2B5X | Genus

Total Genus 47

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	47
sequence length	148
structure length	148
Chain Sequence	MKLRQPMPELTGEKAWLNGEVTREQLIGEKPTLIHFWSISCHLCKEAMPQVNEFRDKYQDQLNVVAVHMPRSEDDLDPGKIKETAAEHDITQPIFVDSDHALTDAFENEYVPAYYVFDKTGQLRHFQAGGSGMKMLEKRVNRVLAETE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	The bacillus subtilis YKUV is a thiol-disulfide oxidoreductase revealed by its redox structures and activity pubmed doi rcsb
molecule keywords	YkuV protein
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Bacillus subtilis
total genus	47
structure length	148
sequence length	148
ec nomenclature
pdb deposition date	2005-09-29

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00578	AhpC-TSA	AhpC/TSA family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	2b5xA00

2JSYA 1LJRA 4N30A 2VIMA 2WB9A 3A2XA 1Z5YE 3HA9A 1PL2A 1O81A 1JZWA 1OC8A 1F3BA 2LRTA 4IJ3A 3GL5A 3VPTA 4ILFA 2NDOA 3FKFA 3G7JA 3BJ5A 1ERUA 2YZHA 3GMFA 3U6VA 4HZ2A 3HZ4A 1XW9A 1NHYA 2GTUA 2NPBA 3FZ5A 5ECPB 1QXHA 1FAAA 4EO3A 1YKCA 4ZL7A 4F03A 3UAPA 4MF7A 1SYRA 1WE0A 5DQSA 1PKWA 1TRVA 3RHBA 1OKDA 3BBYA 5G1LA 1M9BA 5EY6A 3ZZXA 1URMA 2VM2A 4KA0A 2WS2A 4EXJA 2WRTA 1PKZA 5DJMA 1TXXA 5CO3A 2YWOA 4EVMA 3GX0A 3HKRA 4JEDA 4V1Ag 3KIJA 3GN3A 4JU5A 1OC9B 5JCWA 5DJLA 2OE0A 3ERWA 4HJMA 3QAGA 2HT9A 2GZPA 5IQYA 5B8BA 3D21A 1ERWA 1W4VA 2V41A 3HD5A 2KUCA 4POKA 5CRDA 3GFKA 4TXOB 3DWVA 2Z9SA 4I5QA 1FVJA 3D6IA 1Z7PA 4MA9A 2E0QA 1JLVA 1BG5A 1M99A 2PVOC 3L78A 4QL9A 1A2LA 1M7TA 3F0IA 2GSTA 3HXSA 3GHAA 4POBA 1K3OA 5IMCA 3MAKA 6GSUA 4XCSA 5G2ZA 5HFIA 2IFQB 2F9SA 3LORA 1I9DA 1VF3A 1AQVA 4J56E 2HZEB 2YV9A 2VM1A 3PINA 3EWLA 2KP1A 3RPPA 4K0GA 4K8MA 4MCUA 