2BJXA

Protein disulfide isomerase
Total Genus 19
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
19
sequence length
110
structure length
110
Chain Sequence
AATTLPDGAAAESLVESSEVAVIGFFKDVESDSAKQFLQAAEAIDDIPFGITSNSDVFSKYQLDKDGVVLFKKFDEGRNNFEGEVTKENLLDFIKHNQLPLVIEFTEQTA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The structure in solution of the b domain of protein disulfide isomerase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (PROTEIN DISULFIDE ISOMERASE)
molecule tags Electron transport
source organism Homo sapiens
total genus 19
structure length 110
sequence length 110
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 1999-01-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2bjxA00
2N5AA 1O85A 4EE0A 1HYUA 5G30A 3GH6A 1VF2A 4MJBA 1HQOA 5DCHA 5IMVA 2FA8A 1GSFA 1OKTA 3UEMA 2YPMA 4KW6A 20GSA 2G0FA 2H72A 4KDYA 3UVTA 4GTUA 2CX4A 3KH9A 2IMDA 4NAXA 4K7OA 4CW9A 1EGRA 1KNGA 3L4NA 1T00A 1ZOFA 2FNOA 1A23A 2BMXA 4MP4A 12GSA 2Z9SA 1YEXA 2LEGA 1GLQA 1B9XC 3FKFA 5DQYA 5L71A 2C1YA 2O7KA 5EVOA 5IMZA 3DMLA 5ECIB 1SD9A 2XPDA 3KP9A 1GSSA 4LLRA 2KP2A 4PUFC 2OE1A 2C4JA 1GH2A 1J9BA 5KN1A 3I43A 4IS0A 1JZOA 1LBKA 3Q6OA 5D8IA 4HZ2A 2GLRA 2G2QA 5IO2A 2BTOT 1ZYEA 4ZBBA 2N5BA 2IMIA 2GDRA 2VL2A 4XHMA 4LMWA 1YF0A 4V2MA 4ML6A 1RW1A 3TOUA 2HLSA 1H75A 2WULA 1YKAA 3HZ8A 4AJ7A 1IYHA 1XCCA 1T4ZA 1OC9A 4G9HA 4ML1A 1Z7PA 2HZEA 1GUKA 1SJ6A 2L59A 4NMUA 1Q98A 1BX9A 1K0BA 3ZIJA 1SENA 5D9TA 2R5GA 3TCOA 4QL9A 2REMA 1F3BA 4WF5A 1PQNA 2VIMA 2C0GA 3VURA 3IPZA 4N30A 2L4QA 4FH8A 4IJ3A 1YY7A 3CSIA 2C80A 1A2JA 3QPMA 2WDUA 4FYBA 1K3LA 4OD7A 5ECKB 1TJDA 3DKSA 2CQ9A 1JZDA 1G6YA 2VUPA 3D6IA 4ZBDA 3ZTLA 1QGVA 4PQIA 3RHCA 2KOKA 4KSMA 5D9XA 4DSSA 