GSTA 2X99A 5FT3A 3ZREA 4ECJA 3TJFA 3M8NA 3HD5A 3IK7A 1R26A 4V2NA 5IMZA 3EMPA 2YWNA 5IMFA 1X9SB 1OE8A 5DALB 4E8HA 4G10A 4HI7A 4EO3A 2VLTA 3P7XA 4FIWA 3VWWA 3FK8A 2N5FA 2FGXA 2R37A 2WGRA 2B6MA 1QFNA 4NHZA 4ZILA 2JSZA 2C3NA 1G7EA 3FEUA 5J4UA 2QSIA 3KGKA 2VL2C 1ZOFA 4AJ7A 5DVBA 1PA3A 3MSZA 1K0MA 1WWJA 2LRTA 1DSBA 4Q5QA 4FYBA 1OC3A 1OVNA 3O3TA 3H8QA 2VCQA 1K3OA 1XZOA 5B6NA 1GUHA 2DLXA 1WPIA 2VUPA 1Z3EA 2RM5A 1QXHA 4N0ZA 3LGCA 2HLSA 1DUGA 4KDXA 1TTZA 2XPEA 1PKZA 1ZZYA 1ZCPA 2MMAA 4ECBA 3GKMA 2HSYA 1VGLA 2L4QA 4ML1A 4KCAA 2J9HA 5G31A 5AN1A 5JCGA 1EWXA 1M2AA 4RI6A 1XWGA 2I81A 4JE1A 5D9WA 2VL3A 3FW2A 2JU5A 2H30A 2FWHA 1OC8A 4OFNA 4OCFA 1DE2A 4MZBA 1IYHA 2XPDA 1E2YA 2IMFA 3QDNA 3LORA 4K8MA 3Q19A 2ON5A 4WBRD 3IK9A 4POLA 2R3XA 4K1FA 4O32A 2YZUA 3E9JB 2IFQA 3RDWA 4OO4A 2JZTA 4KH7A 2O89A 1U88A 1GTBA 4BWQA 1OKDA 4L0WA 2V6KA 1GSYA 1V2AA 5ECOB 4TR1B 4TVEA 2EC4A 3CYNA 1YKCA 4GSSA 4JEDA 4GSNA 3ED3A 1KNGA 2HFDA 1XBSA 4DSSA 5H5RA 2K8SA 2TRXA 1XW5A 4QL9A 3WGXA 2YNXA 2QKEA 4OMVA 1KBNA 2C4JA 5A4WA 3RHCA 4Q5FA 3ZYWA 3TB2A 1ZL9A 4KSOA 2HRFA 4NPBA 3TRQA 2VM2A 5CYYA 3F4SA 2F3MA 2B5XA 1EP8A 3LJRA 2DIZA 4N11A 4AF2A 4FH8A 2H6YA 1DE1A 5IPGA 2H8LA 3IBHA 4OFMA 3APQA 1G6YA 4G2EA 1JHBA 2C0DA 5AGYA 4K7OA 3TRXA 2AV4A 2EIRA 4POKA 1GNEA 4FYCA 1V98A 2YV7A 2GTUA 4NXIA 3KTLA 1XWBA 1E6BA 5JCWA 3ZFBA 4WBJA 4ILFA 4GTUA 2I4AA 5ECMB 5ABRA 3Q18A 4P3YB 3S9FA 3NOFA 3ISOA 4HU7A 2CAIA 2E0QA 4HQSA 1U3IA 4ZBBA 1FVJA 4BWSA 1FO5A 1MD4A 2M80A 3BD2A 4JZQA 4MH2A 2H0IA 4MPFA 4WXTA 1T1VA 4X0XA 2PU9C 4JRRA 2FA4A 3GURA 1R7HA 2ZCTA 3GX8A 2YWMA 4J57E 1O8XA 2X64A 3EU4A 3CRTA 3C1SA 3MDKA 3HDCA 4WR4A 1M2DA 2P5QA 10GSA 3LQ7A 4KE3A 3F3RA 2PVQA 4Q5NA 3US3A 3A2WA 3QAVA 2NBSA 5J9BA 1YQ1A 3TJJA 1HNAA 3UARA 5CRWA 1M9AA 4GLTA 2YWIA 3LYPA 3OR5A 4WEYA 2M72A 1OYJA 