2BTOT

Structure of btuba from prosthecobacter dejongeii
Total Genus 20
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
20
sequence length
103
structure length
103
Chain Sequence
IIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDAN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of Bacterial Tubulin Btuba/B: Evidence for Horizontal Gene Transfer.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TUBULIN BTUBA
molecule tags Cytoskeletal protein
source organism Prosthecobacter dejongeii
total genus 20
structure length 103
sequence length 103
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
T PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2btoT00
1B9YC 1V9WA 5AISA 1O8XA 5HQPA 3CMIA 4V2NA 5DQSA 1XIYA 2LSTA 3C8EA 5G5FA 2YZUA 5G1KA 2IIYA 5KEJA 2DJ3A 3I9V2 3DGQA 3VI5A 5DALB 3TOTA 1GTAA 3F9UA 5HR0A 1TK5B 2C80A 1R26A 5KN1A 1BX9A 5LD0A 4ZL8A 5ID2B 2RUEA 4K0GA 5F0GA 2HI7A 4CDOA 18GSA 3APQA 4I8BA 2KP1A 1MEKA 2L5OA 3GNJA 3KXOA 2CV4A 4YAPA 3K8NA 4Z7XA 2VUPA 2MYGA 4POKA 1T00A 3HJOA 1X5EA 4LMWA 3F63A 1PL1A 3TOUA 2YWOA 3EE2A 4K9ZA 2O85A 2G0FA 3BJ5A 4NV5A 5HFGA 4I2UA 4N11A 12GSA 4FIWA 3IE3A 3DKSA 4PNGA 2C4JA 2ON5A 3WD6A 1SD8A 5ECNB 3MWHA 2JL4A 1SKSB 3GKXA 1V57A 2RLIA 1VF1A 3LJRA 1TU7A 5C04A 2YV7A 3L78A 2IJYA 1DUGA 3D0ZA 1ERUA 2VL2A 4ZBDA 3GL5A 4MJBA 2YWMA 1K3LA 3MDKA 3MSZA 2DJ2A 3EU4A 4K8MA 4MH3A 1EV9A 3TRQA 1K0NA 5F05A 5EPFA 3HKRA 2CT6A 2EIOA 3ME7A 2CZ2A 5DDLA 1W4VA 2AYTA 2GDRA 2WS2A 2ZCTA 1SK0A 1JFUA 2WRTA 2IL3A 4TR0A 3C73A 3QAGA 2YP6A 4WBJA 3JCML 1MDJA 1XW5A 2VO4A 1K0DA 4TXOA 1WWJA 1T7PB 4RQXA 2P5QA 4ECCA 3ZYWA 3M9KA 1U88A 14GSA 1GSFA 1V40A 2IPAA 2LNSA 2OKAA 3DIEA 5F8BA 3EU3A 4L0UA 4K2DA 1FB6A 2VCTA 1WRYA 1N8JA 2VL3A 5D73A 3V1WA 1GSEA 4MABA 3LXZA 4XS4A 4YQMA 1M0UA 2GQLA 3VFIA 4ZB8A 5IM9A 2N5FA 3D21A 1EEJA 2WCIA 2B5EA 1H4OA 3ERFA 5B8AA 3FZ5A 1Z6MA 1PX6A 2YJHA 3H4KA 1YJ6A 2I1UA 5JWRB 2FWGA 1C72A 3TB2A 4AGSA 4IP1A 2CA8A 1JHBA 1A0RP 3P8WA 3DMLA 4TVEA 3APOA 2WFCA 5DVBA 3VLNA 1PSQA 5IOXA 3GTUA 3D6IA 4PNFA 