2B7KA

Crystal structure of yeast sco1
Total Genus 46

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
169
structure length
155
Chain Sequence
GKPSLGGPFHLEDMYGNEFTEKNLLGKFSIIYFGFSNCPDICPDELDKLGLWLNTLSSKYGITLQPLFITCDPARDSPAVLKEYLSDFHPSILGLTGTFDEVKNACKKYRVLVDHSIFFYLMDPEGQFVDALGRNYDEKTGVDKIVEHVKSYVPA

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
3H1 (131-134)EMPTYAH1 (151-170)TI1 (123-126)TII1 (134-137)TIV1 (148-151)O1 (113-115)S1 (120-123)S2 (128-130)S3 (139-144)TI2 (145-148)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Metal binding protein
source organism Saccharomyces cerevisiae
publication title Crystal structure of yeast Sco1.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SCO1 protein
total genus 46
structure length 155
sequence length 169
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-10-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02630 SCO1-SenC SCO1/SenC
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2b7kA00
2JSYA 3F63A 5J9BA 3EURA 1O8XA 3HJMA 2L57A 2I81A 1S3DA 2DJ3A 2C3QA 5D9TA 3HZ8A 1TRWA 1GSUA 1FW1A 2KP1A 1HNAA 2YZHA 2VCZA 2OA7A 5CYYA 3MNGA 3FYGA 2LKUA 1UVZA 3CSJA 1TKDB 1GSFA 2NPBA 2B7KA 2GZZA 4LLRA 3VPQA 4O32A 1FVKA 3C1RA 1Z6NA 3TJBA 3QFBC 2ZUPA 3KP9A 1I5GA 3F3QA 5IM9A 1SYXA 3P90A 4MMMA 2H1DA 4PNFA 1EOGA 1JZRA 1URMA 3MSZA 1XW9A 3LYKA 4YH2A 5JWRB 1J08A 2GS3A 2JZRA 2L6DA 4DEJA 1SD9A 1HQOA 1GSQA 2CX4A 4JZQA 5H5QA 1ZCPA 2CVKA 4WEYA 4IW9A 3F6DA 1A0FA 4ZBDA 2HRFA 3VFIA 5B6MA 5EVOA 1RW1A 1FG4A 2HZEA 3HKRA 4YQVA 3P8WA 4AF2A 2VM2A 5C04A 2GQLA 2PVQA 1RK4A 1PX7A 1V2AA 2ALBA 4X1UA 1A24A 5B8BA 2HI7A 2YWNA 1SK2A 4XCSA 1BJXA 4KA0A 5FWGA 2H1BA 2H72A 4PQIA 1X0RA 3GKXA 2GGTA 1ZL9A 2KUCA 6GSYA 5DQSA 2LRCA 