2B7KA

Crystal structure of yeast sco1
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
169
structure length
155
Chain Sequence
GKPSLGGPFHLEDMYGNEFTEKNLLGKFSIIYFGFSNCPDICPDELDKLGLWLNTLSSKYGITLQPLFITCDPARDSPAVLKEYLSDFHPSILGLTGTFDEVKNACKKYRVLVDHSIFFYLMDPEGQFVDALGRNYDEKTGVDKIVEHVKSYVPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of yeast Sco1.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SCO1 protein
molecule tags Metal binding protein
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 46
structure length 155
sequence length 169
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-10-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02630 SCO1-SenC SCO1/SenC
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2b7kA00
3GX8A 2HFDA 2WZ9A 2WCIA 1H75A 2P31A 2VCTA 1HYUA 1ABAA 2PGTA 3KMNA 3O76A 1M2DA 2C3TA 2EIOA 2CVBA 4IKHA 4XRAA 2LUSA 4EDZA 4MJEA 5ENUA 2NVLA 2BTOT 2H8LA 1PD21 1UA5A 3GH9A 4LA1A 1XWGA 2YCDA 3WD6A 4KA0A 2WRTA 3GH6A 1ZMAA 5IMAA 4ZILA 2N5FA 3GSTA 1WWJA 2VL9A 4GWRA 4G9HA 2H6XA 2LJAA 2IMFA 3FZAA 4MP4A 4HQSA 2PBJA 3QAVA 5AIXA 1K3YA 11GSA 2CA8A 1IYHA 1MD4A 2TRXA 5KN2A 1M0UA 2IIYA 5CNWA 4F0BA 4IHUA 5H5SA 1PA3A 3ERFA 3EWLA 2HZFA 2V1MA 3UOMA 2RIIA 1F6MC 1U87A 2QKEA 1GSQA 5CREA 3ZFLA 6GSVA 2C0EA 2C80A 2C0DA 4Z7XA 5DALA 4K0GA 2LQQA 4OFTA 2FA8A 5H5QA 1J9BA 4ULXA 1THOA 1EV4A 3LWAA 4IELA 4MZWA 4MLYA 2MMAA 2YJ7A 2C3QA 2YV7A 3EINA 1VF2A 1SL1B 4TW5A 1QK8A 2PERA 1SJZA 4KH7A 1K3LA 3RPPA 2B3SA 3CRTA 1T3BA 1XW6A 2F8FA 1XVWA 1GSDA 2L4CA 4IJ3A 1Z3EA 1T8EB 2H19A 4ZL9A 1V2AA 3ZITA 3N9JA 2YWOA 1GULA 1G7EA 2R6KA 4XHMA 1SD9A 5A4VA 5IO0A 1GH2A 1MTCA 3DIEA 2X8HA 3FZ5A 3IA1A 3UBLA 5DALB 4ZXGA 3J7Yk 19GSA 1Q4JA 3IV4A 4PQHA 3LSZA 3SWLA 2H6YA 3M9KA 5B6MA 3D4TA 2VCZA 2IN3A 2IWTA 5JWOB 3VWVA 3F0IA 1Q98A 2F9SA 1R5PA 3CBUA 4JRRA 3H1NA 5G2ZA 4V2MA 3LXTA 1TXXA 1SL0B 1K0CA 5COHA 1KEBA 3KD0A 4I2TA 4ZB6A 4Q5RA 1GTAA 4RQXA 4PNFA 1K0AA 2IL3A 4WR4A 1A2LA 4N0VA 4FO5A 2D2ZA 2MYGA 5D73A 4IQ1A 4O92A 1X5CA 5DDLA 2VD1A 3FW2A 2YNXA 5E4WA 3ZVJD 3IHQA 