2HT9A 4MMMA 2GVPA 2JZSA 4TXOB 3GA4A 1GNWA 1A2JA 1XWAA 3UVHA 3Q6OA 2H1AA 5CAXA 6GSYA 4MF7A 4NMUA 2B7KA 3G7JA 2OE3A 3F4SA 2NPBA 1LBKA 2FWFA 3UL3A 1PX7A 2VAFA 2C0EA 1I9DA 1A8YA 4XS4B 2LRNA 4EF0A 3ZL5A 5D93A 1ST9A 1EP7A 4OCFA 4P3YB 1XVQA 3EURA 2TIRA 4NV2A 2LS5A 3F3QA 1ZCPA 5ECSA 4HI7A 2I4AA 1TP9A 3QFBC 3C71A 2JACA 4L5OA 4QL9A 3IK9A 3ERGA 4N30A 3VWVA 3GMFA 3GL3A 4WF5A 2H6XA 1JLVA 2ES7A 4ILFA 1JZWA 1GTIA 3GTUB 1TOFA 2N5BA 4DEJA 2C8UA 1JLWA 1Q4JA 3VURA 4K1FA 1Z7RA 2FA8A 3ZLPA 3D22A 2FD3A 4H86A 3FYGA 4CW9A 1KEBA 4EE0A 1QXHA 2QGVA 2FNOA 2OACA 5EVOA 1AIUA 5ECQB 2XPEA 3PGTA 2J9HA 2MBTA 4O5RA 2X99A 4IELA 5G30A 3GH9A 4O7HA 3P90A 1FG4A 1AQWA 5EL8A 4K7IA 4N0ZA 4MPFA 2AUVA 2BTOT 4FYBA 1AC1A 1A23A 3RDWA 1VF3A 2IFQA 4JZQA 2YNXA 1K0OA 3DWVA 2H66A 3BCKA 3WT2A 1B48A 2H6YA 4L5LA 2DMLA 5A4UA 1ZYQB 2GGTA 2JZTA 4HDEA 5H5SA 4ULXA 2HSHA 5AGYA 2ZUPA 5IMFA 5ECRB 3BD2A 2R4VA 3DRNA 5J41A 3KIJA 3TKSC 5IPGA 1SJ6A 2LQQA 1ILOA 3GKKA 5KN2A 3GV1A 3EMPA 2F8AA 1X9SB 2KOKA 1SU9A 4Q5QA 1THOA 1Y25A 3GFKA 1ON4A 5A4VA 2ALBA 5FHIA 2CAIA 3ED3A 3KP9A 3CSIA 4BL7A 2E2MA 4ZXGA 1ZZYA 1TK8B 2QSIA 3MNGA 4XRAA 4MZWA 1O81A 1FAAA 4GWRA 1GLQA 2C3QA 2HRFA 1HYUA 5CRGA 1U87A 2H0IA 3CSHA 1IYIA 1K3YA 5IOWA 2K8VA 2NDOA 4F0CA 4XTSA 3VI7A 1MDIA 4TR1A 4HUAA 1J08A 2A4VA 1FO5A 3PH9A 4IS0A 3L9VA 3O3TA 2IFQB 2VLUA 3HXSA 3N9JA 2TRXA 4YQVA 3KMNA 1B4PA 20GSA 2CQ9A 2HXKA 3BBYA 4IQ1A 4J57E 3CYNA 2GTUA 3FKFA 2H1GA 5CRDA 4IKHA 4PX1A 3UEMA 2FGXA 2XPDA 4OMVA 4LL1B 3FR3A 4KUNA 2CVDA 4LLRA 3H8QA 4WBRD 2D2ZA 4JEDA 1XWGA 4PQ1A 4KDUA 4AJ6A 2GQMA 1PGTA 3DYRA 2P5RA 2IN3A 1O85A 2I9HA 5B7CA 2FA4A 3F4RA 2L6DA 4GF0A 5G2ZA 3TRPA 3A2XA 3D4MA 3P2AA 1SKRB 2K6VA 2V1MA 2GZZA 1SL0B 2RM6A 2CX4A 4EO3A 1RW1A 2DJJA 1EGOA 5CP1A 3TUEA 4GSSA 4HOJA 4TOPA 5G5EA 5HFKA 3W8SA 2H6ZA 3QAWA 3R2QA 3KH7A 3L9SA 4FYCA 2OA7A 2LJAA 4TR1B 1G7OA 3KD0A 3ZMKA 2DJKA 1X9MB 3IPZA 2H71A 4EDZA 3EWLA 1N2AA 3U6VA 5JCGA 2DLXA 3UBLA 5B8BA 3FHKA 4V2MA 2WDUA 4TN8A 3QFAC 4FO5A 2C3TA 4JR6A 1TK0B 5D9TA 2JADA 2PVOC 10GSA 5D9XA 3H79A 3ZITA 4OO5A 2V6OA 