2B7KA

Crystal structure of yeast sco1
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
169
structure length
155
Chain Sequence
GKPSLGGPFHLEDMYGNEFTEKNLLGKFSIIYFGFSNCPDICPDELDKLGLWLNTLSSKYGITLQPLFITCDPARDSPAVLKEYLSDFHPSILGLTGTFDEVKNACKKYRVLVDHSIFFYLMDPEGQFVDALGRNYDEKTGVDKIVEHVKSYVPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of yeast Sco1.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SCO1 protein
molecule tags Metal binding protein
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 46
structure length 155
sequence length 169
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-10-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02630 SCO1-SenC SCO1/SenC
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2b7kA00
3FKFA 5EVOA 3CXGA 3UL3A 2H6ZA 1GLQA 4MF5A 5DBQA 5D93A 3L0HA 4GLTA 2H6YA 2IWTA 5EL8A 1SJ6A 4FYCA 1CQGA 2F9SA 3CRUA 4DVCA 4EUYA 4L8EA 1TTZA 2BTOT 1A24A 3GX0A 3KH7A 5ECPB 2MMAA 3G7IA 3FR6A 3ZIJA 2B1LA 3U5RE 1EWXA 2V1MA 3F63A 1O85A 3ERFA 4KCAA 5B7CA 1C72A 4ZBAA 1TP9A 1N8JA 2B5YA 3DIEA 4FIWA 2FY6A 1CQHA 3A2WA 2LJKA 4WR4A 2G0FA 5D9VA 2IMEA 1XWGA 3HA9A 2LRCA 3MWHA 1FOVA 1X9SB 3BCKA 2N5BA 4WETA 2B6MA 4TKYA 4HOJA 1OKTA 5HR2A 3IV4A 4MLYA 4WBJA 3P2AA 1Z3EA 3GL5A 1XCCA 2H19A 1R4WA 1XZOA 3ZRDA 3VFIA 2E7PA 2YWMA 4DSRA 4KSOA 2GZZA 3KD0A 2LV3A 4J57E 1UA5A 4O5RA 3MDKA 4ZILA 4KE3A 3GKMA 4IN0A 3J7Yk 5ELAA 3GHAA 4CHSA 1QMVA 5ID2B 4GSTA 3GH9A 1GH2A 2IIYA 1RQMA 3P90A 4FH8A 2RUEA 4L5LA 2OA7A 4JE1A 5DJMA 1USBA 4Z7XA 4F9ZA 1Z6MA 4JU5A 2OE1A 3VLNA 4GWRA 2VOCA 4GQCA 2R2JA 1THOA 4ECCA 1PKWA 3HJPA 3WD6A 4N10A 5IO0A 1Z9HA 2B3SA 1A8LA 2H30A 4ACSA 1O6JA 1F2EA 2CX3A 4NV5A 2TRXA 2GGTA 1EOGA 3A5WA 1PD21 4N0ZA 1DE1A 2PWJA 1PGTA 4XHMA 3LQ7A 4LA1A 2JSZA 1PN9A 3EYTA 4EE0A 3C71A 2JSYA 4HZ4A 5L71A 3M0FA 2DLXA 2JZRA 2B7JA 4TVEA 1B48A 1TXXA 2YV9A 2VL2C 2IFQA 3UOMA 9GSSA 3CTFA 22GSA 1ACVA 1F37A 1LU4A 3TKRA 4MA9A 3ZVJA 3DWVA 5ECNB 1U3AA 4LMWA 4MP4A 4K7NA 5IO2A 1M2AA 5H5SA 3BBYA 5J9BA 3L4NA 3P7XA 4IS0A 3UEMA 2L57A 1EV4A 2L6CA 2AUVA 1TOFA 