2CVBA

Crystal structure of a thioredoxin-like protein from thermus thermophilus hb8
Total Genus 55
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
55
sequence length
187
structure length
187
Chain Sequence
LQYPELPLESPLIDAELPDPRGGRYRLSQFHEPLLAVVFMCNHCPYVKGSIGELVALAERYRGKVAFVGINANDYEKYPEDAPEKMAAFAEEHGIFFPYLLDETQEVAKAYRALRTPEVFLFDERRLLRYHGRVNDNPKDPSKVQSHDLEAAIEALLRGEEPPLKEAPAIGCTIKWRPGNEPEVRIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a thioredoxin-like protein from Thermus thermophilus HB8
rcsb
molecule keywords probable thiol-disulfide isomerase/thioredoxin
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Thermus thermophilus
total genus 55
structure length 187
sequence length 187
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2cvbA00
3CTFA 2C4JA 2N5BA 3TRPA 4D73A 3CRTA 3ZLPA 2BMXA 3LYKA 1Z7PA 2YANA 1WWJA 1GTUA 1M2DA 1SKRB 4I2TA 3TUEA 2GZZA 3TB2A 3US3A 2L6CA 2L57A 4MA9A 4OFMA 1A2MA 1LU4A 3GKXA 2X99A 3GL5A 4ZL7A 3FRCA 2GSSA 4G2EA 2VCQA 2DBCA 3EINA 3HZ8A 3EURA 1B48A 3M9KA 1AQWA 2YJ7A 3IOSA 4MJCA 3TKSC 5B8BA 5F0GA 2WJUA 4HUAA 1SD9A 3S9FA 1VF4A 5FWGA 5FHIA 2VIMA 2CX3A 3IR4A 4ID0A 1T7PB 3J7Yb 4MABA 4GSNA 1AXDA 2JZTA 2DJ2A 4NHWA 2H0GA 5E4WA 2IPAA 3TJFA 5F8BA 5ECLB 3EU3A 1Z6MA 4J56E 5H5RA 2IMKA 3KEBA 5H5QA 1TJDA 4LL4B 3NIVA 2V32A 4PNFA 3GNJA 1JZWA 4X43A 5DCGA 1KEBA 3O6TA 5IMDA 1BQ7A 3D4MA 2DMMA 3HJMA 3V1WA 1EV9A 2NDOA 1AQVA 1R5AA 5ECMB 4K7OA 3VK9A 19GSA 4WF4A 2YWOA 4PQIA 3FW2A 3CSHA 3TJKA 2KHPA 1HNCA 1J9BA 5HFGA 5IMAA 3ERFA 3QAVA 2IMEA 3GMFA 3HHVA 1GSDA 4MZWA 1JLWA 2A2SA 3K8NA 3H79A 4ZL9A 1OC9A 2JL4A 2E7PA 2LRNA 1PGTA 3A2WA 1XBSA 3I43A 4HS1A 1TTZA 1ST9A 2LEGA 1TW9A 2KUCA 3DWVA 2M80A 4DSRA 1YZXA 