1Y6EA 2G0FA 3U5RE 1FVKA 1YY7A 2M46A 2EIQA 3QAWA 4IELA 1AXDA 3MNGA 4MA9A 1W89A 4N10A 6GSXA 2K6VA 3C73A 3IR4A 3I9V2 1NM3A 2H0HA 1TI1A 2NDOA 1I5GA 1QUWA 4K6XA 4XTSA 2YCDA 5KEJA 3FY7A 1IYIA 3M1GA 14GSA 3GKKA 3RHBA 2IWTA 1XIYA 3IC4A 2VCWA 1PD21 4MJAA 1FOVA 3N9JA 1QQ2A 1AIUA 3KXOA 4K0NA 4MABA 2GLRA 3IAS2 5CRDA 5IMCA 1OKTA 1AUCA 1WE0A 2B3SA 1B4QA 1YEXA 2OADA 3TKSE 1XXUA 1G6WA 4I6XA 1Z6NA 5HR1A 5LCZA 1AAZA 1K3YA 2HRNA 4N0VA 1YKAA 3D0ZA 4NV5A 2FNOA 1V58A 2HYXA 4PUAA 5ECPB 2VD1A 4I2TA 2MMNA 5HR2A 2PMTA 2YWOA 5JWRB 4F2IA 4KA0A 3Q74A 1JLWA 3M0FA 3WT2A 1BYEA 5EVOA 5KN2A 3IDVA 3G9BA 4DSSB 1WP0A 1VRSD 5E4WA 3KMOA 1K0AA 2L5OA 3LWAA 2KLXA 4TR1A 2LTKA 3KZQA 2CVBA 4KW6A 3E3EA 2V32A 3P90A 1U3AA 3LSZA 1YF0A 1GP1A 1Z7RA 5DCGA 5ID2B 4EL1A 3ZRDA 4TR4A 4AGSA 3EWLA 2WCIA 3TJGA 1THXA 1J08A 2KP2A 3IV4A 2FWFA 1SKSB 5JCUA 2IMEA 3PR8A 3UL3A 4KCEA 1FW1A 3J7Yk 2DC5A 2H19A 2E2GA 3VI7A 8GSSA 5GSTA 4L5LA 3GNJA 4EXJA 2OACA 5D96A 5LNKe 1M9BA 1BQ7A 3BCIA 1WJKA 3M3MA 3HJOA 1NW2A 3CSHA 5JWQB 4V1Ag 1ON4A 1Q98A 4X1UA 3ME8A 5C00A 4MK3A 4HU9A 2B1KA 3EMXA 2NTOA 4MJCA 2VCTA 1PN9A 2DBCA 3UVHA 1OAZA 4JR4A 2XBQA 1B8XA 1EEJA 1ERTA 4ACSA 5A5KA 2PGTA 2HE3A 1K3LA 1XCCA 3WYWA 2HZEB 6GSSA 1F9MA 1SD9A 4MLYA 1A8LA 4WKWA 4OD7A 1SYXA 4EF0A 1XW9A 2P31A 2R6KA 3IA1A 5ECQB 3F9UA 1EV9A 3MAKA 2LJRA 2D2ZA 5AIXA 5J9CA 3KMNA 1ILOA 4GQCA 3PGTA 2GZZA 3F8UA 3GKXA 4IQAA 5B8BA 1CQGA 3UJ1A 3RPPA 2H72A 3F0IA 1ZYQB 2FWEA 3G7IA 3K8NA 1ML6A 2MBSA 2GZPA 4EDZA 2BTOT 1R5AA 2H1BA 1T4ZA 2XHFA 3CTFA 2YJHA 1JZDA 5A4UA 2JSYA 2PWJA 3SWLA 4POBA 3KH9A 2F8AA 2BJXA 4BVYA 3QFAC 3ZITA 4E8EA 4LLRA 3VWVA 2FY6A 2TRCP 4PGTA 2KUCA 2X8CA 3TOUA 4EUYA 3SBCA 5ECHB 3BOAA 4ZB9A 4XCSA 2H76A 1SL0B 1SL1B 3CXGA 4XRDA 4N30A 1T3BA 1DBYA 5A4VA 4HOJA 1F2EA 2V6OA 1A8YA 2H6ZA 4Z7XA 4TOPA 1O8WA 1KEBA 