2BMXA

Mycobacterium tuberculosis ahpc
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
169
structure length
169
Chain Sequence
PLLTIGDQFPAYQLTALIGGDLSKVDAKQPGDYFTTITSDEHPGKWRVVFFWPKDFTFVCPTEIAAFSKLNDEFEDRDAQILGVSIDSEFAHFQWRAQHNDLKTLPFPMLSDIKRELSQAAGVLNADGVADRVTFIVDPNNEIQFVSATAGSVGRNVDEVLRVLDALQS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure and Mechanism of the Alkyl Hydroperoxidase Ahpc, a Key Element of the Mycobacterium Tuberculosis Defense System Against Oxidative Stress.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ALKYL HYDROPEROXIDASE C
molecule tags Oxidoreductase
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 46
structure length 169
sequence length 169
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2005-03-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2bmxA00
2C3NA 3DVXA 1O81A 2K6VA 4ML1A 3KTBA 4HUAA 2L6DA 2AUVA 2CVBA 2VO4A 2RM5A 4K7OA 3GTUA 2VL9A 2PMTA 3TUEA 4PGTA 3D0ZA 1OKTA 2DJ2A 2XC2A 1GUKA 1QGVA 5AISA 1NSWA 2HFDA 2JZRA 2LNTA 1ZYEA 4IP6A 5JCGA 1SK2A 3N9JA 2B7KA 3LSZA 5H5QA 1XW9A 4F0CA 4XS4B 3H8QA 2VL2C 3E0UA 1U87A 2VM1A 2IN3A 1DUGA 1X5EA 2IPAA 2FCHA 5IOXA 11GSA 3W6GA 3ISOA 1TU8A 4PQHA 4L0UA 4IJIA 2K18A 3HA9A 1YEPA 1JLVA 1N8JA 2HZEA 4IJ3A 3Q6OA 2C80A 5G31A 1YF1A 5J9CA 3FR3A 3M8NA 5GZZB 3APOA 2HT9A 3D21A 3DRNA 5G5FA 2EC4A 3CMIA 3W8JA 4ZBDA 4E8EA 6GSUA 4IN0A 2FWFA 2ON7A 2KOKA 4O5RA 4J2FA 2PERA 4P3YB 3C8EA 4IS0A 1MDJA 1OVNA 1PX6A 2H75A 6GSVA 2B1LA 4DSSB 2LQOA 3IA1A 4BA7A 1U6TA 1M0UA 3ZFBA 2VCWA 3UVTA 2A2RA 2FLSA 3LORA 2NDOA 1Z6MA 4KCEA 4WR4A 4ECBA 4EC0A 1T1VA 2YWNA 3G7JA 3VURA 3C1SA 4L5OA 2VD1A 5L71A 3L9SA 3TRQA 2DJ3A 3TKSC 1DE2A 4LL4B 1EP7A 4DVCA 4L5LA 1Q4JA 2CX3A 1SD8A 