4BWSA 4WEYA 2XHFA 1ABAA 2HT9A 4AJ8A 2DJ1A 3IA1A 4F2IA 1PX7A 3APOA 1Z3EA 2YV7A 1X9WB 2C3NA 1G7EA 3QAWA 3KD0A 3ZTLA 2CVBA 3ZL5A 4F9ZA 3H93A 1S3AA 2CVKA 3F4SA 4FYCA 4WXTA 1NSWA 2C0EA 4LMVA 3KH9A 1HQOA 1WOUA 3H4KA 1WE0A 2FHEA 5J9BA 2H75A 2AB6A 3NZNA 2F9SA 3LXTA 5F07A 1VRSD 1O81A 3C7MA 5LD0A 4NPBA 1ILOA 3IC4A 3IV4A 1ON4A 5EPFA 4HU7A 5ECHB 3F3RA 4N10A 5GSTA 2LRCA 1TU7A 5GAND 2AYTA 1Y6EA 1EOHA 1T1VA 4OD7A 1O85A 4K7IA 4NV2A 3PINA 4IP6A 2LQQA 2YWIA 4O32A 1JHBA 1LBKA 2CQ9A 4GF0A 2HE3A 2IN3A 5LCZA 2WDUA 4HZ2A 3UBKA 2V6KA 2C0FA 3L9UA 2L4QA 3R2QA 2DMLA 4OCEA 1M7TA 4X1UA 5DALA 1AW9A 2YNXA 2IWTA 3TRXA 5D9XA 4ILFA 1OE8A 2FCHA 3TKSA 4IW9A 4PUFC 4BL7A 1YQ1A 3LWAA 4IELA 3FY7A 1TP9A 1SJZA 3A5WA 4V2NA 4EF0A 2VAFA 3ZRDA 3IK7A 2LV3A 2K9FA 2R2JA 2A2RA 2GTUA 1Z5YE 3IXRA 4NMUA 4XRDA 3L9SA 5G1LA 2NBSA 2CVDA 4EC0A 1XPVA 1SJ6A 2TRCP 5DJLA 4YQVA 3FZ5A 4GRFA 2L6DA 1GNWA 4JR6A 4KAEA 2DJJA 2CAIA 2MMNA 3FK8A 1B9XC 17GSA 1FHEA 2H66A 1TXXA 3KIJA 2DJ0A 5JWRB 4MDCA 4AF2A 4WKWA 2GLRA 4EKZA 4WF5A 7GSSA 3C71A 4JR4A 4OO5A 4CHSA 5G5EA 4O5RA 5ID2A 3TRQA 2P0GA 4K0NA 3DXBA 3F9UA 4NWYA 4YAPA 5IMVA 3EYTA 3UARA 1YF1A 4FIWA 4G9HA 2L5OA 1QXHA 2REMA 2WGRA 4V1Ap 1U87A 1GSUA 4HQSA 4ULXA 5HQPA 4TOPA 2B1KA 3RAZA 4LLRA 5CAXA 2LJRA 4TXOA 3W6GA 1U6TA 2EIOA 5IO0A 3WD6A 3D4TA 2K8SA 1F6MC 3VWUA 3TDGA 5C04A 4Q5NA 5B6MA 1ZGNA 2AAWA 1SL0B 2P31A 5JWQB 2H72A 1O8XA 3ERWA 3HYPA 1OKDA 1G0TA 3DMLA 1TK8B 5ECQB 2IMDA 3E9JB 5KN0A 2WULA 2DJKA 4RQXA 3DGQA 2C0GA 1V57A 3CRUA 1F3AA 4V2MA 2GQKA 4TR1A 4XHMA 2F51A 3ZVJA 5JWOB 1K0DA 1GLPA 1MDJA 4XS4B 3HA9A 2C3QA 4TKYA 4BWQA 4Q5FA 4IN0A 3M3MA 5CO3A 1TI3A 5HFIA 13GSA 2MBSA 2WCIA 3GA4A 2XBQA 2H30A 3Q74A 5HR3A 4DSSA 1A23A 5DALB 4HZ4A 3G7IA 2JSZA 