2H6ZA 3FZ4A 3TJGA 2FHEA 2K18A 5IOXA 4TW5A 4Q5QA 1TXXA 4K7IA 1HD2A 1EWXA 1N8JA 5IPHA 5H5RA 4OMVA 3UVHA 4RQRA 2DBCA 2GVPA 3S9FA 4KCAA 4MH2A 3DD3A 3UBLA 3GMFA 3TKQA 1GSDA 3LEFA 2PUKC 4IQ1A 4BVYA 1B48A 4KW6A 2LUSA 1TRVA 1OVNA 1TK8B 5HFKA 5GAND 5CRGA 2L5OA 17GSA 1TOFA 3IXRA 5EPFA 1NSWA 1WP0A 3GKKA 3VPTA 3LSZA 1EP7A 1KEBA 2IJYA 4HQZA 1OC9A 5C00A 5ID2A 3GH9A 5GAPD 2J9HA 3IC4A 2H1GA 3KH9A 4AJ6A 3ME7A 4IBPA 5IIZA 1M2BA 4YQMA 5A4UA 2AAWA 3Q74A 5DAKB 4TKYA 4D73B 1AQWA 1WWJA 5J3RA 2F8AA 13GSA 4BWSA 2H71A 3RHCA 5E59A 3ZMLA 5L71A 2RIIA 3PINA 2DIZA 1EZKA 5AGYA 5COHA 5A5KA 5AN1A 1WJKA 1Q98A 3GYKA 4DSSA 2B5EA 2M80A 2K8VA 4MP4A 2VCWA 4ECIA 4ZL9A 1K0CA 4CHSA 3GX0A 2B1KA 5H5SA 3F4RA 5KN2A 2CX3A 3GHAA 1IYIA 3RPNA 1DE2A 1EGRA 2V2GA 4F9ZA 3GX8A 2H70A 4JBBA 3FHKA 3J7Yk 1G6YA 2RM6A 3CBUA 4QQ7A 2GSSA 2C3NA 3G7YA 3US3A 3C73A 1K3YA 1SJIA 2CVBA 5INYA 4LL4B 2R6KA 6GSSA 4NV2A 5B6NA 1ZZYA 1B9YC 4F0BA 1UA5A 5F06A 2R37A 1XW6A 3RDWA 3HD5A 5J9CA 3CMIA 4KSOA 2IWTA 4TXOA 3E3EA 4HU9A 2LRNA 2P5QA 4OFTA 3GTUA 5DCGA 1ZYEA 3TKSA 1G6WA 1XVQA 4AGSA 3W6GA 2VM1A 1THOA 1G7EA 2YN1A 1YF1A 4LA1A 5JWOB 1KBNA 1PX6A 1GRXA 1FHEA 5ECKB 1SYRA 2YJ7A 3ZVJA 3GIXA 7GSSA 4YAPA 4PNGA 4KGIA 1G0TA 4V1Ap 3UVTA 3W8JA 2VCXA 4TVEA 3O3TA 1YJ6A 5IQYA 1HYUA 3I9V2 3A2WA 4ZBBA 4WF5A 1F2EA 1Y6EA 3FKFA 3SWLA 1X9MB 2CT6A 3HYPA 4MLYA 4EKZA 2KOKA 5ECIB 4POKA 2H30A 1QUWA 1BG5A 3ERWA 1LBKA 5JCUA 2VL3A 1Z6MA 4EE0A 2BMXA 5GSSA 4BL7A 3IR4A 4PXOA 1XXUA 1A2MA 2M72A 6GSVA 5HQPA 2MBSA 2K9FA 1M0UA 3BCKA 5G2ZA 4IJIA 1Z3EA 4J56E 2WJUA 3G7IA 1QGVA 4JR6A 1U6TA 4TRXA 3C7MA 2WFCA 5KN0A 3N9JA 2C0EA 1ABAA 3WT2A 4RI6A 4PQ1A 2OKAA 1QXHA 2X8GA 3APOA 3ZLPA 4I97A 4PUAA 1K3LA 1MTCA 4XRDA 1EV9A 1NM3A 2HSYA 1R26A 5CREA 1WPIA 1GSSA 4IJ3A 3TKSE 3ZRDA 