2R4VA 1U3AA 3C71A 1SK1A 2X99A 4HUAA 2H74A 4IQAA 4TR4A 4WF4A 2GQLA 5LCZA 1A0FA 4HOJA 3KH7A 1SJIA 1VRSD 4JE1A 2RM5A 3ZITA 1XVWA 5H5SA 4IGJA 3L9UA 5DALA 4TR1B 4KNDA 11GSA 2FWGA 3L4NA 3RPNA 1XOAA 16GSA 1QFNA 3F63A 2IMDA 1X5EA 1HQOA 4D73A 1XWAA 1BYEA 1R5AA 2FGXA 3UARA 2B5XA 4HS1A 4BWSA 3US3A 2P0GA 3LFLA 4TXVA 2XBQA 1BQ7A 3GKMA 2F8FA 2MYGA 4X43A 4K7IA 5ABRA 2TRCP 4IQ1A 4KDXA 1Q4JA 2AV4A 4J57E 2VCZA 5ECQB 1EOGA 2OBKA 2BMXA 4WXTA 3TJGA 1ML6A 2KHPA 3ZMKA 4KE3A 4PXOA 4ULXA 2B3SA 5IPHA 5F07A 2AUVA 4KB3A 5B8AA 4L0WA 3P2AA 4KDUA 2GT5A 2O7KA 5DVBA 4KSOA 1J0FA 3PR8A 3LXZA 4MMMA 3Q18A 4YAVA 5CP1A 22GSA 3ZVJA 3D4MA 4ZL8A 3VWXA 3BD2A 4HU9A 3HJMA 3FZAA 2OA7A 3GNJA 3A5WA 5D9XA 2CAIA 3GH6A 3CSJA 1QGVA 3IA1A 3UIWA 2DMMA 4E8EA 4MK3A 2LS5A 3GH9A 2NTOA 1R4WA 1ERTA 3O6TA 4ISDA 3VWWA 3APOA 2VD1A 2WZ9A 3LXTA 3FR3A 1B48A 4FYCA 2JACA 1JZRA 1RW1A 2HRFA 2QGVA 5DBQA 2EC4A 4MPFA 2J23A 3DKSA 3GV1A 4AF2A 2G2QA 4YAPA 1T00A 2CZ3A 5CRWA 2AB6A 1SKRB 4MJAA 3CBUA 2EIOA 1V57A 1OAZA 3APSA 2KLXA 1AQWA 3EMPA 4BA7A 1TRSA 3C7MA 1X0RA 3D4TA 5IMDA 1Z7RA 3MDKA 4EUYA 1Q98A 4OMVA 5E59A 4YQMA 2MMNA 3N5OA 2GQKA 3JCML 5ECKB 5G1KA 4BVYA 1GSQA 1SL2B 2JU5A 2CX4A 4TVEA 3TJFA 1O8WA 1R5PA 4DSSB 5JCGA 3CTGA 1IYIA 1SK2A 4AJ7A 4KGIA 3ME7A 5CREA 4XRAA 1O85A 4JR6A 3HDCA 1BJXA 3FY7A 4KUNA 2WFCA 4HEA2 4TR0A 2C3TA 1MDJA 4XS4B 5DCGA 3I6AA 3W8JA 3QR6A 1AIUA 2YP6A 5F8BA 2D2ZA 1YF0A 2QC7A 3VI5A 3WGEA 1GUMA 2ZUPA 5DAKB 1ZYEA 3A2WA 2LKUA 2WDUA 3UOMA 2B1KA 3QAVA 8GSSA 1UC7A 1A2JA 3F6DA 3TJKA 4EL1A 1NM3A 2PN8A 1UA5A 4G10A 4TKYA 4ML6A 3TJBA 1X9WB 2R3XA 1F6MC 1VF4A 3DYRA 5J9BA 4Z7XA 3LGCA 1ILOA 5J9CA 4MLYA 2TRXA 1KNGA 1V2AA 2LTKA 3A3TA 5ECNB 3QFAC 2TIRA 4KCEA 1FHEA 1EEMA 5ELAA 1WPIA 4DSRA 3VWUA 2H1GA 6GSTA 1FOVA 