4MJBA 1PKZA 4ZB6A 3GHAA 5GAPD 1YY7A 3LYPA 1GP1A 3LJRA 5EVOA 5IPGA 1QK8A 2VCZA 3KP8A 4MH2A 4Z7XA 3ME7A 2OBIA 5JCUA 5CRGA 5H5SA 14GSA 2EIQA 4FYUA 1HNAA 2X8CA 4JU5A 1FW1A 1AQXA 3AY8A 3F6DA 3EC3A 3HKRA 4AJ6A 1A2LA 2V41A 4DVCA 2DC5A 1QUWA 2NPBA 4ECCA 2FNOA 4Q5QA 3BCIA 3TJGA 1PA3A 3DD3A 4ZBBA 2PVOC 4N30A 4MJAA 4HQZA 1VF3A 1EGOA 3IE3A 2C8UA 4POBA 3KP9A 1JLVA 2VM1A 3RBTA 3H1NA 1OVNA 3WGDA 2B7KA 4PURA 1XVQA 3M9JA 2GQMA 3IHQA 4YQUA 1F9MA 2HFDA 4EE0A 3VPTA 1EP8A 1T3BA 1XWCA 4XS1A 4I5QA 5IIZA 1TRWA 2F8AA 3A2VA 3KZQA 2BJXA 1J08A 2R37A 3APQA 1IYIA 3FZ9A 2NVLA 3FZAA 5DQYA 1WMJA 4ZB9A 2XC2A 2E0QA 3RHBA 3VURA 2B6MA 4KX4A 2LS5A 2H6XA 2FGXA 4EUYA 1DBYA 4PXOA 4O7HA 1SL2B 1URMA 3CYNA 5DJMA 1UVZA 3GN3A 1N2AA 3TJJA 5B6NA 5IOWA 3GV1A 2VO4A 5J3RA 3EE2A 1O7UA 1K0MA 2OE1A 4F0CA 18GSA 1T4ZA 1GTIA 2O85A 1GSSA 3C1RA 4ECJA 1OYJA 2WB9A 1Z9HA 1DE1A 1C72A 1RQMA 2VL9A 4TR0A 3QAGA 2LKUA 1F3BA 1M9BA 1A0FA 4ECIA 4EDZA 6GSUA 5AN1A 2V6OA 2D2ZA 3GTUA 3U5RE 4MPGA 4RUVA 4P3YB 3KCMA 3VI7A 4MH3A 1U3IA 3C1SA 10GSA 5J9CA 2HSYA 3ZFBA 2CZ2A 2FY6A 5DCHA 4G19A 2K18A 2OE3A 3J7Yk 1ML6A 2H19A 1NW2A 2ZCTA 3D22A 4L5LA 5IOXA 1GSFA 3FR6A 1X0RA 4KUNA 3DEXA 2VCWA 4L0UA 1A2JA 4RI7A 1SKSB 11GSA 2O89A 4DSQA 5D9WA 1JFUA 1EWXA 2XPDA 3PH9A 5ECKB 4BPYA 2OADA 2RM5A 5CYYA 3DRNA 3HZ4A 4GCIA 3GURA 4EVMA 2XBIA 1T4YA 1OC8A 2B5XA 5INYA 3OR5A 4MPFA 4AJ7A 4PQ1A 2HZEA 1B4PA 4GQCA 4EO3A 4KSOA 2YWMA 2H71A 4MMMA 3F0IA 1XCCA 1GH2A 1XFLA 2BTOT 4K6XA 2C0DA 1BJXA 4J2FA 1XW5A 3TKSE 3O76A 1W89A 6GSWA 3QMXA 1T00A 3DVXA 2J23A 6GSYA 2H70A 2G0FA 1MEKA 2H76A 5G5FA 1CQHA 4ZBAA 2LSTA 3E3EA 3M0FA 2R6KA 4PUAA 1NHYA 2K8VA 2MZCA 4D73B 4CW9A 4KDYA 1PQNA 1F2EA 3F4TA 5IMZA 2PPTA 1WJKA 3FYGA 1TRSA 4TW5A 2VCTA 4QL9A 