2V32A 3D22A 4GXZA 5IMFA 4DVCA 4BA7A 3MAKA 2XPDA 4TN8A 4F2IA 1XBSA 2ON5A 3GNJA 2O8VB 2WDUA 1ZOFA 4HJ2A 4WBRD 3C1SA 5KN3A 2I9HA 3L9UA 1V58A 1SL0B 2ON7A 4PQHA 1T3BA 4NXIA 1NHYA 1SL1B 3LJRA 3GV1A 4MH3A 2LQOA 1QQ2A 5DALA 2CQ9A 1SENA 3DIEA 4MZBA 4MPGA 5ENUA 5JCGA 10GSA 3LQ7A 1TU8A 3L9VA 2YPMA 4K8MA 6GSUA 2XHFA 1XWCA 3TKSC 3DKSA 1XOAA 3IA1A 3RPPA 3ED3A 3WGDA 1MD3A 3H8QA 5CRWA 3D0ZA 3DWVA 1GH2A 2R2JA 2JACA 3QFAC 1WE0A 3IRAA 2DJ0A 3TJFA 2WRTA 3IAM2 2PVOC 1XWKA 1JZDA 1ST9A 1EEJA 3TKRA 3QDNA 5FT3A 20GSA 2FWHA 1PRXA 3KIJA 4L5OA 1A23A 1K0AA 3L78A 2ES7A 1FOVA 4ACSA 4JRRA 3Q18A 4OFNA 4BPYA 2DMLA 4IKHA 2PN8A 2HYXA 4OWYA 5ECSA 2VCQA 1THXA 2GSTA 2PMTA 2OADA 3D5JA 4HZ4A 2C0FA 4G9HA 5HFGA 1W4VA 4GCIA 4RI7A 3TB2A 2B7JA 22GSA 2RM5A 2H0IA 4MJAA 3I6AA 4MF7A 2HE3A 2IMDA 3GSSA 4GLTA 2F3MA 2EIQA 2BJXA 1T7PB 1GUHA 4KX4A 3GA4A 2NDOA 4G19A 4JEDA 2IFQB 2P0GA 4JU5A 1WMJA 2AUVA 2XBQA 1R7HA 3C8EA 2CZ2A 1F6MC 4GRFA 1T4ZA 4QL7A 3A2VA 4L0UA 5J4UA 1K0MA 1GLPA 4TR1B 4POLA 4BWQA 1J0FA 1YEXA 2GT6A 2EIOA 2MBTA 5ELGA 3VURA 1R5AA 3ZZXA 1U87A 3LYPA 4FH8A 5G31A 4K0GA 2GTUA 5G5EA 2D2ZA 5CRDA 4HEA2 1GWCA 1KTEA 1AC1A 3GN3A 1EP8A 3EU4A 5GZZB 1QK8A 1O7UA 5EL8A 1MDJA 4P3YB 2A2SA 3UJ1A 5HFIA 3ZIVA 1OC8A 1DUGA 1ACVA 2YJHA 3ERFA 4K7NA 4ML6A 4XS1A 4QL9A 4L8EA 1W89A 1E2YA 2VLUA 2GSQA 4GSTA 2NTOA 1T8EB 2TIRA 3FEUA 4K7OA 3ZFLA 2PERA 5HR1A 1OKDA 3G7JA 5CO3A 4O7HA 4AJ7A 1AW9A 2YANA 4EO3A 5IPGA 1ERUA 1GSYA 4G2EA 4F0CA 5E4WA 1YKCA 3EYTA 2I3YA 5IO2A 1Q4JA 4MDCA 2WS2A 4MF5A 4F82A 3ZITA 2N5BA 4TR4A 3M1GA 3WYWA 2B5YA 2LRTA 3CSIA 3P7XA 1SD8A 2OE3A 4J2FA 3HJOA 3WGEA 1OE8A 2LQQA 2G2QA 4EF0A 3CTGA 4ULXA 3IK9A 4LMWA 4XRAA 3BCIA 4IP6A 1O8WA 4OO5A 1LU4A 1GLQA 5F0GA 1TRSA 1S3CA 11GSA 3HHVA 3CXGA 3TCOA 1BYEA 4IS0A 3RBTA 