4K7NA 2VCVA 1GSDA 5ECLB 4WR4A 3ZRDA 1Z6NA 2P0GA 3L9VA 1KTEA 4I97A 1EEMA 4MJAA 3TKSE 1Y6EA 4ECBA 4IN0A 4EO3A 3F0IA 3WGDA 4PXOA 3GRXA 1TW9A 5COHA 5AIVA 1WIKA 3H93A 2OE3A 4JEDA 1OVNA 5GAPD 2A2SA 1B4PA 2YNXA 2YOIA 1K0CA 1QFNA 5J41A 1QK8A 1SYXA 3N9JA 3TGZA 2IIYA 3L0HA 5CO3A 4JBBA 3KP8A 1M0UA 3QD9A 1TU7A 3E3EA 1ZL9A 3E9JB 1ERTA 1KBNA 2RM5A 2YJHA 2O8VB 1O73A 4RUVA 2M72A 4ECJA 5ABRA 4YAVA 2H75A 4KX4A 4POKA 3TUEA 4MH3A 4EF0A 1ERWA 2H74A 5IMCA 2E2GA 2MZCA 2H71A 1AQWA 2OE0A 3GSTA 3IBHA 3IXRA 4TOPA 3WYWA 3D4MA 1XWCA 1SK1A 2AB6A 1IYIA 2YN1A 4MH2A 5C00A 2C3NA 1B4QA 1U87A 5IQYA 3U5RE 4KA0A 1EZKA 5DCGA 2PERA 3EWLA 3IAS2 3DWVA 3UBKA 1MEKA 2CZ2A 1F2EA 4I8BA 2OBKA 2B6MA 4OCFA 4ZBAA 2X8CA 4XCSA 3APQA 1R7HA 1RK4A 3V1WA 2V6KA 5JWQB 4ACSA 2PU9C 1EP7A 2HRNA 1MDKA 2YZHA 4D73B 2YV9A 4L0WA 5J4UA 3GYKA 1GP1A 3LG6A 3ERWA 4AGSA 5EL8A 5G2ZA 2E0QA 3KGKA 1T7PB 3DEXA 3O76A 4RI7A 4BL7A 2FGXA 1O7UA 4L5OA 2AAWA 3M3MA 4NV5A 6GSUA 1N2AA 3AY8A 3VWUA 3P2AA 1BYEA 18GSA 2X64A 3HZ4A 2YANA 4GRFA 3A3TA 2RLIA 5HR2A 4YQUA 3IHQA 5IMAA 2ALBA 5KEJA 3FR3A 1PX6A 3M9KA 5JWRB 4PUAA 2OJLA 4IELA 2N5FA 3VFIA 1VF3A 1MDIA 2IJYA 2JL4A 1GUHA 2P31A 4JE1A 2WGRA 2YJ7A 2VLTA 1CQGA 4N0ZA 2PPTA 2V41A 2MBSA 3KMOA 4KDUA 4MF6A 5HFGA 1SKRB 3ISOA 2H0HA 1Y25A 2H70A 4Q5RA 2LTKA 3TJBA 2HZEB 2FLSA 4NWYA 4ZIJA 2VD1A 2NTOA 4LA1A 2C0EA 1BJXA 3BJ5A 3HJPA 4EKZA 2B5YA 5HQPA 2VL9A 2NBSA 3H4KA 2H66A 3BBYA 2H6XA 5CYYA 3MAKA 2VLVA 1MTCA 2H0GA 3IOSA 1WP0A 1CQHA 1FHEA 2HFDA 4TXOA 2ZNMA 3PH9A 2LJRA 2R4VA 3LXTA 4DSQA 1Z5YE 5D96A 4HJ2A 4HU7A 2L5LA 2VM2A 2DMLA 1JLVA 2ON7A 3W8JA 3FW2A 2EIOA 2L6DA 3CYNA 2LRNA 4NHZA 3RPNA 1HNCA 1R26A 2GSSA 4EDYA 2LRCA 1SKWB 3GFKA 3TJGA 5DJMA 3A2WA 2LRTA 1MD3A 2CZ3A 4MZCA 2IMEA 