5HQPA 4PUFC 1M0UA 2GSTA 5ECSA 1SK0A 6GSUA 5KN0A 3IK7A 3TJJA 1GTBA 1K0OA 2G2QA 3APSA 2OBIA 2LQOA 4AJ6A 3LORA 1WWJA 3GKNA 5IOXA 1BQ7A 3IBHA 5H5RA 5LCZA 1GTIA 5ELGA 2HSHA 1A0RP 5CRGA 2O87A 3GNJA 3ED3A 2HLSA 3IPZA 3LJRA 4G19A 4LLRA 1N2AA 1QFNA 2FWEA 1YJ6A 4DSSB 2JZSA 4IHUA 2YZUA 5JWQB 2PUKC 2P31A 3E0UA 2GQLA 5IIZA 1M99A 1QQ2A 3GKXA 1EZKA 4MZBA 1A23A 3TRXA 2K9FA 3KTBA 1EEJA 2JL4A 4ML1A 5HFKA 3K8NA 2M72A 4MCUA 5CO3A 3U6VA 5LNKe 3VI7A 2CA8A 3ISOA 4XS4A 1H4OA 2OACA 1PRXA 3CMIA 4OWYA 2FHEA 3C7MA 3LYPA 5FHIA 4MH3A 2V2GA 2KUCA 1QGVA 1MDIA 1RW1A 4K0GA 3F4SA 4MZCA 4PNGA 3QFAC 5CRHA 1FW1A 3GUSA 2E0QA 1BYEA 1GNEA 2CVDA 5JCGA 2MMNA 3WGEA 2DJKA 3F3RA 4BVXA 4QL7A 3Q74A 4V2NA 4Q5RA 2MYGA 5F8BA 2H1AA 3WT2A 5INYA 1EEMA 3IAM2 4HQZA 5A4VA 3H8QA 3M8NA 4XTSA 2I1UA 5COHA 2H72A 3ZLPA 1YF0A 2PERA 5DAKA 2R3XA 4EDYA 3KIJA 5JWOB 2VL3A 1TI3A 1B4QA 2HRFA 1TI1A 1WMJA 2KP2A 2PU9C 5ECRB 5GSTA 5H5QA 5D73A 1A2MA 4KAEA 3WGXA 2N5FA 2WZ9A 2RIIA 3ZVJD 4AF2A 4WKWA 4ML6A 4F82A 2NDOA 1Z7PA 4GXZA 5ABRA 4EVMA 4ECIA 2YV7A 2F3MA 2IMDA 2MMZA 3QCPA 2B1KA 4TOPA 4RI7A 4HI7A 1GULA 4OFNA 1GP1A 2N5AA 5AGYA 3EMPA 4IVFA 1T7PB 3G7JA 4ID0A 2DSAA 3IOSA 5A4UA 3G7YA 12GSA 4X43A 4RQXA 4WXTA 3F4RA 1GSYA 5DQSA 3HXSA 4YQUA 5J3RA 5ECOB 4AJ7A 2L4CA 1PA3A 5KN2A 1UC7A 2FUG2 2VAFA 1AQWA 4KNDA 2GTUA 2LSTA 2HZFA 3LXZA 2DJ3A 2GLRA 1VRSD 3DYRA 3Q19A 1OC9A 4XRAA 2H74A 2RUFA 1JLVA 3TJFA 3RDWA 3IRAA 3O3TA 1VF4A 4KCEA 2IN3A 3HZ4A 1AXDA 3KGKA 1HYUA 2JACA 1ML6A 1S3DA 1EOHA 3UBKA 4Q5QA 2IJYA 2WULA 1U88A 1B8XA 4NHWA 1EGOA 2E2MA 2LNSA 1IYIA 2XPDA 1FHEA 4F2IA 2DMMA 17GSA 2CAQA 3US3A 2K8SA 3QMXA 3BOAA 3CYNA 1ERWA 2F8FA 3S9FA 4YH2A 4GRFA 3KTLA 3L9VA 5IMVA 2IMKA 2YP6A 2YCDA 4MPFA 3FR3A 1I5GA 2HZEA 1JZRA 3LYKA 5KN3A 1K0AA 3HY2A 2DC5A 3HDCA 3ZFLA 3I69A 3PGTA 4IELA 5IPGA 3VURA 2VCZA 3GRXA 1U6TA 4ZB9A 4EDZA 2V32A 1XOBA 3M3MA 2A4VA 3C1SA 4TR1B 1Z5YE 2FNOA 2J9HA 2CT6A 3H79A 2VL2A 4IGJA 2CQ9A 2CAIA 5DALA 4KX4A 2H8LA 2WB9A 1JZWA 1T1VA 1XWAA 4RUVA 6GSTA 1XVWA 3F3QA 3IAS2 4GSNA 4HZ2A 5CREA 4KW6A 4ILFA 1Q4JA 2VCTA 3M9KA 4BL7A 