3QFBC 1C72A 1K0OA 2FNOA 2YPMA 6GSWA 1JZOA 4NPBA 2C3NA 4L5OA 3KP9A 3GURA 1B48A 4LL4B 2IMEA 4WR5A 3BOAA 3GUSA 2C0FA 3TKPA 1PL2A 1K3OA 3F3RA 4Q5FA 1TU7A 5J9CA 17GSA 3APOA 4GLTA 2HE3A 4JR4A 5J41A 1EOHA 1YKCA 2HZEA 3QPMA 2M46A 5IMCA 4XS1A 3P8WA 1N2AA 5IIZA 1FB0A 4WBJA 5G30A 1ERWA 1XXUA 1USBA 2KP1A 3HKRA 1YQ1A 4NAXA 4L5LA 1OC8A 1SK0A 4TXOA 5IOWA 4HEA2 1G0TA 2OE3A 3UVHA 2GQMA 2L4QA 1ON4A 2VUPA 2B6MA 4V1Ap 4EE0A 2YZUA 1R26A 2H6ZA 1U88A 1GSSA 4KDXA 2L57A 1O81A 4MMMA 5DAKA 3IDVA 3KM6A 2F51A 1AQVA 1ST9A 5F06A 2K8SA 2RM5A 3G7JA 1WE0A 2HZEB 3TOTA 1V58A 4BVXA 4IBPA 3DVWA 4K7IA 1X5DA 2KOKA 5L71A 2L59A 1O8WA 2YV9A 3VPQA 4BWQA 4EO3A 4OO5A 2WS2A 2GLRA 5AN1A 2PMTA 4TXOB 3TCOA 1U3AA 5FT3A 5AIVA 3UL3A 3GTUA 1OKTA 2JZTA 3D4MA 2DC5A 3CSJA 3UVTA 2HLSA 5IO2A 2LJKA 4RUVA 5DAKB 1AC1A 1X0RA 1V40A 3C8EA 4TOPA 1ERUA 4XS6A 4ECJA 4NV5A 3VURA 4J56E 4D73A 2ON5A 5INYA 2VL3A 3P90A 2HYXA 1SKSB 1BX9A 3V1WA 3EU3A 5DJMA 4NXIA 5IMVA 3Q74A 3U5RE 1EZKA 2A2RA 1PQNA 1B9XC 1O6JA 3GTUB 1JFUA 4KDYA 5IQYA 3UMAA 3UJ1A 1HD2A 5JWRB 1GLPA 3ZVJA 1YY7A 2LS5A 4KX4A 3EMPA 5HQPA 2K6VA 2WULA 2VCVA 2H30A 4CDOA 1WRYA 2CT6A 4TKYA 4GSNA 3BJ5A 3GKXA 4D73B 4HQZA 3GMFA 2IMDA 5C00A 1F9MA 4WEYA 3TGZA 5B8AA 1JLVA 4POMA 3A2VA 5ECLB 4ZL8A 3WGXA 3ZZXA 1MDIA 4DVCA 2V6KA 3GA4A 3TOUA 5ECPB 3FY7A 4ZB9A 4ZIJA 2PVQA 2O7KA 1F37A 2VM2A 3HHVA 3HVVA 3K8NA 3UBKA 3QAGA 3HZ8A 1FAAA 3VWWA 3IXRA 3PH9A 5JCWA 3KTLA 2FWEA 1SKRB 1K0DA 4F0CA 2HRFA 4IGJA 2LV3A 1DE1A 3BD2A 5HR1A 5JCUA 4KNDA 2B1LA 3UEMA 1EOGA 1ZL9A 1SJIA 4KCAA 4CW9A 2MMNA 4K6XA 2DJJA 4EL1A 5D9TA 2EC4A 3UARA 1GSEA 2K8VA 2VO4A 2DJ0A 4J2FA 3F3QA 4DSQA 2LKUA 3TKSC 6GSUA 1MDJA 5B7CA 3TJKA 4BPYA 2H66A 2PUKC 3M1GA 3WT2A 2YP6A 1EGRA 4OWYA 3ZIJA 3JCML 2GZZA 3KXOA 3KH7A 2XBIA 1SYRA 10GSA 3KCMA 2BJXA 1A2MA 1WMJA 2B5XA 2PPTA 3QOUA 5EVOA 3LEFA 2DBCA 2H0IA 2LEGA 3ZFBA 3ZMKA 2IPAA 5G5FA 1SK2A 3M0FA 14GSA 2AAWA 3A2WA 5KN3A 4FYCA 5A4WA 2GSTA 4K0NA 3HDCA 3VLNA 4KSMA 2YWIA 2GSSA 1BEDA 5CRHA 3WYWA 2YWNA 3CTFA 3F9UA 2O87A 1BQ7A 4PGTA 2VCXA 3QAWA 5LCZA 4F2IA 3FR3A 2J23A 4TR1B 