4WR4A 1I5GA 1B4PA 1M0UA 5DQYA 2OE1A 2H0HA 2GT6A 5E4WA 2LRCA 1DE1A 5ID2A 2YWIA 3KP9A 4G9HA 3RDWA 4GQCA 3HJOA 4GWRA 4MJBA 1HYUA 2YN1A 4EDYA 4PQHA 5IM9A 2PVQA 5B6MA 3IOSA 1EOHA 2X8GA 2V6OA 3DD3A 4WBRD 3IC4A 4CW9A 4HU7A 4AJ8A 1SD8A 4NAXA 2DJJA 1XWBA 3L0HA 2H66A 2GZYA 4DEJA 1QQ2A 1F9MA 3W6GA 5A4UA 4MABA 3OR5A 2DMLA 4JZQA 2F8AA 2H30A 5CRHA 1SD9A 3H79A 3VK9A 2AAWA 4KDYA 4I97A 3TKPA 1TJDA 2P5QA 3G7YA 3NOFA 3KJYA 2VD0A 4QL7A 2R6KA 4BVXA 1T3BA 1TW9A 2OJLA 5AIVA 2R2JA 2HXKA 1A8LA 3KMOA 2JL4A 1U6TA 4GRFA 1XOBA 4G19A 1XFLA 2JZTA 4V2NA 2CVDA 1GLQA 5IO2A 1THOA 5KEJA 5IOWA 3I43A 1GSUA 3LEFA 1G6YA 2OKAA 5COHA 1H4OA 4IP1A 2DIYA 3FW2A 18GSA 9GSSA 3CYNA 1TP9A 2FWHA 1Z6MA 1SL0B 1TK0B 1UN2A 3BCIA 3FZ4A 4E8HA 2A2RA 1GTAA 1O73A 3C1SA 3QOUA 1LU4A 1T1VA 3IK7A 2EIRA 2E2GA 3ISOA 3LQ7A 1BEDA 2NVLA 2RM6A 3UBLA 6GSSA 4OO5A 2JADA 4ZB8A 2IN3A 4MJCA 2XPEA 2E7PA 2CV4A 1ZYQB 5J4UA 3D5JA 3F6FA 4MZWA 1GTBA 1SYXA 4IELA 2GLRA 1XVQA 1JZDA 2ZNMA 4O5RA 3IXRA 1K3LA 3I69A 2HSHA 5B6NA 3C1RA 2QKEA 4OWYA 2B1LA 4ML1A 4ECCA 3DIEA 3WGDA 4YQVA 2DJKA 4GTUA 1OYJA 3TDGA 3VWVA 1DE2A 1YKAA 3NZNA 2GSSA 3BCKA 3QMXA 2HRNA 4POMA 5B7CA 4IBPA 2B7KA 2WULA 2VCTA 2PGTA 2AHEA 3G9BA 4GXZA 4GF0A 3GTUA 5IMZA 1RQMA 4XTSA 3UEMA 1TTZA 4EF0A 3ZRDA 2CVBA 2H0IA 3TKQA 1H75A 3QFBC 3EINA 3GYKA 5G30A 2YANA 3HVSA 1ZZYA 1V40A 4RUVA 4ZIJA 3VURA 4XIHA 2V32A 5D93A 1THXA 2CX3A 4XHMA 3HVVA 2GZZA 4NPBA 1A24A 4HJ2A 2RIIA 1Z9HA 1F2EA 2LNTA 1TKDB 1SJ6A 3IE3A 2KOKA 3KXOA 3F3QA 3QD9A 1EGOA 3KD0A 4TN8A 2H76A 1GUHA 2F3MA 3HYPA 1GSFA 3EC3A 3IK9A 2N5BA 4FYUA 3SWLA 2DLXA 4I6XA 1VGLA 1ZMAA 5GAND 4MZCA 2VL3A 2C0GA 2A2SA 20GSA 4IKHA 1JLWA 4ECBA 1EV4A 1PSQA 2RUEA 2MMOA 1EEJA 1YF1A 2ON7A 1CQHA 3APQA 2GQMA 5DCHA 2YWMA 3Q19A 3TOUA 