1SK1A 4NHZA 1PD21 4LMVA 3OR5A 4RUVA 4XS4B 3F4SA 1AIUA 4L5LA 2YWMA 2GT5A 4EDZA 5J41A 4O5RA 4K2DA 5D9WA 1AQXA 3BD2A 4ECJA 2GSRA 4WR4A 1TTZA 3TUEA 9GSSA 3EWLA 3FR3A 4K1FA 2LS5A 3F3RA 2R3XA 3F0IA 2LJAA 3GSTA 4NHWA 2R5GA 5G30A 2FGXA 2FLSA 3GKMA 3QPMA 4IQAA 2XPEA 4HUAA 3CTFA 3PH9A 5AIXA 3BJ5A 4XS6A 1USBA 4PX1A 3F8UA 2C0DA 5ECPB 1V57A 1O81A 3I43A 3KJYA 3FRCA 3HXSA 3U5RE 2GQMA 1T00A 5HR0A 5DBQA 1B4QA 4N10A 4HU7A 2H8LA 2HZFA 3AY8A 3VWUA 2AYTA 3RHBA 1Y25A 5DJLA 3VK9A 4IELA 5JCWA 3TRXA 1TDIA 2DJ2A 1MD4A 4GSSA 1YQ1A 3WGXA 4GSNA 2A2RA 1ZMAA 1SKWB 1VF1A 1T4YA 3M3MA 3GURA 1U88A 3ZMKA 2OACA 5IMAA 4X0XA 2H76A 3IAS2 3EMPA 1RQMA 5DAKA 4D73A 3VI7A 3IPZA 4RQXA 3TDGA 3LXZA 4IN0A 4NWYA 2C0GA 3CRUA 4FIWA 2GDRA 4O92A 1B9XC 4MF6A 1B8XA 3H93A 4POBA 5ECNB 4MCUA 1G7OA 1AXDA 4KUNA 3TGZA 3EU3A 4IGJA 3ZIJA 5ECHB 2G0FA 2FD3A 5LNKe 1PL2A 1M99A 4G10A 1YZXA 1K0BA 3DYRA 4WXTA 4WR5A 3HVXA 2GQKA 4WF4A 2VUPA 4IHUA 1E6BA 3DMLA 3NIVA 2C1YA 4ID0A 3UL3A 5G5FA 3ZYWA 5F8BA 19GSA 1IYHA 1SKRB 1GP1A 1PN9A 1A2JA 4EUYA 1MDKA 1FAAA 4NPBA 1GNEA 2VLVA 2JZSA 1TW9A 1F3AA 5LD0A 2O89A 1N2AA 2IPAA 2H0GA 2CZ3A 2HNLA 3KEBA 2VCTA 3TRQA 2YOIA 3Q6OA 1J9BA 4DSQA 1GUKA 1PGTA 3NZNA 2FWEA 1Z7PA 14GSA 5ECLB 4ZBAA 1EEMA 1WIKA 1AQVA 3O6TA 1AUCA 2H19A 2A4VA 3TJJA 5ECMB 1K3OA 4WBJA 2WCIA 1V9WA 2HT9A 5ECOB 4CW9A 1XCCA 1XWGA 4GTUA 2L5LA 4ZB8A 1S3AA 3ZTLA 1V98A 3D21A 2IL3A 2VL9A 2FWGA 2JZTA 3IOSA 4Q5NA 2NBSA 2YV7A 4K9ZA 1PMTA 5DQYA 4POMA 2V6KA 4CDOA 2DIYA 4E8HA 3DXBA 5CRHA 1YDKA 2PGTA 1ERVA 3UOMA 1MEKA 2PPTA 4I2TA 3KTLA 2HLSA 1XWBA 3HJPA 2MYGA 3F9UA 5D96A 4MPFA 2VD0A 2H01A 2GZPA 4V1Ag 1A0RP 5B8AA 1JZWA 1PQNA 4FYBA 4ZB9A 4J57E 2WGRA 1V40A 2CAIA 5IMZA 2MMAA 5HR2A 5IO0A 5A4VA 2ZNMA 2H73A 2L4QA 1SKSB 5IMCA 1M7TA 1I9DA 1ERTA 