2MBTA 2B7KA 4HJ2A 1AIUA 3BCIA 4IQ1A 2GT5A 3ZMKA 3LXTA 1B4PA 2PVOC 4MJEA 3HYPA 4QL9A 2XPEA 4Q5NA 2R6KA 2HT9A 3RPNA 3Q18A 4PQIA 3CSJA 1DE2A 4YAVA 3TB2A 18GSA 3FW2A 2OBKA 4O7HA 2H1BA 2GQMA 1V57A 5B6NA 6GSSA 1K3YA 4ULXA 2YN1A 3TJKA 4MF6A 3C1RA 2HI7A 1FVKA 4LL4B 5CAXA 2H66A 3E3EA 3F0IA 5J41A 2BJXA 2YZHA 1TK8B 4G9HA 1EGRA 1G7EA 1ZCPA 3GIXA 2GSRA 4TW5A 4ZL8A 2YNXA 3QOUA 2P5QA 4POMA 2VM2A 4NWYA 3FRCA 1URMA 1T8EB 2B5EA 1SJZA 4TR4A 1TW9A 2LNTA 3LSZA 5F07A 1OVNA 5B6MA 1ZOFA 5DCHA 1TRSA 4F0CA 2AHEA 1SD9A 4K0NA 1ZYQB 1TRUA 3KZQA 4TR0A 4K7IA 3DMLA 3D0ZA 2M46A 3A2XA 4EXJA 2ES7A 2H1GA 1YKCA 5EPFA 3GTUA 1OYJA 5J9CA 3A3TA 5C04A 1Y6EA 1ZZYA 4K7OA 1PL1A 1S3CA 8GSSA 3EWLA 3TJBA 4NV2A 2QC7A 4IJ3A 1V40A 2H75A 5FWGA 1G0TA 4ZBDA 4NPBA 4FYBA 1F3AA 1R7HA 5B8BA 2DIZA 2LEGA 4O92A 1VF2A 5HFIA 2NBSA 1TU7A 5ECIB 4IBPA 1H75A 1SD8A 1M7TA 1SK1A 1V9WA 3LWAA 2VUPA 1MTCA 2AB6A 1R5AA 1MD3A 5GAND 1AC1A 2QSIA 5A4WA 2REMA 4LL1B 3KP9A 2YWIA 2QGVA 2ZUPA 1XW5A 2NPBA 1EP8A 3VPTA 5G2ZA 3E9JB 3TKPA 1TJDA 1HNAA 3F8UA 3DKSA 4XIHA 1V58A 5ID2A 4K9ZA 3IDVA 2ALBA 3F4TA 5G30A 2AYTA 5HR3A 2H70A 2L5LA 4JZQA 1X5EA 1HNCA 4KDYA 2C3TA 1WE0A 5HFGA 5JWRB 3HJOA 1OC3A 2VO4A 1J0FA 2YWNA 4I97A 2LTKA 4MJAA 4ZL9A 3CSHA 1YDKA 4LMVA 3TKSA 1NW2A 1SU9A 5IMDA 2GT6A 3FYGA 1FB0A 4NXIA 2CV4A 3QAGA 2H76A 4PXOA 4D73A 3UBLA 6GSWA 1DBYA 2PN8A 4JR6A 3W8SA 3D4MA 3CBUA 1PX6A 1W4VA 2V6OA 4HEA2 1FO5A 1KNGA 3UARA 4I2TA 2LS5A 4OFTA 2VCWA 1IYHA 1SL2B 1GWCA 3VK9A 4IW9A 2NVLA 1TKDB 3IXRA 5GZZB 2C3NA 3ERWA 1XPVA 2FWHA 3QAWA 3ZZXA 4N0VA 1ZMAA 2EIRA 3GH6A 3UIWA 2GQKA 2FA8A 2FGXA 3TJGA 1O7UA 1FVJA 4KSMA 2L6DA 5G1LA 2LQQA 4PNFA 3FZAA 2LJAA 2VLTA 4WEYA 3F9UA 4NMUA 5CNWA 5J5NA 2MMOA 3PR8A 4MABA 1E2YA 2A2RA 2LRTA 1SYXA 2IL3A 2XC2A 4KDXA 2RLIA 4BVYA 2H1DA 1X5CA 4FO5A 2H0GA 2HSYA 1YKAA 3TOUA 2P0GA 3UMAA 1SYRA 2D2ZA 5LD0A 2GSSA 5CP1A 4MDCA 1KTEA 3GX8A 1WJKA 2O89A 1PKZA 1DSBA 3G9BA 1VF1A 1O73A 2AV4A 3MSZA 1LJRA 4DSQA 1GL8A 1XOAA 5ENUA 2X99A 4XRDA 2X8HA 3BD2A 5AIVA 5D9WA 4IKHA 3IA1A 3TUEA 5C00A 1FG4A 3L9UA 3KM6A 2FD3A 1TK0B 3APQA 3WGDA 