1SKRB 1GSDA 1EWXA 1ML6A 4AF2A 4WF5A 1SYRA 1YEXA 5KEJA 3GKMA 5CREA 1G6WA 1FVJA 1E2YA 1AUCA 3GKKA 4G10A 1THXA 3O6TA 4ZB6A 2H0IA 2XPEA 3GMFA 4LA1A 2V2GA 1R7HA 1ST9A 2H30A 4OO4A 1XFLA 5HFGA 2OADA 3ZLPA 3K8NA 5B8BA 2VIMA 2ALBA 5ECOB 3CXGA 1YDKA 4GTUA 4RI6A 5CP1A 12GSA 16GSA 1JZRA 3KGKA 3Q74A 2H71A 3QR6A 3PGTA 3J7Yb 1HNAA 5LNKe 1SJ6A 1EZKA 3TRXA 3RPNA 2YV9A 2GZPA 2C4JA 1B4PA 2R4VA 3DVWA 3NOFA 2VOCA 5D8IA 3DWVA 10GSA 3QCPA 3GIXA 4YQVA 3NIVA 2H1DA 1HD2A 4OD7A 2JACA 2OBKA 4KCAA 4YAVA 4XRDA 5HR0A 1F3BA 4N10A 5FHIA 1ZGNA 3GKXA 1GSSA 4I5QA 2MBSA 2AYTA 4HQZA 4I2UA 4XHMA 2YANA 3WT2A 1KEBA 2YWMA 4I2TA 5DDLA 2FNOA 19GSA 3GYKA 4WKWA 5JCWA 3GTUB 3FYGA 4K0GA 1GWCA 5IQYA 2JSYA 3O3TA 2YCDA 2Z9SA 1OYJA 1B4QA 1B8XA 3FKFA 3ZREA 3IAM2 1TU7A 3VWWA 3E3EA 3GL3A 3PH9A 5A4WA 4TXVA 3DEXA 3U6VA 1A0FA 4X1UA 4OFNA 3HJMA 3HCZA 3LQ7A 5IPGA 3IK9A 5JWQB 4HZ4A 2H70A 2A4VA 5DCHA 3TRPA 3TKPA 1MD3A 1BEDA 4AJ7A 3CSIA 4IGJA 4TRXA 2LEGA 4YQMA 4MZWA 2LRNA 2H19A 4AJ6A 3ZL5A 4K7NA 3EMXA 4MMMA 1B9XC 4K1FA 3HD5A 4YH2A 1F6MC 2FA8A 3KMNA 2B6MA 1EV4A 3FZ5A 3RAZA 1TK8B 1PKZA 3M9JA 3OR5A 2X99A 3BOAA 2X64A 3GN3A 5A4VA 1VF1A 1SD9A 4PUAA 3FY7A 3UARA 2D2ZA 3FZ4A 2HNLA 5DQSA 2HSYA 4PQIA 2LUSA 3P8WA 5J41A 2AB6A 2P5QA 1G6YA 2KHPA 3I6AA 3GRXA 3BBYA 3KMOA 1ERVA 4DSSA 1Q98A 3HKRA 18GSA 4ZBAA 1JHBA 1S3AA 2FY6A 4EUYA 1XW6A 4AGSA 2H1GA 3KM6A 3ERGA 2X8GA 1SKWB 1PD21 5B6MA 4N30A 4NPBA 3RBTA 1TKDB 4FYUA 3WGEA 1N2AA 2ES7A 2L5LA 3FRCA 4GXZA 5J5NA 1K0CA 2R6KA 1BAYA 2BTOT 3HZ4A 2IMEA 5IMZA 2X8CA 1PQNA 2R37A 4ZB8A 5IMDA 1EV9A 1GLPA 2JADA 4J57E 4QQ7A 4GWRA 4WBRD 4CDOA 1BG5A 1FO5A 3VFIA 2WGRA 2IMKA 3PINA 1QQ2A 5IMFA 4TVEA 3ZZXA 3F0IA 5DALA 4QL9A 3GA4A 7GSSA 4XIHA 3F6FA 2RIIA 2H01A 4MH3A 2DJJA 