4KDXA 3LXTA 1C72A 4I2UA 2PBJA 5F05A 3ZVJD 2H1AA 2VO4A 2HZEB 3ME8A 3F4TA 4HQSA 2LV3A 1XOBA 2CAQA 3PR8A 4GQFA 1H75A 3TRPA 3UBKA 4X43A 1M9BA 4MJCA 2H6XA 4EL1A 4OO4A 2H74A 2YNXA 3EC3A 5CAXA 3IE3A 1R5PA 3VI5A 3IV4A 1ZGNA 1X9WB 2OBIA 3ZFBA 2V41A 3ZREA 3FZ5A 1JLWA 1OAZA 4OD7A 5J5NA 2VD1A 2HSHA 4KDUA 6GSTA 3CSHA 3L9SA 12GSA 2FNOA 3UMAA 2VCVA 4EC0A 3TOUA 3H1NA 5KEJA 2YCDA 1JHBA 1F37A 5JWQB 3CRTA 4MJEA 4ZB6A 4N11A 3QAGA 5IMVA 4N0ZA 2P31A 2I4AA 3DEXA 4KH7A 2PWJA 1M9AA 8GSSA 2RLIA 5DDLA 3QD9A 2HFDA 4F03A 2MZCA 4EVMA 4ISDA 3FK8A 2IN3A 3QAVA 4OCFA 1OC9B 3QCPA 3UAPA 5ID2B 2B3SA 3DRNA 4MZWA 2GLRA 4NAXA 2WULA 2X99A 3E0UA 2PU9C 3IBHA 1TRUA 3CYNA 3M0FA 3BBYA 1O73A 2AHEA 1YF0A 2CV4A 2E2MA 3HCZA 4LL1B 1O6JA 2VOCA 3LGCA 2F51A 4ECCA 1M2DA 2AJQB 1X5CA 1K0DA 2FUG2 2IMKA 2LSTA 2KP2A 1OE7A 4IP1A 3KCMA 2KHPA 4DSSB 1FO5A 3IDVA 1GNWA 1BQ7A 5DCHA 2MMNA 3ZL5A 1PA3A 1U3IA 3N5OA 4K0NA 2FA4A 3NOFA 2VL2A 1U3AA 5F07A 2KLXA 5D9XA 1GTUA 3F6FA 2E0QA 1XFLA 1VF2A 2LNTA 2DSAA 1M2AA 1SL2B 4E8EA 1KNGA 2DLXA 4FYUA 4HZ2A 3LWAA 2N5AA 5G1KA 1Z9HA 3GUSA 4ML1A 4TXVA 4PUFC 2BTOT 1H4OA 3SBCA 4IVFA 4EXJA 2YWIA 4L0WA 2VLTA 1ERWA 3QOUA 1CQGA 2ZCTA 16GSA 2LTKA 3LG6A 2GZYA 2RUEA 2M46A 4GQCA 3DVXA 3KXOA 2VAFA 1A2LA 5KN1A 5DVBA 1NHOA 1TP9A 3TOTA 2IFQA 3E9JB 3DVWA 4TXOB 3APQA 4OCEA 5DJMA 3GTUB 3MDKA 3KP8A 4N0VA 1ZYQB 4ZL8A 3A3TA 4V2LA 3VWWA 4TR1A 3APSA 2JADA 1O85A 2H66A 2IMFA 3EVIA 3HVVA 3M9KA 1K0NA 3KGKA 1GTIA 4K6XA 1JZOA 3GKNA 3UEMA 3M8NA 1YY7A 4Z7XA 1SU9A 1DBYA 1XZOA 3LFLA 3FZ9A 4KCEA 5ELAA 5CNWA 2H0HA 2DJ1A 2DJKA 2FA8A 1X5DA 3C71A 3GL5A 3TKPA 3I69A 2E7PA 1OKTA 2X64A 2YV9A 2OJLA 3IHQA 4MK3A 2AB6A 3K8NA 1CQHA 2OE0A 3KH7A 2L6CA 2QC7A 4I5QA 3D4TA 2AV4A 3QAWA 2XBIA 1SK0A 3KTBA 2QKEA 3H4KA 6GSWA 4I8BA 4WKWA 