4K7NA 1YKCA 5CYYA 1LU4A 1GH2A 4XIHA 4BVXA 4MPGA 4GQFA 4XRDA 4KA0A 1XW6A 3QD9A 1Z5YE 4HJ2A 2VLVA 1QFNA 2TRCP 4ISDA 3TDGA 3WGEA 1TI1A 3WGDA 1E6BA 5IQYA 4MJCA 5G31A 1ZOFA 2XC2A 3EINA 4GXZA 4N10A 1AW9A 1HNCA 1T3BA 3UJ1A 3RAZA 1KTEA 5CRWA 2VOCA 4IQAA 1FVKA 3TGZA 1SK1A 3ZIJA 4KSOA 1YEPA 2WB9A 2H30A 1S3DA 4YH2A 3M1GA 2PERA 1QUWA 4I6XA 4PQIA 17GSA 1GP1A 4X1UA 3J7Yk 1W89A 1QGVA 4ML1A 1ABAA 1HNBA 3HYPA 1ERVA 3QDNA 4DSQA 1JZRA 4DSRA 5LCZA 5JCWA 3D5JA 3QR6A 1NSWA 1YF1A 3GRXA 3TJGA 2RUFA 1YQ1A 2H01A 3ZZXA 3LWAA 5IMCA 1V58A 4TXVA 2MBSA 5GSSA 1TJDA 3NOFA 2K8SA 1OAZA 2IWTA 4Q5FA 2BMXA 3KH9A 1B8XA 2HFDA 2VD0A 1EGRA 5A5KA 4ECIA 2CVKA 1T8EB 3LYPA 4WR4A 4JRRA 1FB0A 3F4TA 3IR4A 1GLPA 1Z3EA 4K7OA 1TXXA 3D4TA 3C1RA 1EOGA 4MZBA 1XWCA 2YN1A 6GSTA 3UBKA 1K0AA 2HE3A 3LXTA 2MMNA 2IMDA 2E7PA 5CO3A 2IMIA 3OR5A 4WKWA 2MMOA 4TR3A 2LV3A 4XHMA 3IBHA 2B5YA 1GULA 4DSSA 5JWQB 2M72A 4NAXA 1EZKA 2OE1A 1UVZA 4I2TA 2VL9A 4LA1A 3TJBA 2L6CA 1QMVA 5COHA 19GSA 4K6XA 1R5PA 1AXDA 3IC4A 2YZHA 8GSSA 1YEXA 4NHZA 4EKZA 2VCQA 2C3NA 5G1LA 2Z9SA 1Z6NA 3GN3A 1TKDB 2WGRA 1GSYA 5E59A 1F2EA 3LFLA 1XCCA 1GWCA 3GURA 4MZCA 4ZB6A 1B4QA 3CRUA 1E2YA 3A2VA 1F3AA 3RBTA 3FR6A 4PQHA 1NHYA 4QL7A 1CQHA 4MA9A 1JZDA 1SENA 3GYKA 1V98A 3I69A 3KCMA 3VWWA 1PQNA 1FHEA 2O7KA 1Z9HA 1M99A 9GSSA 4HZ4A 1RQMA 3SWLA 1PD21 2HZEA 4JR4A 1EOHA 3UVTA 4WR5A 1KBNA 4FH8A 3CTGA 3HY2A 2X8HA 2VL2C 3F8UA 4G19A 5ABRA 1U6TA 1WOUA 1ERTA 4DSSB 5DQYA 1GTUA 2H19A 4GSNA 3GHAA 4RQRA 3KZQA 2CZ3A 2YWNA 1M7TA 4HU7A 2PN8A 1WMJA 3FZ9A 3DEXA 4GSTA 1BEDA 2WZ9A 6GSSA 1Z7PA 1GNEA 1WIKA 3L0HA 2H0HA 3LGCA 1BAYA 4IW9A 2IMKA 1MDKA 4OFTA 1FVJA 1WPIA 2ZNMA 3ZMLA 5DBQA 3E3EA 3EC3A 1YDKA 2AAWA 2F8FA 6GSXA 3FRCA 3TKRA 4TRXA 1WP0A 2I3YA 4HJMA 5ECIB 1G6WA 1H75A 3ZVJA 3KEBA 2LTKA 3IA1A 2XHFA 1SKWB 3M0FA 3GH6A 1V2AA 3A2WA 5IMZA 5DJMA 2NVLA 5GSTA 4E8EA 16GSA 2GSTA 2KLXA 3TCOA 4XS6A 2HZEB 2C0GA 4EL1A 3ZTLA 3KM6A 4OD7A 2A2SA 4IHUA 2AV4A 4EDYA 1U3AA 2JU5A 4POLA 2H0GA 2GS3A 4MLYA 5JWOB 5H5QA 2EIRA 3EVIA 4MK3A 3QPMA 1R5AA 3U5RE 3ZREA 1GSUA 4JE1A 