1THOA 5EPFA 1S3DA 5F0GA 1TU8A 4KAEA 14GSA 2OA7A 2VL3A 1PKWA 2CV4A 3MSZA 1VRSD 3FR6A 2FWFA 4XIHA 1EGOA 2JSYA 2BJXA 3O6TA 4OFMA 4V2NA 4HQSA 2H19A 3F8UA 5FWGA 2X99A 1SJZA 4WXTA 3HJOA 3ZMKA 1SD8A 1T1VA 2OBIA 3UAPA 2LQQA 5CRHA 3PGTA 3VK9A 1GLPA 2GZPA 4XRDA 4GCIA 2JADA 3GURA 3MNGA 5IPGA 1JZWA 1TOFA 5JCWA 3C7MA 1EWXA 1TDIA 3QR6A 4DSRA 4HDEA 3TKSA 3CBUA 3F6FA 3GNJA 5JCGA 1LJRA 3GMFA 1AQXA 1V40A 2VOCA 3DYRA 5ID2A 2J9HA 5JCUA 3ZREA 5FT3A 1ILOA 2GT6A 1XFLA 2GZZA 1TI3A 1EEJA 4OFTA 1A2LA 4ZILA 3C8EA 4X0XA 3UL3A 4F82A 5ECPB 1ZZYA 1PL2A 5J5NA 2H01A 2PMTA 4WKWA 1QXHA 4WR5A 3FHKA 4IHUA 4BWSA 2LNTA 2VD0A 4O32A 4WBRD 4V1Ag 5G1LA 3GHAA 1WPIA 3UBLA 3EMPA 2NDOA 1PL1A 5GZZB 1DBYA 1GTUA 3P7XA 3IV4A 3IC4A 5JWOB 1GSEA 1OE8A 5ECOB 5HR0A 1G6WA 1NM3A 1BG5A 1UC7A 4IP6A 3UJ1A 3LEFA 1M2DA 1TRVA 13GSA 3LSZA 4RI6A 5ELGA 3FEUA 5DDLA 5ENUA 3TJKA 4KB3A 1Q4JA 2FWGA 3ED3A 4IKHA 4GSNA 3WT2A 4L0UA 1XXUA 4XS4A 2F3MA 2IMFA 1BQ7A 3IA1A 1TI1A 5IPHA 2AV4A 2VCTA 2C3QA 2AYTA 5H5RA 1XVWA 4K6XA 3EU4A 1FB6A 3HY2A 5B8BA 5J3RA 1T4YA 2LJKA 2VCXA 4BVXA 1ERVA 2IN3A 4IVFA 5G5EA 5F8BA 3BCIA 2YWIA 4F2IA 1W4VA 1FB0A 3Q19A 4KDXA 4AJ6A 1M7TA 5HR1A 4TR4A 5EY6A 4MF7A 2QSIA 3IAM2 4ZL7A 3BOAA 4O92A 1TP9A 2B7JA 2VAFA 3F63A 3M1GA 3HKRA 4PNGA 3HXSA 4JRRA 1URMA 3FY7A 1ABAA 4EVMA 3N5OA 2QGVA 3PINA 4ECCA 4GSTA 5D9WA 1OC3A 2ZUPA 2LQOA 3Q18A 1USBA 4ZB6A 1JZRA 3EMXA 5D93A 1M99A 1HNBA 3GTUA 3VI7A 2HZFA 1AUCA 2MMNA 4FYCA 5AN1A 5CREA 1GULA 4E8HA 1O8WA 1FOVA 3HYPA 3ZYWA 3ME8A 2FA4A 2P5RA 3H79A 7GSSA 1O81A 2DJ1A 1EV9A 1PX7A 2I4AA 2DSAA 3RBTA 4MMMA 2VO4A 3L78A 4TVEA 1XW9A 2DJ2A 5F06A 2CT6A 1YDKA 3SBCA 4TR1B 2C3TA 5HFIA 3F4TA 3G9BA 4HI7A 1PGTA 1YJ6A 2NVLA 11GSA 4IW9A 4POBA 1TK8B 4YQMA 5DAKB 3LYPA 1PSQA 