1GSQA 3GSTA 3FR9A 1F37A 4MCUA 3F3QA 3ZZXA 4JRRA 3H8QA 1E6BA 5AISA 5D9VA 1PX6A 3VPQA 1RK4A 4L5OA 3ZIVA 2QKEA 2KP1A 2QGVA 4ECBA 1GLQA 1K3YA 1MDKA 4MF7A 1A8YA 5ABRA 3A3TA 4FYBA 2CAQA 1H75A 1V9WA 2L59A 1M2BA 1K0OA 1BEDA 3FZ4A 2N5AA 1GRXA 3LORA 1GL8A 3IAM2 4XRAA 2GS3A 1EV4A 2KLXA 2IMIA 5ELGA 2GGTA 3MWHA 3D6IA 3EWLA 22GSA 1MTCA 4HJ2A 2CT6A 2H0IA 1M9AA 3N9JA 2HNLA 1Q4JA 3ZMLA 1UA5A 2B5EA 2JZRA 3FR3A 2ZUPA 4PX1A 1THXA 3JCML 2VCXA 2FWFA 3MNGA 1EOGA 1ERTA 2H74A 2DLXA 4XCSA 3RPNA 1ZL9A 5A5KA 1SENA 5KEJA 2PUKC 2VD0A 4N0ZA 5CREA 2YZUA 4TN8A 1SK2A 4J57E 3MSZA 2PBJA 1XWKA 2GZPA 2VCVA 5IMCA 12GSA 1IYHA 1XOBA 1S3CA 2VL2C 2LTKA 4POLA 3O3TA 4FH8A 5AIVA 3E0UA 2B3SA 4GLTA 2LNTA 1SU9A 2HI7A 2B1LA 3TKQA 1XW9A 1OC9B 2VM2A 4GQFA 4N0VA 4XIHA 1NHOA 5CP1A 4PGTA 4IGJA 1O6JA 3A2XA 3RPPA 3ERGA 2HSHA 5DVBA 4I8BA 4GTUA 5COHA 2PN8A 6GSVA 5DAKA 1A0RP 2QSIA 2VLVA 1AIUA 1EEJA 3SWLA 2DIYA 1KNGA 1R4WA 5G1KA 1ERUA 1VF2A 4LL1B 4WBJA 1XZOA 3GFKA 1K3OA 2FA8A 3I6AA 1R26A 4MJEA 5D73A 4GXZA 3HVVA 3N5OA 1JZOA 1V40A 4NV5A 2B5YA 5F05A 1K0CA 2IIYA 3LFLA 5D96A 1K3LA 1GTBA 4IHUA 8GSSA 4HJMA 1E2YA 1CQGA 1XWBA 4PNGA 3GKMA 5EL8A 3ZREA 5J4UA 1ACVA 2OKAA 1V2AA 3KH7A 2MBTA 3WGEA 1TOFA 1FAAA 2CA8A 3NOFA 4BVXA 3LG6A 3VI5A 3WT2A 3TCOA 2C80A 1UN2A 1HNBA 1MD3A 1G6WA 2KP2A 3HD5A 1DE2A 3M8NA 1EZKA 1M2AA 1V58A 1B8XA 3UBLA 4JZQA 2I3YA 3D5JA 4ML1A 3ZVJD 2YN1A 1ZMAA 2ZNMA 1H4OA 3CXGA 1X5CA 6GSXA 3QCPA 1Z6NA 4KNDA 4KA0A 1A8LA 1SD8A 3GKKA 2GZYA 2EC4A 3CSIA 3HVXA 2GDRA 1ZCPA 2X8HA 20GSA 5CRDA 1WRYA 1O8WA 1OE7A 1XWAA 5G31A 4EXJA 3Q18A 3LEFA 3TKRA 1BYEA 3HJPA 1TI1A 4POKA 4RI6A 3APSA 4E8EA 3P7XA 4ISDA 1XXUA 3IAS2 2ON7A 1VF1A 4JEDA 5A4VA 3EMXA 3D0ZA 3KMOA 4JE1A 3LGCA 4LA1A 1U3AA 3WGXA 