3ZIVA 1SJZA 2O87A 3FZAA 4ZILA 3UIWA 1X5CA 1ZGNA 3ZFBA 2FUG2 3ZRDA 1J0FA 2JSYA 5DCHA 2XBQA 4ZIJA 1XVWA 4V1Ap 1T4YA 2CAQA 2LNTA 4OCEA 3KTLA 2PVQA 3A3TA 5F07A 2O8VB 2DJ1A 4JBBA 1DSBA 3UAPA 2H1DA 3GSTA 2R5GA 3PINA 4AJ7A 5ECPB 3VPQA 2DC5A 4RI7A 4QQ7A 1O7UA 4Q5NA 3RHCA 4MJEA 3UARA 1K0BA 5IPHA 4IVFA 3PR8A 2B1KA 4KGIA 4IP6A 5DJLA 1QK8A 4I97A 4KB3A 1VF2A 3ISOA 1UN2A 4F0BA 1XBSA 2B5XA 1J9BA 5J3RA 2BJXA 2V32A 1THXA 2VM1A 2MMZA 2YCDA 3UOMA 4PXOA 1OC3A 4G10A 5D96A 4X43A 1MD3A 1OYJA 4BA7A 2C0FA 3HZ4A 2NBSA 3H1NA 4PUAA 4OFNA 1QQ2A 5HR2A 4J56E 5DAKA 1Y6EA 1G6YA 3HJPA 2PU9C 2NTOA 2LJKA 3QAVA 2G2QA 3ZVJD 1TW9A 5EY6A 2X8CA 6GSWA 2MZCA 4BWSA 5AIVA 1GTBA 4RI6A 4F9ZA 3HHVA 1GSQA 3F0IA 5ECKB 2WJUA 1OVNA 1SK2A 3NZNA 1SD9A 4F2IA 2YPMA 5J9CA 2H74A 3QMXA 5JCUA 4ZBAA 1O8WA 4G2EA 3RPNA 2L4CA 1M2BA 1GSSA 1X0RA 2N5AA 4PGTA 2VM2A 3BCIA 3L4NA 2O89A 3FEUA 1ZMAA 5IO2A 1PL2A 1R4WA 2FY6A 4MDCA 2AHEA 4KH7A 1M2AA 5ECMB 3IOSA 7GSSA 1PA3A 2F51A 3KMOA 1XPVA 1ZYEA 1YY7A 1A2MA 3SBCA 1NM3A 5ECLB 1YKAA 3AY8A 1URMA 2PUKC 2VCVA 1U3IA 2R2JA 3Q18A 3TKPA 5GAND 1EP8A 3KJYA 3ERWA 3TJFA 4PUFC 1A2LA 3DD3A 2LRCA 1OKTA 2DBCA 5DAKB 5GZZB 2A2RA 13GSA 1OE8A 5J5NA 1AAZA 1GRXA 3HA9A 4MF5A 2ON7A 2LKUA 1S3AA 4BWQA 1OKDA 4WEYA 2GZYA 2V6KA 2LJRA 3N5OA 4KAEA 4KCEA 2KUCA 2RIIA 3IRAA 2OADA 5HR3A 1AUCA 1EV4A 1TRSA 3GKMA 3WT1A 4L8EA 2B7JA 3VWUA 3VWXA 1MTCA 1XXUA 3CSJA 5AIXA 2VD1A 4WETA 2YWIA 2HLSA 2DJ0A 4EXJA 1GSDA 2LEGA 3GSSA 3LYKA 4JU5A 2JZRA 3DVWA 2H1BA 1PKWA 1F9MA 1AQVA 2EC4A 3HCZA 2VCWA 4TKYA 1BYEA 1TRVA 1T4ZA 1MD4A 2GT6A 2HNLA 1RK4A 4MP4A 11GSA 2K9FA 5ECOB 1SL1B 5DCGA 2VLTA 4TR4A 6GSUA 3LG6A 4ZL7A 1A0FA 4HEA2 5GAPD 1M9BA 2DIYA 3G7YA 1OE7A 5LNKe 3F6FA 1WE0A 3VPTA 3GX0A 4OWYA 4CHSA 3TKQA 2CVBA 2REMA 2E2GA 4IJIA 4KCAA 2FCHA 5ECHB 1K0CA 1I5GA 2LQOA 5AN1A 1EEMA 2L5LA 3W6GA 4X0XA 22GSA 2R6KA 3TJJA 1OC9A 3LORA 2EIQA 3M8NA 4EC0A 3RPPA 2KHPA 2MMAA 2OBIA 5IMVA 3IXRA 4NPBA 2LRTA 4EVMA 5A4WA 3TKSE 2LUSA 1F6MC 2KP2A 1UA5A 5FWGA 3KTBA 2C0DA 3QOUA 4L0WA 3APSA 1G7EA 2RM5A 3ME8A 2M80A 1DE2A 4PURA 