1UA5A 1JLWA 1X5DA 3WGXA 3ZZXA 4YH2A 1A2MA 4KE3A 3TJFA 1BEDA 3F4SA 2PUKC 1A8LA 4FO5A 4QQ7A 1XOBA 1O8XA 1B9YC 3H1NA 2PWJA 3VWXA 2B1KA 3IR4A 1SL1B 4E8EA 3A2XA 3FZ4A 2FCHA 3GSSA 4JZQA 1K0OA 3ZFLA 1M9BA 4KSOA 3DRNA 3KZQA 3J7Yb 5DQSA 1K0AA 5KN0A 1U3AA 5ID2B 3QAWA 1TKDB 2K6VA 5IIZA 2CA8A 1X5CA 2E7PA 1MD4A 2WZ9A 2PVOC 1Z3EA 1OAZA 3APSA 4F0BA 1R5AA 4K2DA 4EC0A 2MMAA 2R6KA 4ISDA 2XBQA 2MMOA 3A5WA 4KH7A 2CVBA 3A2VA 1SJIA 4KUNA 4Z7XA 3HVSA 4FYUA 6GSTA 4BVYA 3VLNA 3DVXA 1K0NA 3NOFA 1A0RP 1V57A 2VCQA 2DIZA 1TK5B 5A5KA 3DD3A 1K3OA 4Q5FA 1C72A 1PMTA 2YCDA 2MBTA 2LJAA 3QAVA 2GGTA 1OYJA 2FWEA 3M8NA 3LYKA 2L6CA 4RQRA 4IQAA 1SKSB 1Z7RA 3IK7A 2L57A 2B1LA 4ILFA 4N10A 4NV2A 4CHSA 2GSQA 3HCZA 5GSTA 3FRCA 5GAND 1T3BA 3D4TA 3WD6A 5KN2A 3F3RA 4K8MA 1SL2B 2B3SA 3D5JA 1UN2A 1XIYA 2KLXA 2IFQA 1S3CA 4WETA 1OC9B 3KTLA 1AW9A 1XW5A 3KTBA 3GKXA 2P5QA 5DALA 2I3YA 1GTBA 6GSWA 3EINA 3R2QA 2B5XA 5CP1A 1GTIA 2LS5A 2V32A 4RQXA 5DVBA 3NIVA 4H86A 4PNFA 3DXBA 1T8EB 1VGLA 2H8LA 2VCWA 4HQZA 4ZB8A 3EVIA 3UMAA 3JCML 3TKPA 5D73A 1Z9HA 1E6BA 1XBSA 6GSSA 3GKMA 4N11A 4OCEA 3GKNA 3KEBA 2K9FA 3LFLA 3VI5A 1YKCA 3GA4A 2H30A 1FVKA 9GSSA 4WEYA 4NPBA 5DBQA 2JZRA 4ZL8A 1XWGA 1YF1A 3D22A 1SK0A 4PQHA 2H6ZA 2R2JA 4IJIA 2K8VA 2ZCTA 4MA9A 4GWRA 1XWAA 3D0ZA 1M9AA 1DSBA 4DSSB 1EOGA 2IL3A 2RUFA 2KP1A 2FWHA 3FZ9A 3QMXA 4K9ZA 2OADA 3Q74A 2YWMA 1PRXA 2XHFA 4X43A 5LCZA 2C0FA 1E2YA 2DJKA 2OKAA 3L9UA 2MYGA 3MDKA 3ZLPA 3GX0A 3DVWA 6GSVA 3FR9A 1QQ2A 1GSQA 4J57E 1R5PA 4I2UA 4HZ4A 1GSUA 1PD21 2HSHA 1HNAA 2CX3A 4N0VA 4TKYA 5B7CA 3KCMA 3GIXA 2DIYA 2ES7A 1XW6A 4LL1B 1OE7A 5CRGA 3LQ7A 4OO4A 1AQVA 2X8GA 4MABA 1ML6A 1GL8A 5LD0A 3VPQA 10GSA 2F51A 5IMDA 1ZYQB 1J0FA 3QAGA 4YAPA 4G19A 4POLA 3WGEA 5CRWA 