1ZMAA 1TI3A 2JZRA 3FZ5A 1ST9A 4F82A 2VD0A 1VF2A 12GSA 2MBTA 3HKRA 3TDGA 3CBUA 1BG5A 4KB3A 2CZ3A 3VWUA 4ZIJA 2N5BA 4ZBAA 1TU8A 5HFGA 20GSA 3KP9A 4X43A 5G2ZA 1USBA 4DVCA 19GSA 2LJAA 4XS1A 1RQMA 4KNDA 2B1LA 3GH9A 2PUKC 2OE1A 4DSQA 5HQPA 4DSRA 2HZFA 5ENUA 3KP8A 1WMJA 1HQOA 3GL5A 5ECIB 1EV4A 3L0HA 5HR3A 4V1Ap 4EC0A 3BJ5A 3GSSA 2PN8A 3KM6A 3D22A 3UIWA 4RQXA 3ZMLA 5IO2A 3UBKA 4RUVA 3ZL5A 1JLVA 1GLPA 4ZL9A 5DQSA 3H93A 3A2VA 3AY8A 3H1NA 2GQLA 3VLNA 9GSSA 1GH2A 4F0BA 3QCPA 3WD6A 4NWYA 5B7CA 1X5DA 5IOWA 4HJMA 1WRYA 1R5PA 2H01A 2B5YA 1KTEA 1J9BA 2F51A 4NHWA 1EOGA 1ERUA 2ALBA 3F63A 2YPMA 3DRNA 2L59A 4ID0A 1XFLA 4GQFA 4LMVA 3GX0A 5F8BA 4AJ8A 3L78A 1TRWA 3VK9A 2H71A 1SD8A 1SENA 4L8EA 4D73B 2CX4A 3UAPA 5ID2A 4K7IA 2PPTA 3GL3A 2C0GA 4O92A 1PQNA 1UC7A 5LD0A 2KHPA 1SKWB 2VCVA 2O8VB 2ZNMA 3Q6OA 3I43A 3LXTA 1UA5A 4IQ1A 2OBKA 5D73A 3H79A 2MYGA 3DVXA 2WZ9A 3TCOA 2OJLA 5DBQA 1T00A 1AQVA 1S3AA 3PINA 2IPAA 2L57A 4NMUA 3VPQA 4IBPA 2CV4A 1GTUA 5CAXA 1X5EA 5DCHA 6GSTA 4JR6A 1TK8B 1PX7A 4KUNA 3LXZA 3ERFA 5JWOB 4GWRA 1BJXA 3GA4A 3GV1A 4TXOB 2BMXA 3HXSA 1H4OA 1WIKA 2HZEA 4WF5A 2OBIA 1TRUA 2DJ3A 3CTGA 5F06A 4IKHA 5DAKB 3C71A 1OC9B 3F6FA 1BAYA 5ELAA 1TP9A 4MP4A 1A0RP 3GTUA 4KX4A 1XWAA 3APSA 3M9JA 2VO4A 5D8IA 2KOKA 4XHMA 3V1WA 2JACA 2HI7A 1GUKA 1S3CA 2OE0A 4LMWA 3LG6A 4V2LA 3JCML 5DDLA 5F05A 5INYA 3DGQA 4I5QA 2H0GA 3FKFA 2L6DA 1THOA 1A2LA 4MZWA 2H6XA 1O81A 1SJ6A 3TJKA 5G5FA 1Z9HA 5KN1A 1B9YC 2B7KA 4PURA 2I9HA 4LA1A 1SJZA 3P8WA 3DIEA 3GFKA 3W6GA 4BL7A 5GZZB 4EVMA 2AAWA 2C80A 2GSTA 3W8JA 4IVFA 4ISDA 5B6MA 1TRVA 2O87A 2LRNA 2HXKA 5IM9A 1EGRA 1H75A 2QGVA 2RUEA 2REMA 1YF1A 4O5RA 3TRPA 2FA8A 2I3YA 1TK0B 2HNLA 2H73A 4TKYA 2EIOA 3HVVA 4I2UA 2CQ9A 3CMIA 3VPTA 4OFTA 4ECCA 4ML6A 1FG4A 1A23A 2MMZA 4PQIA 3ZVJD 3GHAA 4F0CA 3DD3A 3UOMA 