3ZIJA 2R5GA 4P3YB 5LNKe 3DXBA 1TDIA 5F0GA 1K0MA 1G7OA 3K8NA 3ME8A 3E3EA 3J7Yk 1TK5B 2LJAA 3FK8A 1EP8A 6GSWA 2VCVA 1U88A 1T4ZA 2IIYA 4KW6A 1SJZA 1SU9A 2C4JA 5ECHB 2LQQA 1E6BA 3EYTA 3GSSA 4EDZA 2GSRA 2VLUA 2H1DA 3F8UA 3I9V2 2YWNA 3G7IA 3GRXA 2JSZA 2K8VA 2YPMA 2WGRA 4KCAA 2P31A 3M9KA 1PGTA 4V2MA 5D73A 5AISA 4ZBBA 4L5OA 3WT1A 2GGTA 1E2YA 4MH2A 2LUSA 3IAS2 2ALBA 2C0DA 1YZXA 1OE8A 1EV9A 1K0DA 2WJUA 4J2FA 3CTFA 5EL8A 2DSAA 2HLSA 2A4VA 2H01A 4ECIA 1TK8B 4NHZA 2RUFA 1PRXA 3KM6A 5G5FA 3EU4A 4XS1A 3P8WA 2PWJA 1T4YA 1AUCA 1TU8A 2I1UA 1GWCA 5FT3A 2B7JA 3EMXA 3R2QA 3DRNA 2ES7A 1S3AA 3QDNA 3GX8A 2N5AA 3IBHA 3O3TA 2G0FA 4CHSA 2DJ1A 3KP8A 5KN1A 3TCOA 3LJRA 4RQRA 1BAYA 1TU7A 3UL3A 2EIQA 5EPFA 2F51A 3ZFBA 3L9VA 2CA8A 1OE7A 3GKXA 4IS0A 4FYBA 2REMA 1OC9A 3TRXA 3ZL5A 5HR2A 5FWGA 3WGXA 2K8SA 2FCHA 5A4VA 2PUKC 5KN3A 3FRCA 3ZMLA 1NHOA 2OE3A 2H6YA 3TKRA 2PU9C 3F4RA 4IVFA 3HCZA 5IIZA 3DVWA 4RI7A 2M46A 1VF1A 3KTLA 3P7XA 2CZ2A 4KAEA 4OFNA 2B5YA 1WIKA 1RK4A 1W89A 1M9AA 1X5CA 1N2AA 5ENUA 6GSXA 3GTUB 2LSTA 2FA8A 2C80A 2IFQA 5HQPA 4NV5A 4MF6A 4PNFA 1XPVA 2HSYA 4AGSA 5D96A 4K9ZA 4JBBA 14GSA 1K0BA 3WT2A 2V6KA 3CRUA 4TOPA 3IAM2 2HZEA 1XXUA 3HY2A 5CRGA 2YJHA 2HZFA 1GRXA 4IHUA 2IMKA 3MWHA 4HI7A 3VLNA 1XIYA 1GUKA 2L4QA 5IO0A 1O6JA 1V98A 1SKWB 5F06A 3RBTA 2B5EA 1EGRA 2YOIA 1TRWA 5DALB 5J3RA 2O8VB 2IMEA 1S3DA 1YEPA 1J9BA 4PGTA 5L71A 2HFDA 2FY6A 4LMVA 2H8LA 4ZXGA 3N9JA 4D73B 1GSYA 4LL4B 1XWKA 3TB2A 3BOAA 1ON4A 2K6VA 1X9SB 4XS6A 1LBKA 2CAQA 1PL1A 2LJKA 1AXDA 2PERA 2H75A 3CSIA 2VCXA 3MNGA 4KH7A 5ECMB 4OCFA 4TRXA 2H73A 3D0ZA 2XHFA 1AW9A 5INYA 5ECRB 4ZBDA 1MEKA 1G6WA 2GVPA 1A8YA 3D22A 1WJKA 5IMFA 1G7EA 1TI3A 2C0EA 4MDCA 5HR1A 1B9YC 1EWXA 4ZILA 1ZCPA 3EE2A 1GH2A 3NIVA 2XPDA 