1YEPA 5G5FA 1NHYA 2GQLA 3M0FA 2LKUA 4MK3A 1BAYA 3TKRA 3K8NA 1V58A 2H76A 1AC1A 1MDJA 2LNSA 1VF1A 2YWOA 2OACA 2H0IA 4AF2A 2JSZA 2M80A 1NSWA 2B7KA 2VL2C 4KCAA 4HU9A 2LUSA 4NHWA 4EXJA 2QC7A 5ELAA 4TXVA 3ZFBA 1XWBA 3UARA 1XWKA 4PURA 3MWHA 3FYGA 4MZBA 3GL3A 3EC3A 1UVZA 4KNDA 2CVKA 2JZSA 2DC5A 3E0UA 2IMKA 2XC2A 3GV1A 3D21A 4ZXGA 2NPBA 2GSTA 3NZNA 3DIEA 4PGTA 5ECSA 1FG4A 4ID0A 2V6OA 4D73A 2K18A 3C1SA 3TJJA 1X9WB 5DJLA 1OKDA 4F03A 4HJMA 5B6NA 3UVHA 1VF4A 1EP8A 1GNWA 5GSSA 5B8AA 2AJQB 4BPYA 4P3YB 3C1RA 3GX8A 3F9UA 2D2ZA 1YQ1A 1FO5A 2EIRA 3TRPA 4GXZA 2L5OA 4MPGA 2CAIA 1M2AA 2PN8A 2H1DA 1N8JA 3VPTA 2EC4A 4K0GA 1FAAA 3IK9A 5G31A 4TR3A 3LGCA 3GH9A 3HHVA 5CNWA 2HT9A 4I2TA 3TRXA 5IMFA 2O87A 1TRUA 2ON5A 3TB2A 3LJRA 4GF0A 4Q5NA 1YZXA 1U3IA 2VCZA 4IGJA 2IFQB 1V98A 4WBJA 5DALB 3US3A 2HSYA 2H73A 4GQFA 1JFUA 1GSYA 2A4VA 1XVQA 2I81A 4Q5QA 5F07A 1GNEA 5J9CA 4MZWA 3LWAA 2V1MA 5CAXA 3ZITA 5A4VA 16GSA 3QFBC 2DLXA 4XTSA 2HYXA 4TXOB 4KGIA 2PGTA 2A2RA 4ECIA 1H4OA 2C0DA 5FHIA 2GVPA 1AIUA 1F3AA 3ERFA 1V9WA 1ERUA 4V2LA 8GSSA 3OR5A 2TIRA 3KM6A 2E2MA 2F9SA 3I9V2 4MJCA 3F6DA 4MPFA 3QFAC 3CRTA 5IO0A 1OC8A 1ZCPA 4XS1A 4DVCA 4QL7A 4MJEA 2VLUA 4FIWA 3GKKA 1A24A 6GSYA 4EUYA 2GS3A 4F9ZA 2H1AA 3ERGA 3CSHA 3P8WA 3I69A 4K1FA 4OO5A 1X5EA 1G7EA 1U88A 1SK2A 1TRWA 1EV4A 1X9MB 1M2BA 5E4WA 2GQMA 2R3XA 3GL5A 3S9FA 2GT5A 1WRYA 1FW1A 3CSJA 3GUSA 1X0RA 2QKEA 4OMVA 2CVDA 2L4CA 2B5EA 2H1GA 4IBPA 4CDOA 4LMVA 2I1UA 1WMJA 5CRDA 1F6MC 5H5SA 3EE2A 5ECMB 2AUVA 1NW2A 2DJ0A 3KH7A 3W6GA 5HR3A 1WOUA 3CTGA 5J9BA 3HDCA 6GSXA 2V2GA 4O7HA 4XRAA 3KJYA 4GSSA 1RQMA 2DBCA 1ZMAA 4TW5A 5H5QA 2EIQA 1PKZA 17GSA 4HS1A 3CRUA 2PVQA 19GSA 3U6VA 1G0TA 2GSRA 1THXA 4XS6A 5B6MA 3C71A 3KD0A 1A0FA 1ZGNA 