3J7Yk 2CZ3A 3P90A 1FW1A 3CBUA 2ZUPA 5EY6A 1OC3A 4GSSA 1GTIA 1A2JA 5D9WA 3FK8A 4RUVA 1NW2A 1V2AA 4KH7A 5ID2B 1QMVA 2CQ9A 3I43A 3DMLA 3HVSA 1M2AA 4RQRA 3ED3A 2HYXA 1FB6A 3L78A 1R5AA 3U5RE 4ZL8A 1MEKA 1VF3A 2DSAA 1QFNA 2AV4A 1A8YA 1WP0A 1GNEA 1GTUA 2HZFA 4GRFA 2RUFA 1ZYQB 3IR4A 3QMXA 4ZL7A 3H79A 2GQMA 5E4WA 5GSSA 3ZTLA 1A23A 3TJKA 4HJMA 1PSQA 3CSJA 4MJAA 2NBSA 5EPFA 1S3DA 2JZSA 4Q5QA 3FZ9A 5ECLB 1AXDA 2OKAA 4TOPA 4FH8A 1UVZA 2YJ7A 5CNWA 4PUFC 2ZNMA 4YQUA 4IP1A 2EIRA 1TTZA 3IHQA 1R26A 1PX7A 2B7JA 4Q5NA 2WRTA 2G2QA 1YJ6A 3VWUA 1GSUA 5B7CA 3IV4A 5KN0A 2C3QA 4PQ1A 2V41A 4CW9A 2KLXA 2YOIA 1MTCA 3F8UA 5CO3A 5ECIB 2VAFA 3APQA 1I9DA 1JZDA 2V6KA 4MCUA 5CRGA 2TIRA 3TB2A 3V1WA 2RUEA 2GSRA 2H1AA 3TCOA 3HJOA 2DLXA 1TP9A 2RLIA 5ELGA 3WGDA 4POKA 4WBJA 2H72A 4FO5A 4HS1A 5DAKB 2GZYA 5F07A 2GZZA 2WFCA 4NMUA 5ECNB 3LEFA 2DBCA 4V2LA 4KDXA 2NVLA 1ON4A 1T7PB 1PA3A 4JEDA 3UIWA 1V57A 1PL2A 4MF5A 4KA0A 4KX4A 5KN3A 3FHKA 3KZQA 1NHOA 5IIZA 1UN2A 4WXTA 2IMIA 2AJQB 2PN8A 5AIXA 2FGXA 4MJEA 5F05A 4JZQA 4N0ZA 1M2DA 3QAVA 1JZWA 5ECKB 4TW5A 4HDEA 1EEJA 2DC5A 5KN2A 1AW9A 1VRSD 4ACSA 5F0GA 1OE7A 3BCIA 1PL1A 5IO2A 1E6BA 3TJFA 2H76A 1HNBA 4KNDA 1TI3A 5JCUA 3GKNA 1RW1A 2LJKA 2OA7A 3GX8A 4ULXA 4X43A 1GNWA 2YWOA 1XOBA 2OBIA 1R5PA 1X5DA 2KP1A 4TKYA 2M80A 1JFUA 4LL1B 1GSQA 1M2BA 1BYEA 2R3XA 3LGCA 2DMLA 2J9HA 4G2EA 4CHSA 4RQXA 3KCMA 5D9XA 4OWYA 3IDVA 3ZMLA 1K3OA 1V58A 3H4KA 3ZVJD 1QK8A 2H66A 5DALB 4XS6A 1SL2B 3UEMA 4POBA 1SJZA 3M9KA 1AIUA 3G9BA 1EEMA 2E2GA 1W89A 2H0GA 2VL3A 3DD3A 3KH9A 4BWQA 1YY7A 1Y25A 1GSEA 2WULA 5HFIA 3Q18A 3E9JB 2F3MA 1FAAA 3BJ5A 3CRTA 3H1NA 2WJUA 2J23A 2VCVA 3L9UA 3QAWA 4L0WA 4ZL9A 5EL8A 4K7IA 3NZNA 3ZITA 3S9FA 3UBLA 4OMVA 5D96A 2FWGA 3HZ8A 3IAS2 