3EMPA 1X5DA 5ECSA 3IBHA 4TVEA 3UAPA 1TKDB 5JCWA 1BG5A 1AUCA 5ECNB 5D9TA 1X5EA 3QOUA 1YEPA 3GIXA 5AGYA 4K0GA 1GUKA 1U88A 4V2LA 2DJ3A 3BOAA 4KE3A 5ID2B 5A4UA 2KOKA 4V1Ag 2YZHA 4Q5RA 4KCEA 4GSTA 1QFNA 2LJKA 2WZ9A 1A24A 2RUFA 3HVSA 3CMIA 6GSTA 1PL2A 2MYGA 1SJIA 2VL2A 3IK9A 3G9BA 3ZITA 2JU5A 1QGVA 3KJYA 2F3MA 4TR4A 4TXOB 2JADA 1ZZYA 1W4VA 2GVPA 1HD2A 2YP6A 4F82A 5DAKB 3GSSA 1TK5B 4ZILA 1BX9A 2RUEA 3L9VA 2HYXA 5IM9A 1XOAA 6GSSA 3KXOA 1RW1A 1WP0A 2H1GA 3QDNA 1PSQA 5ELAA 2DSAA 2O87A 1ERVA 5DBQA 4OMVA 2H6ZA 3QD9A 2GT5A 3IDVA 3BBYA 2L4CA 2HLSA 3U6VA 2XPEA 2OA7A 1EGRA 1FB0A 2H1BA 4TR3A 3LXZA 1GTAA 5D8IA 3QR6A 1FVJA 1YEXA 1XIYA 3KGKA 1GSYA 4I97A 4L8EA 4K7NA 4TR1B 5ECOB 3BCKA 3M1GA 1PKWA 2GSQA 4YAVA 4E8HA 1K0AA 1QMVA 1FG4A 4HDEA 2MMZA 1AAZA 1G6YA 3HY2A 5ECIB 4RQRA 2EIRA 4FO5A 1ZYQB 2OACA 3QFAC 3CBUA 5G30A 2YWNA 1R7HA 3D21A 4PQHA 4NXIA 5DQSA 2JACA 3KTLA 1M0UA 5CNWA 1YJ6A 3G7JA 1EEMA 1B9YC 5EY6A 4EDYA 3WYWA 2OJLA 1PL1A 1X9SB 1BAYA 4DSSB 2JSYA 2IJYA 2I1UA 2VL3A 4AGSA 4MP4A 3W8JA 3TJBA 4OFTA 3F4RA 4NHZA 3CTGA 2WFCA 2R3XA 4IKHA 2PGTA 2YOIA 3QFBC 1Z7RA 2NTOA 3HXSA 1XW6A 2X64A 1SYXA 1ERWA 4KDXA 1GUHA 1TRUA 4ZIJA 4OWYA 2H8LA 4TXVA 2YV9A 3UVHA 4WR5A 1TK0B 5FT3A 3ZMKA 4HOJA 2TIRA 1X9MB 3HDCA 3GH6A 5A4WA 2FWHA 1WPIA 4ACSA 5ENUA 1FB6A 1T8EB 1TDIA 5HR0A 3ZFLA 2P5QA 4JBBA 2M46A 1B4QA 4X0XA 3G7YA 1R5PA 3VWVA 4WBRD 4I2UA 3F6FA 3LSZA 5HR2A 5L71A 2AJQB 3PGTA 2GQLA 3KM6A 2M72A 1I5GA 4MZCA 4ML6A 5B7CA 4YQMA 1GUMA 4XS6A 4KH7A 2E2GA 3FEUA 4BVYA 1SK1A 3EVIA 3MAKA 1KBNA 3RDWA 5KN2A 4ZB8A 1XWGA 4LMWA 3UL3A 4ZL8A 1PD21 2YCDA 2RIIA 4IJ3A 1ZYEA 3L4NA 2IMFA 1J0FA 3VWWA 4TRXA 5CRHA 2FWGA 3WT1A 1ZOFA 4XS4A 2H73A 1G7OA 1V98A 1XVWA 1YKCA 2X8GA 4N11A 4QQ7A 