2AV4A 1EEMA 4ACSA 2WGRA 1RW1A 2F3MA 2OE0A 3I6AA 4GQCA 4EKZA 2OADA 3CYNA 3LFLA 2XPEA 3W8JA 2R3XA 1QQ2A 1YZXA 3FEUA 2LSTA 1Z7RA 2CVKA 4MABA 4K8MA 1MDKA 5A5KA 4AF2A 2DJ1A 4TN8A 2PVOC 1YF0A 3HJMA 2VLTA 4HJ2A 3UAPA 4G19A 5KN1A 2MMZA 2H73A 3FR9A 4F9ZA 4POKA 1TI3A 4ECCA 2FWGA 4MDCA 1TRVA 4OD7A 3TDGA 1YEXA 1JHBA 2CV4A 1XWCA 1GSUA 1R5AA 4POBA 1F3BA 1FVJA 4ZBAA 5IPHA 3D22A 3F4TA 5B6NA 4E8HA 3IE3A 2MZCA 1PGTA 1TDIA 4MZCA 3GKMA 4PUAA 3APSA 3U6VA 1B4PA 3FKFA 2WB9A 1V57A 2KHPA 5ECOB 2EIQA 2K18A 1A8LA 2P5RA 4K2DA 4TRXA 4I5QA 2FWHA 2ON7A 2LJRA 1AW9A 3LORA 4Q5NA 5D93A 3HD5A 3GL5A 1TK5B 3RHCA 2YZHA 1J08A 3APQA 1HNBA 3DD3A 3KEBA 5GSTA 3G9BA 2VL2C 4F82A 4ZL7A 2C4JA 3L9VA 4MPGA 3F6DA 2O89A 2H71A 2LNTA 3W8SA 4LMVA 3GV1A 1HNAA 4L8EA 1O85A 4QQ7A 1NW2A 3EVIA 4TR3A 2LRTA 1M9BA 4YQMA 1XWBA 4MCUA 1O7UA 2L6CA 1BYEA 4YAVA 2VM1A 1GL8A 3CXGA 3O3TA 3VI7A 4ZB8A 3TRXA 5F8BA 5IMDA 3ZYWA 1CQGA 3QD9A 4ID0A 1UC7A 5DQSA 3ZRDA 1F3AA 2CAIA 3DWVA 1A8YA 3F6FA 2YANA 4GXZA 1FO5A 2LRNA 4GRFA 1ILOA 3UIWA 5IOXA 4X0XA 5IPGA 5FHIA 4KDUA 4BVYA 4TVEA 5CAXA 4JBBA 2IMIA 4EUYA 1GSFA 1PKWA 4KGIA 4BWSA 5J5NA 4IP6A 3RDWA 3TJBA 5HR2A 2H1BA 2LTKA 3ZMLA 1X5EA 1VF1A 2FHEA 3NIVA 1THXA 3US3A 5B8BA 3C73A 4BA7A 1XIYA 2QC7A 3LXZA 2GT5A 1V9WA 4OMVA 3VI5A 1DE2A 4G10A 2NPBA 5D9VA 4TXVA 2XHFA 1PSQA 2C1YA 1KNGA 3PGTA 3GIXA 3MWHA 4K1FA 2VAFA 2ALBA 2VL2A 1QUWA 4NMUA 4IQAA 2FLSA 3ZIVA 4AJ7A 3QCPA 4WETA 1M2BA 2P0GA 1J0FA 5F05A 4AGSA 3QFAC 3M9JA 2PN8A 4I97A 2JACA 1T7PB 4IVFA 4NWYA 1ZYEA 1I9DA 4N10A 1B8XA 3GFKA 3TUEA 2H0HA 2E2MA 1AIUA 1A2JA 4POLA 4K7OA 3E3EA 3F4RA 3KGKA 12GSA 2OACA 3GX0A 3GKKA 4PURA 2ZCTA 2CZ3A 5HR3A 2DIYA 3I69A 1TK8B 5D96A 1GTBA 4GSTA 3MDKA 3VWUA 1XW5A 4L0WA 2I1UA 2YOIA 2HSYA 4QL9A 2B5EA 3HXSA 2I3YA 3E9JB 2FGXA 4H86A 3IBHA 2WDUA 1FOVA 5GAND 2IMKA 3P2AA 1WP0A 1S3AA 1IYIA 3CRUA 5D9WA 3D6IA 4MF6A 1NHOA 3HJOA 2VLVA 2B7KA 4WF5A 3F8UA 2R37A 5CRDA 4P3YB 2B5YA 2V41A 4HI7A 4IN0A 1E6BA 3DYRA 2HSHA 2LNSA 3DEXA 3FK8A 3BCKA 1WJKA 2GTUA 1OC9A 2YWMA 3EMXA 4XRDA 3BBYA 1PMTA 4JU5A 1R4WA 4RI7A 2OE1A 1PX7A 1A23A 