3J7Yb 3VWXA 2FWFA 1PL1A 5IMDA 2HRNA 2I1UA 4TR0A 1DSBA 1XPVA 3TJKA 2K8SA 4GF0A 2V1MA 5AIVA 2WZ9A 1BX9A 4HOJA 2L4CA 3A2XA 3KMNA 2QSIA 3A5WA 1X5EA 3FR6A 2JU5A 3KM6A 1JLVA 1BAYA 1R4WA 5B7CA 4PURA 1AAZA 3L4NA 2H75A 2CA8A 4ZL7A 2C3TA 2IIYA 4PGTA 4YAVA 1ON4A 3W8SA 1QMVA 1K0OA 2DJJA 2YP6A 2CVDA 1X9SB 1HNBA 4HJMA 3UIWA 1FB6A 1OC3A 3HA9A 4KAEA 4XS4A 4NMUA 2LJKA 3GH6A 2TRCP 2F8FA 2V6OA 2VL2C 3V1WA 1WOUA 4KE3A 2H6YA 2F9SA 4V2MA 4KDYA 3QMXA 1PSQA 4HS1A 5CP1A 4MZCA 2J23A 3L0HA 1XVWA 2HXKA 3PGTA 4MA9A 2REMA 5G1LA 1T1VA 2P5RA 3G9BA 4MABA 1A8YA 3BOAA 5IOWA 5EY6A 3WT1A 5HR3A 1QFNA 5D73A 2N5FA 2C4JA 5ECRB 1TI3A 1GL8A 5DALB 3KMOA 3EE2A 4XTSA 5AISA 1Z5YE 1B4PA 5ECQB 3KZQA 2OBKA 4H86A 5D8IA 4BVXA 4YQUA 2C80A 3GL3A 3VLNA 1VRSD 3JCML 2IMIA 3HDCA 2EC4A 2MMOA 3R2QA 3HVSA 4KB3A 1TU7A 2QGVA 1GULA 4KNDA 4ILFA 2E2GA 2IMEA 2MMZA 2OE1A 1A8LA 18GSA 1TI1A 3FW2A 4JE1A 2LJRA 2C8UA 2VIMA 1SJ6A 1EOHA 3WD6A 3P2AA 3QR6A 3LORA 4JR4A 1Z7RA 1ILOA 2FY6A 4Q5RA 2K6VA 1XW5A 4KSMA 3HY2A 1UN2A 1WRYA 3M9JA 1VGLA 1GTBA 2B5XA 5ABRA 2EIRA 1YEPA 4XIHA 4AJ8A 2NVLA 1UC7A 3Q19A 5D93A 1JFUA 4Q5FA 5GSTA 3U6VA 2R4VA 1XIYA 2B6MA 3RAZA 2YWOA 3KD0A 2RUFA 1MDIA 1F3BA 2LNSA 2JSZA 1TK5B 1PKWA 4N30A 4ZXGA 1VF3A 1HNCA 2X8HA 4XHMA 1ML6A 1YKAA 4ZIJA 1SJZA 3ERGA 3HZ4A 2TRXA 5FHIA 5LCZA 1FVJA 2O87A 1VF4A 2O85A 4TR3A 4WETA 1NW2A 3ISOA 4OFMA 6GSXA 4DSRA 4FO5A 5A4WA 4HDEA 4V2NA 3FZAA 3D6IA 1GSEA 4NV5A 5D9VA 2JL4A 4GWRA 1F9MA 1PKZA 1OYJA 3GRXA 3FY7A 2DMMA 1EV4A 3UARA 3EMXA 1TK0B 2LEGA 3H79A 2L59A 1XWAA 4ECBA 4FYCA 2FCHA 3D4MA 2WB9A 1FB0A 1EGOA 3GFKA 3MWHA 1BEDA 4I6XA 4ZILA 4EDYA 2X8CA 2O7KA 2B1LA 1TJDA 1LJRA 3FR9A 2XC2A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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