2YJHA 4L0WA 1TU8A 2VLTA 2R5GA 3GKNA 4K2DA 3ZYWA 5F06A 4ZXGA 3KMNA 3VWXA 4KDUA 4EL1A 3EU4A 2AUVA 3P8WA 4MZBA 3DYRA 3GTUB 4QL7A 4OCFA 2OBKA 3P2AA 5GSSA 3QPMA 4K9ZA 2IFQA 2LUSA 3ME8A 5E59A 2AHEA 5ECPB 2ALBA 16GSA 2F8FA 2E2MA 2CV4A 2IL3A 3UOMA 2O7KA 3BD2A 1SK0A 1JZDA 4KGIA 3SBCA 1K0BA 3GRXA 4GWRA 2ON5A 3LQ7A 2PERA 2I81A 9GSSA 3PR8A 5IQYA 4KW6A 3UEMA 4IP1A 3UMAA 3UIWA 5HR1A 2HZFA 1Y25A 1O73A 2VD1A 1AC1A 2FD3A 2PU9C 3C73A 4IBPA 3F63A 1SYRA 1MD4A 1KTEA 3DIEA 3CSJA 2ES7A 1OAZA 3IPZA 1USBA 3Q6OA 5KN3A 3MDKA 2V1MA 4HI7A 2HZEB 2RM6A 5IMFA 1EP7A 2L5LA 2PMTA 3GYKA 4H86A 3UVTA 3TGZA 3ZIJA 3FHKA 2H01A 2FA4A 1PN9A 5ECRB 2LNSA 5JCGA 4WETA 2QC7A 3UJ1A 2FLSA 5KN1A 5AIXA 3L78A 4POMA 3RHCA 3GL3A 3TOTA 2GSRA 2FUG2 4IS0A 1GULA 1SL1B 5DDLA 2VUPA 1WIKA 2A4VA 4CDOA 4K1FA 2C1YA 3GX0A 2H0HA 4HU9A 4GSSA 2CZ3A 1UC7A 4OO4A 1Q98A 2GSTA 2PVQA 2MMOA 3BJ5A 1DSBA 1M99A 5G2ZA 3IRAA 1PRXA 2G2QA 2HXKA 1SKWB 1FOVA 4MF5A 2R4VA 4IQAA 2O8VB 2N5FA 5CRWA 1YKAA 4MLYA 2H1AA 1THOA 2VLUA 3GH9A 4NAXA 4WR4A 3HCZA 2AV4A 1N8JA 2JZSA 3TKPA 1I9DA 1NM3A 5HFKA 1OC3A 4MK3A 4OFNA 2YPMA 2GT6A 2HRNA 2Z9SA 4IQ1A 4DEJA 1LJRA 2V2GA 4O92A 2WRTA 5LNKe 3L0HA 3F8UA 4MF6A 4I6XA 3VFIA 3HJOA 4BA7A 4K8MA 2PWJA 3VLNA 2LJAA 2HRFA 4F0BA 1GSEA 1YF0A 2I4AA 2B7JA 4HEA2 4YH2A 1TRVA 4KCAA 4XTSA 4IJIA 1MDIA 1OKTA 1HYUA 3P90A 1QQ2A 3C8EA 2P5RA 5IPHA 1DUGA 1JZRA 3ED3A 3I69A 2IFQB 1YDKA 2K6VA 1GWCA 5D93A 4KB3A 4F03A 1K0NA 3DVWA 3DKSA 3TOUA 2I9HA 1VGLA 3ISOA 1PMTA 4KSMA 2J9HA 1FO5A 2LRTA 1FVKA 2MMAA 5B8AA 5GZZB 5J5NA 4ZBDA 4G10A 2H1DA 3GUSA 5J41A 3I9V2 5IO2A 3W8SA 5C00A 2H6YA 2C3TA 1S3DA 2VOCA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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