2B7JA

Crystal structure of yeast sco1 with copper bound
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
172
structure length
158
Chain Sequence
GKPSLGGPFHLEDMYGNEFTEKNLLGKFSIIYFGFSNCPDICPDELDKLGLWLNTLSSKYGITLQPLFITCDPARDSPAVLKEYLSDFHPSILGLTGTFDEVKNACKKYRVYVDHSIFFYLMDPEGQFVDALGRNYDEKTGVDKIVEHVKSYVPAEQR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of yeast Sco1.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SCO1 protein
molecule tags Metal binding protein
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 46
structure length 158
sequence length 172
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-10-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02630 SCO1-SenC SCO1/SenC
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2b7jA00
2OBKA 2LUSA 3F8UA 2DMMA 3CYNA 2CVBA 2OBIA 4KSMA 2CAIA 3ZITA 3KD0A 5FT3A 5D73A 2AJQB 5J5NA 3ED3A 1SKWB 2AHEA 20GSA 1JLVA 1X5CA 4L5LA 3VPTA 4OFMA 3D21A 2HRNA 1QMVA 2MMZA 1DSBA 2F8FA 4G10A 4TRXA 3WGXA 2B7KA 1ZYQB 4PQ1A 4XS1A 3TUEA 3UEMA 4XCSA 3HZ8A 1NW2A 3LFLA 1TOFA 1K0NA 3QFBC 1ST9A 1XPVA 3PINA 5GAPD 2H19A 3LQ7A 4HZ2A 3U6VA 2RIIA 5EY6A 4X1UA 3J7Yk 3ZVJA 4KGIA 1AQVA 1JLWA 5G1LA 1AUCA 2MBSA 3FR6A 6GSUA 1U6TA 1PL1A 3ZRDA 3M0FA 3LYPA 2YJ7A 1OC9B 1Y25A 4JRRA 1VF2A 3ME7A 1H75A 1PX7A 4KDYA 1XWBA 3CRUA 2HZEA 5IO2A 1YY7A 1J9BA 4DEJA 3EURA 1XWKA 3UARA 1SJ6A 3A5WA 1AW9A 3IPZA 4RI7A 5E59A 4DSRA 3C71A 5L71A 2IJYA 3IBHA 1AIUA 2DJ2A 1O81A 5DALA 1RK4A 5F8BA 5B8BA 2YN1A 3ZMKA 2H8LA 3HA9A 3U5RE 1A8LA 2M72A 5G31A 2L6DA 2G0FA 2XHFA 1A0RP 4FIWA 1I9DA 3GSSA 2IN3A 2NVLA 4NMUA 4GWRA 2IMKA 4XS6A 4D73B 1WWJA 3D6IA 3IC4A 2OE3A 2LTKA 4PX1A 2F51A 2XBIA 3RPPA 4FO5A 5IM9A 3L9UA 2V6OA 4L0UA 4EDZA 1BX9A 4ZL7A 3FZ9A 3CSJA 4EO3A 3L4NA 3APQA 1TU8A 2H01A 2QGVA 1Z7RA 1ACVA 2ZUPA 1TJDA 2HSHA 3ZIVA 3ZVJD 1RW1A 1GLQA 3QFAC 2AV4A 4HS1A 2V1MA 1YZXA 4KCEA 5ENUA 1M0UA 1OYJA 2WJUA 7GSSA 4HQSA 2H0GA 1SK1A 18GSA 5GSTA 4KAEA 2FD3A 3C1RA 2NBSA 1VGLA 3RHCA 2C3TA 5CRGA 2GZPA 2R4VA 3HVXA 1PRXA 1XCCA 5ELAA 3VURA 4I5QA 4ZIJA 5DCHA 