1JZWA 2DJ1A 2VLVA 2I1UA 3IE3A 5CRHA 2RIIA 4PQHA 4IJ3A 5IIZA 3GSTA 2G2QA 2WULA 4NV2A 1ABAA 5IMDA 3RPNA 1BX9A 4HJ2A 2IMIA 4IHUA 2YP6A 2R4VA 4Q5RA 1XOBA 1WOUA 1GTAA 3IAM2 2CA8A 2R2JA 1GSSA 1T7PB 4WETA 3A3TA 5FWGA 4L5OA 1EP7A 1BEDA 4FYUA 1TJDA 1VF3A 1QMVA 1MEKA 3FZ4A 1B4PA 4ECIA 3FZ9A 1F37A 2AUVA 3GH6A 3TKQA 5H5QA 3FR3A 1QGVA 2QC7A 1N8JA 1XWKA 3C1RA 3HZ8A 1GL8A 3EYTA 1GSEA 1A2MA 3EVIA 2N5AA 3TUEA 4IS0A 5AIVA 1Z5YE 2DJ0A 3N5OA 3HA9A 3RAZA 1NHYA 1TK5B 4LL4B 2MZCA 1XOAA 1HD2A 2C0EA 4MZCA 3FYGA 3WGDA 1FB6A 1GNWA 3LEFA 4G19A 1TDIA 3KEBA 5ECNB 3DXBA 1T4YA 3HYPA 1HNCA 4D73A 3TKSA 2K18A 3VI5A 6GSUA 1M99A 3HJMA 2LNTA 1ZGNA 3D5JA 5HFIA 2IMKA 3VURA 5G5EA 1PRXA 3GRXA 2LUSA 2GSRA 4BA7A 5AISA 1O6JA 4YAPA 1TOFA 1JZRA 2LSTA 3F6DA 3M9KA 3LYKA 2LJKA 3APOA 3DKSA 2A4VA 3ME7A 1NSWA 1PMTA 5J41A 1VF1A 2CAQA 1XVQA 2FHEA 4KSMA 1SKRB 5ECKB 1SU9A 4YQMA 1FAAA 3BBYA 3WGEA 3R2QA 1GWCA 1MD3A 2LS5A 2RM6A 2LEGA 4GCIA 2WRTA 4CDOA 2WFCA 1GSQA 1YJ6A 11GSA 1GSDA 3GTUB 4TXOA 2WS2A 1PX6A 2LRCA 2CVKA 3IXRA 1SYRA 2ES7A 5DAKA 1Y25A 1TU7A 1OC9A 3NZNA 2X8HA 3I6AA 1YEPA 4ULXA 1NHOA 3E0UA 4K2DA 2L5LA 3WT1A 5G30A 1MDIA 1HYUA 2P0GA 4DEJA 1Q4JA 3KTBA 2H74A 3HZ4A 2VL2A 4HEA2 4CW9A 4HUAA 4PQ1A 1C72A 3D4MA 4L0UA 4IP6A 5J5NA 5EL8A 3D4TA 1LJRA 3KH7A 4JBBA 2K9FA 4LL1B 3DVWA 4MJEA 2YV9A 3F3QA 4PUFC 3UMAA 2IIYA 2LNSA 1ZYEA 4GF0A 1OE7A 4ZL8A 5CREA 2PBJA 3VWXA 1CQHA 4G9HA 3ZLPA 3CSJA 4XS4B 1MTCA 3RBTA 5G1KA 1V57A 3H4KA 2OA7A 4FO5A 1M2BA 2GDRA 2JZSA 4XS6A 4OWYA 5CRGA 1X5CA 4PXOA 4IJIA 1GSUA 1VF4A 4TR0A 2VAFA 4KGIA 7GSSA 4BPYA 5F0GA 6GSWA 1Z6MA 2DJ2A 3KD0A 3QD9A 4TR3A 5IPHA 2AHEA 3I69A 3DMLA 4ZXGA 2CX3A 1S3DA 1RW1A 5HR0A 6GSVA 4MF5A 3QAGA 1LU4A 4J56E 4JU5A 3FR9A 4O7HA 2V1MA 3FHKA 4YH2A 3U6VA 4V2MA 4WF4A 1U87A 2F8FA 1K0DA 2KP1A 4IW9A 2C8UA 3W8SA 1O73A 