5ID2A 4HOJA 4KB3A 4BVXA 3MWHA 3G7YA 1Y6EA 2IJYA 2PU9C 5IM9A 3TJJA 2YV7A 3WD6A 4HU7A 2LV3A 4I8BA 1FVKA 2GTUA 2B5EA 1PN9A 2WCIA 1XWKA 1F2EA 3EE2A 5IMCA 3IBHA 2WDUA 1U3AA 4MZBA 1U88A 1WIKA 4NHZA 1B48A 3ZYWA 3CYNA 1CQHA 3F9UA 3GL5A 4KW6A 2C8UA 1TRUA 2FWHA 1AQWA 2B1KA 3KH7A 4ML6A 1BX9A 2RM6A 2CVKA 1O8XA 4O7HA 1TXXA 3F6DA 5D9VA 2GDRA 1LJRA 2H8LA 4K6XA 2GT6A 4OCEA 5F06A 2IMFA 4WEYA 1G0TA 3KXOA 2P31A 4EE0A 3CRUA 3US3A 4ILFA 1CQGA 5IOWA 5ABRA 1RK4A 5ECPB 2YZHA 1EP8A 1BQ7A 4MJCA 4JR6A 1ILOA 5IMVA 5DAKA 1T3BA 2GQKA 3IXRA 2M72A 3F4TA 5D93A 4NHWA 2MMNA 2VLVA 1GSYA 4POMA 5GAPD 5G2ZA 1A0RP 1AC1A 2HLSA 3VPTA 2FHEA 1AAZA 1URMA 1WOUA 4DSRA 5CAXA 2O89A 3EYTA 4V2NA 4TR4A 4KGIA 4PXOA 5HR1A 3MAKA 3QFAC 2P5RA 1M99A 1XCCA 4BVYA 5J3RA 1TRSA 4PX1A 2H73A 4F0BA 2H74A 2VCXA 3F3RA 1PKWA 1KBNA 1O7UA 3D6IA 2MMZA 3APSA 4WETA 1A24A 1YKAA 5GSTA 2O7KA 3RHCA 2H1BA 1C72A 1KNGA 1XXUA 2IWTA 1V40A 4IVFA 4MF7A 1A2MA 1SL1B 4MDCA 1K0NA 1EGOA 3N5OA 5H5RA 1J08A 4TR0A 1Z5YE 2HRFA 3I69A 4MJBA 4TR3A 2N5FA 1YZXA 4F03A 2EIQA 5CRHA 3GV1A 4BL7A 1HNCA 1OC9B 3Q19A 4QL7A 3GFKA 3P7XA 4K9ZA 1K0DA 1OAZA 1H4OA 3KJYA 4F2IA 1WWJA 6GSWA 3GX0A 2CZ2A 2MMOA 4Q5FA 2EIOA 2QGVA 4E8HA 3CSHA 4EXJA 4KAEA 1J0FA 2F9SA 1VF2A 2QC7A 2VCZA 3O76A 3HXSA 3C7MA 1XOAA 4PURA 5ECSA 2O87A 4NWYA 5DBQA 3GH6A 1AQXA 1XBSA 3QPMA 1ZOFA 2L6CA 1A2LA 2H6ZA 3HDCA 4TN8A 2IFQB 1T00A 3ME8A 2YNXA 1SJIA 1WJKA 1DBYA 5AIVA 2XBQA 3SWLA 1XWAA 4ISDA 4XRAA 3TOUA 2H0HA 2DMMA 1DE1A 2DJ0A 5ECQB 4DEJA 5LD0A 4POLA 5A4UA 2PGTA 1VF4A 2DIZA 2DIYA 4MP4A 3VK9A 3VWVA 3ME7A 1TOFA 2VL2A 1WRYA 1IYIA 1O73A 3UAPA 2WZ9A 4XTSA 1J9BA 4TR1B 1GH2A 2AHEA 1TJDA 5AGYA 5HFKA 5EVOA 5ECRB 1Z7RA 4TXOB 2P0GA 1Z6NA 1HQOA 2TRXA 2I3YA 3F63A 4KSMA 3A2WA 3C1RA 