1GRXA 1O6JA 2X64A 3KH7A 2H1AA 4KX4A 1ZL9A 3ME8A 3P90A 4WF5A 5KN2A 1TK8B 2PU9C 4MK3A 4TXVA 4X43A 5J9BA 3JCML 2C0FA 4MF6A 1A2JA 2L4QA 5CRWA 1GTIA 1PD21 3GKKA 5J41A 2VLUA 1XIYA 4FYCA 1GTAA 2GTUA 3KEBA 4MJAA 3TKPA 1ERUA 1U3AA 4TXOB 3QMXA 3IRAA 5JWOB 5B6NA 5HFGA 3SBCA 2L57A 1F2EA 2QC7A 2JZRA 2H6ZA 1GWCA 4DVCA 4ML6A 2OKAA 1IYHA 3DVXA 3GL3A 1AC1A 1TI1A 1HNCA 1PN9A 1TKDB 2C4JA 2JACA 2XC2A 2OACA 6GSWA 2RLIA 4HDEA 3F4SA 2GQLA 3NOFA 4XHMA 3HXSA 2X99A 3GHAA 1M2AA 4GQCA 5GAND 4ID0A 4KB3A 5DAKB 4FYUA 2AUVA 2FLSA 1W4VA 4JU5A 4X0XA 2A4VA 3C73A 4XIHA 4BPYA 2JZSA 5IMCA 3ZIJA 2VCVA 3ZTLA 3UIWA 1USBA 1A2LA 1MEKA 1EGOA 1YEPA 4AF2A 1NM3A 4POBA 2L59A 4JZQA 19GSA 2VL2C 3CSIA 2YANA 2QSIA 5D9TA 3DD3A 4GRFA 4GXZA 3RHBA 1TRUA 2K8SA 5ECSA 1Y6EA 1EOGA 1KBNA 2M80A 2P0GA 1OC3A 1TTZA 1H4OA 4BVYA 1YEXA 3TOUA 4QQ7A 3KTBA 2V2GA 2TIRA 4RI6A 4MH3A 2C3NA 1FHEA 1M9AA 4KDUA 3WD6A 5ECIB 3US3A 4E8EA 2L4CA 2H70A 4F82A 3UAPA 1GSEA 2IMEA 1SL1B 5ECNB 3EC3A 3TKSA 1FG4A 2B6MA 3TKQA 4K0NA 4EVMA 1K3OA 2K18A 5CRDA 2K8VA 5G30A 3IAS2 1O7UA 1BYEA 2O89A 1T7PB 1BQ7A 3W8SA 2R2JA 5JCWA 1K0DA 2VM2A 2YV7A 2HE3A 5AN1A 1XWGA 5KN1A 2GS3A 3A2XA 2I9HA 3S9FA 1GULA 3H4KA 2XBQA 1JZOA 2FWHA 4HJMA 5CRHA 2EC4A 1ABAA 4N0VA 3M8NA 3IE3A 2WGRA 3TKSE 2P5QA 3TCOA 1BJXA 3RDWA 5D96A 16GSA 3GKNA 4QL7A 3CRTA 5C00A 2IMFA 3KP8A 2BMXA 2N5AA 3F63A 2VO4A 3LWAA 2GQMA 2CV4A 4PGTA 2H1GA 4N11A 1SKSB 2CZ3A 5IO0A 4PNFA 2R6KA 5ELGA 3CMIA 5FWGA 1WRYA 2NDOA 4D73A 2VM1A 5IOWA 3LJRA 5HFKA 2L5LA 3DKSA 2MMNA 2H75A 2JSYA 3TKRA 5INYA 1QK8A 1XW5A 1FO5A 2WB9A 3HZ4A 5HR1A 3GFKA 2LQQA 1J0FA 1EEJA 2YNXA 1GH2A 4XRDA 2VOCA 4YH2A 1X5EA 2B3SA 1X9SB 1KNGA 1TW9A 4EL1A 5A4VA 2RM6A 1FOVA 3M1GA 5AISA 5HQPA 3CTFA 4LMWA 2LKUA 1DE2A 5G2ZA 2VCWA 2IMDA 2J9HA 3A2VA 3ZFBA 5CYYA 1VF4A 2DJ1A 1MDJA 1EP7A 1FW1A 1URMA 3VWUA 1T1VA 5HFIA 2LJAA 3L78A 5CO3A 2CZ2A 2VAFA 1K0BA 2E7PA 3RPNA 4K7NA 2FA8A 3TJJA 2PMTA 1TP9A 2VIMA 5B7CA 3ERGA 2MBTA 4TW5A 1PA3A 1PSQA 1YQ1A 5J9CA 3HJOA 2ZNMA 2ZCTA 1T3BA 1V9WA 4XS4A 3M9KA 1R5PA 3M3MA 4DSSA 1WJKA 2KLXA 2GT6A 1G6YA 3QD9A 1M9BA 