1B9XC 3ZREA 5JWRB 3ED3A 5JCUA 1A23A 2AJQB 1EZKA 2MZCA 3M3MA 4IW9A 5D9VA 4EE0A 4K0NA 4RI6A 4L0UA 1JFUA 4F0BA 1V58A 4KX4A 3TOTA 1XW6A 3UBKA 2GDRA 1TI1A 12GSA 2O85A 3GKKA 2MMZA 2H70A 3GURA 1V9WA 2PMTA 5HFKA 3RAZA 1MD3A 1PN9A 1FO5A 4DSQA 1OC3A 4IP6A 1K3YA 5ECSA 1OVNA 4I2UA 4LMWA 1YQ1A 2AYTA 4OFMA 2C8UA 2H6XA 1HNCA 2C1YA 5D9TA 3QPMA 5GSSA 1YJ6A 2L6CA 1SK0A 3RHCA 1DUGA 2YNXA 4DVCA 3FZ9A 1PMTA 4HZ4A 4IN0A 4MF5A 1EP7A 3SBCA 4NXIA 2MBSA 5CAXA 2L57A 1FB0A 4HQSA 5HR3A 10GSA 2HNLA 2FLSA 2LQOA 2FUG2 1B4QA 4KSMA 2VAFA 3FYGA 1BX9A 4N0ZA 1MDKA 3CMIA 4XRDA 1GL8A 3IR4A 1T7PB 1KTEA 5ECOB 1XCCA 4N11A 4N10A 4ZL9A 1A2MA 4LA1A 3A2VA 3W8SA 2ON5A 1GNEA 4BL7A 2X8HA 4WR5A 1X5DA 5HR0A 2M80A 1T8EB 1GLPA 1A0RP 2P5RA 2OADA 4OFTA 1F3AA 2VL9A 3GIXA 5AIXA 1NSWA 2H19A 4EC0A 5H5RA 5GZZB 4HQZA 3C73A 4DSSA 5HFGA 2K9FA 3GUSA 5EVOA 3TGZA 3M8NA 4GSSA 4TR3A 17GSA 1K0NA 4POLA 3PH9A 5H5QA 3UVTA 2XC2A 1J08A 2HYXA 2OACA 1WWJA 5FHIA 2L59A 2GS3A 3KTBA 4GCIA 4HDEA 1DBYA 4NHWA 4MP4A 4PQIA 5C00A 3CSHA 4WBJA 2M72A 4ZBAA 2PPTA 1ZL9A 4XS4A 2DC5A 5JWOB 2I9HA 3TJJA 1CQGA 4K7NA 5A5KA 3J7Yb 4WKWA 2N5FA 2YV7A 2JZRA 1U3IA 4I8BA 1ZGNA 3UMAA 5DAKA 1QK8A 4IJIA 2K18A 3TUEA 2CVKA 4OO4A 1G0TA 4RQXA 4YQUA 4WEYA 2IPAA 4GLTA 3ZYWA 5C04A 4F9ZA 1S3CA 4GSNA 2H1AA 3F4TA 4N0VA 5GAPD 2RLIA 1JHBA 2H6ZA 1WRYA 4GQFA 3VPQA 3S9FA 2DBCA 4Q5RA 2C3NA 3HJPA 3Q74A 5G31A 3E9JB 1XZOA 2FHEA 1MD4A 3C8EA 3M0FA 1X9MB 3M1GA 3F3RA 3KCMA 1FVKA 3E0UA 5IMAA 2VCWA 3KH9A 2FNOA 3FEUA 3FHKA 5CYYA 1Z3EA 3EURA 1HNAA 5ID2B 1WP0A 1M2AA 2DJ0A 3IHQA 2E2MA 2LRNA 5LD0A 1HD2A 1R26A 4F2IA 2H71A 1ZOFA 4MH3A 2VUPA 2IMIA 3DVXA 4WETA 5KN0A 3PGTA 5G5EA 4JR4A 3ZFLA 2X64A 3HZ8A 3EVIA 4Q5QA 1M2BA 2VL2A 4AJ6A 5IOXA 2VLVA 3F4SA 2IMFA 3GSTA 3M9JA 3EU3A 