4OCEA 1GUMA 1A2JA 5ECRB 3ZTLA 1W4VA 2C3QA 4KAEA 4IGJA 1YDKA 4XIHA 5COHA 3KCMA 5G1LA 2NPBA 2FUG2 4AJ6A 4MJBA 3ZIVA 3CRUA 2AJQB 2B5EA 5DJMA 3QR6A 5IO0A 2H1AA 2C0FA 2V2GA 3HHVA 2AB6A 2NVLA 3EINA 3TOTA 1FB0A 2FD3A 2GQKA 2HSHA 4MCUA 2DSAA 3ZMKA 1RK4A 4QQ7A 4IP1A 3IHQA 1G0TA 2B7JA 2JADA 2LQOA 4OO5A 2DMLA 1TKDB 3DYRA 4EE0A 18GSA 3L9VA 5IOXA 2YJ7A 4YQVA 3UBLA 2GSSA 4I97A 5GAND 3D6IA 3FR6A 5J3RA 3LFLA 17GSA 3HCZA 4RQRA 3A5WA 1SK0A 4K9ZA 4ZB6A 1URMA 5ECLB 2OKAA 4IN0A 4POMA 5EPFA 5FHIA 2CZ2A 5D9XA 1K0NA 1O7UA 16GSA 3GYKA 3O6TA 3P2AA 2L4CA 1PL2A 1X0RA 1K0BA 3C7MA 1Z7PA 2XC2A 3TJBA 2DJKA 1X9MB 4RI7A 2WJUA 4ZBDA 5IMAA 1EEMA 4MH3A 1K0CA 3KJYA 2F9SA 2LQQA 1J0FA 2LKUA 2FCHA 5GSSA 1M0UA 2CT6A 2E7PA 2OE3A 1GSFA 3QOUA 3BCKA 1B48A 1XVWA 4I8BA 2GSQA 2VCXA 2RUFA 3L4NA 2VL9A 1F6MC 4TRXA 2H70A 3GKNA 4EDYA 2YOIA 2RLIA 4MPGA 22GSA 4HZ4A 3QMXA 4XRAA 3ZZXA 4PNFA 2PERA 1SK2A 1A24A 4K7NA 4TN8A 2H1DA 2ON7A 3EE2A 5H5SA 2GVPA 1I9DA 1EOHA 4MF7A 5DALA 1G7OA 3F4RA 4MDCA 3ZIJA 2GT5A 3DEXA 3TKRA 6GSYA 4H86A 3GIXA 3UEMA 3O76A 1MDJA 5ELGA 3G7JA 3A2XA 5ECSA 4GRFA 1GULA 3GUSA 2CVDA 2O85A 1SK1A 1O85A 2IL3A 3ERWA 5F07A 3DWVA 4PNGA 1AC1A 2JL4A 2VLUA 4YAVA 4F9ZA 3L9UA 5IMVA 4NAXA 3L9SA 2WDUA 1F3BA 4XS4A 3VFIA 2A2RA 3GMFA 1AW9A 1PSQA 1SJIA 4GXZA 1TRSA 5GAPD 5KN0A 2P5RA 1M7TA 3CSIA 5D9TA 3IPZA 2PVOC 3KIJA 4TW5A 1U6TA 3EU3A 2MMOA 1N2AA 2GGTA 2IMDA 5C04A 1UVZA 4HDEA 1GRXA 1PL1A 4MMMA 1A0FA 1PGTA 4BVXA 1MDKA 4J2FA 2HT9A 1PKWA 3C8EA 3UVTA 1ERVA 5CP1A 2J23A 2YN1A 4KDUA 3ZFLA 3QPMA 1R4WA 1TXXA 2H66A 2X8GA 1GLQA 2TIRA 5D9VA 1QK8A 1T8EB 2IFQB 3MWHA 3D21A 3IRAA 5E59A 2FWGA 4PX1A 2V41A 2VM1A 4WR5A 2C3TA 3IOSA 2K8VA 1EGOA 4ZL7A 2IJYA 1UN2A 3FZAA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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