4ZBBA 1B9YC 3LGCA 2QSIA 2L5LA 3RHBA 5DJLA 2H72A 5DCGA 5CYYA 2JADA 2XC2A 1R7HA 3IAS2 5D9XA 4WXTA 4XCSA 1G7OA 2KLXA 1GP1A 4DSRA 5FWGA 2H74A 1Z6NA 5J3RA 1GWCA 3E0UA 1XVQA 2RM6A 1YJ6A 1XFLA 3KZQA 1FVKA 1XBSA 22GSA 3VK9A 5ABRA 1KTEA 1OC9B 3ZREA 1JZWA 2I9HA 4GTUA 1GNEA 4GQFA 3ERWA 5E59A 4LL1B 4PQIA 4RI6A 1TK0B 3KH9A 1I5GA 1YEPA 3AY8A 3PINA 4MJCA 2H1GA 1DUGA 2CAQA 5LD0A 3SBCA 4ILFA 4KAEA 1EEJA 1XWKA 1M7TA 4MZBA 6GSTA 3CSIA 2QGVA 1TU8A 2FY6A 1EGOA 3L78A 2DMLA 5J9BA 2AJQB 2FA4A 3ZLPA 1K0MA 4KUNA 3LYKA 1JZRA 2H0GA 2GSRA 1Y6EA 3GKNA 1FW1A 4KE3A 4NV2A 5CRWA 4QL7A 5EL8A 1RK4A 4JEDA 4OFNA 4EVMA 1XPVA 1FB6A 5HFGA 3S9FA 1SJ6A 1QMVA 3IOSA 3W6GA 4I6XA 1OVNA 4TR1A 1UVZA 4X43A 5CO3A 3TJJA 1FG4A 3MNGA 1Y25A 2WFCA 3ERGA 2CX4A 4MF7A 2GGTA 5D8IA 5GSSA 5G31A 3F63A 2B7JA 4HU7A 3L9UA 4MJAA 2OJLA 3HVSA 5DBQA 4HS1A 3FRCA 2H76A 5F0GA 4PUFC 3ZL5A 2TIRA 1VF3A 4EF0A 2A2SA 3H79A 5EPFA 2CVDA 3RPNA 1JLWA 3WT1A 3EC3A 2EIRA 2IJYA 5ECIB 1S3DA 2X64A 4ML6A 1O73A 1DSBA 2BMXA 4NHZA 1JZDA 1WIKA 4HOJA 5ECQB 2H1AA 4OFMA 1PKZA 3GL3A 2H75A 6GSSA 2HXKA 6GSYA 5ECSA 4EXJA 5JWQB 1SL2B 2JSYA 3FYGA 5HFIA 1SENA 1ML6A 1OYJA 2C0GA 1EP7A 5AGYA 5F07A 1BJXA 4LMWA 3LG6A 3DRNA 2H01A 4DEJA 3H4KA 3IAM2 1T1VA 1N8JA 2KUCA 3IK7A 4TR0A 1A24A 2R2JA 3TJGA 2NTOA 18GSA 16GSA 2F8AA 4L0UA 2DJKA 5ELGA 1VRSD 1H4OA 3TKSA 1GUMA 2L5OA 2ZNMA 3TKRA 4PXOA 3GNJA 4OO4A 2G2QA 4HU9A 1HQOA 2HT9A 3HY2A 4KCEA 1TP9A 4IS0A 2OBIA 2H1DA 2VD0A 2ES7A 2O85A 2GQKA 2GT6A 4HDEA 3L9SA 2VCQA 2RLIA 3ZTLA 1AAZA 1U3IA 4O7HA 2OKAA 3A2XA 2KP2A 5GZZB 5ECMB 1W4VA 1ZYQB 2DJ2A 2MMOA 3EE2A 5ECHB 1EWXA 3M8NA 2O8VB 4O5RA 4PNGA 1GUKA 1CQHA 3KP8A 2RUEA 1XZOA 3LQ7A 4MJBA 2ZUPA 1TTZA 5H5RA 2GS3A 3VWXA 3PR8A 3QR6A 1LJRA 3M3MA 2JL4A 4RQRA 3G7IA 4MF5A 2XBQA 3Q6OA 2P5QA 1Z6MA 3DXBA 4K7NA 1NSWA 3H93A 2DIZA 1RQMA 4MH2A 4JZQA 1EP8A 3KMOA 5CRGA 1AQXA 2DJ3A 3EYTA 3KTBA 1XCCA 4ZBDA 5LNKe 2JZRA 2M72A 3KJYA 4FH8A 2FWFA 1S3CA 4X1UA 2OA7A 2VOCA 1HNCA 5KN0A 1URMA 4I8BA 2YN1A 3I9V2 3NZNA 1Z9HA 2VLUA 4N0ZA 4TR4A 1T4YA 1PRXA 2DMMA 3J7Yb 3I43A 4JE1A 3Q19A 1SK1A 