3LYPA 4X0XA 5D9WA 2C3QA 1M2DA 3ZLPA 1GP1A 2O87A 4Q5FA 3WYWA 1O7UA 4FIWA 4V1Ap 3O76A 7GSSA 3QAWA 4X1UA 4LLRA 1TOFA 3DMLA 1XBSA 2LEGA 2DJ2A 3IRAA 2XBIA 3U5RE 1GSEA 5J5NA 1USBA 1YY7A 2IWTA 5A4WA 3VI7A 2C0FA 4K7OA 2O89A 1KBNA 3CRTA 1NW2A 4BWQA 4ZB9A 2H72A 3TRQA 3UVHA 4I2TA 4ID0A 2YCDA 2L6DA 3WD6A 3VFIA 3TKSA 4MPGA 3H8QA 4YH2A 4F82A 3KMNA 4F0CA 3ZTLA 4V2LA 2VLTA 2MBTA 4PUFC 4TW5A 4Q5NA 5IMVA 3HVXA 2H1BA 4NV2A 3MSZA 5CNWA 4BPYA 1GSDA 4H86A 5AGYA 3QCPA 4K6XA 3GKNA 3L9SA 1PA3A 1DSBA 1Z6NA 2BJXA 3P90A 1ERVA 3KEBA 5F05A 1N8JA 3LYKA 1WMJA 3ERGA 1TRUA 2H0GA 2VL2C 2KP2A 2VO4A 3LWAA 5ELGA 1F37A 3V1WA 6GSYA 3AY8A 3IPZA 1PQNA 3ZVJD 5J41A 4EKZA 4K1FA 2LJRA 2ZCTA 5IPGA 3Q6OA 2FWEA 2L4CA 4TXOA 4PURA 1O8XA 2IL3A 2VCQA 3IV4A 2DIZA 4G2EA 5JWQB 2PBJA 1MDIA 2X8CA 3H1NA 1GSSA 1YDKA 2L5LA 1FW1A 1FG4A 1SL1B 1GNWA 4WF5A 2CT6A 1HNBA 4K2DA 1IYHA 5AN1A 1Y25A 3H93A 4ECJA 1K0CA 2GSQA 4PNGA 2L5OA 1Y6EA 4CDOA 1K0AA 2BTOT 2DJ3A 1ABAA 1XWGA 2HI7A 3TKSC 2WCIA 1PX7A 1UVZA 2QSIA 4ACSA 1AAZA 1OKTA 4OD7A 2I3YA 4O32A 3CXGA 1QMVA 2JZSA 1ACVA 6GSVA 13GSA 2NBSA 1GTIA 1PX6A 5ECIB 3IDVA 2IJYA 3DGQA 3KZQA 2HE3A 1VF2A 3KGKA 1B8XA 4PX1A 2I81A 4NWYA 3ERFA 5KN2A 3FR9A 3ZIVA 2I4AA 4L5LA 2YJ7A 4TR1A 1JZOA 2FD3A 2LV3A 2YZUA 3DEXA 4ZB6A 4OCEA 4FO5A 5ECLB 3F9UA 1AC1A 1R7HA 4MJEA 2R37A 4L8EA 4GSTA 5D8IA 4PQ1A 1PD21 2FA4A 1C72A 2V1MA 4MZBA 1FB6A 1WOUA 3HHVA 2VOCA 3TKSE 2B6MA 2CQ9A 4PUAA 3LSZA 1AQXA 1QUWA 3GA4A 19GSA 1GTUA 4QQ7A 1XWCA 4LL1B 2OBIA 2MMAA 3FR6A 1U87A 5GSTA 4NMUA 1SKSB 3UJ1A 4FH8A 1SENA 2LNSA 1KEBA 1ST9A 4O92A 2J9HA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2B5XA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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