3RHBA 1T4ZA 1X0RA 2H01A 3CSIA 1WPIA 5D9XA 4IJIA 3HKRA 4KH7A 4F03A 3J7Yb 3DD3A 2O85A 2KLXA 5E4WA 2WDUA 4BWSA 4JEDA 3UJ1A 2MBSA 3HJMA 4HU9A 3HVXA 1K3LA 4TXVA 2VD1A 1M9BA 2H73A 2LUSA 3TRPA 4WBRD 4YQMA 3TKQA 3TKSC 4ZXGA 4EC0A 1LBKA 3ZFBA 2E2GA 1JZOA 3ZYWA 3W6GA 3ZL5A 3ZITA 2YPMA 3LG6A 4PGTA 2YOIA 1PX7A 3QR6A 5IMAA 4KB3A 3KP8A 1XWKA 2I9HA 2K6VA 5ECQB 4BA7A 5J4UA 4V1Ap 5G5FA 4FYUA 4XCSA 1G7OA 4TN8A 2VIMA 3VWXA 1BG5A 4G10A 1A2LA 2C0FA 1YF1A 4BPYA 10GSA 3EVIA 1T00A 2WS2A 2FA4A 1ST9A 1V2AA 4L5OA 3KCMA 5CRWA 3BJ5A 4YAPA 14GSA 4NHZA 1ERVA 1QK8A 2B5XA 3QDNA 5IMZA 2YJHA 2OADA 2HFDA 3DXBA 3WT1A 3MNGA 4HQSA 2HZEB 3DVXA 4Q5FA 4EKZA 1XXUA 3VI5A 3O6TA 2IMFA 1YZXA 4GQFA 3VWVA 2O8VB 2CZ3A 3KMNA 4K8MA 1F9MA 2I4AA 1O8WA 3I9V2 1T4YA 3IE3A 2FLSA 2TIRA 1AQVA 1GSUA 4TXOB 1A8YA 3EU3A 5AISA 2VLVA 1YEPA 2P5RA 4IP6A 3L9SA 2K8VA 1SENA 1BEDA 4CDOA 1O81A 1R5PA 3OR5A 2FCHA 2WFCA 5HR0A 2JADA 3KMOA 2HNLA 1SJIA 2WRTA 1GNWA 3CRTA 4EF0A 1GUHA 11GSA 1GSQA 4MMMA 3IK9A 3D5JA 3VPQA 1BJXA 3DRNA 1GSEA 4MK3A 4IP1A 2V6KA 2GVPA 2PBJA 2OE0A 4HJMA 2KHPA 2I3YA 3C8EA 4V1Ag 3TOTA 2J23A 3HZ8A 4CW9A 1GUKA 1KBNA 5ECLB 4V2MA 4OCFA 1ZGNA 4GTUA 2AAWA 4AJ8A 5F06A 1I9DA 1UN2A 4PQ1A 4KDUA 4POLA 1TU8A 5GAPD 1YEXA 2H0IA 4GCIA 4IQAA 4V2LA 3L78A 3FEUA 2LJRA 5G31A 1XVQA 2YWOA 4MH2A 5DQYA 1XWCA 3H4KA 4JBBA 1G6YA 2C3QA 1WOUA 1MDJA 3UVTA 1F3BA 3GL3A 2VCQA 3LGCA 4TR1A 2JU5A 2WGRA 1XW6A 7GSSA 2IPAA 1YQ1A 4ISDA 2GZYA 1SK2A 3DVWA 2XBIA 3GFKA 5GSSA 5D9TA 2L4QA 2ON5A 3O76A 2C8UA 4EO3A 4N30A 4QQ7A 2ON7A 1PQNA 2X8GA 1M2BA 1Y25A 3VWWA 3GTUB 2HYXA 1AUCA 1NSWA 3HCZA 3IC4A 1O8XA 4OMVA 1XW9A 3NZNA 2JZTA 3CTGA 2L5OA 4GSSA 1ABAA 4K6XA 3KXOA 5EY6A 3FK8A 3C73A 1QXHA 2RM5A 1ON4A 1OKDA 3EINA 3HD5A 1SL1B 5IM9A 2MZCA 2OJLA 1G6WA 5HR1A 1OAZA 5A5KA 4F0BA 4ZIJA 1VGLA 3D4TA 2VL9A 4HDEA 4AGSA 6GSYA 4WR5A 1JLWA 5ECHB 1XWBA 16GSA 2C0GA 4EL1A 4KA0A 3ZTLA 1AQXA 1WIKA 2IFQB 5D8IA 2DJ1A 3EURA 5IMFA 3PH9A 1OC8A 2H71A 4MPGA 3GKKA 3QAVA 2RM6A 3HVSA 3H1NA 1F6MC 1XFLA 2GZPA 1DUGA 4I8BA 3APOA 3LEFA 6GSVA 4HUAA 2XBQA 4TRXA 4HS1A 4D73B 