2G0FA 5G5EA 1BG5A 2V32A 1XWAA 5A4UA 1ACVA 4ISDA 3FZ4A 2GDRA 3O6TA 3G7YA 3HA9A 4O32A 4FIWA 4MPFA 3LYPA 3IC4A 2X99A 1MEKA 4ML1A 4V2LA 3C1RA 5HFKA 4XIHA 4DSSA 3C7MA 2AHEA 2AUVA 3CTGA 5ELAA 1K0BA 1WPIA 2GZPA 2Z9SA 3IK9A 1GRXA 4GCIA 4YQVA 2N5AA 2I4AA 4EDYA 2FD3A 4AJ8A 5HR0A 3GSSA 3MAKA 2XPDA 1XW9A 3TKQA 2GVPA 4I2UA 5CP1A 4MH3A 5G1KA 1UN2A 4ECIA 3HJPA 4HUAA 4HZ2A 5GAPD 1GTIA 2FCHA 3Q18A 1YDKA 3D21A 4Q5QA 3EU4A 2I81A 3IRAA 2VIMA 2LRCA 2NBSA 3RBTA 3EURA 1ERTA 4J57E 4GF0A 1M9AA 2X8CA 4DSSB 1Z5YE 1U6TA 3QMXA 2K9FA 2REMA 2NDOA 5C04A 1OKDA 1TRSA 1SYXA 2X8GA 2B1KA 4V2NA 3TKSE 1TRWA 1PN9A 1ZZYA 1SKWB 1SU9A 3HCZA 4PQ1A 2GSQA 3L4NA 4E8EA 4XS4A 2H70A 2R5GA 1M2AA 4HJMA 2HI7A 3ME8A 2DLXA 3MSZA 3WGDA 3DVXA 4WKWA 1TRUA 2YJHA 1G6YA 1ERVA 2VCWA 2V2GA 2FUG2 3DGQA 5ECKB 2WJUA 2JSZA 1T4ZA 3VFIA 1GTUA 5EY6A 2N5BA 1AQWA 4HZ4A 1XOBA 4EC0A 5J4UA 3TRPA 3VPTA 3ME7A 1M99A 3FHKA 1OC3A 5DVBA 4N30A 2DSAA 1TW9A 2AB6A 1GLQA 2CQ9A 4KW6A 5ID2A 3FZ9A 1AUCA 4G2EA 4XS4B 1MD3A 2M80A 1O8XA 4JR6A 3P7XA 1NHYA 4KSOA 1OE7A 3LJRA 2GQLA 5G1LA 4F03A 1ZOFA 2IFQA 2GZYA 13GSA 1PL1A 4OCEA 1YKAA 3GN3A 1WOUA 5AISA 3BCIA 1ZCPA 3A5WA 2PWJA 1GUHA 1YF1A 1BAYA 1NM3A 3CMIA 3HZ4A 2PU9C 3D5JA 4YAPA 1FHEA 5IMFA 5IM9A 5ECNB 4CHSA 3TRQA 8GSSA 3GRXA 3CSHA 2JU5A 5DQYA 1VF4A 2HRNA 5ID2B 1Z7PA 2R4VA 9GSSA 1SD8A 4IW9A 3R2QA 1B4QA 5JCGA 1E2YA 2IFQB 1OAZA 2JZSA 1TJDA 3TJFA 3TB2A 1QGVA 3GHAA 4FYBA 2TRCP 2V6OA 3OR5A 4WF4A 5ECRB 2CX3A 1LU4A 2AYTA 3ISOA 4LLRA 2A4VA 4MA9A 1VGLA 3DKSA 2E0QA 3RAZA 1X9SB 2E7PA 3C71A 1XOAA 4IJIA 3L0HA 1W89A 2J9HA 2MBTA 1OE8A 6GSXA 3N5OA 1AXDA 3ED3A 1DBYA 3HVXA 5DCHA 4V1Ag 1G6WA 4PX1A 1TI1A 2CZ2A 2L6DA 1QXHA 3NOFA 1QFNA 5IMZA 4NHWA 1TKDB 3C1SA 4IP1A 1EV9A 4YQUA 4KB3A 5KEJA 4GSSA 4XTSA 1KBNA 2RUFA 2LQOA 1A0FA 4YH2A 2OBKA 2HNLA 20GSA 3QDNA 2MBSA 4BL7A 1K0NA 3DMLA 4FYUA 3WGEA 1F2EA 1T00A 3GYKA 3F4SA 4ECBA 4K9ZA 4N11A 1GSYA 3KIJA 1X9WB 1GNWA 1ZGNA 3H8QA 1TOFA 1PX6A 3IR4A 2C8UA 3FR6A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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