2JADA 1FVJA 2V6KA 1ZCPA 4CW9A 6GSTA 1LBKA 5ECOB 4GSNA 1E2YA 4K7IA 5D8IA 4PUAA 4NXIA 1B48A 3EVIA 3KXOA 1U88A 1S3AA 3FZ5A 1BEDA 2IIYA 4F03A 1THOA 1EWXA 3FZAA 4NV5A 4AJ7A 1XZOA 3F3RA 2VD1A 5LCZA 2DJ0A 3PGTA 1F9MA 4KA0A 5DAKA 4V1Ap 3HVSA 3MAKA 4HJ2A 2WDUA 3PH9A 4AJ8A 3VI7A 1SYXA 2ON5A 4MA9A 3KCMA 1HQOA 1UC7A 2REMA 2X8CA 4KCAA 3EYTA 6GSXA 1GUKA 4AJ6A 4CHSA 1PKZA 2C8UA 2A2SA 4JR4A 3IXRA 2GVPA 4GSTA 2IFQA 3DVWA 1X9MB 2H6XA 1O8WA 1CQGA 14GSA 4BA7A 1SL0B 1Z5YE 4WBRD 2V32A 2WRTA 3V1WA 3FR3A 5AGYA 1MTCA 3D4MA 3KZQA 4ZBDA 4BWQA 3R2QA 4HOJA 1WPIA 1ILOA 1AQXA 1G6WA 2DJJA 1B8XA 3ZYWA 2HYXA 4BVXA 4KDXA 4K1FA 4HU7A 2H71A 3F0IA 4F0BA 1YDKA 2EIOA 3UJ1A 2H0HA 4MCUA 2VLVA 2MZCA 2M46A 1OKTA 22GSA 4N10A 3PR8A 4IQ1A 1LU4A 2VCQA 4ZB9A 2JL4A 1DUGA 2ALBA 4EC0A 2CA8A 1X9WB 2YZUA 5G1KA 4F0CA 3KM6A 3QPMA 2KOKA 4ACSA 2C0GA 2B5EA 4IHUA 4OFTA 3ZFLA 3HYPA 5A5KA 1XW9A 2DBCA 3F9UA 2PN8A 4MZBA 2I3YA 4O5RA 3GX8A 3C7MA 2AYTA 4MZWA 2FNOA 2MMAA 1XBSA 1B9YC 2YJHA 5HR0A 3G7JA 3DGQA 1DE1A 6GSSA 3DXBA 2VCTA 3FY7A 10GSA 3LGCA 2HLSA 2GZYA 4IVFA 1PL2A 3FHKA 2AAWA 3LYKA 2WFCA 4MZCA 5IOXA 2LJKA 4JR6A 4OCFA 1F37A 2CVDA 3KTLA 5IIZA 3TKSC 3GTUA 5DQSA 5B8AA 2IL3A 4ISDA 4I97A 3P8WA 1G0TA 1TRVA 1VRSD 3CTGA 3H1NA 3GNJA 4ZL8A 4V1Ag 3D22A 1K0MA 4K8MA 1SD9A 4YQVA 4ML1A 3BCIA 4NV2A 4RQRA 1N2AA 5CREA 5HR3A 4AGSA 4K6XA 2O7KA 2XPDA 4EKZA 1OAZA 1KEBA 2FWGA 2PVOC 1SL2B 2H1BA 3N9JA 5ECPB 2IPAA 4EUYA 1A0FA 2GSSA 4E8HA 2YWMA 4G19A 3Q6OA 4LMVA 3GH9A 1A24A 2R37A 3WGEA 3UBLA 2RM5A 1GSYA 5F06A 2N5BA 3UMAA 1F3AA 4GLTA 1Z6NA 1RQMA 3FYGA 2I1UA 4IQAA 3MNGA 1GSDA 3ZLPA 3QAGA 1OVNA 2IWTA 3VFIA 5IPGA 11GSA 5JCGA 4ECJA 4Q5FA 2DLXA 5ECRB 1X5DA 4I2UA 4HUAA 1UN2A 2DJ3A 3TGZA 1T4YA 3NZNA 3QOUA 3D5JA 1OKDA 1YKCA 3G7YA 3O6TA 1T8EB 3KIJA 3IK7A 4IBPA 4OMVA 2GGTA 1XOBA 1ML6A 4YQMA 2EIQA 4JEDA 5AIVA 2BTOT 1GSUA 2FY6A 2HZEB 1WE0A 3EMXA 4WETA 4Q5QA 2MYGA 1B4PA 4EE0A 4O32A 4Q5NA 1GTUA 4ULXA 5ECLB 3J7Yb 2F3MA 2CAQA 1XOAA 3ERFA 1HNBA 3G9BA 1PKWA 4FH8A 1XVQA 4LL4B 1R5AA 2DMLA 2OJLA 2L5OA 3EINA 4IKHA 4CDOA 4MLYA 3QDNA 5IQYA 1OC9A 