2LSTA 2MBTA 14GSA 4HU9A 3LWAA 5DJLA 4JRRA 2LS5A 2V6OA 1F9MA 1MDKA 2H6YA 4HI7A 4KUNA 2L5OA 2AAWA 5GAND 3DIEA 3R2QA 1ZCPA 4EF0A 1Z7PA 2LKUA 2CVDA 1T8EB 1ZMAA 22GSA 3MNGA 5DJMA 3LJRA 4ECCA 1JZOA 1WMJA 1O85A 4V1Ag 4KE3A 4D73A 5J4UA 3FR9A 2QKEA 1XWCA 1ERWA 3MDKA 3D4TA 4Z7XA 5G5EA 3TKSA 2V32A 3KIJA 2C0EA 4H86A 1PRXA 4XS1A 2XPDA 4OFMA 1AQVA 4ZILA 2QSIA 4IQ1A 1RQMA 2PBJA 4XCSA 1YKCA 3RDWA 5HQPA 2VCQA 3QAGA 5COHA 1OKDA 4MZCA 2E2MA 3C71A 2VLTA 4ZXGA 5LCZA 3L0HA 2M46A 2VUPA 4PNFA 1HYUA 5B6NA 5HR2A 2NPBA 3LG6A 1WPIA 1UC7A 3HY2A 3IRAA 3GH9A 4NV2A 3DKSA 1ZL9A 3LXZA 2K8SA 4IKHA 2I9HA 1OC8A 4JU5A 2R2JA 4MK3A 4LMWA 2TRCP 1ERTA 2KUCA 1FHEA 1GUHA 2B5XA 4O32A 5JWOB 4MPGA 5IO0A 2ON5A 2IL3A 1X0RA 4N0VA 2L57A 3ZIJA 1SKSB 3PR8A 4FIWA 3L9VA 3H93A 2GSTA 2B5YA 1GL8A 2GLRA 3VLNA 1QUWA 1K0OA 2GSSA 1ACVA 5CRWA 3VPQA 1Z9HA 3RPPA 5AN1A 1BJXA 3UVHA 1OC9A 3GHAA 3KD0A 1TW9A 1X5CA 5JWRB 3ZVJA 5G30A 2C0GA 3SBCA 3M0FA 1FOVA 2PVOC 1XIYA 4Q5RA 3KTLA 3VI7A 4EVMA 1SK1A 1XVQA 4NAXA 3UL3A 1TI1A 1GRXA 2LJAA 1K0AA 2L4CA 3F4SA 3ZRDA 2GSQA 4KDYA 5FT3A 5DVBA 1ZZYA 5E59A 2IIYA 3GSTA 4MPFA 4MH2A 6GSYA 3EU3A 5HR3A 1MD4A 4NV5A 2F8AA 5CYYA 5G1KA 1GUMA 3HYPA 5H5SA 2B3SA 3LXTA 2JSZA 3DYRA 2OE1A 4V2MA 5CRDA 3DXBA 6GSXA 1IYHA 2IFQA 4HJ2A 2F51A 2XHFA 2C1YA 1F3AA 3FZAA 5D73A 2YWIA 5ECHB 1GTBA 3G7IA 1X9WB 3IK7A 3HVXA 3QFBC 3TGZA 3TJGA 2V1MA 2FA4A 4YAPA 2HI7A 1Z3EA 4IHUA 2LNSA 4HEA2 1GULA 4ECJA 1LBKA 1TRWA 1OE8A 2C3TA 4GCIA 1A8LA 5DCGA 3W8SA 1SYXA 2BJXA 4TR1A 2LRTA 4MA9A 1X9SB 3A2VA 3VWXA 4IELA 1W4VA 1H75A 4TXOA 1V9WA 2O8VB 4G9HA 2F8FA 2GT5A 4N11A 3TJBA 1K0BA 4GSTA 4IW9A 2DJKA 2ZCTA 3M1GA 3LFLA 2GQLA 2CAQA 2REMA 2LJRA 1EOHA 4EDYA 2PPTA 4ZBBA 4JE1A 2DJ1A 2CV4A 4GSNA 4OCFA 1YQ1A 2NTOA 