4MCUA 3WGXA 2F9SA 3IHQA 5B6NA 4ECBA 2GSSA 3C1SA 2OBKA 1S3CA 2VCXA 3LEFA 2FWEA 3IAS2 1FW1A 5HR1A 2DMMA 1XWBA 1HD2A 3F3RA 3IK7A 3TJKA 1F37A 1BJXA 3HDCA 1CQGA 3CTFA 4NXIA 5D8IA 4YQUA 1VF4A 4O92A 2HSYA 3LQ7A 5KN0A 2I81A 4ML6A 5D9VA 2HYXA 3A5WA 4GCIA 1A8LA 5INYA 4KX4A 4IBPA 2R3XA 3EMXA 5ELAA 1HQOA 3CXGA 1OC9B 2V41A 3FK8A 5C00A 3TKSA 5E4WA 2PWJA 3F6DA 3HD5A 2QC7A 2H75A 4IJ3A 2F3MA 3G9BA 3HZ8A 1DE1A 3HVXA 1XOAA 4WXTA 3GIXA 5HFIA 4ID0A 4ZBBA 4F03A 3KP8A 4POMA 2FHEA 2PPTA 1NHOA 3P7XA 1PMTA 1DBYA 3S9FA 2GLRA 4HS1A 4YAVA 1SYXA 4GRFA 3J7Yb 1JZOA 1UC7A 2X8GA 1SYRA 2L4QA 2WULA 4KNDA 4OO4A 1TRUA 1YZXA 1BQ7A 5ENUA 1BG5A 5IIZA 3Q74A 2HRNA 3CRTA 4D73A 4ZB9A 4G9HA 1LJRA 5KN3A 1X9WB 3DVXA 3FW2A 1XFLA 3IDVA 3MAKA 2VIMA 4IGJA 3GUSA 1G0TA 1YF0A 4Q5RA 1R7HA 2C1YA 2GQKA 2YV9A 2FWHA 5IO0A 4LL4B 4BPYA 2X64A 1O73A 2PMTA 2H73A 3NIVA 2B3SA 5IMAA 1K0MA 2DSAA 3M3MA 4KE3A 1PRXA 4KSMA 4ZL9A 5ELGA 1TI3A 2XBIA 4HZ2A 1AQXA 4MH2A 2PGTA 3FY7A 4V1Ag 4V2LA 2L57A 2CX3A 4KDXA 4ACSA 3KGKA 4FYUA 5H5RA 1TDIA 1EWXA 1SJIA 3BOAA 3H93A 3HJMA 2P31A 4N0VA 4ECJA 1GUMA 3GKNA 3HVSA 1XZOA 5IMDA 1USBA 1NW2A 3FR9A 2L59A 3DXBA 1Q98A 2J23A 4XS1A 3I6AA 4K0NA 1B9XC 4HQZA 1XOBA 2JSZA 2R37A 4IN0A 4WF4A 3E9JB 5J4UA 3W8JA 1M2DA 5F06A 4D73B 3LSZA 1TTZA 2GT5A 1ZL9A 2HZFA 2PBJA 2H72A 5FT3A 3ZFLA 4OFMA 3IAM2 2IMEA 1XWKA 1O6JA 1PN9A 5J9BA 2B1LA 4AJ8A 1T1VA 1GUKA 4F82A 2AJQB 3VK9A 1FOVA 3TRXA 1ACVA 4HU9A 1M9AA 1TU8A 5D9WA 3WYWA 2YJ7A 3IV4A 4E8HA 1GUHA 2QKEA 4TW5A 2E0QA 2IMFA 1X5DA 4AF2A 4GTUA 2GSQA 1OC8A 3QCPA 3E0UA 4MJAA 2GSRA 1IYHA 2FLSA 4NWYA 1WJKA 5CNWA 4I5QA 3RHBA 3M9JA 2P0GA 2M46A 5CRHA 5DALA 1ERWA 4O32A 5L71A 1TRWA 4EUYA 3EYTA 5ID2A 3HVVA 2DIZA 4POBA 1F3BA 4DVCA 1PKZA 2OJLA 4HQSA 1A24A 3FZ4A 3O76A 3O6TA 3G7IA 2GZPA 3L9UA 1XW9A 2AB6A 1VGLA 3GX8A 1HNAA 4BVYA 4XCSA 5CREA 3Q19A 6GSVA 3I43A 4GLTA 4J2FA 1SL2B 3UMAA 1GL8A 2B6MA 2YANA 4NHWA 2OE0A 1K3OA 4KDYA 3C7MA 2K18A 1VRSD 2YOIA 1KNGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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