2VCZA 4MPGA 2YPMA 1CQHA 1GTBA 3GKMA 3GV1A 3LORA 4V2NA 1SU9A 1R7HA 1MDKA 3LXZA 5GZZB 1TRWA 1ZZYA 4EXJA 4WR5A 2DC5A 3TDGA 1K3YA 2YV9A 3CXGA 4N0ZA 3HKRA 2X8GA 4J56E 2VL3A 1FAAA 2C0DA 3P7XA 2CX3A 1SJZA 2B1LA 2HI7A 2PWJA 5G5FA 2J23A 4MJEA 3KH9A 4KNDA 3GMFA 4WKWA 1ON4A 3UVTA 2YWOA 3EMPA 1ZOFA 2H0IA 3LEFA 1PX6A 2OE1A 3EU4A 3TJFA 1ERTA 2LRTA 3KP9A 3VWWA 1MDIA 1EV4A 2HZFA 4PQIA 1V40A 4TN8A 2DJKA 2IMIA 2C3QA 3HD5A 3QCPA 4WBJA 2LRCA 3OR5A 3BBYA 2YWIA 5KEJA 4MJBA 5D9VA 5B6MA 4POLA 1HD2A 3EU3A 2DIZA 4G2EA 3F4TA 1DBYA 1WMJA 2AB6A 4IGJA 2DSAA 5COHA 1GSSA 2YOIA 4V2MA 4MDCA 3TOTA 3KMNA 1T4ZA 2HT9A 3TB2A 3MWHA 4EF0A 3EWLA 5ECMB 2B5YA 1J08A 4JBBA 2JZTA 3A3TA 1ZMAA 2VD0A 1QXHA 1YKAA 5C04A 1ZYEA 1MD4A 4H86A 1O8XA 1XFLA 1ERVA 2C0EA 1QGVA 2GLRA 3TJBA 3VPQA 4ZXGA 5ID2B 3H79A 3AY8A 5D9WA 4WEYA 5DJLA 3E0UA 3N5OA 2PERA 5LD0A 4MP4A 4ECIA 3Q19A 4TR3A 3HCZA 1TDIA 4NPBA 3WT1A 2KP2A 4LL1B 3DWVA 3APOA 4KUNA 1G7EA 1OC8A 4ZILA 2VL9A 1PGTA 4PQHA 3UOMA 2TRCP 2BJXA 1TU7A 1AAZA 1VF3A 3GYKA 6GSYA 1NHOA 4XTSA 4TKYA 2JU5A 3BOAA 2LS5A 3L0HA 2KHPA 8GSSA 3NIVA 2R5GA 4TXOA 4DSQA 1E6BA 2H6YA 5ECQB 1HYUA 4KW6A 1R4WA 3SWLA 5JCUA 3I9V2 1SK2A 2E2GA 1B4QA 4HI7A 3W6GA 2O87A 3ZREA 5GSSA 4K0GA 1XWAA 1HNAA 2P5RA 2I81A 3E3EA 3VK9A 4GTUA 3FR9A 2V41A 4MABA 2RUEA 1SJIA 1NHYA 3FZ4A 3BCKA 2E0QA 2OE0A 1EGRA 5IMZA 5A4WA 3LXTA 1ZGNA 2L6CA 5F05A 4J57E 4I6XA 1A8YA 5KN3A 4RQXA 3QR6A 2RUFA 3TRPA 3ISOA 3GIXA 3VWVA 1VF1A 1Z7PA 2FWEA 4ILFA 3FKFA 1M2DA 1Z9HA 3C8EA 3I43A 4OCEA 1GSQA 9GSSA 3HHVA 13GSA 4OWYA 1OE7A 4WR4A 3LG6A 3KJYA 2G2QA 4PURA 1GNEA 3HY2A 4V2LA 3VWXA 2F8AA 3IHQA 3IDVA 2FHEA 1M99A 3UBKA 1Z6MA 4TR1B 1TK5B 4NWYA 3WYWA 3D4TA 3DRNA 1C72A 2A2RA 4I2TA 2JSZA 4RUVA 2K9FA 3HJPA 5IMDA 2TRXA 4ZL9A 2NTOA 4I8BA 2WCIA 2ON7A 4IP6A 3DMLA 3GH6A 4K2DA 3Q18A 5D9XA 4NAXA 5DQYA 4K7OA 3GUSA 4OD7A 3ZZXA 2WULA 5DCGA 3IAM2 5D93A 4IN0A 3H8QA 4ZB6A 1XVWA 4ZBAA 2GSTA 5KN0A 1R26A 4ZB8A 1EZKA 2GT5A 2GQKA 3F6FA 3GL5A 2K6VA 5H5SA 3TJGA 4IP1A 4ZBBA 1M2BA 2YZHA 1F3BA 2B1KA 2LEGA 6GSVA 1JHBA 5F0GA 1XWCA 2LSTA 2VCXA 3VI5A 2VLTA 