1MDKA 1XIYA 3QFBC 3ZIVA 2F8AA 6GSXA 4G2EA 4E8HA 20GSA 3FHKA 3AY8A 1Z6NA 5IPHA 1NM3A 3JCML 1X9MB 3W8JA 3EC3A 3NIVA 3TGZA 3EE2A 2R5GA 3PINA 2YANA 5G5EA 5F0GA 2V41A 4E8EA 2H6XA 1B9XC 3WYWA 1EP7A 1HQOA 3RAZA 1SKSB 2EIOA 3FY7A 5CYYA 2L59A 2DJ2A 2DJJA 4MJBA 3M1GA 1FAAA 2FWGA 1K3OA 3FZ9A 2DMLA 2QKEA 1M2DA 2PVQA 4JR4A 2C0DA 5KEJA 1MEKA 4MF7A 3RHCA 3EU4A 4OO4A 1J08A 4H86A 4ZBBA 5G1KA 1JZDA 1PSQA 2O7KA 3SWLA 4XS1A 2HXKA 1YY7A 3F6DA 1WRYA 1AW9A 2X64A 1TK5B 2PPTA 3IR4A 4XS4B 1XBSA 3ME7A 3FR9A 3GURA 3DEXA 1M9AA 3SBCA 3GYKA 4X1UA 2A2SA 3Q6OA 1SKRB 1ERTA 2GS3A 3D21A 1V98A 4HU7A 3UAPA 5E59A 1X5DA 13GSA 5DCGA 1X9WB 4L0WA 3DGQA 5JCWA 4O32A 2C0EA 4KGIA 2C80A 5IMCA 1K0DA 3GA4A 3QPMA 1K0NA 1QUWA 3I6AA 4OD7A 2X8CA 4X0XA 2GSQA 1RK4A 4DSSA 1GSFA 5DAKB 1NHYA 4OO5A 2M80A 1K0BA 4K1FA 1OE8A 2DIYA 4MJCA 1GSSA 2IMIA 2VLUA 2NTOA 2H0HA 4PQHA 2YJ7A 2VM1A 5ECMB 4POKA 3FZ4A 1EV9A 3ERGA 4GF0A 5JCUA 1W89A 3FZ5A 4OFMA 4P3YB 3QD9A 1U87A 1A0FA 1WP0A 2DBCA 4RI6A 2C4JA 1SKWB 3IHQA 3ZREA 4ECJA 4ZB8A 3HHVA 4DEJA 4JRRA 2LRNA 4N11A 1E6BA 2HRNA 3I43A 4ZB6A 1UVZA 4PX1A 1THXA 1Q98A 4PURA 1KEBA 2VCXA 3N9JA 1TRWA 3HVVA 1GRXA 1ERUA 2C1YA 2XHFA 2CVBA 3D6IA 19GSA 1ZL9A 2VCVA 2LKUA 2EC4A 2I81A 5CRDA 3VWUA 4I2UA 1J9BA 2OE3A 1OC9B 1B9YC 5KN1A 3KH9A 1A2JA 4KUNA 3RBTA 3ZMLA 2ZNMA 4I6XA 3GMFA 2PGTA 1OE7A 3H93A 2R4VA 1JHBA 1PL2A 3M9JA 3ME8A 3GN3A 1GUMA 5FT3A 3RPPA 1PMTA 1HNBA 4TR3A 1AAZA 3EMXA 2CVKA 2KP1A 5IOWA 2K18A 4K2DA 3TCOA 4MZWA 3GV1A 2AJQB 1HD2A 3KEBA 4ECBA 2TRCP 3LFLA 4NAXA 1JFUA 2KOKA 4PUAA 4WF5A 4BWQA 5IQYA 4ZL7A 5DVBA 3GSSA 3A2VA 1NHOA 2R37A 4I5QA 4J56E 4J2FA 3V1WA 5DDLA 2OKAA 4POBA 2VD0A 3TDGA 5ECKB 1T3BA 1ZYEA 1K0CA 5F05A 1ILOA 1GLPA 1GTUA 4WF4A 1TDIA 2HE3A 1VF3A 1GSDA 2GDRA 2Z9SA 2PMTA 3KJYA 3UVHA 4L0UA 2WJUA 5DALB 2WCIA 3GSTA 5DJLA 1R26A 1U3IA 1BX9A 5D96A 3D22A 2F51A 1GTAA 3N5OA 4YQVA 2BMXA 3TKSE 1K0MA 3F6FA 2EIQA 3P8WA 4OCEA 5AN1A 1MD4A 3TRQA 2DJ0A 4TXOA 1Z7RA 3R2QA 2ZCTA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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