4KSOA 1TDIA 3LYKA 4HQSA 4D73B 3EWLA 4X0XA 2BMXA 3QOUA 3IC4A 5ENUA 4RI7A 1K0MA 4L8EA 5F8BA 3I9V2 1O6JA 2E7PA 2LTKA 1S3CA 4GLTA 1ABAA 1USBA 2VD0A 1EOGA 1QXHA 4FYCA 4DSQA 3CTFA 4MF6A 5G1LA 1VGLA 2N5BA 1XVWA 3TKSE 2CX4A 1F37A 3KEBA 1FG4A 3EINA 3WT1A 3QDNA 3M3MA 1UA5A 1XWGA 4V1Ap 4J56E 1SL0B 4K2DA 1MDIA 3L4NA 2C0FA 3KP8A 2HE3A 2O85A 2YN1A 3D5JA 1GP1A 3ZFLA 4EKZA 4XS4A 2HZEB 2GS3A 2OE0A 1O8WA 4FYBA 1B9YC 3ERFA 13GSA 2E0QA 5INYA 5ECMB 4LLRA 2MMAA 3JCML 1PGTA 4NXIA 4O92A 3A2XA 3GURA 4JBBA 4I6XA 3TDGA 2OJLA 3UMAA 3EU4A 2CAIA 1XWBA 3HVVA 2MYGA 5C00A 1THOA 2FUG2 3F4RA 3CTGA 2I81A 2LRCA 4AJ8A 3IPZA 1YF0A 5FWGA 5A5KA 4ID0A 1ERUA 2FD3A 3QD9A 2OE3A 2LQQA 3P2AA 1I5GA 4WF4A 3BD2A 4WR5A 2PVQA 1FB0A 2JU5A 2GGTA 4KDUA 1M9AA 1LU4A 2VCTA 3FEUA 1XZOA 5DQYA 3D4MA 4OO5A 2JZTA 2X8HA 3GSSA 2MZCA 2WB9A 3EURA 3GUSA 3RHBA 4EO3A 1SU9A 1G7OA 3A3TA 1EGRA 3EC3A 1U3IA 2XBIA 2K9FA 3IOSA 1JLWA 2H6XA 2L59A 2FWEA 4PNGA 3FW2A 4EL1A 5IPHA 2HRNA 4JR4A 4K8MA 2PUKC 5B8AA 4HZ2A 3LYPA 1TK0B 1PMTA 4G19A 5ELAA 4ECIA 1V98A 2CT6A 2G0FA 1X9MB 2WS2A 2OACA 4BWSA 2PWJA 5C04A 1KTEA 1GLQA 2CA8A 2L4QA 3UOMA 4GQFA 4F9ZA 3ERWA 3IE3A 1WE0A 4LMVA 2I1UA 20GSA 3TOTA 2N5AA 4OFTA 2KP2A 4BPYA 4K0NA 2R5GA 3UBKA 1M9BA 1GSFA 3EVIA 1K3YA 3EMPA 4ZB9A 3D22A 3BCKA 3AY8A 2YPMA 1NHYA 3TKQA 1T4YA 3HHVA 3GNJA 2VLUA 3KP9A 3A5WA 2A2SA 5J9BA 2I4AA 2YP6A 4MABA 17GSA 4GF0A 3ZIVA 4IBPA 2VM2A 3VI5A 6GSSA 1XW5A 3MSZA 4MLYA 2GVPA 1NM3A 3DGQA 6GSTA 5D9TA 9GSSA 2C0DA 2IMDA 3C73A 3WGXA 3FR6A 4EDZA 4IQAA 1DSBA 1R4WA 3HJPA 4GQCA 2K8VA 3ZMKA 4ZIJA 4I97A 8GSSA 2HSHA 2YJHA 3F3QA 1SENA 3WYWA 2HXKA 1TRVA 1GTAA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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