4K9ZA 2CVKA 2LJRA 3F6DA 3VLNA 4ECCA 3RAZA 2YP6A 3BD2A 5J3RA 1XW6A 4F9ZA 2N5FA 5ECHB 1Q4JA 1AQWA 17GSA 4N30A 3H93A 4EDYA 1F6MC 5AIXA 3HVVA 1V2AA 4YAPA 1PQNA 2MMOA 3CBUA 1U3IA 3UL3A 1W89A 1YJ6A 3GKXA 1SKRB 2XPEA 1QFNA 1UVZA 2FA4A 2F9SA 2PGTA 1QQ2A 2WZ9A 1X0RA 2R3XA 5ABRA 2H1DA 2QKEA 2CT6A 1UA5A 3GSTA 2D2ZA 3TJKA 5EL8A 1EV9A 4BWSA 4PNGA 2GDRA 2WS2A 3ERWA 2C80A 4LLRA 1EEMA 4TVEA 4MPFA 3FRCA 5CNWA 2B5XA 3DIEA 1QUWA 1GP1A 4Z7XA 4POMA 1V58A 3F4RA 4POKA 1FB6A 3MDKA 5JWQB 4XS4B 2I4AA 4GCIA 3KMOA 1K3LA 4DSSB 4HQZA 5ID2A 2H30A 3I6AA 1SK0A 3ZMLA 5JWRB 2DIYA 1Q98A 3TRXA 5CAXA 3LSZA 1JZWA 4IJ3A 1TXXA 2PBJA 1EP8A 3WT2A 4PXOA 4TR4A 1JFUA 4MF5A 1YF1A 2P31A 4YQUA 4IW9A 1KTEA 4PUFC 4O7HA 5H5RA 3FEUA 1NSWA 3P2AA 4QL9A 3TRQA 5LNKe 2H73A 4TOPA 4GSSA 1TRSA 3G7IA 2FCHA 1THXA 3CSHA 3O76A 1G7OA 2HNLA 3RBTA 1WOUA 1FB0A 1GSFA 5EPFA 3A2WA 4F2IA 4KH7A 4Q5RA 2YWNA 2IFQB 2HSYA 1WIKA 1M7TA 1GLPA 1LJRA 3IR4A 1T00A 5A4UA 1WP0A 5DVBA 4WXTA 1O85A 5DALB 2OA7A 4YAVA 2YCDA 3I69A 5ECKB 2FGXA 1A2MA 4OFNA 5FHIA 5H5QA 2H66A 2KP1A 1AXDA 1JZDA 1SYRA 4HZ4A 3M9JA 4IJIA 4NHZA 3C1SA 2KUCA 5F07A 1XXUA 2GSRA 2HRFA 1BG5A 5HR2A 4IS0A 2EIRA 1V98A 4FYBA 4HEA2 4O92A 5IMVA 3GA4A 4OO4A 2NPBA 2GSQA 2PPTA 3D0ZA 2E2MA 2LV3A 4BL7A 4TR1A 5IPHA 3F3QA 2FUG2 3GRXA 3FW2A 3EE2A 4L8EA 3APSA 3W8JA 1S3DA 5G5EA 3IK9A 3BJ5A 3O3TA 3QAWA 4GQFA 3QAVA 1K0OA 4GF0A 4TR0A 2B7JA 4WF4A 3HDCA 4L5OA 3UVHA 4MF7A 4P3YB 2O85A 3IV4A 4MJCA 5DDLA 3E9JB 1YF0A 2LRNA 3GN3A 1GUHA 5J4UA 1EOHA 1O73A 1SD8A 3HJMA 5DJMA 5IMAA 3ZL5A 4HU9A 4IELA 1TI3A 1GNWA 2PVQA 4ECBA 1Z3EA 2LNSA 2PUKC 5CP1A 2CQ9A 4KSOA 1GUMA 5EVOA 1GL8A 1V57A 4OO5A 2CX4A 2ES7A 2H76A 3GURA 1K0AA 1BAYA 3GTUB 3L9SA 1IYIA 3K8NA 12GSA 1N8JA 2Z9SA 4MH2A 1JZRA 1S3CA 4LA1A 4NHWA 1OE8A 5IMFA 2VL2A 1U87A 1MD3A 3Q74A 3KGKA 4KE3A 1PMTA 2LNTA 4JE1A 2H74A 1FVKA 1TK0B 3WGDA 2VUPA 5E4WA 3DYRA 2O8VB 2FWFA 2OADA 4L0WA 3IA1A 2C1YA 1A23A 2X8HA 1I5GA 3FK8A 4XRAA 3GX0A 5DBQA 4G9HA 3IOSA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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