5HFKA 5D9VA 3LXZA 2RM6A 2HI7A 1TK0B 4F0CA 2GQKA 4HEA2 1S3AA 2HNLA 3G7YA 1WWJA 2AHEA 3BCKA 3KIJA 4WF4A 3UIWA 2R37A 4YQVA 4GQCA 4J56E 3ZL5A 3H8QA 3DGQA 3HVXA 1K0MA 1GTAA 3KXOA 2HRFA 2YWNA 1B8XA 3ZMLA 4OFNA 2H6YA 4L8EA 5AIXA 1F37A 4LL4B 4BA7A 1AAZA 2FD3A 5KN3A 3FK8A 3HD5A 3PR8A 3QCPA 1SU9A 3TRQA 1GWCA 3LORA 3QDNA 2J23A 2O89A 2RIIA 2DJJA 3VWWA 2K8SA 2XBIA 1XOAA 5ECNB 2WCIA 5G1KA 2C8UA 1SL0B 2F8AA 2IPAA 3UOMA 2WFCA 1TXXA 5IOXA 4XS4B 1EOHA 1O6JA 3W8SA 3FZ5A 3WT1A 3RDWA 1JHBA 3P90A 1ST9A 3GN3A 1KEBA 1I5GA 1V2AA 5AGYA 1K3YA 2X8HA 4G10A 4ZL9A 3BD2A 1DE1A 1GUMA 2PBJA 1LU4A 4IP1A 4JU5A 4X1UA 2H1BA 3ZIVA 2DMMA 1TTZA 3FZAA 3CTFA 2DJ3A 3VWVA 1PN9A 3I6AA 1AXDA 2FUG2 2WJUA 4EL1A 4MLYA 1ON4A 1TRSA 22GSA 3CMIA 2JZTA 3RHBA 1XZOA 2TRXA 2M46A 5ECHB 3IE3A 1ACVA 3C73A 3M9JA 2WS2A 4O5RA 1I9DA 4ZB9A 3TDGA 3HVVA 5E59A 2FHEA 3ME7A 2FY6A 3TOTA 4TN8A 1F9MA 1DUGA 5INYA 2F8FA 3SWLA 1W89A 4GLTA 3TKSC 4OWYA 3HJMA 5IM9A 2IWTA 4MDCA 4ULXA 5A4UA 5C04A 4V1Ap 4MF5A 1GRXA 3ZVJA 3EU3A 4JR6A 3GTUB 4I5QA 4NXIA 3IRAA 5A4WA 5AISA 4AJ8A 2YV7A 4HUAA 2TRCP 2JU5A 3G7JA 4TRXA 3J7Yk 1DE2A 1FVJA 4I6XA 2XPEA 4J2FA 2GTUA 5F05A 3APOA 3F4RA 4TR0A 3QOUA 5ECQB 1NHOA 4MCUA 4KCEA 4BWQA 3G7IA 2VM1A 1Z6MA 3EURA 2CAQA 1QUWA 4HOJA 1U6TA 1QMVA 4TR1A 1HD2A 5ECRB 3O3TA 2HXKA 1K0DA 2LSTA 1A8YA 3EYTA 1WE0A 1SYRA 5DAKA 2WRTA 4DEJA 3ZVJD 2YZUA 2MMZA 4K7IA 4EDZA 2WB9A 2KUCA 2KHPA 3KMNA 4POMA 1WJKA 2HE3A 1PA3A 2GZYA 3RPPA 2I9HA 1G7OA 4JR4A 1X9SB 4PX1A 2RUEA 1R4WA 3F3QA 4K0NA 5LNKe 1B48A 1XPVA 3RAZA 3L9SA 2JACA 4PQ1A 3CXGA 2LV3A 1J08A 4IQ1A 5IOWA 4L5LA 3TKQA 2YP6A 3IDVA 3HA9A 4G2EA 2O85A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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